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Database: Pfam
Entry: HORMA
LinkDB: HORMA
Original site: HORMA 
#=GF ID   HORMA
#=GF AC   PF02301.17
#=GF DE   HORMA domain
#=GF PI   MAD2; 
#=GF AU   Bateman A, Mian N
#=GF SE   [2]
#=GF GA   21.40 21.40;
#=GF TC   21.70 21.50;
#=GF NC   21.20 21.30;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 26740544 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF WK   HORMA_domain
#=GF RN   [1]
#=GF RM   9223296
#=GF RT   The Schizosaccharomyces pombe spindle checkpoint protein mad2p
#=GF RT   blocks anaphase and genetically interacts with the
#=GF RT   anaphase-promoting complex. 
#=GF RA   He X, Patterson TE, Sazer S; 
#=GF RL   Proc Natl Acad Sci U S A 1997;94:7965-7970.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   9757827
#=GF RT   The HORMA domain: a common structural denominator in mitotic
#=GF RT   checkpoints, chromosome synapsis and DNA repair. 
#=GF RA   Aravind L, Koonin EV; 
#=GF RL   Trends Biochem Sci 1998;23:284-286.
#=GF DR   INTERPRO; IPR003511;
#=GF DR   SCOP; 1duj; fa;
#=GF CC   The HORMA (for Hop1p, Rev7p and MAD2) domain has been suggested
#=GF CC   to recognise chromatin states that result from DNA adducts,
#=GF CC   double stranded breaks or non-attachment to the spindle and acts
#=GF CC   as an adaptor that recruits other proteins. MAD2 is a spindle
#=GF CC   checkpoint protein which prevents progression of the cell cycle
#=GF CC   upon detection of a defect in mitotic spindle integrity.
#=GF SQ   2110
#=GS Q76CY8_ORYSJ/17-223       AC Q76CY8.1
#=GS A0A0W7V9E4_9HYPO/48-250   AC A0A0W7V9E4.1
#=GS V5EIW2_KALBG/19-204       AC V5EIW2.1
#=GS D7TAX9_VITVI/1-134        AC D7TAX9.1
#=GS G3QJ92_GORGO/16-196       AC G3QJ92.1
#=GS A0A096N8I6_PAPAN/20-149   AC A0A096N8I6.1
#=GS W4IXP6_PLAFP/271-403      AC W4IXP6.1
#=GS A0A093IB07_PICPB/17-197   AC A0A093IB07.1
#=GS A0A067MJJ1_9HOMO/13-186   AC A0A067MJJ1.1
#=GS A0A0R3RTI4_9BILA/1-148    AC A0A0R3RTI4.1
#=GS A0A0A0ARD2_CHAVO/1-176    AC A0A0A0ARD2.1
#=GS A0A161W730_9PEZI/24-203   AC A0A161W730.1
#=GS G8ZVI1_TORDC/10-197       AC G8ZVI1.1
#=GS A0A132B371_9HELO/20-206   AC A0A132B371.1
#=GS A0A024UC57_9STRA/15-189   AC A0A024UC57.1
#=GS A0A024VP39_PLAFA/267-399  AC A0A024VP39.1
#=GS A0A093EIA3_TYTAL/1-123    AC A0A093EIA3.1
#=GS C3Y7J4_BRAFL/23-195       AC C3Y7J4.1
#=GS E9J3D4_SOLIN/16-201       AC E9J3D4.1
#=GS Q16Z52_AEDAE/14-193       AC Q16Z52.1
#=GS REV7_ARATH/14-150         AC Q94FL5.1
#=GS U1HHJ6_ENDPU/21-220       AC U1HHJ6.1
#=GS B9RI37_RICCO/13-138       AC B9RI37.1
#=GS A0A0P1B591_9STRA/16-191   AC A0A0P1B591.1
#=GS I4YHF6_WALMC/12-194       AC I4YHF6.1
#=GS A0A094HJ01_9PEZI/38-260   AC A0A094HJ01.1
