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Database: Pfam
Entry: Glyco_hydro_42M
LinkDB: Glyco_hydro_42M
Original site: Glyco_hydro_42M 
#=GF ID   Glyco_hydro_42M
#=GF AC   PF08532.8
#=GF DE   Beta-galactosidase trimerisation domain
#=GF AU   Bateman A
#=GF SE   Pfam-B_2131 (release 5.4)
#=GF GA   24.10 24.10;
#=GF TC   24.20 24.10;
#=GF NC   23.90 24.00;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 17690987 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF WK   Glycoside_hydrolase_family_42
#=GF RN   [1]
#=GF RM   8577281
#=GF RT   Sequence analysis of flanking regions of the pfoA gene of
#=GF RT   Clostridium perfringens: beta-galactosidase gene (pbg) is
#=GF RT   located in the 3'-flanking region. 
#=GF RA   Shimizu T, Kobayashi T, Ba-Thein W, Ohtani K, Hayashi H; 
#=GF RL   Microbiol Immunol 1995;39:677-686.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   12215416
#=GF RT   Trimeric crystal structure of the glycoside hydrolase family 42
#=GF RT   beta-galactosidase from Thermus thermophilus A4 and the
#=GF RT   structure of its complex with galactose. 
#=GF RA   Hidaka M, Fushinobu S, Ohtsu N, Motoshima H, Matsuzawa H, Shoun
#=GF RA   H, Wakagi T; 
#=GF RL   J Mol Biol 2002;322:79-91.
#=GF DR   INTERPRO; IPR013738;
#=GF DR   SCOP; 1kwg; fa;
#=GF CC   This is non catalytic domain B of beta-galactosidase enzymes
#=GF CC   belong to the glycosyl hydrolase 42 family. This domain is
#=GF CC   related to glutamine amidotransferase enzymes, but the catalytic
#=GF CC   residues are replaced by non functional amino acids. This domain
#=GF CC   is involved in trimerisation [1].
#=GF SQ   865
#=GS C5AM14_BURGB/404-598      AC C5AM14.1
#=GS C6LHY7_9FIRM/408-614      AC C6LHY7.1
#=GS H6NIQ8_9BACL/397-608      AC H6NIQ8.1
#=GS A0A0F4RAI8_9GAMM/410-602  AC A0A0F4RAI8.1
#=GS A0A0N1FWJ2_9ACTN/398-600  AC A0A0N1FWJ2.1
#=GS U5W266_9ACTN/406-606      AC U5W266.1
#=GS A0A0F2TCB6_9ACTN/400-603  AC A0A0F2TCB6.1
#=GS A0A0B5E667_9RHOB/367-478  AC A0A0B5E667.1
#=GS U5VY38_9ACTN/389-587      AC U5VY38.1
#=GS I0HFC0_ACTM4/394-592      AC I0HFC0.1
#=GS A0A0M2HH21_9MICO/405-584  AC A0A0M2HH21.1
#=GS A0A0F5K0J7_9BURK/405-599  AC A0A0F5K0J7.1
