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Database: Pfam
Entry: OmpA_membrane
LinkDB: OmpA_membrane
Original site: OmpA_membrane 
#=GF ID   OmpA_membrane
#=GF AC   PF01389.12
#=GF DE   OmpA-like transmembrane domain
#=GF AU   Bateman A
#=GF SE   Bateman A
#=GF GA   20.20 20.20;
#=GF TC   20.20 20.20;
#=GF NC   20.10 20.10;
#=GF BM   hmmbuild --amino HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 23193494 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF WK   OmpA-like_transmembrane_domain
#=GF RN   [1]
#=GF RM   9808047
#=GF RT   Structure of the outer membrane protein A transmembrane domain. 
#=GF RA   Pautsch A, Schulz GE; 
#=GF RL   Nat Struct Biol 1998;5:1013-1017.
#=GF DR   INTERPRO; IPR000498;
#=GF DR   SCOP; 1bxw; fa;
#=GF DR   TC; 1.B.6;
#=GF CC   The structure of OmpA transmembrane domain shows that it
#=GF CC   consists of an eight stranded beta barrel [1]. This family
#=GF CC   includes some other distantly related outer membrane proteins
#=GF CC   with low scores.
#=GF SQ   1301
#=GS C6S313_VIBCL/18-173     AC C6S313.1
#=GS E7W6Q4_SALMO/42-218     AC E7W6Q4.1
#=GS D7YLJ1_ECOLX/31-207     AC D7YLJ1.1
#=GS F0LVS5_VIBFN/34-192     AC F0LVS5.1
#=GS Q93QL8_ERWCA/1-84       AC Q93QL8.1
#=GS G2C1X7_ECOLX/23-199     AC G2C1X7.1
#=GS G7CWD5_AERSA/23-183     AC G7CWD5.1
#=GS A1EJS9_VIBCL/18-173     AC A1EJS9.1
#=GS A7K5D9_VIBSE/17-171     AC A7K5D9.1
#=GS C8SY27_KLEPR/31-213     AC C8SY27.1
#=GS B2PKE9_ECO57/31-203     AC B2PKE9.1
#=GS H3LL07_KLEOX/23-205     AC H3LL07.1
#=GS G7TNM6_VIBCL/18-173     AC G7TNM6.1
#=GS H0LUH9_SALMO/23-199     AC H0LUH9.1
#=GS C6AMX5_AGGAN/25-229     AC C6AMX5.1
#=GS E9P6U0_SODGL/1-92       AC E9P6U0.1
#=GS D5CZC6_ECOKI/23-195     AC D5CZC6.1
#=GS B9YZJ8_9NEIS/28-224     AC B9YZJ8.1
#=GS Q65T83_MANSM/23-212     AC Q65T83.1
#=GS G4A791_AGGAC/26-222     AC G4A791.1
#=GS F4D808_AERVB/22-187     AC F4D808.1
#=GS H5DYE9_ECOLX/23-195     AC H5DYE9.1
#=GS B6I931_ECOSE/23-195     AC B6I931.1
#=GS D0WVH1_VIBAL/21-182     AC D0WVH1.1
#=GS D9P8G3_ACTPL/21-227     AC D9P8G3.1
#=GS E3XYK2_SHIFL/23-199     AC E3XYK2.1
#=GS Q9AQ64_ERWAM/1-88       AC Q9AQ64.1
