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Database: Pfam
Entry: Lycopene_cycl
LinkDB: Lycopene_cycl
Original site: Lycopene_cycl 
#=GF ID   Lycopene_cycl
#=GF AC   PF05834.11
#=GF DE   Lycopene cyclase protein
#=GF AU   Moxon SJ
#=GF SE   Pfam-B_8336 (release 8.0)
#=GF GA   23.40 23.40;
#=GF TC   23.40 23.40;
#=GF NC   23.30 23.30;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 26740544 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   8837512
#=GF RT   Functional analysis of the beta and epsilon lycopene cyclase
#=GF RT   enzymes of Arabidopsis reveals a mechanism for control of cyclic
#=GF RT   carotenoid formation. 
#=GF RA   Cunningham FX Jr, Pogson B, Sun Z, McDonald KA, DellaPenna D,
#=GF RA   Gantt E; 
#=GF RL   Plant Cell 1996;8:1613-1626.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   11226339
#=GF RT   One ring or two? Determination of ring number in carotenoids by
#=GF RT   lycopene epsilon-cyclases. 
#=GF RA   Cunningham FX Jr, Gantt E; 
#=GF RL   Proc Natl Acad Sci U S A 2001;98:2905-2910.
#=GF CC   This family consists of lycopene beta and epsilon cyclase
#=GF CC   proteins. Carotenoids with cyclic end groups are essential
#=GF CC   components of the photosynthetic membranes in all plants, algae,
#=GF CC   and cyanobacteria. These lipid-soluble compounds protect against
#=GF CC   photo-oxidation, harvest light for photosynthesis, and dissipate
#=GF CC   excess light energy absorbed by the antenna pigments. The
#=GF CC   cyclisation of lycopene (psi, psi-carotene) is a key branch
#=GF CC   point in the pathway of carotenoid biosynthesis. Two types of
#=GF CC   cyclic end groups are found in higher plant carotenoids: the
#=GF CC   beta and epsilon rings. Carotenoids with two beta rings are
#=GF CC   ubiquitous, and those with one beta and one epsilon ring are
#=GF CC   common; however, carotenoids with two epsilon rings are rare
#=GF CC   [1,2].  
#=GF SQ   995
#=GS A0A0Q4KST3_9SPHN/8-380     AC A0A0Q4KST3.1
#=GS E6XDE0_CELAD/5-376         AC E6XDE0.1
#=GS I1H9L4_BRADI/11-194        AC I1H9L4.1
#=GS G0L580_ZOBGA/8-380         AC G0L580.1
#=GS A0A0N1BKL0_9SPHN/7-379     AC A0A0N1BKL0.1
#=GS A0A0F5PAL0_9SPHN/7-379     AC A0A0F5PAL0.1
#=GS K1L9I7_9BACT/9-382         AC K1L9I7.1
#=GS M4CRJ7_BRARP/116-510       AC M4CRJ7.1
#=GS U7D5N7_9BACT/5-197         AC U7D5N7.1
#=GS A0A0B8WRE3_9DELT/7-370     AC A0A0B8WRE3.1
#=GS A5VB81_SPHWW/7-380         AC A5VB81.1
#=GS J3L1C5_ORYBR/28-427        AC J3L1C5.1
#=GS L0IX24_9MYCO/3-165         AC L0IX24.1
#=GS W9S642_9ROSA/80-473        AC W9S642.1
#=GS V4YJ10_9PROT/4-401         AC V4YJ10.1
#=GS D9XNI7_9ACTN/1-313         AC D9XNI7.1
#=GS L1K0V8_GUITH/136-278       AC L1K0V8.1
#=GS A0A0D0USZ0_9ACTN/10-381    AC A0A0D0USZ0.1
