GenomeNet

Database: Pfam
Entry: MIP-T3
LinkDB: MIP-T3
Original site: MIP-T3 
#=GF ID   MIP-T3
#=GF AC   PF10243.5
#=GF DE   Microtubule-binding protein MIP-T3
#=GF AU   KOGs, Finn RD, Coggill PC
#=GF SE   KOGs (KOG3809)
#=GF GA   32.30 32.30;
#=GF TC   32.30 32.30;
#=GF NC   32.20 32.20;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 80369284 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   10791955
#=GF RT   MIP-T3, a novel protein linking tumor necrosis factor
#=GF RT   receptor-associated factor 3 to the microtubule network. 
#=GF RA   Ling L, Goeddel DV; 
#=GF RL   J Biol Chem. 2000;275:23852-23860.
#=GF CC   This protein, which interacts with both microtubules and TRAF3
#=GF CC   (tumour necrosis factor receptor-associated factor 3), is
#=GF CC   conserved from worms to humans. The N-terminal region is the
#=GF CC   microtubule binding domain and is well-conserved; the C-terminal
#=GF CC   100 residues, also well-conserved, constitute the coiled-coil
#=GF CC   region which binds to TRAF3.  The central region of the protein
#=GF CC   is rich in lysine and glutamic acid and carries KKE motifs which
#=GF CC   may also be necessary for tubulin-binding, but this region is
#=GF CC   the least well-conserved [1].
#=GF SQ   399
#=GS G1M8D9_AILME/9-530        AC G1M8D9.1
#=GS G3SS94_LOXAF/4-518        AC G3SS94.1
#=GS V4Z986_TOXGO/424-750      AC V4Z986.1
#=GS F7BNX7_CIOIN/171-546      AC F7BNX7.1
#=GS B2BWH3_DANRE/49-623       AC B2BWH3.1
#=GS G1KJA2_ANOCA/200-672      AC G1KJA2.2
#=GS K2MUT0_TRYCR/49-340       AC K2MUT0.1
#=GS B4G4Z5_DROPE/54-658       AC B4G4Z5.1
#=GS U6HBD1_ECHMU/1-170        AC U6HBD1.1
#=GS E9BNQ6_LEIDB/55-187       AC E9BNQ6.1
#=GS T1I0X3_RHOPR/58-375       AC T1I0X3.1
#=GS U6HBD1_ECHMU/178-486      AC U6HBD1.1
#=GS F4P4I6_BATDJ/183-517      AC F4P4I6.1
#=GS K2MDG2_TRYCR/56-195       AC K2MDG2.1
#=GS L5M2N6_MYODS/8-618        AC L5M2N6.1
#=GS B4MBD1_DROVI/54-608       AC B4MBD1.1
#=GS W2SPD1_NECAM/190-270      AC W2SPD1.1
#=GS I1EX77_AMPQE/143-530      AC I1EX77.1
#=GS A8JBY2_CHLRE/51-252       AC A8JBY2.1
#=GS A0A024GJW8_9STRA/271-413  AC A0A024GJW8.1
#=GS G4VA61_SCHMA/52-212       AC G4VA61.1
#=GS M7BRW8_CHEMY/575-754      AC M7BRW8.1
#=GS A7RX62_NEMVE/336-548      AC A7RX62.1
#=GS H2SSE7_TAKRU/48-684       AC H2SSE7.1
#=GS B7PMS6_IXOSC/140-217      AC B7PMS6.1
#=GS H3H3Z8_PHYRM/52-274       AC H3H3Z8.1
#=GS I1G2M8_AMPQE/261-550      AC I1G2M8.1
#=GS F6SZX7_MACMU/49-685       AC F6SZX7.1
#=GS K3WMZ2_PYTUL/410-765      AC K3WMZ2.1
#=GS H2YVY1_CIOSA/195-372      AC H2YVY1.1
