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Database: Pfam
Entry: Ndc1_Nup
LinkDB: Ndc1_Nup
Original site: Ndc1_Nup 
#=GF ID   Ndc1_Nup
#=GF AC   PF09531.9
#=GF DE   Nucleoporin protein Ndc1-Nup
#=GF AU   Wood V, Coggill P
#=GF SE   Wood, V
#=GF GA   24.90 24.90;
#=GF TC   25.40 24.90;
#=GF NC   24.80 24.80;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 26740544 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   16702233
#=GF RT   NDC1: a crucial membrane-integral nucleoporin of metazoan
#=GF RT   nuclear pore complexes. 
#=GF RA   Stavru F, Hulsmann BB, Spang A, Hartmann E, Cordes VC, Gorlich
#=GF RA   D; 
#=GF RL   J Cell Biol. 2006;173:509-519.
#=GF DR   INTERPRO; IPR019049;
#=GF CC   Ndc1 is a nucleoporin protein that is a component of the Nuclear
#=GF CC   Pore Complex, and, in fungi, also of the Spindle Pole Body. It
#=GF CC   consists of six transmembrane segments, three lumenal loops,
#=GF CC   both concentrated at the N-terminus and cytoplasmic domains
#=GF CC   largely at the C-terminus, all of which are well conserved.
#=GF SQ   770
#=GS A0A154NY19_9HYME/134-420  AC A0A154NY19.1
#=GS A0A136JGR8_9PEZI/15-610   AC A0A136JGR8.1
#=GS A0A094ES57_9PEZI/96-718   AC A0A094ES57.1
#=GS A0A0P7XM42_9TELE/8-650    AC A0A0P7XM42.1
#=GS A0A091G0I7_9AVES/1-650    AC A0A091G0I7.1
#=GS F6PV21_CIOIN/11-639       AC F6PV21.2
#=GS A0A165EBM3_9APHY/1-528    AC A0A165EBM3.1
#=GS A0A0L0NKI7_9HYPO/333-606  AC A0A0L0NKI7.1
#=GS A0A137NXX4_CONC2/359-459  AC A0A137NXX4.1
#=GS A0A094CE36_9PEZI/16-638   AC A0A094CE36.1
#=GS A0A091KVF2_COLST/1-655    AC A0A091KVF2.1
#=GS M4AEM0_XIPMA/13-596       AC M4AEM0.1
#=GS G0SXJ4_RHOT2/48-672       AC G0SXJ4.1
#=GS S3EF72_GLAL2/16-635       AC S3EF72.1
#=GS W5KFN0_ASTMX/372-652      AC W5KFN0.1
#=GS A0A093HVF1_STRCA/3-613    AC A0A093HVF1.1
#=GS C0NIT1_AJECG/22-667       AC C0NIT1.1
#=GS E3QGY2_COLGM/17-610       AC E3QGY2.1
#=GS R4XEV5_TAPDE/1-201        AC R4XEV5.1
#=GS A0A072PA81_9EURO/20-599   AC A0A072PA81.1
#=GS M8ADU7_TRIUA/20-219       AC M8ADU7.1
#=GS A0A0N5BG69_STREA/459-574  AC A0A0N5BG69.1
#=GS H2N2C0_ORYLA/1-165        AC H2N2C0.1
#=GS W9XCD9_9EURO/22-608       AC W9XCD9.1
#=GS A0A094HE93_9PEZI/16-638   AC A0A094HE93.1
#=GS F2PMJ9_TRIEC/16-647       AC F2PMJ9.1
#=GS K2S984_MACPH/14-613       AC K2S984.1
#=GS L9KRM9_TUPCH/544-685      AC L9KRM9.1
#=GS B9GLM4_POPTR/144-375      AC B9GLM4.2
#=GS I1P363_ORYGL/240-373      AC I1P363.1
#=GS A0A0L0BYG9_LUCCU/10-576   AC A0A0L0BYG9.1
#=GS A0A0D2NH47_9AGAR/43-682   AC A0A0D2NH47.1
#=GS G7LCI8_MEDTR/157-266      AC G7LCI8.2
#=GS T1JHR9_STRMM/1709-2090    AC T1JHR9.1
