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Database: Pfam
Entry: TFIIA
LinkDB: TFIIA
Original site: TFIIA 
#=GF ID   TFIIA
#=GF AC   PF03153.10
#=GF DE   Transcription factor IIA, alpha/beta subunit
#=GF AU   Mifsud W
#=GF SE   Pfam-B_3542 (release 6.5)
#=GF GA   30.50 30.50;
#=GF TC   30.80 30.50;
#=GF NC   30.40 30.40;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 11927849 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   11089979
#=GF RT   A transcription reinitiation intermediate that is stabilized by
#=GF RT   activator. 
#=GF RA   Yudkovsky N, Ranish JA, Hahn S; 
#=GF RL   Nature 2000;408:225-229.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   8224848
#=GF RT   A single cDNA, hTFIIA/alpha, encodes both the p35 and p19
#=GF RT   subunits of human TFIIA. 
#=GF RA   DeJong J, Roeder RG; 
#=GF RL   Genes Dev 1993;7:2220-2234.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   8610010
#=GF RT   Crystal structure of a yeast TFIIA/TBP/DNA complex. 
#=GF RA   Tan S, Hunziker Y, Sargent DF, Richmond TJ; 
#=GF RL   Nature 1996;381:127-151.
#=GF DR   INTERPRO; IPR004855;
#=GF DR   SCOP; 1nh2; fa;
#=GF CC   Transcription initiation factor IIA (TFIIA) is a heterotrimer,
#=GF CC   the three subunits being known as alpha, beta, and gamma, in
#=GF CC   order of molecular weight. The N and C-terminal domains of the
#=GF CC   gamma subunit are represented in Pfam:PF02268 and Pfam:PF02751,
#=GF CC   respectively. This family represents the precursor that yields
#=GF CC   both the alpha and beta subunits. The TFIIA heterotrimer is an
#=GF CC   essential general transcription initiation factor for the
#=GF CC   expression of genes transcribed by RNA polymerase II. Together
#=GF CC   with TFIID, TFIIA binds to the promoter region; this is the
#=GF CC   first step in the formation of a pre-initiation complex (PIC).
#=GF CC   Binding of the rest of the transcription machinery follows this
#=GF CC   step [1]. After initiation, the PIC does not completely
#=GF CC   dissociate from the promoter. Some components, including TFIIA,
#=GF CC   remain attached and re-initiate a subsequent round of
#=GF CC   transcription.
#=GF SQ   757
#=GS H2NLY7_PONAB/13-270        AC H2NLY7.1
#=GS A0A0A6YYH4_HUMAN/714-1152  AC A0A0A6YYH4.1
#=GS H0ZQ55_TAEGU/242-366       AC H0ZQ55.1
#=GS G8BXN3_TETPH/87-257        AC G8BXN3.1
#=GS G3VCP5_SARHA/13-270        AC G3VCP5.1
#=GS G1SMS4_RABIT/3-261         AC G1SMS4.1
#=GS D2VU95_NAEGR/14-149        AC D2VU95.1
#=GS Q173T9_AEDAE/246-367       AC Q173T9.1
#=GS E4WVB3_OIKDI/14-326        AC E4WVB3.1
#=GS S0DK85_GIBF5/9-400         AC S0DK85.1
#=GS I1HKL8_BRADI/9-400         AC I1HKL8.1
#=GS G2YWZ4_BOTF4/9-456         AC G2YWZ4.1
#=GS K5WYP8_AGABU/9-208         AC K5WYP8.1
#=GS H2NLY7_PONAB/244-376       AC H2NLY7.1
#=GS G8BXN3_TETPH/9-158         AC G8BXN3.1
#=GS O44625_CAEEL/10-354        AC O44625.1
#=GS M5BZD4_THACB/136-318       AC M5BZD4.1
#=GS TF2AA_MOUSE/254-378        AC Q99PM3.2