#=GS C4S8Q7_YERMO/23-199     AC C4S8Q7.1
#=GS D0XGJ6_VIBHA/20-182     AC D0XGJ6.1
#=GS Q9AQ57_ERWAM/1-88       AC Q9AQ57.1
#=GS E9P6T1_SODGL/1-134      AC E9P6T1.1
#=GS C9PHA7_VIBFU/17-173     AC C9PHA7.1
#=GS H8NTL5_RAHAQ/23-206     AC H8NTL5.1
#=GS F5BBE1_PASMD/23-217     AC F5BBE1.1
#=GS E9P6S9_SODGL/1-134      AC E9P6S9.1
#=GS H4FRW8_ECOLX/1-59       AC H4FRW8.1
#=GS B8F8S4_HAEPS/23-230     AC B8F8S4.1
#=GS F0CMR8_SALMO/42-218     AC F0CMR8.1
#=GS Q2BYK3_9GAMM/22-209     AC Q2BYK3.1
#=GS D9IR15_HAEPR/23-226     AC D9IR15.1
#=GS Q6WAH6_ENTCL/1-86       AC Q6WAH6.1
#=GS F8Z0U2_VIBCL/18-173     AC F8Z0U2.1
#=GS OMPA_ESCFE/1-101        AC P0C8Z2.1
#=GS Q93QP5_9ENTR/1-87       AC Q93QP5.1
#=GS F0D0X8_SALMO/42-218     AC F0D0X8.1
#=GS E3DC53_ERWSE/23-204     AC E3DC53.1
#=GS F8VEJ3_SALBC/23-198     AC F8VEJ3.1
#=GS A4SHF1_AERS4/23-217     AC A4SHF1.1
#=GS G6E0Q4_9GAMM/51-222     AC G6E0Q4.1
#=GS D9IR01_HAEPR/23-226     AC D9IR01.1
#=GS E9A013_SALET/42-218     AC E9A013.1
#=GS B6XC18_9ENTR/23-204     AC B6XC18.1
#=GS A5KWS3_9GAMM/23-185     AC A5KWS3.1
#=GS G2S601_ENTAL/23-199     AC G2S601.1
#=GS C0L8K1_HAEPR/23-224     AC C0L8K1.1
#=GS F9RK82_9VIBR/18-174     AC F9RK82.1
#=GS E5G1K6_HAEPR/23-226     AC E5G1K6.1
#=GS OMPA_SALTI/23-199       AC Q8Z7S0.1
#=GS E6XGC6_SHEP2/3753-3925  AC E6XGC6.1
#=GS G2EZ91_ECOLX/23-195     AC G2EZ91.1
#=GS E1SQQ1_FERBD/51-223     AC E1SQQ1.1
#=GS B5FR00_SALDC/42-218     AC B5FR00.1
#=GS B0UUP0_HAES2/21-210     AC B0UUP0.1
#=GS Q9RM69_ERWCA/23-207     AC Q9RM69.1
#=GS D8MQG5_ERWBE/23-205     AC D8MQG5.1
#=GS G9SHN0_CITFR/1-32       AC G9SHN0.1
#=GS E7XKV5_SALMO/42-218     AC E7XKV5.1
#=GS H4W8B6_ECOLX/23-195     AC H4W8B6.1
#=GS C4U5S6_YERAL/23-199     AC C4U5S6.1
#=GS H5AAS5_ECOLX/23-195     AC H5AAS5.1
#=GS G4PP10_ECOLX/31-207     AC G4PP10.1
#=GS Q44299_AERSA/23-180     AC Q44299.1
#=GS E5G1J6_HAEPR/23-224     AC E5G1J6.1
#=GS H5KSY0_ECOLX/23-195     AC H5KSY0.1
#=GS G5X4R6_ECOLX/23-195     AC G5X4R6.1
#=GS G0GID1_KLEPN/23-205     AC G0GID1.1
#=GS D2KAR8_AERHY/22-191     AC D2KAR8.1
#=GS A0KRJ3_SHESA/3361-3533  AC A0KRJ3.1
#=GS D9P5M5_ACTPL/21-224     AC D9P5M5.1
#=GS Q93QP3_ERWCA/1-84       AC Q93QP3.1
