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Database: Pfam
Entry: Glyco_hydro_42M
LinkDB: Glyco_hydro_42M
Original site: Glyco_hydro_42M 
#=GF ID   Glyco_hydro_42M
#=GF AC   PF08532.9
#=GF DE   Beta-galactosidase trimerisation domain
#=GF AU   Bateman A
#=GF SE   Pfam-B_2131 (release 5.4)
#=GF GA   24.10 24.10;
#=GF TC   24.20 24.10;
#=GF NC   23.90 24.00;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 26740544 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF WK   Glycoside_hydrolase_family_42
#=GF RN   [1]
#=GF RM   8577281
#=GF RT   Sequence analysis of flanking regions of the pfoA gene of
#=GF RT   Clostridium perfringens: beta-galactosidase gene (pbg) is
#=GF RT   located in the 3'-flanking region. 
#=GF RA   Shimizu T, Kobayashi T, Ba-Thein W, Ohtani K, Hayashi H; 
#=GF RL   Microbiol Immunol 1995;39:677-686.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   12215416
#=GF RT   Trimeric crystal structure of the glycoside hydrolase family 42
#=GF RT   beta-galactosidase from Thermus thermophilus A4 and the
#=GF RT   structure of its complex with galactose. 
#=GF RA   Hidaka M, Fushinobu S, Ohtsu N, Motoshima H, Matsuzawa H, Shoun
#=GF RA   H, Wakagi T; 
#=GF RL   J Mol Biol 2002;322:79-91.
#=GF DR   INTERPRO; IPR013738;
#=GF DR   SCOP; 1kwg; fa;
#=GF CC   This is non catalytic domain B of beta-galactosidase enzymes
#=GF CC   belong to the glycosyl hydrolase 42 family. This domain is
#=GF CC   related to glutamine amidotransferase enzymes, but the catalytic
#=GF CC   residues are replaced by non functional amino acids. This domain
#=GF CC   is involved in trimerisation [1].
#=GF SQ   1615
#=GS A0A0N1FWJ2_9ACTN/398-600    AC A0A0N1FWJ2.1
#=GS A0A0F2TCB6_9ACTN/400-603    AC A0A0F2TCB6.1
#=GS A0A100Y976_9ACTN/394-592    AC A0A100Y976.1
#=GS A0A0P7DUL1_9GAMM/402-600    AC A0A0P7DUL1.1
#=GS B8DWB0_BIFA0/415-627        AC B8DWB0.1
#=GS A0A0R1UFT6_9LACO/397-602    AC A0A0R1UFT6.1
#=GS A0A098U0R2_9BURK/410-619    AC A0A098U0R2.1
#=GS A0A0W1NS71_9ACTN/401-608    AC A0A0W1NS71.1
#=GS A0A101QNY6_9ACTN/407-611    AC A0A101QNY6.1
#=GS A0A0R1X714_9LACO/396-600    AC A0A0R1X714.1
#=GS Q0FG15_9RHOB/400-584        AC Q0FG15.1
#=GS D1CHJ6_THET1/376-432        AC D1CHJ6.1
#=GS L7FA22_9ACTN/414-643        AC L7FA22.1
#=GS H1YA89_9SPHI/353-613        AC H1YA89.1
