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Database: Pfam
Entry: RIO1
LinkDB: RIO1
Original site: RIO1 
#=GF ID   RIO1
#=GF AC   PF01163.19
#=GF DE   RIO1 family
#=GF AU   Finn RD, Bateman A, Wood V, Mistry J
#=GF SE   Prosite
#=GF GA   20.40 20.40;
#=GF TC   20.40 20.40;
#=GF NC   20.30 20.30;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 11927849 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   12021457
#=GF RT   Lipopolysaccharide phosphorylating enzymes encoded in the
#=GF RT   genomes of Gram-negative bacteria are related to the eukaryotic
#=GF RT   protein kinases. 
#=GF RA   Krupa A, Srinivasan N; 
#=GF RL   Protein Sci 2002;11:1580-1584.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   12612080
#=GF RT   Late cytoplasmic maturation of the small ribosomal subunit
#=GF RT   requires RIO proteins in Saccharomyces cerevisiae. 
#=GF RA   Vanrobays E, Gelugne JP, Gleizes PE, Caizergues-Ferrer M; 
#=GF RL   Mol Cell Biol 2003;23:2083-2095.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   12690111
#=GF RT   Rio2p: An evolutionarily conserved, low-abundant protein kinase
#=GF RT   essential for processing of 20S Pre-rRNA in Saccharomyces
#=GF RT   cerevisiae. 
#=GF RA   Geerlings TH, Faber AW, Bister M, Vos JC, Raue HA; 
#=GF RL   0;0:0-0.
#=GF RN   [4]
#=GF RM   16008568
#=GF RT   Structure and activity of the atypical serine kinase Rio1. 
#=GF RA   Laronde-Leblanc N, Guszczynski T, Copeland T, Wlodawer A; 
#=GF RL   FEBS J 2005;272:3698-3713.
#=GF DR   INTERPRO; IPR018934;
#=GF DR   PROSITE; PDOC00958;
#=GF CC   This is a family of atypical serine kinases which are found in
#=GF CC   archaea, bacteria and eukaryotes.                         
#=GF CC   Activity of Rio1 is vital in Saccharomyces cerevisiae for the
#=GF CC   processing of ribosomal RNA, as well as for proper cell cycle
#=GF CC   progression and chromosome maintenance.  The structure of RIO1
#=GF CC   has been determined [4].
#=GF SQ   1688
#=GS S8EMA3_FOMPI/412-461      AC S8EMA3.1
#=GS L0KVY6_METHD/19-158       AC L0KVY6.1
#=GS C4YCV5_CANAW/113-306      AC C4YCV5.1
#=GS B4QUS1_DROSI/108-287      AC B4QUS1.1
#=GS M4FCS1_BRARP/106-284      AC M4FCS1.1
#=GS A0A0C2J7C8_THEKT/78-267   AC A0A0C2J7C8.1
#=GS D2RHP8_ARCPA/64-255       AC D2RHP8.1
#=GS A8Q5A1_MALGO/170-367      AC A8Q5A1.1
#=GS V6TQ34_GIAIN/107-296      AC V6TQ34.1
#=GS Q0W8M8_METAR/68-251       AC Q0W8M8.1
#=GS W4XNT1_STRPU/202-326      AC W4XNT1.1
#=GS C5DD24_LACTC/108-292      AC C5DD24.1
