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Database: Pfam
Entry: Suf
LinkDB: Suf
Original site: Suf 
#=GF ID   Suf
#=GF AC   PF05843.10
#=GF DE   Suppressor of forked protein (Suf)
#=GF AU   Moxon SJ
#=GF SE   Pfam-B_8911 (release 8.0)
#=GF GA   22.30 22.30;
#=GF TC   22.30 22.30;
#=GF NC   22.20 22.20;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 80369284 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   9826695
#=GF RT   Autoregulation at the level of mRNA 3' end formation of the
#=GF RT   suppressor of forked gene of Drosophila melanogaster is
#=GF RT   conserved in Drosophila virilis. 
#=GF RA   Audibert A, Simonelig M; 
#=GF RL   Proc Natl Acad Sci U S A 1998;95:14302-14307.
#=GF DR   INTERPRO; IPR008847;
#=GF CC   This family consists of several eukaryotic suppressor of forked
#=GF CC   (Suf) like proteins. The Drosophila melanogaster Suppressor of
#=GF CC   forked [Su(f)] protein shares homology with the yeast RNA14
#=GF CC   protein and the 77-kDa subunit of human cleavage stimulation
#=GF CC   factor, which are proteins involved in mRNA 3' end formation.
#=GF CC   This suggests a role for Su(f) in mRNA 3' end formation in
#=GF CC   Drosophila. The su(f) gene produces three transcripts; two of
#=GF CC   them are polyadenylated at the end of the transcription unit,
#=GF CC   and one is a truncated transcript, polyadenylated in intron 4.
#=GF CC   It is thought that su(f) plays a role in the regulation of
#=GF CC   poly(A) site utilisation and an important role of the GU-rich
#=GF CC   sequence for this regulation to occur [1].
#=GF SQ   1184
#=GS RNA14_YEAST/413-603         AC P25298.2
#=GS K0KVL3_WICCF/1619-1724      AC K0KVL3.1
#=GS B6K4N2_SCHJY/426-718        AC B6K4N2.1
#=GS E9G324_DAPPU/554-841        AC E9G324.1
#=GS F6H9L6_VITVI/490-800        AC F6H9L6.1
#=GS L8GQL2_ACACA/400-711        AC L8GQL2.1
#=GS G0RIA4_HYPJQ/599-894        AC G0RIA4.1
#=GS B0WGG9_CULQU/24-295         AC B0WGG9.1
#=GS H0X282_OTOGA/375-652        AC H0X282.1
#=GS E6ZZB5_SPORE/615-907        AC E6ZZB5.1
#=GS S8AUT2_PENO1/704-1006       AC S8AUT2.1
#=GS B7FYK1_PHATC/697-818        AC B7FYK1.1
#=GS W5DJ06_WHEAT/3-84           AC W5DJ06.1
#=GS G7KP74_MEDTR/351-629        AC G7KP74.1
#=GS A7S6G7_NEMVE/391-615        AC A7S6G7.1
#=GS F7BUE9_CALJA/375-649        AC F7BUE9.1
#=GS A0A028JWP8_TRIRU/232-329    AC A0A028JWP8.1
#=GS F1QIB2_DANRE/375-648        AC F1QIB2.1
#=GS F2UPG0_SALR5/184-368        AC F2UPG0.1
#=GS B0E436_LACBS/265-303        AC B0E436.1
#=GS CLF1_CANGA/44-237           AC Q6FW76.1
#=GS A0A024XCJ9_PLAFC/763-1149   AC A0A024XCJ9.1
#=GS A0A022RQ86_MIMGU/285-590    AC A0A022RQ86.1
#=GS R9ANG8_WALI9/591-918        AC R9ANG8.1
#=GS M1WEX9_CLAP2/592-889        AC M1WEX9.1
#=GS A0A034VJM4_BACDO/437-632    AC A0A034VJM4.1
#=GS M2PPP9_CERS8/675-986        AC M2PPP9.1
