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Database: Pfam
Entry: Lycopene_cycl
LinkDB: Lycopene_cycl
Original site: Lycopene_cycl 
#=GF ID   Lycopene_cycl
#=GF AC   PF05834.9
#=GF DE   Lycopene cyclase protein
#=GF AU   Moxon SJ
#=GF SE   Pfam-B_8336 (release 8.0)
#=GF GA   23.40 23.40;
#=GF TC   23.40 23.40;
#=GF NC   23.30 23.30;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 11927849 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   8837512
#=GF RT   Functional analysis of the beta and epsilon lycopene cyclase
#=GF RT   enzymes of Arabidopsis reveals a mechanism for control of cyclic
#=GF RT   carotenoid formation. 
#=GF RA   Cunningham FX Jr, Pogson B, Sun Z, McDonald KA, DellaPenna D,
#=GF RA   Gantt E; 
#=GF RL   Plant Cell 1996;8:1613-1626.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   11226339
#=GF RT   One ring or two? Determination of ring number in carotenoids by
#=GF RT   lycopene epsilon-cyclases. 
#=GF RA   Cunningham FX Jr, Gantt E; 
#=GF RL   Proc Natl Acad Sci U S A 2001;98:2905-2910.
#=GF DR   INTERPRO; IPR008671;
#=GF CC   This family consists of lycopene beta and epsilon cyclase
#=GF CC   proteins. Carotenoids with cyclic end groups are essential
#=GF CC   components of the photosynthetic membranes in all plants, algae,
#=GF CC   and cyanobacteria. These lipid-soluble compounds protect against
#=GF CC   photo-oxidation, harvest light for photosynthesis, and dissipate
#=GF CC   excess light energy absorbed by the antenna pigments. The
#=GF CC   cyclisation of lycopene (psi, psi-carotene) is a key branch
#=GF CC   point in the pathway of carotenoid biosynthesis. Two types of
#=GF CC   cyclic end groups are found in higher plant carotenoids: the
#=GF CC   beta and epsilon rings. Carotenoids with two beta rings are
#=GF CC   ubiquitous, and those with one beta and one epsilon ring are
#=GF CC   common; however, carotenoids with two epsilon rings are rare
#=GF CC   [1,2].  
#=GF SQ   413
#=GS W0A1Z9_9SPHN/13-385        AC W0A1Z9.1
#=GS F4AZ58_DOKS4/6-376         AC F4AZ58.1
#=GS M0UAH8_MUSAM/90-200        AC M0UAH8.1
#=GS D6X579_STRPR/21-399        AC D6X579.1
#=GS Q2RLB4_MOOTA/210-338       AC Q2RLB4.1
#=GS E6XDE0_CELAD/5-376         AC E6XDE0.1
#=GS E4TNE2_MARTH/8-381         AC E4TNE2.1
#=GS I1H9L4_BRADI/11-194        AC I1H9L4.1
#=GS G0L580_ZOBGA/8-380         AC G0L580.1
#=GS A0A087SGQ3_AUXPR/52-461    AC A0A087SGQ3.1
#=GS Q7V6C0_PROMM/5-177         AC Q7V6C0.1
#=GS A5GRY7_SYNR3/8-400         AC A5GRY7.1
#=GS R1DDM5_EMIHU/7-426         AC R1DDM5.1
#=GS A0A022QPF8_ERYGU/91-489    AC A0A022QPF8.1
#=GS L0G1H9_ECHVK/5-340         AC L0G1H9.1
#=GS A4FBR5_SACEN/1-373         AC A4FBR5.1
#=GS M4CRJ7_BRARP/116-510       AC M4CRJ7.1
#=GS M4DW24_BRARP/112-476       AC M4DW24.1
