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Database: Pfam
Entry: Peripla_BP_1
LinkDB: Peripla_BP_1
Original site: Peripla_BP_1 
#=GF ID   Peripla_BP_1
#=GF AC   PF00532.19
#=GF DE   Periplasmic binding proteins and sugar binding domain of LacI family
#=GF PI   periplasmic_binding_like; 
#=GF AU   Bateman A, Griffiths-Jones SR
#=GF SE   MRC-LMB Genome group
#=GF GA   21.70 21.70;
#=GF TC   21.70 21.70;
#=GF NC   21.60 21.60;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 17690987 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF RN   [1]
#=GF RM   1583688
#=GF RT   1.7 A X-ray structure of the periplasmic ribose receptor from
#=GF RT   Escherichia coli. 
#=GF RA   Mowbray SL, Cole LB; 
#=GF RL   J Mol Biol 1992;225:155-175.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   8638105
#=GF RT   Crystal structure of the lactose operon repressor and its
#=GF RT   complexes with DNA and inducer. 
#=GF RA   Lewis M, Chang G, Horton NC, Kercher MA, Pace HC, Schumacher MA,
#=GF RA   Brennan RG, Lu P; 
#=GF RL   Science 1996;271:1247-1254.
#=GF DR   INTERPRO; IPR001761;
#=GF DR   SCOP; 8abp; sf;
#=GF DR   HOMSTRAD; sugbp;
#=GF DR   TC; 3.A.1;
#=GF CC   This family includes the periplasmic binding proteins, and the
#=GF CC   LacI  family transcriptional regulators. The periplasmic binding
#=GF CC    proteins are the primary receptors for chemotaxis and transport
#=GF CC   of many sugar based solutes.  The LacI family of proteins
#=GF CC   consist of  transcriptional regulators related to the lac
#=GF CC   repressor. In this case, generally the sugar binding domain
#=GF CC   binds a sugar which changes the DNA binding activity of the
#=GF CC   repressor domain (Pfam:PF00356).
#=GF SQ   1618
#=GS F7KP65_9FIRM/79-291       AC F7KP65.1
#=GS A4WGA3_ENT38/58-325       AC A4WGA3.1
#=GS L7WAI1_NONDD/59-332       AC L7WAI1.1
#=GS G5III2_9CLOT/60-197       AC G5III2.1
#=GS A0A0G4JVN3_9ENTR/61-320   AC A0A0G4JVN3.1
#=GS U3U0R2_9ENTR/77-225       AC U3U0R2.1
#=GS L0MKD0_SERMA/70-292       AC L0MKD0.1
#=GS A0A0N0I6P3_9BACI/82-214   AC A0A0N0I6P3.1
#=GS R7BXD1_9FIRM/60-320       AC R7BXD1.1
#=GS A0A0K8P5Z6_9BURK/60-335   AC A0A0K8P5Z6.1
#=GS R7HCI2_9FIRM/64-332       AC R7HCI2.1
#=GS A8H7X4_SHEPA/60-346       AC A8H7X4.1
#=GS I3DIQ5_9PAST/67-327       AC I3DIQ5.1
#=GS A3V9E8_9RHOB/82-342       AC A3V9E8.1
#=GS A0A0A7EL87_9GAMM/80-339   AC A0A0A7EL87.1