#=GS A0A095SW91_9FLAO/6-374     AC A0A095SW91.1
#=GS F6GHB9_LACS5/8-377         AC F6GHB9.1
#=GS M0RZ31_MUSAM/28-426        AC M0RZ31.1
#=GS A0A0H5CGI0_9PSEU/6-357     AC A0A0H5CGI0.1
#=GS A0A0C7NDU4_9THEO/6-51      AC A0A0C7NDU4.1
#=GS I0KE89_9BACT/5-375         AC I0KE89.1
#=GS A0A0S9R7Z4_9ACTN/7-366     AC A0A0S9R7Z4.1
#=GS K0ET44_9NOCA/10-357        AC K0ET44.1
#=GS J3MT20_ORYBR/83-241        AC J3MT20.1
#=GS A0A164I4K6_9NOCA/10-366    AC A0A164I4K6.1
#=GS W0E9A2_9FIRM/5-44          AC W0E9A2.1
#=GS A0A0N0APC3_9PSEU/1-330     AC A0A0N0APC3.1
#=GS C0ZZI7_RHOE4/9-367         AC C0ZZI7.1
#=GS A0A0S7WPD5_9CHLR/3-335     AC A0A0S7WPD5.1
#=GS A0A059MRG9_9NOCA/11-384    AC A0A059MRG9.1
#=GS A0A099J448_9MICO/8-372     AC A0A099J448.1
#=GS A0A096UC65_MAIZE/38-436    AC A0A096UC65.1
#=GS A0A078LU15_9PSED/6-376     AC A0A078LU15.1
#=GS A0A0U1QKC2_9SYNE/13-399    AC A0A0U1QKC2.1
#=GS K6WZ54_9MICO/293-418       AC K6WZ54.1
#=GS F6EUT8_SPHCR/5-376         AC F6EUT8.1
#=GS L1K0V8_GUITH/351-614       AC L1K0V8.1
#=GS C1N7E6_MICPC/854-1137      AC C1N7E6.1
#=GS A0A0J8BAA9_BETVU/125-523   AC A0A0J8BAA9.1
#=GS A0A0N0A2R5_9NOCA/3-371     AC A0A0N0A2R5.1
#=GS A0A176TCC1_9FLAO/2-357     AC A0A176TCC1.1
#=GS A0A0F7KYY9_9SPHN/7-380     AC A0A0F7KYY9.1
#=GS C1N7E6_MICPC/713-839       AC C1N7E6.1
#=GS Q0S0G9_RHOJR/59-418        AC Q0S0G9.1
#=GS G8RY24_MYCRN/37-218        AC G8RY24.1
#=GS A0A0S8EYQ0_9DELT/6-385     AC A0A0S8EYQ0.1
#=GS A0A143BQ70_9BACT/24-403    AC A0A143BQ70.1
#=GS L8EHN6_STRRM/5-384         AC L8EHN6.1
#=GS A0A0A1B2R7_9GAMM/6-376     AC A0A0A1B2R7.1
#=GS A0A0K9NQI4_ZOSMR/91-488    AC A0A0K9NQI4.1
#=GS Y801_DEIRA/10-385          AC Q9RW68.1
#=GS C1IP75_WHEAT/115-514       AC C1IP75.1
#=GS A0A0X3SWS3_9ACTN/14-161    AC A0A0X3SWS3.1
#=GS D7L8W7_ARALL/84-479        AC D7L8W7.1
#=GS V4LF12_EUTSA/82-478        AC V4LF12.1
#=GS A0A0D2UFJ3_GOSRA/115-518   AC A0A0D2UFJ3.1
#=GS A9S871_PHYPA/102-495       AC A9S871.1
#=GS U5ECN2_NOCAS/4-344         AC U5ECN2.1
#=GS A0A0M8WSI2_9ACTN/1-369     AC A0A0M8WSI2.1
#=GS A2Q2Y6_MEDTR/83-476        AC A2Q2Y6.1
#=GS I9WDF4_9SPHN/24-395        AC I9WDF4.1
#=GS A0A0D2JKJ9_9CHLO/60-459    AC A0A0D2JKJ9.1
#=GS A0A0D6TM50_9FLAO/6-374     AC A0A0D6TM50.1
#=GS M1APW5_SOLTU/85-478        AC M1APW5.1
#=GS G7GIT4_9ACTN/1-361         AC G7GIT4.1
#=GS H8GZY4_DEIGI/12-391        AC H8GZY4.1
#=GS B8BUM8_THAPS/89-499        AC B8BUM8.1
#=GS A0A085VM14_PSESX/4-374     AC A0A085VM14.1
#=GS W1PYB6_AMBTC/126-519       AC W1PYB6.1
#=GS V7B1F7_PHAVU/1-152         AC V7B1F7.1
#=GS A0A0U5KZA4_9GAMM/6-376     AC A0A0U5KZA4.1
#=GS A0A0U3MMI0_9BURK/230-380   AC A0A0U3MMI0.1
#=GS A0A0B8XMX7_9SPHI/10-392    AC A0A0B8XMX7.1
#=GS Q0W1J4_METAR/4-349         AC Q0W1J4.1
