GenomeNet

Database: Pfam
Entry: Nicastrin
LinkDB: Nicastrin
Original site: Nicastrin 
#=GF ID   Nicastrin
#=GF AC   PF05450.13
#=GF DE   Nicastrin
#=GF AU   Moxon SJ
#=GF SE   Pfam-B_15452 (release 8.0)
#=GF GA   20.20 20.20;
#=GF TC   20.20 20.20;
#=GF NC   20.10 20.10;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 17690987 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   12584255
#=GF RT   gamma-Secretase activity requires the presenilin-dependent
#=GF RT   trafficking of nicastrin through the Golgi apparatus but not its
#=GF RT   complex glycosylation. 
#=GF RA   Herreman A, Van Gassen G, Bentahir M, Nyabi O, Craessaerts K,
#=GF RA   Mueller U, Annaert W, De Strooper B; 
#=GF RL   J Cell Sci 2003;116:1127-1136.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   12507492
#=GF RT   Nicastrin is a resident lysosomal membrane protein. 
#=GF RA   Bagshaw RD, Pasternak SH, Mahuran DJ, Callahan JW; 
#=GF RL   Biochem Biophys Res Commun 2003;300:615-618.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   10993067
#=GF RT   Nicastrin modulates presenilin-mediated notch/glp-1 signal
#=GF RT   transduction and betaAPP processing. 
#=GF RA   Yu G, Nishimura M, Arawaka S, Levitan D, Zhang L, Tandon A, Song
#=GF RA   YQ, Rogaeva E, Chen F, Kawarai T, Supala A, Levesque L, Yu H,
#=GF RA   Yang DS, Holmes E, Milman P, Liang Y, Zhang DM, Xu DH, Sato C,
#=GF RA   Rogaev E, Smith M, Janus C, Zhang Y, Aebersold R, Farrer LS,
#=GF RA   Sorb
#=GF RL   Nature 2000;407:48-54.
#=GF RN   [4]
#=GF RM   11295540
#=GF RT   Nicastrin, a presenilin-interacting protein, contains an
#=GF RT   aminopeptidase/transferrin receptor superfamily domain. 
#=GF RA   Fagan R, Swindells M, Overington J, Weir M; 
#=GF RL   Trends Biochem Sci 2001;26:213-214.
#=GF DR   INTERPRO; IPR008710;
#=GF CC   Nicastrin and presenilin are two major components of the
#=GF CC   gamma-secretase complex, which executes the intramembrane
#=GF CC   proteolysis of type I integral membrane proteins such as the
#=GF CC   amyloid precursor protein (APP) and Notch.  Nicastrin is
#=GF CC   synthesised in fibroblasts and neurons as an
#=GF CC   endoglycosidase-H-sensitive glycosylated precursor protein
#=GF CC   (immature nicastrin) and is then modified by complex
#=GF CC   glycosylation in the Golgi apparatus and by sialylation in the
#=GF CC   trans-Golgi network (mature nicastrin) [1]. A region featured in
#=GF CC   this family has a fold similar to human transferrin receptor
#=GF CC   (TfR, Swiss:P02786) and a bacterial aminopeptidase
#=GF CC   (Swiss:P80561). It is implicated in the pathogenesis of
#=GF CC   Alzheimer's disease [4].
#=GF SQ   387
#=GS F6UBR8_ORNAN/1-163          AC F6UBR8.1
#=GS NICA_DICDI/229-470          AC Q54JT7.2
#=GS A0A087Y2U1_POEFO/263-487    AC A0A087Y2U1.1
#=GS G0NXW2_CAEBE/112-290        AC G0NXW2.1
