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Database: Pfam
Entry: Suf
LinkDB: Suf
Original site: Suf 
#=GF ID   Suf
#=GF AC   PF05843.9
#=GF DE   Suppressor of forked protein (Suf)
#=GF AU   Moxon SJ
#=GF SE   Pfam-B_8911 (release 8.0)
#=GF GA   21.90 21.90;
#=GF TC   21.90 21.90;
#=GF NC   21.80 21.80;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 23193494 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   9826695
#=GF RT   Autoregulation at the level of mRNA 3' end formation of the
#=GF RT   suppressor of forked gene of Drosophila melanogaster is
#=GF RT   conserved in Drosophila virilis. 
#=GF RA   Audibert A, Simonelig M; 
#=GF RL   Proc Natl Acad Sci U S A 1998;95:14302-14307.
#=GF DR   INTERPRO; IPR008847;
#=GF CC   This family consists of several eukaryotic suppressor of forked
#=GF CC   (Suf) like proteins. The Drosophila melanogaster Suppressor of
#=GF CC   forked [Su(f)] protein shares homology with the yeast RNA14
#=GF CC   protein and the 77-kDa subunit of human cleavage stimulation
#=GF CC   factor, which are proteins involved in mRNA 3' end formation.
#=GF CC   This suggests a role for Su(f) in mRNA 3' end formation in
#=GF CC   Drosophila. The su(f) gene produces three transcripts; two of
#=GF CC   them are polyadenylated at the end of the transcription unit,
#=GF CC   and one is a truncated transcript, polyadenylated in intron 4.
#=GF CC   It is thought that su(f) plays a role in the regulation of
#=GF CC   poly(A) site utilisation and an important role of the GU-rich
#=GF CC   sequence for this regulation to occur [1].
#=GF SQ   583
#=GS A8IIA0_CHLRE/47-137     AC A8IIA0.1
#=GS F5H0G6_HUMAN/308-582    AC F5H0G6.1
#=GS B6K4N2_SCHJY/426-718    AC B6K4N2.1
#=GS B8C670_THAPS/73-218     AC B8C670.1
#=GS B4M186_DROVI/457-683    AC B4M186.1
#=GS F6H9L6_VITVI/490-800    AC F6H9L6.1
#=GS H2MCL8_ORYLA/547-656    AC H2MCL8.1
#=GS B2VZM3_PYRTR/82-195     AC B2VZM3.1
#=GS G0RIA4_HYPJQ/599-894    AC G0RIA4.1
#=GS A7F375_SCLS1/653-978    AC A7F375.1
#=GS B4JSG9_DROGR/431-664    AC B4JSG9.1
#=GS H0X282_OTOGA/375-652    AC H0X282.1
#=GS E6ZZB5_SPORE/615-907    AC E6ZZB5.1
#=GS G7KP74_MEDTR/351-629    AC G7KP74.1
#=GS H3GFY5_PHYRM/398-708    AC H3GFY5.1
#=GS F7BUE9_CALJA/375-649    AC F7BUE9.1
#=GS F7E5W0_MONDO/1736-1845  AC F7E5W0.1
#=GS G3B9Z4_CANTC/576-664    AC G3B9Z4.1
#=GS E0S5V1_ENCIT/290-490    AC E0S5V1.1
