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Database: Pfam
Entry: Lycopene_cycl
LinkDB: Lycopene_cycl
Original site: Lycopene_cycl 
#=GF ID   Lycopene_cycl
#=GF AC   PF05834.7
#=GF DE   Lycopene cyclase protein
#=GF AU   Moxon SJ
#=GF SE   Pfam-B_8336 (release 8.0)
#=GF GA   23.40 23.40;
#=GF TC   23.40 23.40;
#=GF NC   23.30 23.30;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 23193494 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   8837512
#=GF RT   Functional analysis of the beta and epsilon lycopene cyclase
#=GF RT   enzymes of Arabidopsis reveals a mechanism for control of cyclic
#=GF RT   carotenoid formation. 
#=GF RA   Cunningham FX Jr, Pogson B, Sun Z, McDonald KA, DellaPenna D,
#=GF RA   Gantt E; 
#=GF RL   Plant Cell 1996;8:1613-1626.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   11226339
#=GF RT   One ring or two? Determination of ring number in carotenoids by
#=GF RT   lycopene epsilon-cyclases. 
#=GF RA   Cunningham FX Jr, Gantt E; 
#=GF RL   Proc Natl Acad Sci U S A 2001;98:2905-2910.
#=GF DR   INTERPRO; IPR008671;
#=GF CC   This family consists of lycopene beta and epsilon cyclase
#=GF CC   proteins. Carotenoids with cyclic end groups are essential
#=GF CC   components of the photosynthetic membranes in all plants, algae,
#=GF CC   and cyanobacteria. These lipid-soluble compounds protect against
#=GF CC   photo-oxidation, harvest light for photosynthesis, and dissipate
#=GF CC   excess light energy absorbed by the antenna pigments. The
#=GF CC   cyclisation of lycopene (psi, psi-carotene) is a key branch
#=GF CC   point in the pathway of carotenoid biosynthesis. Two types of
#=GF CC   cyclic end groups are found in higher plant carotenoids: the
#=GF CC   beta and epsilon rings. Carotenoids with two beta rings are
#=GF CC   ubiquitous, and those with one beta and one epsilon ring are
#=GF CC   common; however, carotenoids with two epsilon rings are rare
#=GF CC   [1,2].  
#=GF SQ   839
#=GS E5FQF2_MUSBA/1-226     AC E5FQF2.1
#=GS F4AZ58_KROS4/6-376     AC F4AZ58.1
#=GS B9RK92_RICCO/104-473   AC B9RK92.1
#=GS E8S783_MICSL/16-387    AC E8S783.1
#=GS C5HU10_CITPA/87-481    AC C5HU10.1
#=GS A4GHN9_9BACT/10-353    AC A4GHN9.1
#=GS E6XDE0_CELAD/5-376     AC E6XDE0.1
