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Database: Pfam
Entry: Relaxase
LinkDB: Relaxase
Original site: Relaxase 
#=GF ID   Relaxase
#=GF AC   PF03432.12
#=GF DE   Relaxase/Mobilisation nuclease domain 
#=GF AU   Finn RD, Mifsud W, Bateman A
#=GF SE   Pfam-B_4002 (release 6.6)
#=GF GA   20.70 20.70;
#=GF TC   20.70 20.70;
#=GF NC   20.50 20.60;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 17690987 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   9350859
#=GF RT   Nicking by transesterification: the reaction catalysed by a
#=GF RT   relaxase. 
#=GF RA   Byrd DR, Matson SW; 
#=GF RL   Mol Microbiol 1997;25:1011-1022.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   10940031
#=GF RT   Identification of the mob genes of plasmid pSC101 and
#=GF RT   characterization of a hybrid pSC101-R1162 system for conjugal
#=GF RT   mobilization. 
#=GF RA   Meyer R; 
#=GF RL   J Bacteriol 2000;182:4875-4881.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   10482518
#=GF RT   Bacterial conjugation protein MobA mediates integration of
#=GF RT   complex DNA structures into plant cells. 
#=GF RA   Bravo-Angel AM, Gloeckler V, Hohn B, Tinland B; 
#=GF RL   J Bacteriol 1999;181:5758-5765.
#=GF DR   INTERPRO; IPR005094;
#=GF CC   Relaxases/mobilisation proteins are required for the horizontal
#=GF CC   transfer of genetic information contained on plasmids that
#=GF CC   occurs during bacterial conjugation. The relaxase, in
#=GF CC   conjunction with several auxiliary proteins, forms the
#=GF CC   relaxation complex or relaxosome. Relaxases nick duplex DNA in a
#=GF CC   specific manner by catalysing  trans-esterification[1].    
#=GF SQ   1370
#=GS K2FLQ5_9BACT/18-256       AC K2FLQ5.1
#=GS A0A0F2RN44_9PROT/24-239   AC A0A0F2RN44.1
#=GS D4K2J4_9FIRM/17-258       AC D4K2J4.1
#=GS Q1QF90_NITHX/310-469      AC Q1QF90.1
#=GS A6NWW1_9FIRM/17-258       AC A6NWW1.1
#=GS B7C9J8_9FIRM/9-267        AC B7C9J8.1
#=GS R5ZAE7_9CLOT/10-247       AC R5ZAE7.1
#=GS I1YLR9_METFJ/5-245        AC I1YLR9.1
#=GS R5EKS8_9CLOT/13-255       AC R5EKS8.1
#=GS Q6AIC6_DESPS/11-260       AC Q6AIC6.1
#=GS H1YHD2_9SPHI/7-266        AC H1YHD2.1
#=GS A8ART7_CITK8/45-247       AC A8ART7.1
#=GS D1Q0I9_9BACT/13-263       AC D1Q0I9.1
#=GS R6N6D9_9CLOT/9-247        AC R6N6D9.1
#=GS R5B737_9BACE/7-249        AC R5B737.1
#=GS B7RP34_9RHOB/25-244       AC B7RP34.1
#=GS J4TDM9_9FIRM/9-250        AC J4TDM9.1
#=GS V5SHH7_9RHIZ/7-231        AC V5SHH7.1
#=GS A6LGY8_PARD8/7-241        AC A6LGY8.1
