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Database: Pfam
Entry: Relaxase
LinkDB: Relaxase
Original site: Relaxase 
#=GF ID   Relaxase
#=GF AC   PF03432.11
#=GF DE   Relaxase/Mobilisation nuclease domain 
#=GF AU   Finn RD, Mifsud W, Bateman A
#=GF SE   Pfam-B_4002 (release 6.6)
#=GF GA   20.70 20.70;
#=GF TC   20.70 20.70;
#=GF NC   20.40 20.50;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 11927849 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   9350859
#=GF RT   Nicking by transesterification: the reaction catalysed by a
#=GF RT   relaxase. 
#=GF RA   Byrd DR, Matson SW; 
#=GF RL   Mol Microbiol 1997;25:1011-1022.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   10940031
#=GF RT   Identification of the mob genes of plasmid pSC101 and
#=GF RT   characterization of a hybrid pSC101-R1162 system for conjugal
#=GF RT   mobilization. 
#=GF RA   Meyer R; 
#=GF RL   J Bacteriol 2000;182:4875-4881.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   10482518
#=GF RT   Bacterial conjugation protein MobA mediates integration of
#=GF RT   complex DNA structures into plant cells. 
#=GF RA   Bravo-Angel AM, Gloeckler V, Hohn B, Tinland B; 
#=GF RL   J Bacteriol 1999;181:5758-5765.
#=GF DR   INTERPRO; IPR005094;
#=GF CC   Relaxases/mobilisation proteins are required for the horizontal
#=GF CC   transfer of genetic information contained on plasmids that
#=GF CC   occurs during bacterial conjugation. The relaxase, in
#=GF CC   conjunction with several auxiliary proteins, forms the
#=GF CC   relaxation complex or relaxosome. Relaxases nick duplex DNA in a
#=GF CC   specific manner by catalysing  trans-esterification[1].    
#=GF SQ   832
#=GS R5F3V3_9CLOT/17-256      AC R5F3V3.1
#=GS Q2Y5A3_NITMU/8-255       AC Q2Y5A3.1
#=GS G8UM11_TANFA/7-250       AC G8UM11.1
#=GS Q18AV7_PEPD6/9-243       AC Q18AV7.1
#=GS D4K2J4_9FIRM/17-258      AC D4K2J4.1
#=GS Q1QF90_NITHX/310-469     AC Q1QF90.1
#=GS E6U8Y8_ETHHY/18-258      AC E6U8Y8.1
#=GS R5ZAE7_9CLOT/10-247      AC R5ZAE7.1
#=GS I1YLR9_METFJ/5-245       AC I1YLR9.1
#=GS N8ZV76_9GAMM/16-318      AC N8ZV76.1
#=GS R5EKS8_9CLOT/13-255      AC R5EKS8.1
#=GS E6K6H2_9BACT/7-242       AC E6K6H2.1
#=GS Q6AIC6_DESPS/11-260      AC Q6AIC6.1
