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Database: Pfam
Entry: DNA_primase_S
LinkDB: DNA_primase_S
Original site: DNA_primase_S 
#=GF ID   DNA_primase_S
#=GF AC   PF01896.15
#=GF DE   Eukaryotic and archaeal DNA primase small subunit
#=GF AU   Enright A, Ouzounis C, Bateman A
#=GF SE   Enright A
#=GF GA   26.80 26.80;
#=GF TC   26.80 26.80;
#=GF NC   26.70 26.70;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 80369284 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   2023935
#=GF RT   Mutations in conserved yeast DNA primase domains impair DNA
#=GF RT   replication in vivo. 
#=GF RA   Francesconi S, Longhese MP, Piseri A, Santocanale C, Lucchini G,
#=GF RA   Plevani P; 
#=GF RL   Proc Natl Acad Sci U S A 1991;88:3877-3881.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   11836407
#=GF RT   Baculovirus replication factor LEF-1 is a DNA primase. 
#=GF RA   Mikhailov VS, Rohrmann GF; 
#=GF RL   J Virol 2002;76:2287-2297.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   16027112
#=GF RT   Origin and evolution of the archaeo-eukaryotic primase
#=GF RT   superfamily and related palm-domain proteins: structural
#=GF RT   insights and new members. 
#=GF RA   Iyer LM, Koonin EV, Leipe DD, Aravind L; 
#=GF RL   Nucleic Acids Res. 2005;33:3875-3896.
#=GF DR   INTERPRO; IPR002755;
#=GF DR   SCOP; 1g71; fa;
#=GF CC   DNA primase synthesises the RNA primers for the Okazaki
#=GF CC   fragments in lagging strand DNA synthesis. DNA primase is a
#=GF CC   heterodimer of large and small subunits.  This family also
#=GF CC   includes baculovirus late expression factor 1 or LEF-1 proteins.
#=GF CC   Baculovirus LEF-1 is a DNA primase enzyme [1].  Bacterial DNA
#=GF CC   primase adopts a different fold to archaeal and eukaryotic
#=GF CC   primases.
#=GF SQ   4742
#=GS W3WI55_9PEZI/207-438      AC W3WI55.1
#=GS G8SFA9_ACTS5/136-258      AC G8SFA9.1
#=GS A0A038VQS8_MYCTX/138-260  AC A0A038VQS8.1
#=GS A0A051JUK6_MYCTX/132-261  AC A0A051JUK6.1
#=GS I8I445_MYCAB/139-261      AC I8I445.1
#=GS A0A048KZ24_MYCTX/138-260  AC A0A048KZ24.1
#=GS A0A050SH08_MYCTX/138-260  AC A0A050SH08.1
#=GS K8RCN9_9BURK/729-850      AC K8RCN9.1
#=GS H2RL95_TAKRU/110-342      AC H2RL95.1
#=GS K9GGJ7_PEND1/171-402      AC K9GGJ7.1
#=GS A0A047G569_MYCTX/138-260  AC A0A047G569.1
#=GS A0A023ZDB6_YEASX/110-344  AC A0A023ZDB6.1
