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Database: Pfam
Entry: RIO1
LinkDB: RIO1
Original site: RIO1 
#=GF ID   RIO1
#=GF AC   PF01163.17
#=GF DE   RIO1 family
#=GF AU   Finn RD, Bateman A, Wood V, Mistry J
#=GF SE   Prosite
#=GF GA   20.40 20.40;
#=GF TC   20.40 20.40;
#=GF NC   20.30 20.30;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 23193494 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   12021457
#=GF RT   Lipopolysaccharide phosphorylating enzymes encoded in the
#=GF RT   genomes of Gram-negative bacteria are related to the eukaryotic
#=GF RT   protein kinases. 
#=GF RA   Krupa A, Srinivasan N; 
#=GF RL   Protein Sci 2002;11:1580-1584.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   12612080
#=GF RT   Late cytoplasmic maturation of the small ribosomal subunit
#=GF RT   requires RIO proteins in Saccharomyces cerevisiae. 
#=GF RA   Vanrobays E, Gelugne JP, Gleizes PE, Caizergues-Ferrer M; 
#=GF RL   Mol Cell Biol 2003;23:2083-2095.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   12690111
#=GF RT   Rio2p: An evolutionarily conserved, low-abundant protein kinase
#=GF RT   essential for processing of 20S Pre-rRNA in Saccharomyces
#=GF RT   cerevisiae. 
#=GF RA   Geerlings TH, Faber AW, Bister M, Vos JC, Raue HA; 
#=GF RL   0;0:0-0.
#=GF RN   [4]
#=GF RM   16008568
#=GF RT   Structure and activity of the atypical serine kinase Rio1. 
#=GF RA   Laronde-Leblanc N, Guszczynski T, Copeland T, Wlodawer A; 
#=GF RL   FEBS J 2005;272:3698-3713.
#=GF DR   INTERPRO; IPR018934;
#=GF DR   PROSITE; PDOC00958;
#=GF CC   This is a family of atypical serine kinases which are found in
#=GF CC   archaea, bacteria and eukaryotes.		 Activity of Rio1
#=GF CC   is vital in Saccharomyces cerevisiae for the processing of
#=GF CC   ribosomal RNA, as well as for proper cell cycle progression and
#=GF CC   chromosome maintenance.  The structure of RIO1 has been
#=GF CC   determined [4].
#=GF SQ   1707
#=GS C4YCV5_CANAW/113-306    AC C4YCV5.1
#=GS D2RHP8_ARCPA/64-255     AC D2RHP8.1
#=GS Q802W9_DANRE/108-285    AC Q802W9.1
#=GS B0KUT3_PSEPG/30-226     AC B0KUT3.1
#=GS RIO2_YEAST/108-293      AC P40160.1
#=GS E1G7Q8_LOALO/17-199     AC E1G7Q8.1
#=GS A6QZ58_AJECN/1-84       AC A6QZ58.1
#=GS B0CQ65_LACBS/107-287    AC B0CQ65.1
