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Database: Pfam
Entry: Prominin
LinkDB: Prominin
Original site: Prominin 
#=GF ID   Prominin
#=GF AC   PF05478.9
#=GF DE   Prominin
#=GF AU   Moxon SJ
#=GF SE   Pfam-B_18226 (release 8.0)
#=GF GA   31.70 31.70;
#=GF TC   31.70 32.00;
#=GF NC   31.50 31.60;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 17690987 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   11467842
#=GF RT   Rat prominin, like its mouse and human orthologues, is a
#=GF RT   pentaspan membrane glycoprotein. 
#=GF RA   Corbeil D, Fargeas CA, Huttner WB; 
#=GF RL   Biochem Biophys Res Commun 2001;285:939-944.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   10587575
#=GF RT   A frameshift mutation in prominin (mouse)-like 1 causes human
#=GF RT   retinal degeneration. 
#=GF RA   Maw MA, Corbeil D, Koch J, Hellwig A, Wilson-Wheeler JC, Bridges
#=GF RA   RJ, Kumaramanickavel G, John S, Nancarrow D, Roper K, Weigmann
#=GF RA   A, Huttner WB, Denton MJ; 
#=GF RL   Hum Mol Genet 2000;9:27-34.
#=GF DR   INTERPRO; IPR008795;
#=GF CC   The prominins are an emerging family of proteins that among the
#=GF CC   multispan membrane proteins display a novel topology. Mouse
#=GF CC   prominin and human prominin (mouse)-like 1 (PROML1) are
#=GF CC   predicted to contain five membrane spanning domains, with an
#=GF CC   N-terminal domain exposed to the extracellular space followed by
#=GF CC   four, alternating small cytoplasmic and large extracellular,
#=GF CC   loops and a cytoplasmic C-terminal domain [1]. The exact
#=GF CC   function of prominin is unknown although in humans defects in
#=GF CC   PROM1, the gene coding for prominin, cause retinal degeneration
#=GF CC   [2].
#=GF SQ   570
#=GS A0A0Q9WLM6_DROVI/37-831   AC A0A0Q9WLM6.1
#=GS T1HML6_RHOPR/6-218        AC T1HML6.1
#=GS I3N8V6_ICTTR/1-755        AC I3N8V6.1
#=GS B4JDN5_DROGR/250-361      AC B4JDN5.1
#=GS J9ETE3_WUCBA/3-234        AC J9ETE3.1
#=GS M3WLW5_FELCA/1-730        AC M3WLW5.1
#=GS A0A088AR64_APIME/59-853   AC A0A088AR64.1
#=GS H2ST74_TAKRU/1-720        AC H2ST74.1
#=GS H0Y9D4_HUMAN/1-43         AC H0Y9D4.1
#=GS H3CFA2_TETNG/1-778        AC H3CFA2.1
#=GS Q7Q6R9_ANOGA/24-836       AC Q7Q6R9.3
#=GS K1PJ91_CRAGI/18-673       AC K1PJ91.1
#=GS G1NJ24_MELGA/17-822       AC G1NJ24.1
#=GS K1R0F5_CRAGI/475-766      AC K1R0F5.1
#=GS A0A044T5I5_ONCVO/18-793   AC A0A044T5I5.1
#=GS B4JDN5_DROGR/360-456      AC B4JDN5.1
#=GS A0A0R4J0B0_MOUSE/18-326   AC A0A0R4J0B0.1
#=GS F7I904_CALJA/1-263        AC F7I904.1
#=GS H3C6K6_TETNG/1-354        AC H3C6K6.1
#=GS L5K554_PTEAL/71-188       AC L5K554.1