#=GS Q6PUS3_DANRE/375-647        AC Q6PUS3.1
#=GS N9TN99_ENTHI/25-121         AC N9TN99.1
#=GS M3CZ54_SPHMS/678-1032       AC M3CZ54.1
#=GS A0A026WFR9_CERBI/231-372    AC A0A026WFR9.1
#=GS B4NEU6_DROWI/376-658        AC B4NEU6.1
#=GS M4BJB6_HYAAE/1861-1969      AC M4BJB6.1
#=GS F0WGU6_9STRA/522-840        AC F0WGU6.1
#=GS Q4PGT5_USTMA/1381-1556      AC Q4PGT5.1
#=GS M3K6S9_CANMX/460-751        AC M3K6S9.1
#=GS V9EBI0_PHYPR/397-712        AC V9EBI0.1
#=GS B7P740_IXOSC/371-648        AC B7P740.1
#=GS E1BGY7_BOVIN/376-650        AC E1BGY7.2
#=GS A0A044QLS7_ONCVO/377-674    AC A0A044QLS7.1
#=GS RNA14_SCHPO/440-716         AC O14233.1
#=GS A9TT67_PHYPA/331-634        AC A9TT67.1
#=GS B8BRF6_THAPS/873-1011       AC B8BRF6.1
#=GS F7GX05_MACMU/375-649        AC F7GX05.1
#=GS V9FIC4_PHYPR/1832-1930      AC V9FIC4.1
#=GS B3NYA3_DROER/376-650        AC B3NYA3.1
#=GS J7RTA7_NAUDC/436-687        AC J7RTA7.1
#=GS M0U122_MUSAM/378-679        AC M0U122.1
#=GS R1EMR3_BOTPV/31-272         AC R1EMR3.1
#=GS A8NFZ6_BRUMA/1650-1793      AC A8NFZ6.2
#=GS Q9FZ58_ARATH/392-691        AC Q9FZ58.1
#=GS W7T8N9_9STRA/456-653        AC W7T8N9.1
#=GS A2EWG2_TRIVA/651-878        AC A2EWG2.1
#=GS R7WDH5_AEGTA/1855-1956      AC R7WDH5.1
#=GS S3CFP5_OPHP1/1591-1815      AC S3CFP5.1
#=GS T5AMK2_OPHSC/694-904        AC T5AMK2.1
#=GS H3C389_TETNG/1736-1841      AC H3C389.1
#=GS S9XNS4_9CETA/163-289        AC S9XNS4.1
#=GS F0Y7W7_AURAN/1552-1694      AC F0Y7W7.1
#=GS S9W135_SCHCR/95-187         AC S9W135.1
#=GS G3ALP1_SPAPN/1562-1671      AC G3ALP1.1
#=GS F2QXJ1_PICP7/1553-1694      AC F2QXJ1.1
#=GS RRP5_SCHPO/1584-1690        AC O74835.1
#=GS U4U5G6_DENPD/554-823        AC U4U5G6.1
#=GS J0D5U7_AURDE/503-859        AC J0D5U7.1
#=GS M0UFM0_HORVD/1030-1133      AC M0UFM0.1
#=GS W9MNK5_FUSOX/598-895        AC W9MNK5.1
#=GS V9FHY4_PHYPR/534-652        AC V9FHY4.1
#=GS W0VS21_ZYGBA/404-592        AC W0VS21.1
#=GS B8CE26_THAPS/142-256        AC B8CE26.1
#=GS E2LS14_MONPE/226-343        AC E2LS14.1
#=GS C5DCN2_LACTC/400-582        AC C5DCN2.1
#=GS A8Q8Y1_MALGO/460-812        AC A8Q8Y1.1
#=GS W7PY03_YEASX/588-669        AC W7PY03.1
#=GS I6QLG1_9ORYZ/18-124         AC I6QLG1.1
#=GS C8ZER3_YEAS8/413-603        AC C8ZER3.1
#=GS V9EBH2_PHYPR/398-713        AC V9EBH2.1
#=GS H3EDS5_PRIPA/363-418        AC H3EDS5.1
#=GS G0V7C6_NAUCC/429-619        AC G0V7C6.1
#=GS K3YG88_SETIT/419-677        AC K3YG88.1
#=GS L8G2J8_PSED2/656-981        AC L8G2J8.1
#=GS R0IY55_SETT2/677-1011       AC R0IY55.1
#=GS M7NMI5_PNEMU/497-678        AC M7NMI5.1
#=GS M2XVY5_GALSU/380-713        AC M2XVY5.1
#=GS L0AY32_BABEQ/457-804        AC L0AY32.1
#=GS L8H5V0_ACACA/65-235         AC L8H5V0.1
#=GS W7QUJ8_YEASX/588-669        AC W7QUJ8.1
#=GS H2AM73_KAZAF/419-598        AC H2AM73.1
#=GS W2GGH0_PHYPR/478-566        AC W2GGH0.1
#=GS G3J4C5_CORMM/571-867        AC G3J4C5.1