#=GS H0ABW3_9EURY/1-74       AC H0ABW3.1
#=GS F7I7F9_CALJA/108-284    AC F7I7F9.1
#=GS F2CY24_HORVD/212-400    AC F2CY24.1
#=GS B9RAG3_RICCO/1-131      AC B9RAG3.1
#=GS E7QKQ8_YEASZ/89-301     AC E7QKQ8.1
#=GS E0SNX8_IGNAA/65-258     AC E0SNX8.1
#=GS C5MCX9_CANTT/114-307    AC C5MCX9.1
#=GS Q387G5_TRYB2/22-152     AC Q387G5.1
#=GS H2ZSD4_LATCH/108-285    AC H2ZSD4.1
#=GS C4XVF4_DROME/129-308    AC C4XVF4.1
#=GS A3DMT0_STAMF/21-188     AC A3DMT0.1
#=GS Q6AZQ3_XENLA/108-285    AC Q6AZQ3.1
#=GS F3LEW4_9GAMM/30-226     AC F3LEW4.1
#=GS F4J3B0_ARATH/106-276    AC F4J3B0.1
#=GS F2DJS1_HORVD/128-303    AC F2DJS1.1
#=GS Q8EAD3_SHEON/30-226     AC Q8EAD3.1
#=GS G4N3B9_MAGO7/184-383    AC G4N3B9.1
#=GS H3ZIU1_9ALTE/30-226     AC H3ZIU1.1
#=GS E9D887_COCPS/189-385    AC E9D887.1
#=GS G0MKB6_CAEBE/260-446    AC G0MKB6.1
#=GS G0A7T2_METMM/30-226     AC G0A7T2.1
#=GS H1EXE6_9ARCH/81-263     AC H1EXE6.1
#=GS B6A9M2_CRYMR/227-333    AC B6A9M2.1
#=GS A6US98_METVS/73-253     AC A6US98.1
#=GS G2U9X9_PSEAI/30-226     AC G2U9X9.1
#=GS B8BWB8_THAPS/107-293    AC B8BWB8.1
#=GS H6Q6S7_PYROT/51-238     AC H6Q6S7.1
#=GS H0WYJ4_OTOGA/108-284    AC H0WYJ4.1
#=GS B9LMZ9_HALLT/86-202     AC B9LMZ9.1
#=GS D1RNA7_SEROD/30-226     AC D1RNA7.1
#=GS RIOK3_MOUSE/264-464     AC Q9DBU3.3
#=GS A8BUB5_GIAIC/50-193     AC A8BUB5.1
#=GS D8QJZ3_SCHCM/114-246    AC D8QJZ3.1
#=GS H2QS96_PANTR/193-381    AC H2QS96.1
#=GS E2MEX8_PSEUB/30-226     AC E2MEX8.1
#=GS C4ULF3_YERRU/30-226     AC C4ULF3.1
#=GS H2S2M9_TAKRU/180-348    AC H2S2M9.1
#=GS D1TZE4_YERPE/30-226     AC D1TZE4.1
#=GS E9I1Q6_DAPPU/46-127     AC E9I1Q6.1
#=GS G6E0P7_9GAMM/30-226     AC G6E0P7.1
#=GS E5SN82_TRISP/145-323    AC E5SN82.1
#=GS G4IFE4_9EURY/92-202     AC G4IFE4.1
#=GS E7KII8_YEASA/89-301     AC E7KII8.1
#=GS F7XPT4_METZD/355-492    AC F7XPT4.1
#=GS B8GGC9_METPE/67-248     AC B8GGC9.1
#=GS H7EW58_PSEST/30-227     AC H7EW58.1
#=GS C4JRY6_UNCRE/151-286    AC C4JRY6.1
#=GS F0UE58_AJEC8/108-242    AC F0UE58.1
#=GS F4FYP4_METCR/20-204     AC F4FYP4.1
#=GS H0ADC4_9EURY/44-228     AC H0ADC4.1
#=GS O58248_PYRHO/114-296    AC O58248.1
#=GS G4TWW8_PIRID/211-401    AC G4TWW8.1
#=GS B3LJG2_YEAS1/89-301     AC B3LJG2.1
#=GS KAE1B_METMJ/354-476     AC A3CXS0.1
#=GS D0IW02_COMT2/71-197     AC D0IW02.1
#=GS A2FAB3_TRIVA/105-284    AC A2FAB3.1
