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Database: Pfam
Entry: PF10447
LinkDB: PF10447
Original site: PF10447 
#=GF ID   EXOSC1
#=GF AC   PF10447.8
#=GF DE   Exosome component EXOSC1/CSL4
#=GF AU   Mistry J, Wood V
#=GF SE   Pfam-B_6887 (release 22.0)
#=GF GA   21.20 21.20;
#=GF TC   21.20 21.20;
#=GF NC   21.10 21.10;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 26740544 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF RN   [1]
#=GF RM   11719186
#=GF RT   AU binding proteins recruit the exosome to degrade
#=GF RT   ARE-containing mRNAs. 
#=GF RA   Chen CY, Gherzi R, Ong SE, Chan EL, Raijmakers R, Pruijn GJ,
#=GF RA   Stoecklin G, Moroni C, Mann M, Karin M; 
#=GF RL   Cell. 2001;107:451-464.
#=GF DR   INTERPRO; IPR019495;
#=GF CC   This family of proteins are components of the exosome 3'->5'
#=GF CC   exoribonuclease complex.  The exosome mediates degradation of
#=GF CC   unstable mRNAs that contain AU-rich elements (AREs) within their
#=GF CC   3' untranslated regions [1].
#=GF SQ   794
#=GS K1QVP7_CRAGI/87-131         AC K1QVP7.1
#=GS G6DRB9_DANPL/99-142         AC G6DRB9.1
#=GS A0A0G2ECQ0_9PEZI/90-124     AC A0A0G2ECQ0.1
#=GS B8NM17_ASPFN/99-204         AC B8NM17.1
#=GS W5G013_WHEAT/81-152         AC W5G013.1
#=GS K3VPA9_FUSPC/112-155        AC K3VPA9.1
#=GS G7Y5M9_CLOSI/130-173        AC G7Y5M9.1
#=GS A0A014QXL0_9HYPO/112-155    AC A0A014QXL0.1
#=GS Q5E9E9_BOVIN/91-135         AC Q5E9E9.1
#=GS A0A0D2AB60_9PEZI/66-99      AC A0A0D2AB60.1
#=GS R1EQT0_EMIHU/104-146        AC R1EQT0.1
#=GS A0DQZ2_PARTE/83-127         AC A0DQZ2.1
#=GS J3LIB9_ORYBR/101-146        AC J3LIB9.1
#=GS U6N0J4_9EIME/93-135         AC U6N0J4.1
#=GS A0A158NN48_ATTCE/94-137     AC A0A158NN48.1
#=GS A0A0F7ZZG9_9HYPO/112-155    AC A0A0F7ZZG9.1
#=GS A0A0L0P6V8_9ASCO/105-222    AC A0A0L0P6V8.1
#=GS K4BS19_SOLLC/100-146        AC K4BS19.1
#=GS W5PKA0_SHEEP/91-135         AC W5PKA0.1
#=GS J4HSK5_9APHY/86-130         AC J4HSK5.1
#=GS X0D0M3_FUSOX/112-155        AC X0D0M3.1
#=GS A0A067TPH1_9AGAR/86-131     AC A0A067TPH1.1
#=GS B7G2P0_PHATC/115-153        AC B7G2P0.1
#=GS S2JMC7_MUCC1/93-136         AC S2JMC7.1
#=GS A0A0P1BHS1_9BASI/67-162     AC A0A0P1BHS1.1
#=GS A0A0R3SK84_HYMDI/98-139     AC A0A0R3SK84.1
#=GS A0A0F8DDY6_CERFI/107-154    AC A0A0F8DDY6.1
#=GS A0A078F264_BRANA/91-136     AC A0A078F264.1
#=GS W4YEC4_STRPU/57-91          AC W4YEC4.1
#=GS A0A044SUV3_ONCVO/113-157    AC A0A044SUV3.1
#=GS A0A093H5C8_PICPB/89-133     AC A0A093H5C8.1
#=GS Q9VKJ4_DROME/95-139         AC Q9VKJ4.1
#=GS F4RVF4_MELLP/107-151        AC F4RVF4.1
#=GS S3BWZ1_OPHP1/99-133         AC S3BWZ1.1