#=GS G7UN84_PSEUP/30-224       AC G7UN84.1
#=GS W5JH76_ANODA/108-286      AC W5JH76.1
#=GS RIO2_YEAST/108-293        AC P40160.1
#=GS F0VLM9_NEOCL/106-283      AC F0VLM9.1
#=GS A0A091DNS1_FUKDA/239-427  AC A0A091DNS1.1
#=GS E1G7Q8_LOALO/17-199       AC E1G7Q8.1
#=GS A6QZ58_AJECN/1-84         AC A6QZ58.1
#=GS E1QQ30_VULDI/64-191       AC E1QQ30.1
#=GS L8Y1P6_TUPCH/116-214      AC L8Y1P6.1
#=GS H2PG62_PONAB/108-284      AC H2PG62.1
#=GS F2KPS4_ARCVS/67-254       AC F2KPS4.1
#=GS S7ZPC1_PENO1/108-241      AC S7ZPC1.1
#=GS K0KK52_WICCF/108-293      AC K0KK52.1
#=GS B0CQ65_LACBS/107-287      AC B0CQ65.1
#=GS W5L8B2_ASTMX/242-437      AC W5L8B2.1
#=GS B4KGQ8_DROMO/313-517      AC B4KGQ8.1
#=GS A0A096NKS3_PAPAN/192-380  AC A0A096NKS3.1
#=GS M4BSL8_HYAAE/200-397      AC M4BSL8.1
#=GS F4BVA5_METCG/65-249       AC F4BVA5.1
#=GS F7I7F9_CALJA/108-284      AC F7I7F9.1
#=GS B9RAG3_RICCO/1-131        AC B9RAG3.1
#=GS E7QKQ8_YEASZ/89-301       AC E7QKQ8.1
#=GS W7K8Q8_PLAFO/106-283      AC W7K8Q8.1
#=GS K0SXD0_THAOC/107-259      AC K0SXD0.1
#=GS S6F6T2_ZYGB2/89-285       AC S6F6T2.1
#=GS E7Q8A4_YEASB/108-293      AC E7Q8A4.1
#=GS X6MK19_RETFI/39-156       AC X6MK19.1
#=GS A8Y2F5_CAEBR/350-503      AC A8Y2F5.1
#=GS R4T0V4_AMYOR/110-299      AC R4T0V4.1
#=GS C5MCX9_CANTT/114-307      AC C5MCX9.1
#=GS I1N3N2_SOYBN/194-382      AC I1N3N2.2
#=GS D4AJA4_ARTBC/193-240      AC D4AJA4.1
#=GS H2ZSD4_LATCH/108-285      AC H2ZSD4.1
#=GS A0A0C4DMF4_MAGP6/272-317  AC A0A0C4DMF4.1
#=GS W5Q9S9_SHEEP/108-284      AC W5Q9S9.1
#=GS M3AMD3_PSEFD/109-292      AC M3AMD3.1
#=GS M5DSN8_9GAMM/30-226       AC M5DSN8.1
#=GS Q0D8G3_ORYSJ/129-317      AC Q0D8G3.1
#=GS F8DCV6_HALXS/86-214       AC F8DCV6.1
#=GS M5E718_MALS4/292-345      AC M5E718.1
#=GS B8BUR8_THAPS/531-659      AC B8BUR8.1
#=GS H9JS87_BOMMO/108-284      AC H9JS87.1
#=GS A0A0C4EHX0_PUCT1/227-431  AC A0A0C4EHX0.1
#=GS F4D148_PSEUX/114-303      AC F4D148.1
#=GS I3M8B2_SPETR/108-284      AC I3M8B2.1
#=GS F7W2G4_SORMK/212-352      AC F7W2G4.1
#=GS D2VR17_NAEGR/265-464      AC D2VR17.1
#=GS Q6BVU2_DEBHA/553-620      AC Q6BVU2.1
#=GS B5ICK9_ACIB4/66-247       AC B5ICK9.1
#=GS Q2U6C8_ASPOR/258-304      AC Q2U6C8.1
#=GS F4J3B0_ARATH/106-276      AC F4J3B0.1
#=GS Q8EAD3_SHEON/30-226       AC Q8EAD3.1
#=GS F7PJW2_9EURY/136-325      AC F7PJW2.1
#=GS C5LWY2_PERM5/106-297      AC C5LWY2.1
#=GS G4N3B9_MAGO7/184-383      AC G4N3B9.1
#=GS A2BML7_HYPBU/40-230       AC A2BML7.1
#=GS E9D887_COCPS/189-385      AC E9D887.1
#=GS G0MKB6_CAEBE/260-446      AC G0MKB6.1