#=GS A0JN22_RAT/18-81          AC A0JN22.1
#=GS G3QUE2_GORGO/25-807       AC G3QUE2.1
#=GS B4H409_DROPE/97-182       AC B4H409.1
#=GS A0A096NZG9_PAPAN/18-820   AC A0A096NZG9.1
#=GS A0A0N4VBF0_ENTVE/362-506  AC A0A0N4VBF0.1
#=GS G1SMB9_RABIT/25-807       AC G1SMB9.1
#=GS G3RJ70_GORGO/18-820       AC G3RJ70.1
#=GS W5LQH3_ASTMX/38-846       AC W5LQH3.1
#=GS W5PJL2_SHEEP/18-812       AC W5PJL2.1
#=GS V4BDS2_LOTGI/17-742       AC V4BDS2.1
#=GS C3Y3N7_BRAFL/353-492      AC C3Y3N7.1
#=GS W5KXW9_ASTMX/23-806       AC W5KXW9.1
#=GS H0Y9Q5_HUMAN/1-71         AC H0Y9Q5.1
#=GS I3NA83_ICTTR/26-814       AC I3NA83.1
#=GS B4JA47_DROGR/57-865       AC B4JA47.1
#=GS U3IXV2_ANAPL/1-68         AC U3IXV2.1
#=GS T1IES3_RHOPR/4-319        AC T1IES3.1
#=GS B3M7E2_DROAN/103-906      AC B3M7E2.2
#=GS F7HZF4_CALJA/27-374       AC F7HZF4.1
#=GS T1KVU9_TETUR/13-287       AC T1KVU9.1
#=GS Q8IRE6_DROME/107-722      AC Q8IRE6.3
#=GS PRM1A_DANRE/28-816        AC Q9W735.2
#=GS E4XF62_OIKDI/51-877       AC E4XF62.1
#=GS U3K1M8_FICAL/7-766        AC U3K1M8.1
#=GS A0A091D5N8_FUKDA/703-845  AC A0A091D5N8.1
#=GS G3S7V7_GORGO/18-820       AC G3S7V7.1
#=GS B4QBY5_DROSI/39-435       AC B4QBY5.1
#=GS F7HJD9_MACMU/25-807       AC F7HJD9.1
#=GS K1PAP9_CRAGI/38-147       AC K1PAP9.1
#=GS W5JWQ1_ANODA/23-760       AC W5JWQ1.1
#=GS H2VR60_CAEJA/233-536      AC H2VR60.1
#=GS A0A0P8YDK7_DROAN/51-837   AC A0A0P8YDK7.1
#=GS PROM2_MOUSE/25-808        AC Q3UUY6.1
#=GS K7GRT6_PIG/1-409          AC K7GRT6.1
#=GS S9XE13_9CETA/247-359      AC S9XE13.1
#=GS V8NES1_OPHHA/237-346      AC V8NES1.1
#=GS A0A0N5CZL1_THECL/74-322   AC A0A0N5CZL1.1
#=GS W4XP01_STRPU/40-588       AC W4XP01.1
#=GS A0A0G2JG30_MOUSE/18-97    AC A0A0G2JG30.1
#=GS A0A0R3NGT7_DROPS/1-344    AC A0A0R3NGT7.1
#=GS A0A0R3NN89_DROPS/1-504    AC A0A0R3NN89.1
#=GS A0A0Q9WNE9_DROVI/37-813   AC A0A0Q9WNE9.1
#=GS W5L0W5_ASTMX/1-773        AC W5L0W5.1
#=GS PROM1_HUMAN/18-820        AC O43490.1
#=GS F7HZF4_CALJA/419-808      AC F7HZF4.1
#=GS G5BGC4_HETGA/11-814       AC G5BGC4.1
#=GS G3NWN7_GASAC/1-749        AC G3NWN7.1
#=GS I3IYG0_ORENI/20-842       AC I3IYG0.1
#=GS K7IUF8_NASVI/17-368       AC K7IUF8.1
#=GS H2ST69_TAKRU/21-713       AC H2ST69.1
#=GS J9JRA3_ACYPI/42-856       AC J9JRA3.2
#=GS A0A0G2JWD0_RAT/18-821     AC A0A0G2JWD0.1
#=GS A0A0P9C0E8_DROAN/51-837   AC A0A0P9C0E8.1
#=GS W4YY62_STRPU/22-213       AC W4YY62.1
#=GS B4H411_DROPE/95-899       AC B4H411.1
#=GS M3WDQ9_FELCA/29-810       AC M3WDQ9.1
#=GS B4H680_DROPE/10-289       AC B4H680.1
#=GS A0A0Q9WCS1_DROVI/37-620   AC A0A0Q9WCS1.1
#=GS H2ST71_TAKRU/1-724        AC H2ST71.1
