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Database: Pfam
Entry: Kdo
LinkDB: Kdo
Original site: Kdo 
#=GF ID   Kdo
#=GF AC   PF06293.12
#=GF DE   Lipopolysaccharide kinase (Kdo/WaaP) family
#=GF AU   Studholme DJ
#=GF SE   Krupa A, Srinivasan N
#=GF GA   21.30 21.30;
#=GF TC   21.30 21.30;
#=GF NC   21.20 21.20;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 17690987 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF WK   Lipopolysaccharide_kinase_(Kdo/WaaP)_family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   11069912
#=GF RT   Purification and characterization of WaaP from Escherichia coli,
#=GF RT   a lipopolysaccharide kinase essential for outer membrane
#=GF RT   stability. 
#=GF RA   Yethon JA, Whitfield C; 
#=GF RL   J Biol Chem 2001;276:5498-5504.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   12021457
#=GF RT   Lipopolysaccharide phosphorylating enzymes encoded in the
#=GF RT   genomes of Gram-negative bacteria are related to the eukaryotic
#=GF RT   protein kinases. 
#=GF RA   Krupa A, Srinivasan N; 
#=GF RL   Protein Sci 2002;11:1580-1584.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   10531340
#=GF RT   A Haemophilus influenzae gene that encodes a membrane bound
#=GF RT   3-deoxy-D-manno-octulosonic acid (Kdo) kinase. Possible
#=GF RT   involvement of kdo phosphorylation in bacterial virulence. 
#=GF RA   White KA, Lin S, Cotter RJ, Raetz CR; 
#=GF RL   J Biol Chem 1999;274:31391-31400.
#=GF DR   INTERPRO; IPR010440;
#=GF CC   These lipopolysaccharide kinases are related to protein kinases
#=GF CC   Pfam:PF00069. This family includes waaP (rfaP) gene product is
#=GF CC   required for the addition of phosphate to O-4 of the first
#=GF CC   heptose residue of the lipopolysaccharide (LPS) inner core
#=GF CC   region. It has previously been shown that WaaP is  necessary for
#=GF CC   resistance to hydrophobic and polycationic antimicrobials in E.
#=GF CC   coli and that it is required for virulence in invasive strains
#=GF CC   of S. enterica [1].
#=GF SQ   1309
#=GS A1KBH9_AZOSB/27-241         AC A1KBH9.1
#=GS A0A094B0S1_9PEZI/178-255    AC A0A094B0S1.1
#=GS Q87VD9_PSESM/20-231         AC Q87VD9.1
#=GS A3QJC4_SHELP/28-238         AC A3QJC4.1
#=GS G7LTZ2_9ENTR/22-233         AC G7LTZ2.1
#=GS E1SW63_FERBD/28-235         AC E1SW63.1
#=GS B8MPN8_TALSN/670-755        AC B8MPN8.1
#=GS A0A089YU81_9PSED/20-231     AC A0A089YU81.1
#=GS A0A0F6A0U5_9GAMM/28-231     AC A0A0F6A0U5.1
#=GS A0A0C5VWY3_9GAMM/27-205     AC A0A0C5VWY3.1
#=GS W2CLA2_9PORP/59-196         AC W2CLA2.1
#=GS T1KH66_TETUR/20-189         AC T1KH66.1
#=GS A0A0M0BN66_9ARCH/7-181      AC A0A0M0BN66.1
#=GS G8Q3U0_PSEFL/280-464        AC G8Q3U0.1
#=GS A0A067N3I4_PLEOS/94-180     AC A0A067N3I4.1
#=GS K1WD31_TRIAC/446-557        AC K1WD31.1
#=GS M7SXD8_EUTLA/214-286        AC M7SXD8.1