#=GS G3XD97_PSEAE/70-333       AC G3XD97.1
#=GS C5EHH6_9FIRM/65-331       AC C5EHH6.1
#=GS Q2NQC9_SODGM/63-325       AC Q2NQC9.1
#=GS W0HTH7_9ENTR/25-320       AC W0HTH7.1
#=GS C0CZC1_9FIRM/55-324       AC C0CZC1.1
#=GS A0A0B5DXZ1_9RHOB/59-324   AC A0A0B5DXZ1.1
#=GS A0A0M2XZC7_9SPHI/62-332   AC A0A0M2XZC7.1
#=GS A0A0H4LAE8_9LACO/59-332   AC A0A0H4LAE8.1
#=GS A5VML6_LACRD/60-314       AC A5VML6.1
#=GS B2VEI0_ERWT9/67-327       AC B2VEI0.1
#=GS A3V2Q3_9RHOB/69-338       AC A3V2Q3.1
#=GS D1NWI6_9BIFI/64-338       AC D1NWI6.1
#=GS K6WCH7_9ACTN/78-340       AC K6WCH7.1
#=GS W8U2U0_YEREN/59-186       AC W8U2U0.1
#=GS F9HJC4_9STRE/59-309       AC F9HJC4.1
#=GS F8F332_TRECH/66-317       AC F8F332.1
#=GS B4EDK3_BURCJ/60-324       AC B4EDK3.1
#=GS A0A0N1IZT9_9LACO/63-316   AC A0A0N1IZT9.1
#=GS Q32DI0_SHIDS/60-329       AC Q32DI0.1
#=GS K1L785_9BACT/66-217       AC K1L785.1
#=GS D9R026_CLOSW/58-329       AC D9R026.1
#=GS F2L930_BURGS/27-315       AC F2L930.1
#=GS K2JAK2_9RHOB/81-338       AC K2JAK2.1
#=GS N6X7Y5_9RHOO/60-323       AC N6X7Y5.1
#=GS Q9CMG1_PASMU/63-322       AC Q9CMG1.1
#=GS A0A0D8MSV5_PHOLE/64-339   AC A0A0D8MSV5.1
#=GS B5H4C8_STRPR/57-327       AC B5H4C8.1
#=GS K0VZ51_9RHIZ/63-263       AC K0VZ51.1
#=GS CCPB_BACSU/59-311         AC P37517.1
#=GS C0D912_9FIRM/61-262       AC C0D912.1
#=GS A0A0N0Y7U2_THEVU/1-119    AC A0A0N0Y7U2.1
#=GS A0A0N0E3G1_9PSED/31-326   AC A0A0N0E3G1.1
#=GS B5I0S6_9ACTN/135-252      AC B5I0S6.2
#=GS A0A0M2HPI4_9MICO/81-244   AC A0A0M2HPI4.1
#=GS J6CRW7_PASMD/59-229       AC J6CRW7.1
#=GS A6APH6_VIBCY/30-326       AC A6APH6.1
#=GS G8LSD8_CLOCD/58-266       AC G8LSD8.1
#=GS F5YEA8_TREAZ/69-280       AC F5YEA8.1
#=GS A0KI64_AERHH/68-343       AC A0KI64.1
#=GS Q4KBP2_PSEF5/62-330       AC Q4KBP2.1
#=GS A0A0C1T5Y6_9ACTN/33-78    AC A0A0C1T5Y6.1
#=GS A0A0A0Z1N5_9ENTR/63-322   AC A0A0A0Z1N5.1
#=GS I3DJ52_HAEPH/59-324       AC I3DJ52.1
#=GS T1HMJ0_RHOPR/56-136       AC T1HMJ0.1
#=GS D1BY69_XYLCX/66-322       AC D1BY69.1
#=GS V5CYD2_ENTCL/93-345       AC V5CYD2.1
#=GS R3TIJ0_9ENTE/59-328       AC R3TIJ0.1
#=GS L0M4T5_ENTBF/25-320       AC L0M4T5.1
#=GS C8W857_ATOPD/63-322       AC C8W857.1
#=GS A0A0C1QBN1_9ACTN/65-205   AC A0A0C1QBN1.1
#=GS A0A089PFA4_PLUGE/60-329   AC A0A089PFA4.1
#=GS A0A0F3RR51_9LACO/62-243   AC A0A0F3RR51.1
#=GS I6HFD8_SHIFL/44-301       AC I6HFD8.1
#=GS L0M9L9_ENTBF/63-327       AC L0M9L9.1