#=GS H2MV47_ORYLA/49-613       AC H2MV47.1
#=GS B0WJG0_CULQU/52-597       AC B0WJG0.1
#=GS H2YVY1_CIOSA/49-209       AC H2YVY1.1
#=GS G0UV59_TRYCI/141-602      AC G0UV59.1
#=GS E1B9E6_BOVIN/49-680       AC E1B9E6.2
#=GS Q4DJU0_TRYCC/56-190       AC Q4DJU0.1
#=GS S9VCQ1_9TRYP/104-211      AC S9VCQ1.1
#=GS A2EAF4_TRIVA/52-253       AC A2EAF4.1
#=GS G6DEY4_DANPL/53-596       AC G6DEY4.1
#=GS X6NP17_RETFI/31-334       AC X6NP17.1
#=GS S7PE19_MYOBR/288-864      AC S7PE19.1
#=GS F1LN20_RAT/49-647         AC F1LN20.1
#=GS M3DES8_SPHMS/75-492       AC M3DES8.1
#=GS X6NHV2_RETFI/352-716      AC X6NHV2.1
#=GS W2LQQ0_PHYPR/294-455      AC W2LQQ0.1
#=GS H0YYA2_TAEGU/364-604      AC H0YYA2.1
#=GS G3W5Z4_SARHA/48-641       AC G3W5Z4.1
#=GS Q4QC32_LEIMA/223-476      AC Q4QC32.1
#=GS H3CU11_TETNG/49-609       AC H3CU11.1
#=GS B4KPY0_DROMO/129-474      AC B4KPY0.1
#=GS W2ZVJ7_PHYPR/294-455      AC W2ZVJ7.1
#=GS G7N9A9_MACMU/11-647       AC G7N9A9.1
#=GS H3AZ78_LATCH/1-623        AC H3AZ78.1
#=GS W2LQQ0_PHYPR/392-729      AC W2LQQ0.1
#=GS E4YHA2_OIKDI/277-497      AC E4YHA2.1
#=GS W2JJ75_PHYPR/435-729      AC W2JJ75.1
#=GS C1N591_MICPC/135-517      AC C1N591.1
#=GS G3W5Z3_SARHA/48-667       AC G3W5Z3.1
#=GS L5KT56_PTEAL/29-297       AC L5KT56.1
#=GS I1RZ08_GIBZE/25-391       AC I1RZ08.1
#=GS G1MTQ3_MELGA/49-638       AC G1MTQ3.2
#=GS A9UXI1_MONBE/183-360      AC A9UXI1.1
#=GS A4HKD4_LEIBR/57-155       AC A4HKD4.1
#=GS Q5CHL3_CRYHO/8-252        AC Q5CHL3.1
#=GS G3RV81_GORGO/49-179       AC G3RV81.1
#=GS A8Q1F2_BRUMA/114-484      AC A8Q1F2.1
#=GS M7BRW8_CHEMY/106-535      AC M7BRW8.1
#=GS B0S7L7_DANRE/49-623       AC B0S7L7.1
#=GS W4WIJ6_ATTCE/53-565       AC W4WIJ6.1
#=GS G1RKL3_NOMLE/49-685       AC G1RKL3.1
#=GS A7RXQ3_NEMVE/133-539      AC A7RXQ3.1
#=GS J9HZ83_9SPIT/38-273       AC J9HZ83.1
#=GS K4DN93_TRYCR/49-570       AC K4DN93.1
#=GS G4ZZ44_PHYSP/177-468      AC G4ZZ44.1
#=GS K0RCA0_THAOC/52-180       AC K0RCA0.1
#=GS F6PY07_XENTR/49-609       AC F6PY07.1
#=GS U6G3L1_9EIME/17-465       AC U6G3L1.1
#=GS U1MK66_ASCSU/102-502      AC U1MK66.1
#=GS H0YYA2_TAEGU/49-306       AC H0YYA2.1
#=GS Q4SK34_TETNG/61-194       AC Q4SK34.1
#=GS D0P0K7_PHYIT/3-208        AC D0P0K7.1
#=GS F2U7V8_SALR5/54-566       AC F2U7V8.1
#=GS W4G1T5_9STRA/307-433      AC W4G1T5.1
#=GS E1ZXL7_CAMFO/53-582       AC E1ZXL7.1
#=GS J9EX20_WUCBA/285-416      AC J9EX20.1
#=GS MIPT3_DANRE/49-623        AC Q6PGZ3.1
#=GS A0A024TML3_9STRA/297-429  AC A0A024TML3.1
#=GS J9KWF8_ACYPI/119-488      AC J9KWF8.1
#=GS V3ZY28_LOTGI/49-690       AC V3ZY28.1
