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Database: Pfam
Entry: Lycopene_cycl
LinkDB: Lycopene_cycl
Original site: Lycopene_cycl 
#=GF ID   Lycopene_cycl
#=GF AC   PF05834.10
#=GF DE   Lycopene cyclase protein
#=GF AU   Moxon SJ
#=GF SE   Pfam-B_8336 (release 8.0)
#=GF GA   23.40 23.40;
#=GF TC   23.40 23.40;
#=GF NC   23.30 23.30;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 17690987 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   8837512
#=GF RT   Functional analysis of the beta and epsilon lycopene cyclase
#=GF RT   enzymes of Arabidopsis reveals a mechanism for control of cyclic
#=GF RT   carotenoid formation. 
#=GF RA   Cunningham FX Jr, Pogson B, Sun Z, McDonald KA, DellaPenna D,
#=GF RA   Gantt E; 
#=GF RL   Plant Cell 1996;8:1613-1626.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   11226339
#=GF RT   One ring or two? Determination of ring number in carotenoids by
#=GF RT   lycopene epsilon-cyclases. 
#=GF RA   Cunningham FX Jr, Gantt E; 
#=GF RL   Proc Natl Acad Sci U S A 2001;98:2905-2910.
#=GF DR   INTERPRO; IPR008671;
#=GF CC   This family consists of lycopene beta and epsilon cyclase
#=GF CC   proteins. Carotenoids with cyclic end groups are essential
#=GF CC   components of the photosynthetic membranes in all plants, algae,
#=GF CC   and cyanobacteria. These lipid-soluble compounds protect against
#=GF CC   photo-oxidation, harvest light for photosynthesis, and dissipate
#=GF CC   excess light energy absorbed by the antenna pigments. The
#=GF CC   cyclisation of lycopene (psi, psi-carotene) is a key branch
#=GF CC   point in the pathway of carotenoid biosynthesis. Two types of
#=GF CC   cyclic end groups are found in higher plant carotenoids: the
#=GF CC   beta and epsilon rings. Carotenoids with two beta rings are
#=GF CC   ubiquitous, and those with one beta and one epsilon ring are
#=GF CC   common; however, carotenoids with two epsilon rings are rare
#=GF CC   [1,2].  
#=GF SQ   655
#=GS A0A0A0KY78_CUCSA/71-468    AC A0A0A0KY78.1
#=GS F4AZ58_DOKS4/6-376         AC F4AZ58.1
#=GS E6XDE0_CELAD/5-376         AC E6XDE0.1
#=GS I1H9L4_BRADI/11-194        AC I1H9L4.1
#=GS K1XAX9_9BACT/4-43          AC K1XAX9.1
#=GS G0L580_ZOBGA/8-380         AC G0L580.1
#=GS A0A0N1BKL0_9SPHN/7-379     AC A0A0N1BKL0.1
#=GS A0A0F5PAL0_9SPHN/7-379     AC A0A0F5PAL0.1
#=GS K1L9I7_9BACT/9-382         AC K1L9I7.1
#=GS A0A0D2SVQ5_GOSRA/106-391   AC A0A0D2SVQ5.1
#=GS A5GRY7_SYNR3/8-400         AC A5GRY7.1
#=GS A0A022QPF8_ERYGU/91-489    AC A0A022QPF8.1
#=GS L0G1H9_ECHVK/5-340         AC L0G1H9.1
#=GS M4CRJ7_BRARP/116-510       AC M4CRJ7.1
#=GS A5VB81_SPHWW/7-380         AC A5VB81.1
#=GS J3L1C5_ORYBR/28-427        AC J3L1C5.1
#=GS L0IX24_MYCSM/3-165         AC L0IX24.1
#=GS W9S642_9ROSA/80-473        AC W9S642.1