#=GS A0A0M2HTL4_9MICO/65-323   AC A0A0M2HTL4.1
#=GS J9W4R2_LACBU/1-252        AC J9W4R2.1
#=GS Q8EHJ2_SHEON/58-345       AC Q8EHJ2.1
#=GS F4CF89_SPHS2/61-328       AC F4CF89.1
#=GS R5HWX8_9FIRM/63-225       AC R5HWX8.1
#=GS G5ID42_9CLOT/62-324       AC G5ID42.1
#=GS A1A3I5_BIFAA/63-317       AC A1A3I5.1
#=GS A0A078M0H2_9STAP/60-322   AC A0A078M0H2.1
#=GS C9ABU1_ENTCA/61-330       AC C9ABU1.1
#=GS C2BF23_9FIRM/66-333       AC C2BF23.1
#=GS Q03FJ7_PEDPA/59-302       AC Q03FJ7.1
#=GS D4LR67_9FIRM/61-321       AC D4LR67.1
#=GS A1S317_SHEAM/67-332       AC A1S317.1
#=GS S0NG06_9ENTE/60-229       AC S0NG06.1
#=GS R6VM05_9BACT/63-328       AC R6VM05.1
#=GS G8Q167_PSEFL/31-326       AC G8Q167.1
#=GS A0A0E3JWT7_CLOSL/62-332   AC A0A0E3JWT7.1
#=GS C6IYZ9_9BACL/61-320       AC C6IYZ9.1
#=GS Q92W55_RHIME/25-319       AC Q92W55.1
#=GS F0GB99_9BURK/27-319       AC F0GB99.1
#=GS A0A099T826_9RHOB/71-331   AC A0A099T826.1
#=GS A0A090GN92_9RHIZ/63-193   AC A0A090GN92.1
#=GS A0A0A1B0M2_9ENTR/67-307   AC A0A0A1B0M2.1
#=GS A4WBR5_ENT38/25-320       AC A4WBR5.1
#=GS E1R3U6_SPISS/59-257       AC E1R3U6.1
#=GS S5Y1C6_PARAH/70-255       AC S5Y1C6.1
#=GS R5U9S6_9FIRM/64-330       AC R5U9S6.1
#=GS A3JZ93_9RHOB/30-321       AC A3JZ93.1
#=GS YKVZ_BACSU/59-319         AC O31690.1
#=GS A0A0A1D3G5_9MICC/59-324   AC A0A0A1D3G5.1
#=GS H3SJD4_9BACL/58-333       AC H3SJD4.1
#=GS A0A0C5W518_9GAMM/63-336   AC A0A0C5W518.1
#=GS E0SBY8_DICD3/25-320       AC E0SBY8.1
#=GS C1DMI0_AZOVD/62-330       AC C1DMI0.1
#=GS D8IH75_LACFC/63-315       AC D8IH75.1
#=GS H7F8S0_9LIST/75-329       AC H7F8S0.1
#=GS H4GJ40_9LACO/59-251       AC H4GJ40.1
#=GS D4BRK2_BIFBR/44-308       AC D4BRK2.1
#=GS D1AFZ7_SEBTE/54-325       AC D1AFZ7.1
#=GS A0A090FQ76_9RHIZ/75-339   AC A0A090FQ76.1
#=GS Q481A3_COLP3/67-332       AC Q481A3.1
#=GS A0A089UCE2_9ENTR/61-335   AC A0A089UCE2.1
#=GS C4ZP40_THASP/55-329       AC C4ZP40.1
#=GS I3U4N6_ENTFC/59-195       AC I3U4N6.1
#=GS R5BQ41_9FIRM/62-333       AC R5BQ41.1
#=GS F0Z5T5_9CLOT/59-279       AC F0Z5T5.1
#=GS A0A0M2SP82_9BACI/59-314   AC A0A0M2SP82.1
#=GS Q32HR6_SHIDS/44-337       AC Q32HR6.1
#=GS M4U3J9_9GAMM/61-263       AC M4U3J9.1
#=GS A8AQY9_CITK8/81-337       AC A8AQY9.1
#=GS A0A0E4CV40_9BACL/60-327   AC A0A0E4CV40.1
#=GS K0VYD2_9RHIZ/64-255       AC K0VYD2.1
#=GS X1WZJ4_ACYPI/196-460      AC X1WZJ4.1
#=GS A1WPD2_VEREI/28-322       AC A1WPD2.1
