GenomeNet

Database: Pfam
Entry: RVP_2
LinkDB: RVP_2
Original site: RVP_2 
#=GF ID   RVP_2
#=GF AC   PF08284.6
#=GF DE   Retroviral aspartyl protease
#=GF AU   Bateman A
#=GF SE   Pfam-B_
#=GF GA   20.30 20.30;
#=GF TC   20.30 20.30;
#=GF NC   20.20 20.20;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 23193494 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF DR   INTERPRO; IPR013242;
#=GF CC   Single domain aspartyl proteases from retroviruses,
#=GF CC   retrotransposons, and badnaviruses (plant dsDNA viruses). These
#=GF CC   proteases are generally part of a larger polyprotein; usually
#=GF CC   pol, more rarely gag. Retroviral proteases appear to be
#=GF CC   homologous to a single domain of the two-domain eukaryotic
#=GF CC   aspartyl proteases
#=GF SQ   1125
#=GS Q7FAA8_ORYSJ/649-783    AC Q7FAA8.1
#=GS Q69MZ1_ORYSJ/497-631    AC Q69MZ1.1
#=GS Q01LT1_ORYSA/535-669    AC Q01LT1.1
#=GS Q2QRA7_ORYSJ/569-703    AC Q2QRA7.1
#=GS G7JWY5_MEDTR/10-89      AC G7JWY5.1
#=GS Q01JD2_ORYSA/611-745    AC Q01JD2.1
#=GS Q7XS22_ORYSJ/340-474    AC Q7XS22.2
#=GS Q01M09_ORYSA/683-817    AC Q01M09.1
#=GS Q2QVZ5_ORYSJ/268-402    AC Q2QVZ5.1
#=GS F8NEM9_SERL9/23-135     AC F8NEM9.1
#=GS Q7XW84_ORYSJ/381-515    AC Q7XW84.2
#=GS A5C7Y3_VITVI/64-165     AC A5C7Y3.1
#=GS Q2R110_ORYSJ/718-748    AC Q2R110.1
#=GS G4ZBK2_PHYSP/8-67       AC G4ZBK2.1
#=GS Q7XU11_ORYSJ/669-803    AC Q7XU11.1
#=GS Q7XM47_ORYSJ/225-318    AC Q7XM47.1
#=GS B9N4U8_POPTR/415-517    AC B9N4U8.1
#=GS E5GC03_CUCME/1-60       AC E5GC03.1
#=GS Q9XE85_SORBI/364-498    AC Q9XE85.1
#=GS Q8LM87_ORYSJ/691-825    AC Q8LM87.1
#=GS G7Y8X3_CLOSI/40-144     AC G7Y8X3.1
#=GS Q60D63_ORYSJ/633-767    AC Q60D63.1
#=GS Q8LMQ3_ORYSJ/199-311    AC Q8LMQ3.1
#=GS F8Q5K1_SERL3/1-92       AC F8Q5K1.1
#=GS Q8S782_ORYSJ/605-739    AC Q8S782.1
#=GS F4J487_ARATH/129-239    AC F4J487.1
#=GS G7ISV0_MEDTR/181-316    AC G7ISV0.1
#=GS Q7XP83_ORYSJ/537-671    AC Q7XP83.2
#=GS A5B947_VITVI/121-229    AC A5B947.1
#=GS Q0KIP3_SOLDE/464-590    AC Q0KIP3.1
#=GS A7BIS0_LENED/68-177     AC A7BIS0.1
#=GS H3H3R4_PHYRM/1046-1162  AC H3H3R4.1
#=GS Q2R4T1_ORYSJ/589-723    AC Q2R4T1.1
#=GS Q8LLX8_ORYSJ/695-829    AC Q8LLX8.1
#=GS Q2QR60_ORYSJ/345-479    AC Q2QR60.1
#=GS G4Z0V7_PHYSP/28-150     AC G4Z0V7.1
