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Database: Pfam
Entry: Kdo
LinkDB: Kdo
Original site: Kdo 
#=GF ID   Kdo
#=GF AC   PF06293.13
#=GF DE   Lipopolysaccharide kinase (Kdo/WaaP) family
#=GF AU   Studholme DJ
#=GF SE   Krupa A, Srinivasan N
#=GF GA   21.30 21.30;
#=GF TC   21.30 21.30;
#=GF NC   21.20 21.20;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 26740544 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF WK   Lipopolysaccharide_kinase_(Kdo/WaaP)_family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   11069912
#=GF RT   Purification and characterization of WaaP from Escherichia coli,
#=GF RT   a lipopolysaccharide kinase essential for outer membrane
#=GF RT   stability. 
#=GF RA   Yethon JA, Whitfield C; 
#=GF RL   J Biol Chem 2001;276:5498-5504.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   12021457
#=GF RT   Lipopolysaccharide phosphorylating enzymes encoded in the
#=GF RT   genomes of Gram-negative bacteria are related to the eukaryotic
#=GF RT   protein kinases. 
#=GF RA   Krupa A, Srinivasan N; 
#=GF RL   Protein Sci 2002;11:1580-1584.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   10531340
#=GF RT   A Haemophilus influenzae gene that encodes a membrane bound
#=GF RT   3-deoxy-D-manno-octulosonic acid (Kdo) kinase. Possible
#=GF RT   involvement of kdo phosphorylation in bacterial virulence. 
#=GF RA   White KA, Lin S, Cotter RJ, Raetz CR; 
#=GF RL   J Biol Chem 1999;274:31391-31400.
#=GF DR   INTERPRO; IPR010440;
#=GF CC   These lipopolysaccharide kinases are related to protein kinases
#=GF CC   Pfam:PF00069. This family includes waaP (rfaP) gene product is
#=GF CC   required for the addition of phosphate to O-4 of the first
#=GF CC   heptose residue of the lipopolysaccharide (LPS) inner core
#=GF CC   region. It has previously been shown that WaaP is  necessary for
#=GF CC   resistance to hydrophobic and polycationic antimicrobials in E.
#=GF CC   coli and that it is required for virulence in invasive strains
#=GF CC   of S. enterica [1].
#=GF SQ   2126
#=GS U3AKT3_9VIBR/28-231         AC U3AKT3.1
#=GS E1SW63_FERBD/28-235         AC E1SW63.1
#=GS A0A011NUR7_9PROT/23-232     AC A0A011NUR7.1
#=GS B8MPN8_TALSN/670-755        AC B8MPN8.1
#=GS A0A0S7XJZ7_9BACT/104-252    AC A0A0S7XJZ7.1
#=GS A0A0H4W0S9_9BORD/38-229     AC A0A0H4W0S9.1
#=GS A0A0D1MB47_PSEPU/55-196     AC A0A0D1MB47.1
#=GS A0A165SCK3_9HOMO/270-333    AC A0A165SCK3.1
#=GS A0A078LQ40_9PSED/285-461    AC A0A078LQ40.1
#=GS A0A0C5VWY3_9GAMM/27-205     AC A0A0C5VWY3.1
#=GS A0A0V0VIF8_9BILA/523-701    AC A0A0V0VIF8.1
#=GS K1WD31_TRIAC/446-557        AC K1WD31.1
#=GS M7SXD8_EUTLA/214-286        AC M7SXD8.1
#=GS D9XU35_9ACTN/53-209         AC D9XU35.1
