GenomeNet

Database: Pfam
Entry: Nicastrin
LinkDB: Nicastrin
Original site: Nicastrin 
#=GF ID   Nicastrin
#=GF AC   PF05450.10
#=GF DE   Nicastrin
#=GF AU   Moxon SJ
#=GF SE   Pfam-B_15452 (release 8.0)
#=GF GA   20.20 20.20;
#=GF TC   20.20 20.20;
#=GF NC   20.10 20.10;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 23193494 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   12584255
#=GF RT   gamma-Secretase activity requires the presenilin-dependent
#=GF RT   trafficking of nicastrin through the Golgi apparatus but not its
#=GF RT   complex glycosylation. 
#=GF RA   Herreman A, Van Gassen G, Bentahir M, Nyabi O, Craessaerts K,
#=GF RA   Mueller U, Annaert W, De Strooper B; 
#=GF RL   J Cell Sci 2003;116:1127-1136.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   12507492
#=GF RT   Nicastrin is a resident lysosomal membrane protein. 
#=GF RA   Bagshaw RD, Pasternak SH, Mahuran DJ, Callahan JW; 
#=GF RL   Biochem Biophys Res Commun 2003;300:615-618.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   10993067
#=GF RT   Nicastrin modulates presenilin-mediated notch/glp-1 signal
#=GF RT   transduction and betaAPP processing. 
#=GF RA   Yu G, Nishimura M, Arawaka S, Levitan D, Zhang L, Tandon A, Song
#=GF RA   YQ, Rogaeva E, Chen F, Kawarai T, Supala A, Levesque L, Yu H,
#=GF RA   Yang DS, Holmes E, Milman P, Liang Y, Zhang DM, Xu DH, Sato C,
#=GF RA   Rogaev E, Smith M, Janus C, Zhang Y, Aebersold R, Farrer LS,
#=GF RA   Sorb
#=GF RL   Nature 2000;407:48-54.
#=GF RN   [4]
#=GF RM   11295540
#=GF RT   Nicastrin, a presenilin-interacting protein, contains an
#=GF RT   aminopeptidase/transferrin receptor superfamily domain. 
#=GF RA   Fagan R, Swindells M, Overington J, Weir M; 
#=GF RL   Trends Biochem Sci 2001;26:213-214.
#=GF DR   INTERPRO; IPR008710;
#=GF CC   Nicastrin and presenilin are two major components of the
#=GF CC   gamma-secretase complex, which executes the intramembrane
#=GF CC   proteolysis of type I integral membrane proteins such as the
#=GF CC   amyloid precursor protein (APP) and Notch.  Nicastrin is
#=GF CC   synthesised in fibroblasts and neurons as an
#=GF CC   endoglycosidase-H-sensitive glycosylated precursor protein
#=GF CC   (immature nicastrin) and is then modified by complex
#=GF CC   glycosylation in the Golgi apparatus and by sialylation in the
#=GF CC   trans-Golgi network (mature nicastrin) [1]. A region featured in
#=GF CC   this family has a fold similar to human transferrin receptor
#=GF CC   (TfR, Swiss:P02786) and a bacterial aminopeptidase
#=GF CC   (Swiss:P80561). It is implicated in the pathogenesis of
#=GF CC   Alzheimer's disease [4].
