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Database: Pfam
Entry: KaiC
LinkDB: KaiC
Original site: KaiC 
#=GF ID   KaiC
#=GF AC   PF06745.8
#=GF DE   KaiC
#=GF AU   Vella Briffa B
#=GF SE   Pfam-B_2234 (release 10.0)
#=GF GA   22.00 22.00;
#=GF TC   22.00 22.00;
#=GF NC   21.90 21.90;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 23193494 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF WK   Cyanobacterial_clock_proteins
#=GF RN   [1]
#=GF RM   10064581
#=GF RT   Physical interactions among circadian clock proteins KaiA, KaiB
#=GF RT   and KaiC in cyanobacteria. 
#=GF RA   Iwasaki H, Taniguchi Y, Ishiura M, Kondo T; 
#=GF RL   EMBO J 1999;18:1137-1145.
#=GF DR   INTERPRO; IPR014774;
#=GF CC   This family represents a conserved region within bacterial and
#=GF CC   archaeal proteins, most of which are hypothetical. More than one
#=GF CC   copy is sometimes found in each protein. This family includes
#=GF CC   KaiC, which is one of the Kai proteins among which direct
#=GF CC   protein-protein association may be a critical process in the
#=GF CC   generation of circadian rhythms in cyanobacteria [1].
#=GF SQ   1953
#=GS E9F1G4_METAR/68-150   AC E9F1G4.1
#=GS RAD55_YEAST/18-187    AC P38953.1
#=GS O29797_ARCFU/4-227    AC O29797.1
#=GS H0T0X5_9BRAD/12-244   AC H0T0X5.1
#=GS A3MU19_PYRCJ/14-277   AC A3MU19.1
#=GS A9CL35_AGRT5/251-472  AC A9CL35.1
#=GS D8FUV2_9CYAN/260-479  AC D8FUV2.1
#=GS B1ARD4_MOUSE/82-129   AC B1ARD4.1
#=GS E7Q255_YEASB/18-192   AC E7Q255.1
#=GS G7UY82_LACRH/70-145   AC G7UY82.1
#=GS F3IBS6_PSESL/207-428  AC F3IBS6.1
#=GS Q46JC4_PROMT/6-236    AC Q46JC4.1
#=GS F8CP37_MYXFH/1-219    AC F8CP37.1
#=GS G4FJS4_9SYNE/248-468  AC G4FJS4.1
#=GS B0JQ11_MICAN/13-244   AC B0JQ11.1
#=GS F0V8D2_NEOCL/97-144   AC F0V8D2.1
#=GS Q1MFQ3_RHIL3/10-239   AC Q1MFQ3.1
#=GS B6YX55_THEON/6-229    AC B6YX55.1
#=GS I0GFW5_9BRAD/11-240   AC I0GFW5.1
#=GS H8Z688_9GAMM/153-286  AC H8Z688.1
#=GS D7E6A6_METEZ/15-244   AC D7E6A6.1
#=GS F3IBS6_PSESL/1-194    AC F3IBS6.1
#=GS C7QTM1_CYAP0/264-484  AC C7QTM1.1
#=GS B5ICC3_ACIB4/1-180    AC B5ICC3.1
#=GS B5IA85_ACIB4/230-439  AC B5IA85.1
#=GS H0RTZ1_9BRAD/259-480  AC H0RTZ1.1
#=GS G8S8G9_ACTS5/240-464  AC G8S8G9.1