#=GS B8DWB0_BIFA0/415-627      AC B8DWB0.1
#=GS C4IHE9_CLOBU/410-622      AC C4IHE9.1
#=GS R7D5Q1_9FIRM/389-598      AC R7D5Q1.1
#=GS C4FH29_9BIFI/443-658      AC C4FH29.1
#=GS D6D9M5_BIFLN/409-621      AC D6D9M5.1
#=GS Q0FG15_9RHOB/400-584      AC Q0FG15.1
#=GS D1CHJ6_THET1/376-432      AC D1CHJ6.1
#=GS H1YA89_9SPHI/353-613      AC H1YA89.1
#=GS A0A089M926_9BACL/405-619  AC A0A089M926.1
#=GS A0A0N0MLM4_9ACTN/413-639  AC A0A0N0MLM4.1
#=GS A0A0N0T8C6_9NOCA/390-593  AC A0A0N0T8C6.1
#=GS B1Y1P1_LEPCP/413-613      AC B1Y1P1.1
#=GS D3PP13_MEIRD/399-591      AC D3PP13.1
#=GS D2BD44_STRRD/389-587      AC D2BD44.1
#=GS A0A0M9GNW5_9RHOB/412-604  AC A0A0M9GNW5.1
#=GS Q8RDH1_CALS4/382-535      AC Q8RDH1.1
#=GS S5ZMR6_9CREN/336-496      AC S5ZMR6.1
#=GS A0A0H4L1S8_9RHOB/392-515  AC A0A0H4L1S8.1
#=GS F7KHG3_9FIRM/396-611      AC F7KHG3.1
#=GS A0A0N0SK13_9ACTN/394-592  AC A0A0N0SK13.1
#=GS A0A0H4CEW7_9ACTN/400-606  AC A0A0H4CEW7.1
#=GS A0A0D5LM90_9RHIZ/370-476  AC A0A0D5LM90.1
#=GS A6W513_KINRD/393-596      AC A6W513.1
#=GS J1YT57_9ENTR/403-616      AC J1YT57.1
#=GS A0A0N0V3E0_9RHOB/401-589  AC A0A0N0V3E0.1
#=GS W0JB17_9BACT/792-954      AC W0JB17.1
#=GS F3ZVQ2_MAHA5/368-493      AC F3ZVQ2.1
#=GS R6GJZ1_9FIRM/404-612      AC R6GJZ1.1
#=GS A6WA74_KINRD/433-550      AC A6WA74.1
#=GS G9RU95_9FIRM/395-608      AC G9RU95.1
#=GS A0A0N1GPZ7_9ACTN/399-597  AC A0A0N1GPZ7.1
#=GS B5I1U0_9ACTN/411-630      AC B5I1U0.1
#=GS A0A089M873_9BACL/388-597  AC A0A089M873.1
#=GS C9A7I9_ENTCA/394-601      AC C9A7I9.1
#=GS M9R0Z3_9RHOB/410-595      AC M9R0Z3.1
#=GS A0A0F5LMA9_9RHIZ/402-593  AC A0A0F5LMA9.1
#=GS R5HSX1_9FIRM/398-603      AC R5HSX1.1
#=GS A1WNH3_VEREI/33-170       AC A1WNH3.1
#=GS A0A097EJM0_9SPHN/417-626  AC A0A097EJM0.1
#=GS Q28KL5_JANSC/402-590      AC Q28KL5.1
#=GS F9PN85_9ACTO/408-544      AC F9PN85.1
#=GS R5CE10_9FIRM/430-614      AC R5CE10.1
#=GS C4ZF63_AGARV/395-601      AC C4ZF63.1
#=GS I3VXS9_THESW/375-535      AC I3VXS9.1
#=GS B8E215_DICTD/402-617      AC B8E215.1
#=GS A0A0M8VTB9_9ACTN/392-598  AC A0A0M8VTB9.1
#=GS A8LIC7_DINSH/402-590      AC A8LIC7.1
#=GS K4RF33_9ACTN/400-606      AC K4RF33.1
#=GS A0A0M2Z4E1_9ACTN/400-606  AC A0A0M2Z4E1.1