#=GS Q7XB75_ORYSJ/1560-1667  AC Q7XB75.1
#=GS H2AM73_KAZAF/419-672    AC H2AM73.1
#=GS F1QIB2_DANRE/375-648    AC F1QIB2.1
#=GS B9PZ16_TOXGO/117-217    AC B9PZ16.1
#=GS B0E436_LACBS/265-303    AC B0E436.1
#=GS G4VNB3_SCHMA/370-677    AC G4VNB3.1
#=GS B4LXN4_DROVI/1284-1397  AC B4LXN4.1
#=GS Q6PUS3_DANRE/375-647    AC Q6PUS3.1
#=GS B9GDV8_ORYSJ/330-659    AC B9GDV8.1
#=GS H6BN84_EXODN/1696-1808  AC H6BN84.1
#=GS B6AI79_CRYMR/446-610    AC B6AI79.1
#=GS B4NEU6_DROWI/376-658    AC B4NEU6.1
#=GS A7S6G7_NEMVE/391-622    AC A7S6G7.1
#=GS F2UTE0_SALS5/1-217      AC F2UTE0.1
#=GS F2PHW5_TRIEC/677-810    AC F2PHW5.1
#=GS B9SPA3_RICCO/467-705    AC B9SPA3.1
#=GS B7P740_IXOSC/371-648    AC B7P740.1
#=GS E1BGY7_BOVIN/376-650    AC E1BGY7.2
#=GS G3BDQ1_CANTC/430-717    AC G3BDQ1.1
#=GS CLF1_CANAL/102-268      AC Q5AED6.2
#=GS Q16HV8_AEDAE/1-262      AC Q16HV8.1
#=GS RNA14_SCHPO/440-716     AC O14233.1
#=GS A9TT67_PHYPA/331-634    AC A9TT67.1
#=GS RNA14_USTMA/623-924     AC Q4PCV8.1
#=GS H3JBG1_STRPU/154-433    AC H3JBG1.1
#=GS F7GX05_MACMU/375-649    AC F7GX05.1
#=GS B4GP24_DROPE/416-649    AC B4GP24.1
#=GS B3NYA3_DROER/376-650    AC B3NYA3.1
#=GS B8N3S9_ASPFN/686-990    AC B8N3S9.1
#=GS B4NCA6_DROWI/90-296     AC B4NCA6.1
#=GS G3ALN2_SPAPN/429-714    AC G3ALN2.1
#=GS B0WGG9_CULQU/25-292     AC B0WGG9.1
#=GS Q19866_CAEEL/363-651    AC Q19866.1
#=GS B0W9I8_CULQU/373-643    AC B0W9I8.1
#=GS D8QLI4_SCHCM/429-761    AC D8QLI4.1
#=GS Q9FZ58_ARATH/392-691    AC Q9FZ58.1
#=GS A2AQH9_MOUSE/375-649    AC A2AQH9.1
#=GS E9EC54_METAQ/589-885    AC E9EC54.1
#=GS F7DAV0_ORNAN/1761-1870  AC F7DAV0.1
#=GS C3XZ30_BRAFL/126-240    AC C3XZ30.1
#=GS F0WGU6_9STRA/522-839    AC F0WGU6.1
#=GS G2R7X0_THITE/630-947    AC G2R7X0.1
#=GS F8NZK9_SERL9/438-648    AC F8NZK9.1
#=GS E7Q7Q0_YEASB/413-660    AC E7Q7Q0.1
#=GS E6ZL97_SPORE/1400-1550  AC E6ZL97.1
#=GS E5S8Z9_TRISP/2003-2153  AC E5S8Z9.1
#=GS D8QQS6_SELML/373-638    AC D8QQS6.1
#=GS RNA14_CRYNJ/694-1023    AC P0CO12.1
#=GS E5SC99_TRISP/243-468    AC E5SC99.1
#=GS E9FUJ8_DAPPU/1326-1485  AC E9FUJ8.1
#=GS B5DYE1_DROPS/417-648    AC B5DYE1.1
#=GS G1T9E3_RABIT/375-649    AC G1T9E3.1
#=GS F6QSK8_CIOIN/378-656    AC F6QSK8.2
#=GS Q54LG7_DICDI/504-883    AC Q54LG7.1
#=GS G3SCJ8_GORGO/457-625    AC G3SCJ8.1
#=GS G8JRY9_ERECY/414-597    AC G8JRY9.1
#=GS Q0CNV6_ASPTN/690-994    AC Q0CNV6.1