#=GS B9P3F0_PROMR/259-479  AC B9P3F0.1
#=GS D2EFY2_9EURY/4-214    AC D2EFY2.1
#=GS D4ST74_9XANT/255-478  AC D4ST74.1
#=GS Q05TY5_9SYNE/17-247   AC Q05TY5.1
#=GS A2BJX3_HYPBU/6-239    AC A2BJX3.1
#=GS G4IG24_9EURY/13-210   AC G4IG24.1
#=GS B5IML8_9CHRO/259-479  AC B5IML8.1
#=GS F8ALS7_METOI/4-238    AC F8ALS7.1
#=GS A7HFC8_ANADF/247-466  AC A7HFC8.1
#=GS F0NV66_LACHH/75-150   AC F0NV66.1
#=GS H0PAG9_9SYNC/255-476  AC H0PAG9.1
#=GS D3RYW9_FERPA/8-243    AC D3RYW9.1
#=GS G8TFS1_NIAKG/16-244   AC G8TFS1.1
#=GS O29463_ARCFU/20-274   AC O29463.1
#=GS D2RJM6_ACIFV/72-154   AC D2RJM6.1
#=GS B1JA47_PSEPW/8-226    AC B1JA47.1
#=GS G8TFS1_NIAKG/256-475  AC G8TFS1.1
#=GS A6UTN3_META3/7-222    AC A6UTN3.1
#=GS A6UKZ3_SINMW/9-238    AC A6UKZ3.1
#=GS F2KSF4_ARCVS/229-303  AC F2KSF4.1
#=GS H0S191_9BRAD/20-248   AC H0S191.1
#=GS D5U2W1_THEAM/4-234    AC D5U2W1.1
#=GS A3DNT6_STAMF/240-450  AC A3DNT6.1
#=GS E6NB23_9ARCH/236-454  AC E6NB23.1
#=GS A1RS42_PYRIL/21-257   AC A1RS42.1
#=GS O29896_ARCFU/2-224    AC O29896.1
#=GS F5UH89_9CYAN/246-471  AC F5UH89.1
#=GS O27166_METTH/246-469  AC O27166.1
#=GS D5U2V6_THEAM/5-238    AC D5U2V6.1
#=GS F5Y600_RAMTT/10-239   AC F5Y600.1
#=GS A3SEF3_9RHOB/13-240   AC A3SEF3.1
#=GS D2EGM1_9EURY/13-232   AC D2EGM1.1
#=GS G6ES83_LACDE/75-149   AC G6ES83.1
#=GS C5A4F7_THEGJ/9-246    AC C5A4F7.1
#=GS I0CN95_LISMN/150-281  AC I0CN95.1
#=GS B9K1D9_AGRVS/253-474  AC B9K1D9.1
#=GS A2BKD6_HYPBU/6-244    AC A2BKD6.1
#=GS Q9YAP5_AERPE/16-241   AC Q9YAP5.1
#=GS H8MNZ9_CORCM/12-230   AC H8MNZ9.1
#=GS E1NIA7_9LACO/151-281  AC E1NIA7.1
#=GS E6N6M7_9ARCH/49-165   AC E6N6M7.1
#=GS F7PFY2_9EURY/4-51     AC F7PFY2.1
#=GS Q5N594_SYNP6/21-251   AC Q5N594.1
#=GS F0LKZ2_THEBM/4-133    AC F0LKZ2.1
#=GS E1TFJ2_BURSG/11-238   AC E1TFJ2.1
#=GS B3QK07_RHOPT/8-236    AC B3QK07.1
#=GS D7EB74_METEZ/19-254   AC D7EB74.1
#=GS E3R4R9_9LACO/75-150   AC E3R4R9.1
#=GS H1XSG9_9BACT/6-235    AC H1XSG9.1
#=GS B1ZHT3_METPB/258-476  AC B1ZHT3.1
#=GS A5D488_PELTS/4-224    AC A5D488.1
#=GS O26692_METTH/5-183    AC O26692.1
#=GS C7P5Z5_METFA/8-242    AC C7P5Z5.1
#=GS H0T0H6_9BRAD/18-246   AC H0T0H6.1
#=GS C7Z7E5_NECH7/42-104   AC C7Z7E5.1
#=GS C7NNP0_HALUD/176-400  AC C7NNP0.1