#=GS A5VB81_SPHWW/7-380         AC A5VB81.1
#=GS J3L1C5_ORYBR/28-427        AC J3L1C5.1
#=GS L0IX24_MYCSM/3-165         AC L0IX24.1
#=GS K7LLZ2_SOYBN/8-194         AC K7LLZ2.1
#=GS D8RTT4_SELML/97-495        AC D8RTT4.1
#=GS C6C216_DESAD/8-384         AC C6C216.1
#=GS B7J778_ACIF2/208-348       AC B7J778.1
#=GS F6GHB9_LACS5/8-377         AC F6GHB9.1
#=GS M0RZ31_MUSAM/28-426        AC M0RZ31.1
#=GS C1EFJ5_MICSR/661-1067      AC C1EFJ5.1
#=GS C4LIP4_CORK4/104-394       AC C4LIP4.1
#=GS A9DAC2_9RHIZ/19-401        AC A9DAC2.2
#=GS I0KE89_9BACT/5-375         AC I0KE89.1
#=GS U5T4B7_9GAMM/5-368         AC U5T4B7.1
#=GS H8XRS7_FLAIG/6-374         AC H8XRS7.1
#=GS E1Z6E2_CHLVA/52-463        AC E1Z6E2.1
#=GS F6AD51_PSEF1/4-374         AC F6AD51.1
#=GS K0ET44_9NOCA/10-357        AC K0ET44.1
#=GS J3MT20_ORYBR/83-241        AC J3MT20.1
#=GS A0A0D3H0D1_9ORYZ/42-211    AC A0A0D3H0D1.1
#=GS G2LGG3_CHLTF/2-385         AC G2LGG3.1
#=GS A4X7K5_SALTO/13-382        AC A4X7K5.1
#=GS E3J4J5_FRASU/278-425       AC E3J4J5.1
#=GS D8RJD9_SELML/30-428        AC D8RJD9.1
#=GS C0ZZI7_RHOE4/9-367         AC C0ZZI7.1
#=GS M9RJ96_9RHOB/5-364         AC M9RJ96.1
#=GS A0A022QFJ3_ERYGU/80-473    AC A0A022QFJ3.1
#=GS R4W6B8_9EURY/6-211         AC R4W6B8.1
#=GS A5UWL4_ROSS1/5-392         AC A5UWL4.1
#=GS A0RTS5_CENSY/5-189         AC A0RTS5.1
#=GS A0A059MRG9_9NOCA/11-384    AC A0A059MRG9.1
#=GS I1N8T4_SOYBN/92-485        AC I1N8T4.1
#=GS A0A096UC65_MAIZE/38-436    AC A0A096UC65.1
#=GS M4EM05_BRARP/81-471        AC M4EM05.1
#=GS D8QRG2_SELML/30-428        AC D8QRG2.1
#=GS Q6YUU2_ORYSJ/69-466        AC Q6YUU2.1
#=GS L0ADP4_NATGS/6-210         AC L0ADP4.1
#=GS C1N7E6_MICPC/854-1137      AC C1N7E6.1
#=GS R6SVI9_9CLOT/5-165         AC R6SVI9.1
#=GS B9HQ44_POPTR/81-474        AC B9HQ44.1
#=GS N6YKH5_9RHOO/5-172         AC N6YKH5.1
#=GS A0A022PSZ1_ERYGU/88-481    AC A0A022PSZ1.1
#=GS A0A0C1DJB6_9FLAO/5-375     AC A0A0C1DJB6.1
#=GS Q5V433_HALMA/6-210         AC Q5V433.1
#=GS M5A1U3_9ACTN/6-387         AC M5A1U3.1
#=GS G2PQJ9_MURRD/5-376         AC G2PQJ9.1
#=GS A0M4B3_GRAFK/8-375         AC A0M4B3.1
#=GS I4AKI4_FLELS/4-383         AC I4AKI4.1
#=GS Q1J025_DEIGD/32-413        AC Q1J025.1
#=GS B2CPI9_SOLLC/108-505       AC B2CPI9.1
#=GS C1N7E6_MICPC/713-839       AC C1N7E6.1
#=GS Q0S0G9_RHOJR/59-418        AC Q0S0G9.1
#=GS G8RY24_MYCRN/37-218        AC G8RY24.1
#=GS A0A0A7TV74_9ENTR/7-377     AC A0A0A7TV74.1
#=GS K6YV65_9ALTE/6-382         AC K6YV65.1
#=GS D5URP4_TSUPD/97-335        AC D5URP4.1
#=GS H5X2N4_9PSEU/2-379         AC H5X2N4.1
#=GS J9S318_9ACTN/4-357         AC J9S318.1
#=GS W8KRM2_HALHR/208-345       AC W8KRM2.1
#=GS F6HHE0_VITVI/82-475        AC F6HHE0.1
#=GS F6EN87_AMYSD/7-360         AC F6EN87.1
#=GS LCYE_ARATH/110-502         AC Q38932.2
