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Database: Pfam
Entry: Herpes_ori_bp
LinkDB: Herpes_ori_bp
Original site: Herpes_ori_bp 
#=GF ID   Herpes_ori_bp
#=GF AC   PF02399.14
#=GF DE   Origin of replication binding protein
#=GF AU   Mian N, Bateman A
#=GF SE   Pfam-B_1518 (release 5.4)
#=GF GA   19.40 19.40;
#=GF TC   19.40 19.40;
#=GF NC   19.30 19.20;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 26740544 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   7941342
#=GF RT   Nucleotide sequence analysis of a 21-kbp region of the genome of
#=GF RT   human herpesvirus-6 containing homologues of human
#=GF RT   cytomegalovirus major immediate-early and replication genes. 
#=GF RA   Nicholas J; 
#=GF RL   Virology 1994;204:738-750.
#=GF DR   INTERPRO; IPR003450;
#=GF CC   This Pfam family represents the herpesvirus origin of
#=GF CC   replication binding protein, probably involved in DNA
#=GF CC   replication.
#=GF SQ   89
#=GS A0A015JNQ3_9GLOM/402-592    AC A0A015JNQ3.1
#=GS A0A0U9HKD2_KLEFL/1232-1337  AC A0A0U9HKD2.1
#=GS YR001_MIMIV/111-282         AC Q5UP78.1
#=GS A0A015KI34_9GLOM/7-109      AC A0A015KI34.1
#=GS PRIM_ASFB7/553-696          AC Q65146.1
#=GS A0A0A6P0R3_9GAMM/73-297     AC A0A0A6P0R3.1
#=GS U9TCS9_RHIID/463-637        AC U9TCS9.1
#=GS OBP_HHV6U/3-780             AC P52378.1
#=GS A0A015LHW1_9GLOM/234-404    AC A0A015LHW1.1
#=GS G9EQF2_9GAMM/401-588        AC G9EQF2.1
#=GS K9QV03_NOSS7/34-242         AC K9QV03.1
#=GS D2XAI8_GBMV/699-820         AC D2XAI8.1
#=GS A0A015ISW8_9GLOM/172-351    AC A0A015ISW8.1
#=GS K4JYG0_ABHV/507-688         AC K4JYG0.1
#=GS B1X397_CYAA5/359-562        AC B1X397.1
#=GS OBP_GAHVM/3-834             AC Q9E6Q7.1
#=GS A0A0V7ZUQ2_9CYAN/333-487    AC A0A0V7ZUQ2.1
#=GS U9TAF6_RHIID/219-410        AC U9TAF6.1
#=GS U9U3Z3_RHIID/86-225         AC U9U3Z3.1
#=GS A0A0L0CHT0_LUCCU/1067-1267  AC A0A0L0CHT0.1
#=GS K1P1J1_CRAGI/214-597        AC K1P1J1.1
#=GS Q4C0J3_CROWT/478-660        AC Q4C0J3.1
#=GS R4SKF5_AMYOR/15-57          AC R4SKF5.1
#=GS OBP_PSHV1/18-879            AC Q6UDH3.1
#=GS A8TC50_9VIBR/21-191         AC A8TC50.1
#=GS A0A015JYM0_9GLOM/485-588    AC A0A015JYM0.1
#=GS G2H1Q2_9ENTR/330-532        AC G2H1Q2.1
#=GS U9SU53_RHIID/5-150          AC U9SU53.1
#=GS A0A0S3PBL4_9NOSO/285-490    AC A0A0S3PBL4.1
#=GS U9SIF8_RHIID/19-216         AC U9SIF8.1
#=GS A0A0U9I7T9_KLEFL/1246-1470  AC A0A0U9I7T9.1
#=GS U9TRQ5_RHIID/478-645        AC U9TRQ5.1
#=GS U9TRQ2_RHIID/395-498        AC U9TRQ2.1
#=GS A0A015L2A6_9GLOM/112-251    AC A0A015L2A6.1
#=GS A0A0L0HP67_SPIPN/378-553    AC A0A0L0HP67.1
#=GS A0A0L0SS18_ALLMA/216-632    AC A0A0L0SS18.1
#=GS A0A0C1QLH5_9CYAN/384-615    AC A0A0C1QLH5.1
#=GS K9W776_9CYAN/529-708        AC K9W776.1
#=GS A0A0B7N7V2_9FUNG/58-216     AC A0A0B7N7V2.1
#=GS K9W2G6_9CYAN/191-383        AC K9W2G6.1
#=GS A0A0D6YF76_MASLA/301-640    AC A0A0D6YF76.1
#=GS A0A0D6Y9N6_MASLA/103-282    AC A0A0D6Y9N6.1
#=GS A0A0V7ZCK5_9CYAN/325-546    AC A0A0V7ZCK5.1
#=GS OBP_HHV2H/44-860            AC P89432.2
#=GS YR008_MIMIV/541-716         AC Q5UP79.1
#=GS H0J8S0_9PSED/158-341        AC H0J8S0.1
#=GS U9SGB7_RHIID/3-203          AC U9SGB7.1
#=GS W6FRN7_NODSP/412-576        AC W6FRN7.1
#=GS W1HYU6_KLEPN/53-260         AC W1HYU6.1
#=GS G0FV88_AMYMS/30-67          AC G0FV88.1