#=GS B9XHU6_9BACT/13-240   AC B9XHU6.1
#=GS G6IZ49_LACRH/70-145   AC G6IZ49.1
#=GS Y1931_PYRFU/5-238     AC Q8TZQ5.1
#=GS D0CGP7_9SYNE/248-468  AC D0CGP7.1
#=GS F0BTJ8_9XANT/224-447  AC F0BTJ8.1
#=GS F4HLS0_PYRSN/16-251   AC F4HLS0.1
#=GS F8AH76_PYRYC/18-252   AC F8AH76.1
#=GS Q3AZG0_SYNS9/259-479  AC Q3AZG0.1
#=GS Q4J9K9_SULAC/3-224    AC Q4J9K9.1
#=GS E6JR42_STAEP/147-275  AC E6JR42.1
#=GS B4WMM0_9SYNE/267-487  AC B4WMM0.1
#=GS B1FU43_9BURK/14-232   AC B1FU43.1
#=GS Q8TU39_METAC/1-159    AC Q8TU39.1
#=GS G3YYE4_9LACO/151-281  AC G3YYE4.1
#=GS D2RH30_ARCPA/5-230    AC D2RH30.1
#=GS A8MC25_CALMQ/31-293   AC A8MC25.1
#=GS F6DWI0_SINMK/27-208   AC F6DWI0.1
#=GS F7XNP2_METZD/231-453  AC F7XNP2.1
#=GS E7PZ62_STRDY/113-245  AC E7PZ62.1
#=GS C1DU16_SULAA/50-304   AC C1DU16.1
#=GS F2AP68_RHOBT/5-187    AC F2AP68.1
#=GS F0LGP5_AGRSH/251-472  AC F0LGP5.1
#=GS B7RA82_9THEO/8-113    AC B7RA82.1
#=GS H3W4Y9_STAEP/147-275  AC H3W4Y9.1
#=GS RADA_BACSU/152-282    AC P37572.1
#=GS H3ZRC0_THELI/11-229   AC H3ZRC0.1
#=GS B7R245_9EURY/5-231    AC B7R245.1
#=GS H0GE34_9SACH/18-187   AC H0GE34.1
#=GS C7QTM1_CYAP0/22-252   AC C7QTM1.1
#=GS A3MX38_PYRCJ/5-238    AC A3MX38.1
#=GS Q1YGV5_MOBAS/35-264   AC Q1YGV5.1
#=GS KAIC_THEEB/22-251     AC Q79V60.1
#=GS E3FUY5_STIAD/246-468  AC E3FUY5.1
#=GS E1TJ25_BURSG/246-468  AC E1TJ25.1
#=GS C3N3Y5_SULIA/4-237    AC C3N3Y5.1
#=GS H0PF32_9SYNC/264-483  AC H0PF32.1
#=GS E6WV21_PSEUU/254-475  AC E6WV21.1
#=GS F1VY98_9BURK/244-466  AC F1VY98.1
#=GS A6Q0W7_NITSB/240-462  AC A6Q0W7.1
#=GS D8GBR1_LACCZ/70-145   AC D8GBR1.1
#=GS F8DCE7_HALXS/62-311   AC F8DCE7.1
#=GS B9LD18_CHLSY/252-472  AC B9LD18.1
#=GS B9LTG7_HALLT/10-247   AC B9LTG7.1
#=GS F3E3Z3_9PSED/248-465  AC F3E3Z3.1
#=GS A6WWZ9_OCHA4/53-210   AC A6WWZ9.1
#=GS C5WJ90_STRDG/113-245  AC C5WJ90.1
#=GS F7PIY5_9EURY/11-252   AC F7PIY5.1
#=GS H3W0F4_STAEP/147-275  AC H3W0F4.1
#=GS E7KLI5_YEASL/18-192   AC E7KLI5.1
#=GS F0HUP9_LACDL/75-149   AC F0HUP9.1
#=GS C7LQB8_DESBD/254-472  AC C7LQB8.1
#=GS G7DB37_BRAJP/16-230   AC G7DB37.1
#=GS I0YAV8_9BURK/7-225    AC I0YAV8.1
#=GS F7QCV7_9GAMM/1-229    AC F7QCV7.1
#=GS F8CNM5_MYXFH/250-472  AC F8CNM5.1
#=GS F8D4Q1_HALXS/6-206    AC F8D4Q1.1