#=GS A0A0A1H236_9BURK/56-315   AC A0A0A1H236.1
#=GS S0GFF6_9PORP/1-214        AC S0GFF6.1
#=GS C8WP16_EGGLE/18-290       AC C8WP16.1
#=GS E6U2P5_ETHHY/18-257       AC E6U2P5.1
#=GS A9EBT9_9RHOB/59-167       AC A9EBT9.1
#=GS Q8DZ67_STRA5/11-265       AC Q8DZ67.1
#=GS R5FV76_9FIRM/9-248        AC R5FV76.1
#=GS F1T6L7_9ACTN/1-90         AC F1T6L7.1
#=GS C3M8B9_HAMD5/50-321       AC C3M8B9.1
#=GS D4L4B1_9FIRM/32-272       AC D4L4B1.1
#=GS R5KVL9_9CLOT/10-274       AC R5KVL9.1
#=GS Q140C3_BURXL/119-244      AC Q140C3.1
#=GS R5AR66_9BACT/7-197        AC R5AR66.1
#=GS R5DNH3_9FIRM/18-269       AC R5DNH3.1
#=GS D4LJN8_9FIRM/7-235        AC D4LJN8.1
#=GS A0A0A2FIJ2_9PORP/7-244    AC A0A0A2FIJ2.1
#=GS K9UFC1_9CHRO/11-244       AC K9UFC1.1
#=GS F9D556_PREDD/7-250        AC F9D556.1
#=GS R5AZ78_9BACE/8-184        AC R5AZ78.1
#=GS D8DVP2_PREBR/1-115        AC D8DVP2.1
#=GS D9RU79_PREMB/6-168        AC D9RU79.1
#=GS E0TFI2_PARBH/91-259       AC E0TFI2.1
#=GS R7JWI3_9CLOT/14-149       AC R7JWI3.1
#=GS D7GTR8_9FIRM/17-225       AC D7GTR8.1
#=GS B2JC19_NOSP7/7-227        AC B2JC19.1
#=GS D1PNV5_9FIRM/40-279       AC D1PNV5.1
#=GS D1PN20_9FIRM/37-201       AC D1PN20.1
#=GS F0YZ64_9CLOT/24-264       AC F0YZ64.1
#=GS C7RI29_ANAPD/9-250        AC C7RI29.1
#=GS D0UIT5_AGGAD/63-200       AC D0UIT5.1
#=GS A0A0B7HQP7_9FLAO/9-202    AC A0A0B7HQP7.1
#=GS D6D387_9BACE/1-214        AC D6D387.1
#=GS A6TV37_ALKMQ/2-218        AC A6TV37.1
#=GS S0RI51_9ENTE/8-241        AC S0RI51.1
#=GS Q1GN41_RUEST/59-272       AC Q1GN41.1
#=GS R5PY83_9FIRM/14-264       AC R5PY83.1
#=GS G2IU40_9SPHN/111-279      AC G2IU40.1
#=GS E4ND06_KITSK/50-278       AC E4ND06.1
#=GS C7H2R2_9FIRM/18-257       AC C7H2R2.1
#=GS Q9PHG1_XYLFA/55-323       AC Q9PHG1.1
#=GS H1Y3W9_9SPHI/9-172        AC H1Y3W9.1
#=GS A3K4M9_9RHOB/262-489      AC A3K4M9.1
#=GS Q5LFX5_BACFN/32-261       AC Q5LFX5.1
#=GS H1PMG2_9FIRM/9-250        AC H1PMG2.1
#=GS C6I146_9BACT/15-273       AC C6I146.1
#=GS Q2KZD8_BORA1/78-259       AC Q2KZD8.1
#=GS E1SBZ7_PANVC/4-228        AC E1SBZ7.1
#=GS G9RQQ4_9FIRM/11-262       AC G9RQQ4.1
#=GS C3JCN4_POREA/36-261       AC C3JCN4.1
#=GS F0R988_BACSH/9-280        AC F0R988.1
#=GS T5RKT0_9FIRM/14-239       AC T5RKT0.1
#=GS F2KUL0_PREDF/20-223       AC F2KUL0.1
#=GS K9X890_9NOST/7-233        AC K9X890.1
#=GS A0A0A8B623_9ACTN/23-275   AC A0A0A8B623.1
#=GS E3I094_RHOVT/29-168       AC E3I094.1
#=GS E7RM51_9BACT/7-242        AC E7RM51.1
#=GS K5ZEF4_9PROT/2-91         AC K5ZEF4.1
#=GS G5KB04_9STRE/9-250        AC G5KB04.1
#=GS I2F0X4_EMTOG/13-251       AC I2F0X4.1
