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Database: Pfam
Entry: PPV_E1_C
LinkDB: PPV_E1_C
Original site: PPV_E1_C 
#=GF ID   PPV_E1_C
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#=GF TP   Family
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#=GF DR   SCOP; 1f08; fa;
#=GF CC   This protein is a DNA helicase that is required for initiation
#=GF CC   of viral DNA replication.  This protein forms a complex with the
#=GF CC   E2 protein Pfam:PF00508.
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#=GS C6K5N6_HPV16/70-154   AC C6K5N6.1
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#=GS C6K607_HPV39/29-159   AC C6K607.1
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C6K575_HPV53/66-223              ..............................................................................................................KFKDIFGIPFSELVRTFKSDSTCCHDWICAIF.GV.NETLAEALKTIIKTQCIYYHMQCL.TC..TWG.VVILLLIRYTCGKNRKTIVKSLASILNVPTEQM.LVQPPKIRSPAVALYFYKTSI..S..NI..SDV..YGTTPEWIERQTQLQHS.-.F.ED.CQFELSKMVQWAFDN----------.----..----------------....------...------------------...........-.....---....----....----...........-......---.-...-...-..-.-...---..-...-........-....-.....-..-.....-.....-.........-.....-.........-....-.........--.---.-.....-....-....-..-.--------------------.----.-.-..-..-..-.-.---.....-...-..-..-..-.-...-..-------.--..--.-----.-..........-..........-..-.........-...........-...........-..........-..........--..........-...........-..--------.--..---------.----..-----.----..-.-........-.-........-..........-.......--.....-.....-.-........-------------.--.-----.-.---.------------------..---------....-..----------..................................................................
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Q84288_HPV56/1-52                ..............................................................................................................--------------------------------.--.------------------------.--..---.---------------------------------.---------------------..-..--..---..-----------------.-.-.--.-----------------------AF.QYAQ..LADVDSNAQAFLKSNM....QAKYVK...DCGIMCRHYKRAQQQQMN...........M.....CQW....IK--....----...........-......---.-...-...-..-.-...---..-...-........-....-.....-..-.....-.....-.........-.....-.........-....-.........--.---.-.....-....-....-..-.--------------------.----.-.-..-..-..-.-.---.....-...-..-..-..-.-...-..-------.--..--.-----.-..........-..........-..-.........-...........-...........-..........-..........--..........-...........-..--------.--..---------.----..-----.----..-.-........-.-........-..........-.......--.....-.....-.-........-------------.--.-----.-.---.------------------..---------....-..----------..................................................................
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C6K626_9PAPI/64-219              ..............................................................................................................KFKDIYGLSFMELARQFKSNRTTCLDWVICAF.GV.YCTVAEGVKTLIQQHCQYAHIQVQ.TS..NWG.MVVLMLVRYNCAKNRDTVAKCMGRLLNIPEQHM.LIEPPKIRHPAAALYWYKAGM..G..NA..SEI..IGETPEWIVRQTVVGHS.-.L.EE.CQFQLSVMVQWA-------------.----..----------------....------...------------------...........-.....---....----....----...........-......---.-...-...-..-.-...---..-...-........-....-.....-..-.....-.....-.........-.....-.........-....-.........--.---.-.....-....-....-..-.--------------------.----.-.-..-..-..-.-.---.....-...-..-..-..-.-...-..-------.--..--.-----.-..........-..........-..-.........-...........-...........-..........-..........--..........-...........-..--------.--..---------.----..-----.----..-.-........-.-........-..........-.......--.....-.....-.-........-------------.--.-----.-.---.------------------..---------....-..----------l.................................................................
