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Database: Pfam
Entry: Nicastrin
LinkDB: Nicastrin
Original site: Nicastrin 
#=GF ID   Nicastrin
#=GF AC   PF05450.12
#=GF DE   Nicastrin
#=GF AU   Moxon SJ
#=GF SE   Pfam-B_15452 (release 8.0)
#=GF GA   20.20 20.20;
#=GF TC   20.20 20.20;
#=GF NC   20.10 20.10;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 11927849 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   12584255
#=GF RT   gamma-Secretase activity requires the presenilin-dependent
#=GF RT   trafficking of nicastrin through the Golgi apparatus but not its
#=GF RT   complex glycosylation. 
#=GF RA   Herreman A, Van Gassen G, Bentahir M, Nyabi O, Craessaerts K,
#=GF RA   Mueller U, Annaert W, De Strooper B; 
#=GF RL   J Cell Sci 2003;116:1127-1136.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   12507492
#=GF RT   Nicastrin is a resident lysosomal membrane protein. 
#=GF RA   Bagshaw RD, Pasternak SH, Mahuran DJ, Callahan JW; 
#=GF RL   Biochem Biophys Res Commun 2003;300:615-618.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   10993067
#=GF RT   Nicastrin modulates presenilin-mediated notch/glp-1 signal
#=GF RT   transduction and betaAPP processing. 
#=GF RA   Yu G, Nishimura M, Arawaka S, Levitan D, Zhang L, Tandon A, Song
#=GF RA   YQ, Rogaeva E, Chen F, Kawarai T, Supala A, Levesque L, Yu H,
#=GF RA   Yang DS, Holmes E, Milman P, Liang Y, Zhang DM, Xu DH, Sato C,
#=GF RA   Rogaev E, Smith M, Janus C, Zhang Y, Aebersold R, Farrer LS,
#=GF RA   Sorb
#=GF RL   Nature 2000;407:48-54.
#=GF RN   [4]
#=GF RM   11295540
#=GF RT   Nicastrin, a presenilin-interacting protein, contains an
#=GF RT   aminopeptidase/transferrin receptor superfamily domain. 
#=GF RA   Fagan R, Swindells M, Overington J, Weir M; 
#=GF RL   Trends Biochem Sci 2001;26:213-214.
#=GF DR   INTERPRO; IPR008710;
#=GF CC   Nicastrin and presenilin are two major components of the
#=GF CC   gamma-secretase complex, which executes the intramembrane
#=GF CC   proteolysis of type I integral membrane proteins such as the
#=GF CC   amyloid precursor protein (APP) and Notch.  Nicastrin is
#=GF CC   synthesised in fibroblasts and neurons as an
#=GF CC   endoglycosidase-H-sensitive glycosylated precursor protein
#=GF CC   (immature nicastrin) and is then modified by complex
#=GF CC   glycosylation in the Golgi apparatus and by sialylation in the
#=GF CC   trans-Golgi network (mature nicastrin) [1]. A region featured in
#=GF CC   this family has a fold similar to human transferrin receptor
#=GF CC   (TfR, Swiss:P02786) and a bacterial aminopeptidase
#=GF CC   (Swiss:P80561). It is implicated in the pathogenesis of
#=GF CC   Alzheimer's disease [4].
#=GF SQ   280
#=GS F6UBR8_ORNAN/1-163        AC F6UBR8.1
#=GS M0UEQ5_HORVD/1-123        AC M0UEQ5.1
#=GS NICA_DICDI/229-470        AC Q54JT7.2
#=GS K7UMV8_MAIZE/211-385      AC K7UMV8.1
