GenomeNet

Database: Pfam
Entry: Neisseria_TspB
LinkDB: Neisseria_TspB
Original site: Neisseria_TspB 
#=GF ID   Neisseria_TspB
#=GF AC   PF05616.8
#=GF DE   Neisseria meningitidis TspB protein
#=GF AU   Moxon SJ
#=GF SE   Pfam-B_8925 (release 8.0)
#=GF GA   19.90 19.90;
#=GF TC   20.40 19.90;
#=GF NC   19.80 19.50;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 23193494 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF DR   INTERPRO; IPR008708;
#=GF CC   This family consists of several Neisseria meningitidis TspB
#=GF CC   virulence factor proteins.
#=GF SQ   184
#=GS F0AG50_NEIME/1-430    AC F0AG50.1
#=GS D0WD86_NEILA/321-609  AC D0WD86.1
#=GS A1KVE8_NEIMF/2-131    AC A1KVE8.1
#=GS F0B2E9_NEIME/22-512   AC F0B2E9.1
#=GS F0AZ43_NEIME/18-145   AC F0AZ43.1
#=GS G2J4U4_PSEUL/294-432  AC G2J4U4.1
#=GS E7BF67_NEIMW/26-508   AC E7BF67.1
#=GS A1IQJ2_NEIMA/22-504   AC A1IQJ2.1
#=GS O87783_NEIME/2-503    AC O87783.1
#=GS F0AS34_NEIME/1-87     AC F0AS34.1
#=GS Q4W7Z6_EIKCO/96-200   AC Q4W7Z6.1
#=GS F0A728_NEIME/1-129    AC F0A728.1
#=GS D1DRQ2_NEIGO/1-161    AC D1DRQ2.1
#=GS F0B7C3_NEIME/1-156    AC F0B7C3.1
#=GS D6L2P4_9NEIS/3-277    AC D6L2P4.1
#=GS F0AN85_NEIME/18-145   AC F0AN85.1
#=GS C1HZU2_NEIGO/1-140    AC C1HZU2.1
#=GS F0N6J1_NEIMN/1-129    AC F0N6J1.1
#=GS Q9JYD9_NEIMB/10-516   AC Q9JYD9.1
#=GS F0MCW5_NEIMG/1-430    AC F0MCW5.1
#=GS C0EPC7_NEIFL/1-63     AC C0EPC7.1
#=GS F0N9R5_NEIMN/25-501   AC F0N9R5.1
#=GS C6SAF0_NEIME/20-149   AC C6SAF0.1
#=GS F0F2A1_9NEIS/443-547  AC F0F2A1.1
#=GS F0MKY9_NEIMH/1-492    AC F0MKY9.1
#=GS A9BV75_DELAS/26-253   AC A9BV75.1
#=GS F0ATF8_NEIME/1-130    AC F0ATF8.1
#=GS B4RJA5_NEIG2/18-522   AC B4RJA5.1
#=GS E9ZT15_NEIME/1-129    AC E9ZT15.1
#=GS F0ADP2_NEIME/46-536   AC F0ADP2.1
#=GS F0AW42_NEIME/1-430    AC F0AW42.1
#=GS E0N6Z5_NEIME/1-64     AC E0N6Z5.1
#=GS A1IRJ0_NEIMA/18-145   AC A1IRJ0.1
#=GS F0MMS2_NEIMH/1-130    AC F0MMS2.1
#=GS C6MAH2_NEISI/61-135   AC C6MAH2.1
#=GS C0ERG0_NEIFL/245-375  AC C0ERG0.1
#=GS A9M243_NEIM0/2-131    AC A9M243.1
#=GS E3D6I9_NEIM7/51-541   AC E3D6I9.1
#=GS F9F0G8_9NEIS/4-214    AC F9F0G8.1
#=GS D1DEV7_NEIGO/1-98     AC D1DEV7.1
#=GS G3Z1S8_9NEIS/397-609  AC G3Z1S8.1
#=GS D6H5P8_NEIGO/1-308    AC D6H5P8.1
#=GS F0A1Q3_NEIME/50-530   AC F0A1Q3.1
#=GS F0AL43_NEIME/1-130    AC F0AL43.1
#=GS D1DDL7_NEIGO/1-37     AC D1DDL7.1
#=GS F0A608_NEIME/18-145   AC F0A608.1