#=GS D9XU35_9ACTN/53-209         AC D9XU35.1
#=GS PRPK_HUMAN/49-225           AC Q96S44.2
#=GS F1QB90_DANRE/11-203         AC F1QB90.1
#=GS W6UM79_ECHGR/316-506        AC W6UM79.1
#=GS A0A0D8Q827_9GAMM/28-231     AC A0A0D8Q827.1
#=GS J6GQB6_9PORP/40-229         AC J6GQB6.1
#=GS C9R5G5_AGGAD/23-219         AC C9R5G5.1
#=GS N1RYI8_FUSC4/177-254        AC N1RYI8.1
#=GS A0A0F4NMQ4_9VIBR/28-231     AC A0A0F4NMQ4.1
#=GS G8RNV9_MYCRN/54-213         AC G8RNV9.1
#=GS A0A0H4CJJ6_9ACTN/52-210     AC A0A0H4CJJ6.1
#=GS H3CDT1_TETNG/18-208         AC H3CDT1.1
#=GS A0A067PTL8_9HOMO/127-240    AC A0A067PTL8.1
#=GS K1XQT6_9BACT/39-259         AC K1XQT6.1
#=GS Q3A540_PELCD/269-463        AC Q3A540.1
#=GS Q543M9_MOUSE/31-216         AC Q543M9.1
#=GS C3PGB7_CORA7/45-197         AC C3PGB7.1
#=GS A0A0F2QX57_9PSED/20-231     AC A0A0F2QX57.1
#=GS D4XAA9_9BURK/42-234         AC D4XAA9.1
#=GS F2TJB6_AJEDA/689-754        AC F2TJB6.1
#=GS A0A0D9RQT4_CHLSB/49-225     AC A0A0D9RQT4.1
#=GS I0RTH9_MYCPH/54-212         AC I0RTH9.1
#=GS R7EF88_9BACE/25-198         AC R7EF88.1
#=GS D6Z2M2_DESAT/33-237         AC D6Z2M2.1
#=GS A0A0B4XFQ6_9GAMM/28-197     AC A0A0B4XFQ6.1
#=GS J9NUH9_CANLF/88-274         AC J9NUH9.1
#=GS A0A094BYJ8_9PEZI/339-416    AC A0A094BYJ8.1
#=GS A0A0M9VMU5_9BASI/65-241     AC A0A0M9VMU5.1
#=GS BUD32_YEAST/46-224          AC P53323.1
#=GS BUD32_YEAST/46-224          DR PDB; 4WW7 A; 46-224;
#=GS BUD32_YEAST/46-224          DR PDB; 4WW5 A; 46-224;
#=GS BUD32_YEAST/46-224          DR PDB; 4WWA A; 47-224;
#=GS BUD32_YEAST/46-224          DR PDB; 4WW9 A; 46-224;
#=GS A0A094G633_9PEZI/64-244     AC A0A094G633.1
#=GS A0A074RTG7_9HOMO/119-224    AC A0A074RTG7.1
#=GS K8WGU6_PRORE/20-230         AC K8WGU6.1
#=GS A1D5Z6_NEOFI/56-249         AC A1D5Z6.1
#=GS A0A0N4WIU5_HAEPC/220-402    AC A0A0N4WIU5.1
#=GS A0A094DI74_9PEZI/64-245     AC A0A094DI74.1
#=GS A0A0F3L3L1_9GAMM/31-235     AC A0A0F3L3L1.1
#=GS M1WER6_CLAP2/154-223        AC M1WER6.1
#=GS L0M0E9_ENTBF/19-230         AC L0M0E9.1
#=GS B1Y613_LEPCP/307-432        AC B1Y613.1
#=GS W0H4A9_PSECI/22-223         AC W0H4A9.1
#=GS A0A090U139_9ENTR/19-230     AC A0A090U139.1
#=GS B6HWF7_PENRW/497-580        AC B6HWF7.1
#=GS I3I9U5_9GAMM/62-247         AC I3I9U5.1
#=GS A0A0N4XGU1_NIPBR/262-456    AC A0A0N4XGU1.1
#=GS B6GVT4_PENRW/647-730        AC B6GVT4.1
#=GS H0EHA7_GLAL7/273-357        AC H0EHA7.1
#=GS G3JLC1_CORMM/143-242        AC G3JLC1.1
#=GS L2GBI8_COLGN/309-383        AC L2GBI8.1
#=GS T0LQP4_COLGC/136-228        AC T0LQP4.1
#=GS F3YXC4_DESAF/112-262        AC F3YXC4.1
#=GS A0A0F5EYH1_AVIPA/28-240     AC A0A0F5EYH1.1
#=GS A0A0F2QZF2_9PSED/22-223     AC A0A0F2QZF2.1
#=GS A0A0L1J6G4_ASPNO/116-200    AC A0A0L1J6G4.1
#=GS M9X4J7_MANHA/30-233         AC M9X4J7.1
#=GS A0A0M8UYP1_9ACTN/53-209     AC A0A0M8UYP1.1
#=GS V5FMF8_BYSSN/7-94           AC V5FMF8.1
#=GS C7RMS7_ACCPU/25-234         AC C7RMS7.1