#=GS G1L4H6_AILME/3-726        AC G1L4H6.1
#=GS G6DML5_DANPL/2-782        AC G6DML5.1
#=GS PROM2_HUMAN/25-807        AC Q8N271.1
#=GS B4KWS6_DROMO/61-862       AC B4KWS6.1
#=GS E2AB51_CAMFO/519-811      AC E2AB51.1
#=GS B4LGX1_DROVI/57-861       AC B4LGX1.1
#=GS T1HW48_RHOPR/45-141       AC T1HW48.1
#=GS I5APF9_DROPS/76-882       AC I5APF9.2
#=GS B4IHF8_DROSE/4-176        AC B4IHF8.1
#=GS U4UT99_DENPD/1-323        AC U4UT99.1
#=GS H3CED2_TETNG/1-740        AC H3CED2.1
#=GS A0A0R3P8Q0_DROPS/95-899   AC A0A0R3P8Q0.1
#=GS G1MUN6_MELGA/3-354        AC G1MUN6.2
#=GS H2XJI5_CIOIN/8-285        AC H2XJI5.1
#=GS H2LUW2_ORYLA/1-337        AC H2LUW2.1
#=GS H7BWW9_DANRE/28-825       AC H7BWW9.2
#=GS D6WAM5_TRICA/1-327        AC D6WAM5.1
#=GS F1RCM2_DANRE/36-837       AC F1RCM2.1
#=GS C3YIS9_BRAFL/780-911      AC C3YIS9.1
#=GS H2QP91_PANTR/18-820       AC H2QP91.1
#=GS K1R0F5_CRAGI/241-461      AC K1R0F5.1
#=GS A0A0N4TRJ7_BRUPA/14-462   AC A0A0N4TRJ7.1
#=GS M3XKH5_LATCH/23-603       AC M3XKH5.1
#=GS H2QIC1_PANTR/25-807       AC H2QIC1.1
#=GS A0A0Q9XBX0_DROMO/65-839   AC A0A0Q9XBX0.1
#=GS W4VXG2_ATTCE/1-275        AC W4VXG2.1
#=GS A0A0N4XYD3_NIPBR/235-806  AC A0A0N4XYD3.1
#=GS I3JSU1_ORENI/22-800       AC I3JSU1.1
#=GS G5E8G5_MOUSE/18-822       AC G5E8G5.1
#=GS F1NQ52_CHICK/29-811       AC F1NQ52.2
#=GS E2AWX0_CAMFO/9-735        AC E2AWX0.1
#=GS B4IZP7_DROGR/73-877       AC B4IZP7.1
#=GS G6CNJ2_DANPL/3-212        AC G6CNJ2.1
#=GS B4QP19_DROSI/305-728      AC B4QP19.1
#=GS F7ES12_MONDO/20-823       AC F7ES12.2
#=GS T1GIW2_MEGSC/1-32         AC T1GIW2.1
#=GS F7HZI3_CALJA/1-284        AC F7HZI3.1
#=GS U6IVX4_ECHGR/254-844      AC U6IVX4.1
#=GS B0WLP3_CULQU/9-803        AC B0WLP3.1
#=GS A0A0N5CKZ7_THECL/12-793   AC A0A0N5CKZ7.1
#=GS H9J350_BOMMO/347-663      AC H9J350.1
#=GS G1PC77_MYOLU/27-807       AC G1PC77.1
#=GS F1PMC8_CANLF/1-741        AC F1PMC8.2
#=GS H3F9A2_PRIPA/19-792       AC H3F9A2.1
#=GS U3K3R9_FICAL/17-822       AC U3K3R9.1
#=GS F6VPE5_ORNAN/1-548        AC F6VPE5.2
#=GS G3I7L4_CRIGR/441-554      AC G3I7L4.1
#=GS PROM1_MOUSE/18-822        AC O54990.1
#=GS B0W3X9_CULQU/85-895       AC B0W3X9.1
#=GS A0A0N5B086_9BILA/20-325   AC A0A0N5B086.1
#=GS A0A0G2JDH9_MOUSE/18-813   AC A0A0G2JDH9.1
#=GS W4VXG5_ATTCE/1-113        AC W4VXG5.1
#=GS B4H679_DROPE/17-333       AC B4H679.1
#=GS G4LYQ2_SCHMA/21-179       AC G4LYQ2.1
#=GS A0A0B2W1M0_TOXCA/13-270   AC A0A0B2W1M0.1
#=GS V8NYI4_OPHHA/319-491      AC V8NYI4.1
#=GS K1PAP9_CRAGI/143-416      AC K1PAP9.1
#=GS F7AD77_XENTR/1-768        AC F7AD77.1
#=GS H3A1N1_LATCH/1-423        AC H3A1N1.1