#=GS A0A087Y2U1_POEFO/263-487  AC A0A087Y2U1.1
#=GS M3YRN9_MUSPF/294-519      AC M3YRN9.1
#=GS G0NXW2_CAEBE/112-290      AC G0NXW2.1
#=GS H3DUY5_PRIPA/384-618      AC H3DUY5.1
#=GS B0W373_CULQU/272-508      AC B0W373.1
#=GS G7J8R2_MEDTR/242-467      AC G7J8R2.2
#=GS M4F1R1_BRARP/222-375      AC M4F1R1.1
#=GS A0A0C2MZL2_THEKT/128-308  AC A0A0C2MZL2.1
#=GS U4UXQ6_DENPD/260-482      AC U4UXQ6.1
#=GS A0A0D9S3P0_CHLSB/274-499  AC A0A0D9S3P0.1
#=GS D8S4R7_SELML/213-418      AC D8S4R7.1
#=GS I3MCD0_SPETR/274-499      AC I3MCD0.1
#=GS U5GGE4_POPTR/199-354      AC U5GGE4.1
#=GS K0TI67_THAOC/288-518      AC K0TI67.1
#=GS M3W183_FELCA/287-512      AC M3W183.1
#=GS J3MPJ4_ORYBR/216-398      AC J3MPJ4.1
#=GS H0WIR7_OTOGA/273-499      AC H0WIR7.1
#=GS I1LKP2_SOYBN/221-374      AC I1LKP2.1
#=GS G3H7X9_CRIGR/180-405      AC G3H7X9.1
#=GS C1FGC9_MICSR/281-499      AC C1FGC9.1
#=GS I1C2J8_RHIO9/1008-1206    AC I1C2J8.1
#=GS A0A088AD09_APIME/247-454  AC A0A088AD09.1
#=GS E1G5P4_LOALO/246-465      AC E1G5P4.2
#=GS E2BHJ1_HARSA/246-446      AC E2BHJ1.1
#=GS I1I093_BRADI/214-419      AC I1I093.1
#=GS A0A0D3FA77_9ORYZ/245-454  AC A0A0D3FA77.1
#=GS H2TJZ9_TAKRU/269-493      AC H2TJZ9.1
#=GS G3Q0Q5_GASAC/245-470      AC G3Q0Q5.1
#=GS F2D6L7_HORVD/214-406      AC F2D6L7.1
#=GS H3AMW0_LATCH/245-469      AC H3AMW0.1
#=GS B9HQ38_POPTR/231-384      AC B9HQ38.2
#=GS B9SCX6_RICCO/218-377      AC B9SCX6.1
#=GS M0TWW5_MUSAM/221-388      AC M0TWW5.1
#=GS A7SD25_NEMVE/260-506      AC A7SD25.1
#=GS Q17CA6_AEDAE/268-504      AC Q17CA6.1
#=GS F6YW17_HORSE/286-511      AC F6YW17.1
#=GS M8ASR6_TRIUA/306-492      AC M8ASR6.1
#=GS C5YLD1_SORBI/212-399      AC C5YLD1.1
#=GS A0A068XB95_HYMMI/260-488  AC A0A068XB95.1
#=GS F7HT10_CALJA/274-499      AC F7HT10.1
#=GS K7LJJ3_SOYBN/2-102        AC K7LJJ3.1
#=GS E1ZAK5_CHLVA/266-494      AC E1ZAK5.1
#=GS A0A091D5L2_FUKDA/274-499  AC A0A091D5L2.1
#=GS G5BWK2_HETGA/274-499      AC G5BWK2.1
#=GS K1Q961_CRAGI/235-459      AC K1Q961.1
#=GS H2ZQB4_CIOSA/56-194       AC H2ZQB4.1
#=GS A9V5M6_MONBE/922-1146     AC A9V5M6.1
#=GS G4V7F3_SCHMA/339-545      AC G4V7F3.1
#=GS H2N544_PONAB/274-497      AC H2N544.2
#=GS K7MPU1_SOYBN/195-417      AC K7MPU1.1
#=GS W4Z241_STRPU/1-93         AC W4Z241.1
#=GS I1FCL5_AMPQE/752-955      AC I1FCL5.1
#=GS B4HHL8_DROSE/266-499      AC B4HHL8.1
#=GS G4ZR63_PHYSP/245-492      AC G4ZR63.1
#=GS F7EHX8_MACMU/274-499      AC F7EHX8.1
#=GS G0NXV9_CAEBE/1-97         AC G0NXV9.1
#=GS A0A090M8Y9_OSTTA/271-428  AC A0A090M8Y9.1
#=GS W4YT93_STRPU/235-471      AC W4YT93.1
#=GS R1FAY5_EMIHU/225-320      AC R1FAY5.1
#=GS A0A077RD29_ECHMU/19-228   AC A0A077RD29.1
#=GS A0A024MSD9_BRUMA/137-351  AC A0A024MSD9.1
#=GS W5H004_WHEAT/247-456      AC W5H004.1
#=GS F2U745_SALR5/248-469      AC F2U745.1
#=GS D8S2C0_SELML/209-422      AC D8S2C0.1
#=GS F4J820_ARATH/251-489      AC F4J820.1