#=GS B7J778_ACIF2/208-348       AC B7J778.1
#=GS D9XNI7_9ACTN/1-313         AC D9XNI7.1
#=GS L1K0V8_GUITH/136-278       AC L1K0V8.1
#=GS F6GHB9_LACS5/8-377         AC F6GHB9.1
#=GS M0RZ31_MUSAM/28-426        AC M0RZ31.1
#=GS A0A0F0GUW3_NOCAE/92-314    AC A0A0F0GUW3.1
#=GS H5TW99_9ACTN/1-342         AC H5TW99.1
#=GS A9DAC2_HOEPD/19-401        AC A9DAC2.2
#=GS I0KE89_9BACT/5-375         AC I0KE89.1
#=GS U5T4B7_9GAMM/5-368         AC U5T4B7.1
#=GS A0A0E3L5Q9_9EURY/4-379     AC A0A0E3L5Q9.1
#=GS Q0FDV5_9RHOB/118-353       AC Q0FDV5.1
#=GS E1Z6E2_CHLVA/52-463        AC E1Z6E2.1
#=GS F6AD51_PSEF1/4-374         AC F6AD51.1
#=GS K0ET44_9NOCA/10-357        AC K0ET44.1
#=GS J3MT20_ORYBR/83-241        AC J3MT20.1
#=GS A0A061F3F7_THECC/90-483    AC A0A061F3F7.1
#=GS A0A0D3H0D1_9ORYZ/42-211    AC A0A0D3H0D1.1
#=GS G2LGG3_CHLTF/2-385         AC G2LGG3.1
#=GS A0A0N0APC3_9PSEU/1-330     AC A0A0N0APC3.1
#=GS D8RJD9_SELML/30-428        AC D8RJD9.1
#=GS C0ZZI7_RHOE4/9-367         AC C0ZZI7.1
#=GS M9RJ96_9RHOB/5-364         AC M9RJ96.1
#=GS A3Z7S8_9SYNE/8-412         AC A3Z7S8.1
#=GS A0A022QFJ3_ERYGU/80-473    AC A0A022QFJ3.1
#=GS R4W6B8_9EURY/6-211         AC R4W6B8.1
#=GS A0A059MRG9_9NOCA/11-384    AC A0A059MRG9.1
#=GS A0A096UC65_MAIZE/38-436    AC A0A096UC65.1
#=GS D8QRG2_SELML/30-428        AC D8QRG2.1
#=GS K6WZ54_9MICO/293-418       AC K6WZ54.1
#=GS L1K0V8_GUITH/351-614       AC L1K0V8.1
#=GS C1N7E6_MICPC/854-1137      AC C1N7E6.1
#=GS A0A0J8BAA9_BETVU/125-523   AC A0A0J8BAA9.1
#=GS B6B3Q5_9RHOB/3-367         AC B6B3Q5.1
#=GS R6SVI9_9CLOT/5-165         AC R6SVI9.1
#=GS B9HQ44_POPTR/81-474        AC B9HQ44.1
#=GS A0A0N0A2R5_9NOCA/3-371     AC A0A0N0A2R5.1
#=GS G2PQJ9_MURRD/5-376         AC G2PQJ9.1
#=GS B2CPI9_SOLLC/108-505       AC B2CPI9.1
#=GS A0A0F7KYY9_9SPHN/7-380     AC A0A0F7KYY9.1
#=GS C1N7E6_MICPC/713-839       AC C1N7E6.1
#=GS Q0S0G9_RHOJR/59-418        AC Q0S0G9.1
#=GS G8RY24_MYCRN/37-218        AC G8RY24.1
#=GS A0A0A7TV74_9ENTR/7-377     AC A0A0A7TV74.1
#=GS A0A0E9MRU8_9SPHN/120-365   AC A0A0E9MRU8.1
#=GS J9S318_9ACTN/4-357         AC J9S318.1
#=GS M1V5C8_CYAME/78-485        AC M1V5C8.1
#=GS F6EN87_AMYSD/7-360         AC F6EN87.1
#=GS A5FLG7_FLAJ1/10-384        AC A5FLG7.1
#=GS L8EHN6_STRRM/5-384         AC L8EHN6.1
#=GS D5BNT9_PUNMI/29-375        AC D5BNT9.1
#=GS D5BH49_ZUNPS/8-377         AC D5BH49.1
#=GS A0A0A1B2R7_9ENTR/6-376     AC A0A0A1B2R7.1
#=GS A0A0K9NQI4_ZOSMR/91-488    AC A0A0K9NQI4.1
#=GS Y801_DEIRA/10-385          AC Q9RW68.1
#=GS C1IP75_WHEAT/115-514       AC C1IP75.1
#=GS A0A0F0HAJ3_9ACTN/5-406     AC A0A0F0HAJ3.1
#=GS A0A0M8QNU2_9ACTN/4-383     AC A0A0M8QNU2.1
#=GS K9SBF0_9CYAN/3-390         AC K9SBF0.1
#=GS D7L8W7_ARALL/84-479        AC D7L8W7.1
#=GS V4LF12_EUTSA/82-478        AC V4LF12.1