#=GS E6M9V8_STALU/148-277  AC E6M9V8.1
#=GS Q0I804_SYNS3/17-247   AC Q0I804.1
#=GS F7QCV7_9GAMM/241-456  AC F7QCV7.1
#=GS B8JG68_ANAD2/12-237   AC B8JG68.1
#=GS F2L503_THEU7/14-250   AC F2L503.1
#=GS B0UKD3_METS4/258-482  AC B0UKD3.1
#=GS F0T5Z6_METSL/4-229    AC F0T5Z6.1
#=GS E0U7Y6_CYAP2/275-341  AC E0U7Y6.1
#=GS Q5JHY0_PYRKO/9-65     AC Q5JHY0.1
#=GS B0UAS4_METS4/256-477  AC B0UAS4.1
#=GS F9CWR5_9ARCH/207-440  AC F9CWR5.1
#=GS Q3I1N9_MICAE/22-252   AC Q3I1N9.1
#=GS C3N185_SULIA/5-234    AC C3N185.1
#=GS H6QBX6_PYROT/4-190    AC H6QBX6.1
#=GS H2C435_9CREN/2-218    AC H2C435.1
#=GS B0RUP6_XANCB/21-251   AC B0RUP6.1
#=GS Q8PLW8_XANAC/255-478  AC Q8PLW8.1
#=GS F0NMW7_SULIH/9-231    AC F0NMW7.1
#=GS A8MBY5_CALMQ/6-239    AC A8MBY5.1
#=GS F3J7B7_PSEAP/1-210    AC F3J7B7.1
#=GS F2LQN1_BURGS/29-247   AC F2LQN1.1
#=GS F2MZ14_PSEU6/7-225    AC F2MZ14.1
#=GS F8C5Z4_THESO/44-298   AC F8C5Z4.1
#=GS Q9V2A5_PYRAB/12-249   AC Q9V2A5.1
#=GS H8MH02_CORCM/9-228    AC H8MH02.1
#=GS C5N2Y9_STAA3/69-198   AC C5N2Y9.1
#=GS H0P8I0_9SYNC/253-475  AC H0P8I0.1
#=GS F7XNH3_METZD/10-239   AC F7XNH3.1
#=GS G0HT53_HALHT/94-217   AC G0HT53.1
#=GS F6F1V6_SPHCR/250-471  AC F6F1V6.1
#=GS G4JR58_9CREN/6-260    AC G4JR58.1
#=GS E6WV21_PSEUU/13-241   AC E6WV21.1
#=GS E8T3B4_THEA1/33-288   AC E8T3B4.1
#=GS C7NX03_HALMD/11-251   AC C7NX03.1
#=GS D2PF72_SULID/5-234    AC D2PF72.1
#=GS D1JIW0_9ARCH/6-238    AC D1JIW0.1
#=GS G6FJY5_9EURY/7-231    AC G6FJY5.1
#=GS H8I5P0_METCZ/8-231    AC H8I5P0.1
#=GS F2KSF1_ARCVS/4-90     AC F2KSF1.1
#=GS D1YY79_METPS/22-245   AC D1YY79.1
#=GS I0Y4U6_9BURK/22-240   AC I0Y4U6.1
#=GS D4GVU8_HALVD/3-231    AC D4GVU8.1
#=GS F7XNK8_METZD/62-275   AC F7XNK8.1
#=GS A4WHH4_PYRAR/4-267    AC A4WHH4.1
#=GS F3EZP1_9PSED/248-469  AC F3EZP1.1
#=GS A2BJC1_HYPBU/18-242   AC A2BJC1.1
#=GS D1CDU0_THET1/239-457  AC D1CDU0.1
#=GS C3NCW2_SULIY/1-213    AC C3NCW2.1
#=GS D3RPR9_ALLVD/18-246   AC D3RPR9.1
#=GS C7DIQ5_9EURY/13-243   AC C7DIQ5.1
#=GS A9WC99_CHLAA/245-466  AC A9WC99.1
#=GS C7DU18_HALVO/5-229    AC C7DU18.1
#=GS C8Z4Z4_YEAS8/18-187   AC C8Z4Z4.1
#=GS E1TFJ2_BURSG/251-472  AC E1TFJ2.1
#=GS H0DPY5_STAEP/147-275  AC H0DPY5.1
#=GS Q8Q020_METMA/11-235   AC Q8Q020.1
