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Database: Pfam
Entry: PF10447
LinkDB: PF10447
Original site: PF10447 
#=GF ID   EXOSC1
#=GF AC   PF10447.7
#=GF DE   Exosome component EXOSC1/CSL4
#=GF AU   Mistry J, Wood V
#=GF SE   Pfam-B_6887 (release 22.0)
#=GF GA   21.20 21.20;
#=GF TC   21.20 21.20;
#=GF NC   21.10 21.10;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 17690987 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF RN   [1]
#=GF RM   11719186
#=GF RT   AU binding proteins recruit the exosome to degrade
#=GF RT   ARE-containing mRNAs. 
#=GF RA   Chen CY, Gherzi R, Ong SE, Chan EL, Raijmakers R, Pruijn GJ,
#=GF RA   Stoecklin G, Moroni C, Mann M, Karin M; 
#=GF RL   Cell. 2001;107:451-464.
#=GF DR   INTERPRO; IPR019495;
#=GF CC   This family of proteins are components of the exosome 3'->5'
#=GF CC   exoribonuclease complex.  The exosome mediates degradation of
#=GF CC   unstable mRNAs that contain AU-rich elements (AREs) within their
#=GF CC   3' untranslated regions [1].
#=GF SQ   596
#=GS K1QVP7_CRAGI/87-131       AC K1QVP7.1
#=GS G6DRB9_DANPL/99-142       AC G6DRB9.1
#=GS A0A0G2ECQ0_9PEZI/90-124   AC A0A0G2ECQ0.1
#=GS B8NM17_ASPFN/99-204       AC B8NM17.1
#=GS W5G013_WHEAT/81-152       AC W5G013.1
#=GS K3VPA9_FUSPC/112-155      AC K3VPA9.1
#=GS G7Y5M9_CLOSI/130-173      AC G7Y5M9.1
#=GS Q5E9E9_BOVIN/91-135       AC Q5E9E9.1
#=GS R1EQT0_EMIHU/104-146      AC R1EQT0.1
#=GS A0DQZ2_PARTE/83-127       AC A0DQZ2.1
#=GS J3LIB9_ORYBR/101-146      AC J3LIB9.1
#=GS U6N0J4_9EIME/93-135       AC U6N0J4.1
#=GS A0A0L0P6V8_9ASCO/105-222  AC A0A0L0P6V8.1
#=GS K4BS19_SOLLC/100-146      AC K4BS19.1
#=GS W5PKA0_SHEEP/91-135       AC W5PKA0.1
#=GS X0D0M3_FUSOX/112-155      AC X0D0M3.1
#=GS A0A067TPH1_9AGAR/86-131   AC A0A067TPH1.1
#=GS B7G2P0_PHATC/115-153      AC B7G2P0.1
#=GS S2JMC7_MUCC1/93-136       AC S2JMC7.1
#=GS A0A0F8DDY6_CERFI/107-154  AC A0A0F8DDY6.1
#=GS A0A078F264_BRANA/91-136   AC A0A078F264.1
#=GS W4YEC4_STRPU/57-91        AC W4YEC4.1
#=GS A0A044SUV3_ONCVO/113-157  AC A0A044SUV3.1
#=GS Q9VKJ4_DROME/95-139       AC Q9VKJ4.1
#=GS F4RVF4_MELLP/107-151      AC F4RVF4.1
#=GS S3BWZ1_OPHP1/99-133       AC S3BWZ1.1
#=GS C6HKK2_AJECH/134-236      AC C6HKK2.1