#=GS A0A0D2UFJ3_GOSRA/115-518   AC A0A0D2UFJ3.1
#=GS E8U839_DEIML/9-391         AC E8U839.1
#=GS A0A0D6TA06_9RHOB/4-374     AC A0A0D6TA06.1
#=GS A3WEH4_9SPHN/7-392         AC A3WEH4.1
#=GS A9S871_PHYPA/102-495       AC A9S871.1
#=GS S5VG59_STRC3/6-385         AC S5VG59.1
#=GS E8N507_ANATU/6-377         AC E8N507.1
#=GS I2GBN6_9BACT/5-244         AC I2GBN6.1
#=GS Q5Z1W7_NOCFA/9-359         AC Q5Z1W7.1
#=GS Q7V508_PROMM/7-405         AC Q7V508.1
#=GS A2Q2Y6_MEDTR/83-476        AC A2Q2Y6.1
#=GS A6G822_9DELT/7-414         AC A6G822.1
#=GS I9WDF4_9SPHN/24-395        AC I9WDF4.1
#=GS M1APW5_SOLTU/85-478        AC M1APW5.1
#=GS G7GIT4_9ACTN/1-361         AC G7GIT4.1
#=GS H8GZY4_DEIGI/12-391        AC H8GZY4.1
#=GS A9BA10_PROM4/8-406         AC A9BA10.1
#=GS B8BUM8_THAPS/89-499        AC B8BUM8.1
#=GS W1PYB6_AMBTC/126-519       AC W1PYB6.1
#=GS U6EA16_9EURY/5-365         AC U6EA16.1
#=GS V7B1F7_PHAVU/1-152         AC V7B1F7.1
#=GS D8TIQ5_VOLCA/106-517       AC D8TIQ5.1
#=GS W5GF21_WHEAT/1-277         AC W5GF21.1
#=GS A4SAS8_OSTLU/99-512        AC A4SAS8.1
#=GS G2Z2I9_FLABF/4-376         AC G2Z2I9.1
#=GS Q0W1J4_METAR/4-349         AC Q0W1J4.1
#=GS A0A0N1BV40_9PROT/11-393    AC A0A0N1BV40.1
#=GS D9TDL7_MICAI/16-387        AC D9TDL7.1
#=GS A0A0A0L1H5_CUCSA/89-482    AC A0A0A0L1H5.1
#=GS K2QAR5_9RHIZ/6-389         AC K2QAR5.1
#=GS B0C3S0_ACAM1/4-392         AC B0C3S0.1
#=GS A0A0N0K7T3_9CAUL/7-377     AC A0A0N0K7T3.1
#=GS A2BJ01_HYPBU/7-331         AC A2BJ01.1
#=GS Q2G7B6_NOVAD/7-378         AC Q2G7B6.1
#=GS H6R2S4_NOCCG/1-314         AC H6R2S4.1
#=GS Q8FT90_COREF/155-293       AC Q8FT90.1
#=GS B1L6M6_KORCO/5-184         AC B1L6M6.1
#=GS A0B730_METTP/5-343         AC A0B730.1
#=GS M4ECZ6_BRARP/1-77          AC M4ECZ6.1
#=GS A0A096PG33_MAIZE/12-106    AC A0A096PG33.1
#=GS A0A0F2J1A4_9BACT/8-189     AC A0A0F2J1A4.1
#=GS A9RIN2_PHYPA/142-539       AC A9RIN2.1
#=GS Q4FPE3_PELUB/1-336         AC Q4FPE3.1
#=GS F8E2K3_CORRG/5-360         AC F8E2K3.1
#=GS V5XE35_MYCNE/38-217        AC V5XE35.1
#=GS K0SH12_THAOC/82-517        AC K0SH12.1
#=GS K3XGC4_SETIT/120-518       AC K3XGC4.1
#=GS A0A0B5ETP4_STRA4/13-387    AC A0A0B5ETP4.1
#=GS Q7V254_PROMP/8-406         AC Q7V254.1
#=GS E8QX21_ISOPI/59-454        AC E8QX21.1
#=GS W9QK12_9ROSA/116-520       AC W9QK12.1
#=GS B5ING8_9CHRO/19-424        AC B5ING8.1
#=GS J1RWG7_9ACTN/5-383         AC J1RWG7.1
#=GS A9BB45_PROM4/6-398         AC A9BB45.1
#=GS E3BG51_9VIBR/4-367         AC E3BG51.1
#=GS A0A067L5S1_JATCU/80-473    AC A0A067L5S1.1
#=GS M1FEX3_9ALTE/23-290        AC M1FEX3.1
#=GS E8W601_STRFA/11-384        AC E8W601.1
#=GS A0A0F6W5J6_9DELT/11-384    AC A0A0F6W5J6.1
#=GS V9XCD0_9NOCA/8-363         AC V9XCD0.1
#=GS B9SZS9_RICCO/99-492        AC B9SZS9.1
#=GS C1N7E6_MICPC/152-567       AC C1N7E6.1
#=GS M5VYW6_PRUPE/82-475        AC M5VYW6.1