#=GS C0EM97_NEIFL/1-336    AC C0EM97.1
#=GS C0DVS5_EIKCO/11-140   AC C0DVS5.1
#=GS F0MET2_NEIMG/1-130    AC F0MET2.1
#=GS E1P4X2_NEILA/1-488    AC E1P4X2.1
#=GS F0A993_NEIME/44-385   AC F0A993.1
#=GS D6L2Z3_9NEIS/417-503  AC D6L2Z3.1
#=GS D6JK14_NEIGO/1-97     AC D6JK14.1
#=GS D1E3Q7_NEIGO/28-259   AC D1E3Q7.1
#=GS Q9JYK0_NEIMB/50-547   AC Q9JYK0.1
#=GS D6JK15_NEIGO/1-407    AC D6JK15.1
#=GS F0MWR9_NEIMP/18-145   AC F0MWR9.1
#=GS A1ITJ3_NEIMA/1-130    AC A1ITJ3.1
#=GS E0ND49_NEIME/1-130    AC E0ND49.1
#=GS F0MSB6_NEIMM/1-129    AC F0MSB6.1
#=GS D1DGH7_NEIGO/50-236   AC D1DGH7.1
#=GS E9ZUU6_NEIME/1-129    AC E9ZUU6.1
#=GS F0AE92_NEIME/4-503    AC F0AE92.1
#=GS E0N6U4_NEIME/1-47     AC E0N6U4.1
#=GS D6L361_9NEIS/197-395  AC D6L361.1
#=GS B4RNK3_NEIG2/1-309    AC B4RNK3.1
#=GS E1P4K2_NEILA/346-476  AC E1P4K2.1
#=GS F0AXF2_NEIME/1-130    AC F0AXF2.1
#=GS E0ND67_NEIME/1-244    AC E0ND67.1
#=GS F0AUT6_NEIME/50-530   AC F0AUT6.1
#=GS F0AB74_NEIME/22-525   AC F0AB74.1
#=GS F0A738_NEIME/1-249    AC F0A738.1
#=GS E4ZDS5_NEIL0/1-421    AC E4ZDS5.1
#=GS F0A2Y1_NEIME/1-430    AC F0A2Y1.1
#=GS F0ALK6_NEIME/1-190    AC F0ALK6.1
#=GS D1EGD9_NEIGO/28-223   AC D1EGD9.1
#=GS D1EHE9_NEIGO/1-312    AC D1EHE9.1
#=GS A1KR75_NEIMF/22-518   AC A1KR75.1
#=GS B0VQE2_ACIBS/1-43     AC B0VQE2.1
#=GS F0A3C4_NEIME/23-520   AC F0A3C4.1
#=GS F0AJX3_NEIME/4-500    AC F0AJX3.1
#=GS F0N4X1_NEIMO/1-129    AC F0N4X1.1
#=GS E1P4W1_NEILA/492-579  AC E1P4W1.1
#=GS D1DQE0_NEIGO/1-308    AC D1DQE0.1
#=GS Q5F7K4_NEIG1/20-526   AC Q5F7K4.1
#=GS E9ZYP6_NEIME/1-129    AC E9ZYP6.1
#=GS C4GI39_9NEIS/246-420  AC C4GI39.1
#=GS F0MP71_NEIMM/1-130    AC F0MP71.1
#=GS A1W3Z0_ACISJ/264-433  AC A1W3Z0.1
#=GS C6M5W6_NEISI/392-604  AC C6M5W6.1
#=GS G4CLJ7_9NEIS/348-481  AC G4CLJ7.1
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#=GS F0MQQ7_NEIMM/1-430    AC F0MQQ7.1
#=GS D1D6L7_NEIGO/18-249   AC D1D6L7.1
#=GS C6SM63_NEIME/20-149   AC C6SM63.1
#=GS C6SCY8_NEIME/20-149   AC C6SCY8.1
#=GS E9ZUU0_NEIME/1-130    AC E9ZUU0.1
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#=GS E0N6U5_NEIME/49-246   AC E0N6U5.1
#=GS D6JK43_NEIGO/1-197    AC D6JK43.1
#=GS B1SX83_9BURK/349-535  AC B1SX83.1
#=GS A1IT08_NEIMA/51-538   AC A1IT08.1
#=GS C0ERG0_NEIFL/209-267  AC C0ERG0.1
#=GS F0AIM4_NEIME/50-530   AC F0AIM4.1
#=GS F0B0D5_NEIME/4-503    AC F0B0D5.1
#=GS D1E9X3_NEIGO/28-258   AC D1E9X3.1
