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Database: Pfam
Entry: Suf
LinkDB: Suf
Original site: Suf 
#=GF ID   Suf
#=GF AC   PF05843.11
#=GF DE   Suppressor of forked protein (Suf)
#=GF AU   Moxon SJ
#=GF SE   Pfam-B_8911 (release 8.0)
#=GF GA   22.30 22.30;
#=GF TC   22.30 22.30;
#=GF NC   22.20 22.20;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 11927849 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   9826695
#=GF RT   Autoregulation at the level of mRNA 3' end formation of the
#=GF RT   suppressor of forked gene of Drosophila melanogaster is
#=GF RT   conserved in Drosophila virilis. 
#=GF RA   Audibert A, Simonelig M; 
#=GF RL   Proc Natl Acad Sci U S A 1998;95:14302-14307.
#=GF DR   INTERPRO; IPR008847;
#=GF CC   This family consists of several eukaryotic suppressor of forked
#=GF CC   (Suf) like proteins. The Drosophila melanogaster Suppressor of
#=GF CC   forked [Su(f)] protein shares homology with the yeast RNA14
#=GF CC   protein and the 77-kDa subunit of human cleavage stimulation
#=GF CC   factor, which are proteins involved in mRNA 3' end formation.
#=GF CC   This suggests a role for Su(f) in mRNA 3' end formation in
#=GF CC   Drosophila. The su(f) gene produces three transcripts; two of
#=GF CC   them are polyadenylated at the end of the transcription unit,
#=GF CC   and one is a truncated transcript, polyadenylated in intron 4.
#=GF CC   It is thought that su(f) plays a role in the regulation of
#=GF CC   poly(A) site utilisation and an important role of the GU-rich
#=GF CC   sequence for this regulation to occur [1].
#=GF SQ   829
#=GS RNA14_YEAST/413-603         AC P25298.2
#=GS RNA14_YEAST/413-603         DR PDB; 2L9B B; 630-669;
#=GS A0A0D3AED5_BRAOL/1804-1913  AC A0A0D3AED5.1
#=GS K0KVL3_WICCF/1619-1724      AC K0KVL3.1
#=GS B6K4N2_SCHJY/426-718        AC B6K4N2.1
#=GS E9G324_DAPPU/554-841        AC E9G324.1
#=GS U7Q206_SPOS1/1596-1836      AC U7Q206.1
#=GS H3G9F8_PHYRM/463-692        AC H3G9F8.1
#=GS F6H9L6_VITVI/490-800        AC F6H9L6.1
#=GS H2MCL8_ORYLA/547-656        AC H2MCL8.1
#=GS G0RIA4_HYPJQ/599-894        AC G0RIA4.1
#=GS B0WGG9_CULQU/24-295         AC B0WGG9.1
#=GS A7F375_SCLS1/653-978        AC A7F375.1
#=GS W4XQF4_STRPU/50-255         AC W4XQF4.1
#=GS H0X282_OTOGA/375-652        AC H0X282.1
#=GS E6ZZB5_SPORE/615-907        AC E6ZZB5.1
#=GS K3XF70_SETIT/285-577        AC K3XF70.1
#=GS S8AUT2_PENO1/704-1006       AC S8AUT2.1
#=GS S9WYY0_SCHCR/1587-1691      AC S9WYY0.1
