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Database: Pfam
Entry: Prominin
LinkDB: Prominin
Original site: Prominin 
#=GF ID   Prominin
#=GF AC   PF05478.6
#=GF DE   Prominin
#=GF AU   Moxon SJ
#=GF SE   Pfam-B_18226 (release 8.0)
#=GF GA   31.00 31.00;
#=GF TC   31.30 31.10;
#=GF NC   30.80 30.80;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 23193494 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   11467842
#=GF RT   Rat prominin, like its mouse and human orthologues, is a
#=GF RT   pentaspan membrane glycoprotein. 
#=GF RA   Corbeil D, Fargeas CA, Huttner WB; 
#=GF RL   Biochem Biophys Res Commun 2001;285:939-944.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   10587575
#=GF RT   A frameshift mutation in prominin (mouse)-like 1 causes human
#=GF RT   retinal degeneration. 
#=GF RA   Maw MA, Corbeil D, Koch J, Hellwig A, Wilson-Wheeler JC, Bridges
#=GF RA   RJ, Kumaramanickavel G, John S, Nancarrow D, Roper K, Weigmann
#=GF RA   A, Huttner WB, Denton MJ; 
#=GF RL   Hum Mol Genet 2000;9:27-34.
#=GF DR   INTERPRO; IPR008795;
#=GF CC   The prominins are an emerging family of proteins that among the
#=GF CC   multispan membrane proteins display a novel topology. Mouse
#=GF CC   prominin and human prominin (mouse)-like 1 (PROML1) are
#=GF CC   predicted to contain five membrane spanning domains, with an
#=GF CC   N-terminal domain exposed to the extracellular space followed by
#=GF CC   four, alternating small cytoplasmic and large extracellular,
#=GF CC   loops and a cytoplasmic C-terminal domain [1]. The exact
#=GF CC   function of prominin is unknown although in humans defects in
#=GF CC   PROM1, the gene coding for prominin, cause retinal degeneration
#=GF CC   [2].
#=GF SQ   435
#=GS PROM2_MOUSE/18-818     AC Q3UUY6.1
#=GS B4KU79_DROMO/2-609     AC B4KU79.1
#=GS G1SMB9_RABIT/18-817    AC G1SMB9.1
#=GS H9J350_BOMMO/34-340    AC H9J350.1
#=GS F6LI77_XENLA/2-775     AC F6LI77.1
#=GS B4IHF8_DROSE/330-647   AC B4IHF8.1
#=GS B4HTJ8_DROSE/72-891    AC B4HTJ8.1
#=GS B4GFU9_DROPE/46-180    AC B4GFU9.1
#=GS B0AZU8_HUMAN/1-120     AC B0AZU8.1
#=GS H9JZ83_APIME/57-855    AC H9JZ83.1
#=GS Q91XN5_RAT/11-822      AC Q91XN5.1
#=GS D0PWG5_XENLA/2-775     AC D0PWG5.1
#=GS B4QP20_DROSI/72-891    AC B4QP20.1