#=GS C6HKK2_AJECH/134-236        AC C6HKK2.1
#=GS G0VHY5_NAUCC/108-213        AC G0VHY5.1
#=GS A0A0N1H985_9EURO/92-149     AC A0A0N1H985.1
#=GS G9MDX8_HYPVG/110-155        AC G9MDX8.1
#=GS B6YTH5_THEON/66-124         AC B6YTH5.1
#=GS K1X3G2_MARBU/118-161        AC K1X3G2.1
#=GS D2A4N8_TRICA/89-134         AC D2A4N8.1
#=GS T1IIZ2_STRMM/89-134         AC T1IIZ2.1
#=GS A0A178B6S9_9PLEO/120-161    AC A0A178B6S9.1
#=GS R0JMY0_ANAPL/1-32           AC R0JMY0.1
#=GS A0A0N4VHL9_ENTVE/115-159    AC A0A0N4VHL9.1
#=GS A0A093ZJF5_9PEZI/124-165    AC A0A093ZJF5.1
#=GS A0A0G0A884_TRIHA/108-155    AC A0A0G0A884.1
#=GS A0A151GNK8_9HYPO/112-155    AC A0A151GNK8.1
#=GS G2Q7S4_MYCTT/138-183        AC G2Q7S4.1
#=GS M7NKM7_PNEMU/102-144        AC M7NKM7.1
#=GS A4S034_OSTLU/2-37           AC A4S034.1
#=GS L8FYJ3_PSED2/124-165        AC L8FYJ3.1
#=GS A0A067RQ47_ZOONE/82-125     AC A0A067RQ47.1
#=GS D8LF37_ECTSI/94-137         AC D8LF37.1
#=GS A0A084FX79_9PEZI/112-157    AC A0A084FX79.1
#=GS A0A135UFN0_9PEZI/115-158    AC A0A135UFN0.1
#=GS A0A0L8FLQ2_OCTBM/43-134     AC A0A0L8FLQ2.1
#=GS A0A165CPC2_EXIGL/84-128     AC A0A165CPC2.1
#=GS F6PUU2_HORSE/91-135         AC F6PUU2.1
#=GS A0A0K8L3R7_9EURO/92-197     AC A0A0K8L3R7.1
#=GS J3P1B9_GAGT3/124-167        AC J3P1B9.1
#=GS A0A0A1NLI9_9FUNG/93-136     AC A0A0A1NLI9.1
#=GS Q7Q3V5_ANOGA/98-142         AC Q7Q3V5.3
#=GS F0LJK0_THEBM/70-130         AC F0LJK0.1
#=GS A0A0R3U8F0_9CEST/14-105     AC A0A0R3U8F0.1
#=GS A0A072VY32_MEDTR/97-141     AC A0A072VY32.1
#=GS K1X3G2_MARBU/90-123         AC K1X3G2.1
#=GS A0A0W8DIH8_PHYNI/90-134     AC A0A0W8DIH8.1
#=GS U7Q4Y5_SPOS1/105-139        AC U7Q4Y5.1
#=GS A0A0L0S5X9_ALLMA/37-128     AC A0A0L0S5X9.1
#=GS A0A074VI77_9PEZI/99-144     AC A0A074VI77.1
#=GS A0A094E906_9PEZI/94-128     AC A0A094E906.1
#=GS B6Q6A9_TALMQ/99-194         AC B6Q6A9.1
#=GS F2KQH1_ARCVS/54-175         AC F2KQH1.1
#=GS S8A8G3_DACHA/108-151        AC S8A8G3.1
#=GS A0A176WMU3_MARPO/95-138     AC A0A176WMU3.1
#=GS A0A0D2C4R1_9EURO/98-152     AC A0A0D2C4R1.1
#=GS A0A177C621_9PLEO/98-153     AC A0A177C621.1
#=GS A0A0J8RXA3_COCIT/100-207    AC A0A0J8RXA3.1
#=GS U1HRH6_ENDPU/102-159        AC U1HRH6.1
#=GS V9EFS0_PHYPR/90-134         AC V9EFS0.1
#=GS A0A094E906_9PEZI/124-165    AC A0A094E906.1
#=GS W1QFJ0_OGAPD/102-155        AC W1QFJ0.1
#=GS Q4WVW3_ASPFU/91-196         AC Q4WVW3.1
#=GS EXOS1_HUMAN/90-135          AC Q9Y3B2.1
#=GS EXOS1_HUMAN/90-135          DR PDB; 2NN6 I; 90-135;
#=GS I0Z3L8_COCSC/93-137         AC I0Z3L8.1
#=GS A0A0J0XF37_9TREE/51-133     AC A0A0J0XF37.1
#=GS E1FM75_LOALO/113-157        AC E1FM75.1