#=GS I1MJ80_SOYBN/17-155       AC I1MJ80.1
#=GS A0A0D2WGQ2_CAPO3/156-271  AC A0A0D2WGQ2.1
#=GS A5DVK9_LODEL/15-227       AC A5DVK9.1
#=GS B7P291_IXOSC/17-193       AC B7P291.1
#=GS A0A094GHX7_9PEZI/41-242   AC A0A094GHX7.1
#=GS G3XMU9_ASPNA/19-215       AC G3XMU9.1
#=GS A0A074WLH0_9PEZI/14-211   AC A0A074WLH0.1
#=GS A0A091VB44_OPIHO/1-172    AC A0A091VB44.1
#=GS A0A0K9Q225_ZOSMR/18-224   AC A0A0K9Q225.1
#=GS A0A087GUI9_ARAAL/17-192   AC A0A087GUI9.1
#=GS I3JHG5_ORENI/16-135       AC I3JHG5.1
#=GS A0A166U2N7_9PEZI/94-295   AC A0A166U2N7.1
#=GS A0A067NSZ8_PLEOS/33-222   AC A0A067NSZ8.1
#=GS A0A024GPQ3_9STRA/128-266  AC A0A024GPQ3.1
#=GS L9L0A9_TUPCH/16-139       AC L9L0A9.1
#=GS F7W5N6_SORMK/25-231       AC F7W5N6.1
#=GS A0A091CLJ5_FUKDA/405-547  AC A0A091CLJ5.1
#=GS T1MP33_TRIUA/546-673      AC T1MP33.1
#=GS A0A0L7KVB9_9NEOP/15-71    AC A0A0L7KVB9.1
#=GS A0A0K6GAU3_9HOMO/32-187   AC A0A0K6GAU3.1
#=GS A0A0E9NQK1_9ASCO/21-206   AC A0A0E9NQK1.1
#=GS A0A0E9NI00_9ASCO/28-211   AC A0A0E9NI00.1
#=GS A0A091H0U8_BUCRH/15-114   AC A0A091H0U8.1
#=GS W5F720_WHEAT/1-170        AC W5F720.1
#=GS A0A0P7V6T1_9TELE/36-236   AC A0A0P7V6T1.1
#=GS A0A094FDX4_9PEZI/18-210   AC A0A094FDX4.1
#=GS R1CP37_EMIHU/14-196       AC R1CP37.1
#=GS M4ASW7_XIPMA/19-194       AC M4ASW7.1
#=GS A0A183H3C8_9BILA/7-176    AC A0A183H3C8.1
#=GS I1IZ16_BRADI/16-191       AC I1IZ16.1
#=GS A0A093GYT1_PICPB/15-114   AC A0A093GYT1.1
#=GS I1IZ17_BRADI/1-139        AC I1IZ17.1
#=GS A0A096RTG2_MAIZE/16-190   AC A0A096RTG2.1
#=GS A0A091ENR9_CORBR/15-129   AC A0A091ENR9.1
#=GS M4C3C3_HYAAE/16-193       AC M4C3C3.1
#=GS M4ED53_BRARP/15-154       AC M4ED53.1
#=GS A0A0N4TVQ6_BRUPA/28-207   AC A0A0N4TVQ6.1
#=GS A0A090N3C9_OSTTA/1-189    AC A0A090N3C9.1
#=GS E4WZD7_OIKDI/47-239       AC E4WZD7.1
#=GS A0A0N0DUZ6_9TRYP/13-199   AC A0A0N0DUZ6.1
#=GS A0A0C3DF31_9HOMO/17-196   AC A0A0C3DF31.1
#=GS G5C511_HETGA/16-107       AC G5C511.1
#=GS M3XZM6_MUSPF/26-220       AC M3XZM6.1
#=GS A0A0N8JVE3_9TELE/201-326  AC A0A0N8JVE3.1
#=GS MAD2_YEAST/10-193         AC P40958.1
#=GS G4VLQ7_SCHMA/28-223       AC G4VLQ7.1
#=GS K3X3Y8_PYTUL/31-208       AC K3X3Y8.1
#=GS A0A0S7DNG8_9EURO/22-206   AC A0A0S7DNG8.1
#=GS A0A091Q6Z5_LEPDC/12-204   AC A0A091Q6Z5.1
#=GS H1VLT3_COLHI/24-204       AC H1VLT3.1
#=GS A0A024VP39_PLAFA/21-187   AC A0A024VP39.1
#=GS W7JJ79_PLAFA/21-184       AC W7JJ79.1
#=GS G3NP64_GASAC/16-107       AC G3NP64.1
#=GS A0A067GQX0_CITSI/16-191   AC A0A067GQX0.1
#=GS G0RBL6_HYPJQ/30-238       AC G0RBL6.1
#=GS A0A091R7W4_9GRUI/12-210   AC A0A091R7W4.1
#=GS G2QGT8_MYCTT/23-240       AC G2QGT8.1
#=GS A0A0M8MM49_9BASI/23-184   AC A0A0M8MM49.1
#=GS E2AZ24_CAMFO/9-164        AC E2AZ24.1
