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Database: Pfam
Entry: Peripla_BP_1
LinkDB: Peripla_BP_1
Original site: Peripla_BP_1 
#=GF ID   Peripla_BP_1
#=GF AC   PF00532.20
#=GF DE   Periplasmic binding proteins and sugar binding domain of LacI family
#=GF PI   periplasmic_binding_like; 
#=GF AU   Bateman A, Griffiths-Jones SR
#=GF SE   MRC-LMB Genome group
#=GF GA   21.70 21.70;
#=GF TC   21.70 21.70;
#=GF NC   21.60 21.60;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 26740544 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF RN   [1]
#=GF RM   1583688
#=GF RT   1.7 A X-ray structure of the periplasmic ribose receptor from
#=GF RT   Escherichia coli. 
#=GF RA   Mowbray SL, Cole LB; 
#=GF RL   J Mol Biol 1992;225:155-175.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   8638105
#=GF RT   Crystal structure of the lactose operon repressor and its
#=GF RT   complexes with DNA and inducer. 
#=GF RA   Lewis M, Chang G, Horton NC, Kercher MA, Pace HC, Schumacher MA,
#=GF RA   Brennan RG, Lu P; 
#=GF RL   Science 1996;271:1247-1254.
#=GF DR   INTERPRO; IPR001761;
#=GF DR   SCOP; 8abp; sf;
#=GF DR   HOMSTRAD; sugbp;
#=GF DR   TC; 3.A.1;
#=GF CC   This family includes the periplasmic binding proteins, and the
#=GF CC   LacI  family transcriptional regulators. The periplasmic binding
#=GF CC    proteins are the primary receptors for chemotaxis and transport
#=GF CC   of many sugar based solutes.  The LacI family of proteins
#=GF CC   consist of  transcriptional regulators related to the lac
#=GF CC   repressor. In this case, generally the sugar binding domain
#=GF CC   binds a sugar which changes the DNA binding activity of the
#=GF CC   repressor domain (Pfam:PF00356).
#=GF SQ   2869
#=GS F7KP65_9FIRM/79-291       AC F7KP65.1
#=GS A4WGA3_ENT38/58-325       AC A4WGA3.1
#=GS A0A0T9LAY2_9GAMM/61-329   AC A0A0T9LAY2.1
#=GS W1DG66_KLEPN/25-82        AC W1DG66.1
#=GS A0A101QV36_9ACTN/71-344   AC A0A101QV36.1
#=GS L7WAI1_NONDD/59-332       AC L7WAI1.1
#=GS G5III2_9CLOT/60-197       AC G5III2.1
#=GS A0A0B8YIX0_9SPHI/61-330   AC A0A0B8YIX0.1
#=GS U3U0R2_9ENTR/77-225       AC U3U0R2.1
#=GS S6IH75_9PSED/31-326       AC S6IH75.1
#=GS A0A0U2W8B4_9BACL/59-321   AC A0A0U2W8B4.1
#=GS L0MKD0_SERMA/70-292       AC L0MKD0.1
#=GS A0A0C1FMB5_9SPHI/63-337   AC A0A0C1FMB5.1
#=GS A0A135IC01_9GAMM/63-329   AC A0A135IC01.1
#=GS A0A161SKR2_9MICO/91-329   AC A0A161SKR2.1
#=GS A0A0Q7U6P0_9MICO/65-266   AC A0A0Q7U6P0.1
#=GS A0A0Q5DBB5_9RHIZ/74-337   AC A0A0Q5DBB5.1
#=GS A0A0N0I6P3_9BACI/82-214   AC A0A0N0I6P3.1
#=GS R7BXD1_9FIRM/60-320       AC R7BXD1.1
#=GS A0A0K8P5Z6_IDESA/60-335   AC A0A0K8P5Z6.1