#=GS G8Z7X4_SALCE/23-199     AC G8Z7X4.1
#=GS E8GAY4_SALMO/42-218     AC E8GAY4.1
#=GS F0JLB8_ESCFE/31-208     AC F0JLB8.1
#=GS A0KHS0_AERHH/23-183     AC A0KHS0.1
#=GS G3ZIJ0_AGGAC/23-212     AC G3ZIJ0.1
#=GS G5QGZ6_SALRU/42-218     AC G5QGZ6.1
#=GS D9IR02_HAEPR/23-226     AC D9IR02.1
#=GS G7CXR1_AERSA/23-217     AC G7CXR1.1
#=GS G7AFE6_VIBCL/18-173     AC G7AFE6.1
#=GS A5A4X3_EDWTA/23-199     AC A5A4X3.1
#=GS E3G185_ENTCS/34-210     AC E3G185.1
#=GS B6EMK0_ALISL/45-213     AC B6EMK0.1
#=GS C1M9N4_9ENTR/31-205     AC C1M9N4.1
#=GS F9B368_VIBCL/18-173     AC F9B368.1
#=GS G4AF55_AGGAC/23-212     AC G4AF55.1
#=GS A3N3E8_ACTP2/21-224     AC A3N3E8.1
#=GS A6B082_VIBPA/21-182     AC A6B082.1
#=GS C4HEE9_YERPE/23-201     AC C4HEE9.1
#=GS G5M1L1_SALET/42-218     AC G5M1L1.1
#=GS B5PK31_SALET/42-218     AC B5PK31.1
#=GS G0DZM1_ENTAK/23-199     AC G0DZM1.1
#=GS G8FVK1_PASHA/1-142      AC G8FVK1.1
#=GS B3PCH6_CELJU/27-189     AC B3PCH6.1
#=GS E7V0U5_SALTM/31-207     AC E7V0U5.1
#=GS F9ARX6_VIBCL/18-173     AC F9ARX6.1
#=GS I0A7W0_SALET/31-207     AC I0A7W0.1
#=GS E9YB06_ECOLX/23-195     AC E9YB06.1
#=GS Q93QN8_ERWCH/1-84       AC Q93QN8.1
#=GS H4LA19_ECOLX/23-195     AC H4LA19.1
#=GS Q4QLD3_HAEI8/23-224     AC Q4QLD3.1
#=GS G3ZYA7_AGGAC/23-212     AC G3ZYA7.1
#=GS F8ZBG5_VIBCL/18-173     AC F8ZBG5.1
#=GS E6T068_SHEB6/3240-3411  AC E6T068.1
#=GS Q93QR3_9ENTR/1-88       AC Q93QR3.1
#=GS H4QEC7_ECOLX/23-195     AC H4QEC7.1
#=GS G8FVK9_PASHA/2-143      AC G8FVK9.1
#=GS I0ZQ05_ECOLX/31-203     AC I0ZQ05.1
#=GS H0NDG6_SALET/42-218     AC H0NDG6.1
#=GS C9XEB3_SALTD/23-199     AC C9XEB3.1
#=GS D4BBQ9_9ENTR/31-209     AC D4BBQ9.1
#=GS G4BCW9_HAEAP/23-212     AC G4BCW9.1
#=GS Q8VPL3_PASMD/23-217     AC Q8VPL3.1
#=GS Q7N602_PHOLL/23-207     AC Q7N602.1
#=GS D3VC14_XENNA/21-210     AC D3VC14.1
#=GS OMPA_CITFR/1-96         AC P24016.1
#=GS Q8RMM0_HAEGA/23-211     AC Q8RMM0.1
#=GS Q6GUB5_PASMD/23-222     AC Q6GUB5.1
#=GS Q9AQ73_ERWAM/1-88       AC Q9AQ73.1
#=GS Q9AQ59_ERWAM/1-88       AC Q9AQ59.1
#=GS H4I916_ECOLX/23-195     AC H4I916.1
#=GS B2N584_ECOLX/23-195     AC B2N584.1
#=GS E3JGG3_BUCA3/23-207     AC E3JGG3.1
#=GS D0GRU1_VIBMI/18-173     AC D0GRU1.1