#=GS B3NQJ0_DROER/4-196     AC B3NQJ0.1
#=GS H3JMH1_STRPU/11-99     AC H3JMH1.1
#=GS F7HZI3_CALJA/343-759   AC F7HZI3.1
#=GS H2LUW1_ORYLA/1-211     AC H2LUW1.1
#=GS E2AWX0_CAMFO/9-745     AC E2AWX0.1
#=GS B4LK67_DROVI/28-397    AC B4LK67.1
#=GS B4PB93_DROYA/13-202    AC B4PB93.1
#=GS G1KMB5_ANOCA/1-732     AC G1KMB5.1
#=GS H2P533_PONAB/18-651    AC H2P533.1
#=GS B7PAU5_IXOSC/16-271    AC B7PAU5.1
#=GS H9HBP4_ATTCE/1-122     AC H9HBP4.1
#=GS C3Y3N7_BRAFL/1-275     AC C3Y3N7.1
#=GS B4H4V5_DROPE/35-845    AC B4H4V5.1
#=GS B4H680_DROPE/19-304    AC B4H680.1
#=GS B3NF28_DROER/20-615    AC B3NF28.1
#=GS F1CLF0_CHICK/14-823    AC F1CLF0.1
#=GS F7I904_CALJA/1-263     AC F7I904.1
#=GS H0ZHW4_TAEGU/1-365     AC H0ZHW4.1
#=GS B4N6I8_DROWI/195-683   AC B4N6I8.1
#=GS G3X9J8_MOUSE/11-823    AC G3X9J8.1
#=GS H3D685_TETNG/1-802     AC H3D685.1
#=GS D6WAM5_TRICA/4-327     AC D6WAM5.1
#=GS H2QP91_PANTR/11-830    AC H2QP91.1
#=GS B4H3Z1_DROPE/1-105     AC B4H3Z1.1
#=GS F0U4F6_AMBME/24-849    AC F0U4F6.1
#=GS B3NF29_DROER/72-890    AC B3NF29.1
#=GS E3LFM7_CAERE/603-718   AC E3LFM7.1
#=GS B4IZP7_DROGR/69-887    AC B4IZP7.1
#=GS F7HZI3_CALJA/1-285     AC F7HZI3.1
#=GS F1LUM7_RAT/1-179       AC F1LUM7.1
#=GS H5V897_DROME/1-727     AC H5V897.1
#=GS B4H3Z2_DROPE/74-256    AC B4H3Z2.1
#=GS G5BGC4_HETGA/4-824     AC G5BGC4.1
#=GS B4IHF8_DROSE/3-175     AC B4IHF8.1
#=GS C3YIS9_BRAFL/1-636     AC C3YIS9.1
#=GS F7HZF4_CALJA/418-818   AC F7HZF4.1
#=GS G7YJK5_CLOSI/525-682   AC G7YJK5.1
#=GS Q8R1Y1_MOUSE/1-59      AC Q8R1Y1.1
#=GS B5DYI8_DROPS/1-70      AC B5DYI8.1
#=GS F1S5C8_PIG/11-833      AC F1S5C8.1
#=GS E2BRB1_HARSA/96-436    AC E2BRB1.1
#=GS H0ZHJ9_TAEGU/1-778     AC H0ZHJ9.1
#=GS PROM1_HUMAN/11-830     AC O43490.1
#=GS G9KIP1_MUSPF/4-523     AC G9KIP1.1
#=GS H2LUW2_ORYLA/1-347     AC H2LUW2.1
#=GS H2US20_TAKRU/1-793     AC H2US20.1
#=GS E2BAM1_HARSA/1-678     AC E2BAM1.1
#=GS E1GJD9_LOALO/192-339   AC E1GJD9.1
#=GS F7IF91_CALJA/3-739     AC F7IF91.1
#=GS F6Y0K9_MONDO/1-733     AC F6Y0K9.1
#=GS F7HHE4_MACMU/99-293    AC F7HHE4.1
#=GS E3M304_CAERE/8-856     AC E3M304.1
#=GS H9F657_MACMU/1-155     AC H9F657.1
#=GS Q4R9B3_MACFA/1-202     AC Q4R9B3.1
#=GS D8T0U1_SELML/73-207    AC D8T0U1.1
#=GS F7GJ88_MONDO/2-104     AC F7GJ88.1