#=GS R1FU15_EMIHU/50-173       AC R1FU15.1
#=GS F5HMW7_ANOGA/1-277        AC F5HMW7.1
#=GS L7N2S0_XENTR/49-267       AC L7N2S0.1
#=GS U3JMI9_FICAL/49-652       AC U3JMI9.1
#=GS W5QBS5_SHEEP/5-315        AC W5QBS5.1
#=GS U3F3J6_CALJA/49-618       AC U3F3J6.1
#=GS E9ISY8_SOLIN/542-620      AC E9ISY8.1
#=GS V6TDL5_GIAIN/53-298       AC V6TDL5.1
#=GS G1SFL9_RABIT/1-565        AC G1SFL9.1
#=GS N6UHM6_DENPD/52-299       AC N6UHM6.1
#=GS F0YK37_AURAN/664-791      AC F0YK37.1
#=GS F0YK37_AURAN/871-1024     AC F0YK37.1
#=GS J0XLN7_LOALO/6-434        AC J0XLN7.1
#=GS M3ZIM2_XIPMA/49-638       AC M3ZIM2.1
#=GS W4G1T5_9STRA/408-707      AC W4G1T5.1
#=GS Q24FQ8_TETTS/275-447      AC Q24FQ8.1
#=GS A0A044TEG5_ONCVO/50-203   AC A0A044TEG5.1
#=GS F6SE49_CALJA/49-619       AC F6SE49.1
#=GS A4HZM1_LEIIN/170-477      AC A4HZM1.2
#=GS V9FN50_PHYPR/294-455      AC V9FN50.1
#=GS D8T7P2_SELML/191-334      AC D8T7P2.1
#=GS A9TKC3_PHYPA/27-122       AC A9TKC3.1
#=GS C1N591_MICPC/51-180       AC C1N591.1
#=GS H2YVY2_CIOSA/255-529      AC H2YVY2.1
#=GS H0YY99_TAEGU/49-638       AC H0YY99.1
#=GS W6L421_9TRYP/1-328        AC W6L421.1
#=GS A8Q1F2_BRUMA/48-198       AC A8Q1F2.1
#=GS E9BFH4_LEIDB/170-477      AC E9BFH4.1
#=GS V9FN50_PHYPR/52-269       AC V9FN50.1
#=GS E9ISY8_SOLIN/53-524       AC E9ISY8.1
#=GS D7G5R9_ECTSI/6-303        AC D7G5R9.1
#=GS MIPT3_MOUSE/49-619        AC Q149C2.2
#=GS G3UHY4_LOXAF/51-645       AC G3UHY4.1
#=GS W2XIV9_PHYPR/294-455      AC W2XIV9.1
#=GS G5BHH8_HETGA/1-556        AC G5BHH8.1
#=GS U6D5Q2_NEOVI/49-357       AC U6D5Q2.1
#=GS W2SPD1_NECAM/3-182        AC W2SPD1.1
#=GS U6D5P3_NEOVI/3-266        AC U6D5P3.1
#=GS W4YX31_STRPU/2-255        AC W4YX31.1
#=GS H9F3X0_MACMU/1-429        AC H9F3X0.1
#=GS E0VUG2_PEDHC/58-434       AC E0VUG2.1
#=GS C1FI46_MICSR/46-211       AC C1FI46.1
#=GS U6G9M3_9EIME/457-829      AC U6G9M3.1
#=GS M5TZ45_9PLAN/328-625      AC M5TZ45.1
#=GS W6U638_ECHGR/52-566       AC W6U638.1
#=GS E4YHA2_OIKDI/49-284       AC E4YHA2.1
#=GS F4P4I6_BATDJ/69-188       AC F4P4I6.1
#=GS S9UEA8_9TRYP/51-163       AC S9UEA8.1
#=GS U6LHS0_9EIME/3-350        AC U6LHS0.1
#=GS E1FVD7_LOALO/51-201       AC E1FVD7.1
#=GS I1EX77_AMPQE/54-230       AC I1EX77.1
#=GS S7UXS6_TOXGO/410-754      AC S7UXS6.1
#=GS A2EAF4_TRIVA/245-457      AC A2EAF4.1
#=GS T1I0W5_RHOPR/5-245        AC T1I0W5.1
#=GS W5MRP7_LEPOC/49-630       AC W5MRP7.1
#=GS A0A023EZD3_TRIIF/44-618   AC A0A023EZD3.1
#=GS T1KHP6_TETUR/56-131       AC T1KHP6.1
#=GS C3ZSU9_BRAFL/1-323        AC C3ZSU9.1