#=GS A0A0B0EJF8_9BACT/33-239     AC A0A0B0EJF8.1
#=GS A0A0T6UIQ8_9PSED/22-223     AC A0A0T6UIQ8.1
#=GS A0A162JBG4_9HYPO/200-271    AC A0A162JBG4.1
#=GS W6UM79_ECHGR/316-506        AC W6UM79.1
#=GS A0A0D6SBF1_9PSED/6-213      AC A0A0D6SBF1.1
#=GS A0A0D8Q827_9GAMM/28-231     AC A0A0D8Q827.1
#=GS J6GQB6_9PORP/40-229         AC J6GQB6.1
#=GS A0A0X8BZ27_9PSED/22-223     AC A0A0X8BZ27.1
#=GS W9T4J7_9PSED/22-223         AC W9T4J7.1
#=GS A0A0V0Z7B9_9BILA/308-491    AC A0A0V0Z7B9.1
#=GS G8RNV9_MYCRN/54-213         AC G8RNV9.1
#=GS H3CDT1_TETNG/18-208         AC H3CDT1.1
#=GS A0A0Q6RMA7_9MICO/47-194     AC A0A0Q6RMA7.1
#=GS A0A0W1NLV5_9ACTN/52-210     AC A0A0W1NLV5.1
#=GS Q543M9_MOUSE/31-216         AC Q543M9.1
#=GS A0A120E5I7_9BASI/118-216    AC A0A120E5I7.1
#=GS U2ZVP1_PSEAC/24-231         AC U2ZVP1.1
#=GS C3PGB7_CORA7/45-197         AC C3PGB7.1
#=GS A0A0D9RQT4_CHLSB/49-225     AC A0A0D9RQT4.1
#=GS A0A139D1S9_9FIRM/1-100      AC A0A139D1S9.1
#=GS D6Z2M2_DESAT/33-237         AC D6Z2M2.1
#=GS J9NUH9_CANLF/88-274         AC J9NUH9.1
#=GS A0A0M9VMU5_9BASI/65-241     AC A0A0M9VMU5.1
#=GS BUD32_YEAST/46-224          AC P53323.1
#=GS BUD32_YEAST/46-224          DR PDB; 4WW7 A; 46-224;
#=GS BUD32_YEAST/46-224          DR PDB; 4WW5 A; 46-224;
#=GS BUD32_YEAST/46-224          DR PDB; 4WWA A; 47-224;
#=GS BUD32_YEAST/46-224          DR PDB; 4WW9 A; 46-224;
#=GS A0A094G633_9PEZI/64-244     AC A0A094G633.1
#=GS A1D5Z6_NEOFI/56-249         AC A1D5Z6.1
#=GS A0A0R0CFR0_9GAMM/39-241     AC A0A0R0CFR0.1
#=GS L1LW05_PSEPU/20-231         AC L1LW05.1
#=GS A0A0N4WIU5_HAEPC/220-402    AC A0A0N4WIU5.1
#=GS A0A135IBB7_9GAMM/28-231     AC A0A135IBB7.1
#=GS A0A0F3L3L1_9GAMM/31-235     AC A0A0F3L3L1.1
#=GS M1WER6_CLAP2/154-223        AC M1WER6.1
#=GS A0A178ELH3_9PLEO/191-269    AC A0A178ELH3.1
#=GS A0A0L1HII2_9PLEO/356-426    AC A0A0L1HII2.1
#=GS A0A085DU25_9GAMM/43-243     AC A0A085DU25.1
#=GS A0A0X8HCK6_9GAMM/36-229     AC A0A0X8HCK6.1
#=GS B6HWF7_PENRW/497-580        AC B6HWF7.1
#=GS I3I9U5_9GAMM/62-247         AC I3I9U5.1
#=GS H0EHA7_GLAL7/273-357        AC H0EHA7.1
#=GS G3JLC1_CORMM/143-242        AC G3JLC1.1
#=GS F3YXC4_DESAF/112-262        AC F3YXC4.1
#=GS A0A0L1J6G4_ASPNO/116-200    AC A0A0L1J6G4.1
#=GS M9X4J7_MANHA/30-233         AC M9X4J7.1
#=GS A0A0M8UYP1_9ACTN/53-209     AC A0A0M8UYP1.1
#=GS M7PIF1_9GAMM/22-224         AC M7PIF1.1
#=GS A0A0A0M4E6_9GAMM/39-121     AC A0A0A0M4E6.1
#=GS N1Q6C5_PSEFD/41-223         AC N1Q6C5.1
#=GS A0A0R3UHY1_9CEST/336-516    AC A0A0R3UHY1.1
#=GS S8GXU6_9BACT/18-213         AC S8GXU6.1
#=GS A0A0T1WFE2_9MYCO/54-200     AC A0A0T1WFE2.1
#=GS C0N8T3_9GAMM/271-447        AC C0N8T3.1
#=GS F3ZQE9_9BACE/28-199         AC F3ZQE9.1
#=GS S6AY35_PSERE/18-221         AC S6AY35.1