#=GS G1PC77_MYOLU/20-817    AC G1PC77.1
#=GS H3A1N0_LATCH/602-703   AC H3A1N0.1
#=GS Q7TSL4_RAT/11-822      AC Q7TSL4.1
#=GS H2TQU6_TAKRU/16-814    AC H2TQU6.1
#=GS A8XQV7_CAEBR/7-827     AC A8XQV7.1
#=GS G3X1S3_SARHA/16-824    AC G3X1S3.1
#=GS Q8MLN9_DROME/36-833    AC Q8MLN9.2
#=GS H2P533_PONAB/647-786   AC H2P533.1
#=GS G1NJ24_MELGA/14-832    AC G1NJ24.1
#=GS D6WYF5_TRICA/39-844    AC D6WYF5.1
#=GS A0AVW1_DROME/38-833    AC A0AVW1.1
#=GS G1MUN6_MELGA/4-364     AC G1MUN6.2
#=GS F1NQ52_CHICK/1-470     AC F1NQ52.1
#=GS F1MAN1_RAT/11-822      AC F1MAN1.1
#=GS PRM1A_DANRE/17-826     AC Q9W735.2
#=GS F6PI40_ORNAN/213-691   AC F6PI40.1
#=GS B4LTM1_DROVI/762-818   AC B4LTM1.1
#=GS C3Y3N7_BRAFL/364-500   AC C3Y3N7.1
#=GS G3X1S4_SARHA/3-740     AC G3X1S4.1
#=GS Q17FE4_AEDAE/32-814    AC Q17FE4.1
#=GS G4LYQ2_SCHMA/191-482   AC G4LYQ2.1
#=GS E9IG00_SOLIN/1-249     AC E9IG00.1
#=GS B7PAU5_IXOSC/540-683   AC B7PAU5.1
#=GS B4M9S9_DROVI/62-851    AC B4M9S9.1
#=GS E3LFK1_CAERE/31-635    AC E3LFK1.1
#=GS G7P5B3_MACFA/1-760     AC G7P5B3.1
#=GS F6Y0I1_MONDO/2-242     AC F6Y0I1.1
#=GS F1R0X8_DANRE/21-845    AC F1R0X8.1
#=GS B4G592_DROPE/219-764   AC B4G592.1
#=GS G1TC31_RABIT/3-736     AC G1TC31.1
#=GS H2VR60_CAEJA/572-691   AC H2VR60.1
#=GS G2HIT2_PANTR/1-347     AC G2HIT2.1
#=GS Q4S3X9_TETNG/1-563     AC Q4S3X9.1
#=GS F7HZF0_CALJA/100-294   AC F7HZF0.1
#=GS H3CED2_TETNG/1-750     AC H3CED2.1
#=GS H2US21_TAKRU/1-784     AC H2US21.1
#=GS Q9VZV1_DROME/323-621   AC Q9VZV1.2
#=GS H2ST75_TAKRU/1-736     AC H2ST75.1
#=GS H0Y9D4_HUMAN/1-53      AC H0Y9D4.1
#=GS H2ST69_TAKRU/22-713    AC H2ST69.1
#=GS F6LI73_XENLA/11-853    AC F6LI73.1
#=GS F6LI74_XENLA/11-842    AC F6LI74.1
#=GS H3C2Q5_TETNG/1-797     AC H3C2Q5.1
#=GS B4IZP6_DROGR/72-661    AC B4IZP6.1
#=GS H2TQU2_TAKRU/16-814    AC H2TQU2.1
#=GS H0V707_CAVPO/2-793     AC H0V707.1
#=GS F0U4F4_AMBME/24-834    AC F0U4F4.1
#=GS G7NAM5_MACMU/18-817    AC G7NAM5.1
#=GS F0U4F8_AMBME/24-843    AC F0U4F8.1
#=GS E9LZ03_BOVIN/18-831    AC E9LZ03.1
#=GS Q09LT0_RAT/11-263      AC Q09LT0.1
#=GS G7MSM0_MACMU/11-830    AC G7MSM0.1
#=GS E2AB51_CAMFO/520-823   AC E2AB51.1
#=GS F1Q4W2_DANRE/21-847    AC F1Q4W2.1
#=GS B5DY41_DROPS/219-764   AC B5DY41.1
#=GS B4H411_DROPE/91-909    AC B4H411.1