#=GS E4RQZ7_LEAB4/61-333       AC E4RQZ7.1
#=GS A0A0D5VEZ0_9BURK/33-323   AC A0A0D5VEZ0.1
#=GS Q13WQ4_BURXL/60-329       AC Q13WQ4.1
#=GS K0VUH9_9RHIZ/129-390      AC K0VUH9.1
#=GS A0A0H4LA93_9LACO/59-292   AC A0A0H4LA93.1
#=GS A0A0A1MGG6_9BACI/59-325   AC A0A0A1MGG6.1
#=GS C0D6S1_9FIRM/85-293       AC C0D6S1.1
#=GS E6WCZ4_PANSA/59-319       AC E6WCZ4.1
#=GS A4VI83_PSEU5/61-322       AC A4VI83.1
#=GS Q8Y3U4_LISMO/59-316       AC Q8Y3U4.1
#=GS B8I9A7_CLOCE/59-324       AC B8I9A7.1
#=GS I3WGN4_BIFBI/61-323       AC I3WGN4.1
#=GS F0GFB8_9BURK/70-221       AC F0GFB8.1
#=GS R5X1B5_9FIRM/64-345       AC R5X1B5.1
#=GS R5SVR8_9CLOT/65-326       AC R5SVR8.1
#=GS D5AKQ2_RHOCB/70-331       AC D5AKQ2.1
#=GS D3D8C6_9ACTN/61-317       AC D3D8C6.1
#=GS E4T6S1_PALPW/62-330       AC E4T6S1.1
#=GS A9BS23_DELAS/104-308      AC A9BS23.1
#=GS F6AJ73_PSEF1/61-260       AC F6AJ73.1
#=GS D2Q7G4_BIFDB/59-319       AC D2Q7G4.1
#=GS A0A0D3V8D8_9BACL/59-312   AC A0A0D3V8D8.1
#=GS A8H4X0_SHEPA/60-324       AC A8H4X0.1
#=GS E1R710_SPISS/67-230       AC E1R710.1
#=GS E1M870_9STRE/64-186       AC E1M870.1
#=GS C0AXH9_9ENTR/59-226       AC C0AXH9.1
#=GS E4KM54_9LACT/64-329       AC E4KM54.1
#=GS A0A0F0KGL5_9MICO/63-230   AC A0A0F0KGL5.1
#=GS S5YI01_PARAH/59-314       AC S5YI01.1
#=GS H8E787_9MICO/96-326       AC H8E787.1
#=GS A0A0F3KFH5_9NEIS/67-272   AC A0A0F3KFH5.1
#=GS F7YUI0_9THEM/62-326       AC F7YUI0.1
#=GS I3Z9D1_BELBD/63-329       AC I3Z9D1.1
#=GS G9PH87_9ACTO/63-279       AC G9PH87.1
#=GS A3JMK2_9RHOB/66-335       AC A3JMK2.1
#=GS A0A0C5WD31_9FLAO/61-332   AC A0A0C5WD31.1
#=GS A0A0B5F6N5_STRA4/59-329   AC A0A0B5F6N5.1
#=GS C7XWI4_9LACO/63-334       AC C7XWI4.1
#=GS A0A0G3GV80_9CORY/73-336   AC A0A0G3GV80.1
#=GS Q8DXF5_STRA5/63-330       AC Q8DXF5.1
#=GS B5Y648_COPPD/60-329       AC B5Y648.1
#=GS R5XXJ3_9CLOT/59-323       AC R5XXJ3.1
#=GS D7C7T4_STRBB/63-301       AC D7C7T4.1
#=GS R6KMT1_9BACE/67-319       AC R6KMT1.1
#=GS B5I6D3_9ACTN/102-303      AC B5I6D3.2
#=GS Q9KM69_VIBCH/61-262       AC Q9KM69.1
#=GS A0A024HN53_PSEKB/61-258   AC A0A024HN53.1
#=GS A0A0F5LB03_9RHIZ/61-325   AC A0A0F5LB03.1
#=GS H8L2U5_FRAAD/66-312       AC H8L2U5.1
#=GS E3F187_KETVY/45-315       AC E3F187.1
#=GS I3WFG7_BIFBI/78-171       AC I3WFG7.1
#=GS X1WK73_ACYPI/322-585      AC X1WK73.1
#=GS B2VDB0_ERWT9/61-323       AC B2VDB0.1
#=GS A8GE32_SERP5/72-349       AC A8GE32.1
#=GS A0A0N1DC80_9MICO/81-352   AC A0A0N1DC80.1