#=GS H3DUY5_PRIPA/384-618        AC H3DUY5.1
#=GS G7J8R2_MEDTR/242-467        AC G7J8R2.2
#=GS M4F1R1_BRARP/222-375        AC M4F1R1.1
#=GS A0A0Q9WP97_DROVI/273-509    AC A0A0Q9WP97.1
#=GS A0A078J723_BRANA/221-374    AC A0A078J723.1
#=GS S8CCF9_9LAMI/223-388        AC S8CCF9.1
#=GS J3MPJ4_ORYBR/216-398        AC J3MPJ4.1
#=GS A0A067JSP2_JATCU/247-456    AC A0A067JSP2.1
#=GS G3H7X9_CRIGR/180-405        AC G3H7X9.1
#=GS C1FGC9_MICSR/281-499        AC C1FGC9.1
#=GS I1C2J8_RHIO9/1008-1206      AC I1C2J8.1
#=GS A0A088AD09_APIME/247-454    AC A0A088AD09.1
#=GS A0A0D2TUA9_GOSRA/246-479    AC A0A0D2TUA9.1
#=GS B4K4I5_DROMO/267-503        AC B4K4I5.2
#=GS I1I093_BRADI/214-419        AC I1I093.1
#=GS H2TJZ9_TAKRU/269-493        AC H2TJZ9.1
#=GS G3Q0Q5_GASAC/245-470        AC G3Q0Q5.1
#=GS B9SCX6_RICCO/218-377        AC B9SCX6.1
#=GS B9HQ38_POPTR/231-384        AC B9HQ38.2
#=GS M0TWW5_MUSAM/221-388        AC M0TWW5.1
#=GS A0A0D9VKR6_9ORYZ/242-451    AC A0A0D9VKR6.1
#=GS F6YW17_HORSE/286-511        AC F6YW17.1
#=GS M8ASR6_TRIUA/306-492        AC M8ASR6.1
#=GS F7HT10_CALJA/274-499        AC F7HT10.1
#=GS E1ZAK5_CHLVA/266-494        AC E1ZAK5.1
#=GS A0A091D5L2_FUKDA/274-499    AC A0A091D5L2.1
#=GS H2ZQB4_CIOSA/56-194         AC H2ZQB4.1
#=GS M5WHE4_PRUPE/224-382        AC M5WHE4.1
#=GS H2N544_PONAB/274-497        AC H2N544.2
#=GS A0A0A1TV88_ENTIV/196-271    AC A0A0A1TV88.1
#=GS I1FCL5_AMPQE/752-955        AC I1FCL5.1
#=GS A0A0N5D831_THECL/252-479    AC A0A0N5D831.1
#=GS F7EHX8_MACMU/274-499        AC F7EHX8.1
#=GS G0NXV9_CAEBE/1-97           AC G0NXV9.1
#=GS A0A078IDM9_BRANA/222-375    AC A0A078IDM9.1
#=GS A0A090M8Y9_OSTTA/271-428    AC A0A090M8Y9.1
#=GS A0A077RD29_ECHMU/19-228     AC A0A077RD29.1
#=GS W5H004_WHEAT/247-456        AC W5H004.1
#=GS D8S2C0_SELML/209-422        AC D8S2C0.1
#=GS F4J820_ARATH/251-489        AC F4J820.1
#=GS A0A061GU46_THECC/221-378    AC A0A061GU46.1
#=GS A0A0J9XQZ0_BRUMA/215-394    AC A0A0J9XQZ0.1
#=GS A0A022PYG9_ERYGU/225-388    AC A0A022PYG9.1
#=GS G0NXW2_CAEBE/27-94          AC G0NXW2.1
#=GS M1B119_SOLTU/89-309         AC M1B119.1
#=GS A0A0N4WUZ6_HAEPC/350-475    AC A0A0N4WUZ6.1
#=GS E4XKY1_OIKDI/372-504        AC E4XKY1.1
#=GS A2E0Z0_TRIVA/204-436        AC A2E0Z0.1
#=GS A0A061J0S5_TRYRA/332-490    AC A0A061J0S5.1
#=GS F6WKW4_MACMU/1-47           AC F6WKW4.1
#=GS C0HE58_MAIZE/209-379        AC C0HE58.1
#=GS A0A058Z441_9EUKA/630-702    AC A0A058Z441.1
#=GS W5I0Z3_WHEAT/79-284         AC W5I0Z3.1
#=GS A0A0D2QBU2_GOSRA/221-382    AC A0A0D2QBU2.1
#=GS E9HAJ0_DAPPU/268-485        AC E9HAJ0.1
#=GS I1LRI7_SOYBN/221-384        AC I1LRI7.2
#=GS W4FD47_9STRA/254-503        AC W4FD47.1
#=GS A0A059AAW3_EUCGR/218-391    AC A0A059AAW3.1
#=GS A0A0G4IRC0_PLABS/226-423    AC A0A0G4IRC0.1
#=GS A0A077YVT0_TRITR/262-470    AC A0A077YVT0.1
#=GS A0A0J7KHQ8_LASNI/1-138      AC A0A0J7KHQ8.1
