GenomeNet

Database: Pfam
Entry: Nicastrin
LinkDB: Nicastrin
Original site: Nicastrin 
#=GF ID   Nicastrin
#=GF AC   PF05450.11
#=GF DE   Nicastrin
#=GF AU   Moxon SJ
#=GF SE   Pfam-B_15452 (release 8.0)
#=GF GA   20.20 20.20;
#=GF TC   20.20 20.20;
#=GF NC   20.10 20.10;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 80369284 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   12584255
#=GF RT   gamma-Secretase activity requires the presenilin-dependent
#=GF RT   trafficking of nicastrin through the Golgi apparatus but not its
#=GF RT   complex glycosylation. 
#=GF RA   Herreman A, Van Gassen G, Bentahir M, Nyabi O, Craessaerts K,
#=GF RA   Mueller U, Annaert W, De Strooper B; 
#=GF RL   J Cell Sci 2003;116:1127-1136.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   12507492
#=GF RT   Nicastrin is a resident lysosomal membrane protein. 
#=GF RA   Bagshaw RD, Pasternak SH, Mahuran DJ, Callahan JW; 
#=GF RL   Biochem Biophys Res Commun 2003;300:615-618.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   10993067
#=GF RT   Nicastrin modulates presenilin-mediated notch/glp-1 signal
#=GF RT   transduction and betaAPP processing. 
#=GF RA   Yu G, Nishimura M, Arawaka S, Levitan D, Zhang L, Tandon A, Song
#=GF RA   YQ, Rogaeva E, Chen F, Kawarai T, Supala A, Levesque L, Yu H,
#=GF RA   Yang DS, Holmes E, Milman P, Liang Y, Zhang DM, Xu DH, Sato C,
#=GF RA   Rogaev E, Smith M, Janus C, Zhang Y, Aebersold R, Farrer LS,
#=GF RA   Sorb
#=GF RL   Nature 2000;407:48-54.
#=GF RN   [4]
#=GF RM   11295540
#=GF RT   Nicastrin, a presenilin-interacting protein, contains an
#=GF RT   aminopeptidase/transferrin receptor superfamily domain. 
#=GF RA   Fagan R, Swindells M, Overington J, Weir M; 
#=GF RL   Trends Biochem Sci 2001;26:213-214.
#=GF DR   INTERPRO; IPR008710;
#=GF CC   Nicastrin and presenilin are two major components of the
#=GF CC   gamma-secretase complex, which executes the intramembrane
#=GF CC   proteolysis of type I integral membrane proteins such as the
#=GF CC   amyloid precursor protein (APP) and Notch.  Nicastrin is
#=GF CC   synthesised in fibroblasts and neurons as an
#=GF CC   endoglycosidase-H-sensitive glycosylated precursor protein
#=GF CC   (immature nicastrin) and is then modified by complex
#=GF CC   glycosylation in the Golgi apparatus and by sialylation in the
#=GF CC   trans-Golgi network (mature nicastrin) [1]. A region featured in
#=GF CC   this family has a fold similar to human transferrin receptor
#=GF CC   (TfR, Swiss:P02786) and a bacterial aminopeptidase
#=GF CC   (Swiss:P80561). It is implicated in the pathogenesis of
#=GF CC   Alzheimer's disease [4].
#=GF SQ   407
#=GS M2R604_ENTHI/201-286      AC M2R604.1
#=GS F6UBR8_ORNAN/1-163        AC F6UBR8.1
#=GS B4DJN0_HUMAN/16-241       AC B4DJN0.1
#=GS NICA_DICDI/229-470        AC Q54JT7.2
#=GS Q012T4_OSTTA/50-207       AC Q012T4.1