#=GS G0VHY5_NAUCC/108-213      AC G0VHY5.1
#=GS A0A0N1H985_9EURO/92-149   AC A0A0N1H985.1
#=GS G9MDX8_HYPVG/110-155      AC G9MDX8.1
#=GS K1X3G2_MARBU/118-161      AC K1X3G2.1
#=GS D2A4N8_TRICA/89-134       AC D2A4N8.1
#=GS T1IIZ2_STRMM/89-134       AC T1IIZ2.1
#=GS R0JMY0_ANAPL/1-32         AC R0JMY0.1
#=GS A0A0N4VHL9_ENTVE/115-159  AC A0A0N4VHL9.1
#=GS A0A093ZJF5_9PEZI/124-165  AC A0A093ZJF5.1
#=GS A0A0G0A884_TRIHA/108-155  AC A0A0G0A884.1
#=GS G2Q7S4_MYCTT/138-183      AC G2Q7S4.1
#=GS M7NKM7_PNEMU/102-144      AC M7NKM7.1
#=GS A4S034_OSTLU/2-37         AC A4S034.1
#=GS L8FYJ3_PSED2/124-165      AC L8FYJ3.1
#=GS A0A067RQ47_ZOONE/82-125   AC A0A067RQ47.1
#=GS D8LF37_ECTSI/94-137       AC D8LF37.1
#=GS A0A084FX79_9PEZI/112-157  AC A0A084FX79.1
#=GS F6PUU2_HORSE/91-135       AC F6PUU2.1
#=GS A0A0K8L3R7_9EURO/92-197   AC A0A0K8L3R7.1
#=GS J3P1B9_GAGT3/124-167      AC J3P1B9.1
#=GS A0A0A1NLI9_9FUNG/93-136   AC A0A0A1NLI9.1
#=GS Q7Q3V5_ANOGA/98-142       AC Q7Q3V5.3
#=GS F0LJK0_THEBM/70-130       AC F0LJK0.1
#=GS A0A072VY32_MEDTR/97-141   AC A0A072VY32.1
#=GS K1X3G2_MARBU/90-123       AC K1X3G2.1
#=GS U7Q4Y5_SPOS1/105-139      AC U7Q4Y5.1
#=GS A0A074VI77_9PEZI/99-144   AC A0A074VI77.1
#=GS A0A094E906_9PEZI/94-128   AC A0A094E906.1
#=GS B6Q6A9_TALMQ/99-194       AC B6Q6A9.1
#=GS F2KQH1_ARCVS/54-175       AC F2KQH1.1
#=GS S8A8G3_DACHA/108-151      AC S8A8G3.1
#=GS U1HRH6_ENDPU/102-159      AC U1HRH6.1
#=GS V9EFS0_PHYPR/90-134       AC V9EFS0.1
#=GS A0A094E906_9PEZI/124-165  AC A0A094E906.1
#=GS W1QFJ0_OGAPD/102-155      AC W1QFJ0.1
#=GS Q4WVW3_ASPFU/91-196       AC Q4WVW3.1
#=GS EXOS1_HUMAN/90-135        AC Q9Y3B2.1
#=GS EXOS1_HUMAN/90-135        DR PDB; 2NN6 I; 90-135;
#=GS I0Z3L8_9CHLO/93-137       AC I0Z3L8.1
#=GS E1FM75_LOALO/113-157      AC E1FM75.1
#=GS A0A0G4MKX7_9PEZI/115-158  AC A0A0G4MKX7.1
#=GS B0W7Q9_CULQU/101-144      AC B0W7Q9.1
#=GS D0NYI6_PHYIT/90-134       AC D0NYI6.1
#=GS A0A0D2U312_GOSRA/97-141   AC A0A0D2U312.1
#=GS A0A0P7XL36_9TELE/29-100   AC A0A0P7XL36.1
#=GS F1S8Y4_PIG/89-136         AC F1S8Y4.2
#=GS A6QYQ2_AJECN/135-236      AC A6QYQ2.1
#=GS Q1K7K5_NEUCR/117-161      AC Q1K7K5.1
#=GS A0A061FAR4_THECC/3-49     AC A0A061FAR4.1
#=GS A5DFG5_PICGU/90-209       AC A5DFG5.2