#=GF SQ   234
#=GS F6UBR8_ORNAN/1-163      AC F6UBR8.1
#=GS B4DJN0_HUMAN/16-241     AC B4DJN0.1
#=GS NICA_DICDI/229-470      AC Q54JT7.2
#=GS G7J8R2_MEDTR/242-413    AC G7J8R2.1
#=GS Q012T4_OSTTA/50-207     AC Q012T4.1
#=GS Q5C3V5_SCHJA/272-387    AC Q5C3V5.2
#=GS B5DY78_DROPS/1-224      AC B5DY78.1
#=GS E9CI47_CAPO3/261-481    AC E9CI47.1
#=GS G0NXW2_CAEBE/112-290    AC G0NXW2.1
#=GS H3DUY5_PRIPA/384-618    AC H3DUY5.1
#=GS B0W373_CULQU/272-508    AC B0W373.1
#=GS Q3TD54_MOUSE/273-498    AC Q3TD54.1
#=GS B6VBY8_9PELO/1404-1631  AC B6VBY8.1
#=GS D8S4R7_SELML/213-418    AC D8S4R7.1
#=GS Q5ZJB9_CHICK/283-507    AC Q5ZJB9.1
#=GS I1LMA4_SOYBN/218-440    AC I1LMA4.1
#=GS H0WIR7_OTOGA/273-499    AC H0WIR7.1
#=GS H0Y3Z4_HUMAN/110-320    AC H0Y3Z4.1
#=GS I1LKP2_SOYBN/221-374    AC I1LKP2.1
#=GS G3H7X9_CRIGR/180-405    AC G3H7X9.1
#=GS C1FGC9_MICSR/281-499    AC C1FGC9.1
#=GS O18033_CAEEL/208-397    AC O18033.1
#=GS I1C2J8_RHIO9/1008-1206  AC I1C2J8.1
#=GS E2BHJ1_HARSA/246-446    AC E2BHJ1.1
#=GS I1I093_BRADI/214-419    AC I1I093.1
#=GS F0W477_9STRA/252-340    AC F0W477.1
#=GS B9HQ38_POPTR/207-360    AC B9HQ38.1
#=GS H2TJZ9_TAKRU/269-493    AC H2TJZ9.1
#=GS G3Q0Q5_GASAC/245-470    AC G3Q0Q5.1
#=GS B6TVH8_MAIZE/209-382    AC B6TVH8.1
#=GS F2D6L7_HORVD/214-406    AC F2D6L7.1
#=GS H3AMW0_LATCH/245-469    AC H3AMW0.1
#=GS B9SCX6_RICCO/218-377    AC B9SCX6.1
#=GS A7SD25_NEMVE/260-506    AC A7SD25.1
#=GS Q17CA6_AEDAE/268-504    AC Q17CA6.1
#=GS F6YW17_HORSE/286-511    AC F6YW17.1
#=GS H9GSA5_ANOCA/7-78       AC H9GSA5.1
#=GS C5YLD1_SORBI/212-399    AC C5YLD1.1
#=GS C3S7J4_CRAGI/41-259     AC C3S7J4.1
#=GS B1Q4T6_BRUGY/226-385    AC B1Q4T6.1
#=GS F7HT10_CALJA/274-499    AC F7HT10.1
#=GS E1ZAK5_CHLVA/266-494    AC E1ZAK5.1
#=GS G5BWK2_HETGA/274-499    AC G5BWK2.1
#=GS H2ZQB4_CIOSA/56-194     AC H2ZQB4.1
#=GS A9V5M6_MONBE/922-1146   AC A9V5M6.1
#=GS B4DR82_HUMAN/190-361    AC B4DR82.1
#=GS H3J6N0_STRPU/1-93       AC H3J6N0.1
#=GS G4V7F3_SCHMA/339-545    AC G4V7F3.1
#=GS A5AV83_VITVI/66-128     AC A5AV83.1
#=GS E9PC09_HUMAN/16-78      AC E9PC09.1
#=GS H2N545_PONAB/274-498    AC H2N545.1
#=GS I1FCL5_AMPQE/752-955    AC I1FCL5.1
#=GS B4HHL8_DROSE/266-499    AC B4HHL8.1
#=GS G4ZR63_PHYSP/245-492    AC G4ZR63.1