#=GS G0NXW2_CAEBE/112-290      AC G0NXW2.1
#=GS H3DUY5_PRIPA/384-618      AC H3DUY5.1
#=GS M4F1R1_BRARP/222-375      AC M4F1R1.1
#=GS A0A026VXH2_CERBI/1-65     AC A0A026VXH2.1
#=GS Q3TD54_MOUSE/273-498      AC Q3TD54.1
#=GS S8CCF9_9LAMI/223-388      AC S8CCF9.1
#=GS Q5ZJB9_CHICK/283-507      AC Q5ZJB9.1
#=GS J3MPJ4_ORYBR/216-398      AC J3MPJ4.1
#=GS G3H7X9_CRIGR/180-405      AC G3H7X9.1
#=GS C1FGC9_MICSR/281-499      AC C1FGC9.1
#=GS I1C2J8_RHIO9/1008-1206    AC I1C2J8.1
#=GS I1I093_BRADI/214-419      AC I1I093.1
#=GS H2TJZ9_TAKRU/269-493      AC H2TJZ9.1
#=GS G3Q0Q5_GASAC/245-470      AC G3Q0Q5.1
#=GS S4PFY1_9NEOP/245-499      AC S4PFY1.1
#=GS B9SCX6_RICCO/218-377      AC B9SCX6.1
#=GS B9HQ38_POPTR/231-384      AC B9HQ38.2
#=GS M0TWW5_MUSAM/221-388      AC M0TWW5.1
#=GS K2H161_ENTNP/201-284      AC K2H161.1
#=GS F6YW17_HORSE/286-511      AC F6YW17.1
#=GS M8ASR6_TRIUA/306-492      AC M8ASR6.1
#=GS C3S7J4_CRAGI/41-259       AC C3S7J4.1
#=GS B1Q4T6_BRUGY/226-385      AC B1Q4T6.1
#=GS R7U585_CAPTE/262-500      AC R7U585.1
#=GS A0A034VU97_BACDO/6-115    AC A0A034VU97.1
#=GS F7HT10_CALJA/274-499      AC F7HT10.1
#=GS E1ZAK5_CHLVA/266-494      AC E1ZAK5.1
#=GS H2ZQB4_CIOSA/56-194       AC H2ZQB4.1
#=GS M5WHE4_PRUPE/224-382      AC M5WHE4.1
#=GS A5AV83_VITVI/66-128       AC A5AV83.1
#=GS H2N544_PONAB/274-497      AC H2N544.2
#=GS I1FCL5_AMPQE/752-955      AC I1FCL5.1
#=GS F7EHX8_MACMU/274-499      AC F7EHX8.1
#=GS G0NXV9_CAEBE/1-97         AC G0NXV9.1
#=GS A0A024MSD9_BRUMA/137-351  AC A0A024MSD9.1
#=GS W5H004_WHEAT/247-456      AC W5H004.1
#=GS D8S2C0_SELML/209-422      AC D8S2C0.1
#=GS F4J820_ARATH/251-489      AC F4J820.1
#=GS B4PV32_DROYA/264-499      AC B4PV32.1
#=GS A0A022PYG9_MIMGU/225-388  AC A0A022PYG9.1
#=GS G0NXW2_CAEBE/27-94        AC G0NXW2.1
#=GS M1B119_SOLTU/89-309       AC M1B119.1
#=GS M1VRR0_CANFA/274-499      AC M1VRR0.1
#=GS E4XKY1_OIKDI/372-504      AC E4XKY1.1
#=GS A2E0Z0_TRIVA/204-436      AC A2E0Z0.1
#=GS M7X2U7_ENTHI/201-286      AC M7X2U7.1
#=GS F6WKW4_MACMU/1-47         AC F6WKW4.1
#=GS C0HE58_MAIZE/209-379      AC C0HE58.1
#=GS U5EXI1_9DIPT/262-498      AC U5EXI1.1
#=GS A0A026VT56_CERBI/1-91     AC A0A026VT56.1
#=GS E7ENA9_HUMAN/16-241       AC E7ENA9.2
#=GS A0A058Z441_9EUKA/630-702  AC A0A058Z441.1
#=GS W5I0Z3_WHEAT/79-284       AC W5I0Z3.1
#=GS C9ZPU2_TRYB9/323-545      AC C9ZPU2.1
#=GS E9HAJ0_DAPPU/268-485      AC E9HAJ0.1
#=GS I1LRI7_SOYBN/221-384      AC I1LRI7.2
#=GS W4FD47_9STRA/254-503      AC W4FD47.1
#=GS A0A059AAW3_EUCGR/218-391  AC A0A059AAW3.1
#=GS S8EAN5_9LAMI/242-451      AC S8EAN5.1
#=GS T1FSB4_HELRO/255-362      AC T1FSB4.1
#=GS G9KCV1_MUSPF/245-470      AC G9KCV1.1
#=GS H0VS58_CAVPO/286-511      AC H0VS58.1
#=GS T1FSB4_HELRO/427-556      AC T1FSB4.1
#=GS B4LVZ2_DROVI/273-509      AC B4LVZ2.1
#=GS A0A024GI64_9STRA/361-524  AC A0A024GI64.1
#=GS G7ME71_MACMU/274-499      AC G7ME71.1