#=GS K0KGG6_WICCF/762-932        AC K0KGG6.1
#=GS N1Q6C5_PSEFD/41-223         AC N1Q6C5.1
#=GS I4MN87_9BURK/462-662        AC I4MN87.1
#=GS Q4KJC2_PSEF5/58-172         AC Q4KJC2.1
#=GS C0N8T3_9GAMM/271-447        AC C0N8T3.1
#=GS F3ZQE9_9BACE/28-199         AC F3ZQE9.1
#=GS S6AY35_PSERE/18-221         AC S6AY35.1
#=GS A0A0F0EUM2_9MICO/51-197     AC A0A0F0EUM2.1
#=GS K9FWF5_PEND2/19-94          AC K9FWF5.1
#=GS A6R5H4_AJECN/581-676        AC A6R5H4.1
#=GS Q3A539_PELCD/57-250         AC Q3A539.1
#=GS W9CC88_9HELO/692-797        AC W9CC88.1
#=GS G5B7R3_HETGA/19-218         AC G5B7R3.1
#=GS L8ET40_STRRM/333-402        AC L8ET40.1
#=GS A6QYQ7_AJECN/267-344        AC A6QYQ7.1
#=GS E3HFN0_ACHXA/41-235         AC E3HFN0.1
#=GS I7A9F7_PSEST/20-231         AC I7A9F7.1
#=GS Q4WMM3_ASPFU/628-717        AC Q4WMM3.1
#=GS A0A067PGM5_9HOMO/48-127     AC A0A067PGM5.1
#=GS G3AWC4_CANTC/53-224         AC G3AWC4.1
#=GS A0A0N4ZXF0_PARTI/23-221     AC A0A0N4ZXF0.1
#=GS A6R3B6_AJECN/634-730        AC A6R3B6.1
#=GS K7DZC6_MONDO/30-199         AC K7DZC6.1
#=GS G8Q3T8_PSEFL/19-219         AC G8Q3T8.1
#=GS A0A094AH86_9PEZI/176-255    AC A0A094AH86.1
#=GS L9JGS1_TUPCH/31-180         AC L9JGS1.1
#=GS D4GSZ6_HALVD/409-530        AC D4GSZ6.1
#=GS U7U7P5_9BURK/40-233         AC U7U7P5.1
#=GS Q15ZV1_PSEA6/31-235         AC Q15ZV1.1
#=GS G8ZYF9_TORDC/40-224         AC G8ZYF9.1
#=GS K8YQ63_9STRA/43-223         AC K8YQ63.1
#=GS F5IXV2_9PORP/40-215         AC F5IXV2.1
#=GS C4L7W6_TOLAT/31-235         AC C4L7W6.1
#=GS E5R3W9_ARTGP/635-712        AC E5R3W9.1
#=GS M9LNH7_PSEA3/517-712        AC M9LNH7.1
#=GS B8M5A4_TALSN/51-252         AC B8M5A4.1
#=GS M4REZ1_9BIFI/72-228         AC M4REZ1.1
#=GS C6WXI9_METML/20-230         AC C6WXI9.1
#=GS R6XX48_9BACT/32-201         AC R6XX48.1
#=GS Q5LIR6_BACFN/39-218         AC Q5LIR6.1
#=GS A0A077YZ20_TRITR/403-574    AC A0A077YZ20.1
#=GS INAA_ECOLI/11-213           AC P27294.3
#=GS B8F3K2_HAEPS/27-230         AC B8F3K2.1
#=GS A0A0F8W2X4_9EURO/640-730    AC A0A0F8W2X4.1
#=GS A0A077F882_9PSED/22-223     AC A0A077F882.1
#=GS E9EM36_METRA/586-684        AC E9EM36.2
#=GS W4WGC5_ATTCE/8-221          AC W4WGC5.1
#=GS F5SZC4_9GAMM/280-463        AC F5SZC4.1
#=GS C2GEK7_9CORY/57-192         AC C2GEK7.1
#=GS A0A0L6VRN5_9BASI/23-218     AC A0A0L6VRN5.1
#=GS D6STK9_9DELT/44-242         AC D6STK9.1
#=GS A0A0F8U7V8_9EURO/707-786    AC A0A0F8U7V8.1
#=GS A0A077FD48_9PSED/40-209     AC A0A077FD48.1
#=GS W9C1Z4_9HELO/153-240        AC W9C1Z4.1
#=GS K2B5W6_9BACT/35-222         AC K2B5W6.1
#=GS A0KEC7_AERHH/28-232         AC A0KEC7.1
#=GS E7NI83_YEASO/46-224         AC E7NI83.1
#=GS A0A067SJM9_9AGAR/132-229    AC A0A067SJM9.1
#=GS G3XNP1_ASPNA/79-157         AC G3XNP1.1
#=GS D9QTS8_ACEAZ/37-219         AC D9QTS8.1
#=GS M7WKM3_RHOT1/608-707        AC M7WKM3.1
#=GS G3JK35_CORMM/198-286        AC G3JK35.1
#=GS D3SSC7_NATMM/427-529        AC D3SSC7.1