#=GS B7FYK1_PHATC/697-818        AC B7FYK1.1
#=GS W5DJ06_WHEAT/3-84           AC W5DJ06.1
#=GS A7S6G7_NEMVE/391-615        AC A7S6G7.1
#=GS F7BUE9_CALJA/375-649        AC F7BUE9.1
#=GS D6WKF7_TRICA/924-1058       AC D6WKF7.1
#=GS V5BKJ8_TOXGO/534-956        AC V5BKJ8.1
#=GS F1QIB2_DANRE/375-648        AC F1QIB2.1
#=GS C5M6D5_CANTT/433-521        AC C5M6D5.1
#=GS F2UPG0_SALR5/184-368        AC F2UPG0.1
#=GS B0E436_LACBS/265-303        AC B0E436.1
#=GS CLF1_CANGA/44-237           AC Q6FW76.1
#=GS A0A022RQ86_ERYGU/285-590    AC A0A022RQ86.1
#=GS R9ANG8_WALI9/591-918        AC R9ANG8.1
#=GS M1WEX9_CLAP2/592-889        AC M1WEX9.1
#=GS G4VNB3_SCHMA/370-677        AC G4VNB3.1
#=GS S0DLK7_GIBF5/597-884        AC S0DLK7.1
#=GS M2PPP9_CERS8/675-986        AC M2PPP9.1
#=GS Q6PUS3_DANRE/375-647        AC Q6PUS3.1
#=GS E2BA44_HARSA/1258-1384      AC E2BA44.1
#=GS M3CZ54_SPHMS/678-1032       AC M3CZ54.1
#=GS B4NEU6_DROWI/376-658        AC B4NEU6.1
#=GS G5E5C4_BOVIN/1730-1873      AC G5E5C4.1
#=GS M4BJB6_HYAAE/1861-1969      AC M4BJB6.1
#=GS F0Z7F8_DICPU/9-207          AC F0Z7F8.1
#=GS M3YJ60_MUSPF/375-649        AC M3YJ60.1
#=GS M3K6S9_CANMX/460-751        AC M3K6S9.1
#=GS F2UTE0_SALR5/1-217          AC F2UTE0.1
#=GS F2PHW5_TRIEC/677-810        AC F2PHW5.1
#=GS RNA14_ASHGO/412-581         AC Q759Y6.1
#=GS B7P740_IXOSC/371-648        AC B7P740.1
#=GS RNA14_YEAST/588-669         AC P25298.2
#=GS E1BGY7_BOVIN/376-650        AC E1BGY7.2
#=GS A0A044QLS7_ONCVO/377-674    AC A0A044QLS7.1
#=GS G8C1B6_TETPH/406-590        AC G8C1B6.1
#=GS J3NVY7_GAGT3/612-952        AC J3NVY7.1
#=GS A0A066XBU9_COLSU/634-937    AC A0A066XBU9.1
#=GS Q16HV8_AEDAE/1-262          AC Q16HV8.1
#=GS RNA14_SCHPO/440-716         AC O14233.1
#=GS A9TT67_PHYPA/331-634        AC A9TT67.1
#=GS W5DK75_WHEAT/1-171          AC W5DK75.1
#=GS B8BRF6_THAPS/873-1011       AC B8BRF6.1
#=GS F7GX05_MACMU/375-649        AC F7GX05.1
#=GS E7QJ65_YEASZ/413-603        AC E7QJ65.1
#=GS B8N3S9_ASPFN/686-990        AC B8N3S9.1
#=GS J7RTA7_NAUDC/436-687        AC J7RTA7.1
#=GS M0U122_MUSAM/378-679        AC M0U122.1
#=GS Q19866_CAEEL/363-651        AC Q19866.1
#=GS R1EMR3_BOTPV/31-272         AC R1EMR3.1
#=GS A8NFZ6_BRUMA/1650-1793      AC A8NFZ6.2
#=GS B0W9I8_CULQU/373-643        AC B0W9I8.1
#=GS D8QLI4_SCHCM/429-761        AC D8QLI4.1
#=GS A2EWG2_TRIVA/651-878        AC A2EWG2.1
#=GS E9EC54_METAQ/589-885        AC E9EC54.1
#=GS S3CFP5_OPHP1/1591-1815      AC S3CFP5.1