#=GS A0A0A1T3W0_9HYPO/190-232  AC A0A0A1T3W0.1
#=GS U4U4C1_DENPD/88-133       AC U4U4C1.1
#=GS A0A0D2XCF7_FUSO4/112-155  AC A0A0D2XCF7.1
#=GS A0A0A7GF25_9EURY/36-155   AC A0A0A7GF25.1
#=GS A0A067EBA0_CITSI/100-144  AC A0A067EBA0.1
#=GS A0A074T7J8_HAMHA/171-213  AC A0A074T7J8.1
#=GS E9GPY0_DAPPU/98-140       AC E9GPY0.1
#=GS C5XVV2_SORBI/102-147      AC C5XVV2.1
#=GS EXOS1_MOUSE/91-135        AC Q9DAA6.1
#=GS B9QFL0_TOXGO/171-213      AC B9QFL0.1
#=GS H9G5X2_ANOCA/44-135       AC H9G5X2.1
#=GS N1QDU1_SPHMS/106-150      AC N1QDU1.1
#=GS A2R3P4_ASPNC/104-151      AC A2R3P4.1
#=GS J4W1X2_BEAB2/112-155      AC J4W1X2.1
#=GS A0A0F0ILP0_ASPPA/99-204   AC A0A0F0ILP0.1
#=GS S3BWZ1_OPHP1/127-170      AC S3BWZ1.1
#=GS D8U6D1_VOLCA/94-140       AC D8U6D1.1
#=GS B4MWE6_DROWI/103-148      AC B4MWE6.1
#=GS S7QML5_GLOTA/85-130       AC S7QML5.1
#=GS B4QAB4_DROSI/95-139       AC B4QAB4.1
#=GS C5MFC2_CANTT/180-298      AC C5MFC2.1
#=GS A0A0F4ZEZ3_9PEZI/109-154  AC A0A0F4ZEZ3.1
#=GS W2S8K3_9EURO/88-147       AC W2S8K3.1
#=GS A1CBT8_ASPCL/95-200       AC A1CBT8.1
#=GS A0A0M0U534_9PEZI/99-131   AC A0A0M0U534.1
#=GS W7AZZ1_PLAVN/87-132       AC W7AZZ1.1
#=GS M2RCM4_CERS8/92-136       AC M2RCM4.1
#=GS A0A0F7TTP6_9EURO/88-192   AC A0A0F7TTP6.1
#=GS A2RVT9_ARATH/93-137       AC A2RVT9.1
#=GS G3JQN5_CORMM/112-155      AC G3JQN5.1
#=GS A0A0D9MKA0_9EURO/89-193   AC A0A0D9MKA0.1
#=GS F6WV46_CALJA/91-135       AC F6WV46.1
#=GS A0A094I517_9PEZI/94-128   AC A0A094I517.1
#=GS B8A4H5_DANRE/89-134       AC B8A4H5.1
#=GS H0ZHD4_TAEGU/89-134       AC H0ZHD4.1
#=GS CSL4_ARCFU/52-172         AC O30033.1
#=GS CSL4_ARCFU/52-172         DR PDB; 3M7N C; 52-172;
#=GS CSL4_ARCFU/52-172         DR PDB; 2BA1 A; 52-172;
#=GS CSL4_ARCFU/52-172         DR PDB; 2BA1 B; 52-172;
#=GS CSL4_ARCFU/52-172         DR PDB; 2BA1 C; 52-172;
#=GS CSL4_ARCFU/52-172         DR PDB; 3M7N A; 52-172;
#=GS CSL4_ARCFU/52-172         DR PDB; 3M85 C; 52-172;
#=GS CSL4_ARCFU/52-172         DR PDB; 3M85 B; 52-172;
#=GS CSL4_ARCFU/52-172         DR PDB; 3M7N B; 52-172;
#=GS CSL4_ARCFU/52-172         DR PDB; 3M85 A; 52-172;
#=GS B4KHB3_DROMO/114-157      AC B4KHB3.2
#=GS A7ED66_SCLS1/114-158      AC A7ED66.1
#=GS CSL4_SCHPO/54-87          AC O59821.2