#=GS G7M843_9CLOT/4-53      AC G7M843.1
#=GS G4XU59_CITSI/88-481    AC G4XU59.1
#=GS A4CHD3_ROBBH/5-374     AC A4CHD3.1
#=GS F2J2K0_POLGS/44-136    AC F2J2K0.1
#=GS F6I0Z1_VITVI/6-160     AC F6I0Z1.1
#=GS A5GRY7_SYNR3/8-400     AC A5GRY7.1
#=GS D3MLW3_PROAA/8-401     AC D3MLW3.1
#=GS A8G5D3_PROM2/5-397     AC A8G5D3.1
#=GS F9U7M7_9GAMM/12-379    AC F9U7M7.1
#=GS F3CX12_PROAA/13-406    AC F3CX12.1
#=GS Q9SDS5_DAUCA/1-165     AC Q9SDS5.1
#=GS Q8L8H5_TARER/11-408    AC Q8L8H5.1
#=GS D9XNI7_9ACTO/1-313     AC D9XNI7.1
#=GS B9P2E9_PROMR/5-397     AC B9P2E9.1
#=GS G0PX44_STRGR/19-199    AC G0PX44.1
#=GS Q2MGW7_TAROF/89-482    AC Q2MGW7.1
#=GS B6BS74_9PROT/5-353     AC B6BS74.1
#=GS G4IHK9_9EURY/6-210     AC G4IHK9.1
#=GS Q2VEX7_DAUCA/92-486    AC Q2VEX7.1
#=GS Q330P8_HAEPL/106-514   AC Q330P8.1
#=GS E1Z6E2_CHLVA/52-463    AC E1Z6E2.1
#=GS F6AD51_PSEF1/4-374     AC F6AD51.1
#=GS Q4JVL5_CORJK/74-272    AC Q4JVL5.1
#=GS B9P5X1_POPTR/1-119     AC B9P5X1.1
#=GS D8RJD9_SELML/30-428    AC D8RJD9.1
#=GS Q64HC6_CITSI/89-482    AC Q64HC6.1
#=GS C0ZZI7_RHOE4/9-367     AC C0ZZI7.1
#=GS Q9EXK5_STRGR/6-386     AC Q9EXK5.1
#=GS A3Z7S8_9SYNE/8-412     AC A3Z7S8.1
#=GS D7D8J7_STAHD/4-202     AC D7D8J7.1
#=GS A1K6U6_AZOSB/3-151     AC A1K6U6.1
#=GS B9LMD6_HALLT/6-213     AC B9LMD6.1
#=GS A2TDC8_CITLA/89-482    AC A2TDC8.1
#=GS GGR_PYRHO/4-362        AC O57920.1
#=GS F7XNL5_METZD/9-359     AC F7XNL5.1
#=GS D8QRG2_SELML/30-428    AC D8QRG2.1
#=GS F6EUT8_SPHCR/5-376     AC F6EUT8.1
#=GS B7XC80_9LILI/1-354     AC B7XC80.1
#=GS D4HA76_PROAS/8-401     AC D4HA76.1
#=GS E4EVD8_PROAA/13-406    AC E4EVD8.1
#=GS Q403Q7_TAXDI/110-503   AC Q403Q7.1
#=GS Q5N344_SYNP6/9-194     AC Q5N344.1
#=GS B9HQ44_POPTR/81-474    AC B9HQ44.1
#=GS G7WQH1_METH6/4-164     AC G7WQH1.1
#=GS A3PDG8_PROM0/5-397     AC A3PDG8.1
#=GS G2PQJ9_MURRD/5-376     AC G2PQJ9.1
#=GS B2CPI9_SOLLC/108-505   AC B2CPI9.1
#=GS F6CKP1_DESK7/6-54      AC F6CKP1.1
#=GS F2EZ64_PANAA/6-375     AC F2EZ64.1
#=GS Q0S0G9_RHOSR/59-418    AC Q0S0G9.1
#=GS E4CWI3_PROAA/13-406    AC E4CWI3.1
#=GS Q00WD1_OSTTA/72-485    AC Q00WD1.1
#=GS G6E9P2_9SPHN/15-391    AC G6E9P2.1
#=GS Q2C284_9GAMM/4-364     AC Q2C284.1
#=GS CRTY_PANAN/6-375       AC P21687.1
#=GS C4XQT1_DESMR/6-182     AC C4XQT1.1