#=GS RRP5_MOUSE/1716-1861        AC Q6NS46.2
#=GS T5AMK2_OPHSC/694-904        AC T5AMK2.1
#=GS N4TL39_FUSC1/598-895        AC N4TL39.1
#=GS H3C389_TETNG/1736-1841      AC H3C389.1
#=GS T1IID0_STRMM/1182-1284      AC T1IID0.1
#=GS G4YUC6_PHYSP/534-674        AC G4YUC6.1
#=GS F0Y7W7_AURAN/1552-1694      AC F0Y7W7.1
#=GS G2R7X0_THITE/630-947        AC G2R7X0.1
#=GS S9W135_SCHCR/95-187         AC S9W135.1
#=GS G3ALP1_SPAPN/1562-1671      AC G3ALP1.1
#=GS E5S8Z9_TRISP/2003-2153      AC E5S8Z9.1
#=GS RNA14_CRYNJ/694-1023        AC P0CO12.1
#=GS I3JDQ4_ORENI/376-649        AC I3JDQ4.1
#=GS RRP5_SCHPO/1584-1690        AC O74835.1
#=GS G1T9E3_RABIT/375-649        AC G1T9E3.1
#=GS F6QSK8_CIOIN/378-656        AC F6QSK8.2
#=GS U4U5G6_DENPD/554-823        AC U4U5G6.1
#=GS RNA14_ASHGO/595-658         AC Q759Y6.1
#=GS Q54LG7_DICDI/504-883        AC Q54LG7.1
#=GS A0A0D2X0A7_CAPO3/391-692    AC A0A0D2X0A7.1
#=GS J0D5U7_AURDE/503-859        AC J0D5U7.1
#=GS A9T4L0_PHYPA/340-664        AC A9T4L0.1
#=GS F6X9G6_MONDO/375-649        AC F6X9G6.2
#=GS M0UFM0_HORVD/1030-1133      AC M0UFM0.1
#=GS Q0CNV6_ASPTN/690-994        AC Q0CNV6.1
#=GS A0A091DJN5_FUKDA/1718-1862  AC A0A091DJN5.1
#=GS A7SSQ6_NEMVE/14-191         AC A7SSQ6.1
#=GS J9ERW0_WUCBA/215-332        AC J9ERW0.1
#=GS G0QK50_ICHMG/177-323        AC G0QK50.1
#=GS E2L7E2_MONPE/1-185          AC E2L7E2.1
#=GS B8CE26_THAPS/142-256        AC B8CE26.1
#=GS E2LS14_MONPE/226-343        AC E2LS14.1
#=GS S8AUK0_DACHA/658-806        AC S8AUK0.1
#=GS A0A091CM83_FUKDA/308-582    AC A0A091CM83.1
#=GS C5DCN2_LACTC/400-582        AC C5DCN2.1
#=GS A8Q8Y1_MALGO/460-812        AC A8Q8Y1.1
#=GS B2W8N9_PYRTR/675-1024       AC B2W8N9.1
#=GS A0A0D2WGW6_CAPO3/356-659    AC A0A0D2WGW6.1
#=GS D7KWP2_ARALL/525-730        AC D7KWP2.1
#=GS A0A096P6H1_PAPAN/1726-1871  AC A0A096P6H1.1
#=GS N1PFE4_DOTSN/568-901        AC N1PFE4.1
#=GS J8Q472_SACAR/413-623        AC J8Q472.1
#=GS A0A087ZSM1_APIME/231-373    AC A0A087ZSM1.1
#=GS H3EDS5_PRIPA/363-418        AC H3EDS5.1
#=GS A0A044V707_ONCVO/1726-1857  AC A0A044V707.1
#=GS G0V7C6_NAUCC/429-619        AC G0V7C6.1
#=GS K3YG88_SETIT/419-677        AC K3YG88.1
#=GS M2S4F8_COCSN/76-201         AC M2S4F8.1
#=GS A0A022PYT5_ERYGU/1692-1827  AC A0A022PYT5.1
#=GS L8G2J8_PSED2/656-981        AC L8G2J8.1
#=GS R0IY55_SETT2/677-1011       AC R0IY55.1
#=GS M7NMI5_PNEMU/497-678        AC M7NMI5.1
#=GS M2XVY5_GALSU/380-713        AC M2XVY5.1
#=GS H2YS46_CIOSA/363-639        AC H2YS46.1