#=GS A0A0J7ZMH4_STRVR/397-609  AC A0A0J7ZMH4.1
#=GS D2PY42_KRIFD/354-452      AC D2PY42.1
#=GS BGAL2_BACLD/397-603       AC Q65CX4.2
#=GS A0A0F0CLA0_9CLOT/398-609  AC A0A0F0CLA0.1
#=GS J2KVJ4_9RHIZ/554-644      AC J2KVJ4.1
#=GS R7ITD6_9FIRM/402-616      AC R7ITD6.1
#=GS A7HK51_FERNB/378-566      AC A7HK51.1
#=GS D4BMY8_BIFBR/409-621      AC D4BMY8.1
#=GS R5JQ47_9BACE/407-609      AC R5JQ47.1
#=GS D3Q0A9_STANL/396-606      AC D3Q0A9.1
#=GS A0A0M1UWM5_CLOSO/367-447  AC A0A0M1UWM5.1
#=GS A0A0F2C3W4_9MICO/412-624  AC A0A0F2C3W4.1
#=GS A0A0M2Z764_9ACTN/402-604  AC A0A0M2Z764.1
#=GS B9NVL6_9RHOB/401-588      AC B9NVL6.1
#=GS BGAL_ALIAD/402-615        AC C8WV58.1
#=GS A9BHE4_PETMO/403-616      AC A9BHE4.1
#=GS D4LQJ0_9FIRM/389-598      AC D4LQJ0.1
#=GS A0A089LQI8_9BACL/3-79     AC A0A089LQI8.1
#=GS A0A0M2HDH9_9MICO/404-614  AC A0A0M2HDH9.1
#=GS A0A078KQK6_9FIRM/405-618  AC A0A078KQK6.1
#=GS A0A0M9YSY6_9ACTN/414-643  AC A0A0M9YSY6.1
#=GS A0A0F0H1B5_NOCAE/390-592  AC A0A0F0H1B5.1
#=GS A0A0F0ENV3_9MICO/396-599  AC A0A0F0ENV3.1
#=GS B0RI81_CLAMS/407-609      AC B0RI81.1
#=GS C1F4W7_ACIC5/396-607      AC C1F4W7.1
#=GS R6PRX4_9CLOT/367-434      AC R6PRX4.1
#=GS A0A0F5FGU5_9RHIZ/378-497  AC A0A0F5FGU5.1
#=GS A0A0M9YSH8_9ACTN/400-611  AC A0A0M9YSH8.1
#=GS A6LST4_CLOB8/412-625      AC A6LST4.1
#=GS D9X0J7_STRVT/398-601      AC D9X0J7.1
#=GS A1R3V3_ARTAT/407-614      AC A1R3V3.1
#=GS A0A0M3DA67_9MICO/403-610  AC A0A0M3DA67.1
#=GS A0A0G0MHE0_9BACT/406-594  AC A0A0G0MHE0.1
#=GS F8DDJ1_HALXS/398-602      AC F8DDJ1.1
#=GS R6ZIR7_9FIRM/401-606      AC R6ZIR7.1
#=GS F0YVX0_9CLOT/397-603      AC F0YVX0.1
#=GS A0A0H4CDT6_9ACTN/395-594  AC A0A0H4CDT6.1
#=GS A0A0N1NUL3_9ACTN/408-612  AC A0A0N1NUL3.1
#=GS A0A0M2HW53_9MICO/408-624  AC A0A0M2HW53.1
#=GS C7PZM2_CATAD/412-615      AC C7PZM2.1
#=GS D6TI39_9CHLR/394-607      AC D6TI39.1
#=GS A0A0F0GS06_NOCAE/391-594  AC A0A0F0GS06.1
#=GS A0A0J8C6Q7_STRVR/397-599  AC A0A0J8C6Q7.1
#=GS G4HKR0_9BACL/397-608      AC G4HKR0.1
#=GS R6DZ39_9BACE/436-646      AC R6DZ39.1
#=GS F4H158_CELFA/400-603      AC F4H158.1
#=GS R6KST9_9FIRM/397-610      AC R6KST9.1
#=GS A0A0N1FTQ6_9ACTN/396-595  AC A0A0N1FTQ6.1