#=GS Q6ATD6_ORYSJ/380-514    AC Q6ATD6.1
#=GS Q7XWS2_ORYSJ/331-465    AC Q7XWS2.2
#=GS Q2R3G0_ORYSJ/458-583    AC Q2R3G0.1
#=GS Q33AA6_ORYSJ/137-271    AC Q33AA6.1
#=GS B5U9W4_LOTJA/430-535    AC B5U9W4.1
#=GS Q2QMU0_ORYSJ/252-386    AC Q2QMU0.1
#=GS Q9MBF9_ARATH/212-325    AC Q9MBF9.1
#=GS Q5TKF0_ORYSJ/256-389    AC Q5TKF0.1
#=GS H2R3P0_PANTR/345-470    AC H2R3P0.1
#=GS Q2HW87_MEDTR/305-440    AC Q2HW87.1
#=GS Q7XN91_ORYSJ/729-863    AC Q7XN91.1
#=GS Q8LMC0_ORYSJ/664-798    AC Q8LMC0.1
#=GS Q2R110_ORYSJ/699-723    AC Q2R110.1
#=GS Q7XM70_ORYSJ/617-658    AC Q7XM70.3
#=GS B7F2U3_ORYSJ/16-128     AC B7F2U3.1
#=GS Q6ATE0_ORYSJ/372-506    AC Q6ATE0.1
#=GS Q6UU73_ORYSJ/976-1110   AC Q6UU73.1
#=GS Q9SKV5_ARATH/415-531    AC Q9SKV5.1
#=GS Q5W6J6_ORYSJ/362-496    AC Q5W6J6.1
#=GS Q60E20_ORYSJ/356-483    AC Q60E20.1
#=GS Q7G4J6_ORYSJ/667-801    AC Q7G4J6.1
#=GS A5JSC4_MAIZE/347-479    AC A5JSC4.1
#=GS Q7XRP6_ORYSJ/597-731    AC Q7XRP6.2
#=GS Q2QZV4_ORYSJ/633-767    AC Q2QZV4.1
#=GS H2KX68_ORYSJ/552-686    AC H2KX68.1
#=GS Q7XP03_ORYSJ/1-26       AC Q7XP03.1
#=GS Q10LB6_ORYSJ/618-752    AC Q10LB6.1
#=GS Q53K92_ORYSJ/255-353    AC Q53K92.1
#=GS G7LCT8_MEDTR/303-437    AC G7LCT8.1
#=GS Q6L428_SOLDE/555-689    AC Q6L428.1
#=GS F8NLP4_SERL9/1-90       AC F8NLP4.1
#=GS G4THH4_PIRID/1108-1229  AC G4THH4.1
#=GS Q7XE62_ORYSJ/377-511    AC Q7XE62.1
#=GS Q8RV09_ORYSJ/313-447    AC Q8RV09.1
#=GS Q8S823_ORYSJ/338-472    AC Q8S823.1
#=GS I1J3X7_SOYBN/299-431    AC I1J3X7.1
#=GS Q9AYC0_ORYSJ/661-795    AC Q9AYC0.1
#=GS F8PI24_SERL3/1-103      AC F8PI24.1
#=GS Q6UU21_ORYSJ/343-477    AC Q6UU21.1
#=GS Q2QR27_ORYSJ/582-653    AC Q2QR27.1
#=GS Q01MP6_ORYSA/555-689    AC Q01MP6.1
#=GS Q33B01_ORYSJ/565-699    AC Q33B01.2
#=GS Q2R1A9_ORYSJ/728-862    AC Q2R1A9.1
#=GS Q53P36_ORYSJ/378-512    AC Q53P36.1
#=GS Q109N9_ORYSJ/51-185     AC Q109N9.1
#=GS Q01M65_ORYSA/611-745    AC Q01M65.1
#=GS Q01M98_ORYSA/377-511    AC Q01M98.1
#=GS Q25A59_ORYSA/729-863    AC Q25A59.1
#=GS Q01KH2_ORYSA/589-645    AC Q01KH2.1
#=GS Q53N31_ORYSJ/579-713    AC Q53N31.1
#=GS A5BRM2_VITVI/117-189    AC A5BRM2.1
#=GS Q7XPE4_ORYSJ/580-714    AC Q7XPE4.2
#=GS Q53JQ7_ORYSJ/734-868    AC Q53JQ7.1
#=GS Q2R011_ORYSJ/381-515    AC Q2R011.1
#=GS Q5W6A7_ORYSJ/505-639    AC Q5W6A7.1