#=GS Q4PGT5_USTMA/1405-1556  AC Q4PGT5.1
#=GS Q010S4_OSTTA/1805-1946  AC Q010S4.1
#=GS I0YYB1_9CHLO/1630-1755  AC I0YYB1.1
#=GS I1LT91_SOYBN/430-661    AC I1LT91.1
#=GS D4DK90_TRIVH/679-988    AC D4DK90.1
#=GS Q297C2_DROPS/1323-1432  AC Q297C2.1
#=GS B4N8Q9_DROWI/379-645    AC B4N8Q9.1
#=GS I1Q8X2_ORYGL/1705-1814  AC I1Q8X2.1
#=GS E2R475_CANFA/283-557    AC E2R475.1
#=GS E2L7E2_MONPE/1-185      AC E2L7E2.1
#=GS C5E3Y5_ZYGRC/405-603    AC C5E3Y5.1
#=GS I1EEA3_AMPQE/167-274    AC I1EEA3.1
#=GS A8Q8Y1_MALGO/460-812    AC A8Q8Y1.1
#=GS B2W8N9_PYRTR/675-1024   AC B2W8N9.1
#=GS G8BE64_CANPC/487-773    AC G8BE64.1
#=GS H3EDS5_PRIPA/363-418    AC H3EDS5.1
#=GS A2EJR5_TRIVA/331-466    AC A2EJR5.1
#=GS I1E7B7_AMPQE/20-135     AC I1E7B7.1
#=GS H2KUB5_CLOSI/441-705    AC H2KUB5.1
#=GS F4Q859_DICFS/441-795    AC F4Q859.1
#=GS G3J4C5_CORMM/571-867    AC G3J4C5.1
#=GS Q0IFE2_AEDAE/375-643    AC Q0IFE2.1
#=GS C4R477_PICPG/47-207     AC C4R477.1
#=GS G9MNU2_HYPVG/590-885    AC G9MNU2.1
#=GS C5DF89_LACTC/1585-1730  AC C5DF89.1
#=GS F2UNM2_SALS5/1865-2005  AC F2UNM2.1
#=GS E1Z619_CHLVA/185-287    AC E1Z619.1
#=GS A8NFZ6_BRUMA/1665-1793  AC A8NFZ6.1
#=GS H9IAX3_ATTCE/1245-1383  AC H9IAX3.1
#=GS H3JF01_STRPU/432-484    AC H3JF01.1
#=GS Q2QNB5_ORYSJ/334-624    AC Q2QNB5.1
#=GS E2R479_CANFA/375-649    AC E2R479.1
#=GS Q5CNN9_CRYHO/502-656    AC Q5CNN9.1
#=GS G3SCJ8_GORGO/375-460    AC G3SCJ8.1
#=GS RNA14_YEAST/413-669     AC P25298.2
#=GS RNA14_YEAST/413-669     DR PDB; 2L9B B; 630-669;
#=GS B4JFX2_DROGR/1283-1396  AC B4JFX2.1
#=GS Q7PQF3_ANOGA/1363-1466  AC Q7PQF3.5
#=GS E2BXK4_HARSA/372-640    AC E2BXK4.1
#=GS Q7JPI2_CAEEL/358-646    AC Q7JPI2.1
#=GS D8T1W4_SELML/158-255    AC D8T1W4.1
#=GS A8PVH1_MALGO/132-249    AC A8PVH1.1
#=GS C5P9D6_COCP7/689-990    AC C5P9D6.1
#=GS F4P9V6_BATDJ/1565-1668  AC F4P9V6.1
#=GS G8BVF3_TETPH/1575-1704  AC G8BVF3.1
#=GS D6WSZ2_TRICA/297-485    AC D6WSZ2.1
#=GS G1X6X8_ARTOA/652-959    AC G1X6X8.1
#=GS D6WKF7_TRICA/924-1059   AC D6WKF7.1
#=GS G4Z6Q4_PHYSP/1790-1888  AC G4Z6Q4.1
#=GS RNA14_CRYNB/694-1023    AC P0CO13.1
#=GS F1MHT0_BOVIN/375-649    AC F1MHT0.1
#=GS G4YUC6_PHYSP/511-855    AC G4YUC6.1
#=GS E6R0T7_CRYGW/710-1040   AC E6R0T7.1
#=GS E7R998_PICAD/33-102     AC E7R998.1
#=GS A4S1C1_OSTLU/432-563    AC A4S1C1.1
#=GS B0CWX5_LACBS/434-574    AC B0CWX5.1
#=GS E1Z556_CHLVA/570-798    AC E1Z556.1
#=GS F7DEE7_XENTR/380-580    AC F7DEE7.1
