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Database: Pfam
Entry: Ndc1_Nup
LinkDB: Ndc1_Nup
Original site: Ndc1_Nup 
#=GF ID   Ndc1_Nup
#=GF AC   PF09531.7
#=GF DE   Nucleoporin protein Ndc1-Nup
#=GF AU   Wood V, Coggill P
#=GF SE   Wood, V
#=GF GA   24.70 24.70;
#=GF TC   25.40 24.80;
#=GF NC   23.40 24.50;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 11927849 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   16702233
#=GF RT   NDC1: a crucial membrane-integral nucleoporin of metazoan
#=GF RT   nuclear pore complexes. 
#=GF RA   Stavru F, Hulsmann BB, Spang A, Hartmann E, Cordes VC, Gorlich
#=GF RA   D; 
#=GF RL   J Cell Biol. 2006;173:509-519.
#=GF DR   INTERPRO; IPR019049;
#=GF CC   Ndc1 is a nucleoporin protein that is a component of the Nuclear
#=GF CC   Pore Complex, and, in fungi, also of the Spindle Pole Body. It
#=GF CC   consists of six transmembrane segments, three lumenal loops,
#=GF CC   both concentrated at the N-terminus and cytoplasmic domains
#=GF CC   largely at the C-terminus, all of which are well conserved.
#=GF SQ   431
#=GS S3C1X5_OPHP1/28-625       AC S3C1X5.1
#=GS Q756F3_ASHGO/22-583       AC Q756F3.2
#=GS I3KQF7_ORENI/13-663       AC I3KQF7.1
#=GS B9SQ62_RICCO/345-489      AC B9SQ62.1
#=GS F6PV21_CIOIN/11-639       AC F6PV21.2
#=GS A0A087HI08_ARAAL/135-362  AC A0A087HI08.1
#=GS G1LSX0_AILME/17-665       AC G1LSX0.1
#=GS A0A0D1DNT0_USTMA/24-633   AC A0A0D1DNT0.1
#=GS B9SQ62_RICCO/129-365      AC B9SQ62.1
#=GS E2L813_MONPE/4-110        AC E2L813.1
#=GS H2PZ26_PANTR/19-667       AC H2PZ26.1
#=GS A0A022Q2Q6_ERYGU/390-523  AC A0A022Q2Q6.1
#=GS M1CEP4_SOLTU/19-398       AC M1CEP4.1
#=GS V4A053_LOTGI/20-577       AC V4A053.1
#=GS M4AEM0_XIPMA/13-596       AC M4AEM0.1
#=GS M7BZN6_CHEMY/188-383      AC M7BZN6.1
#=GS B5DX37_DROPS/292-595      AC B5DX37.1
#=GS B6K3L1_SCHJY/25-599       AC B6K3L1.1
#=GS G0SXJ4_RHOG2/48-672       AC G0SXJ4.1
#=GS S3EF72_GLAL2/16-635       AC S3EF72.1
#=GS C3XV32_BRAFL/292-443      AC C3XV32.1
#=GS E9D0T2_COCPS/18-661       AC E9D0T2.1
#=GS W5KFN0_ASTMX/372-652      AC W5KFN0.1
#=GS E2R294_CANFA/19-667       AC E2R294.1
#=GS D7TY85_VITVI/140-369      AC D7TY85.1
#=GS C0NIT1_AJECG/22-667       AC C0NIT1.1
#=GS E3QGY2_COLGM/17-610       AC E3QGY2.1
#=GS H2AT55_KAZAF/20-595       AC H2AT55.1
#=GS F6YYW8_ORNAN/361-515      AC F6YYW8.1
#=GS M0Y6D3_HORVD/332-467      AC M0Y6D3.1
#=GS G3B6R8_CANTC/19-622       AC G3B6R8.1
#=GS H2N2C0_ORYLA/1-165        AC H2N2C0.1
#=GS R7YLK7_CONA1/19-623       AC R7YLK7.1
#=GS F2PMJ9_TRIEC/16-647       AC F2PMJ9.1
#=GS K2S984_MACPH/14-613       AC K2S984.1
#=GS NDC1_PONAB/19-667         AC Q5RBY5.1