#=GS G4LHP6_PSEAI/30-226     AC G4LHP6.1
#=GS F0LJU1_THEBM/63-249     AC F0LJU1.1
#=GS Q0U2L6_PHANO/108-292    AC Q0U2L6.1
#=GS KAE1B_THEAC/340-477     AC Q9HLA5.1
#=GS E7PB45_PSESG/30-227     AC E7PB45.1
#=GS Q16NT9_AEDAE/199-387    AC Q16NT9.1
#=GS Q2H830_CHAGB/186-384    AC Q2H830.1
#=GS Q3V2R6_MOUSE/264-464    AC Q3V2R6.1
#=GS H3HTP6_STRPU/202-326    AC H3HTP6.1
#=GS G3MK54_9ACAR/163-351    AC G3MK54.1
#=GS D0KK26_PECWW/30-226     AC D0KK26.1
#=GS C0Q9R3_DESAH/236-354    AC C0Q9R3.1
#=GS B6KEU6_TOXGO/106-283    AC B6KEU6.1
#=GS Q5CMY2_CRYHO/230-338    AC Q5CMY2.1
#=GS E5STQ6_TRISP/226-406    AC E5STQ6.1
#=GS B3NGY5_DROER/212-401    AC B3NGY5.1
#=GS B7R0Q4_9EURY/27-153     AC B7R0Q4.1
#=GS D2PEL9_SULID/58-245     AC D2PEL9.1
#=GS I1RR00_GIBZE/172-370    AC I1RR00.1
#=GS D5GAI6_TUBMM/141-338    AC D5GAI6.1
#=GS B8KPA6_9GAMM/30-226     AC B8KPA6.1
#=GS C0ND63_AJECG/177-375    AC C0ND63.1
#=GS B0YJ89_HUMAN/264-464    AC B0YJ89.1
#=GS E1ZQR8_CHLVA/98-274     AC E1ZQR8.1
#=GS H5TDZ4_9ALTE/46-241     AC H5TDZ4.1
#=GS A8WWF0_CAEBR/193-353    AC A8WWF0.2
#=GS D7FSZ9_ECTSI/244-374    AC D7FSZ9.1
#=GS D6WVA9_TRICA/260-456    AC D6WVA9.1
#=GS A0RVP6_CENSY/62-180     AC A0RVP6.1
#=GS Q4WVD7_ASPFU/105-239    AC Q4WVD7.1
#=GS A6VRQ7_MARMS/30-226     AC A6VRQ7.1
#=GS H3I3Y1_STRPU/104-281    AC H3I3Y1.1
#=GS F9U9X4_9GAMM/30-226     AC F9U9X4.1
#=GS Q7XIL7_ORYSJ/129-317    AC Q7XIL7.1
#=GS Q6M1B2_METMP/93-285     AC Q6M1B2.1
#=GS B4G9J4_DROPE/309-517    AC B4G9J4.1
#=GS Q9HN65_HALSA/12-194     AC Q9HN65.1
#=GS G4RKK5_THETK/65-187     AC G4RKK5.1
#=GS E7LN26_TRYCR/27-161     AC E7LN26.1
#=GS A8FZY3_SHESH/30-226     AC A8FZY3.1
#=GS Q0VTL1_ALCBS/36-230     AC Q0VTL1.1
#=GS H2AVZ3_KAZAF/91-319     AC H2AVZ3.1
#=GS F7TNY1_PASMD/18-169     AC F7TNY1.1
#=GS A1DE18_NEOFI/213-259    AC A1DE18.1
#=GS D9PXE3_METTM/3-132      AC D9PXE3.1
#=GS E7Q9N7_YEASB/89-301     AC E7Q9N7.1
#=GS C9SDK3_VERA1/168-365    AC C9SDK3.1
#=GS B9T518_RICCO/106-284    AC B9T518.1
#=GS F4RGL6_MELLP/107-288    AC F4RGL6.1
#=GS G3JB65_CORMM/187-385    AC G3JB65.1
#=GS F6Y7X8_MONDO/125-313    AC F6Y7X8.1
#=GS F2TN49_AJEDA/264-310    AC F2TN49.1
#=GS Q9HV28_PSEAE/30-226     AC Q9HV28.1
#=GS B0WJ57_CULQU/29-189     AC B0WJ57.1
#=GS B4X263_9GAMM/30-224     AC B4X263.1
#=GS F2MUP3_PSEU6/77-273     AC F2MUP3.1