#=GS A0A0G4MKX7_9PEZI/115-158    AC A0A0G4MKX7.1
#=GS W6YCW2_COCCA/115-158        AC W6YCW2.1
#=GS B0W7Q9_CULQU/101-144        AC B0W7Q9.1
#=GS D0NYI6_PHYIT/90-134         AC D0NYI6.1
#=GS A0A0Q3P8K0_AMAAE/90-135     AC A0A0Q3P8K0.1
#=GS A0A0D2U312_GOSRA/97-141     AC A0A0D2U312.1
#=GS A0A093JAR0_STRCA/42-87      AC A0A093JAR0.1
#=GS A0A0P7XL36_9TELE/29-100     AC A0A0P7XL36.1
#=GS A0A178B6S9_9PLEO/90-123     AC A0A178B6S9.1
#=GS F1S8Y4_PIG/89-136           AC F1S8Y4.2
#=GS A6QYQ2_AJECN/135-236        AC A6QYQ2.1
#=GS A0A0B7MSM0_9FUNG/93-136     AC A0A0B7MSM0.1
#=GS Q1K7K5_NEUCR/117-161        AC Q1K7K5.1
#=GS A0A061FAR4_THECC/3-49       AC A0A061FAR4.1
#=GS A5DFG5_PICGU/90-209         AC A5DFG5.2
#=GS A0A0L9THS3_PHAAN/99-143     AC A0A0L9THS3.1
#=GS A0A0A1T3W0_9HYPO/190-232    AC A0A0A1T3W0.1
#=GS U4U4C1_DENPD/88-133         AC U4U4C1.1
#=GS A0A0D2D6Z8_9EURO/97-152     AC A0A0D2D6Z8.1
#=GS A0A165UNE3_9APHY/86-130     AC A0A165UNE3.1
#=GS A0A0D2XCF7_FUSO4/112-155    AC A0A0D2XCF7.1
#=GS A0A183I7H1_9BILA/4-72       AC A0A183I7H1.1
#=GS A0A091PYL2_LEPDC/43-87      AC A0A091PYL2.1
#=GS A0A067EBA0_CITSI/100-144    AC A0A067EBA0.1
#=GS A0A178DSL9_9PLEO/123-166    AC A0A178DSL9.1
#=GS A0A074T7J8_HAMHA/171-213    AC A0A074T7J8.1
#=GS E9GPY0_DAPPU/98-140         AC E9GPY0.1
#=GS A0A061H8B6_9BASI/91-186     AC A0A061H8B6.1
#=GS A0A0D2HQ54_9EURO/95-155     AC A0A0D2HQ54.1
#=GS C5XVV2_SORBI/102-147        AC C5XVV2.1
#=GS EXOS1_MOUSE/91-135          AC Q9DAA6.1
#=GS A0A0D2IZ81_9EURO/70-113     AC A0A0D2IZ81.1
#=GS A0A0P8AJZ7_9EURY/92-154     AC A0A0P8AJZ7.1
#=GS B9QFL0_TOXGV/171-213        AC B9QFL0.1
#=GS H9G5X2_ANOCA/44-135         AC H9G5X2.1
#=GS N1QDU1_SPHMS/106-150        AC N1QDU1.1
#=GS A2R3P4_ASPNC/104-151        AC A2R3P4.1
#=GS J4W1X2_BEAB2/112-155        AC J4W1X2.1
#=GS A0A0F0ILP0_ASPPU/99-204     AC A0A0F0ILP0.1
#=GS S3BWZ1_OPHP1/127-170        AC S3BWZ1.1
#=GS D8U6D1_VOLCA/94-140         AC D8U6D1.1
#=GS A0A0C9W3C0_9HOMO/85-129     AC A0A0C9W3C0.1
#=GS B4MWE6_DROWI/103-148        AC B4MWE6.1
#=GS S7QML5_GLOTA/85-130         AC S7QML5.1
#=GS A0A091QEZ8_MERNU/40-84      AC A0A091QEZ8.1
#=GS B4QAB4_DROSI/95-139         AC B4QAB4.1
#=GS A0A0D2A2J7_9EURO/105-159    AC A0A0D2A2J7.1
#=GS C5MFC2_CANTT/180-298        AC C5MFC2.1
#=GS A0A0F4ZEZ3_9PEZI/109-154    AC A0A0F4ZEZ3.1
#=GS W2S8K3_9EURO/88-147         AC W2S8K3.1
#=GS A0A0R3RW64_9BILA/112-157    AC A0A0R3RW64.1
#=GS A1CBT8_ASPCL/95-200         AC A1CBT8.1
#=GS W7AZZ1_PLAVN/87-132         AC W7AZZ1.1
#=GS M2RCM4_CERS8/92-136         AC M2RCM4.1
#=GS A0A0F7TTP6_9EURO/88-192     AC A0A0F7TTP6.1