#=GS F9F0G7_9NEIS/2-281    AC F9F0G7.1
#=GS G4CLJ7_9NEIS/192-383  AC G4CLJ7.1
#=GS C6S6P6_NEIML/20-149   AC C6S6P6.1
#=GS C6SJ81_NEIME/20-149   AC C6SJ81.1
#=GS F0MHF6_NEIMG/18-145   AC F0MHF6.1
#=GS D1DDE2_NEIGO/1-264    AC D1DDE2.1
#=GS F0A2H0_NEIME/1-430    AC F0A2H0.1
#=GS E6MVZ4_NEIMH/10-514   AC E6MVZ4.1
#=GS H8DX05_9NEIS/226-468  AC H8DX05.1
#=GS D0WDU2_NEILA/8-220    AC D0WDU2.1
#=GS A1KRW7_NEIMF/46-542   AC A1KRW7.1
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#=GS Q7DDP6_NEIMB/1-130    AC Q7DDP6.1
#=GS B1T3R5_9BURK/317-572  AC B1T3R5.1
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#=GS F4DVQ2_PSEMN/370-455  AC F4DVQ2.1
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#=GS F9RSE5_9VIBR/407-490  AC F9RSE5.1
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#=GS A4XU59_PSEMY/352-437  AC A4XU59.1
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#=GS F0A3U3_NEIME/4-231    AC F0A3U3.1
#=GS C2M2C6_CAPGI/239-400  AC C2M2C6.1
#=GS E3D466_NEIM7/23-523   AC E3D466.1
#=GS D6L020_9NEIS/3-89     AC D6L020.1
#=GS F0AS35_NEIME/45-415   AC F0AS35.1
#=GS D1D6L4_NEIGO/1-104    AC D1D6L4.1
#=GS E8SLD9_NEIGO/1-506    AC E8SLD9.1
#=GS F0MKI6_NEIMH/4-509    AC F0MKI6.1
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#=GS C4GK36_9NEIS/174-376  AC C4GK36.1
#=GS D1E9X2_NEIGO/1-273    AC D1E9X2.1
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#=GS Q63PM4_BURPS/383-577  AC Q63PM4.1
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#=GS F0N268_NEIMO/1-130    AC F0N268.1
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#=GS F0ABN8_NEIME/1-130    AC F0ABN8.1
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#=GS F0B4P9_NEIME/1-430    AC F0B4P9.1
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#=GS G4ZAP6_PHYSP/71-251   AC G4ZAP6.1
#=GS Q5F7B3_NEIG1/1-507    AC Q5F7B3.1
#=GS E9ZZC1_NEIME/4-503    AC E9ZZC1.1
#=GS F0B2Y7_NEIME/1-129    AC F0B2Y7.1
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#=GS D1DJK1_NEIGO/1-176    AC D1DJK1.1
#=GS A1KVX5_NEIMF/21-500   AC A1KVX5.1
#=GS F0MJL7_NEIMH/25-501   AC F0MJL7.1
#=GS F0ARW0_NEIME/4-509    AC F0ARW0.1
#=GS D1E3Q6_NEIGO/1-272    AC D1E3Q6.1