#=GS G1T271_RABIT/91-136       AC G1T271.1
#=GS W5PK98_SHEEP/103-147      AC W5PK98.1
#=GS A0A081ID15_PLAVN/87-132   AC A0A081ID15.1
#=GS C1MR50_MICPC/100-142      AC C1MR50.1
#=GS K5WPM1_PHACS/70-113       AC K5WPM1.1
#=GS A0A0E3X0K2_METMT/130-218  AC A0A0E3X0K2.1
#=GS A0A094D3B2_9PEZI/94-128   AC A0A094D3B2.1
#=GS A0A0E9NQA1_9ASCO/72-104   AC A0A0E9NQA1.1
#=GS M0RYW4_MUSAM/104-149      AC M0RYW4.1
#=GS A2R3P4_ASPNC/80-108       AC A2R3P4.1
#=GS A0A094FKI4_9PEZI/94-128   AC A0A094FKI4.1
#=GS C5LAL5_PERM5/91-135       AC C5LAL5.1
#=GS D5GH15_TUBMM/70-111       AC D5GH15.1
#=GS G2QS55_THITE/106-140      AC G2QS55.1
#=GS Q0W8P2_METAR/60-147       AC Q0W8P2.1
#=GS A0A074XRY1_AURPU/69-103   AC A0A074XRY1.1
#=GS C5DD55_LACTC/121-226      AC C5DD55.1
#=GS A0A087SJQ6_AUXPR/95-136   AC A0A087SJQ6.1
#=GS A1DDH9_NEOFI/91-196       AC A1DDH9.1
#=GS Q5KIV2_CRYNJ/33-136       AC Q5KIV2.1
#=GS G0SE33_CHATD/96-128       AC G0SE33.1
#=GS I1ISN9_BRADI/101-146      AC I1ISN9.1
#=GS J3K258_COCIM/100-207      AC J3K258.2
#=GS G8C2F4_TETPH/124-229      AC G8C2F4.1
#=GS A0A0L6VKE0_9BASI/70-115   AC A0A0L6VKE0.1
#=GS A0A0D2VGS7_GOSRA/98-152   AC A0A0D2VGS7.1
#=GS A0A074XRY1_AURPU/98-143   AC A0A074XRY1.1
#=GS J7S880_KAZNA/88-193       AC J7S880.1
#=GS A0A078HNT5_BRANA/91-136   AC A0A078HNT5.1
#=GS I1GE22_AMPQE/93-137       AC I1GE22.1
#=GS A0A0F2LW35_SPOSC/132-176  AC A0A0F2LW35.1
#=GS A0A099P243_PICKU/100-144  AC A0A099P243.1
#=GS A0A060SPZ5_PYCCI/54-97    AC A0A060SPZ5.1
#=GS A0A061F1N6_THECC/96-140   AC A0A061F1N6.1
#=GS K7N502_SOYBN/69-113       AC K7N502.1
#=GS G2YQW2_BOTF4/85-118       AC G2YQW2.1
#=GS W6Q4X9_PENRO/90-194       AC W6Q4X9.1
#=GS L0P8J6_PNEJ8/157-190      AC L0P8J6.1
#=GS A4S034_OSTLU/31-74        AC A4S034.1
#=GS A0A096UB73_MAIZE/1-57     AC A0A096UB73.1
#=GS U9UEB1_RHIID/93-136       AC U9UEB1.1
#=GS F6WG19_ORNAN/1-66         AC F6WG19.1
#=GS M7AXW8_CHEMY/43-88        AC M7AXW8.1
#=GS S8CZ41_9LAMI/1-32         AC S8CZ41.1
#=GS V4KMU5_EUTSA/92-136       AC V4KMU5.1
#=GS H2XUI3_CIOIN/93-135       AC H2XUI3.1
#=GS A0A0G2ECQ0_9PEZI/118-155  AC A0A0G2ECQ0.1
#=GS A3LXJ2_PICST/119-238      AC A3LXJ2.1
#=GS Q8PVT1_METMA/187-247      AC Q8PVT1.1