#=GS A0A0P7B7M1_9HYPO/93-173     AC A0A0P7B7M1.1
#=GS A0A0N9VZR0_9GAMM/62-173     AC A0A0N9VZR0.1
#=GS A6R5H4_AJECN/581-676        AC A6R5H4.1
#=GS A0A0V0U5R3_9BILA/428-606    AC A0A0V0U5R3.1
#=GS Q3A539_PELCD/57-250         AC Q3A539.1
#=GS G5B7R3_HETGA/19-218         AC G5B7R3.1
#=GS L8ET40_STRRM/333-402        AC L8ET40.1
#=GS A6QYQ7_AJECN/267-344        AC A6QYQ7.1
#=GS A0A165JS35_9PEZI/119-219    AC A0A165JS35.1
#=GS Q4WMM3_ASPFU/628-717        AC Q4WMM3.1
#=GS G3AWC4_CANTC/53-224         AC G3AWC4.1
#=GS A6R3B6_AJECN/634-730        AC A6R3B6.1
#=GS A0A094AH86_9PEZI/176-255    AC A0A094AH86.1
#=GS L9JGS1_TUPCH/31-180         AC L9JGS1.1
#=GS R7S4T6_PUNST/215-297        AC R7S4T6.1
#=GS Q15ZV1_PSEA6/31-235         AC Q15ZV1.1
#=GS A0A098SVK1_9PSED/287-460    AC A0A098SVK1.1
#=GS K8YQ63_NANGC/43-223         AC K8YQ63.1
#=GS C4L7W6_TOLAT/31-235         AC C4L7W6.1
#=GS E5R3W9_ARTGP/635-712        AC E5R3W9.1
#=GS A0A0J6GK76_9CELL/49-215     AC A0A0J6GK76.1
#=GS B8M5A4_TALSN/51-252         AC B8M5A4.1
#=GS M4REZ1_9BIFI/72-228         AC M4REZ1.1
#=GS C6WXI9_METML/20-230         AC C6WXI9.1
#=GS R6XX48_9BACT/32-201         AC R6XX48.1
#=GS Q5LIR6_BACFN/39-218         AC Q5LIR6.1
#=GS A0A090P6Q2_9VIBR/35-236     AC A0A090P6Q2.1
#=GS A0A077F882_9PSED/22-223     AC A0A077F882.1
#=GS F5SZC4_9GAMM/280-463        AC F5SZC4.1
#=GS A0A0L6VRN5_9BASI/23-218     AC A0A0L6VRN5.1
#=GS Y0KJ22_9PROT/22-232         AC Y0KJ22.1
#=GS D6STK9_9DELT/44-242         AC D6STK9.1
#=GS A0A0F8U7V8_9EURO/707-786    AC A0A0F8U7V8.1
#=GS W9C1Z4_9HELO/153-240        AC W9C1Z4.1
#=GS A0A086D5M5_9GAMM/24-233     AC A0A086D5M5.1
#=GS E7NI83_YEASO/46-224         AC E7NI83.1
#=GS A0A067SJM9_9AGAR/132-229    AC A0A067SJM9.1
#=GS A0A136GJX9_9GAMM/23-235     AC A0A136GJX9.1
#=GS D9QTS8_ACEAZ/37-219         AC D9QTS8.1
#=GS A0A080M0S5_9PROT/32-244     AC A0A080M0S5.1
#=GS D3SSC7_NATMM/427-529        AC D3SSC7.1
#=GS A0Z6Q2_9GAMM/45-243         AC A0Z6Q2.1
#=GS Q9HUF8_PSEAE/22-224         AC Q9HUF8.1
#=GS N2J0F3_9PSED/22-223         AC N2J0F3.1
#=GS A0A0L1INS5_ASPNO/632-714    AC A0A0L1INS5.1
#=GS A0A0C2ZBV4_9PROT/79-212     AC A0A0C2ZBV4.1
#=GS E4ZGL5_LEPMJ/724-783        AC E4ZGL5.1
#=GS F5T1B2_9GAMM/33-232         AC F5T1B2.1
#=GS U4KHM9_9VIBR/28-231         AC U4KHM9.1
#=GS C5FZM6_ARTOC/649-720        AC C5FZM6.1
#=GS A0A024HNL3_PSEKB/22-223     AC A0A024HNL3.1
#=GS A0A0K8LD94_9EURO/133-194    AC A0A0K8LD94.1
#=GS A0A0A1HXC2_9PSED/22-223     AC A0A0A1HXC2.1
#=GS A0A091W5H6_OPIHO/13-131     AC A0A091W5H6.1
#=GS A0A0K1J0U0_9RHOO/21-180     AC A0A0K1J0U0.1
#=GS A0A0D2BJU9_9EURO/192-267    AC A0A0D2BJU9.1
#=GS A0A0X1T612_PSEAA/490-593    AC A0A0X1T612.1
#=GS C7RPD8_ACCPU/61-217         AC C7RPD8.1
#=GS G4MN82_MAGO7/255-347        AC G4MN82.1