#=GS A0A0D2UWB7_GOSRA/246-474    AC A0A0D2UWB7.1
#=GS S8EAN5_9LAMI/242-451        AC S8EAN5.1
#=GS T1FSB4_HELRO/255-362        AC T1FSB4.1
#=GS A0A067EJE5_CITSI/42-109     AC A0A067EJE5.1
#=GS A0A061GZP2_THECC/221-378    AC A0A061GZP2.1
#=GS H0VS58_CAVPO/286-511        AC H0VS58.1
#=GS T1FSB4_HELRO/427-556        AC T1FSB4.1
#=GS A0A0N8JYP4_9TELE/244-468    AC A0A0N8JYP4.1
#=GS A0A0E0APT4_9ORYZ/214-396    AC A0A0E0APT4.1
#=GS G1T7J5_RABIT/273-498        AC G1T7J5.1
#=GS D8RVM0_SELML/209-371        AC D8RVM0.1
#=GS F1RJY0_PIG/274-499          AC F1RJY0.2
#=GS V4AJE4_LOTGI/240-476        AC V4AJE4.1
#=GS W5M1B7_LEPOC/118-182        AC W5M1B7.1
#=GS B7FSJ4_PHATC/257-518        AC B7FSJ4.1
#=GS A9S8V6_PHYPA/235-438        AC A9S8V6.1
#=GS K4D5V3_SOLLC/247-468        AC K4D5V3.1
#=GS V9FWN4_PHYPR/241-488        AC V9FWN4.1
#=GS A5JYX8_CAEEL/208-410        AC A5JYX8.1
#=GS A0A068YE75_ECHMU/212-356    AC A0A068YE75.1
#=GS W5PGA9_SHEEP/285-510        AC W5PGA9.1
#=GS K3XAK7_PYTUL/251-504        AC K3XAK7.1
#=GS E5RYN6_TRISP/122-189        AC E5RYN6.1
#=GS F0ZBA6_DICPU/231-448        AC F0ZBA6.1
#=GS F0ZBA6_DICPU/231-448        DR PDB; 4R12 A; 231-448;
#=GS F4Q4W1_DICFS/232-463        AC F4Q4W1.1
#=GS W1NW73_AMBTC/218-383        AC W1NW73.1
#=GS A0A072UVE5_MEDTR/223-384    AC A0A072UVE5.1
#=GS V4UDN5_9ROSI/220-380        AC V4UDN5.1
#=GS A0A024TNB7_9STRA/251-497    AC A0A024TNB7.1
#=GS A0A0A1NHQ2_9FUNG/242-489    AC A0A0A1NHQ2.1
#=GS A0A0E0K513_ORYPU/248-457    AC A0A0E0K513.1
#=GS K7UJ87_MAIZE/249-458        AC K7UJ87.1
#=GS H9KZL2_CHICK/283-507        AC H9KZL2.1
#=GS U3JY82_FICAL/218-442        AC U3JY82.1
#=GS A0A0N4YB32_NIPBR/273-501    AC A0A0N4YB32.1
#=GS K4ATD4_SOLLC/224-385        AC K4ATD4.1
#=GS A0A0A1N2J1_9FUNG/242-489    AC A0A0A1N2J1.1
#=GS T1L1W7_TETUR/271-503        AC T1L1W7.1
#=GS A0A0D2RU36_GOSRA/221-379    AC A0A0D2RU36.1
#=GS Q6Z743_ORYSJ/248-457        AC Q6Z743.1
#=GS F1MT12_BOVIN/274-499        AC F1MT12.1
#=GS A0A0B2VNL1_TOXCA/294-522    AC A0A0B2VNL1.1
#=GS F1PU73_CANLF/269-494        AC F1PU73.2
#=GS H2XT29_CIOIN/127-352        AC H2XT29.1
#=GS C4LVX3_ENTHI/201-284        AC C4LVX3.1
#=GS R0HK41_9BRAS/224-370        AC R0HK41.1
#=GS A0A059BTV0_EUCGR/244-453    AC A0A059BTV0.1
#=GS A2F570_TRIVA/212-459        AC A2F570.1
#=GS A0A084VZE3_ANOSI/1072-1306  AC A0A084VZE3.1
#=GS I3KD97_ORENI/278-502        AC I3KD97.1
#=GS A0A061FP76_THECC/244-475    AC A0A061FP76.1
#=GS W5GB63_WHEAT/247-456        AC W5GB63.1
#=GS NICA_RAT/273-498            AC Q8CGU6.1
#=GS B4QTU0_DROSI/264-497        AC B4QTU0.1
#=GS F7IS69_CALJA/190-361        AC F7IS69.1
#=GS Q9M292_ARATH/224-377        AC Q9M292.1
#=GS B8AI33_ORYSI/248-457        AC B8AI33.1
#=GS A0A059BUU5_EUCGR/244-454    AC A0A059BUU5.1
#=GS F6WKT8_MACMU/190-255        AC F6WKT8.1
#=GS H2TJZ8_TAKRU/264-488        AC H2TJZ8.1
#=GS J3LGV5_ORYBR/248-457        AC J3LGV5.1