#=GS Q21KF9_SACD2/30-226       AC Q21KF9.1
#=GS A3FQ05_CRYPI/2-154        AC A3FQ05.1
#=GS G0A7T2_METMM/30-226       AC G0A7T2.1
#=GS I3YF43_THIV6/30-225       AC I3YF43.1
#=GS D8U638_VOLCA/106-284      AC D8U638.1
#=GS J8LI52_SACAR/89-301       AC J8LI52.1
#=GS B6A9M2_CRYMR/227-333      AC B6A9M2.1
#=GS F4SE82_MELLP/18-84        AC F4SE82.1
#=GS N1QDI7_SPHMS/108-296      AC N1QDI7.1
#=GS E2LEI2_MONPE/6-84         AC E2LEI2.1
#=GS B8BWB8_THAPS/107-293      AC B8BWB8.1
#=GS K1QR41_CRAGI/109-286      AC K1QR41.1
#=GS S0DNE4_GIBF5/109-297      AC S0DNE4.1
#=GS L2GQ60_VITCO/14-154       AC L2GQ60.1
#=GS W5CL08_WHEAT/206-267      AC W5CL08.1
#=GS H0WYJ4_OTOGA/108-284      AC H0WYJ4.1
#=GS M7TW13_BOTF1/106-293      AC M7TW13.1
#=GS A4FM49_SACEN/108-309      AC A4FM49.1
#=GS T1G0M2_HELRO/242-433      AC T1G0M2.1
#=GS RIOK3_MOUSE/264-464       AC Q9DBU3.3
#=GS U4LQV2_PYROM/177-369      AC U4LQV2.1
#=GS H2VXP4_CAEJA/108-286      AC H2VXP4.2
#=GS A0A0B5HKK4_9ARCH/56-243   AC A0A0B5HKK4.1
#=GS U6GEA5_EIMAC/145-291      AC U6GEA5.1
#=GS A8BUB5_GIAIC/50-193       AC A8BUB5.1
#=GS D8QJZ3_SCHCM/114-246      AC D8QJZ3.1
#=GS K3WPD6_PYTUL/75-264       AC K3WPD6.1
#=GS A0A0A2LEM7_PENIT/257-304  AC A0A0A2LEM7.1
#=GS L0PD18_PNEJ8/169-357      AC L0PD18.1
#=GS F6PZN3_MACMU/192-377      AC F6PZN3.1
#=GS Q6BTI4_DEBHA/553-619      AC Q6BTI4.2
#=GS H2QS96_PANTR/193-381      AC H2QS96.1
#=GS B9LMZ9_HALLT/85-203       AC B9LMZ9.1
#=GS A2QCV1_ASPNC/192-390      AC A2QCV1.1
#=GS M2MB74_BAUCO/179-388      AC M2MB74.1
#=GS F0XNJ6_GROCL/85-304       AC F0XNJ6.1
#=GS C1GUU2_PARBA/108-242      AC C1GUU2.1
#=GS F8PT94_SERL3/107-296      AC F8PT94.1
#=GS M2UE55_COCH5/108-292      AC M2UE55.1
#=GS Q9HKV5_THEAC/203-298      AC Q9HKV5.1
#=GS N0BD50_9EURY/106-275      AC N0BD50.1
#=GS E9I1Q6_DAPPU/46-127       AC E9I1Q6.1
#=GS H1YYW9_9EURY/106-283      AC H1YYW9.1
#=GS E7KII8_YEASA/89-301       AC E7KII8.1
#=GS B8GGC9_METPE/67-248       AC B8GGC9.1
#=GS A0A0A8DZF7_9XANT/30-225   AC A0A0A8DZF7.1
#=GS Q22Z80_TETTS/106-285      AC Q22Z80.2
#=GS C4JRY6_UNCRE/151-286      AC C4JRY6.1
#=GS F0UE58_AJEC8/108-242      AC F0UE58.1
#=GS G4TWW8_PIRID/211-401      AC G4TWW8.1
#=GS A0A0D2XEX4_FUSO4/172-370  AC A0A0D2XEX4.1
#=GS W5HXG4_WHEAT/35-158       AC W5HXG4.1
#=GS C1N7H7_MICPC/68-256       AC C1N7H7.1
#=GS KAE1B_METMJ/354-476       AC A3CXS0.1
#=GS D0IW02_COMT2/71-197       AC D0IW02.1
#=GS G4U2L0_PIRID/107-283      AC G4U2L0.1
#=GS F0LJU1_THEBM/63-249       AC F0LJU1.1
#=GS Q0U2L6_PHANO/108-292      AC Q0U2L6.1
