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Database: Pfam
Entry: DNA_ligase_A_N
LinkDB: DNA_ligase_A_N
Original site: DNA_ligase_A_N 
#=GF ID   DNA_ligase_A_N
#=GF AC   PF04675.10
#=GF DE   DNA ligase N terminus
#=GF AU   Kerrison ND
#=GF SE   DOMO:DM04655;
#=GF GA   23.30 23.30;
#=GF TC   23.30 23.40;
#=GF NC   23.20 23.20;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 80369284 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   9016621
#=GF RT   Domain structure of vaccinia DNA ligase. 
#=GF RA   Sekiguchi J, Shuman S; 
#=GF RL   Nucleic Acids Res 1997;25:727-734.
#=GF DR   INTERPRO; IPR012308;
#=GF CC   This region is found in many but not all ATP-dependent DNA
#=GF CC   ligase enzymes (EC:6.5.1.1).  It is thought to be involved in
#=GF CC   DNA binding and in catalysis. In human DNA ligase I
#=GF CC   (Swiss:P18858), and in Saccharomyces cerevisiae (Swiss:P04819),
#=GF CC   this region was necessary for catalysis, and separated from the
#=GF CC   amino terminus by targeting elements. In vaccinia virus
#=GF CC   (Swiss:P16272) this region was not essential for catalysis, but
#=GF CC   deletion decreases the affinity for nicked DNA and decreased the
#=GF CC   rate of strand joining at a step subsequent to enzyme-adenylate
#=GF CC   formation [1].
#=GF SQ   4880
#=GS A0A048MQS8_MYCTX/64-140   AC A0A048MQS8.1
#=GS A0A047YRI5_MYCTX/64-140   AC A0A047YRI5.1
#=GS Q3AY23_SYNS9/2-173        AC Q3AY23.1
#=GS M0LYC2_9EURY/2-175        AC M0LYC2.1
#=GS A0A053RYD0_MYCTX/64-140   AC A0A053RYD0.1
#=GS A0A051BYB6_MYCTX/61-140   AC A0A051BYB6.1
#=GS V9I8K2_APICE/1-110        AC V9I8K2.1
#=GS V5QZI2_9POXV/3-168        AC V5QZI2.1
#=GS S4RK95_PETMA/430-606      AC S4RK95.1
#=GS L5NWL1_9EURY/2-182        AC L5NWL1.1
#=GS A0A039VPV4_MYCTX/64-140   AC A0A039VPV4.1
#=GS F3J5H0_PSEAP/2-161        AC F3J5H0.1
#=GS G0XTN2_COWPX/3-168        AC G0XTN2.1
#=GS G9NLE6_HYPAI/50-256       AC G9NLE6.1
#=GS N1P7L4_YEASC/124-301      AC N1P7L4.1
#=GS W9GQH4_9MICO/62-141       AC W9GQH4.1
#=GS A2BWA5_PROM5/2-168        AC A2BWA5.1
#=GS A0A040LHZ4_MYCTX/64-140   AC A0A040LHZ4.1
#=GS A0A022XPH3_TRISD/1-183    AC A0A022XPH3.1
#=GS M0F3E5_9EURY/2-197        AC M0F3E5.1
#=GS S2JRL6_MUCC1/7-185        AC S2JRL6.1
#=GS L7M031_9ACAR/13-212       AC L7M031.1
#=GS A0A046NJ50_MYCTX/64-140   AC A0A046NJ50.1
#=GS G3EI46_9POXV/3-169        AC G3EI46.1
#=GS I1RS99_GIBZE/4-156        AC I1RS99.1
#=GS A0A040N7H0_MYCTX/64-140   AC A0A040N7H0.1
#=GS G4UN69_NEUT9/112-304      AC G4UN69.1
#=GS H3BZA6_TETNG/175-347      AC H3BZA6.1
#=GS A0A041ZL13_MYCTX/64-140   AC A0A041ZL13.1
#=GS A5FJ32_FLAJ1/2-160        AC A5FJ32.1
#=GS A0A050FWM8_MYCTX/64-140   AC A0A050FWM8.1
#=GS G4UMP5_NEUT9/44-253       AC G4UMP5.1
#=GS A0A051JUU3_MYCTX/64-140   AC A0A051JUU3.1
#=GS A0A043RGP3_MYCTX/64-140   AC A0A043RGP3.1