#=GS H1YHD2_9SPHI/7-266       AC H1YHD2.1
#=GS A0A0C5L3D2_9SPHN/16-243  AC A0A0C5L3D2.1
#=GS A8ART7_CITK8/45-247      AC A8ART7.1
#=GS R6N6D9_9CLOT/9-247       AC R6N6D9.1
#=GS R5B737_9BACE/7-249       AC R5B737.1
#=GS V5SHH7_9RHIZ/7-231       AC V5SHH7.1
#=GS A6LGY8_PARD8/7-241       AC A6LGY8.1
#=GS K4KY07_9FIRM/10-271      AC K4KY07.1
#=GS A0A0A1H236_9BURK/56-315  AC A0A0A1H236.1
#=GS C8WP16_EGGLE/18-290      AC C8WP16.1
#=GS A6LHP2_PARD8/7-242       AC A6LHP2.1
#=GS S0GFF6_9PORP/1-214       AC S0GFF6.1
#=GS E6U2P5_ETHHY/18-257      AC E6U2P5.1
#=GS Q8DZ67_STRA5/11-265      AC Q8DZ67.1
#=GS R5FV76_9FIRM/9-248       AC R5FV76.1
#=GS C3M8B9_HAMD5/50-321      AC C3M8B9.1
#=GS D4L4B1_9FIRM/32-272      AC D4L4B1.1
#=GS R5ALH0_9CLOT/51-286      AC R5ALH0.1
#=GS S0GUS1_9PORP/45-215      AC S0GUS1.1
#=GS A0A060RAC1_9BACT/8-248   AC A0A060RAC1.1
#=GS F2KXM1_PREDF/15-261      AC F2KXM1.1
#=GS R5KVL9_9CLOT/10-274      AC R5KVL9.1
#=GS K9ZPI0_ANACC/7-272       AC K9ZPI0.1
#=GS Q140C3_BURXL/119-244     AC Q140C3.1
#=GS R5AR66_9BACT/7-197       AC R5AR66.1
#=GS V6KEJ3_STRRC/68-242      AC V6KEJ3.1
#=GS R5DNH3_9FIRM/18-269      AC R5DNH3.1
#=GS D4LJN8_9FIRM/7-235       AC D4LJN8.1
#=GS F9D556_PREDD/7-250       AC F9D556.1
#=GS K9UFC1_9CHRO/11-244      AC K9UFC1.1
#=GS R5AZ78_9BACE/8-184       AC R5AZ78.1
#=GS I3WIS6_BIFBI/18-311      AC I3WIS6.1
#=GS R7JWI3_9CLOT/14-149      AC R7JWI3.1
#=GS E0TFI2_PARBH/91-259      AC E0TFI2.1
#=GS D7GTR8_9FIRM/17-225      AC D7GTR8.1
#=GS B2JC19_NOSP7/7-227       AC B2JC19.1
#=GS C7RI29_ANAPD/9-250       AC C7RI29.1
#=GS D0UIT5_AGGAD/63-200      AC D0UIT5.1
#=GS D6D387_9BACE/1-214       AC D6D387.1
#=GS A6TV37_ALKMQ/2-218       AC A6TV37.1
#=GS S0RI51_9ENTE/8-241       AC S0RI51.1
#=GS Q1GN41_RUEST/59-272      AC Q1GN41.1
#=GS D3HLL1_LEGLN/12-252      AC D3HLL1.1
#=GS R5PY83_9FIRM/14-264      AC R5PY83.1
#=GS G2IU40_9SPHN/111-279     AC G2IU40.1
#=GS Q5CZF4_BACFN/9-245       AC Q5CZF4.1
#=GS U5Q8U2_9BACT/7-235       AC U5Q8U2.1
#=GS E8UDK5_TAYEM/81-338      AC E8UDK5.1
#=GS E4ND06_KITSK/50-278      AC E4ND06.1
#=GS A0A096AUE1_9BACT/8-261   AC A0A096AUE1.1
#=GS Q1QQL2_NITHX/26-226      AC Q1QQL2.1
#=GS A4JHC7_BURVG/13-266      AC A4JHC7.1
#=GS Q9PHG1_XYLFA/55-323      AC Q9PHG1.1