#=GS Q53L81_ORYSJ/267-359    AC Q53L81.1
#=GS Q2QWA2_ORYSJ/24-115     AC Q2QWA2.1
#=GS Q53MK5_ORYSJ/377-465    AC Q53MK5.1
#=GS Q9XHY2_ORYSJ/377-511    AC Q9XHY2.1
#=GS Q75H32_ORYSJ/266-399    AC Q75H32.1
#=GS Q25AF3_ORYSA/351-485    AC Q25AF3.1
#=GS Q33AK4_ORYSJ/577-711    AC Q33AK4.2
#=GS Q10LB3_ORYSJ/404-538    AC Q10LB3.1
#=GS G4YZ83_PHYSP/2-56       AC G4YZ83.1
#=GS Q9AYK7_ORYSJ/113-152    AC Q9AYK7.1
#=GS Q5WMZ7_ORYSJ/151-285    AC Q5WMZ7.1
#=GS F2UTM4_SALS5/174-308    AC F2UTM4.1
#=GS A5BMS5_VITVI/307-441    AC A5BMS5.1
#=GS Q2R193_ORYSJ/686-820    AC Q2R193.1
#=GS Q4QXS8_HORVD/361-495    AC Q4QXS8.1
#=GS Q2R206_ORYSJ/377-511    AC Q2R206.1
#=GS I1N205_SOYBN/297-429    AC I1N205.1
#=GS E2M0A0_MONPE/1-104      AC E2M0A0.1
#=GS A5BA10_VITVI/1-43       AC A5BA10.1
#=GS Q2QQQ5_ORYSJ/696-830    AC Q2QQQ5.2
#=GS E5GBB7_CUCME/606-740    AC E5GBB7.1
#=GS F8Q709_SERL3/1-91       AC F8Q709.1
#=GS D3IVB8_9POAL/625-759    AC D3IVB8.1
#=GS Q10FW4_ORYSJ/633-760    AC Q10FW4.1
#=GS Q01L72_ORYSA/427-534    AC Q01L72.1
#=GS Q7XKR0_ORYSJ/319-431    AC Q7XKR0.2
#=GS E2LZN4_MONPE/10-119     AC E2LZN4.1
#=GS Q6AU11_ORYSJ/180-314    AC Q6AU11.1
#=GS Q2R3V3_ORYSJ/336-445    AC Q2R3V3.1
#=GS Q7XGQ4_ORYSJ/297-431    AC Q7XGQ4.1
#=GS I1KE69_SOYBN/252-365    AC I1KE69.1
#=GS Q8H914_ORYSJ/540-674    AC Q8H914.1
#=GS Q8SA91_MAIZE/456-565    AC Q8SA91.1
#=GS Q7XQE2_ORYSJ/357-491    AC Q7XQE2.2
#=GS Q60D71_ORYSJ/633-767    AC Q60D71.1
#=GS Q2QTE7_ORYSJ/702-836    AC Q2QTE7.1
#=GS Q53N07_ORYSJ/341-475    AC Q53N07.1
#=GS Q2QUU1_ORYSJ/251-302    AC Q2QUU1.1
#=GS Q53KC5_ORYSJ/420-468    AC Q53KC5.1
#=GS Q60DH3_ORYSJ/654-788    AC Q60DH3.1
#=GS Q7XLQ8_ORYSJ/188-232    AC Q7XLQ8.2
#=GS Q7X8C9_ORYSJ/50-168     AC Q7X8C9.2
#=GS Q7XKP4_ORYSJ/660-794    AC Q7XKP4.3
#=GS Q53JS0_ORYSJ/463-511    AC Q53JS0.1
#=GS Q7XKP3_ORYSJ/463-597    AC Q7XKP3.3
#=GS Q53J67_ORYSJ/585-719    AC Q53J67.1
#=GS Q7XS90_ORYSJ/292-426    AC Q7XS90.2
#=GS Q53K71_ORYSJ/413-451    AC Q53K71.1
#=GS Q7XX57_ORYSJ/278-412    AC Q7XX57.2
#=GS Q2R138_ORYSJ/646-780    AC Q2R138.1
#=GS G7KQ69_MEDTR/20-93      AC G7KQ69.1
#=GS I1KH69_SOYBN/1388-1500  AC I1KH69.1
#=GS Q7XYF1_GOSHI/1-113      AC Q7XYF1.1
#=GS Q53JJ4_ORYSJ/658-739    AC Q53JJ4.1
#=GS Q9XE44_ARATH/1-71       AC Q9XE44.1
#=GS Q7XRT3_ORYSJ/1363-1497  AC Q7XRT3.2