#=GS D7LU95_ARALL/309-518      AC D7LU95.1
#=GS A0A022PYG9_ERYGU/225-388  AC A0A022PYG9.1
#=GS G0NXW2_CAEBE/27-94        AC G0NXW2.1
#=GS M1B119_SOLTU/89-309       AC M1B119.1
#=GS E4XKY1_OIKDI/372-504      AC E4XKY1.1
#=GS A2E0Z0_TRIVA/204-436      AC A2E0Z0.1
#=GS A8XZV7_CAEBR/278-508      AC A8XZV7.1
#=GS C1MRY3_MICPC/278-548      AC C1MRY3.1
#=GS D7LNR0_ARALL/224-369      AC D7LNR0.1
#=GS F6WKW4_MACMU/1-47         AC F6WKW4.1
#=GS C0HE58_MAIZE/209-379      AC C0HE58.1
#=GS A0A072V8S7_MEDTR/89-314   AC A0A072V8S7.1
#=GS W5I0Z3_WHEAT/79-284       AC W5I0Z3.1
#=GS I1I092_BRADI/214-419      AC I1I092.1
#=GS E9HAJ0_DAPPU/268-485      AC E9HAJ0.1
#=GS I1LRI7_SOYBN/221-384      AC I1LRI7.2
#=GS I1LMA4_SOYBN/245-471      AC I1LMA4.2
#=GS A0A067C5B3_SAPPC/245-475  AC A0A067C5B3.1
#=GS A0A077YVT0_TRITR/262-470  AC A0A077YVT0.1
#=GS F4NW98_BATDJ/212-448      AC F4NW98.1
#=GS T1FSB4_HELRO/255-362      AC T1FSB4.1
#=GS H0VS58_CAVPO/286-511      AC H0VS58.1
#=GS V8NRU3_OPHHA/1-53         AC V8NRU3.1
#=GS T1FSB4_HELRO/427-556      AC T1FSB4.1
#=GS M0UCD0_MUSAM/34-91        AC M0UCD0.1
#=GS F4WVP9_ACREC/246-445      AC F4WVP9.1
#=GS Q5T209_HUMAN/190-255      AC Q5T209.1
#=GS B4LVZ2_DROVI/273-509      AC B4LVZ2.1
#=GS W5M1B7_LEPOC/1-47         AC W5M1B7.1
#=GS T1GH01_MEGSC/307-429      AC T1GH01.1
#=GS G1T7J5_RABIT/273-498      AC G1T7J5.1
#=GS F1RJY0_PIG/274-499        AC F1RJY0.2
#=GS D8RVM0_SELML/209-371      AC D8RVM0.1
#=GS V4AJE4_LOTGI/240-476      AC V4AJE4.1
#=GS L5JV68_PTEAL/274-499      AC L5JV68.1
#=GS H0Y6T7_HUMAN/43-176       AC H0Y6T7.1
#=GS W5M1B7_LEPOC/118-182      AC W5M1B7.1
#=GS H9GQ91_ANOCA/1-134        AC H9GQ91.1
#=GS Q4DEM3_TRYCC/344-503      AC Q4DEM3.1
#=GS D7TSK0_VITVI/247-481      AC D7TSK0.1
#=GS V8NR86_OPHHA/125-182      AC V8NR86.1
#=GS B7FSJ4_PHATC/257-518      AC B7FSJ4.1
#=GS A9S8V6_PHYPA/235-438      AC A9S8V6.1
#=GS Q29CG8_DROPS/263-499      AC Q29CG8.3
#=GS K4D5V3_SOLLC/247-468      AC K4D5V3.1
#=GS A0A067QWF2_ZOONE/257-496  AC A0A067QWF2.1
#=GS F6WKW4_MACMU/44-175       AC F6WKW4.1
#=GS T1GH01_MEGSC/425-508      AC T1GH01.1
#=GS H2Q0E4_PANTR/274-499      AC H2Q0E4.1
#=GS A5JYX8_CAEEL/208-410      AC A5JYX8.1
#=GS A0A068YE75_ECHMU/212-356  AC A0A068YE75.1
#=GS W5PGA9_SHEEP/285-510      AC W5PGA9.1
#=GS K3XAK7_PYTUL/251-504      AC K3XAK7.1
#=GS G7J8R1_MEDTR/242-451      AC G7J8R1.1
#=GS E5RYN6_TRISP/122-189      AC E5RYN6.1
#=GS F0ZBA6_DICPU/231-448      AC F0ZBA6.1
#=GS F0ZBA6_DICPU/231-448      DR PDB; 4R12 A; 231-448;
#=GS B8B9Y0_ORYSI/134-317      AC B8B9Y0.1
#=GS M7ZPJ2_TRIUA/247-456      AC M7ZPJ2.1
#=GS F4Q4W1_DICFS/232-463      AC F4Q4W1.1
#=GS E3LUW2_CAERE/278-509      AC E3LUW2.1
#=GS I1P417_ORYGL/248-457      AC I1P417.1
#=GS W1NW73_AMBTC/218-383      AC W1NW73.1
#=GS A0A072UVE5_MEDTR/223-384  AC A0A072UVE5.1
#=GS E1JIV8_DROME/266-499      AC E1JIV8.1
#=GS B4NFN8_DROWI/276-512      AC B4NFN8.1