#=GS G8YUG6_PICSO/17-199     AC G8YUG6.1
#=GS H0XBC8_OTOGA/322-522    AC H0XBC8.1
#=GS F0X5J8_CRYPV/230-338    AC F0X5J8.1
#=GS D5B7K2_YERPZ/30-226     AC D5B7K2.1
#=GS F3BEW8_PSEHA/30-226     AC F3BEW8.1
#=GS E9C2Y0_CAPO3/107-285    AC E9C2Y0.1
#=GS E4PR82_MARAH/44-240     AC E4PR82.1
#=GS E3WQ06_ANODA/200-388    AC E3WQ06.1
#=GS F0YD17_AURAN/66-261     AC F0YD17.1
#=GS B8D6D5_DESK1/17-170     AC B8D6D5.1
#=GS D3SVZ5_NATMM/96-277     AC D3SVZ5.1
#=GS E2RP92_CANFA/182-370    AC E2RP92.1
#=GS C7NWJ2_HALMD/107-282    AC C7NWJ2.1
#=GS I1G592_AMPQE/267-464    AC I1G592.1
#=GS G0HMF9_THES4/111-294    AC G0HMF9.1
#=GS F8D3Y0_HALXS/96-277     AC F8D3Y0.1
#=GS RIOK3_BOVIN/264-464     AC Q1RMT7.1
#=GS G4QE64_GLANF/30-226     AC G4QE64.1
#=GS A8AAA5_IGNH4/99-292     AC A8AAA5.1
#=GS A4WLY4_PYRAR/51-238     AC A4WLY4.1
#=GS Q468F1_METBF/107-289    AC Q468F1.1
#=GS H8NZA8_RAHAQ/30-226     AC H8NZA8.1
#=GS A1SLQ0_NOCSJ/44-231     AC A1SLQ0.1
#=GS C7QIB8_CATAD/81-283     AC C7QIB8.1
#=GS D7MI96_ARALL/179-367    AC D7MI96.1
#=GS G3Y310_ASPNA/192-390    AC G3Y310.1
#=GS Q7S8R7_NEUCR/86-225     AC Q7S8R7.2
#=GS A8B9W5_GIAIC/61-253     AC A8B9W5.1
#=GS Q2IJY2_ANADE/28-221     AC Q2IJY2.1
#=GS Q6L2G5_PICTO/66-248     AC Q6L2G5.1
#=GS E2AT97_CAMFO/199-387    AC E2AT97.1
#=GS D9T4Z6_MICAI/98-296     AC D9T4Z6.1
#=GS F3BH01_PSEHA/21-202     AC F3BH01.1
#=GS D4D8P7_TRIVH/182-380    AC D4D8P7.1
#=GS F3FR66_PSESX/30-227     AC F3FR66.1
#=GS E1VYG4_ARTAR/91-291     AC E1VYG4.1
#=GS D5U3C9_THEAM/16-172     AC D5U3C9.1
#=GS E9BKH1_LEIDB/178-367    AC E9BKH1.1
#=GS G4G7H1_9EURY/86-211     AC G4G7H1.1
#=GS Q081T0_SHEFN/30-228     AC Q081T0.1
#=GS Q0CW37_ASPTN/257-304    AC Q0CW37.1
#=GS Q3TJT2_MOUSE/264-464    AC Q3TJT2.1
#=GS C3Z6A1_BRAFL/108-285    AC C3Z6A1.1
#=GS G7VGH2_9CREN/22-176     AC G7VGH2.1
#=GS C4Y148_CLAL4/117-311    AC C4Y148.1
#=GS F2ZDI0_9PSED/30-226     AC F2ZDI0.1
#=GS Q6BTH0_DEBHA/551-620    AC Q6BTH0.1
#=GS H2C6B5_9CREN/109-278    AC H2C6B5.1
#=GS F4HMY8_PYRSN/13-187     AC F4HMY8.1
#=GS C4SQN4_YERFR/30-226     AC C4SQN4.1
#=GS B0Y119_ASPFC/105-239    AC B0Y119.1
#=GS I1Q890_ORYGL/202-390    AC I1Q890.1
#=GS C9YCV1_9BURK/30-235     AC C9YCV1.1
#=GS F0NBB9_SULIR/58-245     AC F0NBB9.1
#=GS Q47UT8_COLP3/30-225     AC Q47UT8.1