#=GS A0A0D9R0N6_CHLSB/90-135   AC A0A0D9R0N6.1
#=GS F4PJ13_DICFS/119-163      AC F4PJ13.1
#=GS A0A067EEZ8_CITSI/100-144  AC A0A067EEZ8.1
#=GS A0A099P243_PICKU/128-190  AC A0A099P243.1
#=GS J9JCJ5_9SPIT/106-149      AC J9JCJ5.1
#=GS L5MBN7_MYODS/91-135       AC L5MBN7.1
#=GS G4M024_SCHMA/92-135       AC G4M024.1
#=GS F7EG84_MACMU/90-135       AC F7EG84.1
#=GS G3XNG8_ASPNA/93-198       AC G3XNG8.1
#=GS B7PWL4_IXOSC/85-130       AC B7PWL4.1
#=GS A9TGH6_PHYPA/95-139       AC A9TGH6.1
#=GS E3QG00_COLGM/115-158      AC E3QG00.1
#=GS A0A063BQ27_9HYPO/108-155  AC A0A063BQ27.1
#=GS A0A0N4TRE3_BRUPA/114-158  AC A0A0N4TRE3.1
#=GS A1RXJ7_THEPD/61-144       AC A1RXJ7.1
#=GS A0A094FKI4_9PEZI/124-165  AC A0A094FKI4.1
#=GS W9VSW1_9EURO/100-158      AC W9VSW1.1
#=GS U6M3Q3_EIMMA/12-83        AC U6M3Q3.1
#=GS M2NGL9_BAUCO/89-143       AC M2NGL9.1
#=GS U5FWI7_POPTR/62-98        AC U5FWI7.1
#=GS W3X0P0_9PEZI/83-115       AC W3X0P0.1
#=GS R9AIE2_WALI9/82-133       AC R9AIE2.1
#=GS A0A0N5CKQ8_THECL/54-151   AC A0A0N5CKQ8.1
#=GS R0IRK4_SETT2/115-157      AC R0IRK4.1
#=GS K2RLH0_MACPH/85-118       AC K2RLH0.1
#=GS D8M394_BLAHO/90-134       AC D8M394.1
#=GS R1E9W2_BOTPV/82-115       AC R1E9W2.1
#=GS D1YYQ5_METPS/61-151       AC D1YYQ5.1
#=GS L8FYJ3_PSED2/94-128       AC L8FYJ3.1
#=GS W9RT30_9ROSA/98-141       AC W9RT30.1
#=GS A0A0B1P646_UNCNE/134-176  AC A0A0B1P646.1
#=GS I2GXL1_TETBL/138-243      AC I2GXL1.1
#=GS B3S3C6_TRIAD/91-136       AC B3S3C6.1
#=GS I4Y8J2_WALMC/85-132       AC I4Y8J2.1
#=GS CSL4_SCHPO/83-125         AC O59821.2
#=GS D4B4G2_ARTBC/90-194       AC D4B4G2.1
#=GS A0A066VBE1_9BASI/103-209  AC A0A066VBE1.1
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#=GS G7XV15_ASPKW/93-198       AC G7XV15.1
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#=GS B1AMU3_HUMAN/32-110       AC B1AMU3.1
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#=GS W3X0P0_9PEZI/110-154      AC W3X0P0.1
#=GS S3E452_GLAL2/121-164      AC S3E452.1
#=GS T0QBP9_9STRA/89-132       AC T0QBP9.1
#=GS C4JV07_UNCRE/100-205      AC C4JV07.1
#=GS I3KMF1_ORENI/90-135       AC I3KMF1.1
#=GS A0A0B0MMJ8_GOSAR/97-141   AC A0A0B0MMJ8.1
#=GS Q7RSM3_PLAYO/88-133       AC Q7RSM3.1
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