F0AG50_NEIME/1-430               ...........................................................-----...--------------.------------------...........------------------..---------------MAGVGKLARLGAKF..STRAVPYVGTALLAHDVYETFKEDIQAQGYQYDPETDKFVKGYEYSNCL..WYE.....DERRINRTYGCYGVDSSIMRLMS..D..DSR.FP.EVKELMESQMYRLARPFWNWHKEe..lNKLSSLDWN..NFVLNRCTFDWNG..GDCVVNKG.DDYRN....GANFSLSRNPKYKE.EMDAKKLEEILSLKVDANPDKYIKAT.....GYPG..YSE.KVEVAPGTKVNM.G.PVTD.RNGN.PVQVVATFGR..D.SQ...GNTTVDVQVIPRPDLTPGSAEA..PNAQP..LPEVS..P..AENPANNP..AP..N..ENPGTR.P..NPEP.DPD..L.NPD....ANP....DTD..GQPGT..SP..DS.PA......VP..D.....R..PNG..R--...--...--DG.K.D.GGL......LCKFFPDILACDRLPEP--NPAE.......D..L..N..LP.SE.TVN.VEFKKSGIFQDSAQCPAPVT..FTI..TvldsSKQFAFSFENACTIAERLRYMLLALAWAVAAFFCIRTVSRE.....................................................................................................
D0WD86_NEILA/321-609             ..........................................................v-----...--------------.------------------...........------------------..-----------------------------..-------------------------------------------------..---.....-----------------------..-..---.--.-----------------------....---------..-------------..-----GEDiNDARS....FISFSLRRNTKYKE.EMDAKKLEEILALKVDANPDKYIQAT.....GYPG..YSE.KVEVAPGTKVNM.G.PVTD.RNGN.PVQVVATFGR..D.AQ...GNNTVDVQVVPRPDLTPGSAEA..PNVRP..LPEVS..P..AENPANNP..NP..N..EHPGTR.P..NPEP.DPD..L.NPD....ANP....DTD..VQPGT..SP..DS.PA......VP..G.....R..TNG..RDG...KE...RKEG.E.D.GGF......LCKYFPKILACQEMGKPSDGMFD.......D..I..R..IP.QV.TDD.KTWSSDNFLPSNGVCPQPKT..FHV..F....GRQYQASYEPLCVFAEKIRFAVLLAFIIMSAFVVFGSLRG-k....................................................................................................
A1KVE8_NEIMF/2-131               ...........................................................MMYSFeanANAVKISETVSVDT.GQGAKIHKFVPKNSKTYS...........SDLIKTVDLTHIPTGAKA..RINAKITASISRAGVLAGGGKLARLGAKF..STRAVPYVGTALLAHDVYETFKEDIQARGYQYDTETDKFVK--------..---.....-----------------------..-..---.--.-----------------------....---------..-------------..--------.-----....--------------.--------------------------.....----..---.------------.-.----.----.----------..-.--...----------------------..-----..-----..-..--------..--..-..------.-..----.---..-.---....---....---..-----..--..--.--......--..-.....-..---..---...--...----.-.-.---......-----------------------.......-..-..-..--.--.---.--------------------..---..-....-----------------------------------------vs...................................................................................................