#=GS G8P1W4_GRAMM/66-336       AC G8P1W4.1
#=GS F2NA74_CORGP/57-321       AC F2NA74.1
#=GS U2LGT9_TRESO/59-335       AC U2LGT9.1
#=GS F2LN86_BURGS/77-346       AC F2LN86.1
#=GS S6AP28_PSERE/61-303       AC S6AP28.1
#=GS Q49YZ7_STAS1/58-258       AC Q49YZ7.1
#=GS Q03D94_PEDPA/2-227        AC Q03D94.1
#=GS D2PLD5_KRIFD/70-327       AC D2PLD5.1
#=GS I6H2Q2_SHIFL/25-320       AC I6H2Q2.1
#=GS J3BZB0_9FLAO/62-329       AC J3BZB0.1
#=GS Q0FIW7_PELBH/45-310       AC Q0FIW7.1
#=GS A0A0M2K5S9_9MYCO/59-327   AC A0A0M2K5S9.1
#=GS Q13U52_BURXL/28-320       AC Q13U52.1
#=GS W0IZ82_9BACT/85-232       AC W0IZ82.1
#=GS G6Y502_9RHIZ/75-338       AC G6Y502.1
#=GS A7MJZ9_CROS8/61-331       AC A7MJZ9.1
#=GS G2E885_9GAMM/67-333       AC G2E885.1
#=GS Q04G01_OENOB/64-315       AC Q04G01.1
#=GS D3G1C2_BACPE/59-322       AC D3G1C2.1
#=GS C5ADW3_BURGB/60-323       AC C5ADW3.1
#=GS Q7NTN9_CHRVO/50-296       AC Q7NTN9.1
#=GS A0A0G3QEC7_KLUIN/61-329   AC A0A0G3QEC7.1
#=GS B2UBY7_RALPJ/60-329       AC B2UBY7.1
#=GS J7TCF5_MORMO/63-337       AC J7TCF5.1
#=GS A5FKI5_FLAJ1/61-334       AC A5FKI5.1
#=GS A0A0C1T4M0_9ACTN/59-188   AC A0A0C1T4M0.1
#=GS S0RFI6_ENTAV/61-324       AC S0RFI6.1
#=GS C6XYJ0_PEDHD/64-328       AC C6XYJ0.1
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#=GS S2DH60_9BACT/63-331       AC S2DH60.1
#=GS F3ZWQ4_MAHA5/61-331       AC F3ZWQ4.1
#=GS D7VH30_9SPHI/85-349       AC D7VH30.1
#=GS Q87TL1_VIBPA/101-360      AC Q87TL1.1
#=GS A0A0A2U934_9BACL/94-372   AC A0A0A2U934.1
#=GS A0A087D3I6_9BIFI/59-307   AC A0A087D3I6.1
#=GS R7FQR8_9FIRM/1-119        AC R7FQR8.1
#=GS H7EIK4_9SPIO/62-327       AC H7EIK4.1
#=GS D0YXK7_PHODD/48-345       AC D0YXK7.1
#=GS U4K5M4_9VIBR/61-266       AC U4K5M4.1
#=GS I4N116_9PSED/61-263       AC I4N116.1
#=GS C0D8N2_9FIRM/58-329       AC C0D8N2.1
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#=GS D6TSC8_9CHLR/59-330       AC D6TSC8.1
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#=GS A0KKS1_AERHH/61-260       AC A0KKS1.1
#=GS H7FQ38_9FLAO/61-331       AC H7FQ38.1
#=GS C1DPZ3_AZOVD/61-246       AC C1DPZ3.1
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#=GS Q2SJA1_HAHCH/64-283       AC Q2SJA1.1
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#=GS R6JYV2_9FIRM/58-330       AC R6JYV2.1
#=GS Q32K12_SHIDS/61-327       AC Q32K12.1
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#=GS A0A0M9GEM9_9PSED/70-333   AC A0A0M9GEM9.1
