GenomeNet

Database: Pfam
Entry: Herpes_ori_bp
LinkDB: Herpes_ori_bp
Original site: Herpes_ori_bp 
#=GF ID   Herpes_ori_bp
#=GF AC   PF02399.10
#=GF DE   Origin of replication binding protein
#=GF AU   Mian N, Bateman A
#=GF SE   Pfam-B_1518 (release 5.4)
#=GF GA   19.40 19.40;
#=GF TC   19.40 19.40;
#=GF NC   19.30 19.30;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 23193494 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   7941342
#=GF RT   Nucleotide sequence analysis of a 21-kbp region of the genome of
#=GF RT   human herpesvirus-6 containing homologues of human
#=GF RT   cytomegalovirus major immediate-early and replication genes. 
#=GF RA   Nicholas J; 
#=GF RL   Virology 1994;204:738-750.
#=GF DR   INTERPRO; IPR003450;
#=GF CC   This Pfam family represents the herpesvirus origin of
#=GF CC   replication binding protein, probably involved in DNA
#=GF CC   replication.
#=GF SQ   207
#=GS E2IKY5_ELHV1/240-803  AC E2IKY5.1
#=GS G9CUB6_9ALPH/1-481    AC G9CUB6.1
#=GS G3A630_9RALS/309-548  AC G3A630.1
#=GS G8H965_HHV1/26-844    AC G8H965.1
#=GS D5GVE5_9CAUD/463-611  AC D5GVE5.1
#=GS G3G987_9ALPH/18-833   AC G3G987.1
#=GS PRIM_ASFP4/551-695    AC P0CA11.1
#=GS Q4C0J3_CROWT/471-660  AC Q4C0J3.1
#=GS Q9E1W9_9ALPH/1-809    AC Q9E1W9.1
#=GS G8EWC3_9VIRU/499-690  AC G8EWC3.1
#=GS E2IL25_ELHV1/24-252   AC E2IL25.1
#=GS H9NJM9_9BETA/60-287   AC H9NJM9.1
#=GS G9JX59_9BETA/1-242    AC G9JX59.1
#=GS G0FV88_AMYMD/31-66    AC G0FV88.1
#=GS F8RCL2_HHV1/26-844    AC F8RCL2.1
#=GS A3RMA3_9ALPH/24-766   AC A3RMA3.1
#=GS G5J8H1_CROWT/1-74     AC G5J8H1.1
#=GS A3ITZ8_9CHRO/369-565  AC A3ITZ8.1
#=GS G8EC43_9VIRU/389-545  AC G8EC43.1
#=GS A3NCI7_BURP6/308-501  AC A3NCI7.1
#=GS OBP_GAHVM/3-834       AC Q9E6Q7.1
#=GS PRIM_ASFB7/548-694    AC Q65146.1
#=GS A3IVX7_9CHRO/377-568  AC A3IVX7.1
#=GS F8V4X5_MIMIV/540-712  AC F8V4X5.1
#=GS Q9E1I1_MEHV1/3-832    AC Q9E1I1.1
#=GS OBP_HHV7J/219-781     AC P52379.1
#=GS Q4USZ7_XANC8/463-650  AC Q4USZ7.1
#=GS A3IXJ5_9CHRO/391-592  AC A3IXJ5.1
#=GS G8H861_HHV1/26-844    AC G8H861.1
#=GS PRIM_ASFB7/375-563    AC Q65146.1
#=GS Q782T7_9ALPH/131-868  AC Q782T7.1
#=GS H8ZR21_ILTV/48-891    AC H8ZR21.1
#=GS F8RF16_HHV1/26-844    AC F8RF16.1
#=GS Q85046_SUHVK/1-450    AC Q85046.1
#=GS Q6X220_9ALPH/1-816    AC Q6X220.1
#=GS Q8PLX7_XANAC/448-649  AC Q8PLX7.1
#=GS F8REL5_HHV1/26-844    AC F8REL5.1
#=GS Q69468_9BETA/98-659   AC Q69468.1
#=GS H3RLI8_ERWST/479-689  AC H3RLI8.1
#=GS O56293_9BETA/3-223    AC O56293.1
#=GS A0ZM50_NODSP/414-571  AC A0ZM50.1
#=GS G9JX79_9BETA/1-177    AC G9JX79.1
#=GS Q9YZA6_9ALPH/3-62     AC Q9YZA6.1