#=GS A0Z894_9GAMM/417-610      AC A0Z894.1
#=GS F7YX66_9THEM/362-544      AC F7YX66.1
#=GS D5WIQ3_BURSC/404-604      AC D5WIQ3.1
#=GS D7CDJ7_STRBB/395-597      AC D7CDJ7.1
#=GS K6TXJ5_9CLOT/412-625      AC K6TXJ5.1
#=GS J0WZH0_9BIFI/452-660      AC J0WZH0.1
#=GS F7KDI6_9FIRM/404-610      AC F7KDI6.1
#=GS C1F307_ACIC5/488-697      AC C1F307.1
#=GS A0A0N0SM47_9ACTN/416-618  AC A0A0N0SM47.1
#=GS I5AUJ4_EUBCE/257-468      AC I5AUJ4.1
#=GS C6WI75_ACTMD/392-585      AC C6WI75.1
#=GS H8E0V5_9MICO/408-612      AC H8E0V5.1
#=GS G2TH90_BACCO/392-597      AC G2TH90.1
#=GS R5HUA4_9FIRM/404-619      AC R5HUA4.1
#=GS G2SXF1_ROSHA/390-595      AC G2SXF1.1
#=GS B0K7Y4_THEP3/374-529      AC B0K7Y4.1
#=GS D5ZUE2_9ACTN/399-598      AC D5ZUE2.1
#=GS D4BMM7_BIFBR/411-630      AC D4BMM7.1
#=GS R5JGR5_9BACE/378-589      AC R5JGR5.1
#=GS F8EWQ4_TRECH/399-625      AC F8EWQ4.1
#=GS D1C035_XYLCX/396-606      AC D1C035.1
#=GS E8W104_STRFA/401-603      AC E8W104.1
#=GS R6KUZ7_9BACE/430-641      AC R6KUZ7.1
#=GS E8NDZ3_MICTS/411-613      AC E8NDZ3.1
#=GS A0A059W8B6_STRA9/388-606  AC A0A059W8B6.1
#=GS Q165E8_ROSDO/406-592      AC Q165E8.1
#=GS A0A0E3WHQ0_9BACL/406-617  AC A0A0E3WHQ0.1
#=GS A0A0A7I441_9BIFI/435-652  AC A0A0A7I441.1
#=GS D9SMP5_CLOC7/398-609      AC D9SMP5.1
#=GS R6EFE1_9FIRM/405-612      AC R6EFE1.1
#=GS D6YQA1_PANVC/403-616      AC D6YQA1.1
#=GS L0E8Q4_THECK/389-597      AC L0E8Q4.1
#=GS F2ADR7_RHIET/450-574      AC F2ADR7.1
#=GS D5ZQP4_9ACTN/1-59         AC D5ZQP4.1
#=GS Q03XA8_LEUMM/407-613      AC Q03XA8.1
#=GS R9P080_PSEHS/496-718      AC R9P080.1
#=GS M5GCD2_DACSP/363-464      AC M5GCD2.1
#=GS A0A0C5L9R9_9SPHN/421-627  AC A0A0C5L9R9.1
#=GS A0A0M8Y1B0_9PSEU/398-598  AC A0A0M8Y1B0.1
#=GS A0A0M2S826_9ACTN/404-606  AC A0A0M2S826.1
#=GS D1BB58_SANKS/425-636      AC D1BB58.1
#=GS W0J217_9BACT/414-591      AC W0J217.1
#=GS B8HFB8_ARTCA/406-608      AC B8HFB8.1
#=GS R7JN37_9FIRM/393-599      AC R7JN37.1
#=GS D6D9W7_BIFLN/411-630      AC D6D9W7.1
#=GS A0A0F5L6P9_9RHIZ/404-594  AC A0A0F5L6P9.1
#=GS C9AAJ9_ENTCA/391-595      AC C9AAJ9.2
#=GS I2GE88_9BACT/450-655      AC I2GE88.1
#=GS A0A0M9X9Q8_9ACTN/408-612  AC A0A0M9X9Q8.1
#=GS R4LQA5_9ACTN/404-604      AC R4LQA5.1