#=GS Q403S4_CRYJA/110-503   AC Q403S4.1
#=GS A0FJC0_CITLA/1-250     AC A0FJC0.1
#=GS C8NNZ0_COREF/150-283   AC C8NNZ0.1
#=GS C7C531_9ENTR/5-375     AC C7C531.1
#=GS A2BRP2_PROMS/5-397     AC A2BRP2.1
#=GS F1A8E1_BRANA/113-506   AC F1A8E1.1
#=GS B5HD00_STRPR/22-214    AC B5HD00.1
#=GS A5FLG7_FLAJ1/10-384    AC A5FLG7.1
#=GS D5BNT9_PUNMI/29-375    AC D5BNT9.1
#=GS A3CVD0_METMJ/1-328     AC A3CVD0.1
#=GS G9AY31_PANAN/6-375     AC G9AY31.1
#=GS G0EEH2_PYRF1/6-164     AC G0EEH2.1
#=GS D9UQL5_9ACTO/1-321     AC D9UQL5.1
#=GS C1IP75_WHEAT/115-514   AC C1IP75.1
#=GS Q9M546_CITSI/89-482    AC Q9M546.2
#=GS Q403Q6_TAXDI/110-503   AC Q403Q6.1
#=GS B7J778_ACIF2/208-341   AC B7J778.1
#=GS D7L8W7_ARALL/84-479    AC D7L8W7.1
#=GS B5IYY8_9RHOB/7-366     AC B5IYY8.1
#=GS C4LIP4_CORK4/106-390   AC C4LIP4.1
#=GS A2BQB4_PROMS/3-401     AC A2BQB4.1
#=GS E8U839_DEIML/9-391     AC E8U839.1
#=GS Q70SZ9_BIXOR/84-477    AC Q70SZ9.1
#=GS A3WEH4_9SPHN/7-392     AC A3WEH4.1
#=GS A9S871_PHYPA/102-495   AC A9S871.1
#=GS E8N507_ANATU/6-377     AC E8N507.1
#=GS LCYB_TOBAC/85-478      AC Q43578.1
#=GS B4S957_PROA2/4-172     AC B4S957.1
#=GS Q5Z1W7_NOCFA/9-359     AC Q5Z1W7.1
#=GS Q7V508_PROMM/7-405     AC Q7V508.1
#=GS A2Q2Y6_MEDTR/83-476    AC A2Q2Y6.1
#=GS F1V011_PROAA/13-406    AC F1V011.1
#=GS A6G822_9DELT/7-414     AC A6G822.1
#=GS Q9SDS6_DAUCA/1-165     AC Q9SDS6.1
#=GS E4C4L8_PROAA/13-406    AC E4C4L8.1
#=GS F2DNF6_HORVD/166-336   AC F2DNF6.1
#=GS E5FQF4_MUSBA/1-224     AC E5FQF4.1
#=GS H8GZY4_DEIGI/12-391    AC H8GZY4.1
#=GS A9BA10_PROM4/8-406     AC A9BA10.1
#=GS Q766E9_CITSI/1-235     AC Q766E9.1
#=GS C8WQ32_ALIAD/6-45      AC C8WQ32.1
#=GS B8BUM8_THAPS/89-499    AC B8BUM8.1
#=GS Q9K426_STRCO/16-207    AC Q9K426.1
#=GS G0QIJ4_9EURY/3-201     AC G0QIJ4.1
#=GS Q83WZ9_STRRO/5-384     AC Q83WZ9.1
#=GS A3J3G3_9FLAO/6-388     AC A3J3G3.1
#=GS E9LFG0_ENTAG/5-374     AC E9LFG0.1
#=GS Q403S8_CRYJA/110-503   AC Q403S8.1
#=GS D8JT19_HYPDA/12-170    AC D8JT19.1
#=GS D8TIQ5_VOLCA/106-517   AC D8TIQ5.1
#=GS H0C496_9BURK/2-202     AC H0C496.1
#=GS Q6QM26_CITSI/17-415    AC Q6QM26.1
#=GS C3V9U1_CITSI/89-482    AC C3V9U1.1
#=GS D9IL23_ONCHC/61-450    AC D9IL23.1
#=GS D5URP4_TSUPD/107-336   AC D5URP4.1
#=GS B9F3S8_ORYSJ/1-173     AC B9F3S8.1