#=GS DNLI_ANADF/58-141         AC A7HID3.1
#=GS K2FX77_9BACT/2-174        AC K2FX77.1
#=GS E2U298_MYCTX/64-140       AC E2U298.1
#=GS K9GSY3_PEND1/148-326      AC K9GSY3.1
#=GS A0A057VIV8_MYCTX/64-140   AC A0A057VIV8.1
#=GS U6N6R1_9EIME/415-596      AC U6N6R1.1
#=GS Q98BP5_RHILO/10-166       AC Q98BP5.1
#=GS W2S7N3_9EURO/2-195        AC W2S7N3.1
#=GS X6J0A9_9RHIZ/2-158        AC X6J0A9.1
#=GS B4HGZ0_DROSE/12-185       AC B4HGZ0.1
#=GS C5P9C8_COCP7/211-389      AC C5P9C8.1
#=GS A0A049Y2M7_MYCTX/64-140   AC A0A049Y2M7.1
#=GS A0A039M166_MYCTX/64-140   AC A0A039M166.1
#=GS A0A055EJU0_MYCTX/64-140   AC A0A055EJU0.1
#=GS W2WEA7_PHYPR/266-463      AC W2WEA7.1
#=GS A0A049JF35_MYCTX/64-140   AC A0A049JF35.1
#=GS H3EQ41_PRIPA/5-75         AC H3EQ41.1
#=GS T1A1H9_9ZZZZ/1-52         AC T1A1H9.1
#=GS X0I251_FUSOX/180-358      AC X0I251.1
#=GS U3JNN2_FICAL/20-213       AC U3JNN2.1
#=GS A0A050MCS8_MYCTX/64-140   AC A0A050MCS8.1
#=GS D9UXK0_9ACTO/65-139       AC D9UXK0.1
#=GS G4TFE8_PIRID/249-439      AC G4TFE8.1
#=GS A0A044N2S1_MYCTX/64-140   AC A0A044N2S1.1
#=GS A0A038UF25_MYCTX/64-140   AC A0A038UF25.1
#=GS V5F0W1_PSEBG/42-218       AC V5F0W1.1
#=GS K7DH07_PANTR/263-434      AC K7DH07.1
#=GS A0A057LVR0_MYCTX/64-140   AC A0A057LVR0.1
#=GS A0A048FE09_MYCTX/64-140   AC A0A048FE09.1
#=GS A0A047SAL2_MYCTX/64-140   AC A0A047SAL2.1
#=GS A0A057XNG4_MYCTX/64-140   AC A0A057XNG4.1
#=GS A0A048Q7V8_MYCTX/64-140   AC A0A048Q7V8.1
#=GS M0KYT9_9EURY/2-184        AC M0KYT9.1
#=GS A0A050K806_MYCTX/64-140   AC A0A050K806.1
#=GS A0A045BR72_MYCTX/64-140   AC A0A045BR72.1
#=GS A0A052U6S6_MYCTX/64-140   AC A0A052U6S6.1
#=GS A0A054NZB8_MYCTX/64-140   AC A0A054NZB8.1
#=GS G9I0C0_9VIRU/447-696      AC G9I0C0.1
#=GS B4SRJ5_STRM5/2-166        AC B4SRJ5.1
#=GS DNLI_ANADE/58-142         AC Q2IH69.1
#=GS DNLI_METJA/2-179          AC Q57635.1
#=GS F9G3P5_FUSOF/169-347      AC F9G3P5.1
#=GS E5QZZ9_ARTGP/167-345      AC E5QZZ9.1
#=GS T0JS13_COLGC/48-254       AC T0JS13.1
#=GS A0A055MRI4_MYCTX/64-140   AC A0A055MRI4.1
#=GS A0A038P1I7_MYCTX/64-140   AC A0A038P1I7.1
#=GS M3U1G5_ENTHI/68-241       AC M3U1G5.1
#=GS A0A055Q8I8_MYCTX/64-140   AC A0A055Q8I8.1
#=GS A0A039DV93_MYCTX/64-140   AC A0A039DV93.1
#=GS A0A044FID4_MYCTX/64-140   AC A0A044FID4.1
#=GS A3KKD6_STRAM/62-138       AC A3KKD6.1
#=GS A0A042HB44_MYCTX/64-140   AC A0A042HB44.1
#=GS Q8MZC0_DROME/2-95         AC Q8MZC0.1
#=GS C6AS36_RHILS/2-160        AC C6AS36.1
#=GS F1RL99_PIG/284-460        AC F1RL99.1
#=GS B3NQ16_DROER/126-298      AC B3NQ16.1
#=GS M2ULI5_PSEST/2-161        AC M2ULI5.1
#=GS A0A047XXP7_MYCTX/64-140   AC A0A047XXP7.1
#=GS B6B211_9RHOB/2-160        AC B6B211.1
#=GS A0A057QN30_MYCTX/64-140   AC A0A057QN30.1
#=GS A0A044WIJ4_MYCTX/64-140   AC A0A044WIJ4.1
#=GS S9UQG8_9TRYP/29-205       AC S9UQG8.1
#=GS W4HKC7_9RHOB/2-160        AC W4HKC7.1