#=GS H1Y3W9_9SPHI/9-172       AC H1Y3W9.1
#=GS R5G7G0_9PORP/7-242       AC R5G7G0.1
#=GS Q5LFX5_BACFN/32-261      AC Q5LFX5.1
#=GS Q2KZD8_BORA1/78-259      AC Q2KZD8.1
#=GS E1SBZ7_PANVC/4-228       AC E1SBZ7.1
#=GS F0R988_BACSH/9-280       AC F0R988.1
#=GS F9D400_PREDD/7-265       AC F9D400.1
#=GS F2KUL0_PREDF/20-223      AC F2KUL0.1
#=GS Q7MUL9_PORGI/38-347      AC Q7MUL9.1
#=GS L0FVD7_ECHVK/8-254       AC L0FVD7.1
#=GS K9X890_9NOST/7-233       AC K9X890.1
#=GS K9V8Y0_9CYAN/7-293       AC K9V8Y0.1
#=GS A0A0A8B623_9ACTN/23-275  AC A0A0A8B623.1
#=GS E3I094_RHOVT/29-168      AC E3I094.1
#=GS U7GNT3_9RHOB/10-264      AC U7GNT3.1
#=GS K4RG23_9ACTN/67-238      AC K4RG23.1
#=GS E7RM51_9BACT/7-242       AC E7RM51.1
#=GS C4ZEN9_EUBR3/19-269      AC C4ZEN9.1
#=GS A0A0D5YPG7_9FLAO/8-250   AC A0A0D5YPG7.1
#=GS I2F0X4_EMTOG/13-251      AC I2F0X4.1
#=GS D2QV25_SPILD/7-253       AC D2QV25.1
#=GS G9WQB8_9FIRM/10-250      AC G9WQB8.1
#=GS W0EZ38_9SPHI/7-248       AC W0EZ38.1
#=GS L0FX91_ECHVK/8-227       AC L0FX91.1
#=GS D4MR37_9FIRM/9-241       AC D4MR37.1
#=GS E3I5H6_RHOVT/29-263      AC E3I5H6.1
#=GS B1VJ78_PROMH/72-296      AC B1VJ78.1
#=GS D5BJP0_ZUNPS/7-230       AC D5BJP0.1
#=GS W8X9D7_CASDE/12-252      AC W8X9D7.1
#=GS D3LWZ0_9FIRM/9-250       AC D3LWZ0.1
#=GS C4Z3W2_EUBE2/17-247      AC C4Z3W2.1
#=GS A3DKF3_CLOTH/13-258      AC A3DKF3.1
#=GS I5B0Y0_9DELT/11-243      AC I5B0Y0.1
#=GS D6GRJ0_FILAD/10-255      AC D6GRJ0.1
#=GS R5XKM3_9FIRM/10-113      AC R5XKM3.1
#=GS Q8DPX7_STRR6/11-205      AC Q8DPX7.1
#=GS G1UWJ5_9DELT/16-209      AC G1UWJ5.1
#=GS F7V0R2_EEGSY/54-274      AC F7V0R2.1
#=GS D6D723_9BACE/7-242       AC D6D723.1
#=GS D4K6W7_9FIRM/9-242       AC D4K6W7.1
#=GS N2BU79_9ACTN/9-242       AC N2BU79.1
#=GS U2R2I5_9FIRM/9-241       AC U2R2I5.1
#=GS F0S6W1_PSESL/31-199      AC F0S6W1.1
#=GS U2SAS5_9FIRM/13-229      AC U2SAS5.1
#=GS R5A6L8_9CLOT/14-252      AC R5A6L8.1
#=GS A0A0D4DFF9_9ACTN/67-278  AC A0A0D4DFF9.1
#=GS D9R2S9_CLOSW/19-266      AC D9R2S9.1
#=GS Q0VMT5_ALCBS/80-264      AC Q0VMT5.1
#=GS A0A088F406_9SPHI/9-201   AC A0A088F406.1
#=GS G1UW45_9DELT/13-262      AC G1UW45.1
#=GS K9X7B2_9NOST/7-275       AC K9X7B2.1
#=GS K9VRX7_9CYAN/7-247       AC K9VRX7.1