#=GS H3C1Y7_TETNG/1-788     AC H3C1Y7.1
#=GS B7YZQ3_DROME/37-831    AC B7YZQ3.1
#=GS PROM2_HUMAN/18-817     AC Q8N271.1
#=GS Q19188_CAEEL/8-827     AC Q19188.1
#=GS E1C9E2_CHICK/14-832    AC E1C9E2.1
#=GS E0VGJ4_PEDHC/2-684     AC E0VGJ4.1
#=GS E9C7B6_CAPO3/14-828    AC E9C7B6.1
#=GS E1BM92_BOVIN/21-816    AC E1BM92.2
#=GS H2N0M2_ORYLA/1-763     AC H2N0M2.1
#=GS F7DVP6_MONDO/1-729     AC F7DVP6.1
#=GS H2TQU7_TAKRU/16-821    AC H2TQU7.1
#=GS F1CLF1_DANRE/15-835    AC F1CLF1.1
#=GS G1S3H0_NOMLE/11-830    AC G1S3H0.1
#=GS F1CLF2_DANRE/15-843    AC F1CLF2.1
#=GS H2ST74_TAKRU/1-730     AC H2ST74.1
#=GS F4WDR5_ACREC/11-746    AC F4WDR5.1
#=GS E9LYZ8_XENTR/1-779     AC E9LYZ8.1
#=GS F6QEH7_XENTR/4-732     AC F6QEH7.1
#=GS B5DY40_DROPS/46-163    AC B5DY40.1
#=GS H9KG54_APIME/2-168     AC H9KG54.1
#=GS B5DRF1_DROPS/143-246   AC B5DRF1.1
#=GS G1KUW1_ANOCA/12-95     AC G1KUW1.1
#=GS E1GPK6_LOALO/1-146     AC E1GPK6.1
#=GS C3YIS9_BRAFL/782-921   AC C3YIS9.1
#=GS Q16LQ3_AEDAE/75-903    AC Q16LQ3.1
#=GS G3I7L4_CRIGR/2-403     AC G3I7L4.1
#=GS H2TQU5_TAKRU/16-328    AC H2TQU5.1
#=GS H2TQU1_TAKRU/16-813    AC H2TQU1.1
#=GS B4KEZ3_DROMO/112-217   AC B4KEZ3.1
#=GS B4MN21_DROWI/96-911    AC B4MN21.1
#=GS B4LGX0_DROVI/119-655   AC B4LGX0.1
#=GS H9GTT4_ANOCA/1-722     AC H9GTT4.1
#=GS B0W3X9_CULQU/80-905    AC B0W3X9.1
#=GS F1CLE9_CHICK/14-823    AC F1CLE9.1
#=GS Q28WV3_DROPS/11-594    AC Q28WV3.2
#=GS F6W7E8_ORNAN/1-720     AC F6W7E8.1
#=GS F7HZF0_CALJA/1-107     AC F7HZF0.1
#=GS E9FV88_DAPPU/77-872    AC E9FV88.1
#=GS B5DRF1_DROPS/20-154    AC B5DRF1.1
#=GS Q29E29_DROPS/91-909    AC Q29E29.2
#=GS H9G7P3_ANOCA/1-719     AC H9G7P3.1
#=GS PROM1_MOUSE/11-832     AC O54990.1
#=GS H9I4Q3_ATTCE/9-89      AC H9I4Q3.1
#=GS B3S358_TRIAD/592-760   AC B3S358.1
#=GS F8WDW5_HUMAN/18-108    AC F8WDW5.1
#=GS B3S357_TRIAD/28-841    AC B3S357.1
#=GS D2HWG2_AILME/1-794     AC D2HWG2.1
#=GS E9LYZ5_XENTR/13-832    AC E9LYZ5.1
#=GS E9LZ00_TAKRU/33-855    AC E9LZ00.1
#=GS F7HJD9_MACMU/18-817    AC F7HJD9.1
#=GS H0XAK7_OTOGA/11-821    AC H0XAK7.1
#=GS D8SVC2_SELML/73-207    AC D8SVC2.1
#=GS A0JN22_RAT/11-83       AC A0JN22.1
#=GS H9JPV3_BOMMO/31-271    AC H9JPV3.1
#=GS E9LZ02_ORNAN/13-831    AC E9LZ02.1
#=GS E9LYZ6_XENTR/11-760    AC E9LYZ6.1