#=GS H9K265_APIME/226-433      AC H9K265.1
#=GS G1T7J5_RABIT/273-498      AC G1T7J5.1
#=GS D8RVM0_SELML/209-371      AC D8RVM0.1
#=GS F1RJY0_PIG/274-499        AC F1RJY0.2
#=GS V4AJE4_LOTGI/240-476      AC V4AJE4.1
#=GS D2I012_AILME/254-479      AC D2I012.1
#=GS U6IEZ9_HYMMI/260-488      AC U6IEZ9.1
#=GS F1KXC6_ASCSU/282-504      AC F1KXC6.1
#=GS K7GGD1_PELSI/270-494      AC K7GGD1.1
#=GS W5M1B7_LEPOC/118-182      AC W5M1B7.1
#=GS W8C6X3_CERCA/276-510      AC W8C6X3.1
#=GS B7FSJ4_PHATC/257-518      AC B7FSJ4.1
#=GS A9S8V6_PHYPA/235-438      AC A9S8V6.1
#=GS Q29CG8_DROPS/263-499      AC Q29CG8.3
#=GS H0Y3Z4_HUMAN/110-319      AC H0Y3Z4.2
#=GS K4D5V3_SOLLC/247-468      AC K4D5V3.1
#=GS V9FWN4_PHYPR/241-488      AC V9FWN4.1
#=GS Q5RB43_PONAB/274-499      AC Q5RB43.1
#=GS A5JYX8_CAEEL/208-410      AC A5JYX8.1
#=GS W5PGA9_SHEEP/285-510      AC W5PGA9.1
#=GS L7M255_9ACAR/265-504      AC L7M255.1
#=GS K3XAK7_PYTUL/251-504      AC K3XAK7.1
#=GS V9KKG2_CALMI/258-480      AC V9KKG2.1
#=GS I2CQ37_9STRA/2-77         AC I2CQ37.1
#=GS E5RYN6_TRISP/122-189      AC E5RYN6.1
#=GS F0ZBA6_DICPU/231-448      AC F0ZBA6.1
#=GS F0ZBA6_DICPU/231-448      DR PDB; 4R12 A; 231-448;
#=GS F4Q4W1_DICFS/232-463      AC F4Q4W1.1
#=GS W1NW73_AMBTC/218-383      AC W1NW73.1
#=GS V4UDN5_9ROSI/220-380      AC V4UDN5.1
#=GS A0A024TNB7_9STRA/251-497  AC A0A024TNB7.1
#=GS K7UJ87_MAIZE/249-458      AC K7UJ87.1
#=GS H9KZL2_CHICK/283-507      AC H9KZL2.1
#=GS U3JY82_FICAL/218-442      AC U3JY82.1
#=GS W3A3E2_PHYPR/241-488      AC W3A3E2.1
#=GS K4ATD4_SOLLC/224-385      AC K4ATD4.1
#=GS T1L1W7_TETUR/271-503      AC T1L1W7.1
#=GS Q6Z743_ORYSJ/248-457      AC Q6Z743.1
#=GS F1MT12_BOVIN/274-499      AC F1MT12.1
#=GS A0A016VKY5_9BILA/305-533  AC A0A016VKY5.1
#=GS A0A026WCE7_CERBI/3-108    AC A0A026WCE7.1
#=GS F1PU73_CANFA/269-494      AC F1PU73.2
#=GS H2XT29_CIOIN/127-352      AC H2XT29.1
#=GS C4LVX3_ENTHI/201-284      AC C4LVX3.1
#=GS R0HK41_9BRAS/224-370      AC R0HK41.1
#=GS A0A059BTV0_EUCGR/244-453  AC A0A059BTV0.1
#=GS A2F570_TRIVA/212-459      AC A2F570.1
#=GS Q4T377_TETNG/241-465      AC Q4T377.1
#=GS I3KD97_ORENI/278-502      AC I3KD97.1
#=GS R7QN81_CHOCR/526-620      AC R7QN81.1
#=GS U6HTF8_ECHMU/212-356      AC U6HTF8.1
#=GS W5GB63_WHEAT/247-456      AC W5GB63.1
#=GS NICA_RAT/273-498          AC Q8CGU6.1
#=GS B4QTU0_DROSI/264-497      AC B4QTU0.1
#=GS F7IS69_CALJA/190-361      AC F7IS69.1
#=GS Q9M292_ARATH/224-377      AC Q9M292.1
#=GS B8AI33_ORYSI/248-457      AC B8AI33.1
#=GS A0A059BUU5_EUCGR/244-454  AC A0A059BUU5.1
#=GS F6WKT8_MACMU/190-255      AC F6WKT8.1
#=GS A8NPZ0_BRUMA/215-394      AC A8NPZ0.1
#=GS H2TJZ8_TAKRU/264-488      AC H2TJZ8.1
#=GS J3LGV5_ORYBR/248-457      AC J3LGV5.1
#=GS H9GN16_ANOCA/273-334      AC H9GN16.2
#=GS D3BHE5_POLPA/254-484      AC D3BHE5.1
#=GS F6Y097_HUMAN/190-361      AC F6Y097.1
#=GS F0W477_9STRA/361-529      AC F0W477.1