#=GS R7HCI2_9FIRM/64-332       AC R7HCI2.1
#=GS A0A0R2FVY9_9LACO/39-288   AC A0A0R2FVY9.1
#=GS N2ACH0_9CLOT/25-292       AC N2ACH0.1
#=GS N6W4R0_9ALTE/61-259       AC N6W4R0.1
#=GS A0A0C2ADQ5_9ACTN/69-333   AC A0A0C2ADQ5.1
#=GS D4DXG8_SEROD/65-279       AC D4DXG8.1
#=GS A8H7X4_SHEPA/60-346       AC A8H7X4.1
#=GS L1LV27_PSEPU/61-262       AC L1LV27.1
#=GS A0A0V8S1L1_9CELL/65-285   AC A0A0V8S1L1.1
#=GS A0A0J6REH1_9NEIS/67-287   AC A0A0J6REH1.1
#=GS I3DIQ5_9PAST/67-327       AC I3DIQ5.1
#=GS G5LNY3_SALET/50-143       AC G5LNY3.1
#=GS A3V9E8_9RHOB/82-342       AC A3V9E8.1
#=GS A0A099S348_9CLOT/61-324   AC A0A099S348.1
#=GS A0A0P7YQX1_9RHOB/59-321   AC A0A0P7YQX1.1
#=GS A0A0R2L8A8_9LACO/59-260   AC A0A0R2L8A8.1
#=GS A0A0A7EL87_9GAMM/80-339   AC A0A0A7EL87.1
#=GS J2X744_KLEPN/25-320       AC J2X744.1
#=GS G3XD97_PSEAE/70-333       AC G3XD97.1
#=GS A0A143Q675_9NOCA/59-327   AC A0A143Q675.1
#=GS C5EHH6_9FIRM/65-331       AC C5EHH6.1
#=GS I0QSA3_9GAMM/25-320       AC I0QSA3.1
#=GS A0A0D1EI78_9RHOB/66-335   AC A0A0D1EI78.1
#=GS Q2NQC9_SODGM/63-325       AC Q2NQC9.1
#=GS W0HTH7_9GAMM/25-320       AC W0HTH7.1
#=GS C0CZC1_9FIRM/55-324       AC C0CZC1.1
#=GS A0A0B5DXZ1_9RHOB/59-324   AC A0A0B5DXZ1.1
#=GS A0A0M2XZC7_9SPHI/62-332   AC A0A0M2XZC7.1
#=GS A0A081CTG3_9RHIZ/61-327   AC A0A081CTG3.1
#=GS A0A0H4LAE8_9LACO/59-332   AC A0A0H4LAE8.1
#=GS A0A074K030_9RHOB/69-330   AC A0A074K030.1
#=GS A0A0N8GHL2_9BACI/59-316   AC A0A0N8GHL2.1
#=GS A5VML6_LACRD/60-314       AC A5VML6.1
#=GS A3V2Q3_9RHOB/69-338       AC A3V2Q3.1
#=GS D1NWI6_9BIFI/64-338       AC D1NWI6.1
#=GS K6WCH7_9ACTN/78-340       AC K6WCH7.1
#=GS W8U2U0_YEREN/59-186       AC W8U2U0.1
#=GS F9HJC4_9STRE/59-309       AC F9HJC4.1
#=GS A0A0R2H4A7_9LACO/59-310   AC A0A0R2H4A7.1
#=GS A0A069DIZ1_9BACL/59-323   AC A0A069DIZ1.1
#=GS A0A0Q9JK01_9MICO/80-336   AC A0A0Q9JK01.1
#=GS F8F332_TRECH/66-317       AC F8F332.1
#=GS B4EDK3_BURCJ/60-324       AC B4EDK3.1
#=GS A0A0W7WIV3_9RHOB/67-332   AC A0A0W7WIV3.1
#=GS A0A0N1IZT9_9LACO/63-316   AC A0A0N1IZT9.1
#=GS Q32DI0_SHIDS/60-329       AC Q32DI0.1
#=GS A0A0J9EF41_9RHOB/62-322   AC A0A0J9EF41.1
#=GS A0A139D7Y3_9FIRM/60-328   AC A0A139D7Y3.1
#=GS K1L785_9BACT/66-217       AC K1L785.1
#=GS A0A073JZE5_9BACI/59-323   AC A0A073JZE5.1
#=GS A0A0T7RYS3_SALET/48-341   AC A0A0T7RYS3.1
#=GS D9R026_CLOSW/58-329       AC D9R026.1
#=GS A0A0K0Y4I3_9RHOB/64-335   AC A0A0K0Y4I3.1
#=GS F2L930_BURGS/27-315       AC F2L930.1
#=GS K2JAK2_9RHOB/81-338       AC K2JAK2.1
#=GS N6X7Y5_9RHOO/60-323       AC N6X7Y5.1
#=GS S9P9B6_9DELT/61-259       AC S9P9B6.1
#=GS Q9CMG1_PASMU/63-322       AC Q9CMG1.1
#=GS X7E8G5_9GAMM/58-329       AC X7E8G5.1