#=GS G9IXB3_HHV3/12-828    AC G9IXB3.1
#=GS Q85043_SUHVK/18-836   AC Q85043.1
#=GS F8V4X5_MIMIV/390-547  AC F8V4X5.1
#=GS E0WMI5_ASF/371-559    AC E0WMI5.1
#=GS Q8PAM1_XANCP/463-650  AC Q8PAM1.1
#=GS H9NJQ1_9BETA/1-69     AC H9NJQ1.1
#=GS H9NJQ2_9BETA/1-69     AC H9NJQ2.1
#=GS A9JKZ1_ASFPB/548-694  AC A9JKZ1.1
#=GS G8H8Z5_HHV1/26-844    AC G8H8Z5.1
#=GS E2ILB8_9BETA/233-782  AC E2ILB8.1
#=GS YR001_MIMIV/281-439   AC Q5UP78.1
#=GS G1K7Y8_HHV3/12-828    AC G1K7Y8.1
#=GS PRIM_ASFK5/364-548    AC P0CA10.1
#=GS B2JBK2_NOSP7/401-570  AC B2JBK2.1
#=GS G3GR33_9ALPH/24-852   AC G3GR33.1
#=GS H9NJJ4_9BETA/1-103    AC H9NJJ4.1
#=GS C6ZD35_9ALPH/24-852   AC C6ZD35.1
#=GS B2JAI9_NOSP7/386-572  AC B2JAI9.1
#=GS G6H109_9CHRO/391-592  AC G6H109.1
#=GS H9NJJ4_9BETA/92-189   AC H9NJJ4.1
#=GS G8HKN3_ILTV/48-891    AC G8HKN3.1
#=GS C7QY98_CYAP0/404-591  AC C7QY98.1
#=GS Q07183_ASF/544-689    AC Q07183.1
#=GS G8EC43_9VIRU/538-712  AC G8EC43.1
#=GS F8V4W8_MIMIV/169-335  AC F8V4W8.1
#=GS Q85044_SUHVK/1-463    AC Q85044.1
#=GS Q697J2_9ALPH/1-210    AC Q697J2.1
#=GS F8RFN8_HHV1/26-844    AC F8RFN8.1
#=GS OBP_HHV11/26-844      AC P10193.1
#=GS PRIM_ASFK5/540-684    AC P0CA10.1
#=GS OBP_HHV6U/219-780     AC P52378.1
#=GS Q782T7_9ALPH/3-134    AC Q782T7.1
#=GS Q5Y0U4_9ALPH/52-872   AC Q5Y0U4.1
#=GS OBP_VZVD/12-828       AC P09299.1
#=GS G9JXB5_9BETA/171-266  AC G9JXB5.1
#=GS PRIM_ASFP4/379-559    AC P0CA11.1
#=GS E0ADI5_9VIRU/499-690  AC E0ADI5.1
#=GS F8TBZ9_9ALPH/3-832    AC F8TBZ9.1
#=GS G9JX79_9BETA/167-252  AC G9JX79.1
#=GS D4I5N5_ASF/550-696    AC D4I5N5.1
#=GS E2ILB8_9BETA/15-244   AC E2ILB8.1
#=GS I0XR69_9LEPT/130-335  AC I0XR69.1
#=GS Q07183_ASF/368-551    AC Q07183.1
#=GS OBP_EHV1B/51-880      AC P28947.1
#=GS D4HTY1_9CAUD/350-515  AC D4HTY1.1
#=GS Y115_OSHVF/2-106      AC Q6R7B1.1
#=GS OBP_HHV7J/3-223       AC P52379.1
#=GS D1FXX3_FHV1/26-853    AC D1FXX3.1
#=GS YR001_MIMIV/114-280   AC Q5UP78.1
#=GS E2IL88_ELHV1/24-252   AC E2IL88.1
#=GS PRIM_ASFM2/368-551    AC P0CA12.1
#=GS Q9QTD4_9ALPH/3-134    AC Q9QTD4.1
#=GS E2IKY5_ELHV1/24-248   AC E2IKY5.1
#=GS F2WKX1_9VIRU/615-767  AC F2WKX1.1
#=GS G8EBZ3_9VIRU/526-700  AC G8EBZ3.1
#=GS B7KMM2_CYAP7/413-506  AC B7KMM2.1
#=GS Q66061_9ALPH/1-182    AC Q66061.1
#=GS F8RDI2_HHV1/26-844    AC F8RDI2.1
#=GS D5GVZ5_9CAUD/304-466  AC D5GVZ5.1
#=GS Q19BE4_9ALPH/1-481    AC Q19BE4.1
#=GS F8REU2_HHV1/26-844    AC F8REU2.1
#=GS Q2QBG8_CHV16/52-885   AC Q2QBG8.1
#=GS A3IXT8_9CHRO/375-567  AC A3IXT8.1
#=GS G9I230_HHV2/44-860    AC G9I230.1
#=GS Q6R5Y0_9ALPH/3-834    AC Q6R5Y0.1
#=GS D2XAI8_9VIRU/699-820  AC D2XAI8.1