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#=GS F4QGJ0_9CAUL/80-287       AC F4QGJ0.1
#=GS A0A0F7N1D0_9ACTN/74-331   AC A0A0F7N1D0.1
#=GS X2GU71_9GAMM/66-331       AC X2GU71.1
#=GS Q7MEN8_VIBVY/31-292       AC Q7MEN8.1
#=GS D0Z0L5_PHODD/71-346       AC D0Z0L5.1
#=GS A6T8M3_KLEP7/64-342       AC A6T8M3.1
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#=GS N6YIP1_9RHOO/66-345       AC N6YIP1.1
#=GS F7YS42_VIBA7/29-290       AC F7YS42.1
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#=GS F4C5L6_SPHS2/64-333       AC F4C5L6.1
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#=GS A0A085BR36_9RHOB/67-331   AC A0A085BR36.1
#=GS A0A070C157_BURCE/58-243   AC A0A070C157.1
#=GS I0JKB6_HALH3/59-315       AC I0JKB6.1
#=GS V5ABG9_ENTCL/61-326       AC V5ABG9.1
#=GS I2BCT5_SHIBC/61-326       AC I2BCT5.1
#=GS A0A068QMM3_9ENTR/66-331   AC A0A068QMM3.1
#=GS A0A0L0GRY9_9ENTR/61-335   AC A0A0L0GRY9.1
#=GS R6WXW1_9BACT/66-331       AC R6WXW1.1
#=GS E0DD14_9CORY/24-286       AC E0DD14.1
#=GS K2JWF8_9RHOB/72-336       AC K2JWF8.1
#=GS F2K0J4_MARM1/58-323       AC F2K0J4.1
#=GS U3U0C3_9ENTR/63-140       AC U3U0C3.1
#=GS K8WA68_9ENTR/63-322       AC K8WA68.1
#=GS R7R1S4_9FIRM/58-330       AC R7R1S4.1
#=GS A3UA12_CROAH/63-172       AC A3UA12.1
#=GS D3D7V6_9ACTN/63-333       AC D3D7V6.1
#=GS A9DJ47_9FLAO/61-334       AC A9DJ47.1
#=GS I7KH49_9LACT/63-329       AC I7KH49.1
#=GS R5F0U3_9CLOT/70-336       AC R5F0U3.1
#=GS Q98GH8_RHILO/75-343       AC Q98GH8.1
#=GS R5XFM1_9FIRM/73-355       AC R5XFM1.1
#=GS A6VPC7_ACTSZ/61-258       AC A6VPC7.1
#=GS A0A0F5VC75_9GAMM/61-249   AC A0A0F5VC75.1
#=GS R5DYG5_9FIRM/58-330       AC R5DYG5.1
#=GS B2VEH1_ERWT9/60-329       AC B2VEH1.1
#=GS A7HK50_FERNB/62-327       AC A7HK50.1
#=GS S2DSI8_9BACT/63-334       AC S2DSI8.1
#=GS Q9S1T0_STRCO/82-348       AC Q9S1T0.1
#=GS C7PZC3_CATAD/58-340       AC C7PZC3.1
#=GS A0A0A0Z5P6_9ENTR/61-325   AC A0A0A0Z5P6.1
#=GS D9SQ91_CLOC7/62-328       AC D9SQ91.1
#=GS E6WE77_PANSA/60-325       AC E6WE77.1
#=GS Q1GML4_RUEST/67-334       AC Q1GML4.1
#=GS U5MZ77_CLOSA/60-332       AC U5MZ77.1
#=GS Q0FGE5_9RHOB/62-324       AC Q0FGE5.1
#=GS A0A090U0G7_9ENTR/61-328   AC A0A090U0G7.1
#=GS D5BGU0_ZUNPS/62-333       AC D5BGU0.1
#=GS C3K0L3_PSEFS/27-322       AC C3K0L3.1
#=GS Q5E4D1_VIBF1/26-321       AC Q5E4D1.1
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