#=GS G1R4W5_NOMLE/264-464      AC G1R4W5.1
#=GS KAE1B_THEAC/340-477       AC Q9HLA5.1
#=GS Q16NT9_AEDAE/199-387      AC Q16NT9.1
#=GS M4BXJ4_HYAAE/99-277       AC M4BXJ4.1
#=GS Q2H830_CHAGB/186-384      AC Q2H830.1
#=GS I2FQK7_USTH4/107-243      AC I2FQK7.1
#=GS M3D4Z8_SPHMS/171-373      AC M3D4Z8.1
#=GS U1HMN2_ENDPU/276-321      AC U1HMN2.1
#=GS A7EAI4_SCLS1/29-155       AC A7EAI4.1
#=GS Q4DWT1_TRYCC/177-366      AC Q4DWT1.1
#=GS V4CEV0_LOTGI/109-286      AC V4CEV0.1
#=GS RIOK2_HUMAN/108-284       AC Q9BVS4.2
#=GS R4VU31_9EURY/107-281      AC R4VU31.1
#=GS N1J6I1_BLUG1/106-243      AC N1J6I1.1
#=GS G2MIL9_9ARCH/92-202       AC G2MIL9.1
#=GS A2WXS3_ORYSI/106-284      AC A2WXS3.1
#=GS R0MIQ5_NOSB1/96-267       AC R0MIQ5.1
#=GS G7P4D1_MACFA/192-380      AC G7P4D1.1
#=GS E5STQ6_TRISP/226-406      AC E5STQ6.1
#=GS B5RT71_DEBHA/543-638      AC B5RT71.1
#=GS E2RP92_CANFA/194-382      AC E2RP92.2
#=GS A0A0D5VLF1_9BURK/30-225   AC A0A0D5VLF1.1
#=GS A0A072U729_MEDTR/69-114   AC A0A072U729.1
#=GS L0HE92_METFS/95-277       AC L0HE92.1
#=GS R9AIX2_WALI9/443-638      AC R9AIX2.1
#=GS L2GKD3_VITCO/75-191       AC L2GKD3.1
#=GS B4JQA5_DROGR/299-506      AC B4JQA5.1
#=GS A1CBC4_ASPCL/260-305      AC A1CBC4.1
#=GS L7JZD3_TRAHO/42-210       AC L7JZD3.1
#=GS Q9SK34_ARATH/178-366      AC Q9SK34.1
#=GS D5GAI6_TUBMM/141-338      AC D5GAI6.1
#=GS L5KJM4_PTEAL/108-284      AC L5KJM4.1
#=GS C0ND63_AJECG/177-375      AC C0ND63.1
#=GS A7APL1_BABBO/106-284      AC A7APL1.1
#=GS H3BCT4_LATCH/265-460      AC H3BCT4.1
#=GS J7S750_KAZNA/108-296      AC J7S750.1
#=GS A0A0B5HF86_9ARCH/16-157   AC A0A0B5HF86.1
#=GS E1ZQR8_CHLVA/98-274       AC E1ZQR8.1
#=GS M5G492_DACSP/229-418      AC M5G492.1
#=GS H0YSK4_TAEGU/108-284      AC H0YSK4.1
#=GS Q6BYA5_DEBHA/108-292      AC Q6BYA5.2
#=GS D5GP02_TUBMM/108-285      AC D5GP02.1
#=GS I3R0X6_HALMT/92-274       AC I3R0X6.1
#=GS D6WVA9_TRICA/260-456      AC D6WVA9.1
#=GS J9DIK6_EDHAE/232-394      AC J9DIK6.1
#=GS T0M5B1_9EURY/339-471      AC T0M5B1.1
#=GS A0RVP6_CENSY/62-180       AC A0RVP6.1
#=GS Q4WVD7_ASPFU/105-239      AC Q4WVD7.1
#=GS A6VRQ7_MARMS/30-226       AC A6VRQ7.1
#=GS R9SP14_9EURY/61-249       AC R9SP14.1
#=GS F7W2G4_SORMK/361-406      AC F7W2G4.1
#=GS A0A0C4E9E1_MAGP6/186-400  AC A0A0C4E9E1.1
#=GS R7YG45_CONA1/108-242      AC R7YG45.1
#=GS L8G0D8_PSED2/36-102       AC L8G0D8.1
#=GS V4ZBP1_TOXGO/106-283      AC V4ZBP1.1
#=GS U1GRJ2_ENDPU/4-83         AC U1GRJ2.1
#=GS N4U9X4_FUSC1/109-297      AC N4U9X4.1
#=GS Q7XIL7_ORYSJ/129-317      AC Q7XIL7.1