#=GS A4XI97_CALS8/400-611      AC A4XI97.1
#=GS H0QLE3_ARTGO/407-611      AC H0QLE3.1
#=GS D2UGE6_XANAP/411-617      AC D2UGE6.1
#=GS H6NAB3_9BACL/404-617      AC H6NAB3.1
#=GS A0A0F5FL22_9RHIZ/402-592  AC A0A0F5FL22.1
#=GS A0A0F7FZI5_9ACTN/405-612  AC A0A0F7FZI5.1
#=GS A0A0F7N1Q6_9ACTN/389-593  AC A0A0F7N1Q6.1
#=GS R6DNE5_9CLOT/397-597      AC R6DNE5.1
#=GS Q5WC61_BACSK/410-615      AC Q5WC61.1
#=GS H3SN19_9BACL/368-438      AC H3SN19.1
#=GS W0J5C1_9BACT/411-627      AC W0J5C1.1
#=GS A0A0M2GEA8_9ACTN/400-606  AC A0A0M2GEA8.1
#=GS C7Q359_CATAD/394-600      AC C7Q359.1
#=GS E8N5L4_ANATU/389-596      AC E8N5L4.1
#=GS F4H0Q1_CELFA/398-450      AC F4H0Q1.1
#=GS R6V5H1_9FIRM/392-601      AC R6V5H1.1
#=GS D2Q7E1_BIFDB/399-608      AC D2Q7E1.1
#=GS R6JUR9_9CLOT/1-49         AC R6JUR9.1
#=GS A0A0J7Z8J3_STRVR/407-614  AC A0A0J7Z8J3.1
#=GS E8V1U8_TERSS/428-637      AC E8V1U8.1
#=GS D9WB90_9ACTN/393-600      AC D9WB90.1
#=GS D3EK58_GEOS4/397-608      AC D3EK58.1
#=GS A0A0N1NB45_9ACTN/90-262   AC A0A0N1NB45.1
#=GS D1CIF9_THET1/394-600      AC D1CIF9.1
#=GS S2E4H9_9BACT/51-141       AC S2E4H9.1
#=GS A0A0N1L4H7_9SPHN/421-627  AC A0A0N1L4H7.1
#=GS D7CF76_STRBB/394-593      AC D7CF76.1
#=GS R5NB78_9FIRM/397-610      AC R5NB78.1
#=GS F8A204_CELGA/397-603      AC F8A204.1
#=GS R5RRQ8_9FIRM/397-610      AC R5RRQ8.1
#=GS E6TY00_BACCJ/405-618      AC E6TY00.1
#=GS C9YYM0_STRSW/403-632      AC C9YYM0.1
#=GS D2QHI8_SPILD/421-630      AC D2QHI8.1
#=GS R5HRQ6_9FIRM/397-610      AC R5HRQ6.1
#=GS Q9L152_STRCO/408-612      AC Q9L152.1
#=GS H1LIE2_9LACO/392-617      AC H1LIE2.1
#=GS Q5FJD5_LACAC/406-611      AC Q5FJD5.1
#=GS A6THC9_KLEP7/389-600      AC A6THC9.1
#=GS A0A0M2HM82_9MICO/386-609  AC A0A0M2HM82.1
#=GS R6LU47_9FIRM/404-607      AC R6LU47.1
#=GS A0A0F0KIH4_9MICO/398-604  AC A0A0F0KIH4.1
#=GS R5TIP1_9FIRM/408-615      AC R5TIP1.1
#=GS A1A2Q9_BIFAA/380-597      AC A1A2Q9.1
#=GS Q65NG1_BACLD/405-618      AC Q65NG1.1
#=GS E1TE37_BURSG/404-606      AC E1TE37.1
#=GS I0JRU8_HALH3/393-602      AC I0JRU8.1
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#=GS A0A0D5VI89_9BURK/404-612  AC A0A0D5VI89.1
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