#=GS G5QY36_SALSE/42-218     AC G5QY36.1
#=GS C9Y0P8_CROTZ/31-203     AC C9Y0P8.1
#=GS H5PWF6_ECOLX/23-195     AC H5PWF6.1
#=GS D0I132_VIBCL/18-173     AC D0I132.1
#=GS F0CQA2_SALMO/42-218     AC F0CQA2.1
#=GS D4BKH4_9ENTR/28-195     AC D4BKH4.1
#=GS G5LM11_SALET/31-207     AC G5LM11.1
#=GS G6ZUK1_VIBCL/18-173     AC G6ZUK1.1
#=GS A6WHP8_SHEB8/3516-3687  AC A6WHP8.1
#=GS Q8RJD0_HAEGA/23-211     AC Q8RJD0.1
#=GS B1IVX5_ECOLC/42-214     AC B1IVX5.1
#=GS A1SSS8_PSYIN/24-193     AC A1SSS8.1
#=GS Q9AQ90_ERWAM/1-88       AC Q9AQ90.1
#=GS B7T183_HAEPR/1-201      AC B7T183.1
#=GS C6DKX9_PECCP/23-212     AC C6DKX9.1
#=GS F0CJN5_SALMO/42-218     AC F0CJN5.1
#=GS E8EUE1_SALMO/42-218     AC E8EUE1.1
#=GS B5P6P7_SALET/42-218     AC B5P6P7.1
#=GS H5CJB5_ECOLX/23-195     AC H5CJB5.1
#=GS D5CE97_ENTCC/31-207     AC D5CE97.1
#=GS Q1ZV53_PHOAS/22-194     AC Q1ZV53.1
#=GS A8H1G5_SHEPA/24-198     AC A8H1G5.1
#=GS F5MJS0_SHIFL/23-199     AC F5MJS0.1
#=GS H5EEK1_ECOLX/23-195     AC H5EEK1.1
#=GS I0MGQ8_SALET/23-199     AC I0MGQ8.1
#=GS H4J5W2_ECOLX/23-195     AC H4J5W2.1
#=GS F5PNQ3_SHIFL/23-199     AC F5PNQ3.1
#=GS D0FMB9_HAEPR/23-224     AC D0FMB9.1
#=GS E1EHP5_VIBPA/17-171     AC E1EHP5.1
#=GS E3JHY4_BUCAF/23-207     AC E3JHY4.1
#=GS H5W598_SALEN/42-218     AC H5W598.1
#=GS E5B445_ERWAM/23-204     AC E5B445.1
#=GS A1S415_SHEAM/25-199     AC A1S415.1
#=GS G8IFA1_AERHY/22-192     AC G8IFA1.1
#=GS OMP51_HAEIN/23-218      AC P43840.1
#=GS F5S1I1_9ENTR/23-203     AC F5S1I1.1
#=GS H1EKH5_ECOLX/23-195     AC H1EKH5.1
#=GS E0EB06_ACTPL/21-224     AC E0EB06.1
#=GS B3H2D9_ACTP7/21-228     AC B3H2D9.1
#=GS H1DQL1_ECOLX/23-199     AC H1DQL1.1
#=GS Q5ETV7_ENTCL/1-91       AC Q5ETV7.1
#=GS E5G1L3_HAEPR/23-226     AC E5G1L3.1
#=GS C0L8J7_HAEPR/23-225     AC C0L8J7.1
#=GS E0WAB3_ECOLX/1-153      AC E0WAB3.1
#=GS B5XY48_KLEP3/23-199     AC B5XY48.1
#=GS A5JTV5_SALDU/1-78       AC A5JTV5.1
#=GS D0HJR2_VIBMI/18-173     AC D0HJR2.1
#=GS Q6TRS4_HAEGA/23-212     AC Q6TRS4.1
#=GS A5LHW6_9GAMM/22-188     AC A5LHW6.1
#=GS H4RCB5_ECOLX/23-195     AC H4RCB5.1
#=GS G4B7R0_AGGAC/22-211     AC G4B7R0.1
#=GS Q93QS2_ERWAM/1-88       AC Q93QS2.1