#=GS Q7KS07_DROME/266-499        AC Q7KS07.2
#=GS H9GN16_ANOCA/273-334        AC H9GN16.2
#=GS D3BHE5_POLPA/254-484        AC D3BHE5.1
#=GS U1NF22_ASCSU/278-500        AC U1NF22.1
#=GS D2A5N1_TRICA/227-444        AC D2A5N1.1
#=GS A0A0D3BYG4_BRAOL/171-380    AC A0A0D3BYG4.1
#=GS A0A0K0JS64_BRUMA/255-469    AC A0A0K0JS64.1
#=GS M4DSG4_BRARP/221-366        AC M4DSG4.1
#=GS G1NVE1_MYOLU/280-505        AC G1NVE1.1
#=GS A0A0D3BGY1_BRAOL/224-369    AC A0A0D3BGY1.1
#=GS M7B2R0_CHEMY/232-456        AC M7B2R0.1
#=GS W5GKM2_WHEAT/247-456        AC W5GKM2.1
#=GS K3YGY3_SETIT/214-419        AC K3YGY3.1
#=GS A0A0N4UT91_ENTVE/221-465    AC A0A0N4UT91.1
#=GS D8RHJ7_SELML/219-424        AC D8RHJ7.1
#=GS R0L2Q7_ANAPL/245-469        AC R0L2Q7.1
#=GS I1IFH7_BRADI/255-443        AC I1IFH7.1
#=GS A0A0K9PDI7_ZOSMR/215-381    AC A0A0K9PDI7.1
#=GS A0A0J7KQK1_LASNI/246-297    AC A0A0J7KQK1.1
#=GS A0A085M1J9_9BILA/262-485    AC A0A085M1J9.1
#=GS B9H3E1_POPTR/248-469        AC B9H3E1.2
#=GS F6UC14_ORNAN/1-164          AC F6UC14.1
#=GS B3LV10_DROAN/261-497        AC B3LV10.1
#=GS D0NP58_PHYIT/241-490        AC D0NP58.1
#=GS W9S647_9ROSA/219-380        AC W9S647.1
#=GS A0A0M3JSC4_ANISI/248-470    AC A0A0M3JSC4.1
#=GS G0NXV9_CAEBE/94-196         AC G0NXV9.1
#=GS X1WJF3_ACYPI/257-479        AC X1WJF3.1
#=GS A0A015M1P5_9GLOM/301-422    AC A0A015M1P5.1
#=GS A0A044TY20_ONCVO/301-522    AC A0A044TY20.1
#=GS A0A0D2TLU1_GOSRA/221-382    AC A0A0D2TLU1.1
#=GS M0UEQ6_HORVD/247-456        AC M0UEQ6.1
#=GS G1RTC9_NOMLE/274-499        AC G1RTC9.1
#=GS Q7PY38_ANOGA/276-510        AC Q7PY38.4
#=GS H9JDY0_BOMMO/109-363        AC H9JDY0.1
#=GS M4EX82_BRARP/256-465        AC M4EX82.1
#=GS V4L4H3_EUTSA/208-417        AC V4L4H3.1
#=GS U6NUA1_HAECO/333-561        AC U6NUA1.1
#=GS K3YQM1_SETIT/249-467        AC K3YQM1.1
#=GS A0A022S0B8_ERYGU/248-457    AC A0A022S0B8.1
#=GS F6QUJ6_CALJA/16-241         AC F6QUJ6.1
#=GS L8H287_ACACA/249-477        AC L8H287.1
#=GS K7ISR9_NASVI/246-447        AC K7ISR9.1
#=GS W5JFV8_ANODA/284-519        AC W5JFV8.1
#=GS A0A087GVH5_ARAAL/226-379    AC A0A087GVH5.1
#=GS V7D2B4_PHAVU/245-454        AC V7D2B4.1
#=GS A0A087SQ59_AUXPR/207-382    AC A0A087SQ59.1
#=GS A0A078GF29_BRANA/281-490    AC A0A078GF29.1
#=GS D7TCR2_VITVI/222-377        AC D7TCR2.1
#=GS A0A0J9XW51_BRUMA/137-351    AC A0A0J9XW51.1
#=GS H2LCL9_ORYLA/264-486        AC H2LCL9.1
#=GS Q5T205_HUMAN/32-219         AC Q5T205.1
#=GS NICA_ARATH/251-460          AC Q8GUM5.1
#=GS X6NKB7_RETFI/59-326         AC X6NKB7.1
#=GS A0A093BBY5_CHAPE/258-482    AC A0A093BBY5.1
#=GS A0A0G2KW52_DANRE/319-484    AC A0A0G2KW52.1
#=GS M3ZTN5_XIPMA/263-487        AC M3ZTN5.1
#=GS H0Y6T7_HUMAN/1-48           AC H0Y6T7.1
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#=GS A0A0J8BUW4_BETVU/210-354    AC A0A0J8BUW4.1
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