#=GS H6QRV9_PUCGT/24-675       AC H6QRV9.1
#=GS Q1K8Z4_NEUCR/17-609       AC Q1K8Z4.1
#=GS R9P193_PSEHS/24-618       AC R9P193.1
#=GS S8BD64_DACHA/1-274        AC S8BD64.1
#=GS E0VZA5_PEDHC/5-555        AC E0VZA5.1
#=GS H9H2X7_MACMU/19-529       AC H9H2X7.1
#=GS H0EQP3_GLAL7/1-353        AC H0EQP3.1
#=GS S7PWE1_GLOTA/42-689       AC S7PWE1.1
#=GS C4Y055_CLAL4/97-326       AC C4Y055.1
#=GS F6V0R6_CALJA/1-153        AC F6V0R6.1
#=GS D8QK27_SCHCM/71-783       AC D8QK27.1
#=GS E7LY81_YEASV/21-589       AC E7LY81.1
#=GS G7LCI8_MEDTR/155-267      AC G7LCI8.2
#=GS K7GXG7_CAEJA/80-406       AC K7GXG7.1
#=GS W5M5I4_LEPOC/13-671       AC W5M5I4.1
#=GS C7Z0V3_NECH7/17-604       AC C7Z0V3.1
#=GS A0A022Q2Q6_ERYGU/24-401   AC A0A022Q2Q6.1
#=GS J0DD16_AURDE/18-570       AC J0DD16.1
#=GS K1WVW6_MARBU/16-622       AC K1WVW6.1
#=GS G4US57_NEUT9/17-609       AC G4US57.1
#=GS G0RSF5_HYPJQ/17-612       AC G0RSF5.1
#=GS W4ZEU6_STRPU/11-647       AC W4ZEU6.1
#=GS B4LXS6_DROVI/11-574       AC B4LXS6.1
#=GS A0A072TM92_MEDTR/101-331  AC A0A072TM92.1
#=GS C5M9B5_CANTT/15-608       AC C5M9B5.1
#=GS G3YA57_ASPNA/15-641       AC G3YA57.1
#=GS C4Y054_CLAL4/9-402        AC C4Y054.1
#=GS T1JHR9_STRMM/1709-2076    AC T1JHR9.1
#=GS H2N7C1_PONAB/19-652       AC H2N7C1.1
#=GS A0A0B1PGX8_UNCNE/17-622   AC A0A0B1PGX8.1
#=GS W5P9A4_SHEEP/19-669       AC W5P9A4.1
#=GS T0KR48_COLGC/17-611       AC T0KR48.1
#=GS M2T1J0_COCSN/19-620       AC M2T1J0.1
#=GS M9LIV0_PSEA3/24-633       AC M9LIV0.1
#=GS A0A067C343_SAPPC/225-324  AC A0A067C343.1
#=GS K0KLT6_WICCF/36-587       AC K0KLT6.1
#=GS M5E8M0_MALS4/386-495      AC M5E8M0.1
#=GS F4PGI9_DICFS/77-415       AC F4PGI9.1
#=GS W4XW02_STRPU/4-259        AC W4XW02.1
#=GS A0A0D2WSE5_CAPO3/32-712   AC A0A0D2WSE5.1
#=GS H2N2C2_ORYLA/13-665       AC H2N2C2.1
#=GS M8ADU7_TRIUA/206-349      AC M8ADU7.1
#=GS G6D4D1_DANPL/2-279        AC G6D4D1.1
#=GS D8QXT5_SELML/337-466      AC D8QXT5.1
#=GS C9SL78_VERA1/17-614       AC C9SL78.1
#=GS U5GRK6_POPTR/1-196        AC U5GRK6.1
#=GS L5K3N8_PTEAL/19-667       AC L5K3N8.1
#=GS G8B5Q8_CANPC/19-610       AC G8B5Q8.1
#=GS J4U413_SACK1/21-181       AC J4U413.1
#=GS NDC1_HUMAN/19-667         AC Q9BTX1.2
#=GS H3DBN1_TETNG/8-655        AC H3DBN1.1
#=GS M5CDB9_THACB/1-336        AC M5CDB9.1
#=GS U9UTL2_RHIID/423-533      AC U9UTL2.1
#=GS NDC1_CHATD/16-624         AC G0S235.1
#=GS C5FF13_ARTOC/16-647       AC C5FF13.1
#=GS W5G556_WHEAT/124-337      AC W5G556.1
#=GS F6V0R6_CALJA/132-305      AC F6V0R6.1
#=GS F7IRZ2_CALJA/1-332        AC F7IRZ2.1
#=GS NDC1_CAEEL/191-580        AC Q8I4N3.1
#=GS K4BJP9_SOLLC/19-397       AC K4BJP9.1
#=GS N1PEI4_DOTSN/37-677       AC N1PEI4.1