#=GS A0A0R4IHU7_DANRE/28-833   AC A0A0R4IHU7.1
#=GS H3A1N1_LATCH/454-693      AC H3A1N1.1
#=GS H2US24_TAKRU/1-774        AC H2US24.1
#=GS F1PQT5_CANLF/30-810       AC F1PQT5.2
#=GS B4QP19_DROSI/37-174       AC B4QP19.1
#=GS B4HTJ7_DROSE/98-691       AC B4HTJ7.1
#=GS F1NI31_CHICK/14-777       AC F1NI31.2
#=GS H2P533_PONAB/25-654       AC H2P533.1
#=GS H2TQU1_TAKRU/20-804       AC H2TQU1.1
#=GS J9NZU4_CANLF/19-812       AC J9NZU4.1
#=GS B3S358_TRIAD/27-617       AC B3S358.1
#=GS T1IH19_STRMM/328-971      AC T1IH19.1
#=GS Q17FE4_AEDAE/5-804        AC Q17FE4.1
#=GS B4JQU2_DROGR/1-392        AC B4JQU2.1
#=GS A0A0J7P3N1_LASNI/10-735   AC A0A0J7P3N1.1
#=GS F7F7K6_ORNAN/255-581      AC F7F7K6.2
#=GS H2ST70_TAKRU/19-826       AC H2ST70.1
#=GS H3J314_STRPU/3-216        AC H3J314.1
#=GS F7HZF0_CALJA/100-284      AC F7HZF0.1
#=GS W5NE34_LEPOC/23-793       AC W5NE34.1
#=GS G3X1S3_SARHA/18-814       AC G3X1S3.1
#=GS B4G592_DROPE/159-221      AC B4G592.1
#=GS A0A0P9BT31_DROAN/1-163    AC A0A0P9BT31.1
#=GS G1TC31_RABIT/1-714        AC G1TC31.2
#=GS B4N6I8_DROWI/41-802       AC B4N6I8.2
#=GS B4QP19_DROSI/170-338      AC B4QP19.1
#=GS A0A0Q9X9J0_DROMO/38-828   AC A0A0Q9X9J0.1
#=GS H2ST75_TAKRU/1-726        AC H2ST75.1
#=GS I3JUZ1_ORENI/11-828       AC I3JUZ1.1
#=GS A0A084WA51_ANOSI/29-837   AC A0A084WA51.1
#=GS A0A0P7USI7_9TELE/5-656    AC A0A0P7USI7.1
#=GS G5APT5_HETGA/23-805       AC G5APT5.1
#=GS A0A068YF29_ECHMU/50-470   AC A0A068YF29.1
#=GS A0A068XAG3_HYMMI/1-103    AC A0A068XAG3.2
#=GS A0A067QVM0_ZOONE/44-551   AC A0A067QVM0.1
#=GS H2US21_TAKRU/1-774        AC H2US21.1
#=GS A0A0R4IZS3_DANRE/28-822   AC A0A0R4IZS3.1
#=GS B7PAU5_IXOSC/574-673      AC B7PAU5.1
#=GS A0A0Q9X8X2_DROMO/38-828   AC A0A0Q9X8X2.1
#=GS U6PAM9_HAECO/13-811       AC U6PAM9.1
#=GS B5E076_DROPS/81-907       AC B5E076.1
#=GS A0A0M3J1X3_ANISI/1-326    AC A0A0M3J1X3.1
#=GS A0A0Q9WGH8_DROVI/57-861   AC A0A0Q9WGH8.1
#=GS B4H3Z2_DROPE/52-256       AC B4H3Z2.1
#=GS H2ST68_TAKRU/21-828       AC H2ST68.1
#=GS A0A0G2JDS7_MOUSE/1-41     AC A0A0G2JDS7.1
#=GS K7IYK1_NASVI/31-828       AC K7IYK1.1
#=GS H9J350_BOMMO/23-343       AC H9J350.1
#=GS H3BVN5_TETNG/102-283      AC H3BVN5.1
#=GS B4GAJ2_DROPE/101-895      AC B4GAJ2.1
#=GS G0MVL9_CAEBE/150-298      AC G0MVL9.1
#=GS A0A0M3J2L0_ANISI/1-346    AC A0A0M3J2L0.1
#=GS A0A068Y880_ECHMU/254-844  AC A0A068Y880.1
#=GS H2TQU2_TAKRU/20-804       AC H2TQU2.1
#=GS K1PH12_CRAGI/229-451      AC K1PH12.1
#=GS W5M5M2_LEPOC/18-831       AC W5M5M2.1
#=GS L8Y900_TUPCH/6-516        AC L8Y900.1
#=GS G3SDW8_GORGO/18-820       AC G3SDW8.1
#=GS H2US22_TAKRU/37-842       AC H2US22.1