#=GS C7GL63_YEAS2/413-669    AC C7GL63.1
#=GS B4GEB5_DROPE/1323-1432  AC B4GEB5.1
#=GS G3T2D0_LOXAF/375-649    AC G3T2D0.1
#=GS F2T9G8_AJEDA/722-1058   AC F2T9G8.1
#=GS Q3TV86_MOUSE/1-225      AC Q3TV86.1
#=GS H3BCQ1_LATCH/375-647    AC H3BCQ1.1
#=GS G1NDI6_MELGA/1760-1869  AC G1NDI6.2
#=GS A5DXL3_LODEL/59-225     AC A5DXL3.1
#=GS G3Y3H0_ASPNA/690-993    AC G3Y3H0.1
#=GS G0S2D8_CHATD/611-946    AC G0S2D8.1
#=GS G6CLC2_DANPL/372-690    AC G6CLC2.1
#=GS G0WE03_NAUDC/436-687    AC G0WE03.1
#=GS D8RLQ0_SELML/1677-1806  AC D8RLQ0.1
#=GS D2A3P0_TRICA/372-640    AC D2A3P0.1
#=GS Q4Z689_PLABA/514-865    AC Q4Z689.1
#=GS A9T4L0_PHYPA/340-665    AC A9T4L0.1
#=GS D2VRL2_NAEGR/379-709    AC D2VRL2.1
#=GS E9G324_DAPPU/531-848    AC E9G324.1
#=GS H2UHX7_TAKRU/1730-1837  AC H2UHX7.1
#=GS E2AIW6_CAMFO/1257-1396  AC E2AIW6.1
#=GS F6TIH5_HORSE/398-649    AC F6TIH5.1
#=GS B9IID8_POPTR/173-280    AC B9IID8.1
#=GS F9FT60_FUSOF/598-895    AC F9FT60.1
#=GS Q6ZCC0_ORYSJ/435-688    AC Q6ZCC0.1
#=GS A6RGK8_AJECN/690-879    AC A6RGK8.1
#=GS D8RA86_SELML/399-703    AC D8RA86.1
#=GS G3AZW6_CANTC/50-136     AC G3AZW6.1
#=GS I1E7B7_AMPQE/126-210    AC I1E7B7.1
#=GS D7KFJ1_ARALL/333-632    AC D7KFJ1.1
#=GS G5E5C4_BOVIN/1729-1873  AC G5E5C4.1
#=GS RNA14_ASPFU/687-990     AC Q4WXX4.1
#=GS B3L5Z7_PLAKH/704-1200   AC B3L5Z7.1
#=GS Q5BBD3_EMENI/1603-1780  AC Q5BBD3.1
#=GS C9SG27_VERA1/720-865    AC C9SG27.1
#=GS G2XI62_VERDV/690-780    AC G2XI62.1
#=GS G3R7L4_GORGO/1725-1870  AC G3R7L4.1
#=GS A5DPT1_PICGU/1575-1674  AC A5DPT1.2
#=GS C7YHP7_NECH7/592-888    AC C7YHP7.1
#=GS G3GYX4_CRIGR/375-649    AC G3GYX4.1
#=GS RRP5_BOVIN/1729-1873    AC A7MB10.1
#=GS D8LZ71_BLAHO/72-215     AC D8LZ71.1
#=GS F8MS02_NEUT8/670-1002   AC F8MS02.1
#=GS G1MRM6_MELGA/376-650    AC G1MRM6.2
#=GS B6H4L7_PENCW/688-990    AC B6H4L7.1
#=GS D3ZNI3_RAT/1730-1874    AC D3ZNI3.1
#=GS RNA14_DEBHA/445-738     AC Q6BJD8.2
#=GS C5DCN2_LACTC/400-581    AC C5DCN2.1
#=GS G1KDA1_ANOCA/1739-1849  AC G1KDA1.1
#=GS F6YEW8_XENTR/364-565    AC F6YEW8.1
#=GS C4R3F9_PICPG/1569-1694  AC C4R3F9.1
#=GS D3ZNH8_RAT/1715-1859    AC D3ZNH8.1
#=GS C0S3P0_PARBP/553-632    AC C0S3P0.1
#=GS H2W6C0_CAEJA/363-509    AC H2W6C0.1
#=GS D8M0N9_BLAHO/303-485    AC D8M0N9.1
#=GS G3PU27_GASAC/376-649    AC G3PU27.1
#=GS I1JFV5_SOYBN/1697-1810  AC I1JFV5.1
#=GS G0V2A0_TRYCI/294-606    AC G0V2A0.1