#=GS F5XWZ9_RAMTT/128-257      AC F5XWZ9.1
#=GS A0A042T2R4_MYCTX/138-260  AC A0A042T2R4.1
#=GS A0A056CNK4_MYCTX/138-260  AC A0A056CNK4.1
#=GS A0A049IKT8_MYCTX/132-261  AC A0A049IKT8.1
#=GS A0A048BMV1_MYCTX/132-261  AC A0A048BMV1.1
#=GS A0A047SUJ5_MYCTX/132-261  AC A0A047SUJ5.1
#=GS A0A051LXC6_MYCTX/132-261  AC A0A051LXC6.1
#=GS A0A052PVG6_MYCTX/138-260  AC A0A052PVG6.1
#=GS J4R363_9BURK/509-630      AC J4R363.1
#=GS A0A024Y1N4_YEASX/110-344  AC A0A024Y1N4.1
#=GS A0A038P501_MYCTX/132-261  AC A0A038P501.1
#=GS A0A048RWY3_MYCTX/138-260  AC A0A048RWY3.1
#=GS A0A042UAH0_MYCTX/132-261  AC A0A042UAH0.1
#=GS PRIS_SULIY/129-265        AC C3NDP7.1
#=GS A0A041WUR1_MYCTX/132-261  AC A0A041WUR1.1
#=GS A0A052XAE4_MYCTX/132-261  AC A0A052XAE4.1
#=GS A0A047MMI6_MYCTX/132-261  AC A0A047MMI6.1
#=GS A0A051DFC3_MYCTX/132-261  AC A0A051DFC3.1
#=GS A0A044DDF5_MYCTX/138-260  AC A0A044DDF5.1
#=GS G0HK09_THES4/96-308       AC G0HK09.1
#=GS A6UR62_METVS/103-287      AC A6UR62.1
#=GS L7IKW8_MAGOY/212-444      AC L7IKW8.1
#=GS PRIS_METM7/104-295        AC A6VI60.1
#=GS X7V2L4_MYCAB/139-261      AC X7V2L4.1
#=GS R7THB3_CAPTE/112-343      AC R7THB3.1
#=GS A0A041F603_MYCTX/132-261  AC A0A041F603.1
#=GS G0EEU1_PYRF1/127-319      AC G0EEU1.1
#=GS A0A047VK10_MYCTX/138-260  AC A0A047VK10.1
#=GS A0A051ADF3_MYCTX/132-261  AC A0A051ADF3.1
#=GS A0A041QW96_MYCTX/132-261  AC A0A041QW96.1
#=GS A0A046QD77_MYCTX/132-261  AC A0A046QD77.1
#=GS A0A041HJ07_MYCTX/138-260  AC A0A041HJ07.1
#=GS A0A043NVS5_MYCTX/138-260  AC A0A043NVS5.1
#=GS A0A056EFS5_MYCTX/132-261  AC A0A056EFS5.1
#=GS M2T371_COCSN/190-420      AC M2T371.1
#=GS A0A039JZM0_MYCBI/138-260  AC A0A039JZM0.1
#=GS A0A052MH95_MYCTX/138-260  AC A0A052MH95.1
#=GS S6E2H9_ZYGB2/119-353      AC S6E2H9.1
#=GS A0A058RFE8_MYCTX/132-261  AC A0A058RFE8.1
#=GS A0A039YB26_MYCTX/138-260  AC A0A039YB26.1
#=GS M4FVE2_MAGP6/209-440      AC M4FVE2.1
#=GS A0A046NFK1_MYCTX/138-260  AC A0A046NFK1.1
#=GS X5YC27_9RHIZ/673-794      AC X5YC27.1
#=GS A0A040WU90_MYCTX/132-261  AC A0A040WU90.1
#=GS A0A054PLX5_MYCTX/138-260  AC A0A054PLX5.1
#=GS A0A050MEQ8_MYCTX/138-260  AC A0A050MEQ8.1
#=GS G2WGF4_YEASK/110-344      AC G2WGF4.1
#=GS LEF1_NPVAC/75-223         AC P41417.1
#=GS A0A048XVU9_MYCTX/138-260  AC A0A048XVU9.1
#=GS A0A054AJB9_MYCTX/132-261  AC A0A054AJB9.1
#=GS W6K2V4_9MICO/153-273      AC W6K2V4.1
#=GS A8I5X1_CHLRE/126-374      AC A8I5X1.1