#=GS F8N5G2_9BACT/7-250        AC F8N5G2.1
#=GS D7N9U5_9BACT/7-250        AC D7N9U5.1
#=GS W2CQ44_9PORP/7-250        AC W2CQ44.1
#=GS A0A0G3A8A7_9ACTN/65-251   AC A0A0G3A8A7.1
#=GS G5KBJ9_9STRE/11-265       AC G5KBJ9.1
#=GS A0A0M2GE38_9ACTN/54-242   AC A0A0M2GE38.1
#=GS D7I703_PSESS/9-267        AC D7I703.1
#=GS H7FW50_9FLAO/16-238       AC H7FW50.1
#=GS D3LWZ0_9FIRM/9-250        AC D3LWZ0.1
#=GS A0A0J7ZM19_STRVR/70-279   AC A0A0J7ZM19.1
#=GS I5B0Y0_9DELT/11-243       AC I5B0Y0.1
#=GS D7I719_PSESS/12-322       AC D7I719.1
#=GS G9RNY9_9FIRM/17-257       AC G9RNY9.1
#=GS G1UWJ5_9DELT/16-209       AC G1UWJ5.1
#=GS F9MU95_9FIRM/9-180        AC F9MU95.1
#=GS U2SAS5_9FIRM/13-229       AC U2SAS5.1
#=GS F0S6W1_PSESL/31-199       AC F0S6W1.1
#=GS D9R2S9_CLOSW/19-266       AC D9R2S9.1
#=GS I4Z252_9RHIZ/305-489      AC I4Z252.1
#=GS I6HDX8_SHIFL/1-143        AC I6HDX8.1
#=GS Q0VMT5_ALCBS/80-264       AC Q0VMT5.1
#=GS A3X3Z0_9RHOB/25-233       AC A3X3Z0.1
#=GS K9X7B2_9NOST/7-275        AC K9X7B2.1
#=GS A0A0A2EJ52_9PORP/9-261    AC A0A0A2EJ52.1
#=GS A0A099T561_9RHOB/59-273   AC A0A099T561.1
#=GS F9Z9L1_ODOSD/7-250        AC F9Z9L1.1
#=GS G0J7N6_CYCMS/9-232        AC G0J7N6.1
#=GS E8UE58_TAYEM/51-304       AC E8UE58.1
#=GS A6NXA8_9FIRM/7-240        AC A6NXA8.1
#=GS C6W0U4_DYAFD/10-225       AC C6W0U4.1
#=GS I4Z9K6_9BACT/7-250        AC I4Z9K6.1
#=GS B7C980_9FIRM/1-264        AC B7C980.1
#=GS F7K6S7_9FIRM/9-247        AC F7K6S7.1
#=GS J2AV47_9RHIZ/6-230        AC J2AV47.1
#=GS D4JR94_9FIRM/13-272       AC D4JR94.1
#=GS A0A0C3MBT9_9PORP/20-261   AC A0A0C3MBT9.1
#=GS R6DM75_9FIRM/10-270       AC R6DM75.1
#=GS D4LEK8_RUMC1/1-193        AC D4LEK8.1
#=GS A1WDT1_ACISJ/12-252       AC A1WDT1.1
#=GS D1PWA6_9BACT/14-261       AC D1PWA6.1
#=GS A0A096AYW4_9BACT/8-232    AC A0A096AYW4.1
#=GS D3IED5_9BACT/18-238       AC D3IED5.1
#=GS B6ATV1_9RHOB/23-89        AC B6ATV1.1
#=GS I1YX22_PREI7/7-250        AC I1YX22.1
#=GS H1YHN5_9SPHI/7-206        AC H1YHN5.1
#=GS B3JE23_9BACE/31-203       AC B3JE23.1
#=GS F8KQQ5_HELBC/12-256       AC F8KQQ5.1
#=GS Q5KKF2_CRYNJ/136-232      AC Q5KKF2.2
#=GS K2G2Z1_9BACT/13-256       AC K2G2Z1.1
#=GS D4LS39_9FIRM/9-240        AC D4LS39.1
#=GS D1PQB5_9FIRM/3-255        AC D1PQB5.1
#=GS G5KDP8_9STRE/10-275       AC G5KDP8.1
#=GS G2SZX7_ROSHA/43-310       AC G2SZX7.1
#=GS W2CKC9_9PORP/8-263        AC W2CKC9.1
#=GS D3NQL2_AZOS1/66-315       AC D3NQL2.1
#=GS H1HJR6_9BACT/8-261        AC H1HJR6.1
#=GS H5VCD9_HELBI/16-231       AC H5VCD9.1
#=GS E6UGE0_RUMA7/11-256       AC E6UGE0.1