#=GS L9KQV2_TUPCH/1-92         AC L9KQV2.1
#=GS D0A116_TRYB9/49-269       AC D0A116.1
#=GS A0A044TEG5_ONCVO/300-448  AC A0A044TEG5.1
#=GS C3XQJ3_BRAFL/197-500      AC C3XQJ3.1
#=GS F0ZDT2_DICPU/803-1122     AC F0ZDT2.1
#=GS Q17NG1_AEDAE/914-1248     AC Q17NG1.1
#=GS Q17J13_AEDAE/1-521        AC Q17J13.1
#=GS W3VTP2_9BASI/559-876      AC W3VTP2.1
#=GS A4HC10_LEIBR/237-483      AC A4HC10.1
#=GS U1MK66_ASCSU/35-254       AC U1MK66.1
#=GS A8Y1F6_CAEBR/49-104       AC A8Y1F6.2
#=GS W2PB63_PHYPN/52-268       AC W2PB63.1
#=GS G3W5Z2_SARHA/48-707       AC G3W5Z2.1
#=GS M3XM21_MUSPF/5-680        AC M3XM21.1
#=GS H3H3Z8_PHYRM/455-737      AC H3H3Z8.1
#=GS K4E322_TRYCR/145-284      AC K4E322.1
#=GS E3MA75_CAERE/46-551       AC E3MA75.1
#=GS L5KSG6_PTEAL/1-318        AC L5KSG6.1
#=GS H2YVY2_CIOSA/50-259       AC H2YVY2.1
#=GS M9LWN4_PSEA3/559-861      AC M9LWN4.1
#=GS J9HZ83_9SPIT/243-428      AC J9HZ83.1
#=GS W2PB63_PHYPN/392-729      AC W2PB63.1
#=GS A0A022T240_9HYME/54-598   AC A0A022T240.1
#=GS H9KI81_APIME/53-583       AC H9KI81.1
#=GS F6QTB8_CIOIN/15-411       AC F6QTB8.2
#=GS A0A024GJW8_9STRA/354-694  AC A0A024GJW8.1
#=GS T0Q541_9STRA/303-436      AC T0Q541.1
#=GS D0NND1_PHYIT/401-721      AC D0NND1.1
#=GS F0WAY1_9STRA/51-221       AC F0WAY1.1
#=GS K7FY95_PELSI/1-583        AC K7FY95.1
#=GS D2VE85_NAEGR/131-502      AC D2VE85.1
#=GS B4JS72_DROGR/53-630       AC B4JS72.1
#=GS T1JKW8_STRMM/53-577       AC T1JKW8.1
#=GS F1PJD3_CANFA/48-687       AC F1PJD3.2
#=GS W4YRZ0_STRPU/7-294        AC W4YRZ0.1
#=GS F7BNX7_CIOIN/49-232       AC F7BNX7.1
#=GS V5BRF6_TRYCR/49-558       AC V5BRF6.1
#=GS K0RCA0_THAOC/247-378      AC K0RCA0.1
#=GS V9FN50_PHYPR/392-729      AC V9FN50.1
#=GS X1Y0I3_ANODA/53-707       AC X1Y0I3.1
#=GS C7Z4S6_NECH7/49-426       AC C7Z4S6.1
#=GS L1JRV3_GUITH/54-221       AC L1JRV3.1
#=GS Q9VFL0_DROME/53-588       AC Q9VFL0.1
#=GS Q4SK34_TETNG/187-358      AC Q4SK34.1
#=GS B0WNI8_CULQU/2-347        AC B0WNI8.1
#=GS H3FM09_PRIPA/46-285       AC H3FM09.1
#=GS B4HF29_DROSE/53-588       AC B4HF29.1
#=GS B8C748_THAPS/190-280      AC B8C748.1
#=GS L9KQV2_TUPCH/232-359      AC L9KQV2.1
#=GS E0VUG2_PEDHC/416-595      AC E0VUG2.1
#=GS N6UN14_DENPD/1-192        AC N6UN14.1
#=GS D2I226_AILME/1-123        AC D2I226.1
#=GS F6SL88_CALJA/49-683       AC F6SL88.1
#=GS W2ZVJ7_PHYPR/52-269       AC W2ZVJ7.1
#=GS G3RV81_GORGO/169-603      AC G3RV81.1
#=GS U4U3F9_DENPD/52-273       AC U4U3F9.1
#=GS A0A034WWZ4_BACDO/1-156    AC A0A034WWZ4.1
#=GS A8JBY2_CHLRE/160-506      AC A8JBY2.1
#=GS B4QZW9_DROSI/347-856      AC B4QZW9.1