#=GS A0A055FNI4_MYCTX/138-260  AC A0A055FNI4.1
#=GS A0A047QMK6_MYCTX/138-260  AC A0A047QMK6.1
#=GS X1F6U3_9ZZZZ/73-142       AC X1F6U3.1
#=GS A0A053HFH5_MYCTX/138-260  AC A0A053HFH5.1
#=GS A0A047PB80_MYCTX/138-260  AC A0A047PB80.1
#=GS A0A046F9T6_MYCTX/138-260  AC A0A046F9T6.1
#=GS A0A038VRA1_MYCTX/138-260  AC A0A038VRA1.1
#=GS A0A042QZG5_MYCTX/132-261  AC A0A042QZG5.1
#=GS A0A052XKI7_MYCTX/138-260  AC A0A052XKI7.1
#=GS Q88HU3_PSEPK/661-783      AC Q88HU3.1
#=GS X5QTF9_9RHIZ/673-794      AC X5QTF9.1
#=GS A0A040K2W3_MYCTX/138-260  AC A0A040K2W3.1
#=GS A0A050MR33_MYCTX/132-261  AC A0A050MR33.1
#=GS A0A050F2N2_MYCTX/132-261  AC A0A050F2N2.1
#=GS V4NK68_EUTSA/143-379      AC V4NK68.1
#=GS A0A056WJC3_MYCTX/132-261  AC A0A056WJC3.1
#=GS A0A039RPK3_MYCTX/138-260  AC A0A039RPK3.1
#=GS E4ZWF0_LEPMJ/188-418      AC E4ZWF0.1
#=GS A0A054I549_MYCTX/132-261  AC A0A054I549.1
#=GS A0A053EG41_MYCTX/138-260  AC A0A053EG41.1
#=GS A0A057HAR3_MYCTX/138-260  AC A0A057HAR3.1
#=GS A0A052CEQ7_MYCTX/138-260  AC A0A052CEQ7.1
#=GS Q2GQY8_CHAGB/222-452      AC Q2GQY8.1
#=GS A0A056UA41_MYCTX/138-260  AC A0A056UA41.1
#=GS A0A042MWQ0_MYCTX/132-261  AC A0A042MWQ0.1
#=GS A0A056YUA9_MYCTX/138-260  AC A0A056YUA9.1
#=GS Q4N401_THEPA/121-357      AC Q4N401.1
#=GS Q599G0_9ABAC/80-237       AC Q599G0.1
#=GS A0A057ZR80_MYCTX/132-261  AC A0A057ZR80.1
#=GS K2SIW8_9PSED/677-800      AC K2SIW8.1
#=GS A0A046G4W1_MYCTX/132-261  AC A0A046G4W1.1
#=GS V8QXF0_9BURK/657-778      AC V8QXF0.1
#=GS Q7Q633_ANOGA/117-350      AC Q7Q633.4
#=GS M0PAG4_9EURY/139-361      AC M0PAG4.1
#=GS F3DXM5_9PSED/677-800      AC F3DXM5.1
#=GS G8JN43_ERECY/140-374      AC G8JN43.1
#=GS A0A053S5Z8_MYCTX/132-261  AC A0A053S5Z8.1
#=GS M1ICS0_9CREN/121-259      AC M1ICS0.1
#=GS S6VAB7_PSESF/677-800      AC S6VAB7.1
#=GS A0A048QVU2_MYCTX/132-261  AC A0A048QVU2.1
#=GS A0A046I7U5_MYCTX/132-261  AC A0A046I7U5.1
#=GS L0NPF6_MYCTX/132-261      AC L0NPF6.1
#=GS A0A056PBP5_MYCTX/138-260  AC A0A056PBP5.1
#=GS A0A045AKP1_MYCTX/132-261  AC A0A045AKP1.1
#=GS A0A039VPR3_MYCTX/132-261  AC A0A039VPR3.1
#=GS A0A045LT04_MYCTX/138-260  AC A0A045LT04.1
#=GS D8QU93_SELML/88-325       AC D8QU93.1
#=GS A0A052EWF7_MYCTX/132-261  AC A0A052EWF7.1
#=GS A0A052LV25_MYCTX/138-260  AC A0A052LV25.1
#=GS A0A055BBT4_MYCTX/132-261  AC A0A055BBT4.1
#=GS A0A050YWR7_MYCTX/138-260  AC A0A050YWR7.1