#=GS F9Z9L1_ODOSD/7-250       AC F9Z9L1.1
#=GS G0J7N6_CYCMS/9-232       AC G0J7N6.1
#=GS R7G435_9FIRM/1-133       AC R7G435.1
#=GS E8UE58_TAYEM/51-304      AC E8UE58.1
#=GS L0FY57_ECHVK/11-347      AC L0FY57.1
#=GS C6W0U4_DYAFD/10-225      AC C6W0U4.1
#=GS I4Z9K6_9BACT/7-250       AC I4Z9K6.1
#=GS H2FV74_OCESG/12-252      AC H2FV74.1
#=GS W0EW29_9PORP/7-243       AC W0EW29.1
#=GS D4JR94_9FIRM/13-272      AC D4JR94.1
#=GS A8AM84_CITK8/6-258       AC A8AM84.1
#=GS R6TV85_9FIRM/13-269      AC R6TV85.1
#=GS A0A0C3MBT9_9PORP/20-261  AC A0A0C3MBT9.1
#=GS R6DM75_9FIRM/10-270      AC R6DM75.1
#=GS D4LEK8_RUMC1/1-193       AC D4LEK8.1
#=GS A1WDT1_ACISJ/12-252      AC A1WDT1.1
#=GS A0A096AYW4_9BACT/8-232   AC A0A096AYW4.1
#=GS D3IED5_9BACT/18-238      AC D3IED5.1
#=GS I1XFN6_METNJ/12-253      AC I1XFN6.1
#=GS I1YX22_PREI7/7-250       AC I1YX22.1
#=GS H1YHN5_9SPHI/7-206       AC H1YHN5.1
#=GS F8KQQ5_HELBC/12-256      AC F8KQQ5.1
#=GS B0UTR7_HISS2/11-175      AC B0UTR7.1
#=GS V5XV28_ENTMU/11-265      AC V5XV28.1
#=GS C4ZE46_EUBR3/45-312      AC C4ZE46.1
#=GS A5FDJ5_FLAJ1/22-198      AC A5FDJ5.1
#=GS R6FT59_9BACE/33-261      AC R6FT59.1
#=GS D4LS39_9FIRM/9-240       AC D4LS39.1
#=GS G5KDP8_9STRE/10-275      AC G5KDP8.1
#=GS G2SZX7_ROSHA/43-310      AC G2SZX7.1
#=GS W6KPX2_9PROT/56-232      AC W6KPX2.1
#=GS L0JGG6_PREDD/8-238       AC L0JGG6.1
#=GS U7GAZ3_9RHOB/96-205      AC U7GAZ3.1
#=GS R5KZK3_9CLOT/10-280      AC R5KZK3.1
#=GS E6UGE0_RUMA7/11-256      AC E6UGE0.1
#=GS A0A077KNP2_9FLAO/43-241  AC A0A077KNP2.1
#=GS C6VSD1_DYAFD/3-236       AC C6VSD1.1
#=GS D1AXW1_STRM9/33-171      AC D1AXW1.1
#=GS D5X3W5_THIK1/7-247       AC D5X3W5.1
#=GS I3UHY4_ADVKW/95-254      AC I3UHY4.1
#=GS C4ZFK1_EUBR3/10-246      AC C4ZFK1.1
#=GS E0UNR6_CYAP2/7-249       AC E0UNR6.1
#=GS R7G8V7_9FIRM/1-133       AC R7G8V7.1
#=GS F2KUR8_PREDF/7-242       AC F2KUR8.1
#=GS Q3Y3U3_ENTFC/8-128       AC Q3Y3U3.1
#=GS T2KMG0_9FLAO/7-240       AC T2KMG0.1
#=GS D3IB08_9BACT/7-250       AC D3IB08.2
#=GS A1RDD0_ARTAT/52-273      AC A1RDD0.1
#=GS R5KHB0_9BACT/7-260       AC R5KHB0.1
#=GS F8JPA4_STREN/53-239      AC F8JPA4.1
#=GS X5DLT6_9BACT/8-253       AC X5DLT6.1
#=GS E0TH40_PARBH/44-256      AC E0TH40.1
#=GS B9ECE5_MACCJ/8-238       AC B9ECE5.1
