GenomeNet

Database: Pfam
Entry: DUF276
LinkDB: DUF276
Original site: DUF276 
#=GF ID   DUF276
#=GF AC   PF03434.11
#=GF DE   DUF276 
#=GF AU   Finn RD
#=GF SE   Pfam-B_4450 (release 6.6)
#=GF GA   25.00 25.00;
#=GF TC   549.80 549.70;
#=GF NC   18.30 17.60;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 17690987 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF WK   Domain_of_unknown_function
#=GF DR   INTERPRO; IPR005096;
#=GF CC   This family is specific to Borrelia burgdorferi.  The protein is
#=GF CC   encoded on extra-chromosomal DNA.                  This domain
#=GF CC   has no known function.
#=GF SQ   8
#=GS Q9S0C3_BORBU/1-290  AC Q9S0C3.1
#=GS Q9S046_BORBU/1-290  AC Q9S046.1
#=GS O50903_BORBU/1-289  AC O50903.1
#=GS Q9RZZ5_BORBU/1-290  AC Q9RZZ5.1
#=GS Q9S071_BORBU/1-290  AC Q9S071.1
#=GS Q9S088_BORBU/1-290  AC Q9S088.1
#=GS Q9R331_BORBU/1-290  AC Q9R331.1
#=GS Q9S0F2_BORBU/1-290  AC Q9S0F2.1
Q9S0C3_BORBU/1-290             MSIVFDSDFGILKRTIKDIVRSKREYLRVNYGINIDDNQSSIYNIIASSLALIEEEIINELNLFFSKMKPGGTYWAAIEEHISS.KSTTYSAVRTALLNLDGVEHTNIKSAAGKANIYLILKETLLDDSKSNINSPKFKAKLWETLYLTTPSGTLLEGDIEIDGLNSTGQRKSYKISLGKRKYVYMKVKYKLDLKNYLYLNIDSQIRDIYSRIISNNYSDMGISFEYQDFFAPVNEVKGIKFMEISACIKDTDTESITKIGDSDFKKNQDIAINDDTMLLFNMTDRLLIDI
Q9S046_BORBU/1-290             MSIVFDSDFGILKRTIKDIVRSKREYLRVNYGINIDDNQSSIYNIIASSLALIEEEIINELNLFFSKMKPGGTYWAAIEEHISS.KSTTYSAVRTALLNLDEVEYTNIKSAAGKANIYLILKETLLDTSKSNINSSEFKAKLWETLYLTTPSGTLLEGDIEIDGLNSTGQRKSYKISLGKRKYVYMKVKYKLDLKNYLYLNIDSQIRDIYSRIILNNYSDMGISFEYQDFFAPVNEVKGIKFMEISACIKDTDTESITKIGDSDFKKNQDIAINDDTMLLFNTTDRLLIDI
O50903_BORBU/1-289             MSIIFDKNLGILEKTIEEIQNEKKHILRTKYGINIKDN--SIYDIINFPSSSIDKQISEVLKELFSKIKENGSYFNALKEDLSTpKSSTYEAIRKALLNVEGVKHINILSGPGTINLYLILQDDCFQDQEKKQIKIETKQNIWQAIYYTAPSGTVFKGDIEIEFLNKHNQKKTYKFSLGKKKYAYLKVVYKTEAKDAIYKEIDTQIRDIYNKILTDKYIEMGTSLRYQDFLAPVSIIRGIKELKIGICIKNDETKKITQLSDSDFTFNKDENTKEDEIIIFNTNKRLLINR