#=GS H0ZGA0_TAEGU/1-652        AC H0ZGA0.1
#=GS K1V3N4_TRIAC/511-606      AC K1V3N4.1
#=GS B4KM20_DROMO/190-543      AC B4KM20.1
#=GS C5GE37_AJEDR/1-545        AC C5GE37.1
#=GS E2BZ02_HARSA/11-572       AC E2BZ02.1
#=GS E5R4Y3_LEPMJ/19-621       AC E5R4Y3.1
#=GS B8N9X9_ASPFN/15-642       AC B8N9X9.1
#=GS F8QBF7_SERL3/41-687       AC F8QBF7.1
#=GS G8JT35_ERECY/22-583       AC G8JT35.1
#=GS F0U5B9_AJEC8/22-667       AC F0U5B9.1
#=GS A0A090LYM3_OSTTA/111-409  AC A0A090LYM3.1
#=GS A0A067RH31_ZOONE/11-586   AC A0A067RH31.1
#=GS E1FWR1_LOALO/459-550      AC E1FWR1.1
#=GS M0RUF7_MUSAM/415-578      AC M0RUF7.1
#=GS S0E9P3_GIBF5/17-604       AC S0E9P3.1
#=GS V5EUU9_PSEBG/24-657       AC V5EUU9.1
#=GS G7IP46_MEDTR/328-456      AC G7IP46.2
#=GS D7TY85_VITVI/358-490      AC D7TY85.1
#=GS M3XCP4_FELCA/19-669       AC M3XCP4.1
#=GS J3KCW7_COCIM/18-661       AC J3KCW7.2
#=GS W5GZI1_WHEAT/107-320      AC W5GZI1.1
#=GS E5R324_ARTGP/16-647       AC E5R324.1
#=GS F0X7F4_GROCL/26-640       AC F0X7F4.1
#=GS Q6ETZ8_ORYSJ/63-198       AC Q6ETZ8.1
#=GS G0W7I1_NAUDC/104-733      AC G0W7I1.1
#=GS G4YPF7_PHYSP/276-589      AC G4YPF7.1
#=GS B0S5I6_DANRE/13-664       AC B0S5I6.1
#=GS K1Q4C5_CRAGI/231-491      AC K1Q4C5.1
#=GS K7U7A6_MAIZE/335-465      AC K7U7A6.1
#=GS B0DMD5_LACBS/171-566      AC B0DMD5.1
#=GS M3Y585_MUSPF/121-769      AC M3Y585.1
#=GS B0WDM0_CULQU/17-416       AC B0WDM0.1
#=GS I2FNE0_USTH4/24-659       AC I2FNE0.1
#=GS I2H4P1_TETBL/189-366      AC I2H4P1.1
#=GS H2N2C0_ORYLA/137-306      AC H2N2C0.1
#=GS H3APH5_LATCH/1-653        AC H3APH5.1
#=GS I1M1I7_SOYBN/332-456      AC I1M1I7.1
#=GS A0A0D3D0A7_BRAOL/134-339  AC A0A0D3D0A7.1
#=GS I1M1I7_SOYBN/22-338       AC I1M1I7.1
#=GS Q2UGF1_ASPOR/15-642       AC Q2UGF1.1
#=GS G3B6R9_CANTC/1-369        AC G3B6R9.1
#=GS A2X8D7_ORYSI/125-353      AC A2X8D7.1
#=GS G4VRG7_SCHMA/6-158        AC G4VRG7.1
#=GS M8ADU7_TRIUA/19-220       AC M8ADU7.1
#=GS A1CH20_ASPCL/15-641       AC A1CH20.1
#=GS V4KDJ1_EUTSA/135-364      AC V4KDJ1.1
#=GS H2TZG9_TAKRU/13-664       AC H2TZG9.1
#=GS D8RUK3_SELML/334-466      AC D8RUK3.1
#=GS NDC1_DROME/12-572         AC Q9VCG4.1
#=GS A0A066XJ25_COLSU/17-610   AC A0A066XJ25.1
#=GS J3LFX3_ORYBR/8-176        AC J3LFX3.1
#=GS W7N979_GIBM7/17-604       AC W7N979.1
#=GS W5G556_WHEAT/332-468      AC W5G556.1
#=GS D6WA16_TRICA/246-580      AC D6WA16.1
#=GS A8PNL4_BRUMA/1-192        AC A8PNL4.2
#=GS G3PX30_GASAC/13-665       AC G3PX30.1
#=GS W1QJ09_OGAPD/1-505        AC W1QJ09.1
#=GS M3JTS8_CANMX/1-414        AC M3JTS8.1
#=GS B0DMD5_LACBS/37-190       AC B0DMD5.1
#=GS E7Q7J8_YEASB/21-641       AC E7Q7J8.1
#=GS I1MF07_SOYBN/332-455      AC I1MF07.1