#=GS A5BQ04_VITVI/109-506   AC A5BQ04.1
#=GS A4SAS8_OSTLU/99-512    AC A4SAS8.1
#=GS H6N1M0_GORPV/6-368     AC H6N1M0.1
#=GS G2Z2I9_FLABF/4-376     AC G2Z2I9.1
#=GS E4CQS9_PROAA/13-406    AC E4CQS9.1
#=GS F8H382_PSEUT/6-376     AC F8H382.1
#=GS D9TDL7_MICAI/16-387    AC D9TDL7.1
#=GS F9VR43_9ACTO/4-350     AC F9VR43.1
#=GS Q93HP4_STRAW/56-435    AC Q93HP4.1
#=GS F0Y504_AURAN/59-469    AC F0Y504.1
#=GS GGR_THEGJ/6-365        AC C5A6E5.1
#=GS A1KYX9_SALEU/83-476    AC A1KYX9.1
#=GS A4VMH4_PSEU5/161-205   AC A4VMH4.1
#=GS B0C3S0_ACAM1/4-392     AC B0C3S0.1
#=GS F1C4C1_PHAVU/87-480    AC F1C4C1.1
#=GS C5IBN9_CARPA/79-472    AC C5IBN9.1
#=GS A2BJ01_HYPBU/7-331     AC A2BJ01.1
#=GS C8RT83_CORJE/100-324   AC C8RT83.1
#=GS Q403T9_CRYJA/110-503   AC Q403T9.1
#=GS Q5N0E9_SYNP6/3-391     AC Q5N0E9.1
#=GS H9TE78_NARTA/115-510   AC H9TE78.1
#=GS G7GIT4_9ACTO/1-362     AC G7GIT4.1
#=GS B0R3F4_HALS3/6-211     AC B0R3F4.1
#=GS Q9FV32_SOLLC/83-476    AC Q9FV32.1
#=GS A9RIN2_PHYPA/142-539   AC A9RIN2.1
#=GS Q4FPE3_PELUB/1-336     AC Q4FPE3.1
#=GS Q1MVR5_DIOKA/2-94      AC Q1MVR5.1
#=GS Q3C0I5_CROSA/1-134     AC Q3C0I5.1
#=GS E0WCM3_9VIBR/7-381     AC E0WCM3.1
#=GS C1B4P9_RHOOB/11-369    AC C1B4P9.1
#=GS Q7V254_PROMP/8-406     AC Q7V254.1
#=GS A4GIH4_9BACT/11-110    AC A4GIH4.1
#=GS E8QX21_ISOPI/59-454    AC E8QX21.1
#=GS E6QDI1_9ZZZZ/208-341   AC E6QDI1.1
#=GS B5ING8_9CHRO/19-424    AC B5ING8.1
#=GS D3YGT4_CUCME/89-482    AC D3YGT4.1
#=GS A0ACL9_STRAM/10-384    AC A0ACL9.1
#=GS Q31R56_SYNE7/14-199    AC Q31R56.1
#=GS A3XH51_LEEBM/9-377     AC A3XH51.1
#=GS A9BB45_PROM4/6-398     AC A9BB45.1
#=GS D9XYD7_9ACTO/16-207    AC D9XYD7.1
#=GS D3UT43_9CHLO/93-502    AC D3UT43.1
#=GS D1CHF7_THET1/28-372    AC D1CHF7.1
#=GS A5AV52_VITVI/82-458    AC A5AV52.1
#=GS Q403R3_TAXDI/110-503   AC Q403R3.1
#=GS I1LTX3_SOYBN/41-385    AC I1LTX3.1
#=GS E6CP47_PROAA/13-406    AC E6CP47.1
#=GS E8W601_STRFA/11-384    AC E8W601.1
#=GS C7EYJ4_NARPS/89-482    AC C7EYJ4.1
#=GS Q766F4_CITUN/1-203     AC Q766F4.1
#=GS E4N8I1_KITSK/50-224    AC E4N8I1.1
#=GS H1ZZK4_9ACTO/15-196    AC H1ZZK4.1
#=GS A3KK17_STRAM/16-207    AC A3KK17.1
#=GS B9SZS9_RICCO/99-492    AC B9SZS9.1
#=GS Q8GCS2_9ENTR/6-375     AC Q8GCS2.1
#=GS G2FK67_9FIRM/24-195    AC G2FK67.1
