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Database: Pfam
Entry: Prominin
LinkDB: Prominin
Original site: Prominin 
#=GF ID   Prominin
#=GF AC   PF05478.10
#=GF DE   Prominin
#=GF AU   Moxon SJ
#=GF SE   Pfam-B_18226 (release 8.0)
#=GF GA   31.70 31.70;
#=GF TC   31.70 31.80;
#=GF NC   31.50 31.60;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 26740544 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   11467842
#=GF RT   Rat prominin, like its mouse and human orthologues, is a
#=GF RT   pentaspan membrane glycoprotein. 
#=GF RA   Corbeil D, Fargeas CA, Huttner WB; 
#=GF RL   Biochem Biophys Res Commun 2001;285:939-944.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   10587575
#=GF RT   A frameshift mutation in prominin (mouse)-like 1 causes human
#=GF RT   retinal degeneration. 
#=GF RA   Maw MA, Corbeil D, Koch J, Hellwig A, Wilson-Wheeler JC, Bridges
#=GF RA   RJ, Kumaramanickavel G, John S, Nancarrow D, Roper K, Weigmann
#=GF RA   A, Huttner WB, Denton MJ; 
#=GF RL   Hum Mol Genet 2000;9:27-34.
#=GF DR   INTERPRO; IPR008795;
#=GF CC   The prominins are an emerging family of proteins that among the
#=GF CC   multispan membrane proteins display a novel topology. Mouse
#=GF CC   prominin and human prominin (mouse)-like 1 (PROML1) are
#=GF CC   predicted to contain five membrane spanning domains, with an
#=GF CC   N-terminal domain exposed to the extracellular space followed by
#=GF CC   four, alternating small cytoplasmic and large extracellular,
#=GF CC   loops and a cytoplasmic C-terminal domain [1]. The exact
#=GF CC   function of prominin is unknown although in humans defects in
#=GF CC   PROM1, the gene coding for prominin, cause retinal degeneration
#=GF CC   [2].
#=GF SQ   772
#=GS A0A0Q9WLM6_DROVI/37-831    AC A0A0Q9WLM6.1
#=GS A0A183AWE7_9TREM/5-158     AC A0A183AWE7.1
#=GS A0A0D8XDV9_DICVI/1-59      AC A0A0D8XDV9.1
#=GS T1HML6_RHOPR/6-218         AC T1HML6.1
#=GS A0A151NVG7_ALLMI/3-180     AC A0A151NVG7.1
#=GS A0A091EB09_CORBR/1-355     AC A0A091EB09.1
#=GS I3N8V6_ICTTR/1-755         AC I3N8V6.1
#=GS J9ETE3_WUCBA/3-234         AC J9ETE3.1
#=GS M3WLW5_FELCA/1-730         AC M3WLW5.1
#=GS B4JDN5_DROGR/250-361       AC B4JDN5.1
#=GS A0A183BDR4_9TREM/164-253   AC A0A183BDR4.1
#=GS A0A088AR64_APIME/59-853    AC A0A088AR64.1
#=GS H2ST74_TAKRU/1-720         AC H2ST74.1
#=GS H0Y9D4_HUMAN/1-43          AC H0Y9D4.1
#=GS H3CFA2_TETNG/1-778         AC H3CFA2.1