#=GS A0A077KNP2_9FLAO/43-241   AC A0A077KNP2.1
#=GS C6VSD1_DYAFD/3-236        AC C6VSD1.1
#=GS D5X3W5_THIK1/7-247        AC D5X3W5.1
#=GS A0A0H4CA92_9ACTN/70-241   AC A0A0H4CA92.1
#=GS D1AXW1_STRM9/33-171       AC D1AXW1.1
#=GS E0UNR6_CYAP2/7-249        AC E0UNR6.1
#=GS Q3Y3U3_ENTFC/8-128        AC Q3Y3U3.1
#=GS D3IB08_9BACT/7-250        AC D3IB08.2
#=GS Q0FUC8_PELBH/69-304       AC Q0FUC8.1
#=GS A1RDD0_ARTAT/52-273       AC A1RDD0.1
#=GS R5KHB0_9BACT/7-260        AC R5KHB0.1
#=GS K1LVN3_9FLAO/4-227        AC K1LVN3.1
#=GS C7DFU9_9RHOB/64-266       AC C7DFU9.1
#=GS F0R3Q0_BACSH/10-264       AC F0R3Q0.1
#=GS L0A6F0_DEIPD/41-213       AC L0A6F0.1
#=GS C5ETF1_9FIRM/1-205        AC C5ETF1.1
#=GS G9YTM8_9FIRM/2-136        AC G9YTM8.1
#=GS E0R996_9ENTR/53-277       AC E0R996.1
#=GS H1YAE0_9SPHI/7-250        AC H1YAE0.1
#=GS D7GPD0_9FIRM/10-208       AC D7GPD0.1
#=GS C4GE65_9FIRM/9-250        AC C4GE65.1
#=GS C0CZH8_9FIRM/18-258       AC C0CZH8.1
#=GS G4KY19_OSCVS/24-261       AC G4KY19.1
#=GS H6LDD1_ACEWD/14-260       AC H6LDD1.1
#=GS R6N075_9CLOT/10-266       AC R6N075.1
#=GS Q88BU0_PSESM/12-322       AC Q88BU0.1
#=GS V2UHU0_9GAMM/15-319       AC V2UHU0.1
#=GS E1KU81_9BACT/14-261       AC E1KU81.1
#=GS E0UNG9_CYAP2/7-251        AC E0UNG9.1
#=GS I4Z9P4_9BACT/21-227       AC I4Z9P4.1
#=GS H1YDX5_9SPHI/8-241        AC H1YDX5.1
#=GS A3X6Q4_9RHOB/54-266       AC A3X6Q4.1
#=GS E6MSD1_9BACT/31-261       AC E6MSD1.1
#=GS B1X3D9_CYAA5/49-260       AC B1X3D9.1
#=GS H1XZG7_9SPHI/8-250        AC H1XZG7.1
#=GS F0P2P8_WEEVC/40-195       AC F0P2P8.1
#=GS K6UAE0_9CLOT/13-250       AC K6UAE0.1
#=GS B2VB52_ERWT9/50-323       AC B2VB52.1
#=GS H1YBX3_9SPHI/7-275        AC H1YBX3.1
#=GS F3PNT7_9BACE/7-242        AC F3PNT7.1
#=GS R5KII7_9CLOT/9-267        AC R5KII7.1
#=GS I1YW28_PREI7/7-250        AC I1YW28.1
#=GS D0CZD0_9RHOB/71-266       AC D0CZD0.1
#=GS A3JLU0_9RHOB/22-227       AC A3JLU0.1
#=GS A0A060REI0_9BACT/1-129    AC A0A060REI0.1
#=GS Q82YL3_ENTFA/13-300       AC Q82YL3.1
#=GS R6ZCI0_9CLOT/14-254       AC R6ZCI0.1
#=GS K2HAM2_9RHOB/39-249       AC K2HAM2.1
#=GS A0A077EN08_9FLAO/14-190   AC A0A077EN08.1
#=GS A0A0M8MCW8_9FLAO/38-262   AC A0A0M8MCW8.1
#=GS F3PNR4_9BACE/7-241        AC F3PNR4.1
#=GS D9RSF8_PREMB/7-242        AC D9RSF8.1
#=GS E6K9U3_9BACT/7-250        AC E6K9U3.1
#=GS F7KI00_9FIRM/17-258       AC F7KI00.1
#=GS I0TDM3_9BACT/15-238       AC I0TDM3.1
#=GS A0A077EA35_9FLAO/38-281   AC A0A077EA35.1
#=GS D7NBN0_9BACT/9-263        AC D7NBN0.1
#=GS A3X865_9RHOB/51-266       AC A3X865.1