#=GS F7EHX8_MACMU/274-499    AC F7EHX8.1
#=GS G0NXV9_CAEBE/1-97       AC G0NXV9.1
#=GS F2U745_SALS5/248-469    AC F2U745.1
#=GS D8S2C0_SELML/209-422    AC D8S2C0.1
#=GS F4J820_ARATH/251-489    AC F4J820.1
#=GS D7LU95_ARALL/309-518    AC D7LU95.1
#=GS B4PV32_DROYA/264-499    AC B4PV32.1
#=GS B9H3E1_POPTR/218-425    AC B9H3E1.1
#=GS G0NXW2_CAEBE/27-94      AC G0NXW2.1
#=GS Q3TV74_MOUSE/1-35       AC Q3TV74.1
#=GS F7F9Y3_MONDO/285-510    AC F7F9Y3.1
#=GS E4XKY1_OIKDI/372-504    AC E4XKY1.1
#=GS A2E0Z0_TRIVA/204-436    AC A2E0Z0.1
#=GS A8XZV7_CAEBR/278-508    AC A8XZV7.1
#=GS C1MRY3_MICPC/278-548    AC C1MRY3.1
#=GS D7LNR0_ARALL/224-369    AC D7LNR0.1
#=GS F6WKW4_MACMU/1-47       AC F6WKW4.1
#=GS C0HE58_MAIZE/209-379    AC C0HE58.1
#=GS E7ENA9_HUMAN/16-241     AC E7ENA9.2
#=GS I1I092_BRADI/214-419    AC I1I092.1
#=GS C9ZPU2_TRYB9/323-545    AC C9ZPU2.1
#=GS E9HAJ0_DAPPU/268-485    AC E9HAJ0.1
#=GS E2JCD0_CANFA/1-40       AC E2JCD0.1
#=GS H2N544_PONAB/210-433    AC H2N544.1
#=GS Q29CG8_DROPS/263-495    AC Q29CG8.2
#=GS F4NW98_BATDJ/212-448    AC F4NW98.1
#=GS H2N546_PONAB/239-462    AC H2N546.1
#=GS I0YM99_9CHLO/152-387    AC I0YM99.1
#=GS G9KCV1_MUSPF/245-470    AC G9KCV1.1
#=GS F1PDD4_CANFA/169-234    AC F1PDD4.1
#=GS H0VS58_CAVPO/286-511    AC H0VS58.1
#=GS F4WVP9_ACREC/246-445    AC F4WVP9.1
#=GS Q5C122_SCHJA/223-299    AC Q5C122.2
#=GS Q5T209_HUMAN/190-255    AC Q5T209.1
#=GS B4LVZ2_DROVI/273-509    AC B4LVZ2.1
#=GS G7ME71_MACMU/274-499    AC G7ME71.1
#=GS Q6ZQF2_MOUSE/285-510    AC Q6ZQF2.1
#=GS H9K265_APIME/226-433    AC H9K265.1
#=GS G1T7J5_RABIT/273-498    AC G1T7J5.1
#=GS D8RVM0_SELML/209-371    AC D8RVM0.1
#=GS D2I012_AILME/254-479    AC D2I012.1
#=GS H0Y6T7_HUMAN/43-176     AC H0Y6T7.1
#=GS F1KXC6_ASCSU/282-504    AC F1KXC6.1
#=GS H9GQ91_ANOCA/1-134      AC H9GQ91.1
#=GS Q4DEM3_TRYCC/344-503    AC Q4DEM3.1
#=GS D7TSK0_VITVI/247-481    AC D7TSK0.1
#=GS B7FSJ4_PHATC/257-518    AC B7FSJ4.1
#=GS A9S8V6_PHYPA/235-438    AC A9S8V6.1
#=GS F6WKW4_MACMU/44-175     AC F6WKW4.1
#=GS H2Q0E4_PANTR/274-499    AC H2Q0E4.1
#=GS Q5RB43_PONAB/274-499    AC Q5RB43.1
#=GS A5JYX8_CAEEL/208-410    AC A5JYX8.1
#=GS A8PV26_BRUMA/317-531    AC A8PV26.1
#=GS G7J8R1_MEDTR/242-451    AC G7J8R1.1