#=GS Q7Q6R9_ANOGA/24-836        AC Q7Q6R9.3
#=GS K1PJ91_CRAGI/18-673        AC K1PJ91.1
#=GS G1NJ24_MELGA/17-822        AC G1NJ24.1
#=GS K1R0F5_CRAGI/475-766       AC K1R0F5.1
#=GS A0A044T5I5_ONCVO/18-793    AC A0A044T5I5.1
#=GS B4JDN5_DROGR/360-456       AC B4JDN5.1
#=GS A0A0R4J0B0_MOUSE/18-326    AC A0A0R4J0B0.1
#=GS A0A158QFZ3_HYMDI/1-678     AC A0A158QFZ3.1
#=GS A0A091N592_CARIC/1-354     AC A0A091N592.1
#=GS F7I904_CALJA/1-263         AC F7I904.1
#=GS H3C6K6_TETNG/1-354         AC H3C6K6.1
#=GS L5K554_PTEAL/71-188        AC L5K554.1
#=GS A0JN22_RAT/18-81           AC A0JN22.1
#=GS G3QUE2_GORGO/25-807        AC G3QUE2.1
#=GS B4H409_DROPE/97-182        AC B4H409.1
#=GS A0A096NZG9_PAPAN/18-820    AC A0A096NZG9.1
#=GS A0A0N4VBF0_ENTVE/362-506   AC A0A0N4VBF0.1
#=GS G1SMB9_RABIT/25-807        AC G1SMB9.1
#=GS G3RJ70_GORGO/18-820        AC G3RJ70.1
#=GS W5LQH3_ASTMX/38-846        AC W5LQH3.1
#=GS W5PJL2_SHEEP/18-812        AC W5PJL2.1
#=GS V4BDS2_LOTGI/17-742        AC V4BDS2.1
#=GS A0A087VKU8_BALRE/18-824    AC A0A087VKU8.1
#=GS C3Y3N7_BRAFL/353-492       AC C3Y3N7.1
#=GS W5KXW9_ASTMX/23-806        AC W5KXW9.1
#=GS H0Y9Q5_HUMAN/1-71          AC H0Y9Q5.1
#=GS B4JA47_DROGR/57-865        AC B4JA47.1
#=GS I3NA83_ICTTR/26-814        AC I3NA83.1
#=GS U3IXV2_ANAPL/1-68          AC U3IXV2.1
#=GS T1IES3_RHOPR/4-319         AC T1IES3.1
#=GS B3M7E2_DROAN/103-906       AC B3M7E2.2
#=GS F7HZF4_CALJA/27-374        AC F7HZF4.1
#=GS T1KVU9_TETUR/13-287        AC T1KVU9.1
#=GS Q8IRE6_DROME/107-722       AC Q8IRE6.3
#=GS A0A093EY00_TYTAL/17-824    AC A0A093EY00.1
#=GS A0A183AP61_9TREM/3-278     AC A0A183AP61.1
#=GS PRM1A_DANRE/28-816         AC Q9W735.2
#=GS E4XF62_OIKDI/51-877        AC E4XF62.1
#=GS U3K1M8_FICAL/7-766         AC U3K1M8.1
#=GS A0A091D5N8_FUKDA/703-845   AC A0A091D5N8.1
#=GS B4QBY5_DROSI/39-435        AC B4QBY5.1
#=GS G3S7V7_GORGO/18-820        AC G3S7V7.1
#=GS F7HJD9_MACMU/25-807        AC F7HJD9.1
#=GS K1PAP9_CRAGI/38-147        AC K1PAP9.1
#=GS W2TQF5_NECAM/3-178         AC W2TQF5.1
#=GS W5JWQ1_ANODA/23-760        AC W5JWQ1.1
#=GS A0A0L8I972_OCTBM/4-135     AC A0A0L8I972.1
#=GS H2VR60_CAEJA/233-536       AC H2VR60.1
#=GS A0A0R3W159_TAEAS/659-840   AC A0A0R3W159.1
#=GS A0A0P8YDK7_DROAN/51-837    AC A0A0P8YDK7.1
#=GS PROM2_MOUSE/25-808         AC Q3UUY6.1
#=GS A0A151LY65_ALLMI/46-808    AC A0A151LY65.1
#=GS K7GRT6_PIG/1-409           AC K7GRT6.1
#=GS S9XE13_CAMFR/247-359       AC S9XE13.1