#=GS I2FRU4_USTH4/63-214        AC I2FRU4.1
#=GS G8YCX1_PICSO/9-138         AC G8YCX1.1
#=GS H2WEG3_CAEJA/25-282        AC H2WEG3.2
#=GS T1ITQ5_STRMM/8-265         AC T1ITQ5.1
#=GS U5GUJ6_POPTR/9-405         AC U5GUJ6.1
#=GS F7AIB5_HORSE/237-366       AC F7AIB5.1
#=GS G1PZQ5_MYOLU/233-371       AC G1PZQ5.1
#=GS D4B0C8_ARTBC/60-448        AC D4B0C8.1
#=GS T1M095_TRIUA/161-322       AC T1M095.1
#=GS F2U4F6_SALR5/427-838       AC F2U4F6.1
#=GS D2VU95_NAEGR/329-486       AC D2VU95.1
#=GS A0A0D2XAR0_FUSO4/9-372     AC A0A0D2XAR0.1
#=GS G0WBE7_NAUDC/93-271        AC G0WBE7.1
#=GS G7PB41_MACFA/235-365       AC G7PB41.1
#=GS C5XZF2_SORBI/9-175         AC C5XZF2.1
#=GS A0A096T940_MAIZE/54-438    AC A0A096T940.1
#=GS H3DGQ9_TETNG/498-960       AC H3DGQ9.1
#=GS Q6CLS6_KLULA/103-229       AC Q6CLS6.1
#=GS A7EK82_SCLS1/202-475       AC A7EK82.1
#=GS F7FZJ9_MACMU/3-470         AC F7FZJ9.1
#=GS G8ZMN6_TORDC/9-126         AC G8ZMN6.1
#=GS Q53S48_HUMAN/714-1182      AC Q53S48.1
#=GS H2AZC9_KAZAF/89-267        AC H2AZC9.1
#=GS G3VCP6_SARHA/1-254         AC G3VCP6.1
#=GS F5HKD6_ANOGA/11-224        AC F5HKD6.1
#=GS G3WQD7_SARHA/84-547        AC G3WQD7.1
#=GS Q5BF64_EMENI/13-419        AC Q5BF64.1
#=GS A0A0A2L4V1_PENIT/9-372     AC A0A0A2L4V1.1
#=GS A0A091CKN0_FUKDA/947-1310  AC A0A091CKN0.1
#=GS M2PD65_CERS8/140-300       AC M2PD65.1
#=GS G3SMZ0_LOXAF/3-261         AC G3SMZ0.1
#=GS E3KFM0_PUCGT/73-189        AC E3KFM0.1
#=GS G3AGR6_SPAPN/125-276       AC G3AGR6.1
#=GS A0A0D2VXE3_CAPO3/85-339    AC A0A0D2VXE3.1
#=GS E3RRM2_PYRTT/9-383         AC E3RRM2.1
#=GS C4R067_PICPG/143-240       AC C4R067.1
#=GS A0A0D1E2R0_USTMA/9-99      AC A0A0D1E2R0.1
#=GS A0A016PEI2_GIBZA/200-413   AC A0A016PEI2.1
#=GS TF2AA_DROME/247-366        AC P52654.2
#=GS M7AK72_CHEMY/121-165       AC M7AK72.1
#=GS G3UTF9_MELGA/260-381       AC G3UTF9.1
#=GS Q74ZW6_ASHGO/79-200        AC Q74ZW6.2
#=GS Q2UL91_ASPOR/9-411         AC Q2UL91.1
#=GS U3K936_FICAL/1-367         AC U3K936.1
#=GS F2SX09_TRIRC/9-429         AC F2SX09.2
#=GS TF2AA_PONAB/245-376        AC Q5RCU0.1
#=GS S6F8C6_ZYGB2/9-164         AC S6F8C6.1
#=GS M7AK72_CHEMY/30-62         AC M7AK72.1
#=GS L0PCC2_PNEJ8/9-234         AC L0PCC2.1
#=GS A0A068Y4V6_ECHMU/507-679   AC A0A068Y4V6.1
#=GS K5W6Z7_PHACS/8-159         AC K5W6Z7.1
#=GS Q4WRX7_ASPFU/9-392         AC Q4WRX7.1
#=GS D8TDN9_SELML/8-147         AC D8TDN9.1
#=GS B4G3W4_DROPE/356-743       AC B4G3W4.1
#=GS R0J2X7_SETT2/9-392         AC R0J2X7.1
#=GS A9ULH8_XENTR/13-472        AC A9ULH8.1
#=GS G3AGR6_SPAPN/9-148         AC G3AGR6.1
#=GS D5GD47_TUBMM/9-373         AC D5GD47.1
#=GS H0Y076_OTOGA/13-271        AC H0Y076.1
#=GS T1FMR7_HELRO/180-311       AC T1FMR7.1
#=GS C9SQY7_VERA1/9-416         AC C9SQY7.1
#=GS F4RJK6_MELLP/9-102         AC F4RJK6.1
#=GS G1NJW3_MELGA/3-260         AC G1NJW3.2
#=GS A0A0D9RMF7_CHLSB/3-471     AC A0A0D9RMF7.1
#=GS M3ZHG4_XIPMA/13-391        AC M3ZHG4.1
#=GS F7E9M9_XENTR/696-1173      AC F7E9M9.1
#=GS G4UB39_NEUT9/9-422         AC G4UB39.1
#=GS W7LVH6_GIBM7/1-301         AC W7LVH6.1