#=GS F8PZX8_SERL3/437-636        AC F8PZX8.1
#=GS B6KR44_TOXGO/116-220        AC B6KR44.1
#=GS F4Q859_DICFS/441-795        AC F4Q859.1
#=GS H2AM73_KAZAF/419-598        AC H2AM73.1
#=GS U3IS94_ANAPL/1751-1860      AC U3IS94.1
#=GS A0A0A2K0X5_PENEN/438-555    AC A0A0A2K0X5.1
#=GS I1F7J2_AMPQE/1762-1846      AC I1F7J2.1
#=GS B0EIY6_ENTDS/159-234        AC B0EIY6.1
#=GS G3J4C5_CORMM/571-867        AC G3J4C5.1
#=GS V4C422_LOTGI/160-263        AC V4C422.1
#=GS A0A0B2VZ35_TOXCA/1709-1851  AC A0A0B2VZ35.1
#=GS G3X1K0_SARHA/1757-1868      AC G3X1K0.1
#=GS E9FUJ8_DAPPU/1341-1485      AC E9FUJ8.1
#=GS Q0IFE2_AEDAE/375-643        AC Q0IFE2.1
#=GS M7UQ09_BOTF1/653-978        AC M7UQ09.1
#=GS Q23TZ6_TETTS/1910-2057      AC Q23TZ6.1
#=GS Q7XB75_ORYSJ/1560-1666      AC Q7XB75.1
#=GS G9MNU2_HYPVG/590-885        AC G9MNU2.1
#=GS A0A0C4F8G6_PUCT1/662-1006   AC A0A0C4F8G6.1
#=GS A3LTE6_PICST/658-720        AC A3LTE6.2
#=GS D0NSW6_PHYIT/1777-1878      AC D0NSW6.1
#=GS R1E487_EMIHU/1727-1833      AC R1E487.1
#=GS S8CA94_DACHA/1-169          AC S8CA94.1
#=GS Q2QNB5_ORYSJ/334-624        AC Q2QNB5.1
#=GS E2R479_CANFA/375-649        AC E2R479.1
#=GS G3SCJ8_GORGO/375-460        AC G3SCJ8.1
#=GS M0TFH4_MUSAM/1807-1919      AC M0TFH4.1
#=GS M7B169_CHEMY/646-799        AC M7B169.1
#=GS RNA14_DEBHA/653-738         AC Q6BJD8.2
#=GS I4YC62_WALSC/547-840        AC I4YC62.1
#=GS E2BXK4_HARSA/372-640        AC E2BXK4.1
#=GS A0A0C2MGB0_THEKT/53-138     AC A0A0C2MGB0.1
#=GS T1HT88_RHOPR/372-648        AC T1HT88.1
#=GS J4IAH7_FIBRA/677-812        AC J4IAH7.1
#=GS F4P9V6_BATDJ/1565-1668      AC F4P9V6.1
#=GS K4BGJ1_SOLLC/1842-1977      AC K4BGJ1.1
#=GS G1X6X8_ARTOA/652-959        AC G1X6X8.1
#=GS M0UFL7_HORVD/608-712        AC M0UFL7.1
#=GS R9PDH8_PSEHS/1405-1556      AC R9PDH8.1
#=GS G8YSF5_PICSO/447-700        AC G8YSF5.1
#=GS L2GP00_VITCO/275-406        AC L2GP00.1
#=GS W1Q6W8_OGAPD/358-533        AC W1Q6W8.1
#=GS I1EEA3_AMPQE/166-283        AC I1EEA3.1
#=GS A4S1C1_OSTLU/432-563        AC A4S1C1.1
#=GS R9NX45_PSEHS/577-874        AC R9NX45.1
#=GS U7Q6A9_SPOS1/696-1037       AC U7Q6A9.1
#=GS J7S4B5_KAZNA/408-610        AC J7S4B5.1
#=GS RNA14_YARLI/725-802         AC Q6C8L8.1
#=GS B0CWX5_LACBS/434-574        AC B0CWX5.1
#=GS G7KP74_MEDTR/335-613        AC G7KP74.2
#=GS T5AMK2_OPHSC/588-680        AC T5AMK2.1
#=GS U3IFF1_ANAPL/1-90           AC U3IFF1.1
#=GS G3SCJ8_GORGO/456-625        AC G3SCJ8.1
#=GS E1Z556_CHLVA/570-798        AC E1Z556.1
#=GS K3X1J3_PYTUL/458-682        AC K3X1J3.1