#=GS I3YMH4_ALIFI/19-226       AC I3YMH4.1
#=GS A0A0D6JK93_9RHIZ/8-243    AC A0A0D6JK93.1
#=GS A0A0D4CKZ4_9LACO/8-295    AC A0A0D4CKZ4.1
#=GS E4T4T0_PALPW/19-312       AC E4T4T0.1
#=GS A0A077E9Q5_9FLAO/23-198   AC A0A077E9Q5.1
#=GS R6GY62_9FIRM/41-288       AC R6GY62.1
#=GS F4XG02_9FIRM/17-258       AC F4XG02.2
#=GS D4J629_9FIRM/31-266       AC D4J629.1
#=GS A0AWK2_ARTS2/23-243       AC A0AWK2.1
#=GS K9XLR9_9CHRO/7-238        AC K9XLR9.1
#=GS C0D7B6_9FIRM/12-249       AC C0D7B6.1
#=GS F5J2M4_9PORP/7-241        AC F5J2M4.1
#=GS A0A0A8ELW8_9ACTN/51-238   AC A0A0A8ELW8.1
#=GS E6MT15_9BACT/7-250        AC E6MT15.1
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#=GS B2VAX3_ERWT9/12-269       AC B2VAX3.1
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#=GS U5SG79_9LACT/8-239        AC U5SG79.1
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#=GS E6MNJ8_9BACT/7-250        AC E6MNJ8.1
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#=GS A0A0D1LN41_9LACT/8-248    AC A0A0D1LN41.1
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#=GS G5GJE1_9FIRM/9-242        AC G5GJE1.1
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#=GS C5CKY2_VARPS/106-282      AC C5CKY2.1
#=GS I4Z9T6_9BACT/7-285        AC I4Z9T6.1
#=GS H1Y3H5_9SPHI/7-230        AC H1Y3H5.1
#=GS E2ZJT7_9FIRM/19-310       AC E2ZJT7.1
#=GS R7GDC1_9CLOT/11-247       AC R7GDC1.1
#=GS A0A0N0ZT82_9FLAO/8-233    AC A0A0N0ZT82.1
#=GS D3IB31_9BACT/7-250        AC D3IB31.2
#=GS F3ZTS5_9BACE/17-261       AC F3ZTS5.1
#=GS A6NXV1_9FIRM/10-281       AC A6NXV1.1
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#=GS D4M3M3_9FIRM/10-246       AC D4M3M3.1
#=GS B0PDJ1_9FIRM/9-243        AC B0PDJ1.1
#=GS F6IBV1_9SPHN/65-220       AC F6IBV1.1
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#=GS U1ZUJ2_9BURK/12-252       AC U1ZUJ2.1
#=GS I4EB26_METSZ/74-337       AC I4EB26.1
#=GS J6H857_9FIRM/9-251        AC J6H857.1
#=GS H5VCT3_HELBI/1-50         AC H5VCT3.1
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#=GS W0EVI8_9PORP/35-264       AC W0EVI8.1
#=GS F2IUR6_POLGS/11-272       AC F2IUR6.1
#=GS I3DGZ9_HAEPH/29-227       AC I3DGZ9.1
#=GS N8ZIG8_9GAMM/7-209        AC N8ZIG8.1
#=GS C7HA97_9FIRM/20-174       AC C7HA97.1
#=GS C7PJG9_CHIPD/14-181       AC C7PJG9.1
#=GS A0A0F7N5V9_9ACTN/46-237   AC A0A0F7N5V9.1
#=GS K9ZRM2_ANACC/7-198        AC K9ZRM2.1
#=GS F0R5H9_BACSH/44-348       AC F0R5H9.1
#=GS F3ZNE4_9BACE/17-219       AC F3ZNE4.1
#=GS A0A0N0LIE3_9FLAO/20-262   AC A0A0N0LIE3.1
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