#=GS A0Z6Q2_9GAMM/45-243         AC A0Z6Q2.1
#=GS A0A0L0N1V2_9HYPO/153-217    AC A0A0L0N1V2.1
#=GS Q9HUF8_PSEAE/22-224         AC Q9HUF8.1
#=GS W5YU69_9ALTE/32-232         AC W5YU69.1
#=GS G4T600_PIRID/133-266        AC G4T600.1
#=GS A0A0L1INS5_ASPNO/632-714    AC A0A0L1INS5.1
#=GS A0A0K0JDV3_BRUMA/23-205     AC A0A0K0JDV3.1
#=GS E4ZGL5_LEPMJ/724-783        AC E4ZGL5.1
#=GS D0LWJ5_HALO1/50-211         AC D0LWJ5.1
#=GS F5T1B2_9GAMM/33-232         AC F5T1B2.1
#=GS Q88QY7_PSEPK/60-184         AC Q88QY7.1
#=GS U4KHM9_9VIBR/28-231         AC U4KHM9.1
#=GS N1J6W8_BLUG1/49-231         AC N1J6W8.1
#=GS C5FZM6_ARTOC/649-720        AC C5FZM6.1
#=GS A0A024HNL3_PSEKB/22-223     AC A0A024HNL3.1
#=GS M2QH55_CERS8/50-222         AC M2QH55.1
#=GS A0A0K8LD94_9EURO/133-194    AC A0A0K8LD94.1
#=GS A0A0G2HZV3_9EURO/624-734    AC A0A0G2HZV3.1
#=GS A0A089Z0A0_9PSED/21-219     AC A0A089Z0A0.1
#=GS A0A0B4G7I2_9HYPO/187-251    AC A0A0B4G7I2.1
#=GS E2AID2_CAMFO/7-222          AC E2AID2.1
#=GS E4RJX1_HALHG/48-218         AC E4RJX1.1
#=GS C7RPD8_ACCPU/61-217         AC C7RPD8.1
#=GS D7HU65_PSESS/22-223         AC D7HU65.1
#=GS A0A061IUF3_TRYRA/21-227     AC A0A061IUF3.1
#=GS G4MN82_MAGO7/255-347        AC G4MN82.1
#=GS A0A0G4GZT4_9ALVE/22-134     AC A0A0G4GZT4.1
#=GS A9E332_9FLAO/24-218         AC A9E332.1
#=GS R6DYR7_9BACT/8-201          AC R6DYR7.1
#=GS A0A0B2VBS6_TOXCA/7-225      AC A0A0B2VBS6.1
#=GS I1YG00_METFJ/525-687        AC I1YG00.1
#=GS A0A0B5FRV1_9DELT/19-234     AC A0A0B5FRV1.1
#=GS A0A068XJS2_HYMMI/50-231     AC A0A068XJS2.1
#=GS D5UJ62_CELFN/48-198         AC D5UJ62.1
#=GS G4LYN6_SCHMA/351-519        AC G4LYN6.1
#=GS Q0A4V2_ALKEH/93-233         AC Q0A4V2.1
#=GS M4X2M7_PSEDE/10-195         AC M4X2M7.1
#=GS C8VDA8_EMENI/653-722        AC C8VDA8.1
#=GS A0Y8D1_9GAMM/272-454        AC A0Y8D1.1
#=GS X2H6A6_9GAMM/21-232         AC X2H6A6.1
#=GS A0A0E3YZQ9_9GAMM/39-241     AC A0A0E3YZQ9.1
#=GS A0A077F9Y3_9PSED/16-224     AC A0A077F9Y3.1
#=GS B2WIS7_PYRTR/140-249        AC B2WIS7.1
#=GS A5DIF2_PICGU/56-223         AC A5DIF2.2
#=GS A0M3P8_GRAFK/32-217         AC A0M3P8.1
#=GS Q5E8L5_VIBF1/28-231         AC Q5E8L5.1
#=GS Q6NJ74_CORDI/54-200         AC Q6NJ74.1
#=GS F6ZWY1_XENTR/31-216         AC F6ZWY1.1
#=GS E9E028_METAQ/540-637        AC E9E028.1
#=GS S8EP66_FOMPI/145-251        AC S8EP66.1
#=GS V2XLC6_MONRO/108-212        AC V2XLC6.1
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#=GS D9QTT0_ACEAZ/69-246         AC D9QTT0.1
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#=GS C5FDC9_ARTOC/176-256        AC C5FDC9.1
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#=GS A8P1U3_COPC7/96-208         AC A8P1U3.2
#=GS Q0A4U0_ALKEH/53-250         AC Q0A4U0.1
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#=GS W0TLM7_9GAMM/283-465        AC W0TLM7.1
#=GS W4XEW7_STRPU/114-299        AC W4XEW7.1