#=GS Q0V3J3_PHANO/78-153       AC Q0V3J3.2
#=GS C4R6X7_KOMPG/30-119       AC C4R6X7.1
#=GS M9LWZ2_PSEA3/19-202       AC M9LWZ2.1
#=GS G8C253_TETPH/22-237       AC G8C253.1
#=GS A0A061IWD1_TRYRA/13-225   AC A0A061IWD1.1
#=GS I2FPP5_USTH4/19-211       AC I2FPP5.1
#=GS A0A0M3I9G6_ASCLU/29-158   AC A0A0M3I9G6.1
#=GS A0A094BF77_9PEZI/18-209   AC A0A094BF77.1
#=GS L2FJM6_COLGN/20-217       AC L2FJM6.1
#=GS A0A165J9Z3_9BASI/19-260   AC A0A165J9Z3.1
#=GS G2QWB6_THITE/20-187       AC G2QWB6.1
#=GS S8AFW0_DACHA/13-100       AC S8AFW0.1
#=GS HORM2_MOUSE/31-226        AC Q5SQP1.1
#=GS A0A096NJF9_PAPAN/1-128    AC A0A096NJF9.1
#=GS G4Z216_PHYSP/16-192       AC G4Z216.1
#=GS H0V7B9_CAVPO/26-222       AC H0V7B9.1
#=GS A0A0M3JX50_ANISI/16-193   AC A0A0M3JX50.2
#=GS V7BW62_PHAVU/14-158       AC V7BW62.1
#=GS E3LKP9_CAERE/38-240       AC E3LKP9.1
#=GS C5DMC4_LACTC/10-187       AC C5DMC4.1
#=GS Q4YDE0_PLABA/1-243        AC Q4YDE0.1
#=GS G4MXB1_MAGO7/23-222       AC G4MXB1.1
#=GS A0A0D2PKM1_GOSRA/16-191   AC A0A0D2PKM1.1
#=GS M4AY89_XIPMA/16-114       AC M4AY89.1
#=GS W9X009_9EURO/37-232       AC W9X009.1
#=GS J3MUU7_ORYBR/536-647      AC J3MUU7.1
#=GS A7SC91_NEMVE/14-137       AC A7SC91.1
#=GS L5LIE3_MYODS/16-181       AC L5LIE3.1
#=GS E4UNA7_ARTGP/18-212       AC E4UNA7.1
#=GS A0A0C3FWX1_9HOMO/13-145   AC A0A0C3FWX1.1
#=GS A0A059LMQ0_9CHLO/17-86    AC A0A059LMQ0.1
#=GS A0A1B6QDI1_SORBI/82-288   AC A0A1B6QDI1.1
#=GS A0A0H5SH13_BRUMA/28-195   AC A0A0H5SH13.1
#=GS E9FRZ1_DAPPU/18-197       AC E9FRZ1.1
#=GS G6D4R4_DANPL/15-199       AC G6D4R4.1
#=GS A0A137Q9C6_9AGAR/16-193   AC A0A137Q9C6.1
#=GS I3MEK0_ICTTR/16-114       AC I3MEK0.1
#=GS A0A075AU51_9FUNG/25-236   AC A0A075AU51.1
#=GS R4XC39_TAPDE/21-94        AC R4XC39.1
#=GS G3WDS9_SARHA/1-139        AC G3WDS9.1
#=GS A0A074YD33_9PEZI/22-254   AC A0A074YD33.1
#=GS M1BGZ1_SOLTU/20-186       AC M1BGZ1.1
#=GS A0A178EPQ9_9PLEO/27-219   AC A0A178EPQ9.1
#=GS A0A067TNX0_9AGAR/16-194   AC A0A067TNX0.1
#=GS A0A0M9F273_9HYPO/25-219   AC A0A0M9F273.1
#=GS W4KMH5_9HOMO/1-122        AC W4KMH5.1
#=GS V7D244_PHAVU/17-224       AC V7D244.1
#=GS K9GSW6_PEND2/18-213       AC K9GSW6.1
#=GS A0A0J8R9L9_COCIT/66-277   AC A0A0J8R9L9.1
#=GS A0A0D0DXF4_9HOMO/13-139   AC A0A0D0DXF4.1
#=GS A0A0E0PAS0_ORYRU/61-230   AC A0A0E0PAS0.1
#=GS A0A094HQP2_9PEZI/18-210   AC A0A094HQP2.1
#=GS A0A067QIE5_9HOMO/11-143   AC A0A067QIE5.1
#=GS Q6FPT5_CANGA/10-185       AC Q6FPT5.1
#=GS G1NBA4_MELGA/31-226       AC G1NBA4.2
#=GS A0A067T0V4_9AGAR/18-265   AC A0A067T0V4.1
#=GS A0A0C3DX43_9PEZI/20-214   AC A0A0C3DX43.1
#=GS H2RNK1_TAKRU/26-220       AC H2RNK1.1
#=GS F0Y047_AURAN/63-207       AC F0Y047.1
#=GS F7B4K7_MACMU/26-213       AC F7B4K7.1
#=GS Q7PRP2_ANOGA/14-197       AC Q7PRP2.5