#=GS Q5XLR3_DANRE/263-487    AC Q5XLR3.1
#=GS E5RYN6_TRISP/122-189    AC E5RYN6.1
#=GS F0ZBA6_DICPU/231-448    AC F0ZBA6.1
#=GS B8B9Y0_ORYSI/134-317    AC B8B9Y0.1
#=GS F4Q4W1_DICFS/232-463    AC F4Q4W1.1
#=GS E3LUW2_CAERE/278-509    AC E3LUW2.1
#=GS I1P417_ORYGL/248-457    AC I1P417.1
#=GS E1JIV8_DROME/266-499    AC E1JIV8.1
#=GS B4NFN8_DROWI/276-512    AC B4NFN8.1
#=GS B8A2Z5_MAIZE/211-385    AC B8A2Z5.1
#=GS B4GN29_DROPE/267-503    AC B4GN29.1
#=GS H9KZL2_CHICK/283-507    AC H9KZL2.1
#=GS Q3TDE4_MOUSE/273-498    AC Q3TDE4.1
#=GS F6UF97_MOUSE/285-510    AC F6UF97.1
#=GS B3DGT7_DANRE/263-487    AC B3DGT7.1
#=GS Q7KS07_DROME/236-469    AC Q7KS07.1
#=GS Q6Z743_ORYSJ/248-457    AC Q6Z743.1
#=GS D7FSD7_ECTSI/343-573    AC D7FSD7.1
#=GS F1MT12_BOVIN/274-499    AC F1MT12.1
#=GS F6Q3M8_CALJA/254-479    AC F6Q3M8.1
#=GS G0UM48_TRYCI/324-479    AC G0UM48.1
#=GS E4Z3L8_OIKDI/211-360    AC E4Z3L8.1
#=GS G6CPQ8_DANPL/246-498    AC G6CPQ8.1
#=GS B3DL59_XENTR/264-488    AC B3DL59.1
#=GS H2XT29_CIOIN/127-352    AC H2XT29.1
#=GS C4LVX3_ENTHI/201-284    AC C4LVX3.1
#=GS Q4R7R0_MACFA/274-499    AC Q4R7R0.1
#=GS A2F570_TRIVA/212-459    AC A2F570.1
#=GS Q4T377_TETNG/241-465    AC Q4T377.1
#=GS D8LVK2_BLAHO/13-212     AC D8LVK2.1
#=GS Q5T204_HUMAN/44-175     AC Q5T204.1
#=GS G1M6K2_AILME/286-511    AC G1M6K2.1
#=GS Q67BJ3_CHICK/283-507    AC Q67BJ3.1
#=GS H2LCM3_ORYLA/180-245    AC H2LCM3.1
#=GS F1RJY0_PIG/286-511      AC F1RJY0.1
#=GS NICA_RAT/273-498        AC Q8CGU6.1
#=GS B4QTU0_DROSI/264-497    AC B4QTU0.1
#=GS F7IS69_CALJA/190-361    AC F7IS69.1
#=GS Q9M292_ARATH/224-377    AC Q9M292.1
#=GS NICA_MOUSE/273-498      AC P57716.3
#=GS E3M3S7_CAERE/209-402    AC E3M3S7.1
#=GS B8AI33_ORYSI/248-457    AC B8AI33.1
#=GS Q4CZS8_TRYCC/344-502    AC Q4CZS8.1
#=GS F6WKT8_MACMU/190-255    AC F6WKT8.1
#=GS H2TJZ8_TAKRU/264-488    AC H2TJZ8.1
#=GS A8NPZ0_BRUMA/215-394    AC A8NPZ0.1
#=GS D3BHE5_POLPA/254-484    AC D3BHE5.1
#=GS F6Y097_HUMAN/190-361    AC F6Y097.1
#=GS F0W477_9STRA/361-529    AC F0W477.1
#=GS Q5T208_HUMAN/274-499    AC Q5T208.1
#=GS E4MWE0_THEHA/251-460    AC E4MWE0.1
#=GS NICA_HUMAN/274-499      AC Q92542.2
#=GS D2A5N1_TRICA/227-444    AC D2A5N1.1
#=GS H9H0Y2_MELGA/283-507    AC H9H0Y2.1