#=GS B4GN29_DROPE/267-503      AC B4GN29.1
#=GS K7UJ87_MAIZE/249-458      AC K7UJ87.1
#=GS H9KZL2_CHICK/283-507      AC H9KZL2.1
#=GS U3JY82_FICAL/218-442      AC U3JY82.1
#=GS K4ATD4_SOLLC/224-385      AC K4ATD4.1
#=GS T1L1W7_TETUR/271-503      AC T1L1W7.1
#=GS Q6Z743_ORYSJ/248-457      AC Q6Z743.1
#=GS D7FSD7_ECTSI/343-573      AC D7FSD7.1
#=GS F1MT12_BOVIN/274-499      AC F1MT12.1
#=GS A0A0B2VNL1_TOXCA/294-522  AC A0A0B2VNL1.1
#=GS F6Q3M8_CALJA/254-479      AC F6Q3M8.1
#=GS R1DSB7_EMIHU/224-319      AC R1DSB7.1
#=GS G6CPQ8_DANPL/246-498      AC G6CPQ8.1
#=GS K7MPU0_SOYBN/195-404      AC K7MPU0.1
#=GS F1PU73_CANFA/269-494      AC F1PU73.2
#=GS H2XT29_CIOIN/127-352      AC H2XT29.1
#=GS C4LVX3_ENTHI/201-284      AC C4LVX3.1
#=GS A2F570_TRIVA/212-459      AC A2F570.1
#=GS M4BVK0_HYAAE/250-510      AC M4BVK0.1
#=GS V4M136_EUTSA/224-370      AC V4M136.1
#=GS I3KD97_ORENI/278-502      AC I3KD97.1
#=GS D8LVK2_BLAHO/13-212       AC D8LVK2.1
#=GS G1M6K2_AILME/286-511      AC G1M6K2.1
#=GS H2LCM3_ORYLA/180-245      AC H2LCM3.1
#=GS W5GB63_WHEAT/247-456      AC W5GB63.1
#=GS NICA_RAT/273-498          AC Q8CGU6.1
#=GS B4QTU0_DROSI/264-497      AC B4QTU0.1
#=GS F7IS69_CALJA/190-361      AC F7IS69.1
#=GS Q9M292_ARATH/224-377      AC Q9M292.1
#=GS NICA_MOUSE/273-498        AC P57716.3
#=GS B8AI33_ORYSI/248-457      AC B8AI33.1
#=GS Q4CZS8_TRYCC/344-502      AC Q4CZS8.1
#=GS F6WKT8_MACMU/190-255      AC F6WKT8.1
#=GS H2TJZ8_TAKRU/264-488      AC H2TJZ8.1
#=GS A8NPZ0_BRUMA/215-394      AC A8NPZ0.1
#=GS F7F9Y3_MONDO/289-514      AC F7F9Y3.2
#=GS J3LGV5_ORYBR/248-457      AC J3LGV5.1
#=GS H0Y3Z4_HUMAN/110-320      AC H0Y3Z4.5
#=GS Q7KS07_DROME/266-499      AC Q7KS07.2
#=GS H9GN16_ANOCA/273-334      AC H9GN16.2
#=GS A0A022R744_ERYGU/231-376  AC A0A022R744.1
#=GS D3BHE5_POLPA/254-484      AC D3BHE5.1
#=GS U1NF22_ASCSU/278-500      AC U1NF22.1
#=GS W5H8H2_WHEAT/79-266       AC W5H8H2.1
#=GS L8Y6H9_TUPCH/274-499      AC L8Y6H9.1
#=GS NICA_HUMAN/274-499        AC Q92542.2
#=GS NICA_HUMAN/274-499        DR PDB; 4UPC A; 275-499;
#=GS D2A5N1_TRICA/227-444      AC D2A5N1.1
#=GS K4DLV3_TRYCR/2-158        AC K4DLV3.1
#=GS H9H0Y2_MELGA/283-507      AC H9H0Y2.1
#=GS NICA_DROME/266-499        AC Q9VC27.3
#=GS A0A0D3BYG4_BRAOL/171-380  AC A0A0D3BYG4.1
#=GS K7UBP9_MAIZE/211-385      AC K7UBP9.1
#=GS F7CNY6_XENTR/29-253       AC F7CNY6.1
#=GS G3QLU4_GORGO/286-511      AC G3QLU4.1
#=GS E9I860_SOLIN/276-439      AC E9I860.1
#=GS M4DSG4_BRARP/221-366      AC M4DSG4.1
#=GS A4S1V4_OSTLU/99-248       AC A4S1V4.1
#=GS G1NVE1_MYOLU/280-505      AC G1NVE1.1
#=GS A0A0D3BGY1_BRAOL/224-369  AC A0A0D3BGY1.1
#=GS M7B2R0_CHEMY/232-456      AC M7B2R0.1
#=GS E2AJI0_CAMFO/249-451      AC E2AJI0.1
#=GS T1JAP2_STRMM/302-537      AC T1JAP2.1
#=GS G3VX86_SARHA/246-471      AC G3VX86.1
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