#=GS G8Y3E2_PICSO/9-187        AC G8Y3E2.1
#=GS U5H5V5_USTV1/16-215       AC U5H5V5.1
#=GS A0A0W8C055_PHYNI/1-140    AC A0A0W8C055.1
#=GS A0A0W4ZBU4_PNECA/18-200   AC A0A0W4ZBU4.1
#=GS A0A150UYK2_9PEZI/27-220   AC A0A150UYK2.1
#=GS A0A139HZ88_9PEZI/25-252   AC A0A139HZ88.1
#=GS H2APX9_KAZAF/25-238       AC H2APX9.1
#=GS B6HJM1_PENRW/22-215       AC B6HJM1.1
#=GS A0A0W4ZK39_PNEJI/18-207   AC A0A0W4ZK39.1
#=GS A0A0P4UL26_ROSNE/24-263   AC A0A0P4UL26.1
#=GS H9JT72_BOMMO/7-195        AC H9JT72.1
#=GS K5XL66_AGABU/13-154       AC K5XL66.1
#=GS W5AV28_WHEAT/126-292      AC W5AV28.1
#=GS C5FL88_ARTOC/61-296       AC C5FL88.1
#=GS A0A0G4MWZ9_9PEZI/22-214   AC A0A0G4MWZ9.1
#=GS F1QHN1_DANRE/13-193       AC F1QHN1.1
#=GS K0RKF8_THAOC/17-217       AC K0RKF8.1
#=GS G7PF60_MACFA/31-228       AC G7PF60.1
#=GS F1S1S9_PIG/16-196         AC F1S1S9.1
#=GS A0A078ILV6_BRANA/15-154   AC A0A078ILV6.1
#=GS A0A0C2C5T8_9BILA/1-203    AC A0A0C2C5T8.1
#=GS A0A0R3U262_9CEST/1-55     AC A0A0R3U262.1
#=GS B8C8Y6_THAPS/204-473      AC B8C8Y6.1
#=GS A0A0E0B515_9ORYZ/17-222   AC A0A0E0B515.1
#=GS G3IEL3_CRIGR/16-196       AC G3IEL3.1
#=GS A0A194RBD4_PAPMA/15-199   AC A0A194RBD4.1
#=GS M5CBX1_THACB/18-198       AC M5CBX1.1
#=GS G8B898_CANPC/11-204       AC G8B898.1
#=GS A0A091QB79_MERNU/12-80    AC A0A091QB79.1
#=GS A0A091LR53_CARIC/12-203   AC A0A091LR53.1
#=GS H0XIZ7_OTOGA/16-196       AC H0XIZ7.1
#=GS B3M3L5_DROAN/16-195       AC B3M3L5.1
#=GS A0A094HP82_9PEZI/19-230   AC A0A094HP82.1
#=GS H2QQ35_PANTR/16-196       AC H2QQ35.1
#=GS A5JZ85_PLAVS/21-252       AC A5JZ85.1
#=GS A0A0V0VXU7_9BILA/330-498  AC A0A0V0VXU7.1
#=GS A0A0V1N964_9BILA/44-240   AC A0A0V1N964.1
#=GS A0A094D3T4_9PEZI/18-210   AC A0A094D3T4.1
#=GS A0A024USX6_9STRA/21-199   AC A0A024USX6.1
#=GS A0A0A0LQV9_CUCSA/1-171    AC A0A0A0LQV9.1
#=GS A0A0D9ZMC9_9ORYZ/16-191   AC A0A0D9ZMC9.1
#=GS Q5A928_CANAL/12-211       AC Q5A928.1
#=GS E9F1C9_METRA/31-215       AC E9F1C9.1
#=GS F1MS88_BOVIN/31-226       AC F1MS88.1
#=GS R4XCU9_TAPDE/1-135        AC R4XCU9.1
#=GS B0CPG1_LACBS/16-195       AC B0CPG1.1
#=GS A0A165YJT2_9HOMO/33-226   AC A0A165YJT2.1
#=GS A0A0C9Y2R5_9AGAR/32-276   AC A0A0C9Y2R5.1
#=GS A0A0V0TG71_9BILA/25-221   AC A0A0V0TG71.1
#=GS A0A183QC91_9TREM/14-160   AC A0A183QC91.1
#=GS F9X568_ZYMTI/25-234       AC F9X568.1
#=GS A0A074Y4G6_9PEZI/24-214   AC A0A074Y4G6.1
#=GS H3D002_TETNG/16-111       AC H3D002.1
#=GS A0A0L6V532_9BASI/33-220   AC A0A0L6V532.1
#=GS F7GB10_MONDO/16-196       AC F7GB10.1
#=GS A0A0K6FUB5_9HOMO/15-156   AC A0A0K6FUB5.1
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#=GS A0A094EX13_9PEZI/40-257   AC A0A094EX13.1
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