#=GS E0VZA5_PEDHC/5-555        AC E0VZA5.1
#=GS H0EQP3_GLAL7/1-353        AC H0EQP3.1
#=GS S7PWE1_GLOTA/42-689       AC S7PWE1.1
#=GS C0P3G4_MAIZE/9-178        AC C0P3G4.1
#=GS W5M5I4_LEPOC/13-671       AC W5M5I4.1
#=GS C7Z0V3_NECH7/17-604       AC C7Z0V3.1
#=GS L9KRM9_TUPCH/440-549      AC L9KRM9.1
#=GS A0A091WI64_OPIHO/4-613    AC A0A091WI64.1
#=GS D7KR87_ARALL/9-363        AC D7KR87.1
#=GS A0A0D2EBL1_9EURO/22-624   AC A0A0D2EBL1.1
#=GS A0A183NK78_9TREM/2-137    AC A0A183NK78.1
#=GS A0A183B5R3_9TREM/14-196   AC A0A183B5R3.1
#=GS A0A0L0NPU9_9ASCO/21-628   AC A0A0L0NPU9.1
#=GS K1WVW6_MARBU/16-622       AC K1WVW6.1
#=GS A0A0G2EZ92_9PEZI/14-614   AC A0A0G2EZ92.1
#=GS G4US57_NEUT9/17-609       AC G4US57.1
#=GS A0A176VC32_MARPO/143-410  AC A0A176VC32.1
#=GS A0A0M8ZZF3_9HYME/11-570   AC A0A0M8ZZF3.1
#=GS M1CEP5_SOLTU/180-315      AC M1CEP5.1
#=GS G0RSF5_HYPJQ/17-612       AC G0RSF5.1
#=GS A0A0D3F8Z7_9ORYZ/3-212    AC A0A0D3F8Z7.1
#=GS B4LXS6_DROVI/11-574       AC B4LXS6.1
#=GS A0A0F7TRJ9_9EURO/16-645   AC A0A0F7TRJ9.1
#=GS C5M9B5_CANTT/15-608       AC C5M9B5.1
#=GS A0A151X8H5_9HYME/144-423  AC A0A151X8H5.1
#=GS H2N7C1_PONAB/19-652       AC H2N7C1.1
#=GS A0A0B1PGX8_UNCNE/17-622   AC A0A0B1PGX8.1
#=GS E3LPQ2_CAERE/426-581      AC E3LPQ2.1
#=GS G0NH20_CAEBE/411-577      AC G0NH20.1
#=GS A0A086T284_ACRC1/17-612   AC A0A086T284.1
#=GS T0KR48_COLGC/17-611       AC T0KR48.1
#=GS M5WH61_PRUPE/159-388      AC M5WH61.1
#=GS A0A0C9MVR3_9FUNG/31-596   AC A0A0C9MVR3.1
#=GS M2T1J0_COCSN/19-620       AC M2T1J0.1
#=GS A0A0C3GR74_9PEZI/16-614   AC A0A0C3GR74.1
#=GS H2N2C0_ORYLA/139-306      AC H2N2C0.1
#=GS H2N2C2_ORYLA/13-665       AC H2N2C2.1
#=GS C9SL78_VERA1/17-614       AC C9SL78.1
#=GS A0A0J7KNG9_LASNI/11-571   AC A0A0J7KNG9.1
#=GS A0A0A1TA17_9HYPO/17-603   AC A0A0A1TA17.1
#=GS G8B5Q8_CANPC/19-610       AC G8B5Q8.1
#=GS A0A151RRK4_CAJCA/328-454  AC A0A151RRK4.1
#=GS H3DBN1_TETNG/8-655        AC H3DBN1.1
#=GS M5CDB9_THACB/1-336        AC M5CDB9.1
#=GS A0A067N937_PLEOS/1-142    AC A0A067N937.1
#=GS NDC1_HUMAN/19-667         AC Q9BTX1.2
#=GS A0A0A8KZS1_9SACH/1-437    AC A0A0A8KZS1.1
#=GS A0A124GSS7_9EURO/15-646   AC A0A124GSS7.1
#=GS A0A0R3TP28_HYMNN/242-449  AC A0A0R3TP28.1
#=GS A0A091UVS8_NIPNI/3-613    AC A0A091UVS8.1
#=GS NDC1_CAEEL/191-580        AC Q8I4N3.1
#=GS I1ICP2_BRADI/329-467      AC I1ICP2.1
#=GS K1V3N4_TRIAC/511-606      AC K1V3N4.1
#=GS A0A0G4IVT2_PLABS/369-498  AC A0A0G4IVT2.1
#=GS K7F4I1_PELSI/1-601        AC K7F4I1.1
#=GS A0A139IE20_9PEZI/28-665   AC A0A139IE20.1
#=GS A0A0N4XQ32_NIPBR/1-89     AC A0A0N4XQ32.1
#=GS A0A0C9SLG4_PAXIN/10-153   AC A0A0C9SLG4.1