#=GS U1NF22_ASCSU/278-500      AC U1NF22.1
#=GS D2A5N1_TRICA/227-444      AC D2A5N1.1
#=GS M4DSG4_BRARP/221-366      AC M4DSG4.1
#=GS G1NVE1_MYOLU/280-505      AC G1NVE1.1
#=GS M7B2R0_CHEMY/232-456      AC M7B2R0.1
#=GS W5GKM2_WHEAT/247-456      AC W5GKM2.1
#=GS K3YGY3_SETIT/214-419      AC K3YGY3.1
#=GS D8RHJ7_SELML/219-424      AC D8RHJ7.1
#=GS R0L2Q7_ANAPL/245-469      AC R0L2Q7.1
#=GS I1IFH7_BRADI/255-443      AC I1IFH7.1
#=GS B9H3E1_POPTR/248-469      AC B9H3E1.2
#=GS F6UC14_ORNAN/1-164        AC F6UC14.1
#=GS B3LV10_DROAN/261-497      AC B3LV10.1
#=GS D0NP58_PHYIT/241-490      AC D0NP58.1
#=GS W9S647_9ROSA/219-380      AC W9S647.1
#=GS G0NXV9_CAEBE/94-196       AC G0NXV9.1
#=GS X1WJF3_ACYPI/257-479      AC X1WJF3.1
#=GS A0A015M1P5_9GLOM/301-422  AC A0A015M1P5.1
#=GS A0A044TY20_ONCVO/301-522  AC A0A044TY20.1
#=GS M3U3H0_ENTHI/201-284      AC M3U3H0.1
#=GS M0UEQ6_HORVD/247-456      AC M0UEQ6.1
#=GS G1RTC9_NOMLE/274-499      AC G1RTC9.1
#=GS Q7PY38_ANOGA/276-510      AC Q7PY38.4
#=GS H9JDY0_BOMMO/109-363      AC H9JDY0.1
#=GS M4EX82_BRARP/256-465      AC M4EX82.1
#=GS V4L4H3_EUTSA/208-417      AC V4L4H3.1
#=GS A0A026W3E7_CERBI/22-115   AC A0A026W3E7.1
#=GS W2TXC5_NECAM/156-384      AC W2TXC5.1
#=GS U6NUA1_HAECO/333-561      AC U6NUA1.1
#=GS K3YQM1_SETIT/249-467      AC K3YQM1.1
#=GS A0A022S0B8_MIMGU/248-457  AC A0A022S0B8.1
#=GS F6QUJ6_CALJA/16-241       AC F6QUJ6.1
#=GS L8H287_ACACA/249-477      AC L8H287.1
#=GS K7ISR9_NASVI/246-447      AC K7ISR9.1
#=GS W5JFV8_ANODA/284-519      AC W5JFV8.1
#=GS V7D2B4_PHAVU/245-454      AC V7D2B4.1
#=GS R7QN81_CHOCR/373-474      AC R7QN81.1
#=GS D7TCR2_VITVI/222-377      AC D7TCR2.1
#=GS Q3T9E5_MOUSE/273-498      AC Q3T9E5.1
#=GS U6DYB6_NEOVI/1-85         AC U6DYB6.1
#=GS H2LCL9_ORYLA/264-486      AC H2LCL9.1
#=GS A0A016VMM6_9BILA/179-408  AC A0A016VMM6.1
#=GS Q5T205_HUMAN/32-219       AC Q5T205.1
#=GS NICA_ARATH/251-460        AC Q8GUM5.1
#=GS X6NKB7_RETFI/59-326       AC X6NKB7.1
#=GS S7NXS8_MYOBR/284-509      AC S7NXS8.1
#=GS M3ZTN5_XIPMA/263-487      AC M3ZTN5.1
#=GS H0Y6T7_HUMAN/1-48         AC H0Y6T7.1
#=GS A8PV26_BRUMA/255-469      AC A8PV26.2
#=GS S2J4I2_MUCC1/241-456      AC S2J4I2.1
#=GS H0Z1S0_TAEGU/241-466      AC H0Z1S0.1
#=GS M0UEQ5_HORVD/1-123        AC M0UEQ5.1
#=GS N6TVT0_DENPD/260-386      AC N6TVT0.1
#=GS V4T8R7_9ROSI/230-439      AC V4T8R7.1
#=GS A0A016VLH9_9BILA/146-375  AC A0A016VLH9.1
#=GS K7UMV8_MAIZE/211-385      AC K7UMV8.1
#=GS G7J8R2_MEDTR/242-413      AC G7J8R2.1
#=GS X1YML4_ANODA/1092-1327    AC X1YML4.1
#=GS W8BAG5_CERCA/276-510      AC W8BAG5.1
#=GS Q5C3V5_SCHJA/272-387      AC Q5C3V5.2
#=GS M3YRN9_MUSPF/294-519      AC M3YRN9.1
#=GS V4RS75_9ROSI/220-380      AC V4RS75.1
#=GS E9CI47_CAPO3/261-481      AC E9CI47.1
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#=GS NICA_HUMAN/274-499        DR PDB; 4UPC A; 275-499;
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