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E9K6L6_HPV82/59-214              ..............................................................................................................KFKEVYGISYNELVRVFKSDRTCCTDWVCALF.GV.SPMVAENLKTLIQPFCIYYHIQCL.SC..EWG.TIVLMLARFTCAKNRLTIAKCLGTLLNIPHPQM.FIEPPKLRSTAVALYFYRTGI..S..NI..STT..FGETPEWITRQTQLQHS.-.F.DD.STFELSQMVQWAF------------.----..----------------....------...------------------...........-.....---....----....----...........-......---.-...-...-..-.-...---..-...-........-....-.....-..-.....-.....-.........-.....-.........-....-.........--.---.-.....-....-....-..-.--------------------.----.-.-..-..-..-.-.---.....-...-..-..-..-.-...-..-------.--..--.-----.-..........-..........-..-.........-...........-...........-..........-..........--..........-...........-..--------.--..---------.----..-----.----..-.-........-.-........-..........-.......--.....-.....-.-........-------------.--.-----.-.---.------------------..---------....-..----------..................................................................
H2BQA2_9PAPI/163-592             ..............................................................................................................KIKDLFGMSFNELTRCFKSNKTCSESWTIAVY.NA.REEVLEAAKISLQQHCEFFQIVL-.--..-SG.FSALFLCLFKTAKCRETVEKLFINMLSVNSMQL.LMEPPRTRSAAVSLYFFQKSL..T..NA..SFK..FGDFPDWIKKHTQFNHEaA.A.TA.DSFALAEMVQWCYDNNYTEEPIIAY.RYAL..HAECDKNAAAFLQSNH....QAKHVR...DACTMVRYYKTQEMREMS...........I.....SDW....IWKC....CDEC...........G......TEG.N...W...K..T.I...AML..F...R........Y....Q.....N..V.....N.....F.........L.....S.........F....L.........CA.LRS.F.....F....K....Q..I.PKKTCIVFYGPSDTGKSYFC.NTLV.K.F..M..H..G.K.VVS.....F...M..N..R..Q.S...H..FWLQNLI.NT..KI.GFLDD.A..........T..........L..P.........C...........W...........H..........Y..........MD..........T...........N..MRNALDGT.PV..CLDAKHKAP.TQLS..LPPLL.MTTN..V.D........V.D........K..........E.......PA.....L.....R.Y........LRTRLTIFTFPNP.LP.FNTDG.S.LVY.NITNETWASFFRKLGMQI..DLTPKDEIQ...dE..SGRSDKAFRC..................................................................
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C6K5Y2_HPV16/69-226              ..............................................................................................................KFKELYGVSFTELVRPFKSNKSTCCDWCIAAF.GL.TPSIADSIKTLLQQYCLYLHIQSL.AC..SWG.MVVLLLVRYKCGKNRETIEKLLSKLLCVSPMCM.MIEPPKLRSTAAALYWYKTGI..S..NI..SEV..YGDTPEWIQRQTVLQHS.-.F.ND.CTFELSQMVQWAFDN----------.----..----------------....------...------------------...........-.....---....----....----...........-......---.-...-...-..-.-...---..-...-........-....-.....-..-.....-.....-.........-.....-.........-....-.........--.---.-.....-....-....-..-.--------------------.----.-.-..-..-..-.-.---.....-...-..-..-..-.-...-..-------.--..--.-----.-..........-..........-..-.........-...........-...........-..........-..........--..........-...........-..--------.--..---------.----..-----.----..-.-........-.-........-..........-.......--.....-.....-.-........-------------.--.-----.-.---.------------------..---------....-..----------..................................................................
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C6K5V4_HPV16/137-291             ..............................................................................................................KFKELYGVSFSELVRPFKSNKSTCCDWCIAAF.GL.TPSIADSIKTLLQQYCLYLHIQSL.AC..SWG.MVVLLLVRYKCGKNRETIEKLLSKLLCVSPMCM.MIEPPKLRSTAAALYWYKTGI..S..NI..SEV..YGDTPEWIQRQTVLQHS.-.F.ND.CTFELSQMVQWA-------------.----..----------------....------...------------------...........-.....---....----....----...........-......---.-...-...-..-.-...---..-...-........-....-.....-..-.....-.....-.........-.....-.........-....-.........--.---.-.....-....-....-..-.--------------------.----.-.-..-..-..-.-.---.....-...-..-..-..-.-...-..-------.--..--.-----.-..........-..........-..-.........-...........-...........-..........-..........--..........-...........-..--------.--..---------.----..-----.----..-.-........-.-........-..........-.......--.....-.....-.-........-------------.--.-----.-.---.------------------..---------....-..----------..................................................................