#=GS A5FLG7_FLAJ1/10-384        AC A5FLG7.1
#=GS K0EZG9_9NOCA/9-60          AC K0EZG9.1
#=GS I2F463_9BACT/75-172        AC I2F463.1
#=GS D5BNT9_PUNMI/29-375        AC D5BNT9.1
#=GS D5BH49_ZUNPS/8-377         AC D5BH49.1
#=GS A0A0A1B2R7_9ENTR/6-376     AC A0A0A1B2R7.1
#=GS D4YXB3_SPHJU/8-379         AC D4YXB3.1
#=GS M0ZHH3_SOLTU/1-225         AC M0ZHH3.1
#=GS Y801_DEIRA/10-385          AC Q9RW68.1
#=GS Q6MMA6_BDEBA/11-376        AC Q6MMA6.1
#=GS A0A089X3H5_STRGA/5-384     AC A0A089X3H5.1
#=GS C1IP75_WHEAT/115-514       AC C1IP75.1
#=GS I1MHA5_SOYBN/113-511       AC I1MHA5.1
#=GS V4JFT2_9GAMM/12-379        AC V4JFT2.1
#=GS K9SBF0_9CYAN/3-390         AC K9SBF0.1
#=GS D7L8W7_ARALL/84-479        AC D7L8W7.1
#=GS V4LF12_EUTSA/82-478        AC V4LF12.1
#=GS E8U839_DEIML/9-391         AC E8U839.1
#=GS Q1AUE5_RUBXD/33-405        AC Q1AUE5.1
#=GS F2KQP5_ARCVS/2-286         AC F2KQP5.1
#=GS B4SAL7_PELPB/4-339         AC B4SAL7.1
#=GS A9S871_PHYPA/102-495       AC A9S871.1
#=GS U5D1Y2_AMBTC/28-398        AC U5D1Y2.1
#=GS S5VG59_STRCU/6-385         AC S5VG59.1
#=GS E8N507_ANATU/6-377         AC E8N507.1
#=GS F2I0F9_PELSM/5-368         AC F2I0F9.1
#=GS S5R1I4_9PROT/10-381        AC S5R1I4.1
#=GS F8EHX2_RUNSL/5-377         AC F8EHX2.1
#=GS Q5Z1W7_NOCFA/9-359         AC Q5Z1W7.1
#=GS Q7V508_PROMM/7-405         AC Q7V508.1
#=GS A2Q2Y6_MEDTR/83-476        AC A2Q2Y6.1
#=GS M1APW5_SOLTU/85-478        AC M1APW5.1
#=GS E9T5T9_RHOHA/25-382        AC E9T5T9.1
#=GS H8GZY4_DEIGI/12-391        AC H8GZY4.1
#=GS U7G803_9RHOB/6-162         AC U7G803.1
#=GS A9BA10_PROM4/8-406         AC A9BA10.1
#=GS B8BUM8_THAPS/89-499        AC B8BUM8.1
#=GS A3CVD0_METMJ/1-321         AC A3CVD0.1
#=GS W1PYB6_AMBTC/126-519       AC W1PYB6.1
#=GS A0A0A7LKD2_9BACT/13-383    AC A0A0A7LKD2.1
#=GS K0JY60_SACES/2-359         AC K0JY60.1
#=GS U6EA16_9EURY/5-365         AC U6EA16.1
#=GS M0Z121_HORVD/122-290       AC M0Z121.1
#=GS D8TIQ5_VOLCA/106-517       AC D8TIQ5.1
#=GS I1HNV6_BRADI/123-522       AC I1HNV6.1
#=GS W5GF21_WHEAT/1-277         AC W5GF21.1
#=GS Q7NHQ1_GLOVI/51-220        AC Q7NHQ1.1
#=GS D7BF26_MEISD/6-370         AC D7BF26.1
#=GS A4SAS8_OSTLU/99-512        AC A4SAS8.1
#=GS LCYB_SYNE7/3-391           AC Q55276.1
#=GS B4S957_PROA2/4-340         AC B4S957.1
#=GS G2Z2I9_FLABF/4-376         AC G2Z2I9.1
#=GS Q0W1J4_METAR/4-349         AC Q0W1J4.1
#=GS Q7VBF9_PROMA/8-401         AC Q7VBF9.1
#=GS R1DVT3_EMIHU/89-489        AC R1DVT3.1
#=GS D9TDL7_MICAI/16-387        AC D9TDL7.1
#=GS A0A0C5KZ44_9SPHN/8-380     AC A0A0C5KZ44.1
#=GS W5TEG6_9NOCA/13-366        AC W5TEG6.1
#=GS V4J6F9_9DELT/19-403        AC V4J6F9.1
#=GS R1ELQ0_BOTPV/46-90         AC R1ELQ0.1
#=GS B0C3S0_ACAM1/4-392         AC B0C3S0.1
#=GS A2BJ01_HYPBU/7-331         AC A2BJ01.1
#=GS Q2G7B6_NOVAD/7-378         AC Q2G7B6.1