Q9RZZ5_BORBU/1-290             MSIVFDSDFGILKRTIKDIVRSKREYLRVNYGINIDDNQSSIYNIIASSLALIEEEIINKLNLFFSKMKPGGTYWAAIEEHISS.KSTTYSAVRTALLNLDGVEHTNIKSAAGKANIYLILKETLLDDSKSNINSPKFKAKLWETLYLTTPSGTLLEGDIEIDGLNSTGQRKSYKISLGKRKYVYMKVKYKLDLKNYLYLNIDSQIRDIYSRIISNNYSDMGISFEYQDFFAPVNEVKGIKFMEISACIKDTDTESITKIGDSDFKKNQDIAINDDTMLLFNMTDRLLIDI
Q9S071_BORBU/1-290             MSIVFDSDFGILKRTIKDIVRSKREYLRVNYGINIDDNQSSIYNIIASSLALIEEEIIDELNLFFSKMKPGGTYWAAIEEHISS.KSTTYSAVRTALLNLDGIEYTNIKSAAGKANIYLILKETLLDTSKSNINSPEFKAKLWETLYLTTPSGTLLEGDIEIDGLNSTGQRKSYKISLGKRKYVYMKVKYKLDLKNYLYLNIDSQIRDIYSRIISNNYSDMGISFEYQDFFAPVNEVKGIKFMEISACIKDTDTESITKIGDSDFKKNQDIAINDDTMLLFNMTDRLLIDI
Q9S088_BORBU/1-290             MSIVFDSDFGILKRTIKDIVRAKREYLRVNYGINIDDNQSSIYNIIASSLALIEEEIINELNLFFSKMKPGGTYWAAIEEHISS.KSTTYSAVRNALLNLEGVEYTNIKSAAGKANIYLILKETLLDASKSTINSSEFKAKLWETLYLTTPSGTLLEGDIEIDGLNSTGQRKSYKISLGKRKYVYMKVKYKLDLKNYLYLNIDSQIRDIYSRIISNNYSDMGISFEYQDFFAPVNEVKGIKFMEISACIKDTDTESIAKITDSDFKKNQDITITDDTMLLFNTTDRLLIDI
Q9R331_BORBU/1-290             MSIVFDSDFGILKRTIKDIVRAKREYLRVNYGINIDDNQSSIYNIIASSLALIEEEIINELNLFFSKMKPGGTYWAAIEEHISS.KSTTYSAVRNALLNLDGIEYTNIKSAAGKANIYLILKETLLDTSKSNINSPEFKAKLWETLYLTTPSGTLLEGDIEIDGLNSTGQRKSYKISLGKRKYVYMKVKYKLDLKNYLYLNIDSQIRDIYSRIISNNYSDMGISFEYQDFFAPVNEVKGIKFMEISACIKDTDTESITKIGDSDFKKNQDIAINDDTMLLFNMTDRLLIDI
Q9S0F2_BORBU/1-290             MSIVFDSDFGILKRTIKDIVRSKREYLRVNYGINIDDNQSSIYNIIASSLALIEEEIINELNLFFSKMKPGGTYWAAIEEHISS.KSTTYSAVRTALLNLDGVEYTNIKSAAGKANIYLILKETLLDDSKSNINSPEFKAKLWETLYLTTPSGTLLEGDIEIDGLNSTGQRKSYKISLGKRKYVYMKVKYKLDLKNYLYLNIDSQIRDIYSRIISNNYSDMGISFEYQDFFAPVNEVKGIKFMEISACIKDTDTESITKIGDSDFKKNQDIAINDDTMLLFNMTDRLLIDI
#=GC seq_cons                  MSIVFDSDFGILKRTIKDIVRSKREYLRVNYGINIDDNQSSIYNIIASSLALIEEEIINELNLFFSKMKPGGTYWAAIEEHISS.KSTTYSAVRTALLNLDGVEYTNIKSAAGKANIYLILKETLLDsSKSNINSPEFKAKLWETLYLTTPSGTLLEGDIEIDGLNSTGQRKSYKISLGKRKYVYMKVKYKLDLKNYLYLNIDSQIRDIYSRIISNNYSDMGISFEYQDFFAPVNEVKGIKFMEISACIKDTDTESITKIGDSDFKKNQDIAINDDTMLLFNMTDRLLIDI
//
DBGET integrated database retrieval system