#=GS F7BFS8_MONDO/375-649    AC F7BFS8.1
#=GS B7QIT4_IXOSC/547-843    AC B7QIT4.1
#=GS G4YT57_PHYSP/398-699    AC G4YT57.1
#=GS B5DLV3_DROPS/376-649    AC B5DLV3.1
#=GS H8X158_9ASCO/32-199     AC H8X158.1
#=GS F2UHW6_SALS5/1-209      AC F2UHW6.1
#=GS G4TIJ4_PIRID/461-796    AC G4TIJ4.1
#=GS I1MEB0_SOYBN/549-693    AC I1MEB0.1
#=GS D7MSN2_ARALL/478-554    AC D7MSN2.1
#=GS A9UQH8_MONBE/347-621    AC A9UQH8.1
#=GS B4DFQ5_HUMAN/283-557    AC B4DFQ5.1
#=GS E4UNN0_ARTGP/677-987    AC E4UNN0.1
#=GS G7PDW2_MACFA/1727-1872  AC G7PDW2.1
#=GS I1F7J2_AMPQE/1761-1846  AC I1F7J2.1
#=GS H3G9H3_PHYRM/526-648    AC H3G9H3.1
#=GS G5AN90_HETGA/367-641    AC G5AN90.1
#=GS G7PQG2_MACFA/375-649    AC G7PQG2.1
#=GS I0YN80_9CHLO/347-444    AC I0YN80.1
#=GS B3LVA3_DROAN/371-595    AC B3LVA3.1
#=GS CSTF3_MOUSE/375-649     AC Q99LI7.1
#=GS CSTF3_MOUSE/375-649     DR PDB; 2OND B; 375-549;
#=GS CSTF3_MOUSE/375-649     DR PDB; 2OND A; 375-549;
#=GS CSTF3_MOUSE/375-649     DR PDB; 2OOE A; 375-549;
#=GS G3UUS2_MELGA/371-648    AC G3UUS2.1
#=GS G3X135_SARHA/375-649    AC G3X135.1
#=GS G3X1K0_SARHA/1758-1867  AC G3X1K0.1
#=GS B4QT44_DROSI/85-192     AC B4QT44.1
#=GS CLF1_CANGA/582-690      AC Q6FW76.1
#=GS A4S1L2_OSTLU/477-624    AC A4S1L2.1
#=GS A1D6W6_NEOFI/687-990    AC A1D6W6.1
#=GS A8IBR0_CHLRE/1139-1279  AC A8IBR0.1
#=GS F8MNR2_NEUT8/24-139     AC F8MNR2.1
#=GS E3X7J9_ANODA/303-580    AC E3X7J9.1
#=GS B8BRF6_THAPS/872-1011   AC B8BRF6.1
#=GS C4Y2L4_CLAL4/58-220     AC C4Y2L4.1
#=GS G3ALP1_SPAPN/1568-1671  AC G3ALP1.1
#=GS F2QXJ1_PICP7/1569-1694  AC F2QXJ1.1
#=GS C5KMA8_PERM5/104-227    AC C5KMA8.1
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#=GS D0NGB5_PHYIT/546-673    AC D0NGB5.1
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#=GS B9FW29_ORYSJ/1790-1897  AC B9FW29.1
#=GS RNA14_NEUCR/691-1023    AC Q7S1Y0.1
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#=GS G3IB34_CRIGR/1726-1869  AC G3IB34.1
#=GS RNA14_KLULA/416-661     AC Q6CII8.1
#=GS RNA14_KLULA/416-661     DR PDB; 4E85 B; 416-581;
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#=GS Q7QDA0_ANOGA/377-647    AC Q7QDA0.5
#=GS Q5CRZ2_CRYPI/501-656    AC Q5CRZ2.1
#=GS H2YS45_CIOSA/363-641    AC H2YS45.1
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#=GS A8P7T1_BRUMA/408-587    AC A8P7T1.1
#=GS Q8SWC5_ENCCU/290-490    AC Q8SWC5.1
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