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E9K6L3_HPV66/47-204              ..............................................................................................................KFKEVYGVPYTLSLRTFKSDSTCCNDWICAIF.GV.NETLAEALKTILKPQCVYYHMQCL.TC..SWG.VIVMMLIRYICGKNRKTITKSLSSILNVPQEQM.LIQPPKLRSPAVALYFYKTAM..S..NI..SEV..YGETPEWIQRQTQLQHS.-.L.QD.NQFELSKMVQWAFDN----------.----..----------------....------...------------------...........-.....---....----....----...........-......---.-...-...-..-.-...---..-...-........-....-.....-..-.....-.....-.........-.....-.........-....-.........--.---.-.....-....-....-..-.--------------------.----.-.-..-..-..-.-.---.....-...-..-..-..-.-...-..-------.--..--.-----.-..........-..........-..-.........-...........-...........-..........-..........--..........-...........-..--------.--..---------.----..-----.----..-.-........-.-........-..........-.......--.....-.....-.-........-------------.--.-----.-.---.------------------..---------....-..----------..................................................................
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F8S5N4_HPV58/203-633             ..............................................................................................................KFKEAYGVSFMELVRPFKSDKTSCTDWCITGY.GI.SPSVAESLKVLIKQHSIYTHLQCL.TC..DRG.IILLLLIRFKCSKNRLTVAKLMSNLLSIPETCM.IIEPPKLRSQACALYWFRTAM..S..NI..SDV..QGTTPEWIDRLTVLQHS.-.F.ND.DIFDLSEMIQWAYDNEITDDSDIAY.KYAQ..LADVNSNAAAFLRSNA....QAKIVK...DCGVMCRHYKRAEKRGMT...........M.....GQW....IQSR....CEKT...........N......DGG.N...W...R..P.I...VQF..L...R........Y....Q.....N..I.....E.....F.........T.....A.........F....L.........VA.FKQ.F.....L....Q....G..V.PKKSCMLLCGPANTGKSYFG.MSLI.H.F..L..K..G.C.IIS.....Y...V..N..S..K.S...H..FWLQPLS.DA..KI.GMIDD.V..........T..........A..I.........S...........W...........T..........Y..........ID..........D...........Y..MRNALDGN.DI..SIDVKHRAL.VQLK..CPPLI.ITSN..T.N........A.G........K..........D.......SR.....W.....P.Y........LHSRLTVFEFNNP.FP.FDANG.N.PVY.TINDENWKSFFSRTWCKL..GLIEEEDKE....N..DGGNISTFKC..................................................................
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C6K5N6_HPV16/70-154              ..............................................................................................................KFKELYGVSFTELVRPFKSNKSTCCDWCIAAF.GL.TPSIADSIKTLLQQYCLYLHIQSL.AC..SWG.MVVLLLVRYKCGKNRETIEKLL-----------.---------------------..-..--..---..-----------------.-.-.--.-------------------------.----..----------------....------...------------------...........-.....---....----....----...........-......---.-...-...-..-.-...---..-...-........-....-.....-..-.....-.....-.........-.....-.........-....-.........--.---.-.....-....-....-..-.--------------------.----.-.-..-..-..-.-.---.....-...-..-..-..-.-...-..-------.--..--.-----.-..........-..........-..-.........-...........-...........-..........-..........--..........-...........-..--------.--..---------.----..-----.----..-.-........-.-........-..........-.......--.....-.....-.-........-------------.--.-----.-.---.------------------..---------....-..----------..................................................................
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F8S448_HPV33/203-633             ..............................................................................................................KFKEAYGISFMELVRPFKSDKTS