#=GS H6R2S4_NOCCG/1-314         AC H6R2S4.1
#=GS Q7V6N0_PROMM/1-390         AC Q7V6N0.1
#=GS Q8FT90_COREF/155-293       AC Q8FT90.1
#=GS B1L6M6_KORCO/5-184         AC B1L6M6.1
#=GS A0B730_METTP/5-343         AC A0B730.1
#=GS M4ECZ6_BRARP/1-77          AC M4ECZ6.1
#=GS A0A096PG33_MAIZE/12-106    AC A0A096PG33.1
#=GS F4ITT3_ARATH/113-287       AC F4ITT3.1
#=GS A0A087H8F9_ARAAL/83-478    AC A0A087H8F9.1
#=GS A9RIN2_PHYPA/142-539       AC A9RIN2.1
#=GS Q4FPE3_PELUB/1-336         AC Q4FPE3.1
#=GS W8ERG4_9BACT/24-396        AC W8ERG4.1
#=GS F8E2K3_CORRG/5-360         AC F8E2K3.1
#=GS V5XE35_MYCNE/38-217        AC V5XE35.1
#=GS Q12XE5_METBU/4-378         AC Q12XE5.1
#=GS C6W8B8_ACTMD/2-343         AC C6W8B8.1
#=GS K0SH12_THAOC/82-517        AC K0SH12.1
#=GS K3XGC4_SETIT/120-518       AC K3XGC4.1
#=GS A0A0B5ETP4_9ACTN/13-387    AC A0A0B5ETP4.1
#=GS Q7V254_PROMP/8-406         AC Q7V254.1
#=GS E8QX21_ISOPI/59-454        AC E8QX21.1
#=GS LCYB_ARATH/84-479          AC Q38933.1
#=GS A0A0D5EEQ8_9BURK/4-187     AC A0A0D5EEQ8.1
#=GS Q11W52_CYTH3/10-193        AC Q11W52.1
#=GS A9BB45_PROM4/6-398         AC A9BB45.1
#=GS G7IHF8_MEDTR/78-467        AC G7IHF8.1
#=GS Q8THU0_METAC/4-378         AC Q8THU0.1
#=GS M0ZHH2_SOLTU/108-241       AC M0ZHH2.1
#=GS M1FEX3_9ALTE/23-290        AC M1FEX3.1
#=GS W5DD31_WHEAT/28-395        AC W5DD31.1
#=GS A0B6I0_METTP/4-178         AC A0B6I0.1
#=GS V9XCD0_9NOCA/8-363         AC V9XCD0.1
#=GS B9SZS9_RICCO/99-492        AC B9SZS9.1
#=GS C1N7E6_MICPC/152-567       AC C1N7E6.1
#=GS D7B4H4_NOCDD/5-385         AC D7B4H4.1
#=GS D5U0K9_THEAM/4-315         AC D5U0K9.1
#=GS B1VN28_STRGG/6-386         AC B1VN28.1
#=GS A0A0D5A8I4_9NOCA/7-368     AC A0A0D5A8I4.1
#=GS I0GLA7_CALEA/5-213         AC I0GLA7.1
#=GS F5XXQ0_RAMTT/12-382        AC F5XXQ0.1
#=GS B7FNX5_PHATC/91-517        AC B7FNX5.1
#=GS A1K6U6_AZOSB/2-153         AC A1K6U6.1
#=GS W8R3D6_PSEST/5-375         AC W8R3D6.1
#=GS D6XBX4_9ACTN/47-426        AC D6XBX4.1
#=GS K0F7K3_9NOCA/1-321         AC K0F7K3.1
#=GS I0HDN1_ACTM4/4-373         AC I0HDN1.1
#=GS M8A0B3_TRIUA/161-329       AC M8A0B3.1
#=GS J3N8L9_ORYBR/1-174         AC J3N8L9.1
#=GS Q84VG9_MAIZE/69-467        AC Q84VG9.1
#=GS M8A8B2_TRIUA/11-191        AC M8A8B2.1
#=GS J9YYK6_9PROT/5-282         AC J9YYK6.1
#=GS Q82PA6_STRAW/5-384         AC Q82PA6.1
#=GS Q8FT90_COREF/302-426       AC Q8FT90.1
#=GS G0IVZ7_CYCMS/6-377         AC G0IVZ7.1
#=GS I1JN65_SOYBN/92-485        AC I1JN65.1
#=GS A0A0D3ACH5_BRAOL/1-44      AC A0A0D3ACH5.1
#=GS J3LAE4_ORYBR/1-234         AC J3LAE4.1
#=GS D5WNI3_BURSC/18-206        AC D5WNI3.1
#=GS V6KMC8_STRNV/7-386         AC V6KMC8.1
#=GS Q0WVA1_ARATH/113-500       AC Q0WVA1.1
#=GS A0A096UNQ7_WHEAT/1-329     AC A0A096UNQ7.1
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