#=GS A0A0S2EUD8_9RHIZ/403-595    AC A0A0S2EUD8.1
#=GS D3PP13_MEIRD/399-591        AC D3PP13.1
#=GS A0A084UE79_9RHIZ/400-591    AC A0A084UE79.1
#=GS D2BD44_STRRD/389-587        AC D2BD44.1
#=GS A0A0Q9IZU8_9MICO/408-610    AC A0A0Q9IZU8.1
#=GS A0A0M9GNW5_9RHOB/412-604    AC A0A0M9GNW5.1
#=GS Q8RDH1_CALS4/382-535        AC Q8RDH1.1
#=GS S9RWZ8_9RHOB/399-587        AC S9RWZ8.1
#=GS U1RD00_9BIFI/422-640        AC U1RD00.1
#=GS A0A0H4L1S8_9RHOB/392-515    AC A0A0H4L1S8.1
#=GS L7FCE9_9ACTN/397-601        AC L7FCE9.1
#=GS A0A165S331_9MICO/407-612    AC A0A165S331.1
#=GS A0A0D5LM90_9RHIZ/370-476    AC A0A0D5LM90.1
#=GS A6W513_KINRD/393-596        AC A6W513.1
#=GS A0A0Q4J9H4_9SPHN/429-631    AC A0A0Q4J9H4.1
#=GS A0A0N0V3E0_9RHOB/401-589    AC A0A0N0V3E0.1
#=GS W0JB17_9BACT/792-954        AC W0JB17.1
#=GS F3ZVQ2_MAHA5/368-493        AC F3ZVQ2.1
#=GS A0A0Q7DWS0_9RHIZ/403-593    AC A0A0Q7DWS0.1
#=GS A0A163X694_9RHOB/401-589    AC A0A163X694.1
#=GS A6WA74_KINRD/433-550        AC A6WA74.1
#=GS A0A086ZSV3_9BIFI/399-595    AC A0A086ZSV3.1
#=GS A0A1B1KR50_SERPL/403-616    AC A0A1B1KR50.1
#=GS B5I1U0_9ACTN/411-630        AC B5I1U0.1
#=GS A0A089M873_9BACL/388-597    AC A0A089M873.1
#=GS C9A7I9_ENTCA/394-601        AC C9A7I9.1
#=GS X0RJ47_9BACI/396-602        AC X0RJ47.1
#=GS A0A0Q8N1E0_9RHIZ/560-651    AC A0A0Q8N1E0.1
#=GS A0A0P9CXD8_9BACL/400-611    AC A0A0P9CXD8.1
#=GS W4QQX6_BACA3/93-299         AC W4QQX6.1
#=GS E6LD30_9ENTE/1-47           AC E6LD30.1
#=GS A1WNH3_VEREI/33-170         AC A1WNH3.1
#=GS A0A097EJM0_9SPHN/417-626    AC A0A097EJM0.1
#=GS A0A0N8GNA4_9CHLR/439-629    AC A0A0N8GNA4.1
#=GS A0A101TAU7_9ACTN/400-606    AC A0A101TAU7.1
#=GS F9PN85_9ACTO/408-544        AC F9PN85.1
#=GS A0A167U7Z0_9FLAO/378-585    AC A0A167U7Z0.1
#=GS A0A0Q9CAS3_9CELL/391-609    AC A0A0Q9CAS3.1
#=GS B8E215_DICTD/402-617        AC B8E215.1
#=GS R5CE10_9FIRM/430-614        AC R5CE10.1
#=GS C4ZF63_AGARV/395-601        AC C4ZF63.1
#=GS A0A124IEF7_9ACTN/404-625    AC A0A124IEF7.1
#=GS A0A0M8VTB9_9ACTN/392-598    AC A0A0M8VTB9.1
#=GS A0A0L0B8K5_9MICC/386-602    AC A0A0L0B8K5.1
#=GS L1L1B3_9ACTN/477-642        AC L1L1B3.1
#=GS A0A0M2Z4E1_9ACTN/400-606    AC A0A0M2Z4E1.1
#=GS A0A0J7ZMH4_STRVR/397-609    AC A0A0J7ZMH4.1
#=GS A0A168QKL0_9BACL/396-610    AC A0A168QKL0.1
#=GS D2PY42_KRIFD/354-452        AC D2PY42.1