#=GS A0A091M7V6_CARIC/1-339     AC A0A091M7V6.1
#=GS A0A183P9P2_9TREM/411-788   AC A0A183P9P2.1
#=GS V8NES1_OPHHA/237-346       AC V8NES1.1
#=GS A0A0N5CZL1_THECL/74-322    AC A0A0N5CZL1.1
#=GS W4XP01_STRPU/40-588        AC W4XP01.1
#=GS A0A0G2JG30_MOUSE/18-97     AC A0A0G2JG30.1
#=GS K7G3F2_PELSI/17-813        AC K7G3F2.1
#=GS A0A0R3NGT7_DROPS/1-344     AC A0A0R3NGT7.1
#=GS A0A151NAP0_ALLMI/8-140     AC A0A151NAP0.1
#=GS A0A154PPD0_9HYME/58-852    AC A0A154PPD0.1
#=GS A0A0R3NN89_DROPS/1-504     AC A0A0R3NN89.1
#=GS A0A0R3WLR5_HYDTA/659-840   AC A0A0R3WLR5.1
#=GS A0A0Q9WNE9_DROVI/37-813    AC A0A0Q9WNE9.1
#=GS PROM1_HUMAN/18-820         AC O43490.1
#=GS W5L0W5_ASTMX/1-773         AC W5L0W5.1
#=GS F7HZF4_CALJA/419-808       AC F7HZF4.1
#=GS G5BGC4_HETGA/11-814        AC G5BGC4.1
#=GS G3NWN7_GASAC/1-749         AC G3NWN7.1
#=GS I3IYG0_ORENI/20-842        AC I3IYG0.1
#=GS K7IUF8_NASVI/17-368        AC K7IUF8.1
#=GS A0A091G3W5_9AVES/1-355     AC A0A091G3W5.1
#=GS H2ST69_TAKRU/21-713        AC H2ST69.1
#=GS J9JRA3_ACYPI/42-856        AC J9JRA3.2
#=GS A0A0G2JWD0_RAT/18-821      AC A0A0G2JWD0.1
#=GS A0A0P9C0E8_DROAN/51-837    AC A0A0P9C0E8.1
#=GS W4YY62_STRPU/22-213        AC W4YY62.1
#=GS B4H411_DROPE/95-899        AC B4H411.1
#=GS A0A183JFS6_9TREM/261-319   AC A0A183JFS6.1
#=GS M3WDQ9_FELCA/29-810        AC M3WDQ9.1
#=GS B4H680_DROPE/10-289        AC B4H680.1
#=GS A0A0Q9WCS1_DROVI/37-620    AC A0A0Q9WCS1.1
#=GS A0A0T6AU22_9SCAR/79-862    AC A0A0T6AU22.1
#=GS H2ST71_TAKRU/1-724         AC H2ST71.1
#=GS A0A099YXI5_TINGU/17-824    AC A0A099YXI5.1
#=GS A0A091W9I6_OPIHO/1-433     AC A0A091W9I6.1
#=GS A0A151P9T3_ALLMI/16-812    AC A0A151P9T3.1
#=GS G1L4H6_AILME/3-726         AC G1L4H6.1
#=GS G6DML5_DANPL/2-782         AC G6DML5.1
#=GS A0A091EZY6_CORBR/17-824    AC A0A091EZY6.1
#=GS PROM2_HUMAN/25-807         AC Q8N271.1
#=GS B4KWS6_DROMO/61-862        AC B4KWS6.1
#=GS E2AB51_CAMFO/519-811       AC E2AB51.1
#=GS A0A0L8HAG4_OCTBM/25-787    AC A0A0L8HAG4.1
#=GS B4LGX1_DROVI/57-861        AC B4LGX1.1
#=GS T1HW48_RHOPR/45-141        AC T1HW48.1
#=GS A0A091VD82_PHORB/1-618     AC A0A091VD82.1
#=GS I5APF9_DROPS/76-882        AC I5APF9.2
#=GS B4IHF8_DROSE/4-176         AC B4IHF8.1
#=GS U4UT99_DENPD/1-323         AC U4UT99.1
#=GS A0A093C0A4_9AVES/1-333     AC A0A093C0A4.1
#=GS A0A093F5D4_TYTAL/1-292     AC A0A093F5D4.1
#=GS H3CED2_TETNG/1-740         AC H3CED2.1
#=GS A0A0R3P8Q0_DROPS/95-899    AC A0A0R3P8Q0.1
#=GS G1MUN6_MELGA/3-354         AC G1MUN6.2