#=GS E5R4Y3_LEPMJ/19-621       AC E5R4Y3.1
#=GS W3XKK9_9PEZI/15-606       AC W3XKK9.1
#=GS F8QBF7_SERL3/41-687       AC F8QBF7.1
#=GS F0U5B9_AJEC8/22-667       AC F0U5B9.1
#=GS A0A0R3QI45_9BILA/2-137    AC A0A0R3QI45.1
#=GS A0A0L0TEX3_ALLMA/50-638   AC A0A0L0TEX3.1
#=GS E1Z287_CHLVA/378-512      AC E1Z287.1
#=GS A0A0D2QS21_GOSRA/318-454  AC A0A0D2QS21.1
#=GS A0A067RH31_ZOONE/11-586   AC A0A067RH31.1
#=GS E2L813_MONPE/3-110        AC E2L813.1
#=GS S0E9P3_GIBF5/17-604       AC S0E9P3.1
#=GS A0A0C2WU94_AMAMU/43-741   AC A0A0C2WU94.1
#=GS K7U7A6_MAIZE/334-466      AC K7U7A6.1
#=GS E1Z287_CHLVA/109-390      AC E1Z287.1
#=GS J3KCW7_COCIM/18-661       AC J3KCW7.2
#=GS E1FWR1_LOALO/458-550      AC E1FWR1.1
#=GS K7U7A6_MAIZE/125-339      AC K7U7A6.1
#=GS J9LGW2_ACYPI/305-465      AC J9LGW2.2
#=GS A0A074VQS0_9PEZI/22-610   AC A0A074VQS0.1
#=GS U1MF41_ASCSU/9-155        AC U1MF41.1
#=GS NDC1_CAEBR/191-580        AC Q60M68.2
#=GS B0S5I6_DANRE/13-664       AC B0S5I6.1
#=GS K4BJP9_SOLLC/19-396       AC K4BJP9.1
#=GS K1Q4C5_CRAGI/229-491      AC K1Q4C5.1
#=GS A0A044U1C5_ONCVO/41-547   AC A0A044U1C5.1
#=GS A0A166YC09_9PEZI/17-610   AC A0A166YC09.1
#=GS B0WDM0_CULQU/17-416       AC B0WDM0.1
#=GS M3Y585_MUSPF/121-769      AC M3Y585.1
#=GS A0A0G2I5I1_9PEZI/171-450  AC A0A0G2I5I1.1
#=GS A0A0F4ZBV0_9PEZI/17-614   AC A0A0F4ZBV0.1
#=GS E1FWR1_LOALO/38-454       AC E1FWR1.1
#=GS A0A0G2I5I1_9PEZI/15-174   AC A0A0G2I5I1.1
#=GS W6XR17_COCCA/19-620       AC W6XR17.1
#=GS Q2UGF1_ASPOR/15-642       AC Q2UGF1.1
#=GS W4ZEU6_STRPU/11-648       AC W4ZEU6.1
#=GS A0A088AG24_APIME/142-418  AC A0A088AG24.1
#=GS W5GZI1_WHEAT/314-450      AC W5GZI1.1
#=GS A0A151GAS1_9HYPO/17-634   AC A0A151GAS1.1
#=GS A0A150VIN7_9PEZI/9-638    AC A0A150VIN7.1
#=GS A2X8D7_ORYSI/337-474      AC A2X8D7.1
#=GS A0A194WVV0_9HELO/1-345    AC A0A194WVV0.1
#=GS M4DHN2_BRARP/133-338      AC M4DHN2.1
#=GS A0A0F8D106_CERFI/17-609   AC A0A0F8D106.1
#=GS M4DHN2_BRARP/328-469      AC M4DHN2.1
#=GS W7N979_GIBM7/17-604       AC W7N979.1
#=GS A0A162AIA6_DAUCA/156-376  AC A0A162AIA6.1
#=GS K7J154_NASVI/2-540        AC K7J154.1
#=GS A0A0L6UFM3_9BASI/91-787   AC A0A0L6UFM3.1
#=GS W1QJ09_OGAPD/1-505        AC W1QJ09.1
#=GS M3JTS8_CANMX/1-414        AC M3JTS8.1
#=GS A0A090LHU6_STRRB/38-573   AC A0A090LHU6.1
#=GS W4Z9X6_STRPU/11-188       AC W4Z9X6.1
#=GS Q2GNL7_CHAGB/17-606       AC Q2GNL7.1
#=GS A0A0L9SV17_9HYPO/17-612   AC A0A0L9SV17.1
#=GS A0A0K6G637_9HOMO/229-800  AC A0A0K6G637.1
#=GS W4JPL4_9HOMO/38-675       AC W4JPL4.1
#=GS G1SVY6_RABIT/160-808      AC G1SVY6.2
#=GS V4TXL0_9ROSI/108-241      AC V4TXL0.1