#=GS A0A0F0CLA0_9CLOT/398-609    AC A0A0F0CLA0.1
#=GS A0A0Q9M342_9MICO/396-605    AC A0A0Q9M342.1
#=GS A0A166RWN3_9EURY/397-602    AC A0A166RWN3.1
#=GS J2KVJ4_9RHIZ/554-644        AC J2KVJ4.1
#=GS R7ITD6_9FIRM/402-616        AC R7ITD6.1
#=GS A0A136PTI9_9ACTN/403-624    AC A0A136PTI9.1
#=GS R5JQ47_9BACE/407-609        AC R5JQ47.1
#=GS A0A069D0W7_9BACE/435-645    AC A0A069D0W7.1
#=GS A0A0R1W134_9LACO/405-611    AC A0A0R1W134.1
#=GS A0A069D8C8_9BACL/404-617    AC A0A069D8C8.1
#=GS D3Q0A9_STANL/396-606        AC D3Q0A9.1
#=GS A0A0M1UWM5_CLOSO/367-447    AC A0A0M1UWM5.1
#=GS U2YTB6_9MICO/408-615        AC U2YTB6.1
#=GS A0A0F2C3W4_9MICO/412-624    AC A0A0F2C3W4.1
#=GS A0A0M2Z764_9ACTN/402-604    AC A0A0M2Z764.1
#=GS B9NVL6_9RHOB/401-588        AC B9NVL6.1
#=GS A0A0N7JCV1_9CREN/373-485    AC A0A0N7JCV1.1
#=GS BGAL_ALIAD/402-615          AC C8WV58.1
#=GS D4LQJ0_9FIRM/389-598        AC D4LQJ0.1
#=GS D3AHS5_9CLOT/1-152          AC D3AHS5.1
#=GS A0A0Q9CHP9_9CELL/409-612    AC A0A0Q9CHP9.1
#=GS A0A078KQK6_9FIRM/405-618    AC A0A078KQK6.1
#=GS A0A0M9YSY6_9ACTN/414-643    AC A0A0M9YSY6.1
#=GS A0A0P7XGS9_9RHOB/403-591    AC A0A0P7XGS9.1
#=GS L1KKS0_9ACTN/400-606        AC L1KKS0.1
#=GS A0A0F0ENV3_9MICO/396-599    AC A0A0F0ENV3.1
#=GS A0A021VYR6_9CELL/400-612    AC A0A021VYR6.1
#=GS C1F4W7_ACIC5/396-607        AC C1F4W7.1
#=GS R9LSV2_9FIRM/394-599        AC R9LSV2.1
#=GS A0A0M9YSH8_9ACTN/400-611    AC A0A0M9YSH8.1
#=GS A0A136PND8_9ACTN/395-597    AC A0A136PND8.1
#=GS A0A0J1ILX2_BACCI/404-614    AC A0A0J1ILX2.1
#=GS A0A0R1S097_9LACO/396-604    AC A0A0R1S097.1
#=GS A0A0D1CIF6_9RHOB/409-597    AC A0A0D1CIF6.1
#=GS D9X0J7_STRVT/398-601        AC D9X0J7.1
#=GS S3KIR2_TREMA/399-605        AC S3KIR2.1
#=GS U2BHX5_9CLOT/391-603        AC U2BHX5.1
#=GS A0A0G0MHE0_9BACT/406-594    AC A0A0G0MHE0.1
#=GS R6ZIR7_9FIRM/401-606        AC R6ZIR7.1
#=GS A0A0M2HW53_9MICO/408-624    AC A0A0M2HW53.1
#=GS A0A0N1NUL3_9ACTN/408-612    AC A0A0N1NUL3.1
#=GS C7PZM2_CATAD/412-615        AC C7PZM2.1
#=GS R6KST9_9FIRM/397-610        AC R6KST9.1
#=GS A0A0N1FTQ6_9ACTN/396-595    AC A0A0N1FTQ6.1
#=GS A0Z894_9GAMM/417-610        AC A0Z894.1
#=GS A0A176LA11_9ACTN/395-594    AC A0A176LA11.1
#=GS A0A0Q9QYV3_9MICC/404-606    AC A0A0Q9QYV3.1
#=GS K6TXJ5_9CLOT/412-625        AC K6TXJ5.1