#=GS G4VA60_SCHMA/4-161        AC G4VA60.1
#=GS B3DLT2_XENTR/49-626       AC B3DLT2.1
#=GS B3LZX7_DROAN/53-606       AC B3LZX7.1
#=GS X6P8F0_RETFI/12-208       AC X6P8F0.1
#=GS A8MTK4_HUMAN/49-685       AC A8MTK4.1
#=GS K3WMZ2_PYTUL/52-303       AC K3WMZ2.1
#=GS L1IK31_GUITH/8-365        AC L1IK31.1
#=GS F5HMR4_ANOGA/297-475      AC F5HMR4.1
#=GS D8TYV3_VOLCA/51-266       AC D8TYV3.1
#=GS E4XE99_OIKDI/272-497      AC E4XE99.1
#=GS F0WAY1_9STRA/270-410      AC F0WAY1.1
#=GS B8C748_THAPS/1-129        AC B8C748.1
#=GS V5AZG9_TRYCR/85-219       AC V5AZG9.1
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G1M8D9_AILME/9-530                   ..............................................................................................................................................................................MKGLYTDTEMKSDN.V.KDKD.AKISFLQKAIDVVVMVSGE.PL..SAKPARIVAGHEPERTNELLQRIGKCCLS...kKLSS..DEAVNRVLAG......E..KG.DLK.G.....RTS.LT..S.KS...Q...E...LD.N.K..N..A..R..EE.E.L....R.GH..K..DK......E.E.K.RNS.E..IN...ERS...I..S.R.D..Q....KQKEEM..........KEESKAREKEK-....-.EKM.KE.N...D..R.D....R..HK.D.P...E.RDK..HRE.GERERAR.NRA........................................................................................................................kQDR.....DRGNRDR......DK..DL.DHERER......R.NEG.GKEK......ERW...K...D.R..ER...........ER..E.R.D.KA.....RDRDRR.......KVK.....DG.EHSR............................................................................................................................D.P.EK.EK...SRE.H.DK.PEK..................KS.SSSG.EV.SKKLP...DG.....SL..KD.S.R......A.E.TETEI.S...I..RASRS.VTTKAskrrsknsmegrkednisakkldpivsglnheadqetttsgigtreant..........................................................................................nsasvsddnsaglwrenvepepavkqkvgdspsdaegeagpsgpekpevSESSE..LLS..E....HP..A..NI..R....K...I.PRPGSAR...P.....AP......PR.V.KRQ..DSVEALT...........P..DRAGSG..RVVAS..VIVAAQD............................SD..NEEDD...Q..FVVDA.A.P.QL.PEA.........................SEL.E.M.V.P.T.V.....D..V.E..D.E...EKHG..GL..VKKILET.KKDYEKLQQ.SPR....PGEK.VR..S--...................................................-----------.-------------------------------------------------------------.--------------------...-------------------------df...........................................................................................................................................................................................................................
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