#=GS C6H852_AJECH/22-667       AC C6H852.1
#=GS A0A0S7DYF7_9EURO/15-650   AC A0A0S7DYF7.1
#=GS A0A059A4I1_EUCGR/366-503  AC A0A059A4I1.1
#=GS A0A183IFM2_9BILA/205-339  AC A0A183IFM2.1
#=GS A0A026VXZ7_CERBI/122-433  AC A0A026VXZ7.1
#=GS A0A165J5C7_9PEZI/18-620   AC A0A165J5C7.1
#=GS A0A158PS03_BRUPA/42-400   AC A0A158PS03.1
#=GS A0A0C3QRC4_9HOMO/1-483    AC A0A0C3QRC4.1
#=GS A0A0L0D1R1_THETB/14-625   AC A0A0L0D1R1.1
#=GS G7YCP1_CLOSI/17-272       AC G7YCP1.1
#=GS Q6BJ46_DEBHA/24-634       AC Q6BJ46.2
#=GS A0A0U5FVC1_9EURO/15-640   AC A0A0U5FVC1.1
#=GS D7TY85_VITVI/358-491      AC D7TY85.1
#=GS A0A0C3B240_9HOMO/35-687   AC A0A0C3B240.1
#=GS H0UUK7_CAVPO/19-668       AC H0UUK7.1
#=GS G8BZ36_TETPH/17-597       AC G8BZ36.1
#=GS I1S279_GIBZE/17-604       AC I1S279.1
#=GS A0A165LLE9_EXIGL/15-115   AC A0A165LLE9.1
#=GS W2SJF5_NECAM/68-617       AC W2SJF5.1
#=GS W9CM43_9HELO/16-639       AC W9CM43.1
#=GS Q7Q9X0_ANOGA/13-572       AC Q7Q9X0.5
#=GS G3RMF4_GORGO/1-650        AC G3RMF4.1
#=GS A0A168IHS2_MUCCL/26-566   AC A0A168IHS2.1
#=GS W5GN28_WHEAT/2-197        AC W5GN28.1
#=GS A6R7J1_AJECN/1-384        AC A6R7J1.1
#=GS A0A0D9VJK6_9ORYZ/349-483  AC A0A0D9VJK6.1
#=GS A0A074X1H4_AURPU/22-610   AC A0A074X1H4.1
#=GS A0A063BZK0_9HYPO/17-620   AC A0A063BZK0.1
#=GS M7TSH1_BOTF1/16-639       AC M7TSH1.1
#=GS G3SRF8_LOXAF/19-667       AC G3SRF8.1
#=GS F4W8X5_ACREC/11-565       AC F4W8X5.1
#=GS L8WIB5_THACA/3-282        AC L8WIB5.1
#=GS A0A151M4J0_ALLMI/8-637    AC A0A151M4J0.1
#=GS S8ARN7_PENO1/16-630       AC S8ARN7.1
#=GS A0A139WN84_TRICA/1-361    AC A0A139WN84.1
#=GS A0A0L0NKI7_9HYPO/17-333   AC A0A0L0NKI7.1
#=GS R7SXB4_DICSQ/31-179       AC R7SXB4.1
#=GS G9NWU8_HYPAI/17-612       AC G9NWU8.1
#=GS K7GXG7_CAEJA/79-406       AC K7GXG7.1
#=GS G2XBG5_VERDV/17-614       AC G2XBG5.1
#=GS B4JTZ6_DROGR/11-572       AC B4JTZ6.1
#=GS A0A0M9EWW6_9HYPO/17-604   AC A0A0M9EWW6.1
#=GS A0A0D7B4A9_9HOMO/33-598   AC A0A0D7B4A9.1
#=GS E9E100_METAQ/17-622       AC E9E100.1
#=GS J7S3L1_KAZNA/19-616       AC J7S3L1.1
#=GS A0A068XXZ7_ECHMU/1-384    AC A0A068XXZ7.1
#=GS A0A0P4UES2_ROSNE/17-619   AC A0A0P4UES2.1
#=GS A0A183RPY4_9TREM/9-116    AC A0A183RPY4.1
#=GS A0A165SR73_9HOMO/34-682   AC A0A165SR73.1
#=GS A0A0D2IFM7_9EURO/23-609   AC A0A0D2IFM7.1
#=GS G3RFG1_GORGO/1-649        AC G3RFG1.1
#=GS G0NH20_CAEBE/187-399      AC G0NH20.1
#=GS H2YNY6_CIOSA/1-110        AC H2YNY6.1
#=GS A0A183LB21_9TREM/8-154    AC A0A183LB21.1
#=GS A0A0B2XH14_METRA/17-613   AC A0A0B2XH14.1
#=GS G7E1H7_MIXOS/80-619       AC G7E1H7.1
#=GS B9SQ62_RICCO/335-489      AC B9SQ62.1
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