#=GS F7KDI6_9FIRM/404-610        AC F7KDI6.1
#=GS C1F307_ACIC5/488-697        AC C1F307.1
#=GS A0A0Q7U8C9_9MICO/399-621    AC A0A0Q7U8C9.1
#=GS A0A0B0HHW1_9BACI/167-374    AC A0A0B0HHW1.1
#=GS H8E0V5_9MICO/408-612        AC H8E0V5.1
#=GS C6WI75_ACTMD/392-585        AC C6WI75.1
#=GS R5HUA4_9FIRM/404-619        AC R5HUA4.1
#=GS G2SXF1_ROSHA/390-595        AC G2SXF1.1
#=GS A0A0Q4RHN0_9BACL/393-605    AC A0A0Q4RHN0.1
#=GS A0A0A0BX94_9CELL/410-612    AC A0A0A0BX94.1
#=GS B0K7Y4_THEP3/374-529        AC B0K7Y4.1
#=GS D5ZUE2_9ACTN/399-598        AC D5ZUE2.1
#=GS A0A0S9Q2U5_9ACTN/410-614    AC A0A0S9Q2U5.1
#=GS A0A0Q7DMS8_9RHIZ/378-483    AC A0A0Q7DMS8.1
#=GS R5JGR5_9BACE/378-589        AC R5JGR5.1
#=GS A0A168G285_9MICO/414-626    AC A0A168G285.1
#=GS F8EWQ4_TRECH/399-625        AC F8EWQ4.1
#=GS D1C035_XYLCX/396-606        AC D1C035.1
#=GS A0A0Q5CF58_9MICO/404-629    AC A0A0Q5CF58.1
#=GS Q165E8_ROSDO/406-592        AC Q165E8.1
#=GS A0A0E3WHQ0_9BACL/406-617    AC A0A0E3WHQ0.1
#=GS M6RXT9_LEPIR/3-61           AC M6RXT9.1
#=GS A0A0A7I441_9BIFI/435-652    AC A0A0A7I441.1
#=GS A0A090ZHP1_PAEMA/397-608    AC A0A090ZHP1.1
#=GS A0A143YJ82_9LACT/409-615    AC A0A143YJ82.1
#=GS D9SMP5_CLOC7/398-609        AC D9SMP5.1
#=GS A0A0M0KQN6_9BACI/392-598    AC A0A0M0KQN6.1
#=GS A0A146GFT3_9BACT/375-518    AC A0A146GFT3.1
#=GS D6YQA1_PANVC/403-616        AC D6YQA1.1
#=GS A0A0W1NWY7_9ACTN/407-610    AC A0A0W1NWY7.1
#=GS D5ZQP4_9ACTN/1-59           AC D5ZQP4.1
#=GS L7FKC7_9ACTN/394-592        AC L7FKC7.1
#=GS W4DW12_9BACL/399-636        AC W4DW12.1
#=GS R9P080_PSEHS/496-718        AC R9P080.1
#=GS M5GCD2_DACPD/363-464        AC M5GCD2.1
#=GS A0A0Q8PGS7_9ACTN/395-598    AC A0A0Q8PGS7.1
#=GS A0A069D877_9BACL/397-608    AC A0A069D877.1
#=GS D1BB58_SANKS/425-636        AC D1BB58.1
#=GS A0A172TJ42_9BACL/400-604    AC A0A172TJ42.1
#=GS N6V176_9RHIZ/409-542        AC N6V176.1
#=GS A0A087A2R8_9BIFI/410-622    AC A0A087A2R8.1
#=GS A0A061QFY4_9PROT/405-598    AC A0A061QFY4.1
#=GS A0A0P1I9B0_9RHOB/401-589    AC A0A0P1I9B0.1
#=GS A0A0Q5B1S2_9MICO/388-598    AC A0A0Q5B1S2.1
#=GS A0A0J5QXT7_9BACI/398-609    AC A0A0J5QXT7.1
#=GS C9AAJ9_ENTCA/391-595        AC C9AAJ9.2
#=GS I2GE88_9BACT/450-655        AC I2GE88.1
#=GS A0A0M9X9Q8_9ACTN/408-612    AC A0A0M9X9Q8.1
#=GS A0A0Q7DFK4_9RHIZ/397-607    AC A0A0Q7DFK4.1