#=GS R6DYR7_9BACT/8-201          AC R6DYR7.1
#=GS A0A164Z9A0_9PEZI/82-188     AC A0A164Z9A0.1
#=GS A0A0B2VBS6_TOXCA/7-225      AC A0A0B2VBS6.1
#=GS I1YG00_METFJ/525-687        AC I1YG00.1
#=GS A0A0L0UHG9_9BASI/19-107     AC A0A0L0UHG9.1
#=GS A0A0B5FRV1_9DELT/19-234     AC A0A0B5FRV1.1
#=GS A0A068XJS2_HYMMI/50-231     AC A0A068XJS2.1
#=GS A0A0C9Z9P8_9HOMO/827-922    AC A0A0C9Z9P8.1
#=GS A0A011PKJ0_9PROT/63-272     AC A0A011PKJ0.1
#=GS G4LYN6_SCHMA/351-519        AC G4LYN6.1
#=GS C8VDA8_EMENI/653-722        AC C8VDA8.1
#=GS A0A0D0WXV9_9ACTN/48-192     AC A0A0D0WXV9.1
#=GS A0A0V1H194_9BILA/487-666    AC A0A0V1H194.1
#=GS X2H6A6_9GAMM/21-232         AC X2H6A6.1
#=GS A0A135V3N0_9PEZI/492-555    AC A0A135V3N0.1
#=GS A0A077F9Y3_9PSED/16-224     AC A0A077F9Y3.1
#=GS B2WIS7_PYRTR/140-249        AC B2WIS7.1
#=GS A5DIF2_PICGU/56-223         AC A5DIF2.2
#=GS A0A0V0WZT4_9BILA/522-701    AC A0A0V0WZT4.1
#=GS A0M3P8_GRAFK/32-217         AC A0M3P8.1
#=GS Q6NJ74_CORDI/54-200         AC Q6NJ74.1
#=GS F6ZWY1_XENTR/31-216         AC F6ZWY1.1
#=GS E9E028_METAQ/540-637        AC E9E028.1
#=GS A0A0M2VID2_9GAMM/455-664    AC A0A0M2VID2.1
#=GS A0A165GPM6_EXIGL/97-183     AC A0A165GPM6.1
#=GS M4WSG5_PSEDE/18-221         AC M4WSG5.1
#=GS A0A136M9J1_9BACT/73-216     AC A0A136M9J1.1
#=GS B8NTG6_ASPFN/55-244         AC B8NTG6.1
#=GS A0A0K1RF22_9CORY/24-175     AC A0A0K1RF22.1
#=GS B3M405_DROAN/25-195         AC B3M405.1
#=GS A0A0Q9ZBC7_9FLAO/28-218     AC A0A0Q9ZBC7.1
#=GS A0A132TBI2_9MYCO/53-190     AC A0A132TBI2.1
#=GS A0A165L064_EXIGL/117-222    AC A0A165L064.1
#=GS A0A0V0XWP6_TRIPS/487-666    AC A0A0V0XWP6.1
#=GS A0A0S6W9H5_9BACT/52-250     AC A0A0S6W9H5.1
#=GS G3QI33_GORGO/49-225         AC G3QI33.1
#=GS A0A067MLT3_9HOMO/27-121     AC A0A067MLT3.1
#=GS A0A084TIM2_9FLAO/54-214     AC A0A084TIM2.1
#=GS W7QDG4_9GAMM/48-230         AC W7QDG4.1
#=GS A0A066RK26_9GAMM/28-231     AC A0A066RK26.1
#=GS A0A089WIM8_9PSED/59-196     AC A0A089WIM8.1
#=GS K0C808_CYCSP/20-234         AC K0C808.1
#=GS A0A0W4ZM01_PNECA/30-221     AC A0A0W4ZM01.1
#=GS A0A0D5MA75_9GAMM/8-209      AC A0A0D5MA75.1
#=GS K0UQ70_MYCVA/50-194         AC K0UQ70.1
#=GS A0A0C9Q1B6_9BACT/31-230     AC A0A0C9Q1B6.1
#=GS G7Y1N5_ASPKW/131-212        AC G7Y1N5.1
#=GS A0A0M4GUZ9_9ACTO/50-191     AC A0A0M4GUZ9.1
#=GS J4KM17_BEAB2/150-244        AC J4KM17.1
#=GS A0A0D7B814_9HOMO/111-231    AC A0A0D7B814.1
#=GS A0A166UDJ5_9HOMO/139-241    AC A0A166UDJ5.1
#=GS A0A0W8IED4_9MICO/51-193     AC A0A0W8IED4.1
#=GS A0A0S2DFC9_LYSEN/39-241     AC A0A0S2DFC9.1
#=GS A0A0C9Q1B6_9BACT/315-511    AC A0A0C9Q1B6.1
#=GS A0A0R3WM38_HYDTA/309-496    AC A0A0R3WM38.1
#=GS A0A093H8C6_PICPB/15-131     AC A0A093H8C6.1
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