#=GS I1YKE3_METFJ/273-444        AC I1YKE3.1
#=GS Q4KJC4_PSEF5/22-234         AC Q4KJC4.1
#=GS A0A074W1Y2_9PEZI/178-347    AC A0A074W1Y2.1
#=GS A1S1Q7_SHEAM/41-247         AC A1S1Q7.1
#=GS E8QYE2_ISOPI/87-309         AC E8QYE2.1
#=GS S2JM14_MUCC1/30-207         AC S2JM14.1
#=GS G3VGX9_SARHA/52-230         AC G3VGX9.1
#=GS A0A0F2R2A8_9DELT/29-207     AC A0A0F2R2A8.1
#=GS E9D5H1_COCPS/54-259         AC E9D5H1.1
#=GS B6ITC8_RHOCS/52-194         AC B6ITC8.1
#=GS B8LU52_TALSN/209-299        AC B8LU52.1
#=GS A0A0F8URL3_9EURO/690-775    AC A0A0F8URL3.1
#=GS J3KCC1_COCIM/657-744        AC J3KCC1.2
#=GS K0C8E1_CYCSP/62-241         AC K0C8E1.1
#=GS F0XHY3_GROCL/180-261        AC F0XHY3.1
#=GS B7VHL2_VIBTL/29-232         AC B7VHL2.1
#=GS A0A0M2K4U7_9MYCO/53-192     AC A0A0M2K4U7.1
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#=GS A0A0N0S045_9EURO/1-47       AC A0A0N0S045.1
#=GS E6K2J6_PARDN/88-239         AC E6K2J6.1
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#=GS A0A0A7LAB6_9EURY/25-183     AC A0A0A7LAB6.1
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#=GS D2B949_STRRD/98-227         AC D2B949.1
#=GS S6BPL9_PSERE/22-223         AC S6BPL9.1
#=GS A0A0F7TJY5_9EURO/54-245     AC A0A0F7TJY5.1
#=GS I1XHZ9_METNJ/534-702        AC I1XHZ9.1
#=GS I3MU32_ICTTR/39-225         AC I3MU32.1
#=GS K5XCG2_9PSED/290-446        AC K5XCG2.1
#=GS A0YBN8_9GAMM/18-184         AC A0YBN8.1
#=GS M4XMB4_PSEDE/22-223         AC M4XMB4.1
#=GS R5MD84_9BACE/299-457        AC R5MD84.1
#=GS G0VG50_NAUCC/51-227         AC G0VG50.1
#=GS E8QYE2_ISOPI/481-670        AC E8QYE2.1
#=GS D3SDL2_THISK/81-233         AC D3SDL2.1
#=GS A1KBI1_AZOSB/299-480        AC A1KBI1.1
#=GS W5II10_SCAIO/88-237         AC W5II10.1
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#=GS K2R9R1_MACPH/190-271        AC K2R9R1.1
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#=GS K2JYG0_9GAMM/40-245         AC K2JYG0.1
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#=GS H0Z4Q3_TAEGU/14-132         AC H0Z4Q3.1
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#=GS A6H030_FLAPJ/47-206         AC A6H030.1
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#=GS F8Q255_SERL3/127-234        AC F8Q255.1
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#=GS A0A0F5VK73_9ACTN/53-208     AC A0A0F5VK73.1
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#=GS R6FFN1_9BACE/49-232         AC R6FFN1.1
#=GS F2T2Z3_AJEDA/684-768        AC F2T2Z3.1
#=GS A0A0M2Z962_9ACTN/52-208     AC A0A0M2Z962.1
#=GS D0LK23_HALO1/54-214         AC D0LK23.1
#=GS C4Y0Q7_CLAL4/22-218         AC C4Y0Q7.1
#=GS M1WFD5_CLAP2/194-276        AC M1WFD5.1
#=GS U5WBE2_9ACTN/52-209         AC U5WBE2.1
#=GS A4VR68_PSEU5/57-268         AC A4VR68.1
#=GS H2S3S4_TAKRU/50-226         AC H2S3S4.1
#=GS E1V422_HALED/44-203         AC E1V422.1
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