#=GS C1N7E6_MICPC/152-567   AC C1N7E6.1
#=GS C6NS56_9GAMM/205-328   AC C6NS56.1
#=GS Q766D8_CITLI/1-203     AC Q766D8.1
#=GS H6QZ20_NOCCG/10-350    AC H6QZ20.1
#=GS Q1VUY2_9FLAO/9-379     AC Q1VUY2.1
#=GS Q76J08_CRYJA/110-503   AC Q76J08.1
#=GS A7NML1_ROSCS/5-392     AC A7NML1.1
#=GS H0R608_9ACTO/6-360     AC H0R608.1
#=GS E4FQ61_PROAA/13-406    AC E4FQ61.1
#=GS D6XBX4_9ACTO/47-426    AC D6XBX4.1
#=GS I0HDN1_ACTMI/4-373     AC I0HDN1.1
#=GS B5BUY1_BRANA/1-216     AC B5BUY1.1
#=GS Q76IZ0_CRYJA/110-503   AC Q76IZ0.1
#=GS Q0H2D0_BREVE/12-380    AC Q0H2D0.1
#=GS D7LF09_ARALL/106-279   AC D7LF09.1
#=GS C8XTA3_9BACT/14-384    AC C8XTA3.1
#=GS F6DAK7_THICA/5-377     AC F6DAK7.1
#=GS Q2P9P3_SOLLC/1-128     AC Q2P9P3.1
#=GS Q82PA6_STRAW/5-384     AC Q82PA6.1
#=GS G0IVZ7_CYCMS/6-377     AC G0IVZ7.1
#=GS Q2VJ78_9ENTR/5-375     AC Q2VJ78.1
#=GS Q3AIA0_SYNSC/6-398     AC Q3AIA0.1
#=GS Q9AXK9_9MAGN/109-507   AC Q9AXK9.1
#=GS Q1YGX9_MOBAS/12-382    AC Q1YGX9.1
#=GS A4FBR5_SACEN/1-375     AC A4FBR5.1
#=GS O48853_ARATH/102-272   AC O48853.1
#=GS I1JN65_SOYBN/92-485    AC I1JN65.1
#=GS Q76J04_CRYJA/110-503   AC Q76J04.1
#=GS F8JV85_STREN/27-218    AC F8JV85.1
#=GS H2E7T0_9FLAO/6-376     AC H2E7T0.1
#=GS Q19QX8_CITSI/89-482    AC Q19QX8.1
#=GS C3V9U2_CITSI/89-482    AC C3V9U2.1
#=GS Q8LJ81_ORYSJ/119-518   AC Q8LJ81.1
#=GS Q1NEZ2_9SPHN/20-387    AC Q1NEZ2.1
#=GS E2IHA2_CAMSI/110-510   AC E2IHA2.1
#=GS A2CC76_PROM3/7-405     AC A2CC76.1
#=GS B7XC78_9LILI/1-348     AC B7XC78.1
#=GS G0HNL1_THES4/7-366     AC G0HNL1.1
#=GS Q2G7B6_NOVAD/7-379     AC Q2G7B6.1
#=GS Q7EYS3_ORYSJ/140-309   AC Q7EYS3.1
#=GS Q1XIT2_GENLU/113-506   AC Q1XIT2.1
#=GS Q539Y4_CHLRE/100-510   AC Q539Y4.1
#=GS Q5YU03_NOCFA/15-354    AC Q5YU03.1
#=GS I1L1L3_SOYBN/112-510   AC I1L1L3.1
#=GS D2QEF6_SPILD/5-384     AC D2QEF6.1
#=GS F1UTQ6_PROAA/13-406    AC F1UTQ6.1
#=GS E6C0U9_PROAA/13-406    AC E6C0U9.1
#=GS Q0FDV5_9RHOB/10-353    AC Q0FDV5.1
#=GS Q403R2_TAXDI/110-503   AC Q403R2.1
#=GS D0FZ30_9ASTE/15-393    AC D0FZ30.1
#=GS B4WQJ4_9SYNE/53-220    AC B4WQJ4.1
#=GS A0KJQ5_AERHH/9-91      AC A0KJQ5.1
#=GS B5RZ02_RALSL/2-199     AC B5RZ02.1
#=GS A6LUQ0_CLOB8/4-53      AC A6LUQ0.1
#=GS G2GLD0_9ACTO/16-207    AC G2GLD0.1
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