#=GS H2XJI5_CIOIN/8-285         AC H2XJI5.1
#=GS H2LUW2_ORYLA/1-337         AC H2LUW2.1
#=GS H7BWW9_DANRE/28-825        AC H7BWW9.2
#=GS F1RCM2_DANRE/36-837        AC F1RCM2.1
#=GS C3YIS9_BRAFL/780-911       AC C3YIS9.1
#=GS H2QP91_PANTR/18-820        AC H2QP91.1
#=GS K1R0F5_CRAGI/241-461       AC K1R0F5.1
#=GS A0A0C2FE21_9BILA/2-58      AC A0A0C2FE21.1
#=GS A0A0N4TRJ7_BRUPA/14-462    AC A0A0N4TRJ7.1
#=GS M3XKH5_LATCH/23-603        AC M3XKH5.1
#=GS A0A016TBU7_9BILA/28-821    AC A0A016TBU7.1
#=GS A0A091V5K0_OPIHO/1-365     AC A0A091V5K0.1
#=GS H2QIC1_PANTR/25-807        AC H2QIC1.1
#=GS A0A0Q9XBX0_DROMO/65-839    AC A0A0Q9XBX0.1
#=GS A0A0N4XYD3_NIPBR/235-806   AC A0A0N4XYD3.1
#=GS I3JSU1_ORENI/22-800        AC I3JSU1.1
#=GS G5E8G5_MOUSE/18-822        AC G5E8G5.1
#=GS F1NQ52_CHICK/29-811        AC F1NQ52.2
#=GS E2AWX0_CAMFO/9-735         AC E2AWX0.1
#=GS B4IZP7_DROGR/73-877        AC B4IZP7.1
#=GS G6CNJ2_DANPL/3-212         AC G6CNJ2.1
#=GS S7NCQ3_MYOBR/18-174        AC S7NCQ3.1
#=GS F7ES12_MONDO/20-823        AC F7ES12.2
#=GS B4QP19_DROSI/305-728       AC B4QP19.1
#=GS T1GIW2_MEGSC/1-32          AC T1GIW2.1
#=GS A0A026VYZ0_CERBI/463-764   AC A0A026VYZ0.1
#=GS A0A091J326_CALAN/4-446     AC A0A091J326.1
#=GS F7HZI3_CALJA/1-284         AC F7HZI3.1
#=GS U6IVX4_ECHGR/254-844       AC U6IVX4.1
#=GS B0WLP3_CULQU/9-803         AC B0WLP3.1
#=GS A0A151LY66_ALLMI/46-813    AC A0A151LY66.1
#=GS A0A0N5CKZ7_THECL/12-793    AC A0A0N5CKZ7.1
#=GS H9J350_BOMMO/347-663       AC H9J350.1
#=GS G1PC77_MYOLU/27-807        AC G1PC77.1
#=GS A0A139AJW2_GONPR/5-245     AC A0A139AJW2.1
#=GS A0A091P0E1_APAVI/1-355     AC A0A091P0E1.1
#=GS A0A074Z2G3_9TREM/803-862   AC A0A074Z2G3.1
#=GS F1PMC8_CANLF/1-741         AC F1PMC8.2
#=GS H3F9A2_PRIPA/19-792        AC H3F9A2.1
#=GS U3K3R9_FICAL/17-822        AC U3K3R9.1
#=GS F6VPE5_ORNAN/1-548         AC F6VPE5.2
#=GS G3I7L4_CRIGR/441-554       AC G3I7L4.1
#=GS PROM1_MOUSE/18-822         AC O54990.1
#=GS B0W3X9_CULQU/85-895        AC B0W3X9.1
#=GS A0A091UXF9_NIPNI/18-825    AC A0A091UXF9.1
#=GS A0A0G2JDH9_MOUSE/18-813    AC A0A0G2JDH9.1
#=GS A0A0N5B086_9BILA/20-325    AC A0A0N5B086.1
#=GS A0A091N1J1_APAVI/1-722     AC A0A091N1J1.1
#=GS B4H679_DROPE/17-333        AC B4H679.1
#=GS G4LYQ2_SCHMA/21-179        AC G4LYQ2.1
#=GS A0A0B2W1M0_TOXCA/13-270    AC A0A0B2W1M0.1
#=GS V8NYI4_OPHHA/319-491       AC V8NYI4.1
#=GS K1PAP9_CRAGI/143-416       AC K1PAP9.1
#=GS F7AD77_XENTR/1-768         AC F7AD77.1