#=GS G2Z2I9_FLABF/4-376         AC G2Z2I9.1
#=GS A0A0N1BV40_9PROT/11-393    AC A0A0N1BV40.1
#=GS D9TDL7_MICAI/16-387        AC D9TDL7.1
#=GS A0A0P7B1V1_9FLAO/5-375     AC A0A0P7B1V1.1
#=GS K2QAR5_9RHIZ/6-389         AC K2QAR5.1
#=GS A0A0C1ZXK5_9DELT/13-408    AC A0A0C1ZXK5.1
#=GS A2BJ01_HYPBU/7-331         AC A2BJ01.1
#=GS A0A101DQR8_9EURY/5-362     AC A0A101DQR8.1
#=GS B1L6M6_KORCO/5-184         AC B1L6M6.1
#=GS M4ECZ6_BRARP/1-77          AC M4ECZ6.1
#=GS A0A096PG33_MAIZE/12-106    AC A0A096PG33.1
#=GS A0A0F2J1A4_9BACT/8-189     AC A0A0F2J1A4.1
#=GS Q4FPE3_PELUB/1-336         AC Q4FPE3.1
#=GS A0A0B8NIU0_9NOCA/4-354     AC A0A0B8NIU0.1
#=GS F8E2K3_CORRG/5-360         AC F8E2K3.1
#=GS K0SH12_THAOC/82-517        AC K0SH12.1
#=GS A0A0B5ETP4_STRA4/13-387    AC A0A0B5ETP4.1
#=GS A0A0J8YHA3_9BACT/5-374     AC A0A0J8YHA3.1
#=GS W9QK12_9ROSA/116-520       AC W9QK12.1
#=GS J1RWG7_9ACTN/5-383         AC J1RWG7.1
#=GS A0A151BRN1_9ARCH/10-360    AC A0A151BRN1.1
#=GS A0A0G2HM62_9SYNE/4-390     AC A0A0G2HM62.1
#=GS A0A127MJE2_9SPHN/10-381    AC A0A127MJE2.1
#=GS B9SZS9_RICCO/99-492        AC B9SZS9.1
#=GS M5VYW6_PRUPE/82-475        AC M5VYW6.1
#=GS A0A0N9N3B6_9ACTN/8-359     AC A0A0N9N3B6.1
#=GS A0A172YG06_9GAMM/6-374     AC A0A172YG06.1
#=GS A0A017RSM5_9CLOT/5-46      AC A0A017RSM5.1
#=GS A1K6U6_AZOSB/2-153         AC A1K6U6.1
#=GS D6XBX4_9ACTN/47-426        AC D6XBX4.1
#=GS I0HDN1_ACTM4/4-373         AC I0HDN1.1
#=GS J3N8L9_ORYBR/1-174         AC J3N8L9.1
#=GS M8A8B2_TRIUA/11-191        AC M8A8B2.1
#=GS A0A0D2LRX1_GOSRA/112-510   AC A0A0D2LRX1.1
#=GS A0A0M2K0J5_9MYCO/2-374     AC A0A0M2K0J5.1
#=GS Q82PA6_STRAW/5-384         AC Q82PA6.1
#=GS A0A0W1AF54_9GAMM/7-373     AC A0A0W1AF54.1
#=GS A0A0K2YMS1_9NOCA/3-359     AC A0A0K2YMS1.1
#=GS A0A126ZFR2_9BURK/6-376     AC A0A126ZFR2.1
#=GS I1JN65_SOYBN/92-485        AC I1JN65.1
#=GS T0IW16_9SPHN/8-376         AC T0IW16.1
#=GS Q8LJ81_ORYSJ/119-518       AC Q8LJ81.1
#=GS F7XNL5_METZD/9-360         AC F7XNL5.1
#=GS H8Z4Q7_9GAMM/8-392         AC H8Z4Q7.1
#=GS D7E8N0_METEZ/4-176         AC D7E8N0.1
#=GS V4KXG8_EUTSA/111-506       AC V4KXG8.1
#=GS M7ZUM0_TRIUA/1-179         AC M7ZUM0.1
#=GS A0A067EDS0_CITSI/109-476   AC A0A067EDS0.1
#=GS Q7EYS3_ORYSJ/140-309       AC Q7EYS3.1
#=GS I1L1L3_SOYBN/112-510       AC I1L1L3.1
#=GS D2QEF6_SPILD/5-384         AC D2QEF6.1
#=GS A0A150X3X2_9BACT/6-370     AC A0A150X3X2.1
#=GS V5AW51_ENTCL/6-376         AC V5AW51.1
#=GS C5XX29_SORBI/73-469        AC C5XX29.1
#=GS A0A0C7DVY2_9GAMM/10-297    AC A0A0C7DVY2.1
#=GS A0A147JZD7_9EURY/6-179     AC A0A147JZD7.1
#=GS A0P4Y2_9PROT/6-369         AC A0P4Y2.1
#=GS A0A0P6XE50_9CHLR/5-376     AC A0A0P6XE50.1
#=GS M1A5D5_SOLTU/83-476        AC M1A5D5.1
#=GS LCYB_SOLLC/85-478          AC Q43503.1