#=GS O29212_ARCFU/17-241   AC O29212.1
#=GS Q9FBA1_9CYAN/1-198    AC Q9FBA1.1
#=GS Q4C6W5_CROWT/264-483  AC Q4C6W5.1
#=GS C7SRX7_9CYAN/1-206    AC C7SRX7.1
#=GS H3V694_STAEP/147-275  AC H3V694.1
#=GS C7SRY0_9CYAN/1-204    AC C7SRY0.1
#=GS I1RZ86_GIBZE/42-125   AC I1RZ86.1
#=GS Q84HH0_9NOST/20-208   AC Q84HH0.1
#=GS B6C1I1_9GAMM/1-199    AC B6C1I1.1
#=GS F7XQQ9_METZD/4-241    AC F7XQQ9.1
#=GS A6Q5V7_NITSB/37-292   AC A6Q5V7.1
#=GS E3YC83_LISMN/150-281  AC E3YC83.1
#=GS E3FSG3_STIAD/1-119    AC E3FSG3.1
#=GS H8I4S7_METCZ/16-240   AC H8I4S7.1
#=GS E3GYM8_METFV/5-225    AC E3GYM8.1
#=GS B8ES00_METSB/12-242   AC B8ES00.1
#=GS Q3AHR9_SYNSC/259-479  AC Q3AHR9.1
#=GS C5CTV7_VARPS/259-481  AC C5CTV7.1
#=GS C7NX18_HALMD/5-229    AC C7NX18.1
#=GS Q724H9_LISMF/150-281  AC Q724H9.1
#=GS F2KQ54_ARCVS/6-240    AC F2KQ54.1
#=GS C7P1I1_HALMD/3-225    AC C7P1I1.1
#=GS E1UCU9_LISML/150-281  AC E1UCU9.1
#=GS B6YWB4_THEON/4-230    AC B6YWB4.1
#=GS C7P8Y4_METFA/10-226   AC C7P8Y4.1
#=GS Q2IEE4_ANADE/13-233   AC Q2IEE4.1
#=GS Q98NY9_RHILO/23-251   AC Q98NY9.1
#=GS G7VFM4_9CREN/3-70     AC G7VFM4.1
#=GS F7UMC7_SYNYG/264-483  AC F7UMC7.1
#=GS F8CNM5_MYXFH/15-233   AC F8CNM5.1
#=GS B8G4F0_CHLAD/9-240    AC B8G4F0.1
#=GS I0A1Q9_9CREN/5-230    AC I0A1Q9.1
#=GS Q8RT38_NOSLI/21-209   AC Q8RT38.1
#=GS C7LQB8_DESBD/10-233   AC C7LQB8.1
#=GS E8YS65_9BURK/251-472  AC E8YS65.1
#=GS G2TGX2_RHORU/250-470  AC G2TGX2.1
#=GS A0YK92_LYNSP/22-252   AC A0YK92.1
#=GS E1SZU3_THESX/138-280  AC E1SZU3.1
#=GS A3DNL1_STAMF/9-239    AC A3DNL1.1
#=GS C7TLT8_LACRL/70-145   AC C7TLT8.1
#=GS G2MG82_9ARCH/11-200   AC G2MG82.1
#=GS B1M3N1_METRJ/252-473  AC B1M3N1.1
#=GS D7EB77_METEZ/238-458  AC D7EB77.1
#=GS F8D4M7_HALXS/171-396  AC F8D4M7.1
#=GS H0SBN5_9BRAD/259-480  AC H0SBN5.1
#=GS D2RQC1_HALTV/245-468  AC D2RQC1.1
#=GS D2EGH0_9EURY/10-131   AC D2EGH0.1
#=GS B8FEN8_DESAA/18-119   AC B8FEN8.1
#=GS B5YD14_DICT6/37-292   AC B5YD14.1
#=GS B7KA52_CYAP7/256-477  AC B7KA52.1
#=GS F7X2M0_SINMM/1-153    AC F7X2M0.1
#=GS D9PTZ5_METTM/4-234    AC D9PTZ5.1
#=GS D2RE70_ARCPA/230-444  AC D2RE70.1
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#=GS Q9HQY2_HALSA/1-211    AC Q9HQY2.1
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