#=GS U9TRR1_RHIID/427-594        AC U9TRR1.1
#=GS U9TD65_RHIID/192-296        AC U9TD65.1
#=GS A0A139DIU4_9ALTE/303-498    AC A0A139DIU4.1
#=GS A0A0C2PN49_9CYAN/301-477    AC A0A0C2PN49.1
#=GS B7KLN6_CYAP7/335-509        AC B7KLN6.1
#=GS U9SGC8_RHIID/7-151          AC U9SGC8.1
#=GS U9UJ52_RHIID/404-509        AC U9UJ52.1
#=GS YR008_MIMIV/385-560         AC Q5UP79.1
#=GS I0XR69_9LEPT/129-356        AC I0XR69.1
#=GS OBP_HHV6Z/3-780             AC P52452.1
#=GS OBP_HHV11/26-844            AC P10193.1
#=GS PRIM_ASFB7/376-557          AC Q65146.1
#=GS R0KT75_NOSB1/165-308        AC R0KT75.1
#=GS A0A015K535_9GLOM/1-142      AC A0A015K535.1
#=GS YR001_MIMIV/271-440         AC Q5UP78.1
#=GS A0A015K4S0_9GLOM/291-458    AC A0A015K4S0.1
#=GS A0A0C1RDV6_9CYAN/308-500    AC A0A0C1RDV6.1
#=GS A0A098G9T0_9GAMM/397-613    AC A0A098G9T0.1
#=GS A0A0D6YMQ0_MASLA/6-239      AC A0A0D6YMQ0.1
#=GS Y115_OSHVF/3-105            AC Q6R7B1.1
#=GS A0A138ZX15_GONPR/451-800    AC A0A138ZX15.1
#=GS A0A0V7ZGF6_9CYAN/424-643    AC A0A0V7ZGF6.1
#=GS K9XAG3_9NOST/454-658        AC K9XAG3.1
#=GS OBP_BPT5/368-543            AC Q6QGH9.1
#=GS A0A081NHD6_9GAMM/291-608    AC A0A081NHD6.1
#=GS B7KMM2_CYAP7/335-506        AC B7KMM2.1
#=GS U9TDF6_RHIID/473-645        AC U9TDF6.1
#=GS A0A015LEE0_9GLOM/4-147      AC A0A015LEE0.1
#=GS OBP_VZVD/12-828             AC P09299.1
#=GS A0A015LNN7_9GLOM/506-683    AC A0A015LNN7.1
#=GS U9SZ72_RHIID/44-337         AC U9SZ72.1
#=GS U9T9K0_RHIID/388-499        AC U9T9K0.1
#=GS U9STD1_RHIID/4-147          AC U9STD1.1
#=GS A0A015I4A9_9GLOM/3-102      AC A0A015I4A9.1
#=GS U9T1P1_RHIID/223-396        AC U9T1P1.1
#=GS D2XAI8_GBMV/519-716         AC D2XAI8.1
#=GS F7QH80_9BRAD/304-487        AC F7QH80.1
#=GS S6L188_9PSED/178-335        AC S6L188.1
#=GS A0A015ISL0_9GLOM/486-654    AC A0A015ISL0.1
A0A015JNQ3_9GLOM/402-592               ......................tvdpklsvdtsadcllssasiikyssdsmedyelv------------------------..--.---...------.-------.-...------PTLLVRGNMGLGKTKTL..RR.Y..LDNYF.P.RnatR.EP.V....I...R....FV......TFRQTFSQS....LQQLF-.-.-.--P.DF..TS..YKDI......A.L.GG.IC...QA..DFPRV..IVQV...ES..LH..R.I.....iI..........P.......S.E.........H.........K.........P.........I..D..VLV.........LDEVE.S.TL.AQ.F.S.S...G....L..H..K..H.....FS.S..AF...A....A....F..K.WM....LSTARHVVCMDANLG.ARTIKTLRRM.R-..-.-.-..-.----------.-....-......---------------------.......................--------------.-----.....---.-.------------.---..........---.--------.-----..-------....-.....---.....---...----........--..------------------.-.-.----------.----------.....---------------------------..---...---------------------------------------...---------------------------------------------------..----...-------------------------..............------------------...---------..-------..------------.--------------...--.........--------------------------.........---.-------------------------------------------------------------.----------------------------------------.--------...-----------------------------------------------------------------------.--------------------..--------.------------------alpm...............................................................................................................................
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