#=GS D0N9P0_PHYIT/461-570        AC D0N9P0.1
#=GS B6JWT4_SCHJY/530-628        AC B6JWT4.1
#=GS C1MTK9_MICPC/596-798        AC C1MTK9.1
#=GS G3T2D0_LOXAF/375-649        AC G3T2D0.1
#=GS G1SQS0_RABIT/1729-1874      AC G1SQS0.2
#=GS M0UFL8_HORVD/1718-1820      AC M0UFL8.1
#=GS H3BCQ1_LATCH/375-647        AC H3BCQ1.1
#=GS G1P3R1_MYOLU/1732-1875      AC G1P3R1.1
#=GS G1NDI6_MELGA/1760-1869      AC G1NDI6.2
#=GS F0V7C8_NEOCL/121-219        AC F0V7C8.1
#=GS G3Y3H0_ASPNA/690-993        AC G3Y3H0.1
#=GS G0S2D8_CHATD/611-946        AC G0S2D8.1
#=GS G6CLC2_DANPL/372-690        AC G6CLC2.1
#=GS D2A3P0_TRICA/372-640        AC D2A3P0.1
#=GS D2VRL2_NAEGR/379-709        AC D2VRL2.1
#=GS A0A087XK24_POEFO/1696-1804  AC A0A087XK24.2
#=GS D3ZNI3_RAT/1729-1874        AC D3ZNI3.1
#=GS E2AIW6_CAMFO/1257-1396      AC E2AIW6.1
#=GS F6TIH5_HORSE/398-649        AC F6TIH5.1
#=GS B7QE54_IXOSC/732-834        AC B7QE54.1
#=GS K4D0K9_SOLLC/335-638        AC K4D0K9.1
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#=GS RNA14_KLULA/416-612         DR PDB; 4EBA B; 416-582;
#=GS RNA14_KLULA/416-612         DR PDB; 4E85 A; 416-582;
#=GS RNA14_KLULA/416-612         DR PDB; 4EBA E; 416-582;
#=GS S7RXZ3_GLOTA/506-838        AC S7RXZ3.1
#=GS S3BPP3_OPHP1/611-966        AC S3BPP3.1
#=GS C5G7J3_AJEDR/722-1058       AC C5G7J3.1
#=GS J3KC44_COCIM/763-1064       AC J3KC44.2
#=GS A0A099NZW8_ISSOR/1545-1686  AC A0A099NZW8.1
#=GS R0LDE2_ANAPL/366-640        AC R0LDE2.1
#=GS M7NMI5_PNEMU/667-741        AC M7NMI5.1
#=GS V8NZN8_OPHHA/283-557        AC V8NZN8.1
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#=GS W1NWJ6_AMBTC/355-668        AC W1NWJ6.1
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#=GS Q22C43_TETTS/230-318        AC Q22C43.3
#=GS F0VHS1_NEOCL/1-126          AC F0VHS1.1
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#=GS A0A0D3ED16_BRAOL/63-170     AC A0A0D3ED16.1
#=GS A0A077Z5G0_TRITR/388-702    AC A0A077Z5G0.1
#=GS G4Z6Q4_PHYSP/1787-1888      AC G4Z6Q4.1
#=GS K7JB42_NASVI/1519-1660      AC K7JB42.1
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#=GS A0A0D3CL10_BRAOL/1813-1922  AC A0A0D3CL10.1
#=GS RNA14_EMENI/675-981         AC Q5B3I8.2
#=GS E1Z619_CHLVA/183-288        AC E1Z619.1
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#=GS C4JZ89_UNCRE/619-923        AC C4JZ89.1
#=GS K2RKX4_MACPH/589-919        AC K2RKX4.1
#=GS A7TPA2_VANPO/564-637        AC A7TPA2.1
#=GS H3GFY5_PHYRM/398-592        AC H3GFY5.1