#=GS H3H313_PHYRM/1-72       AC H3H313.1
#=GS Q53P32_ORYSJ/506-640    AC Q53P32.1
#=GS Q7XMR6_ORYSJ/1-62       AC Q7XMR6.1
#=GS Q53J72_ORYSJ/236-370    AC Q53J72.1
#=GS Q7XQZ1_ORYSJ/375-425    AC Q7XQZ1.1
#=GS Q8S760_ORYSJ/536-670    AC Q8S760.1
#=GS Q7XLE8_ORYSJ/621-755    AC Q7XLE8.2
#=GS F9GA28_FUSOF/1-104      AC F9GA28.1
#=GS Q9SY43_ARATH/354-427    AC Q9SY43.1
#=GS Q7XMS4_ORYSJ/45-179     AC Q7XMS4.1
#=GS Q2QRU8_ORYSJ/592-726    AC Q2QRU8.2
#=GS B9NAI0_POPTR/298-389    AC B9NAI0.1
#=GS E2LXF1_MONPE/158-273    AC E2LXF1.1
#=GS D1GEG7_BRARP/1588-1697  AC D1GEG7.1
#=GS Q9SK57_ARATH/497-576    AC Q9SK57.1
#=GS Q7XPN0_ORYSJ/380-514    AC Q7XPN0.2
#=GS Q53JE4_ORYSJ/311-445    AC Q53JE4.1
#=GS Q84MF5_ORYSJ/372-462    AC Q84MF5.1
#=GS G4TTZ8_PIRID/215-333    AC G4TTZ8.1
#=GS Q53J49_ORYSJ/446-568    AC Q53J49.1
#=GS Q7XXH5_ORYSJ/22-64      AC Q7XXH5.2
#=GS Q2QPQ2_ORYSJ/399-449    AC Q2QPQ2.1
#=GS Q75IL2_ORYSJ/619-686    AC Q75IL2.2
#=GS Q8LNL7_ORYSJ/471-590    AC Q8LNL7.1
#=GS Q6ATA2_ORYSJ/697-831    AC Q6ATA2.1
#=GS Q7XXG1_ORYSJ/527-566    AC Q7XXG1.2
#=GS Q01LT2_ORYSA/561-695    AC Q01LT2.1
#=GS D3IVN6_9POAL/222-354    AC D3IVN6.1
#=GS Q75KD2_ORYSJ/306-336    AC Q75KD2.1
#=GS H3H3J0_PHYRM/306-388    AC H3H3J0.1
#=GS Q55S83_CRYNB/388-512    AC Q55S83.1
#=GS Q01MY8_ORYSA/656-790    AC Q01MY8.1
#=GS Q7XUA3_ORYSJ/345-479    AC Q7XUA3.1
#=GS Q2QTG2_ORYSJ/430-564    AC Q2QTG2.1
#=GS H3GE82_PHYRM/86-155     AC H3GE82.1
#=GS Q01LS7_ORYSA/327-461    AC Q01LS7.1
#=GS Q7XXI2_ORYSJ/1-60       AC Q7XXI2.2
#=GS I1J6C8_SOYBN/301-410    AC I1J6C8.1
#=GS H3H5J7_PHYRM/685-767    AC H3H5J7.1
#=GS A9TC71_PHYPA/259-366    AC A9TC71.1
#=GS Q53KY4_ORYSJ/355-489    AC Q53KY4.1
#=GS Q53NF5_ORYSJ/381-515    AC Q53NF5.1
#=GS Q10GE4_ORYSJ/216-289    AC Q10GE4.1
#=GS Q7X7N7_ORYSJ/417-551    AC Q7X7N7.2
#=GS Q7XQR0_ORYSJ/730-762    AC Q7XQR0.1
#=GS Q8S5K5_ORYSJ/681-815    AC Q8S5K5.1
#=GS Q6F2P5_ORYSJ/369-503    AC Q6F2P5.1
#=GS F8PLD1_SERL3/3-106      AC F8PLD1.1
#=GS E2LZ43_MONPE/170-275    AC E2LZ43.1
#=GS A5CAG1_VITVI/4-113      AC A5CAG1.1
#=GS Q6L3R7_SOLDE/73-158     AC Q6L3R7.1
#=GS A5B3B2_VITVI/63-167     AC A5B3B2.1
#=GS Q01HC4_ORYSA/702-836    AC Q01HC4.1
#=GS Q7XS24_ORYSJ/346-480    AC Q7XS24.2
#=GS Q60DI2_ORYSJ/604-738    AC Q60DI2.1
