#=GF ID Orbi_VP6
#=GF AC PF01516.20
#=GF DE Orbivirus helicase VP6
#=GF AU Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF SE Pfam-B_765 (release 4.0)
#=GF GA 22.60 22.60;
#=GF TC 22.70 24.20;
#=GF NC 19.80 22.50;
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch --cpu 4 -E 1000 -Z 75585367 HMM pfamseq
#=GF TP Family
#=GF RN [1]
#=GF RM 9311795
#=GF RT Bluetongue virus VP6 protein binds ATP and exhibits an
#=GF RT RNA-dependent ATPase function and a helicase activity that
#=GF RT catalyze the unwinding of double-stranded RNA substrates.
#=GF RA Stauber N, Martinez-Costas J, Sutton G, Monastyrskaya K, Roy P;
#=GF RL J Virol 1997;71:7220-7226.
#=GF DR INTERPRO; IPR001399;
#=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC The VP6 protein a minor protein in the core of the virion is
#=GF CC probably the viral helicase [1].
#=GF SQ 36
#=GS V9SCP7_9VIRU/6-360 AC V9SCP7.1
#=GS A0A0K1TPJ3_9VIRU/83-253 AC A0A0K1TPJ3.1
#=GS I6ZLX6_9VIRU/6-329 AC I6ZLX6.1
#=GS A0A1V0CJY3_9VIRU/1-270 AC A0A1V0CJY3.1
#=GS A0A0H4M3R5_9VIRU/221-313 AC A0A0H4M3R5.1
#=GS S6C3C2_9VIRU/248-340 AC S6C3C2.1
#=GS A0A0H4M944_9VIRU/226-314 AC A0A0H4M944.1
#=GS M1GUX0_9VIRU/191-287 AC M1GUX0.1
#=GS A0A109RY65_9VIRU/180-272 AC A0A109RY65.1
#=GS U3RA86_9VIRU/6-329 AC U3RA86.1
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#=GS VP6A_BTV10/6-329 AC Q98829.3
#=GS A0A0H4M6T3_9VIRU/268-346 AC A0A0H4M6T3.1
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#=GS A0A0N9LV86_AHSV7/274-369 AC A0A0N9LV86.1
#=GS Q2YH48_9VIRU/6-106 AC Q2YH48.1
#=GS A0A097I4H5_9VIRU/6-330 AC A0A097I4H5.1
#=GS Q2YH48_9VIRU/245-337 AC Q2YH48.1
#=GS A0A346RV23_9VIRU/260-353 AC A0A346RV23.1
#=GS W5QLW6_9VIRU/214-312 AC W5QLW6.1
#=GS U5NXR9_9VIRU/6-190 AC U5NXR9.1
#=GS A0A173G2X5_9VIRU/246-332 AC A0A173G2X5.1
#=GS E1AA97_9VIRU/243-321 AC E1AA97.1
#=GS A0A109RY65_9VIRU/6-186 AC A0A109RY65.1
#=GS VP6B_BTV10/2-325 AC P33423.1
#=GS W5QLY5_9VIRU/190-286 AC W5QLY5.1
#=GS U5NDI7_9VIRU/242-334 AC U5NDI7.1
#=GS Q9DSP1_9VIRU/120-213 AC Q9DSP1.1
#=GS A0A0K1TPJ3_9VIRU/249-346 AC A0A0K1TPJ3.1
#=GS A0A077JF28_9VIRU/256-341 AC A0A077JF28.1
#=GS U5NXR9_9VIRU/185-283 AC U5NXR9.1
#=GS M1GUX0_9VIRU/6-196 AC M1GUX0.1
#=GS A0A0B5GGL5_9VIRU/272-366 AC A0A0B5GGL5.1
#=GS A0A0N7D012_AHSV2/274-369 AC A0A0N7D012.1
V9SCP7_9VIRU/6-360 ............................LLAPGDVIQRSTEELKQRRIQIHLVDWE.KE..DKGRKEETEK.........RS..E....SGGRKEKEKEKDEeTP.....SK.G.REEKKTDEK.D.A.........NEDdvRR.VDAPMGHRSSDYRSGEREKGPSDGGRDKVEGGDRNDATRTGG.DGTG.GGRWLVGSEEIAQCLQNRYGVS...IPVY...KPGSNG..TFINLEKSLQKELGFSREMAAEQTEALRTIRS.......ELKKRKMAKphAVkndvsQK....SDKKWGkaerndgvKKGEG........kDA.N.KHGgqdhdddeggkkIAESSVSS.....SE...SILDL....AVEDV...MSQKKLLSMIGGGEK.RDET.IRARETSVMLVSNSIDDVAHATAYFTAPTGDTKWKEVARAAAKKSNIMAYTS..E....E.G.DVKKNFLHLIDHL...............