#=GS J4HXV0_FIBRA/360-409      AC J4HXV0.1
#=GS B4E1Q4_HUMAN/248-448      AC B4E1Q4.1
#=GS Q6M1B2_METMP/93-285       AC Q6M1B2.1
#=GS B4G9J4_DROPE/309-517      AC B4G9J4.1
#=GS Q9HN65_HALSA/12-194       AC Q9HN65.1
#=GS A0A024MPG7_BRUMA/1-165    AC A0A024MPG7.1
#=GS D1AK07_SEBTE/255-348      AC D1AK07.1
#=GS G7WM87_METH6/27-143       AC G7WM87.1
#=GS G4RKK5_THETK/65-187       AC G4RKK5.1
#=GS Q0VTL1_ALCBS/36-230       AC Q0VTL1.1
#=GS U5FL66_POPTR/106-284      AC U5FL66.1
#=GS Q5JH79_THEKO/65-250       AC Q5JH79.1
#=GS H2ZSG1_LATCH/195-383      AC H2ZSG1.1
#=GS H2AVZ3_KAZAF/91-319       AC H2AVZ3.1
#=GS N1R6T5_FUSC4/109-297      AC N1R6T5.1
#=GS R1E819_BOTPV/106-241      AC R1E819.1
#=GS F6Y7X8_MONDO/195-383      AC F6Y7X8.2
#=GS L8WYC9_THACA/1-69         AC L8WYC9.1
#=GS G4RKV4_THETK/28-180       AC G4RKV4.1
#=GS H3GGE6_PHYRM/198-395      AC H3GGE6.1
#=GS Q7S8R7_NEUCR/109-248      AC Q7S8R7.3
#=GS H8MFM0_CORCM/28-220       AC H8MFM0.1
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#=GS B1KE90_SHEWM/30-226       AC B1KE90.1
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#=GS G1PTV9_MYOLU/108-284      AC G1PTV9.1
#=GS L5K2X0_PTEAL/522-722      AC L5K2X0.1
#=GS E9D2C7_COCPS/258-305      AC E9D2C7.1
#=GS E1FST6_LOALO/133-310      AC E1FST6.1
#=GS F6D6I7_METPW/370-489      AC F6D6I7.1
#=GS RIO2_DICDI/106-281        AC Q54T05.1
#=GS K3WY92_PYTUL/61-253       AC K3WY92.1
#=GS E3L1C1_PUCGT/107-291      AC E3L1C1.1
#=GS J3MIQ9_ORYBR/199-387      AC J3MIQ9.1
#=GS Q7PXQ6_ANOGA/108-286      AC Q7PXQ6.4
#=GS K0T399_THAOC/181-383      AC K0T399.1
#=GS F7XPT4_METZD/355-493      AC F7XPT4.1
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#=GS B0X928_CULQU/108-170      AC B0X928.1
#=GS E6N5B8_9ARCH/28-160       AC E6N5B8.1
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#=GS RIOK3_HUMAN/264-464       AC O14730.2
#=GS B6TP94_MAIZE/167-355      AC B6TP94.1
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#=GS G1MXN3_MELGA/192-380      AC G1MXN3.2
#=GS D4AM34_ARTBC/182-380      AC D4AM34.1
#=GS Q5CRP5_CRYPI/117-235      AC Q5CRP5.1
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#=GS G2Q3V1_THIHA/109-297      AC G2Q3V1.1
#=GS A0CBE5_PARTE/106-283      AC A0CBE5.1
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#=GS RIO2_ARCFU/105-275        AC O30245.1
#=GS RIO2_ARCFU/105-275        DR PDB; 1TQP A; 105-275;
#=GS RIO2_ARCFU/105-275        DR PDB; 1ZAR A; 105-275;
#=GS RIO2_ARCFU/105-275        DR PDB; 1TQI A; 105-275;
#=GS RIO2_ARCFU/105-275        DR PDB; 1ZAO A; 105-275;