#=GS A0A056D8Y7_MYCTX/132-261  AC A0A056D8Y7.1
#=GS A0A058LFC6_MYCTX/138-260  AC A0A058LFC6.1
#=GS A0A056P092_MYCTX/132-261  AC A0A056P092.1
#=GS A0A056VK67_MYCTX/138-260  AC A0A056VK67.1
#=GS A0A039F5X7_MYCTX/138-260  AC A0A039F5X7.1
#=GS F1QKT6_DANRE/110-336      AC F1QKT6.1
#=GS A0A041D0D5_MYCTX/138-260  AC A0A041D0D5.1
#=GS A0A039MU74_MYCTX/138-260  AC A0A039MU74.1
#=GS A0A053BU49_MYCTX/132-261  AC A0A053BU49.1
#=GS A0A051VY86_MYCTX/138-260  AC A0A051VY86.1
#=GS S5N9F7_9BACU/103-256      AC S5N9F7.1
#=GS A0A054EXP8_MYCTX/138-260  AC A0A054EXP8.1
#=GS A0A055GJ70_MYCTX/138-260  AC A0A055GJ70.1
#=GS A0A048HBD5_MYCTX/138-260  AC A0A048HBD5.1
#=GS A0A039VBQ2_MYCTX/138-260  AC A0A039VBQ2.1
#=GS A0A047QBM8_MYCTX/132-261  AC A0A047QBM8.1
#=GS M0PHY3_9EURY/97-319       AC M0PHY3.1
#=GS L0PRG5_9MYCO/132-261      AC L0PRG5.1
#=GS A0A058J6Q5_MYCTX/138-260  AC A0A058J6Q5.1
#=GS A0A056N2Q7_MYCTX/138-260  AC A0A056N2Q7.1
#=GS A0A045VWH8_MYCTX/138-260  AC A0A045VWH8.1
#=GS A0A040HPF3_MYCTX/132-261  AC A0A040HPF3.1
#=GS I1HX71_BRADI/134-369      AC I1HX71.1
#=GS A0A049P4S9_MYCTX/132-261  AC A0A049P4S9.1
#=GS E2U517_MYCTX/151-273      AC E2U517.1
#=GS B9C8S1_9BURK/759-880      AC B9C8S1.1
#=GS A0A039QQY9_MYCTX/132-261  AC A0A039QQY9.1
#=GS A0A045WNU1_9MYCO/132-261  AC A0A045WNU1.1
#=GS A0A042HAJ7_MYCTX/132-261  AC A0A042HAJ7.1
#=GS A0A048N583_MYCTX/132-261  AC A0A048N583.1
#=GS M3AAB3_MYCFI/141-370      AC M3AAB3.1
#=GS V9UK58_9PSED/658-780      AC V9UK58.1
#=GS A0A055YFU3_MYCTX/132-261  AC A0A055YFU3.1
#=GS A0A041QXR4_MYCTX/138-260  AC A0A041QXR4.1
#=GS S3CRS4_OPHP1/294-525      AC S3CRS4.1
#=GS A0A057NKQ7_MYCTX/132-261  AC A0A057NKQ7.1
#=GS A0A057H2W3_MYCTX/138-260  AC A0A057H2W3.1
#=GS A0A053DEE2_MYCTX/138-260  AC A0A053DEE2.1
#=GS A0A042JB90_MYCTX/138-260  AC A0A042JB90.1
#=GS Q461T6_9ABAC/74-213       AC Q461T6.1
#=GS A0A042DMI8_MYCTX/132-261  AC A0A042DMI8.1
#=GS A0A045B2E0_MYCTX/138-260  AC A0A045B2E0.1
#=GS A0A058I9A9_MYCTX/132-261  AC A0A058I9A9.1
#=GS A0A046MXZ1_MYCTX/138-260  AC A0A046MXZ1.1
#=GS A0A050Q6S3_MYCTX/138-260  AC A0A050Q6S3.1
#=GS A0A041D927_MYCTX/132-261  AC A0A041D927.1
#=GS A0A048TPQ0_MYCTX/132-261  AC A0A048TPQ0.1
#=GS A0A057TZ91_MYCTX/132-261  AC A0A057TZ91.1
#=GS A0A050P5F6_MYCTX/132-261  AC A0A050P5F6.1
#=GS A0A045XML0_MYCTX/132-261  AC A0A045XML0.1
#=GS U2SZY7_PSEPU/661-783      AC U2SZY7.1