#=GS U4UXC4_DENPD/65-425       AC U4UXC4.1
#=GS A0A0Q9WPC3_DROVI/23-151   AC A0A0Q9WPC3.1
#=GS A0A093DLE0_CHAPE/1-437    AC A0A093DLE0.1
#=GS F0Z914_DICPU/15-257       AC F0Z914.1
#=GS I3LET7_PIG/1-429          AC I3LET7.1
#=GS E1GPZ7_LOALO/3-93         AC E1GPZ7.2
#=GS F7ICW9_CALJA/18-710       AC F7ICW9.1
#=GS A0A0M3HPF2_ASCLU/8-208    AC A0A0M3HPF2.1
#=GS H3A1N0_LATCH/1-427        AC H3A1N0.1
#=GS V4ALB1_LOTGI/11-77        AC V4ALB1.1
#=GS H2LUW1_ORYLA/1-201        AC H2LUW1.1
#=GS H3D685_TETNG/1-792        AC H3D685.1
#=GS B3M7E3_DROAN/1-742        AC B3M7E3.2
#=GS B8JMY4_DANRE/1-474        AC B8JMY4.1
#=GS B4KU79_DROMO/38-828       AC B4KU79.2
#=GS F7DVV0_MACMU/18-811       AC F7DVV0.1
#=GS U1P3X1_ASCSU/8-301        AC U1P3X1.1
#=GS H2KRJ8_CLOSI/167-536      AC H2KRJ8.1
#=GS K1R0F5_CRAGI/38-247       AC K1R0F5.1
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#=GS Q8MLN9_DROME/42-828       AC Q8MLN9.2
#=GS A0A088AAT1_APIME/443-632  AC A0A088AAT1.1
#=GS L5K554_PTEAL/273-672      AC L5K554.1
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#=GS A0A0R4IE66_DANRE/28-816   AC A0A0R4IE66.1
#=GS D6WYF5_TRICA/45-834       AC D6WYF5.1
#=GS G3I7L4_CRIGR/2-403        AC G3I7L4.1
#=GS G1KMB5_ANOCA/17-832       AC G1KMB5.2
#=GS W5PXF5_SHEEP/85-771       AC W5PXF5.1
#=GS M3ZIQ8_XIPMA/18-843       AC M3ZIQ8.1
#=GS A0A0L7KQ64_9NEOP/120-283  AC A0A0L7KQ64.1
#=GS H3A1N0_LATCH/458-694      AC H3A1N0.1
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#=GS H2P533_PONAB/647-776      AC H2P533.1
#=GS A0A0N5B086_9BILA/185-558  AC A0A0N5B086.1
#=GS F1Q4W2_DANRE/34-837       AC F1Q4W2.1
#=GS G4LYQ2_SCHMA/190-473      AC G4LYQ2.1
#=GS W5K1Z7_ASTMX/19-357       AC W5K1Z7.1
#=GS M3XSS7_MUSPF/3-735        AC M3XSS7.1
#=GS D2HWG2_AILME/3-784        AC D2HWG2.1
#=GS D6WAM5_TRICA/309-558      AC D6WAM5.1
#=GS T1KVW1_TETUR/192-315      AC T1KVW1.1
#=GS A0A0R3P6E6_DROPS/1-124    AC A0A0R3P6E6.1
#=GS F1MK52_BOVIN/18-821       AC F1MK52.2
#=GS B4N6I9_DROWI/105-914      AC B4N6I9.1
#=GS B4IHF8_DROSE/242-647      AC B4IHF8.1
#=GS M7BVV8_CHEMY/1-715        AC M7BVV8.1
#=GS S9XE13_9CETA/8-175        AC S9XE13.1
#=GS A0A0Q9X4N7_DROMO/1-701    AC A0A0Q9X4N7.1
#=GS E3LFK1_CAERE/55-581       AC E3LFK1.1
#=GS W5PJL1_SHEEP/18-821       AC W5PJL1.1
#=GS K1RD67_CRAGI/500-673      AC K1RD67.1
#=GS H2ST72_TAKRU/1-726        AC H2ST72.1
#=GS F1RD29_DANRE/1-124        AC F1RD29.1
#=GS E4XS62_OIKDI/72-327       AC E4XS62.1
#=GS F4NUF2_BATDJ/48-421       AC F4NUF2.1
#=GS A0A087WM22_ECHMU/53-487   AC A0A087WM22.1
#=GS J9LEX8_ACYPI/270-996      AC J9LEX8.2
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