#=GS RIO2_ARCFU/105-275        DR PDB; 1TQM A; 105-275;
#=GS Q8TMY0_METAC/107-288      AC Q8TMY0.1
#=GS R8BHU2_TOGMI/252-300      AC R8BHU2.1
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#=GS H2QEC3_PANTR/264-464      AC H2QEC3.1
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#=GS M5G0S8_DACSP/136-224      AC M5G0S8.1
#=GS D7FSZ9_ECTSI/262-374      AC D7FSZ9.1
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#=GS L8FUZ1_PSED2/75-200       AC L8FUZ1.1
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#=GS Q8STQ0_ENCCU/100-268      AC Q8STQ0.1
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#=GS RIO1_ENCCU/71-261         AC Q8SVI7.2
#=GS F2Q534_TRIEC/182-380      AC F2Q534.1
#=GS D6WDG3_TRICA/108-285      AC D6WDG3.1
#=GS A5WUT7_DANRE/108-285      AC A5WUT7.1
#=GS S8EKT8_FOMPI/107-285      AC S8EKT8.1
#=GS U4TZZ4_DENPD/111-191      AC U4TZZ4.1
#=GS E2RPJ3_CANFA/264-464      AC E2RPJ3.2
#=GS F9FKY4_FUSOF/172-370      AC F9FKY4.1
#=GS R5QUH8_9FIRM/175-303      AC R5QUH8.1
#=GS A4YIW1_METS5/25-154       AC A4YIW1.1
#=GS F7HQF6_CALJA/358-558      AC F7HQF6.1
#=GS E7QJQ7_YEASZ/108-293      AC E7QJQ7.1
#=GS M7ZS82_TRIUA/200-380      AC M7ZS82.1
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#=GS G3H742_CRIGR/108-197      AC G3H742.1
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#=GS L0KWR1_METHD/67-253       AC L0KWR1.1
#=GS A0A0B5HTY3_9ARCH/8-150    AC A0A0B5HTY3.1
#=GS Q12NN8_SHEDO/30-226       AC Q12NN8.1
#=GS G1K8C9_ANOCA/267-464      AC G1K8C9.2
#=GS A5GEE7_GEOUR/30-225       AC A5GEE7.1
#=GS U3JUF5_FICAL/266-463      AC U3JUF5.1
#=GS C0QC92_DESAH/30-224       AC C0QC92.1
#=GS D1YYL5_METPS/106-281      AC D1YYL5.1
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#=GS Q23DM3_TETTS/193-382      AC Q23DM3.1
#=GS G1SFU7_RABIT/108-284      AC G1SFU7.1
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#=GS J9DGY8_EDHAE/104-278      AC J9DGY8.1
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#=GS RIOK1_HUMAN/193-381       AC Q9BRS2.2
#=GS RIOK1_HUMAN/193-381       DR PDB; 4OTP A; 193-381;
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#=GS H2S2N0_TAKRU/272-349      AC H2S2N0.1
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#=GS B2AUW2_PODAN/198-396      AC B2AUW2.1
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#=GS G1N581_MELGA/96-273       AC G1N581.2
#=GS E3KGZ5_PUCGT/227-431      AC E3KGZ5.1
#=GS D8J824_HALJB/95-276       AC D8J824.1
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