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H9ZXT0_9VIRU/6-340 ............................LLAPGDVIRSIQTELKDRQISYNIKPWE.EAknESKKEEVAETadkeeggkgKE..EeekdVKREETKDTTSKG.SEekkgeDAeK.KATGSKEEKsD.ApksqeasirNVD..GF.ISAEVGFGGGS-GKASKDETAADHGRRGKATGRDKNDAGRAS.GDGN.PGQWVVATEEIARLIETRLNTN...VQVF...DKEIHT..KLVNIERGLQKELGFTKEMGAEQTEIIRSI--.......--------K..NL.....NR....GKGDQN........KRGKG.........--.-.---............-KEEKTTQ.....LS...PR--I....EIEDV...LSVKKLTTLIGGKER.THEV.IKARETSVSLVSNDVADVPNATAYFTAPTGDTNWKEVARLASTKSNIMAYSS..D....G.K.DAARELIHLIDHL...............
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Q2YH48_9VIRU/6-106 ............................LLTPGDVILQCQELLKTRGIQTKLKEW-.--..EGMSKDKKSE.........QG..E....TKEESTLDGKNDT.TL.....LE.Q.RKDGGSSTS.D.Q.........ERN..SK.QKTE-RFGTSKNGSNERIS-----------------------.----.----------------------...----...------..--------------------------------.......---------..--.....--....------........-----.........--.-.---............--------.....--...-----....-----...---------------.----.----------------------------------------------------..-....-.-.-------------sagsgtvpv......
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Q2YH48_9VIRU/245-337 .........................nvr----------------------------.--..----------.........--..-....-------------.--.....--.-.---------.-.-.........---..--.------------------------------------------.----.----------------------...----...------..--------------------------------.......---------..--.....--....------........-----.........--.-.---............--------.....--...-----....----V...DSEKGLMDLTNATRK.EKGR.VTSTQTRVHLVTNDPAFVDRAHAIFTAPTGDPGWKDLAREATKRANIRAYVY.kP....G.G.DVS----------lqealatlldv....
A0A346RV23_9VIRU/260-353 ......................dvqflr----------------------------.--..----------.........--..-....-------------.--.....--.-.---------.-.-.........---..--.------------------------------------------.----.----------------------...----...------..--------------------------------.......---------..--.....--....------........-----.........--.-.---............--------.....--...-----....----V...DSEKGLREIFGKEKQ.KADS.KSILKTRVTLITNKKEMVNKAHALFSAPTGDTQWKEVARLATKRPNIRAYVY..S....P.A.D------------gvslvealstll...
W5QLW6_9VIRU/214-312 .......................mdksl----------------------------.--..----------.........--..-....-------------.--.....--.-.---------.-.-.........---..--.------------------------------------------.----.----------------------...----...------..--------------------------------.......---------..--.....--....------........-----.........--.-.---............--------.....--...-----....KVQNV...ASKAKARMIFGGKDS.DVPGaTQLRESVIRHVSNRLEDVPKAIALFTAPTGDTGWKEVAKAAGKHPNIRAYVH..T....G.EeDPIKPFLNLIDHI...............
U5NXR9_9VIRU/6-190 ............................LLVPGDLIEKIRPELSDRQIQVDLVGWKpER..EENAEETTPA.........KE..E....SHTG----GLGEK.DA.....GG.G.KEK--KEEK.A.G.........DKE..NR.ERSEQKEGGIKKDAGPGGGGDDRGGDGVVGNADG--GHGVGA.EGAG.GKRMVVMTEDIARKIKQKIGVD...VQVY...PAE--G..TVLFLERHVQNELLMDKESAAQQQEVFKTIQK.......MGK------..--.....--....------........-----.........--.-.---............--------.....--...-----....-----...---------------.----.----------------------------------------------------..-....-.-.-------------kdqk...........
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E1AA97_9VIRU/243-321 ..............neefpikkrerqhl----------------------------.--..----------.........--..-....-------------.--.....--.-.---------.-.-.........---..--.------------------------------------------.----.----------------------...----...------..--------------------------------.......---------..--.....--....------........-----.........--.-.---............--------.....--...-----....-----...---------------.----.-----TPVVLVTNDPQYVQRAHILYTAPTGDLSWKETARKATQRRDIRAYAY..G....E.H.DK-----------spgealltlvdal..
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