#=GS N6VBE0_9RHIZ/68-329       AC N6VBE0.1
#=GS A0A136Q029_9FIRM/67-335   AC A0A136Q029.1
#=GS A0A171BLK2_9ACTN/60-315   AC A0A171BLK2.1
#=GS W1I2L7_KLEPN/25-320       AC W1I2L7.1
#=GS A0A0V8T785_9CELL/64-327   AC A0A0V8T785.1
#=GS A0A0R1J8Q1_9LACO/69-320   AC A0A0R1J8Q1.1
#=GS A0A014N8X4_9GAMM/61-326   AC A0A014N8X4.1
#=GS A0A0A5I8E0_9BACI/59-302   AC A0A0A5I8E0.1
#=GS B5H4C8_STRPR/57-327       AC B5H4C8.1
#=GS W7Q2T5_9GAMM/44-305       AC W7Q2T5.1
#=GS L9UAK2_9GAMM/30-324       AC L9UAK2.1
#=GS A0A0U9HLC8_9THEO/59-331   AC A0A0U9HLC8.1
#=GS CCPB_BACSU/59-311         AC P37517.1
#=GS A0A0T2L082_9MICO/58-321   AC A0A0T2L082.1
#=GS C0D912_9FIRM/61-262       AC C0D912.1
#=GS A0A0R2MFI2_9LACO/65-257   AC A0A0R2MFI2.1
#=GS A0A0N0Y7U2_THEVU/1-119    AC A0A0N0Y7U2.1
#=GS A0A0N0E3G1_9PSED/31-326   AC A0A0N0E3G1.1
#=GS A0A081MPI4_9RHIZ/77-329   AC A0A081MPI4.1
#=GS B5I0S6_9ACTN/135-252      AC B5I0S6.2
#=GS C4SF73_YERMO/63-318       AC C4SF73.1
#=GS W1TUD8_9ACTO/6-238        AC W1TUD8.1
#=GS A0A0M2HPI4_9MICO/81-244   AC A0A0M2HPI4.1
#=GS J6CRW7_PASMD/59-229       AC J6CRW7.1
#=GS G8LSD8_CLOCD/58-266       AC G8LSD8.1
#=GS F5YEA8_TREAZ/69-280       AC F5YEA8.1
#=GS A0A0J6WXX0_9FIRM/61-335   AC A0A0J6WXX0.1
#=GS A0A085IGZ3_9ENTR/61-332   AC A0A085IGZ3.1
#=GS W1N8G2_9GAMM/61-301       AC W1N8G2.1
#=GS A0KI64_AERHH/68-343       AC A0KI64.1
#=GS Q4KBP2_PSEF5/62-330       AC Q4KBP2.1
#=GS A0A0C1T5Y6_9ACTN/33-78    AC A0A0C1T5Y6.1
#=GS A0A0R1RZM7_9LACO/59-297   AC A0A0R1RZM7.1
#=GS I3DJ52_HAEPH/59-324       AC I3DJ52.1
#=GS L1NIZ3_9BACT/67-328       AC L1NIZ3.1
#=GS A0A0M7B5K9_9RHOB/48-305   AC A0A0M7B5K9.1
#=GS T1HMJ0_RHOPR/56-136       AC T1HMJ0.1
#=GS D1BY69_XYLCX/66-322       AC D1BY69.1
#=GS S6ELX3_AVIPA/54-314       AC S6ELX3.1
#=GS V5CYD2_ENTCL/93-345       AC V5CYD2.1
#=GS R3TIJ0_9ENTE/59-328       AC R3TIJ0.1
#=GS C8W857_ATOPD/63-322       AC C8W857.1
#=GS A0A161XN00_9RHOB/62-321   AC A0A161XN00.1
#=GS A0A0C1QBN1_9ACTN/65-205   AC A0A0C1QBN1.1
#=GS A0A0F3RR51_9LACO/62-243   AC A0A0F3RR51.1
#=GS A0A0Q8CSL3_9MICO/69-354   AC A0A0Q8CSL3.1
#=GS A0A0P7XJR5_9RHOB/71-321   AC A0A0P7XJR5.1
#=GS A0A163TG42_9RHOB/25-319   AC A0A163TG42.1
#=GS U3C8R2_9VIBR/30-327       AC U3C8R2.1
#=GS A0A0R1XLY9_9LACO/63-308   AC A0A0R1XLY9.1
#=GS A0A168R0E7_9BACL/66-334   AC A0A168R0E7.1
#=GS A0A126P7R1_9BACT/106-377  AC A0A126P7R1.1
#=GS A0A0M2HTL4_9MICO/65-323   AC A0A0M2HTL4.1
#=GS A0A0R2I336_9LACO/60-245   AC A0A0R2I336.1
#=GS A0A0J8YWH9_9BACT/61-273   AC A0A0J8YWH9.1
#=GS A0A098RBL5_9GAMM/68-333   AC A0A098RBL5.1
#=GS J9W4R2_LACBU/1-252        AC J9W4R2.1
#=GS W1J452_9GAMM/61-300       AC W1J452.1