#=GS A0A098LUV6_9FLAO/8-376     AC A0A098LUV6.1
#=GS M4F900_BRARP/244-395       AC M4F900.1
#=GS A0A0R2TFG6_9FLAO/6-355     AC A0A0R2TFG6.1
#=GS W9GQG1_9PROT/225-393       AC W9GQG1.1
#=GS A0A0Q8XE03_9SPHN/8-380     AC A0A0Q8XE03.1
#=GS G7WJA8_DESOD/17-184        AC G7WJA8.1
#=GS A0A078FF29_BRANA/113-508   AC A0A078FF29.1
#=GS T0IK94_9SPHN/8-376         AC T0IK94.1
#=GS A0A101EX51_9BACT/204-354   AC A0A101EX51.1
#=GS A0A0Q5VUX2_9ACTN/10-357    AC A0A0Q5VUX2.1
#=GS A0A061GLV2_THECC/110-508   AC A0A061GLV2.1
#=GS U5E603_NOCAS/21-370        AC U5E603.1
#=GS W8VVS0_9FLAO/6-374         AC W8VVS0.1
#=GS H0R608_9ACTN/6-359         AC H0R608.1
#=GS A0A0P9CHN0_9PROT/5-352     AC A0A0P9CHN0.1
#=GS M9SAY3_9EURY/3-340         AC M9SAY3.1
#=GS Q2RWR2_RHORT/232-400       AC Q2RWR2.1
#=GS A0A0Q5E822_9BURK/23-393    AC A0A0Q5E822.1
#=GS A0A0N0MT98_9ACTN/5-384     AC A0A0N0MT98.1
#=GS A0A117S502_9FIRM/5-44      AC A0A117S502.1
#=GS A0A0N0AW12_9ACTN/6-382     AC A0A0N0AW12.1
#=GS B9H962_POPTR/89-482        AC B9H962.1
#=GS A0A101DWJ0_9EURY/4-187     AC A0A101DWJ0.1
#=GS A0A089YP11_9PSED/4-374     AC A0A089YP11.1
#=GS A0A151T5F0_CAJCA/1-32      AC A0A151T5F0.1
#=GS Q1YU65_9GAMM/6-382         AC Q1YU65.1
#=GS D8T5C7_SELML/97-495        AC D8T5C7.1
#=GS A0A0L9UNF8_PHAAN/83-476    AC A0A0L9UNF8.1
#=GS A0A0P0P0Q7_9CAUL/11-382    AC A0A0P0P0Q7.1
#=GS B1VLY2_STRGG/16-394        AC B1VLY2.1
#=GS A0A0D3EBZ0_BRAOL/114-510   AC A0A0D3EBZ0.1
#=GS A0A090Q656_9FLAO/6-376     AC A0A090Q656.1
#=GS E1IFM7_9CHLR/6-377         AC E1IFM7.1
#=GS A0A0F7FHS9_9CREN/4-335     AC A0A0F7FHS9.1
#=GS C6A351_THESM/8-377         AC C6A351.1
#=GS A0A0F4PQ26_9GAMM/4-178     AC A0A0F4PQ26.1
#=GS W5W852_9PSEU/4-350         AC W5W852.1
#=GS H6N1M0_GORPV/6-369         AC H6N1M0.1
#=GS R4SS78_AMYOR/3-363         AC R4SS78.1
#=GS K3YH12_SETIT/66-233        AC K3YH12.1
#=GS I2F0D6_EMTOG/7-381         AC I2F0D6.1
#=GS C4JBX8_MAIZE/119-301       AC C4JBX8.1
#=GS X5MCP7_9RHIZ/13-384        AC X5MCP7.1
#=GS A0A164WPY9_DAUCA/92-486    AC A0A164WPY9.1
#=GS V5X6E6_MYCNE/4-377         AC V5X6E6.1
#=GS A0A0X3WBV1_9ACTN/5-385     AC A0A0X3WBV1.1
#=GS A0A136KHA3_9BACT/67-252    AC A0A136KHA3.1
#=GS F4F2P3_VERMA/9-379         AC F4F2P3.1
#=GS W9Y7Y6_9EURO/10-182        AC W9Y7Y6.1
#=GS A0A164V2Z7_DAUCA/77-470    AC A0A164V2Z7.1
#=GS G2IMQ8_9SPHN/8-380         AC G2IMQ8.1
#=GS D0LDL3_GORB4/3-364         AC D0LDL3.1
#=GS F8JKV5_STREN/5-384         AC F8JKV5.1
#=GS A4BXN5_9FLAO/4-374         AC A4BXN5.1
#=GS A0A0M2YQQ0_9ACTN/6-385     AC A0A0M2YQQ0.1
#=GS A0A0D1EGC9_9RHOB/4-366     AC A0A0D1EGC9.1
#=GS W5WY65_9CORY/17-361        AC W5WY65.1
#=GS A0A0C1TKS4_9ACTN/6-387     AC A0A0C1TKS4.1
#=GS E0UL60_CYAP2/10-188        AC E0UL60.1
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