#=GS H3A1N1_LATCH/1-423         AC H3A1N1.1
#=GS A0A158QIW0_HYMNN/105-263   AC A0A158QIW0.1
#=GS A0A177WBC9_BATDE/48-421    AC A0A177WBC9.1
#=GS A0A093HCR5_STRCA/18-824    AC A0A093HCR5.1
#=GS A0A0R4IHU7_DANRE/28-833    AC A0A0R4IHU7.1
#=GS H3A1N1_LATCH/454-693       AC H3A1N1.1
#=GS H2US24_TAKRU/1-774         AC H2US24.1
#=GS F1PQT5_CANLF/30-810        AC F1PQT5.2
#=GS B4QP19_DROSI/37-174        AC B4QP19.1
#=GS B4HTJ7_DROSE/98-691        AC B4HTJ7.1
#=GS F1NI31_CHICK/14-777        AC F1NI31.2
#=GS H2P533_PONAB/25-654        AC H2P533.1
#=GS A0A194R939_PAPMA/20-395    AC A0A194R939.1
#=GS H2TQU1_TAKRU/20-804        AC H2TQU1.1
#=GS J9NZU4_CANLF/19-812        AC J9NZU4.1
#=GS D6WAM5_TRICA/11-744        AC D6WAM5.2
#=GS B3S358_TRIAD/27-617        AC B3S358.1
#=GS T1IH19_STRMM/328-971       AC T1IH19.1
#=GS Q17FE4_AEDAE/5-804         AC Q17FE4.1
#=GS A0A087QRH9_APTFO/1-437     AC A0A087QRH9.1
#=GS B4JQU2_DROGR/1-392         AC B4JQU2.1
#=GS A0A0J7P3N1_LASNI/10-735    AC A0A0J7P3N1.1
#=GS F7F7K6_ORNAN/255-581       AC F7F7K6.2
#=GS H2ST70_TAKRU/19-826        AC H2ST70.1
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#=GS F7D5R8_MONDO/26-807        AC F7D5R8.1
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#=GS E2AB51_CAMFO/80-448        AC E2AB51.1
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#=GS A0A158PR86_BRUPA/257-513   AC A0A158PR86.1
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#=GS A0A091J3Z2_9AVES/1-348     AC A0A091J3Z2.1
#=GS H2LUW0_ORYLA/1-276         AC H2LUW0.1
#=GS H3C1Y7_TETNG/1-778         AC H3C1Y7.1
#=GS A0A091LNQ9_9GRUI/18-825    AC A0A091LNQ9.1
#=GS G1S3H0_NOMLE/18-811        AC G1S3H0.2
#=GS A0A0N4UH39_DRAME/15-436    AC A0A0N4UH39.2
#=GS H0XAK7_OTOGA/18-811        AC H0XAK7.1
#=GS H2N0M2_ORYLA/1-753         AC H2N0M2.1
#=GS A0A0N4VD09_ENTVE/287-606   AC A0A0N4VD09.1
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#=GS K7ETR4_PONAB/1-35          AC K7ETR4.1
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#=GS N6W5D5_DROPS/58-839        AC N6W5D5.2
#=GS U3IXV2_ANAPL/629-718       AC U3IXV2.1
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#=GS A0A0R3P6E6_DROPS/1-124     AC A0A0R3P6E6.1
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#=GS A0A183R7Z1_9TREM/148-206   AC A0A183R7Z1.1
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#=GS E3LFK1_CAERE/55-581        AC E3LFK1.1
#=GS W5PJL1_SHEEP/18-821        AC W5PJL1.1