#=GS R7DC82_9FIRM/16-307      AC R7DC82.1
#=GS F0R3Q0_BACSH/10-264      AC F0R3Q0.1
#=GS B7KKC0_CYAP7/7-248       AC B7KKC0.1
#=GS R7DFS2_9PORP/2-157       AC R7DFS2.1
#=GS L0A6F0_DEIPD/41-213      AC L0A6F0.1
#=GS H1YAE0_9SPHI/7-250       AC H1YAE0.1
#=GS R5QFU1_9FIRM/12-229      AC R5QFU1.1
#=GS D7GPD0_9FIRM/10-208      AC D7GPD0.1
#=GS E0R996_9ENTR/53-277      AC E0R996.1
#=GS Q7MRR1_WOLSU/2-258       AC Q7MRR1.1
#=GS G4KY19_OSCVS/24-261      AC G4KY19.1
#=GS H6LDD1_ACEWD/14-260      AC H6LDD1.1
#=GS K9Y285_STAC7/7-265       AC K9Y285.1
#=GS B9ECF0_MACCJ/9-247       AC B9ECF0.1
#=GS E7GU93_CLOSY/10-241      AC E7GU93.1
#=GS R6N075_9CLOT/10-266      AC R6N075.1
#=GS Q88BU0_PSESM/12-322      AC Q88BU0.1
#=GS G5KG21_9STRE/11-263      AC G5KG21.1
#=GS C6XEM5_METGS/37-306      AC C6XEM5.1
#=GS V2UHU0_9GAMM/15-319      AC V2UHU0.1
#=GS E0UNG9_CYAP2/7-251       AC E0UNG9.1
#=GS I4Z9P4_9BACT/21-227      AC I4Z9P4.1
#=GS H1YDX5_9SPHI/8-241       AC H1YDX5.1
#=GS B1X3D9_CYAA5/49-260      AC B1X3D9.1
#=GS H1XZG7_9SPHI/8-250       AC H1XZG7.1
#=GS F0P2P8_WEEVC/40-195      AC F0P2P8.1
#=GS D6DIX5_CLOSC/9-243       AC D6DIX5.1
#=GS R6NKK5_9FIRM/10-242      AC R6NKK5.1
#=GS B2VB52_ERWT9/50-323      AC B2VB52.1
#=GS G4Q4L8_ACIIR/2-248       AC G4Q4L8.1
#=GS H1YBX3_9SPHI/7-275       AC H1YBX3.1
#=GS VIRD2_AGRFC/16-220       AC P18592.2
#=GS R5KII7_9CLOT/9-267       AC R5KII7.1
#=GS I1YW28_PREI7/7-250       AC I1YW28.1
#=GS F7UYG2_EEGSY/12-270      AC F7UYG2.1
#=GS A0A0B4Y288_9PROT/14-265  AC A0A0B4Y288.1
#=GS A0A060REI0_9BACT/1-129   AC A0A060REI0.1
#=GS D9R0E7_CLOSW/17-260      AC D9R0E7.1
#=GS Q82YL3_ENTFA/13-300      AC Q82YL3.1
#=GS A0A077EGV4_9FLAO/37-199  AC A0A077EGV4.1
#=GS S1QZN1_9ENTE/34-308      AC S1QZN1.1
#=GS R6ZCI0_9CLOT/14-254      AC R6ZCI0.1
#=GS U2R148_9FIRM/14-255      AC U2R148.1
#=GS H1YF59_9SPHI/8-226       AC H1YF59.1
#=GS A0A077EN08_9FLAO/14-190  AC A0A077EN08.1
#=GS E3GEU9_EUBLK/9-269       AC E3GEU9.1
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#=GS Q6AG09_LEIXX/9-258       AC Q6AG09.1
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#=GS Q13XK0_BURXL/119-241     AC Q13XK0.1
#=GS G0LCD7_ZOBGA/7-239       AC G0LCD7.1
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