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#=GS A0A098D1E1_GIBZA/601-901    AC A0A098D1E1.1
#=GS C1NA95_MICPC/2116-2227      AC C1NA95.1
#=GS B0EAL8_ENTDS/62-195         AC B0EAL8.1
#=GS G8ZQF5_TORDC/407-587        AC G8ZQF5.1
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#=GS F6HLF1_VITVI/1792-1902      AC F6HLF1.1
#=GS I2H234_TETBL/469-656        AC I2H234.1
#=GS F7E5W0_MONDO/1735-1845      AC F7E5W0.1
#=GS T1ED14_HELRO/76-208         AC T1ED14.1
#=GS K1QMA4_CRAGI/1449-1589      AC K1QMA4.1
#=GS L0P8S3_PNEJ8/1038-1220      AC L0P8S3.1
#=GS U5H373_USTV1/1457-1596      AC U5H373.1
#=GS B8M5L3_TALSN/682-989        AC B8M5L3.1
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#=GS RRP5_BOVIN/1730-1873        AC A7MB10.1
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#=GS M2SN44_COCSN/674-1008       AC M2SN44.1
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#=GS A0A077ZE18_TRITR/382-579    AC A0A077ZE18.1
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#=GS E2LHJ8_MONPE/104-241        AC E2LHJ8.1
#=GS K9FCX7_PEND2/680-982        AC K9FCX7.1
#=GS M4ET00_BRARP/205-302        AC M4ET00.1
#=GS D7MSN2_ARALL/475-553        AC D7MSN2.1
#=GS Q9FNM3_ARATH/478-545        AC Q9FNM3.1
#=GS H6BN84_EXODN/1698-1808      AC H6BN84.1
#=GS D7L0Q0_ARALL/491-577        AC D7L0Q0.1
#=GS V2XAQ2_MONRO/382-656        AC V2XAQ2.1
#=GS C3XPK3_BRAFL/1493-1634      AC C3XPK3.1
#=GS H2AM73_KAZAF/585-672        AC H2AM73.1
#=GS M4DJB0_BRARP/333-622        AC M4DJB0.1
#=GS Q22C43_TETTS/373-486        AC Q22C43.3
#=GS Q297C2_DROPS/1324-1432      AC Q297C2.1
#=GS U3K2A0_FICAL/1722-1833      AC U3K2A0.1
#=GS H3G9F8_PHYRM/201-318        AC H3G9F8.1
#=GS T1JFN7_STRMM/158-402        AC T1JFN7.1
#=GS C5KL16_PERM5/1629-1777      AC C5KL16.1
#=GS Q0U7V9_PHANO/666-989        AC Q0U7V9.1
#=GS A9T4L0_PHYPA/60-255         AC A9T4L0.1
#=GS M4F149_BRARP/1818-1928      AC M4F149.1
#=GS S7QPR9_GLOTA/1335-1474      AC S7QPR9.1
#=GS C4M3A2_ENTHI/106-315        AC C4M3A2.1
#=GS G1KBE9_ANOCA/376-650        AC G1KBE9.2
#=GS B6AES9_CRYMR/86-223         AC B6AES9.1
#=GS A0A080WL83_TRIRC/232-329    AC A0A080WL83.1
#=GS RNA14_NEUCR/691-1023        AC Q7S1Y0.1
#=GS B8BML6_ORYSI/482-772        AC B8BML6.1
#=GS U4U7D3_DENPD/428-536        AC U4U7D3.1
#=GS M3JUZ2_CANMX/42-200         AC M3JUZ2.1
#=GS S8ELE8_FOMPI/695-895        AC S8ELE8.1
#=GS H3G9H3_PHYRM/530-642        AC H3G9H3.1
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