#=GS B2KWI9_ECTSI/580-700  AC B2KWI9.1
#=GS Q9DPS5_MEHV1/3-832    AC Q9DPS5.1
#=GS A9JKZ1_ASFPB/375-563  AC A9JKZ1.1
#=GS G8H8K0_HHV1/26-844    AC G8H8K0.1
#=GS G9JXB5_9BETA/1-181    AC G9JXB5.1
#=GS G9JX92_9BETA/1-181    AC G9JX92.1
#=GS E0WMI5_ASF/544-690    AC E0WMI5.1
#=GS H2EG24_9VIRU/358-519  AC H2EG24.1
#=GS G9CUB5_9ALPH/3-834    AC G9CUB5.1
#=GS F2WLB1_9VIRU/480-649  AC F2WLB1.1
#=GS Q99H48_9ALPH/1-132    AC Q99H48.1
#=GS H0J8S0_9PSED/165-334  AC H0J8S0.1
#=GS PRIM_ASFWA/379-559    AC P0CA09.1
#=GS H6WUT9_9ALPH/3-834    AC H6WUT9.1
#=GS Q9WT02_HHV6H/219-780  AC Q9WT02.1
#=GS G8H8D1_HHV1/26-844    AC G8H8D1.1
#=GS OBP_PSHV1/18-879      AC Q6UDH3.1
#=GS H9NJK2_9BETA/1-232    AC H9NJK2.1
#=GS F8RDY6_HHV1/26-848    AC F8RDY6.1
#=GS F2WKX1_9VIRU/448-625  AC F2WKX1.1
#=GS Q85045_SUHVK/1-456    AC Q85045.1
#=GS F2WLB1_9VIRU/603-777  AC F2WLB1.1
#=GS O39293_EHV4/51-880    AC O39293.1
#=GS B2I3U2_ACIBC/390-666  AC B2I3U2.1
#=GS D8HNU6_AMYMU/31-66    AC D8HNU6.1
#=GS Q5Y950_9ALPH/18-809   AC Q5Y950.1
#=GS A8TC50_9VIBR/23-249   AC A8TC50.1
#=GS PRIM_ASFWA/551-695    AC P0CA09.1
#=GS F8RFG4_HHV1/26-844    AC F8RFG4.1
#=GS E2IUG1_SHV1/49-870    AC E2IUG1.1
#=GS Q806C0_CHV1/52-867    AC Q806C0.1
#=GS Q0Q8P8_HHV3/12-574    AC Q0Q8P8.1
#=GS E3VXG8_MIMIV/372-528  AC E3VXG8.1
#=GS D5GVZ5_9CAUD/461-612  AC D5GVZ5.1
#=GS G3G8U2_9ALPH/18-836   AC G3G8U2.1
#=GS OBP_HHV2H/44-860      AC P89432.2
#=GS O56293_9BETA/219-781  AC O56293.1
#=GS E2IL54_ELHV1/240-337  AC E2IL54.1
#=GS F8RF93_HHV1/26-844    AC F8RF93.1
#=GS G8EBZ3_9VIRU/368-540  AC G8EBZ3.1
#=GS OBP_HHV6Z/219-780     AC P52452.1
#=GS F2WKT4_9VIRU/457-631  AC F2WKT4.1
#=GS Q9QP12_ILTV/48-891    AC Q9QP12.1
#=GS YR008_MIMIV/538-712   AC Q5UP79.1
#=GS E3VXG1_MIMIV/114-280  AC E3VXG1.1
#=GS E2IL88_ELHV1/241-336  AC E2IL88.1
#=GS H6WUU0_9ALPH/1-481    AC H6WUU0.1
#=GS E2IL25_ELHV1/240-337  AC E2IL25.1
#=GS PRIM_ASFM2/544-689    AC P0CA12.1
#=GS OBP_EHV1V/51-880      AC P84403.1
#=GS G3G907_9ALPH/18-836   AC G3G907.1
#=GS Q9WT02_HHV6H/3-223    AC Q9WT02.1
#=GS OBP_HHV6Z/3-223       AC P52452.1
#=GS Q66059_9ALPH/1-74     AC Q66059.1
#=GS Q66LV7_BPT5/382-540   AC Q66LV7.1
#=GS A9JLQ2_ASFPP/548-694  AC A9JLQ2.1
#=GS D2XAI8_9VIRU/519-720  AC D2XAI8.1
#=GS E9N449_9CAUD/442-607  AC E9N449.1
#=GS Q9QTD4_9ALPH/131-868  AC Q9QTD4.1
#=GS E3VXG8_MIMIV/521-695  AC E3VXG8.1
#=GS OBP_VZVO/12-828       AC Q9J3N7.1
#=GS Q5PPD8_SUHVF/1-463    AC Q5PPD8.1
#=GS B7FEJ5_9ALPH/24-853   AC B7FEJ5.1
#=GS Q5PP85_SUHVF/18-836   AC Q5PP85.1
#=GS Q67632_ILTV/3-834     AC Q67632.1
#=GS B0RVV8_XANCB/463-650  AC B0RVV8.1