#=GS W9CG49_9HELO/271-462      AC W9CG49.1
#=GS A0A055JDU5_MYCTX/64-140   AC A0A055JDU5.1
#=GS S3DT02_GLAL2/47-253       AC S3DT02.1
#=GS C5G8V5_AJEDR/161-339      AC C5G8V5.1
#=GS F6U6N9_CALJA/1-157        AC F6U6N9.1
#=GS G3SNT4_LOXAF/263-434      AC G3SNT4.1
#=GS B0S533_DANRE/430-606      AC B0S533.1
#=GS K9I2T7_AGABB/132-308      AC K9I2T7.1
#=GS M0PHZ9_9EURY/2-216        AC M0PHZ9.1
#=GS V9NLU9_MONPV/3-170        AC V9NLU9.1
#=GS F0W495_9STRA/385-606      AC F0W495.1
#=GS M0FYP4_9EURY/2-182        AC M0FYP4.1
#=GS A0A041HLI0_MYCTX/64-140   AC A0A041HLI0.1
#=GS A0A045JUA9_9MYCO/64-140   AC A0A045JUA9.1
#=GS A0A058PLN9_MYCTX/64-140   AC A0A058PLN9.1
#=GS K2TA48_PSESY/2-161        AC K2TA48.1
#=GS D8U0I6_VOLCA/29-178       AC D8U0I6.1
#=GS E6R6Y0_CRYGW/5-192        AC E6R6Y0.1
#=GS A0A041BVT0_MYCTX/64-140   AC A0A041BVT0.1
#=GS M0NUM8_9EURY/2-193        AC M0NUM8.1
#=GS D4A0U6_RAT/15-208         AC D4A0U6.1
#=GS D8LFE0_ECTSI/307-486      AC D8LFE0.1
#=GS A0A045XQ49_MYCTX/64-140   AC A0A045XQ49.1
#=GS M0K063_9EURY/2-184        AC M0K063.1
#=GS W9SH65_9ROSA/123-299      AC W9SH65.1
#=GS C0LJI8_9EURY/2-176        AC C0LJI8.1
#=GS C0LJI8_9EURY/2-176        DR PDB; 3RR5 A; 13-187;
#=GS A0A055PHG0_MYCTX/64-140   AC A0A055PHG0.1
#=GS K2TSJ3_PSESY/2-161        AC K2TSJ3.1
#=GS A0A041CJ04_MYCTX/64-140   AC A0A041CJ04.1
#=GS F4BU04_METCG/2-172        AC F4BU04.1
#=GS A0A044PJN2_MYCTX/64-140   AC A0A044PJN2.1
#=GS F7SXJ4_ALCXX/2-166        AC F7SXJ4.1
#=GS A0A039WDE6_MYCTX/64-140   AC A0A039WDE6.1
#=GS F7WK85_MYCTC/64-140       AC F7WK85.1
#=GS A0A043YJD4_MYCTX/64-140   AC A0A043YJD4.1
#=GS A0A039HPD5_MYCTX/64-140   AC A0A039HPD5.1
#=GS G3EL09_9SAUR/1-123        AC G3EL09.1
#=GS DNLI_METM7/2-179          AC A6VFQ9.1
#=GS D3B9H0_POLPA/142-319      AC D3B9H0.1
#=GS A0A057LSJ3_MYCTX/64-140   AC A0A057LSJ3.1
#=GS D8SJP8_SELML/7-187        AC D8SJP8.1
#=GS A0A056XQQ1_MYCTX/61-140   AC A0A056XQQ1.1
#=GS W9J825_FUSOX/180-358      AC W9J825.1
#=GS I7J7N3_METBM/2-174        AC I7J7N3.1
#=GS M0L7R0_HALJP/2-183        AC M0L7R0.1
#=GS A0A024S6Z4_HYPJE/230-421  AC A0A024S6Z4.1
#=GS G8S1T4_ACTS5/62-141       AC G8S1T4.1
#=GS G0EDM6_PYRF1/4-192        AC G0EDM6.1
#=GS M2WMN8_MYCP1/4-205        AC M2WMN8.1
#=GS T0LGF0_COLGC/4-194        AC T0LGF0.1
#=GS J0M391_LOALO/202-369      AC J0M391.1
#=GS F2SK94_TRIRC/224-419      AC F2SK94.1
#=GS J2P917_9PSED/2-160        AC J2P917.1
#=GS F6WXI9_XENTR/227-398      AC F6WXI9.1
#=GS R4VS06_9EURY/2-185        AC R4VS06.1
#=GS A0A052FFA0_MYCTX/64-140   AC A0A052FFA0.1
#=GS R0M5Z5_NOSB1/6-178        AC R0M5Z5.1
#=GS I1RN87_GIBZE/210-401      AC I1RN87.1
#=GS X5T070_9RHIZ/2-158        AC X5T070.1
#=GS W9XN50_9EURO/42-247       AC W9XN50.1
#=GS F6WCY3_XENTR/303-481      AC F6WCY3.1
#=GS M7WAT9_ENTHI/68-241       AC M7WAT9.1