#=GS E9TEL5_ECOLX/31-203     AC E9TEL5.1
#=GS Q93QM7_9ENTR/1-84       AC Q93QM7.1
#=GS Q8RMM1_HAEGA/23-211     AC Q8RMM1.1
#=GS D0H3C7_VIBCL/18-173     AC D0H3C7.1
#=GS I0QTZ3_9ENTR/23-204     AC I0QTZ3.1
#=GS Q6D6D4_ERWCT/23-212     AC Q6D6D4.1
#=GS E8Y2U5_ECOKO/23-195     AC E8Y2U5.1
#=GS Q6XAY6_PASHA/21-238     AC Q6XAY6.1
#=GS E0F713_ACTPL/21-224     AC E0F713.1
#=GS E1SIX9_PANVC/23-204     AC E1SIX9.1
#=GS H4N3D6_ECOLX/23-195     AC H4N3D6.1
#=GS H9C4P7_PASMD/29-223     AC H9C4P7.1
#=GS H2IJJ4_9VIBR/21-182     AC H2IJJ4.1
#=GS D9PCK8_ACTPL/21-224     AC D9PCK8.1
#=GS E9UKU4_ECOLX/23-195     AC E9UKU4.1
#=GS Q93QQ7_9ENTR/1-87       AC Q93QQ7.1
#=GS I1BF62_ECOLX/31-207     AC I1BF62.1
#=GS F2FN95_SALDU/31-207     AC F2FN95.1
#=GS H5I249_ECOLX/23-195     AC H5I249.1
#=GS B1EPI7_9ESCH/31-207     AC B1EPI7.1
#=GS Q93QP6_9ENTR/1-87       AC Q93QP6.1
#=GS A8VTC9_ECOLX/31-207     AC A8VTC9.1
#=GS G3Z8L7_AGGAC/23-212     AC G3Z8L7.1
#=GS Q6WAF8_KLEPN/1-91       AC Q6WAF8.1
#=GS D9IQZ8_HAEPR/23-226     AC D9IQZ8.1
#=GS A4NSJ2_HAEIF/23-226     AC A4NSJ2.1
#=GS D1RPA0_SEROD/23-206     AC D1RPA0.1
#=GS A6BSI4_YERPE/23-201     AC A6BSI4.1
#=GS B7MIB0_ECO45/23-195     AC B7MIB0.1
#=GS A9R2M9_YERPG/23-201     AC A9R2M9.1
#=GS Q9AQ82_ERWAM/1-88       AC Q9AQ82.1
#=GS C9P7K0_VIBME/37-208     AC C9P7K0.1
#=GS Q6QT47_SALGL/5-174      AC Q6QT47.1
#=GS D8BH89_ECOLX/31-203     AC D8BH89.1
#=GS D9IQZ4_HAEPR/23-228     AC D9IQZ4.1
#=GS H4WP48_ECOLX/23-199     AC H4WP48.1
#=GS E0FP51_ACTPL/21-228     AC E0FP51.1
#=GS H5UWZ5_ESCHE/23-199     AC H5UWZ5.1
#=GS Q49P72_ECOLX/23-199     AC Q49P72.1
#=GS Q6WAI3_CITFR/1-86       AC Q6WAI3.1
#=GS Q87RL4_VIBPA/17-171     AC Q87RL4.1
#=GS E9WRD3_ECOLX/23-195     AC E9WRD3.1
#=GS H2ILJ3_9VIBR/46-217     AC H2ILJ3.1
#=GS Q93QN9_9ENTR/1-87       AC Q93QN9.1
#=GS D7ZG33_ECOLX/31-207     AC D7ZG33.1
#=GS A9YXV9_AERHY/22-187     AC A9YXV9.1
#=GS E9P6S6_SODGL/1-89       AC E9P6S6.1
#=GS C3LPL7_VIBCM/18-173     AC C3LPL7.1
#=GS A4W8W9_ENT38/23-199     AC A4W8W9.1
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#=GS C9QZB9_ECOD1/23-195     AC C9QZB9.1
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