#=GS B3MVJ5_DROAN/302-510    AC B3MVJ5.1
#=GS G7X8W6_ASPKW/258-304    AC G7X8W6.1
#=GS E1FJ85_LOALO/254-443    AC E1FJ85.1
#=GS G4YZH4_PHYSP/33-244     AC G4YZH4.1
#=GS B7G0S8_PHATC/1043-1252  AC B7G0S8.1
#=GS Q4R7J7_MACFA/192-380    AC Q4R7J7.1
#=GS C8ZI81_YEAS8/89-301     AC C8ZI81.1
#=GS E7QY64_9EURY/107-282    AC E7QY64.1
#=GS Q99LR9_MOUSE/127-327    AC Q99LR9.1
#=GS F0QXC9_VULM7/109-289    AC F0QXC9.1
#=GS B4LZL0_DROVI/108-287    AC B4LZL0.1
#=GS F4P3J0_BATDJ/107-284    AC F4P3J0.1
#=GS B0W708_CULQU/301-497    AC B0W708.1
#=GS C5DY37_ZYGRC/87-278     AC C5DY37.1
#=GS Q5BH56_EMENI/108-242    AC Q5BH56.1
#=GS Q9RSB6_DEIRA/78-284     AC Q9RSB6.1
#=GS E4UYP5_ARTGP/214-261    AC E4UYP5.1
#=GS D7DNS7_METS0/30-226     AC D7DNS7.1
#=GS B6A893_9ENTR/30-156     AC B6A893.1
#=GS E3RHN2_PYRTT/108-292    AC E3RHN2.1
#=GS A2BIY8_HYPBU/106-288    AC A2BIY8.1
#=GS B9N8L9_POPTR/106-274    AC B9N8L9.1
#=GS G3JKX1_CORMM/109-297    AC G3JKX1.1
#=GS B0R7D7_HALS3/92-274     AC B0R7D7.1
#=GS Q2KIV5_BOVIN/108-284    AC Q2KIV5.1
#=GS E9GFI5_DAPPU/225-420    AC E9GFI5.1
#=GS Q5V0R0_HALMA/107-282    AC Q5V0R0.1
#=GS F2PUS7_TRIEC/256-303    AC F2PUS7.1
#=GS B6GZ99_PENCW/193-393    AC B6GZ99.1
#=GS D7D909_STAHD/110-289    AC D7D909.1
#=GS A8P9L6_BRUMA/108-284    AC A8P9L6.1
#=GS E9IZ72_SOLIN/183-371    AC E9IZ72.1
#=GS C7Z831_NECH7/180-378    AC C7Z831.1
#=GS B8PFA6_POSPM/107-285    AC B8PFA6.1
#=GS E9V1Y0_9ACTO/93-286     AC E9V1Y0.1
#=GS E1SBB7_PANVC/30-226     AC E1SBB7.1
#=GS Q5CRP5_CRYPI/230-338    AC Q5CRP5.1
#=GS C7GTH5_YEAS2/108-293    AC C7GTH5.1
#=GS B8NT73_ASPFN/411-492    AC B8NT73.1
#=GS F6SKJ8_MONDO/108-284    AC F6SKJ8.1
#=GS D0N1K5_PHYIT/33-119     AC D0N1K5.1
#=GS E3H873_ILYPC/24-202     AC E3H873.1
#=GS F0NJ35_SULIH/58-245     AC F0NJ35.1
#=GS A2RAF8_ASPNC/258-304    AC A2RAF8.1
#=GS A8H099_SHEPA/30-226     AC A8H099.1
#=GS B4IJJ8_DROSE/108-287    AC B4IJJ8.1
#=GS G2YMY7_BOTF4/189-389    AC G2YMY7.1
#=GS Q4DEU9_TRYCC/206-385    AC Q4DEU9.1
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#=GS H8I4V0_METCZ/105-281    AC H8I4V0.1
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#=GS D8DA64_COMTE/71-196     AC D8DA64.1
#=GS H1R575_VIBFI/30-226     AC H1R575.1
#=GS Q5K6Y3_CRYNJ/197-387    AC Q5K6Y3.1
#=GS C7Z7M0_NECH7/109-297    AC C7Z7M0.1
#=GS F0QU58_VULM7/26-164     AC F0QU58.1