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#=GS A0A0Q3PMM0_AMAAE/225-623   AC A0A0Q3PMM0.1
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#=GS A0A0R3QWB6_9BILA/15-495    AC A0A0R3QWB6.1
#=GS E4XS62_OIKDI/72-327        AC E4XS62.1
#=GS A0A093ETS5_GAVST/18-440    AC A0A093ETS5.1
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#=GS J9LEX8_ACYPI/270-996       AC J9LEX8.2
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#=GS Q29E29_DROPS/95-899        AC Q29E29.2
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#=GS A0A183FWT7_HELBK/1-464     AC A0A183FWT7.1
#=GS B7Q7R7_IXOSC/1-90          AC B7Q7R7.1
#=GS A0A0H5SCY7_BRUMA/14-310    AC A0A0H5SCY7.1
#=GS A0A0N4VD09_ENTVE/1-304     AC A0A0N4VD09.1
#=GS B7PAU5_IXOSC/21-266        AC B7PAU5.1
#=GS B4H412_DROPE/92-898        AC B4H412.1
#=GS A0A087VX08_ECHMU/19-508    AC A0A087VX08.1
#=GS V8NYI4_OPHHA/218-318       AC V8NYI4.1
#=GS A0A151WHC5_9HYME/31-455    AC A0A151WHC5.1
#=GS A0A085MZL7_9BILA/4-242     AC A0A085MZL7.1
#=GS A0A074ZEY6_9TREM/88-494    AC A0A074ZEY6.1
#=GS A0A0P8XU56_DROAN/103-906   AC A0A0P8XU56.1
#=GS A0A091JUQ5_COLST/1-355     AC A0A091JUQ5.1
#=GS F6QEH7_XENTR/12-732        AC F6QEH7.1
#=GS F7HZF0_CALJA/1-105         AC F7HZF0.1
#=GS A0A087VS43_BALRE/1-354     AC A0A087VS43.1
#=GS G3WAK0_SARHA/26-807        AC G3WAK0.1
#=GS L5K6S1_PTEAL/18-359        AC L5K6S1.1
#=GS PROML_DROME/76-881         AC P82295.1
#=GS A0A091T1J2_NESNO/1-432     AC A0A091T1J2.1
#=GS A0A094KJK8_9AVES/1-258     AC A0A094KJK8.1
#=GS A0A0L8HAS2_OCTBM/25-784    AC A0A0L8HAS2.1
#=GS S7NF69_MYOBR/98-209        AC S7NF69.1
#=GS A0A091M1Y2_CARIC/1-652     AC A0A091M1Y2.1
#=GS Q291C4_DROPS/1-724         AC Q291C4.3
#=GS M9PBK6_DROME/76-881        AC M9PBK6.1
#=GS H0WPV2_OTOGA/23-805        AC H0WPV2.1
#=GS G7YJK5_CLOSI/1-94          AC G7YJK5.1
#=GS W4ZHZ7_STRPU/9-89          AC W4ZHZ7.1
#=GS W4XSR7_STRPU/120-459       AC W4XSR7.1
#=GS A0A0N4TRJ7_BRUPA/456-753   AC A0A0N4TRJ7.1
#=GS A0A0R3S9R5_HYMDI/345-839   AC A0A0R3S9R5.1
#=GS E2BRB1_HARSA/432-753       AC E2BRB1.1
#=GS A0A0G2JE50_MOUSE/18-321    AC A0A0G2JE50.1
#=GS A0A0L0CCD5_LUCCU/47-851    AC A0A0L0CCD5.1
#=GS A0A091GR84_BUCRH/1-355     AC A0A091GR84.1
#=GS A0A177WC86_BATDE/35-428    AC A0A177WC86.1
#=GS W4Z2W2_STRPU/1-444         AC W4Z2W2.1
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#=GS H3FMA3_PRIPA/89-429        AC H3FMA3.1
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