#=GS D5U0K9_THEAM/4-315         AC D5U0K9.1
#=GS A0A0D5A8I4_9NOCA/7-368     AC A0A0D5A8I4.1
#=GS I0GLA7_CALEA/5-213         AC I0GLA7.1
#=GS A1K6U6_AZOSB/2-153         AC A1K6U6.1
#=GS A0A0N0K126_9SPHN/15-387    AC A0A0N0K126.1
#=GS W7TY76_9STRA/362-759       AC W7TY76.1
#=GS W8R3D6_PSEST/5-375         AC W8R3D6.1
#=GS D6XBX4_9ACTN/47-426        AC D6XBX4.1
#=GS K0F7K3_9NOCA/1-321         AC K0F7K3.1
#=GS I0HDN1_ACTM4/4-373         AC I0HDN1.1
#=GS J3N8L9_ORYBR/1-174         AC J3N8L9.1
#=GS M8A8B2_TRIUA/11-191        AC M8A8B2.1
#=GS A0A0D2LRX1_GOSRA/112-510   AC A0A0D2LRX1.1
#=GS A0A0M2K0J5_9MYCO/2-374     AC A0A0M2K0J5.1
#=GS M5WNB3_PRUPE/76-469        AC M5WNB3.1
#=GS K6WZ54_9MICO/10-104        AC K6WZ54.1
#=GS Q82PA6_STRAW/5-384         AC Q82PA6.1
#=GS G0IVZ7_CYCMS/6-377         AC G0IVZ7.1
#=GS A0A0K2YMS1_9NOCA/3-359     AC A0A0K2YMS1.1
#=GS Q1YGX9_AURMS/12-382        AC Q1YGX9.1
#=GS I1JN65_SOYBN/92-485        AC I1JN65.1
#=GS V6KMC8_STRNV/7-386         AC V6KMC8.1
#=GS Q8LJ81_ORYSJ/119-518       AC Q8LJ81.1
#=GS Q1NEZ2_SPHSS/20-387        AC Q1NEZ2.1
#=GS F7XNL5_METZD/9-360         AC F7XNL5.1
#=GS H8Z4Q7_9GAMM/8-392         AC H8Z4Q7.1
#=GS A0A096PBF6_OSTTA/136-549   AC A0A096PBF6.1
#=GS F2IJB9_FLUTR/6-51          AC F2IJB9.1
#=GS V4KXG8_EUTSA/111-506       AC V4KXG8.1
#=GS H2C067_9FLAO/8-374         AC H2C067.1
#=GS M7ZUM0_TRIUA/1-179         AC M7ZUM0.1
#=GS A0A0F0GUW3_NOCAE/6-99      AC A0A0F0GUW3.1
#=GS M0XD92_HORVD/9-206         AC M0XD92.1
#=GS A0A067EDS0_CITSI/109-476   AC A0A067EDS0.1
#=GS Q7EYS3_ORYSJ/140-309       AC Q7EYS3.1
#=GS I1L1L3_SOYBN/112-510       AC I1L1L3.1
#=GS D2QEF6_SPILD/5-384         AC D2QEF6.1
#=GS V5AW51_ENTCL/6-376         AC V5AW51.1
#=GS C5XX29_SORBI/73-469        AC C5XX29.1
#=GS G8RLA5_MYCRN/5-377         AC G8RLA5.1
#=GS A0A088QEA7_9CORY/214-377   AC A0A088QEA7.1
#=GS W0JXD8_9EURY/6-208         AC W0JXD8.1
#=GS A0A0C7DVY2_9GAMM/10-297    AC A0A0C7DVY2.1
#=GS J8VQI3_9SPHN/12-383        AC J8VQI3.1
#=GS H1PKM3_9FIRM/13-191        AC H1PKM3.1
#=GS W0E5A8_MARPU/49-421        AC W0E5A8.1
#=GS X5EC09_9CORY/2-362         AC X5EC09.1
#=GS A0A067EPU4_CITSI/248-375   AC A0A067EPU4.1
#=GS M1A5D5_SOLTU/83-476        AC M1A5D5.1
#=GS F6I0Z1_VITVI/6-161         AC F6I0Z1.1
#=GS LCYB_SOLLC/85-478          AC Q43503.1
#=GS B9RK92_RICCO/104-470       AC B9RK92.1
#=GS A0A0M8W660_9NOCA/54-311    AC A0A0M8W660.1
#=GS M4F900_BRARP/244-395       AC M4F900.1
#=GS E1Z9E9_CHLVA/207-314       AC E1Z9E9.1
#=GS A0A0M3AU11_9SPHN/11-382    AC A0A0M3AU11.1
#=GS B0T3F6_CAUSK/11-382        AC B0T3F6.1
#=GS G7WJA8_DESOD/17-184        AC G7WJA8.1
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#=GS L1J193_GUITH/2-399         AC L1J193.1
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