#=GS A2RVT9_ARATH/93-137         AC A2RVT9.1
#=GS G3JQN5_CORMM/112-155        AC G3JQN5.1
#=GS F6WV46_CALJA/91-135         AC F6WV46.1
#=GS A0A094I517_9PEZI/94-128     AC A0A094I517.1
#=GS B8A4H5_DANRE/89-134         AC B8A4H5.1
#=GS H0ZHD4_TAEGU/89-134         AC H0ZHD4.1
#=GS A0A0L0FIG8_9EUKA/105-150    AC A0A0L0FIG8.1
#=GS CSL4_ARCFU/52-172           AC O30033.1
#=GS CSL4_ARCFU/52-172           DR PDB; 3M7N C; 52-172;
#=GS CSL4_ARCFU/52-172           DR PDB; 2BA1 A; 52-172;
#=GS CSL4_ARCFU/52-172           DR PDB; 2BA1 B; 52-172;
#=GS CSL4_ARCFU/52-172           DR PDB; 2BA1 C; 52-172;
#=GS CSL4_ARCFU/52-172           DR PDB; 3M85 C; 52-172;
#=GS CSL4_ARCFU/52-172           DR PDB; 3M7N A; 52-172;
#=GS CSL4_ARCFU/52-172           DR PDB; 3M85 B; 52-172;
#=GS CSL4_ARCFU/52-172           DR PDB; 3M7N B; 52-172;
#=GS CSL4_ARCFU/52-172           DR PDB; 3M85 A; 52-172;
#=GS A0A0D0EA67_9HOMO/86-130     AC A0A0D0EA67.1
#=GS A0A0V1CIK2_TRIBR/107-150    AC A0A0V1CIK2.1
#=GS A0A162ZYG9_MUCCL/93-136     AC A0A162ZYG9.1
#=GS B4KHB3_DROMO/114-157        AC B4KHB3.2
#=GS A7ED66_SCLS1/114-158        AC A7ED66.1
#=GS A0A151F903_9EURY/60-178     AC A0A151F903.1
#=GS CSL4_SCHPO/54-87            AC O59821.2
#=GS G1T271_RABIT/91-136         AC G1T271.1
#=GS W5PK98_SHEEP/103-147        AC W5PK98.1
#=GS C1MR50_MICPC/100-142        AC C1MR50.1
#=GS K5WPM1_PHACS/70-113         AC K5WPM1.1
#=GS A0A094D3B2_9PEZI/94-128     AC A0A094D3B2.1
#=GS A0A0E9NQA1_9ASCO/72-104     AC A0A0E9NQA1.1
#=GS M0RYW4_MUSAM/104-149        AC M0RYW4.1
#=GS A2R3P4_ASPNC/80-108         AC A2R3P4.1
#=GS A0A183AIZ0_9TREM/2-63       AC A0A183AIZ0.1
#=GS A0A094FKI4_9PEZI/94-128     AC A0A094FKI4.1
#=GS C5LAL5_PERM5/91-135         AC C5LAL5.1
#=GS D5GH15_TUBMM/70-111         AC D5GH15.1
#=GS A0A166IN79_9HOMO/88-132     AC A0A166IN79.1
#=GS G2QS55_THITE/106-140        AC G2QS55.1
#=GS A0A059JJW8_9EURO/91-195     AC A0A059JJW8.1
#=GS Q0W8P2_METAR/60-147         AC Q0W8P2.1
#=GS A0A074XRY1_AURPU/69-103     AC A0A074XRY1.1
#=GS A0A164UJL0_9HOMO/88-132     AC A0A164UJL0.1
#=GS C5DD55_LACTC/121-226        AC C5DD55.1
#=GS A0A0V0W6S8_9BILA/435-479    AC A0A0V0W6S8.1
#=GS A0A087SJQ6_AUXPR/95-136     AC A0A087SJQ6.1
#=GS A1DDH9_NEOFI/91-196         AC A1DDH9.1
#=GS Q5KIV2_CRYNJ/33-136         AC Q5KIV2.1
#=GS G0SE33_CHATD/96-128         AC G0SE33.1
#=GS I1ISN9_BRADI/101-146        AC I1ISN9.1
#=GS A0A0D2IZ81_9EURO/99-152     AC A0A0D2IZ81.1
#=GS J3K258_COCIM/100-207        AC J3K258.2
#=GS G8C2F4_TETPH/124-229        AC G8C2F4.1
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