#=GS Q8EHJ2_SHEON/58-345       AC Q8EHJ2.1
#=GS A0A090SH67_9VIBR/16-136   AC A0A090SH67.1
#=GS A0A0F7H9S2_SERFO/52-340   AC A0A0F7H9S2.1
#=GS F4CF89_SPHS2/61-328       AC F4CF89.1
#=GS A0A150XF18_9BACT/63-332   AC A0A150XF18.1
#=GS R5HWX8_9FIRM/63-225       AC R5HWX8.1
#=GS G5ID42_9CLOT/62-324       AC G5ID42.1
#=GS A1A3I5_BIFAA/63-317       AC A1A3I5.1
#=GS A0A0L8QR43_9ACTN/74-289   AC A0A0L8QR43.1
#=GS Q1ZQ50_PHOAS/61-267       AC Q1ZQ50.1
#=GS W6J1D9_9ENTR/61-336       AC W6J1D9.1
#=GS A0A078M0H2_9STAP/60-322   AC A0A078M0H2.1
#=GS C9ABU1_ENTCA/61-330       AC C9ABU1.1
#=GS C2BF23_9FIRM/66-333       AC C2BF23.1
#=GS A0A0Q9DNG7_9RHIZ/81-327   AC A0A0Q9DNG7.1
#=GS Q03FJ7_PEDPA/59-302       AC Q03FJ7.1
#=GS D4LR67_9FIRM/61-321       AC D4LR67.1
#=GS A0A171AGJ9_9PORP/63-334   AC A0A171AGJ9.1
#=GS A1S317_SHEAM/67-332       AC A1S317.1
#=GS A0A0Q8MQQ7_9RHIZ/58-322   AC A0A0Q8MQQ7.1
#=GS S0NG06_9ENTE/60-229       AC S0NG06.1
#=GS A0A0K9GXG3_9BACI/60-329   AC A0A0K9GXG3.1
#=GS R6VM05_9BACT/63-328       AC R6VM05.1
#=GS A0A0B0IAB3_9BACL/60-208   AC A0A0B0IAB3.1
#=GS A0A085HJ91_9GAMM/63-307   AC A0A085HJ91.1
#=GS A0A0B3RWU9_9RHOB/67-327   AC A0A0B3RWU9.1
#=GS A0A0R2GE52_LACPN/79-320   AC A0A0R2GE52.1
#=GS A0A117L3C9_9THEM/62-331   AC A0A117L3C9.1
#=GS C6IYZ9_9BACL/61-320       AC C6IYZ9.1
#=GS A0A0C1FP99_9SPHI/65-332   AC A0A0C1FP99.1
#=GS A0A0H2LPJ9_PRORE/63-321   AC A0A0H2LPJ9.1
#=GS Q92W55_RHIME/25-319       AC Q92W55.1
#=GS A0A0M0X5P1_9BACI/59-325   AC A0A0M0X5P1.1
#=GS S7WWT8_9FLAO/59-331       AC S7WWT8.1
#=GS A0A099T826_9RHOB/71-331   AC A0A099T826.1
#=GS A0A090GN92_9RHIZ/63-193   AC A0A090GN92.1
#=GS A0A0J1BH63_9SPHI/62-331   AC A0A0J1BH63.1
#=GS A0A0A1B0M2_9GAMM/67-307   AC A0A0A1B0M2.1
#=GS A4WBR5_ENT38/25-320       AC A4WBR5.1
#=GS E1R3U6_SPISS/59-257       AC E1R3U6.1
#=GS S5Y1C6_PARAH/70-255       AC S5Y1C6.1
#=GS R5U9S6_9FIRM/64-330       AC R5U9S6.1
#=GS W1N6K7_9GAMM/66-309       AC W1N6K7.1
#=GS W6WA96_9RHIZ/85-323       AC W6WA96.1
#=GS A3JZ93_9RHOB/30-321       AC A3JZ93.1
#=GS A0A0S8JMY4_9BACE/62-332   AC A0A0S8JMY4.1
#=GS A0A0A1HX11_9PSED/58-324   AC A0A0A1HX11.1
#=GS YKVZ_BACSU/59-319         AC O31690.1
#=GS A0A0R2BT37_9LACO/60-322   AC A0A0R2BT37.1
#=GS A0A0R2CWD1_9LACO/59-299   AC A0A0R2CWD1.1
#=GS A0A0A1D3G5_9MICC/59-324   AC A0A0A1D3G5.1
#=GS H3SJD4_9BACL/58-333       AC H3SJD4.1
#=GS A0A0C5W518_9GAMM/63-336   AC A0A0C5W518.1
#=GS A0A0R2FBW4_9LACO/85-262   AC A0A0R2FBW4.1
#=GS E0SBY8_DICD3/25-320       AC E0SBY8.1
#=GS N2J2Q1_9PSED/61-328       AC N2J2Q1.1
#=GS C4SAH5_YERMO/25-320       AC C4SAH5.1
#=GS C1DMI0_AZOVD/62-330       AC C1DMI0.1
#=GS D8IH75_LACFC/63-315       AC D8IH75.1