F0B2E9_NEIME/22-512              .....................................lgirgsddkrrriwkgvfdres-----...--------------.-------------GRYLT...........SE-AQDLKVRHVSTGASStgKVSSVVSSSVSRAGVLAGVGKLVRLGAKF..STRAVPYVGTALLAHDVYETFKEDIQARGYQYDPETDKFVKGYEYSNCL..WYE.....DERSINRTYGCYGVDSSIMRLMS..D..DSR.FP.EVKELMESQMYRLARPFWNWHKEe..lNKLSSLDWN..NFVLNSCTFSWNG..GDCVVNKG.DDYRN....GANFSLIRNPKYKE.EMDAKKLEEILSLKVDANPDKYIKAT.....GYPG..YSE.KVEVAPGTKVNM.G.PVTD.RNGN.PVQVVATFGR..D.SQ...GNTTVDVQVIPRPDLTPGSAEA..PNAQP..LPEVS..P..AENPANNP..AP..N..ENPGTR.P..NPEP.DPD..L.NPD....ANP....DTD..GQPGT..SP..DS.PA......VP..D.....R..PNG..R--...--...--DG.K.D.GGL......LCKFFPDILACDRLPEP--NPAE.......D..L..N..LP.SE.TVN.VEFKKSGIFQDSAQCPAPVT..FTI..TvldsSKQFAFSFENACTIAERLRYMLLALAWAVAAFFCIRTVSRE.....................................................................................................
F0AZ43_NEIME/18-145              ........................................................ssn---SY...SEPVRLERSQIKFQsSNNLKSSGFKLDSSSKSF...........AKFIEAANFEHIPTGAKA..RINAKITASVSRAGVLAGVGKLARLGAKF..STRAVPYVGTALLAHDVYETFKEDIQARGYQYDPETDKFAK--------..---.....-----------------------..-..---.--.-----------------------....---------..-------------..--------.-----....--------------.--------------------------.....----..---.------------.-.----.----.----------..-.--...----------------------..-----..-----..-..--------..--..-..------.-..----.---..-.---....---....---..-----..--..--.--......--..-.....-..---..---...--...----.-.-.---......-----------------------.......-..-..-..--.--.---.--------------------..---..-....-----------------------------------------vs...................................................................................................
G2J4U4_PSEUL/294-432             ...................tddpipvsqqtqetkttnvynidntvktttetniknsnvt-----...--------------.------------------...........------------------..-----------------------------..-------------------------------------------------..---.....-----------------------..-..---.--.-----------------------....---------..-------------..--------.-----....--------------.--------------------------.....----..---.------------.-.----.----.----------..-.--...----------------------..-----..-----..-..--------..--..-..------.-..----.---..-.---....---....---..-----..--..--.--......--..-.....-..---..---...--...--PA.K.D.PKT......DCDKLPNSVGCADLGTP--PDAP.......D..I..V..QQ.NV.SPS.FSWSPF---SLPTTCPQPQT..LSL..S....RGTYTMSWQPECDFATKYSPLVIAFASLGALFIMFG-----mknd.................................................................................................
E7BF67_NEIMW/26-508              ...........................................................YAERF...KYPIGNSDVRLDID.HTKSVVTDFRVDGQRFS-...........GRIIEPSIIEHVPTGARSleKIPVKVTASVSRAGVLAGVGALVRQGAKL..GKRAVPYVGTALLAYDIYETFKDEIKEQGYQYDPETDKFVKGYEYSNCI..WEH.....AENGI-KTYGCYGVDSSIMRLMS..D..YSR.FP.EVKELMEHQMEIVGRNYWEMVRK....NRNDS--FR..NYNFSRCYFNWNG..GNCNIGEDiNDARS....FINFSLIRNPKYKE.EMDAKKLEEILALKVDANPDKYIQAT.....GYPG..YSE.KVEVAPGTKVNM.G.PVTD.RNGN.PVQVVATFGR..D.SQ...GNTTVDVQVIPRPDLTPGSAEA..PETKP..KPAPT..P..ETNPKEKE..NP..R..EEDQDN.P..KPTP.TPG..E.TPS....PN-....---..-----..--..ES.PK......--..D.....R..---..--R...EE...KKPD.G.N.GGL......LCDLFPKILACAEMGEPSENDFE.......G..I..A..IP.KA.VNE.ETWSPDNMFPSSGVCPKDKT..FHV..F....GKAFSVSYQPLCTLMENVRFAVIIGFIIMSAFITFGSLRKE.....................................................................................................
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