#=GS A8JIN2_CHLRE/10-118       AC A8JIN2.1
#=GS A0A055I851_MYCTX/64-140   AC A0A055I851.1
#=GS A0A052PHM2_MYCTX/64-140   AC A0A052PHM2.1
#=GS A0A022YJC5_TRIRU/1-183    AC A0A022YJC5.1
#=GS A0A039T2F9_MYCTX/64-140   AC A0A039T2F9.1
#=GS N4VVB1_COLOR/56-263       AC N4VVB1.1
#=GS H9K6U9_APIME/177-349      AC H9K6U9.1
#=GS A0A039INM9_MYCTX/64-140   AC A0A039INM9.1
#=GS A0A050F110_MYCTX/64-140   AC A0A050F110.1
#=GS T2DM24_ALTMD/2-156        AC T2DM24.1
#=GS D3S0Y1_FERPA/3-178        AC D3S0Y1.1
#=GS G2WU85_VERDV/4-202        AC G2WU85.1
#=GS A0A041MDU2_MYCTX/64-140   AC A0A041MDU2.1
#=GS S7QMN1_GLOTA/28-208       AC S7QMN1.1
#=GS A0A054H0N1_MYCTX/64-140   AC A0A054H0N1.1
#=GS A0A039TFP6_MYCTX/64-140   AC A0A039TFP6.1
#=GS X6G0I0_9RHIZ/2-158        AC X6G0I0.1
#=GS H8MW57_CORCM/2-165        AC H8MW57.1
#=GS G9N7Y4_HYPVG/210-401      AC G9N7Y4.1
#=GS K2PBB5_9RHIZ/2-157        AC K2PBB5.1
#=GS B2SRV8_XANOP/2-166        AC B2SRV8.1
#=GS A7EDF2_SCLS1/125-208      AC A7EDF2.1
#=GS U6EB73_9EURY/2-179        AC U6EB73.1
#=GS A0A024JHZ8_GEOCN/184-360  AC A0A024JHZ8.1
#=GS S0DXT1_GIBF5/180-358      AC S0DXT1.1
#=GS A0A052Z2K2_MYCTX/64-140   AC A0A052Z2K2.1
#=GS J1KMW9_9FLAO/2-160        AC J1KMW9.1
#=GS S5G859_ANDDA/1-115        AC S5G859.1
#=GS V5GAN7_BYSSN/161-339      AC V5GAN7.1
#=GS D8Q3D0_SCHCM/3-162        AC D8Q3D0.1
#=GS E0W2H3_PEDHC/8-200        AC E0W2H3.1
#=GS A0A047GD87_MYCTX/64-140   AC A0A047GD87.1
#=GS W6TPY9_9SPHI/2-160        AC W6TPY9.1
#=GS A0A023AKP3_TRIRU/1-129    AC A0A023AKP3.1
#=GS F0ZSY6_DICPU/9-172        AC F0ZSY6.1
#=GS A0A043MB71_MYCTX/64-140   AC A0A043MB71.1
#=GS X1DUY8_9ZZZZ/3-88         AC X1DUY8.1
#=GS A0A043T3R3_MYCTX/64-140   AC A0A043T3R3.1
#=GS V7G1K4_9RHIZ/2-158        AC V7G1K4.1
#=GS J9MYS4_FUSO4/180-358      AC J9MYS4.1
#=GS W2S2H1_9EURO/177-355      AC W2S2H1.1
#=GS E4R752_PSEPB/2-161        AC E4R752.1
#=GS D2HMK6_AILME/264-435      AC D2HMK6.1
#=GS L2G8K7_COLGN/48-254       AC L2G8K7.1
#=GS A0A040ZXJ9_MYCTX/62-140   AC A0A040ZXJ9.1
#=GS A0A041TG06_MYCTX/64-140   AC A0A041TG06.1
#=GS M5CSL0_STEMA/2-166        AC M5CSL0.1
#=GS E4V0Q5_ARTGP/32-239       AC E4V0Q5.1
#=GS N4XAQ7_COCH4/233-425      AC N4XAQ7.1
#=GS A0A043BZT2_MYCTX/64-140   AC A0A043BZT2.1
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#=GS A0A058PWD2_MYCTX/64-140   AC A0A058PWD2.1
#=GS K0EK58_ALTMB/2-156        AC K0EK58.1
#=GS G3EL10_BATYE/1-123        AC G3EL10.1
#=GS G7TA76_XANOB/2-166        AC G7TA76.1
#=GS A0A056SDI1_MYCTX/64-140   AC A0A056SDI1.1
#=GS G1MY77_MELGA/174-345      AC G1MY77.2
#=GS U6MAN0_EIMMA/336-437      AC U6MAN0.1
#=GS A0A045T2U7_9MYCO/64-140   AC A0A045T2U7.1
#=GS X0K9E1_FUSOX/269-460      AC X0K9E1.1
#=GS G4UWB4_NEUT9/180-355      AC G4UWB4.1
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#=GS B3M2P9_DROAN/27-200       AC B3M2P9.1