#=GS G0TW30_TRYVI/469-718    AC G0TW30.1
#=GS NICA_DROME/266-499      AC Q9VC27.3
#=GS F7CNY6_XENTR/29-253     AC F7CNY6.1
#=GS Q5RAB2_PONAB/274-499    AC Q5RAB2.1
#=GS E3WXC5_ANODA/1092-1327  AC E3WXC5.1
#=GS G3QLU4_GORGO/286-511    AC G3QLU4.1
#=GS E9I860_SOLIN/276-439    AC E9I860.1
#=GS A4S1V4_OSTLU/99-248     AC A4S1V4.1
#=GS F1PU73_CANFA/288-513    AC F1PU73.1
#=GS G1NVE1_MYOLU/280-505    AC G1NVE1.1
#=GS E2AJI0_CAMFO/249-451    AC E2AJI0.1
#=GS G3VX86_SARHA/246-471    AC G3VX86.1
#=GS Q6Z1Y4_ORYSJ/214-396    AC Q6Z1Y4.1
#=GS G0P8N3_CAEBE/208-413    AC G0P8N3.1
#=GS Q5T204_HUMAN/1-47       AC Q5T204.1
#=GS B9MYT7_POPTR/199-354    AC B9MYT7.1
#=GS NICA_CAEEL/278-508      AC Q23316.3
#=GS D1LX87_SACKO/228-462    AC D1LX87.1
#=GS D8RHJ7_SELML/219-424    AC D8RHJ7.1
#=GS I1IFH7_BRADI/255-443    AC I1IFH7.1
#=GS E7L0U8_TRYCR/336-495    AC E7L0U8.1
#=GS A8JFJ5_CHLRE/243-455    AC A8JFJ5.1
#=GS B4FZF8_MAIZE/211-385    AC B4FZF8.1
#=GS B3RU89_TRIAD/271-485    AC B3RU89.1
#=GS F6UC14_ORNAN/1-164      AC F6UC14.1
#=GS B3LV10_DROAN/261-497    AC B3LV10.1
#=GS F7EHW1_MACMU/254-479    AC F7EHW1.1
#=GS D0NP58_PHYIT/241-490    AC D0NP58.1
#=GS Q57Z43_TRYB2/323-541    AC Q57Z43.1
#=GS E4WZ69_OIKDI/211-390    AC E4WZ69.1
#=GS G0NXV9_CAEBE/94-196     AC G0NXV9.1
#=GS B0ET59_ENTDS/201-288    AC B0ET59.1
#=GS G7Y4B2_CLOSI/176-378    AC G7Y4B2.1
#=GS G1RTC9_NOMLE/274-499    AC G1RTC9.1
#=GS Q7PY38_ANOGA/276-510    AC Q7PY38.4
#=GS H3IXT7_STRPU/235-471    AC H3IXT7.1
#=GS H9JDY0_BOMMO/109-363    AC H9JDY0.1
#=GS H9I1G0_ATTCE/247-446    AC H9I1G0.1
#=GS H3GV47_PHYRM/243-491    AC H3GV47.1
#=GS G7NWD1_MACFA/274-499    AC G7NWD1.1
#=GS I1MZG1_SOYBN/195-384    AC I1MZG1.1
#=GS G3T6Z7_LOXAF/274-451    AC G3T6Z7.1
#=GS B9T119_RICCO/217-426    AC B9T119.1
#=GS A5Z2T7_CAEEL/278-508    AC A5Z2T7.1
#=GS F6QUJ6_CALJA/16-241     AC F6QUJ6.1
#=GS C3YCF0_BRAFL/262-502    AC C3YCF0.1
#=GS F1REK9_DANRE/1-132      AC F1REK9.1
#=GS B4K4I5_DROMO/267-503    AC B4K4I5.1
#=GS E5SIG0_TRISP/214-437    AC E5SIG0.1
#=GS H9GN16_ANOCA/273-331    AC H9GN16.1
#=GS Q3SZQ1_BOVIN/274-499    AC Q3SZQ1.1
#=GS E0VPY0_PEDHC/229-448    AC E0VPY0.1
#=GS B4JI10_DROGR/271-508    AC B4JI10.1
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