#=GS A0A037ZG69_9RHOB/66-330   AC A0A037ZG69.1
#=GS A0A0A0M730_9LACT/60-319   AC A0A0A0M730.1
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#=GS A0A0D4CLA6_9LACO/63-335   AC A0A0D4CLA6.1
#=GS X7FCM7_9RHOB/67-333       AC X7FCM7.1
#=GS F4C920_SPHS2/63-337       AC F4C920.1
#=GS W9AGP0_9BACI/59-127       AC W9AGP0.1
#=GS A0A120I8S7_9LACT/60-320   AC A0A120I8S7.1
#=GS X2H230_9GAMM/75-347       AC X2H230.1
#=GS A0A120LWY4_9MICO/58-321   AC A0A120LWY4.1
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#=GS Q87ID2_VIBPA/30-327       AC Q87ID2.1
#=GS Q87ID2_VIBPA/30-327       DR PDB; 3O1J D; 31-327;
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#=GS Q87ID2_VIBPA/30-327       DR PDB; 3O1J C; 31-327;
#=GS Q87ID2_VIBPA/30-327       DR PDB; 3O1I D; 31-327;
#=GS Q87ID2_VIBPA/30-327       DR PDB; 3O1H B; 31-327;
#=GS A0A068QNK4_9GAMM/83-346   AC A0A068QNK4.1
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#=GS MALR_STRR6/60-327         AC P0A4T2.2
#=GS Q9AAM4_CAUCR/67-337       AC Q9AAM4.1
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#=GS F3NDD0_9ACTN/66-330       AC F3NDD0.1
#=GS A0A159ZA55_9RHOB/80-329   AC A0A159ZA55.1
#=GS Q6LST4_PHOPR/55-351       AC Q6LST4.1
#=GS A0A074M5L9_9BACL/60-329   AC A0A074M5L9.1
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#=GS A8GE06_SERP5/25-320       AC A8GE06.1
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#=GS A4WAG9_ENT38/67-315       AC A4WAG9.1
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#=GS E1SD81_PANVC/61-326       AC E1SD81.1
#=GS G5LP52_SALET/3-151        AC G5LP52.1
#=GS A0A139B8Q9_9BIFI/61-329   AC A0A139B8Q9.1
#=GS G6EQ42_STRTR/59-224       AC G6EQ42.1
#=GS A0A0A2TE91_9BACI/59-325   AC A0A0A2TE91.1
#=GS A4WFM1_ENT38/63-319       AC A4WFM1.1
#=GS A0A0B1YW55_9BURK/27-319   AC A0A0B1YW55.1
#=GS A0A0Q4N171_9GAMM/61-326   AC A0A0Q4N171.1
#=GS E1T3E6_BURSG/60-326       AC E1T3E6.1
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#=GS A0A0A1B4Y0_9GAMM/66-330   AC A0A0A1B4Y0.1
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#=GS B9JK94_AGRRK/68-353       AC B9JK94.1
#=GS A0A0B2AUL9_9ACTN/1-150    AC A0A0B2AUL9.1
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#=GS A0A0K2RCQ3_9MICC/1-133    AC A0A0K2RCQ3.1
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#=GS G4KXB9_OSCVS/60-327       AC G4KXB9.1
#=GS A0A172X5J0_9MICO/74-334   AC A0A172X5J0.1
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#=GS A0A0J1CUS0_9BURK/33-323   AC A0A0J1CUS0.1
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#=GS A0A0Q8V7U0_9MICO/56-316   AC A0A0Q8V7U0.1
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