#=GS Q3U4X8_MOUSE/302-478      AC Q3U4X8.1
#=GS C9RDY7_METVM/2-179        AC C9RDY7.1
#=GS U9T0T2_RHIID/23-199       AC U9T0T2.1
#=GS I4K346_PSEFL/2-161        AC I4K346.1
#=GS C9ZRF3_TRYB9/121-297      AC C9ZRF3.1
#=GS A0A054KZN7_MYCTX/64-140   AC A0A054KZN7.1
#=GS E2W9H2_MYCTX/65-140       AC E2W9H2.1
#=GS W1K1M6_9BRAD/2-160        AC W1K1M6.1
#=GS S7RH30_MYCMR/50-128       AC S7RH30.1
#=GS DNLI_METM5/2-179          AC A4FY19.1
#=GS B6AIL5_CRYMR/166-349      AC B6AIL5.1
#=GS Q2PCE4_9EURY/15-188       AC Q2PCE4.1
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#=GS M5EG21_9RHIZ/2-158        AC M5EG21.1
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#=GS A9UP66_MONBE/20-241       AC A9UP66.1
#=GS W9W8G0_9EURO/4-202        AC W9W8G0.1
#=GS E7QUS0_9EURY/2-181        AC E7QUS0.1
#=GS J9VRY1_CRYNH/179-361      AC J9VRY1.2
#=GS A0A056WDU6_MYCTX/64-140   AC A0A056WDU6.1
#=GS F3DCC9_9PSED/2-161        AC F3DCC9.1
#=GS Q4SED8_TETNG/12-204       AC Q4SED8.1
#=GS S2WJ64_DELAC/2-161        AC S2WJ64.1
#=GS A0A053JXI7_MYCTX/64-140   AC A0A053JXI7.1
#=GS R9PCH9_PSEHS/214-390      AC R9PCH9.1
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#=GS M1IB69_9CREN/2-184        AC M1IB69.1
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#=GS S9X840_SCHCR/22-213       AC S9X840.1
#=GS W2RIG3_9EURO/4-207        AC W2RIG3.1
#=GS G7XBA2_ASPKW/4-202        AC G7XBA2.1
#=GS G9BWP5_EURHE/34-243       AC G9BWP5.1
#=GS A0A056DMP8_MYCTX/64-140   AC A0A056DMP8.1
#=GS L9PEM9_9BURK/2-161        AC L9PEM9.1
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#=GS A0A039P737_MYCTX/64-140   AC A0A039P737.1
#=GS E9C8Y6_CAPO3/122-311      AC E9C8Y6.1
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#=GS B4KMC9_DROMO/115-287      AC B4KMC9.1
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#=GS DNLI_PYRFU/2-176          DR PDB; 2CFM A; 2-176;
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A0A047YRI5_MYCTX/64-140              ..............................................................rslpppap---.-----------..--..-...---.............................--...........----.---...-........---................................................-------.--.......................---....---...--..-......---.-.........-.-.-.-------......-.--.....--..--...-----........................................---.....-------........-----...-.............................................-...............---..........-Q....pA.............LTV....................................................T..............G.VDAT...L.SK.I.G......................................TL...........sGKGSQ.................AQR..AALVAELFSA..A.......................TEAEQTFLLRLLG..G..........EL.R..Q..GAKGG.IMADAVA.........................................................................
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