#=GS G5ENT0_9CAUD/337-495  AC G5ENT0.1
#=GS G9JX65_9BETA/1-238    AC G9JX65.1
#=GS Q9IBW5_9ALPH/3-834    AC Q9IBW5.1
#=GS OBP_BHV1C/28-852      AC P52377.1
#=GS YR008_MIMIV/389-545   AC Q5UP79.1
#=GS Q6QGH9_BPT5/382-540   AC Q6QGH9.1
#=GS G9JX92_9BETA/171-270  AC G9JX92.1
#=GS E3VXG1_MIMIV/281-439  AC E3VXG1.1
#=GS H9NJK9_9BETA/1-174    AC H9NJK9.1
#=GS A6AUX8_VIBHA/341-569  AC A6AUX8.1
#=GS F8V4W8_MIMIV/336-494  AC F8V4W8.1
#=GS A6FFB3_9GAMM/227-436  AC A6FFB3.1
#=GS F2WKT4_9VIRU/643-780  AC F2WKT4.1
#=GS D3YPE9_HHV1/26-844    AC D3YPE9.1
#=GS D5GVE5_9CAUD/303-465  AC D5GVE5.1
#=GS G8H5E5_HHV1/26-844    AC G8H5E5.1
#=GS A9JLQ2_ASFPP/375-563  AC A9JLQ2.1
#=GS D3YPG6_HHV1/26-844    AC D3YPG6.1
#=GS Q6QCK5_HHV3/12-828    AC Q6QCK5.1
#=GS D4I5N5_ASF/377-565    AC D4I5N5.1
#=GS Q69468_9BETA/1-102    AC Q69468.1
#=GS B1X397_CYAA5/361-562  AC B1X397.1
#=GS F2P5H9_PHOMO/342-510  AC F2P5H9.1
#=GS B7KLN6_CYAP7/417-509  AC B7KLN6.1
#=GS A6XEE0_HHV3/12-828    AC A6XEE0.1
#=GS B2KWI9_ECTSI/386-530  AC B2KWI9.1
#=GS H6SUK6_9VIRU/127-282  AC H6SUK6.1
#=GS E2IL54_ELHV1/24-252   AC E2IL54.1
#=GS G2H1Q2_9ENTR/330-533  AC G2H1Q2.1
#=GS G9EQF2_9GAMM/400-606  AC G9EQF2.1
#=GS OBP_HHV6U/3-223       AC P52378.1
#=GS H9NJM9_9BETA/276-372  AC H9NJM9.1
E2IKY5_ELHV1/240-803             ...........................................scftce------------------------..--..----.------------..----------...--------------.--.-------....-...--...-..--...---.......--------------------...........---.-----........--..-.-.---..-...------------.---......-.-.......-.......----..-..-..---------.----.-.-.--..--...-...-.....--.--..-..-.-----------------------------.--..---.-..----------------------------------.....---------..----------------.-THTN.....FMKILLESLLEGKRIC.VFA.STASAACFIADEIR.THfpEKRIL......RM....TG....KDKLE....KS.......E.S........WDSYEVIVYNTVITVGISF...E.KQHFHMLFVYIH.LFRNGPDMMS....VYQSIGRVRYLLDHTMYIYMNPI.MVKK...N..KLDGHLSLFPSITD--.SYSHVDLDIIDRSVDEFKIKCDSSHs..yySGESLSVVRDTFKIKYILEKTVLNNFSDSFTLLYLLLKNNKISVNIEDNLEgrALTS...ESFLNFIKTTVMDCKPLSQAKVTIP...............-----NIPYHPDFIR--...TVGRITECL..FSEDTPI..RTITKIVKSLRY.ENV.KHSFINSLC--...-C.........HILKIG-..VSEESFMKTYDLLCN--IT.........VVSdEECNYTYTLSESSVMYDSRFslVLAKLGRDIVADMQLKSCTDTSS.D........VAESNVVYCAVKYG--.--RRILNCLQCAFNTHIQCFESLSPKTIKLYYAL....KGISVS...MLCMKEY...CIILLKTWFKLVYDMSVIRCSPRYVTETRSSRLTKAQIITELDKRGINHSHCKTHRQLRDLLRSTAAERQRdsIVYKLRGTDLCSLFSAHV..........------....------------------gteewisryrhivvndtttqdssphlcpsve........................................................................
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