#=GS G1QGH9_NOMLE/18-578    AC G1QGH9.1
#=GS F7HZF4_CALJA/20-375    AC F7HZF4.1
#=GS H0WPV2_OTOGA/16-815    AC H0WPV2.1
#=GS G0M6Q0_CAEBE/1-84      AC G0M6Q0.1
#=GS B5DRE6_DROPS/219-766   AC B5DRE6.1
#=GS Q8CDK8_MOUSE/11-823    AC Q8CDK8.1
#=GS Q4S3X9_TETNG/581-623   AC Q4S3X9.1
#=GS F4NU99_BATDJ/45-418    AC F4NU99.1
#=GS Q09LS9_RAT/1-206       AC Q09LS9.1
#=GS B4JA47_DROGR/53-875    AC B4JA47.1
#=GS F7APW0_HORSE/11-831    AC F7APW0.1
#=GS H9I4R0_ATTCE/1-285     AC H9I4R0.1
#=GS F1SU61_PIG/1-302       AC F1SU61.1
#=GS H2W9E7_CAEJA/7-840     AC H2W9E7.1
#=GS H2LUW0_ORYLA/1-286     AC H2LUW0.1
#=GS B3S358_TRIAD/14-616    AC B3S358.1
#=GS Q8C3K1_MOUSE/11-257    AC Q8C3K1.1
#=GS F7D5R8_MONDO/20-817    AC F7D5R8.1
#=GS Q5ZLD8_CHICK/11-99     AC Q5ZLD8.1
#=GS Q9JI49_RAT/11-591      AC Q9JI49.1
#=GS F4W9K7_ACREC/28-365    AC F4W9K7.1
#=GS H3HXM4_STRPU/427-602   AC H3HXM4.1
#=GS F1RD29_DANRE/1-124     AC F1RD29.1
#=GS B4PCV3_DROYA/72-891    AC B4PCV3.1
#=GS F1MK52_BOVIN/18-831    AC F1MK52.2
#=GS Q9VZV1_DROME/107-332   AC Q9VZV1.2
#=GS A2BIE6_DANRE/23-528    AC A2BIE6.1
#=GS F1RCM2_DANRE/23-847    AC F1RCM2.1
#=GS G3QUE2_GORGO/18-817    AC G3QUE2.1
#=GS H3HXM4_STRPU/126-445   AC H3HXM4.1
#=GS F7HHE4_MACMU/1-111     AC F7HHE4.1
#=GS E1GPZ7_LOALO/2-105     AC E1GPZ7.1
#=GS H3CFA1_TETNG/1-788     AC H3CFA1.1
#=GS H9H291_MELGA/1-155     AC H9H291.1
#=GS B4LK68_DROVI/3-159     AC B4LK68.1
#=GS G3NWN7_GASAC/1-759     AC G3NWN7.1
#=GS H2LWM1_ORYLA/13-816    AC H2LWM1.1
#=GS F6W7D1_ORNAN/1-718     AC F6W7D1.1
#=GS D2VLZ3_NAEGR/20-299    AC D2VLZ3.1
#=GS H3J7F0_STRPU/1-454     AC H3J7F0.1
#=GS F1PQT5_CANFA/14-759    AC F1PQT5.1
#=GS F9WJZ8_TRYCI/30-204    AC F9WJZ8.1
#=GS G7YJK5_CLOSI/1-125     AC G7YJK5.1
#=GS H3C6K6_TETNG/1-364     AC H3C6K6.1
#=GS G3PY19_GASAC/33-856    AC G3PY19.1
#=GS H3J2P7_STRPU/21-213    AC H3J2P7.1
#=GS G7PMP9_MACFA/18-817    AC G7PMP9.1
#=GS B4HTJ7_DROSE/98-691    AC B4HTJ7.1
#=GS H3GZE8_PHYRM/173-349   AC H3GZE8.1
#=GS G1PDJ3_MYOLU/11-831    AC G1PDJ3.1
#=GS B5DRF4_DROPS/88-908    AC B5DRF4.1
#=GS H2US25_TAKRU/1-784     AC H2US25.1
#=GS F6VHT3_ORNAN/1-59      AC F6VHT3.1
#=GS H2TQU8_TAKRU/16-703    AC H2TQU8.1
#=GS H2ST73_TAKRU/1-733     AC H2ST73.1
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