#=GS H0QLE3_ARTGO/407-611        AC H0QLE3.1
#=GS A0A0Q8LWE1_9MICO/399-606    AC A0A0Q8LWE1.1
#=GS A0A124ID93_9ACTN/400-606    AC A0A124ID93.1
#=GS W1EBE7_KLEPN/403-486        AC W1EBE7.1
#=GS A0A0F5FL22_9RHIZ/402-592    AC A0A0F5FL22.1
#=GS A0A0F7FZI5_9ACTN/405-612    AC A0A0F7FZI5.1
#=GS R6DNE5_9CLOT/397-597        AC R6DNE5.1
#=GS Q5WC61_BACSK/410-615        AC Q5WC61.1
#=GS W0J5C1_9BACT/411-627        AC W0J5C1.1
#=GS A0A0P1ILZ9_9RHOB/401-589    AC A0A0P1ILZ9.1
#=GS F4H0Q1_CELFA/398-450        AC F4H0Q1.1
#=GS R6V5H1_9FIRM/392-601        AC R6V5H1.1
#=GS D2Q7E1_BIFDB/399-608        AC D2Q7E1.1
#=GS A0A0J7Z8J3_STRVR/407-614    AC A0A0J7Z8J3.1
#=GS E8V1U8_TERSS/428-637        AC E8V1U8.1
#=GS A0A0S9C965_9SPHN/400-501    AC A0A0S9C965.1
#=GS D9WB90_9ACTN/393-600        AC D9WB90.1
#=GS D3EK58_GEOS4/397-608        AC D3EK58.1
#=GS D1CIF9_THET1/394-600        AC D1CIF9.1
#=GS A0A0Q7KDS1_9ACTN/396-598    AC A0A0Q7KDS1.1
#=GS A0A086ZSV3_9BIFI/584-664    AC A0A086ZSV3.1
#=GS A0A0N1L4H7_9SPHN/421-627    AC A0A0N1L4H7.1
#=GS A0A0R1SFV3_9LACO/392-617    AC A0A0R1SFV3.1
#=GS R5NB78_9FIRM/397-610        AC R5NB78.1
#=GS F8A204_CELGA/397-603        AC F8A204.1
#=GS U2B639_9CLOT/403-487        AC U2B639.1
#=GS E6TY00_BACCJ/405-618        AC E6TY00.1
#=GS A0A176U3K1_9FIRM/402-610    AC A0A176U3K1.1
#=GS R9LKD7_9FIRM/392-601        AC R9LKD7.1
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#=GS A0A0R2A592_9LACO/1-77       AC A0A0R2A592.1
#=GS A0A0W1R3D4_9EURY/409-615    AC A0A0W1R3D4.1
#=GS A0A077M9E8_9MICO/396-597    AC A0A077M9E8.1
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#=GS A0A089IME0_9BACL/405-619    AC A0A089IME0.1
#=GS D7CBN4_STRBB/405-601        AC D7CBN4.1
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#=GS A0A0M3BN91_9RHIZ/367-477    AC A0A0M3BN91.1
#=GS A0A087E9H5_9BIFI/411-627    AC A0A087E9H5.1
#=GS A0A089LXS5_9BACL/404-616    AC A0A089LXS5.1
#=GS R5TV79_9FIRM/398-611        AC R5TV79.1
#=GS Q7CGV9_YERPE/403-616        AC Q7CGV9.1
#=GS D9XKB3_9ACTN/407-611        AC D9XKB3.1
#=GS R5QIR3_9FIRM/399-603        AC R5QIR3.1
#=GS E3EIY4_PAEPS/397-608        AC E3EIY4.1
#=GS V6JEL7_STRNV/405-604        AC V6JEL7.1
#=GS A0A0D7QUB4_9MICO/405-629    AC A0A0D7QUB4.1
#=GS B9JJS9_AGRRK/566-653        AC B9JJS9.1
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