#=GS G3X1K0_SARHA/1757-1868      AC G3X1K0.1
#=GS T0M9Y4_9CETA/254-339        AC T0M9Y4.1
#=GS M7UQ09_BOTF1/653-978        AC M7UQ09.1
#=GS W0TC11_KLUMA/1625-1733      AC W0TC11.1
#=GS Q23TZ6_TETTS/1910-2057      AC Q23TZ6.1
#=GS F2EAY6_HORVD/345-448        AC F2EAY6.1
#=GS A3LTE6_PICST/658-720        AC A3LTE6.2
#=GS D0NSW6_PHYIT/1777-1878      AC D0NSW6.1
#=GS W9QKL3_9ROSA/1798-1914      AC W9QKL3.1
#=GS M1EHL0_MUSPF/215-489        AC M1EHL0.1
#=GS Q2QNB5_ORYSJ/334-624        AC Q2QNB5.1
#=GS S7MQK8_MYOBR/320-594        AC S7MQK8.1
#=GS G3SCJ8_GORGO/375-460        AC G3SCJ8.1
#=GS I4YC62_WALSC/547-840        AC I4YC62.1
#=GS E2BXK4_HARSA/372-640        AC E2BXK4.1
#=GS Q7JPI2_CAEEL/358-646        AC Q7JPI2.1
#=GS Q013L0_OSTTA/1200-1416      AC Q013L0.1
#=GS J4IAH7_FIBRA/677-812        AC J4IAH7.1
#=GS C5P9D6_COCP7/689-990        AC C5P9D6.1
#=GS F4P9V6_BATDJ/1565-1668      AC F4P9V6.1
#=GS W3VDS0_9BASI/597-890        AC W3VDS0.1
#=GS K4BGJ1_SOLLC/1842-1977      AC K4BGJ1.1
#=GS M0UFL7_HORVD/608-712        AC M0UFL7.1
#=GS Q55SR9_CRYNB/1365-1476      AC Q55SR9.1
#=GS E6R0T7_CRYGW/710-1040       AC E6R0T7.1
#=GS L2GP00_VITCO/275-406        AC L2GP00.1
#=GS W1Q6W8_OGAPD/358-533        AC W1Q6W8.1
#=GS R9NX45_PSEHS/577-874        AC R9NX45.1
#=GS RNA14_YARLI/725-802         AC Q6C8L8.1
#=GS J7S4B5_KAZNA/408-610        AC J7S4B5.1
#=GS T5AMK2_OPHSC/588-680        AC T5AMK2.1
#=GS E1Z556_CHLVA/570-798        AC E1Z556.1
#=GS B6JWT4_SCHJY/530-628        AC B6JWT4.1
#=GS G3T2D0_LOXAF/375-649        AC G3T2D0.1
#=GS Q3TV86_MOUSE/1-225          AC Q3TV86.1
#=GS M0UFL8_HORVD/1718-1820      AC M0UFL8.1
#=GS V9KS57_CALMI/327-545        AC V9KS57.1
#=GS G1P3R1_MYOLU/1732-1875      AC G1P3R1.1
#=GS G1NDI6_MELGA/1760-1869      AC G1NDI6.2
#=GS W7QUJ8_YEASX/413-603        AC W7QUJ8.1
#=GS T1E5D8_CROHD/120-378        AC T1E5D8.1
#=GS D2A3P0_TRICA/372-640        AC D2A3P0.1
#=GS D2VRL2_NAEGR/379-709        AC D2VRL2.1
#=GS D3ZNI3_RAT/1729-1874        AC D3ZNI3.1
#=GS E2AIW6_CAMFO/1257-1396      AC E2AIW6.1
#=GS F6TIH5_HORSE/398-649        AC F6TIH5.1
#=GS F9FT60_FUSOF/598-895        AC F9FT60.1
#=GS G3T1R4_LOXAF/1723-1834      AC G3T1R4.1
#=GS H2AQI7_KAZAF/1610-1715      AC H2AQI7.1
#=GS S4PJR2_9NEOP/99-380         AC S4PJR2.1
#=GS D7KFJ1_ARALL/333-632        AC D7KFJ1.1
#=GS I1E7B7_AMPQE/126-210        AC I1E7B7.1
#=GS M9N3V0_ASHG1/595-658        AC M9N3V0.1
#=GS B9IID8_POPTR/1745-1854      AC B9IID8.2
#=GS E4Y2D9_OIKDI/1-197          AC E4Y2D9.1
#=GS J0XKS0_LOALO/1645-1788      AC J0XKS0.1
#=GS F1P3T9_CHICK/1728-1837      AC F1P3T9.2
#=GS U5DG63_AMBTC/1845-1955      AC U5DG63.1
#=GS Q67V88_ORYSJ/530-661        AC Q67V88.1
#=GS L7M1K9_9ACAR/382-656        AC L7M1K9.1
#=GS M4BV18_HYAAE/400-449        AC M4BV18.1
#=GS S2JZW8_MUCC1/651-1022       AC S2JZW8.1
#=GS R0H2X0_9BRAS/478-627        AC R0H2X0.1