#=GS E1Z4D7_CHLVA/229-418    AC E1Z4D7.1
#=GS Q6PAA2_XENLA/258-453    AC Q6PAA2.1
#=GS E4NT97_HALBP/107-282    AC E4NT97.1
#=GS H8I9P7_METCZ/65-248     AC H8I9P7.1
#=GS Q0UEX3_PHANO/173-373    AC Q0UEX3.1
#=GS F8GL71_NITSI/30-226     AC F8GL71.1
#=GS D2HCK0_AILME/86-262     AC D2HCK0.1
#=GS G1PS26_MYOLU/194-382    AC G1PS26.1
#=GS F7FQD5_ORNAN/246-445    AC F7FQD5.1
#=GS Q2LZ70_DROPS/207-396    AC Q2LZ70.1
#=GS G9P1B6_HYPAI/109-297    AC G9P1B6.1
#=GS KAE1B_METAC/371-515     AC Q8TJS2.1
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#=GS B4JUX8_DROGR/108-287    AC B4JUX8.1
#=GS RIO1_THEAC/1-179        AC Q03021.1
#=GS I1BT07_RHIO9/107-284    AC I1BT07.1
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#=GS G2XJD9_VERDV/254-301    AC G2XJD9.1
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#=GS F2SL69_TRIRC/182-380    AC F2SL69.1
#=GS C4U805_YERAL/30-226     AC C4U805.1
#=GS G0H4D9_METMI/73-253     AC G0H4D9.1
#=GS Q8I5B1_PLAF7/265-457    AC Q8I5B1.1
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#=GS G2WLQ6_YEASK/108-293    AC G2WLQ6.1
#=GS F0BFQ1_9XANT/30-225     AC F0BFQ1.1
#=GS G7G476_9GAMM/30-226     AC G7G476.1
#=GS H1UVB5_COLHI/176-374    AC H1UVB5.1
#=GS C1GE75_PARBD/108-242    AC C1GE75.1
#=GS C1C2P1_9MAXI/15-161     AC C1C2P1.1
#=GS D2RXE9_HALTV/107-282    AC D2RXE9.1
#=GS KAE1B_METST/354-476     AC Q2NIA4.1
#=GS D7EB56_METEZ/67-253     AC D7EB56.1
#=GS F2RYM1_TRIT1/256-303    AC F2RYM1.1
#=GS Q1ZSQ3_PHOAS/30-226     AC Q1ZSQ3.1
#=GS F5H9I7_CRYNB/197-387    AC F5H9I7.1
#=GS A3DNJ2_STAMF/62-254     AC A3DNJ2.1
#=GS H3DD75_TETNG/1-178      AC H3DD75.1
#=GS G2XHH4_VERDV/169-366    AC G2XHH4.1
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#=GS C9STM3_VERA1/254-301    AC C9STM3.1
#=GS F9CU98_9ARCH/81-263     AC F9CU98.1
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#=GS E6N4A3_9ARCH/71-259     AC E6N4A3.1
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#=GS B3T3P5_9ARCH/70-199     AC B3T3P5.1
#=GS Q8ZVN8_PYRAE/26-176     AC Q8ZVN8.1
#=GS E9GQD2_DAPPU/108-284    AC E9GQD2.1
#=GS E7PIB0_PSESG/30-227     AC E7PIB0.1
#=GS A5DSR0_LODEL/117-310    AC A5DSR0.1
#=GS G8SCZ5_ACTS5/95-294     AC G8SCZ5.1
#=GS E3WKZ9_ANODA/288-488    AC E3WKZ9.1
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