#=GS A0A054VWV1_MYCTX/138-260  AC A0A054VWV1.1
#=GS A0A052D2G6_MYCTX/132-261  AC A0A052D2G6.1
#=GS A0A048H0F9_MYCTX/132-261  AC A0A048H0F9.1
#=GS A0A022MK65_9ACTO/134-256  AC A0A022MK65.1
#=GS A0A055CHF5_MYCTX/132-261  AC A0A055CHF5.1
#=GS J3DN27_9PSED/689-815      AC J3DN27.1
#=GS A0A048E5V0_MYCTX/132-261  AC A0A048E5V0.1
#=GS A0A057GDN7_MYCTX/138-260  AC A0A057GDN7.1
#=GS Q8MWR9_EUPCR/124-358      AC Q8MWR9.1
#=GS A0A055EAH2_MYCTX/132-261  AC A0A055EAH2.1
#=GS A0A044K3K4_MYCTX/132-261  AC A0A044K3K4.1
#=GS M0IBG1_9EURY/96-320       AC M0IBG1.1
#=GS A0A050VZ72_MYCTX/138-260  AC A0A050VZ72.1
#=GS Q5KU16_COPCI/6-238        AC Q5KU16.1
#=GS A0A051UZM6_MYCTX/138-260  AC A0A051UZM6.1
#=GS A0A053JSD5_MYCTX/132-261  AC A0A053JSD5.1
#=GS Q91GN6_NPVEP/74-223       AC Q91GN6.1
#=GS Q91BT8_9ABAC/94-245       AC Q91BT8.1
#=GS A0A045A6N5_MYCTX/138-260  AC A0A045A6N5.1
#=GS G8M3M4_9BURK/729-852      AC G8M3M4.1
#=GS A0A047APT3_MYCTX/138-260  AC A0A047APT3.1
#=GS A0A043RCS2_MYCTX/138-260  AC A0A043RCS2.1
#=GS A0A044YFM7_MYCTX/132-261  AC A0A044YFM7.1
#=GS A0A048AKQ7_MYCTX/132-261  AC A0A048AKQ7.1
#=GS PRIS_PYRAB/94-309         AC Q9V292.1
#=GS A0A042FZ45_MYCTX/132-261  AC A0A042FZ45.1
#=GS A0A057DCY8_MYCTX/132-261  AC A0A057DCY8.1
#=GS A0A040LY65_MYCTX/138-260  AC A0A040LY65.1
#=GS A0A047EL92_MYCTX/132-261  AC A0A047EL92.1
#=GS A0A048T1T3_MYCTX/138-260  AC A0A048T1T3.1
#=GS D7KD65_ARALL/10-165       AC D7KD65.1
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A0A058C0D1_MYCTX/138-260             .............................................................i-DLD...PQPGTG...........--.-......-...--...-......--.....-..-F.V.E.A.R.T.VAVDVL.RSVL..-.......D....DLGLV................-GYPKTSG..........GRG.IHV...F.L..R..I.ATDW......DFVEVR.......RAG..IA-..--.---....................................................................................................--........--------.......------..---..------.................................................LAR.E.V.ERRAP....DAVTTS................------.................................................................................................................WWKEERGA....RIF...IDFNQN---ARDRTMASAYSVRP..TPIaTVSMPLTW.......................................................................................................................................
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