#=GS C4JSZ8_UNCRE/109-633      AC C4JSZ8.1
#=GS M1CEP4_SOLTU/386-520      AC M1CEP4.1
#=GS W4Z9X6_STRPU/11-188       AC W4Z9X6.1
#=GS Q2GNL7_CHAGB/17-606       AC Q2GNL7.1
#=GS N1JIZ1_BLUG1/17-588       AC N1JIZ1.1
#=GS G0VJB3_NAUCC/71-653       AC G0VJB3.1
#=GS U5HET6_USTV1/55-667       AC U5HET6.1
#=GS G4NHB6_MAGO7/17-612       AC G4NHB6.1
#=GS K3YRV6_SETIT/125-333      AC K3YRV6.1
#=GS NDC1_DROPS/12-573         AC Q298S5.1
#=GS H9JAG4_BOMMO/2-245        AC H9JAG4.2
#=GS G1SVY6_RABIT/160-808      AC G1SVY6.2
#=GS H2N2B9_ORYLA/7-655        AC H2N2B9.1
#=GS C6H852_AJECH/22-667       AC C6H852.1
#=GS B3M9I6_DROAN/356-572      AC B3M9I6.1
#=GS E3LPQ2_CAERE/77-581       AC E3LPQ2.1
#=GS I1MF07_SOYBN/107-336      AC I1MF07.1
#=GS F4P993_BATDJ/9-631        AC F4P993.1
#=GS A0A091DDQ2_FUKDA/19-638   AC A0A091DDQ2.1
#=GS G7X6L9_ASPKW/15-641       AC G7X6L9.1
#=GS C8V8S4_EMENI/14-642       AC C8V8S4.1
#=GS J5JXC1_BEAB2/17-608       AC J5JXC1.1
#=GS A0A0D9S783_CHLSB/19-667   AC A0A0D9S783.1
#=GS G0NH20_CAEBE/420-577      AC G0NH20.1
#=GS M5E8M0_MALS4/28-353       AC M5E8M0.1
#=GS K5XLL3_AGABU/45-683       AC K5XLL3.1
#=GS G8BST2_TETPH/14-557       AC G8BST2.1
#=GS H3EIE8_PRIPA/32-365       AC H3EIE8.1
#=GS D4AZI1_ARTBC/1-570        AC D4AZI1.1
#=GS Q6BJ46_DEBHA/24-634       AC Q6BJ46.2
#=GS G7IP46_MEDTR/111-333      AC G7IP46.2
#=GS G7LCI8_MEDTR/7-163        AC G7LCI8.2
#=GS H0UUK7_CAVPO/19-668       AC H0UUK7.1
#=GS G8BZ36_TETPH/17-597       AC G8BZ36.1
#=GS Q7Q9X0_ANOGA/13-572       AC Q7Q9X0.5
#=GS G3RMF4_GORGO/1-650        AC G3RMF4.1
#=GS A0A087HI08_ARAAL/353-481  AC A0A087HI08.1
#=GS F7HMI1_CALJA/19-538       AC F7HMI1.1
#=GS A7EF85_SCLS1/16-639       AC A7EF85.1
#=GS A9U0P8_PHYPA/15-348       AC A9U0P8.1
#=GS W5GN28_WHEAT/2-197        AC W5GN28.1
#=GS A6R7J1_AJECN/1-384        AC A6R7J1.1
#=GS NDC1_DANRE/13-664         AC Q7SZC5.1
#=GS G0NH22_CAEBE/189-578      AC G0NH22.1
#=GS B8LUI9_TALSN/14-641       AC B8LUI9.1
#=GS M7TSH1_BOTF1/16-639       AC M7TSH1.1
#=GS A0A060S470_PYCCI/42-662   AC A0A060S470.1
#=GS A4RUE4_OSTLU/184-549      AC A4RUE4.1
#=GS G3SRF8_LOXAF/19-667       AC G3SRF8.1
#=GS U3I2X7_ANAPL/9-662        AC U3I2X7.1
#=GS G1QTI7_NOMLE/121-717      AC G1QTI7.2
#=GS V8NZ86_OPHHA/29-213       AC V8NZ86.1
#=GS R0KTD4_SETT2/19-620       AC R0KTD4.1
#=GS F4W8X5_ACREC/11-565       AC F4W8X5.1
#=GS J3NT42_GAGT3/17-608       AC J3NT42.1
#=GS L8WIB5_THACA/3-282        AC L8WIB5.1
#=GS A0A088AG24_APIME/142-417  AC A0A088AG24.1
#=GS U1MF41_ASCSU/5-160        AC U1MF41.1
#=GS S8F5Z5_FOMPI/29-669       AC S8F5Z5.1
#=GS G1NFM6_MELGA/10-657       AC G1NFM6.1
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