#=GS G2XI62_VERDV/690-780        AC G2XI62.1
#=GS I2FW74_USTH4/1410-1558      AC I2FW74.1
#=GS Q6BFP9_PARTE/1334-1440      AC Q6BFP9.1
#=GS C7YHP7_NECH7/592-888        AC C7YHP7.1
#=GS G3GYX4_CRIGR/375-649        AC G3GYX4.1
#=GS M1AGH1_SOLTU/680-790        AC M1AGH1.1
#=GS S9PT83_SCHOY/387-517        AC S9PT83.1
#=GS A0A022ZUA1_TRIRU/232-329    AC A0A022ZUA1.1
#=GS G8YSE2_PICSO/1605-1711      AC G8YSE2.1
#=GS I3KRH1_ORENI/1594-1738      AC I3KRH1.1
#=GS F8MS02_NEUT8/670-1002       AC F8MS02.1
#=GS G1MRM6_MELGA/376-650        AC G1MRM6.2
#=GS B6H4L7_PENCW/688-990        AC B6H4L7.1
#=GS W6LFZ4_9TRYP/265-553        AC W6LFZ4.1
#=GS M3ZR13_XIPMA/1680-1785      AC M3ZR13.1
#=GS C0S3P0_PARBP/553-632        AC C0S3P0.1
#=GS A0A024TIX6_9STRA/473-582    AC A0A024TIX6.1
#=GS G0V2A0_TRYCI/294-612        AC G0V2A0.1
#=GS F4J8K6_ARATH/1784-1894      AC F4J8K6.1
#=GS S7UI45_TOXGO/116-220        AC S7UI45.1
#=GS F7BFS8_MONDO/375-649        AC F7BFS8.1
#=GS M7Z5X2_TRIUA/186-326        AC M7Z5X2.1
#=GS S8DHY3_9LAMI/1697-1804      AC S8DHY3.1
#=GS B3LLV4_YEAS1/413-603        AC B3LLV4.1
#=GS B5DLV3_DROPS/376-649        AC B5DLV3.1
#=GS W4H1D0_9STRA/404-627        AC W4H1D0.1
#=GS M7T2T2_EUTLA/637-803        AC M7T2T2.1
#=GS W2I9R5_PHYPR/397-714        AC W2I9R5.1
#=GS A0A058Z8S1_9EUKA/458-524    AC A0A058Z8S1.1
#=GS B5VPI8_YEAS6/503-584        AC B5VPI8.1
#=GS G4TIJ4_PIRID/461-796        AC G4TIJ4.1
#=GS B9T015_RICCO/1191-1329      AC B9T015.1
#=GS W4HA31_9STRA/1763-1865      AC W4HA31.1
#=GS M3YZG4_MUSPF/1724-1869      AC M3YZG4.1
#=GS J9IMZ5_9SPIT/1877-2016      AC J9IMZ5.1
#=GS A9UQH8_MONBE/347-621        AC A9UQH8.1
#=GS W5N1N1_LEPOC/1689-1797      AC W5N1N1.1
#=GS J3NEC4_ORYBR/334-622        AC J3NEC4.1
#=GS E4UNN0_ARTGP/677-987        AC E4UNN0.1
#=GS T0QRI9_9STRA/1750-1856      AC T0QRI9.1
#=GS J9G1E8_9SPIT/231-348        AC J9G1E8.1
#=GS A0A024SAN9_HYPJE/599-894    AC A0A024SAN9.1
#=GS M1JJD5_ENCCN/287-479        AC M1JJD5.1
#=GS Q8I3K0_PLAF7/818-1204       AC Q8I3K0.1
#=GS G5AN90_HETGA/367-641        AC G5AN90.1
#=GS K9G716_PEND1/680-982        AC K9G716.1
#=GS R0MC92_NOSB1/171-308        AC R0MC92.1
#=GS I0YN80_9CHLO/347-444        AC I0YN80.1
#=GS G7PQG2_MACFA/375-649        AC G7PQG2.1
#=GS M7XI06_RHOT1/644-947        AC M7XI06.1
#=GS J4I089_FIBRA/495-808        AC J4I089.1
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#=GS J8Q472_SACAR/599-666        AC J8Q472.1
#=GS K1W5Y3_MARBU/659-975        AC K1W5Y3.1
#=GS B9H057_POPTR/357-662        AC B9H057.1
#=GS A0A059LIN7_9CHLO/64-227     AC A0A059LIN7.1
#=GS T1FXR4_HELRO/364-638        AC T1FXR4.1
#=GS M3VYF0_FELCA/1584-1727      AC M3VYF0.1
#=GS D8T1W4_SELML/173-258        AC D8T1W4.1
#=GS RNA14_CANAL/482-789         AC Q5AM44.1
#=GS B6Q5N3_PENMQ/685-987        AC B6Q5N3.1
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