#=GS Q2R8S5_ORYSJ/542-676    AC Q2R8S5.1
#=GS Q2R2I7_ORYSJ/646-780    AC Q2R2I7.1
#=GS Q65WZ3_ORYSJ/686-820    AC Q65WZ3.1
#=GS Q339Z4_ORYSJ/537-671    AC Q339Z4.2
#=GS G7JSI2_MEDTR/288-422    AC G7JSI2.1
#=GS Q01L42_ORYSA/306-440    AC Q01L42.1
#=GS Q2R9I7_ORYSJ/320-450    AC Q2R9I7.1
#=GS F2EHA6_HORVD/2-49       AC F2EHA6.1
#=GS Q5W677_ORYSJ/361-495    AC Q5W677.1
#=GS A5AGW4_VITVI/27-135     AC A5AGW4.1
#=GS A0MEC4_ARATH/1-65       AC A0MEC4.1
#=GS Q2QRE2_ORYSJ/450-584    AC Q2QRE2.1
#=GS Q6L3M7_SOLDE/526-659    AC Q6L3M7.2
#=GS F8PHE3_SERL3/1-90       AC F8PHE3.1
#=GS Q53NQ5_ORYSJ/630-764    AC Q53NQ5.1
#=GS Q10RT0_ORYSJ/2363-2452  AC Q10RT0.1
#=GS Q5JPW5_ORYSJ/268-402    AC Q5JPW5.1
#=GS Q10LB2_ORYSJ/674-808    AC Q10LB2.1
#=GS Q94HP9_ORYSJ/633-767    AC Q94HP9.1
#=GS Q2QQN7_ORYSJ/343-477    AC Q2QQN7.1
#=GS I1HNB7_BRADI/379-513    AC I1HNB7.1
#=GS Q8H873_ORYSJ/690-824    AC Q8H873.1
#=GS H3GQN2_PHYRM/272-381    AC H3GQN2.1
#=GS Q2QTB2_ORYSJ/83-217     AC Q2QTB2.1
#=GS Q2R2J9_ORYSJ/732-855    AC Q2R2J9.1
#=GS Q2QRR0_ORYSJ/222-356    AC Q2QRR0.2
#=GS F2U3B9_SALS5/294-428    AC F2U3B9.1
#=GS Q01KN4_ORYSA/468-602    AC Q01KN4.1
#=GS Q5JPY0_ORYSJ/573-707    AC Q5JPY0.2
#=GS Q2QZV5_ORYSJ/945-1067   AC Q2QZV5.1
#=GS Q7XPD5_ORYSJ/287-351    AC Q7XPD5.1
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#=GS Q7XR40_ORYSJ/653-787    AC Q7XR40.1
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#=GS Q6I552_ORYSJ/660-794    AC Q6I552.1
#=GS E2M055_MONPE/1-104      AC E2M055.1
#=GS C5Z905_SORBI/351-404    AC C5Z905.1
#=GS B8BLB5_ORYSI/424-532    AC B8BLB5.1
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#=GS Q2QS61_ORYSJ/387-521    AC Q2QS61.1
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#=GS F8NWL7_SERL9/1-97       AC F8NWL7.1
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#=GS F8Q227_SERL3/13-115     AC F8Q227.1
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#=GS B8BKF4_ORYSI/88-220     AC B8BKF4.1
#=GS Q8H832_ORYSJ/583-717    AC Q8H832.1
#=GS H2MY16_ORYLA/352-460    AC H2MY16.1
#=GS Q7XRP7_ORYSJ/692-826    AC Q7XRP7.2
#=GS O04169_MAIZE/39-132     AC O04169.1
#=GS Q7XNK2_ORYSJ/1-62       AC Q7XNK2.2
#=GS Q7G779_ORYSJ/1-26       AC Q7G779.1
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