#=GS Q7SG05_NEUCR/9-421         AC Q7SG05.1
#=GS V2YHU3_MONRO/152-310       AC V2YHU3.1
#=GS U1GFG5_ENDPU/40-418        AC U1GFG5.1
#=GS H0EJU5_GLAL7/9-427         AC H0EJU5.1
#=GS A9TAV6_PHYPA/20-400        AC A9TAV6.1
#=GS G8BIA0_CANPC/9-155         AC G8BIA0.1
#=GS A0A0D3ECM8_BRAOL/9-108     AC A0A0D3ECM8.1
#=GS R1GIC5_BOTPV/9-351         AC R1GIC5.1
#=GS J9NWE1_CANFA/29-285        AC J9NWE1.1
#=GS J9EMT5_WUCBA/14-98         AC J9EMT5.1
#=GS A8X6V8_CAEBR/10-353        AC A8X6V8.1
#=GS Q6FP29_CANGA/83-248        AC Q6FP29.1
#=GS T1F3V4_HELRO/18-538        AC T1F3V4.1
#=GS J8LHY9_SACAR/9-165         AC J8LHY9.1
#=GS F6RR58_MACMU/1-122         AC F6RR58.1
#=GS C5M2I7_CANTT/132-268       AC C5M2I7.1
#=GS E4XKT1_OIKDI/21-331        AC E4XKT1.1
#=GS G1KTW8_ANOCA/250-383       AC G1KTW8.1
#=GS M2SNK8_COCH5/9-376         AC M2SNK8.1
#=GS G3R9V5_GORGO/718-1187      AC G3R9V5.1
#=GS N6U0J5_DENPD/13-405        AC N6U0J5.1
#=GS E2B5F4_HARSA/11-367        AC E2B5F4.1
#=GS K1QMJ8_CRAGI/10-187        AC K1QMJ8.1
#=GS W5P392_SHEEP/711-1170      AC W5P392.1
#=GS TF2AY_MOUSE/10-468         AC Q8R4I4.2
#=GS K1QMJ8_CRAGI/177-251       AC K1QMJ8.1
#=GS A0A0D2X5R9_CAPO3/968-1374  AC A0A0D2X5R9.1
#=GS M5G609_DACSP/119-234       AC M5G609.1
#=GS U3KDF4_FICAL/1-231         AC U3KDF4.1
#=GS A0A0A2K4R1_PENEN/9-372     AC A0A0A2K4R1.1
#=GS A0A096T939_MAIZE/54-320    AC A0A096T939.1
#=GS A0A0C4F6M5_PUCT1/9-93      AC A0A0C4F6M5.1
#=GS N1R6N8_FUSC4/9-397         AC N1R6N8.1
#=GS D8TNJ1_VOLCA/2-227         AC D8TNJ1.1
#=GS J6EEP3_SACK1/9-163         AC J6EEP3.1
#=GS H2M4R8_ORYLA/13-52         AC H2M4R8.1
#=GS A0A0D9RGW3_CHLSB/13-270    AC A0A0D9RGW3.1
#=GS A2QAU3_ASPNC/9-362         AC A2QAU3.1
#=GS G8ZMN6_TORDC/77-256        AC G8ZMN6.1
#=GS I3LE29_PIG/1-211           AC I3LE29.1
#=GS Q173T9_AEDAE/11-256        AC Q173T9.1
#=GS H2M5H2_ORYLA/685-1098      AC H2M5H2.1
#=GS F4PU78_DICFS/8-176         AC F4PU78.1
#=GS I2FRU4_USTH4/9-95          AC I2FRU4.1
#=GS W5AEZ9_WHEAT/9-400         AC W5AEZ9.1
#=GS F0XAM5_GROCL/9-429         AC F0XAM5.1
#=GS W5P395_SHEEP/10-380        AC W5P395.1
#=GS B4M009_DROVI/260-379       AC B4M009.1
#=GS M7UWG9_BOTF1/203-455       AC M7UWG9.1
#=GS F1SE01_PIG/1-227           AC F1SE01.1
#=GS A0A0D3ECM8_BRAOL/83-200    AC A0A0D3ECM8.1
#=GS E9GM63_DAPPU/11-218        AC E9GM63.1
#=GS Q93VP4_ARATH/10-375        AC Q93VP4.1
#=GS G1S4M7_NOMLE/255-376       AC G1S4M7.1
#=GS G1RBU4_NOMLE/714-1182      AC G1RBU4.1
#=GS Q4N6S2_THEPA/8-210         AC Q4N6S2.1
#=GS Q01EM7_OSTTA/6-93          AC Q01EM7.2
#=GS G3UTF9_MELGA/13-274        AC G3UTF9.1
#=GS B4G3V6_DROPE/11-165        AC B4G3V6.1
#=GS O49349_ARATH/157-375       AC O49349.1
#=GS Q149E9_MOUSE/216-339       AC Q149E9.1
#=GS M2MQ72_BAUCO/9-386         AC M2MQ72.1
#=GS A0A087ZQ42_APIME/11-384    AC A0A087ZQ42.1
#=GS K1VFN6_TRIAC/91-182        AC K1VFN6.1
#=GS W5FTJ4_WHEAT/6-198         AC W5FTJ4.1
#=GS A2Y2S6_ORYSI/9-394         AC A2Y2S6.1
#=GS H3AU85_LATCH/692-1169      AC H3AU85.1
#=GS G3XRH1_ASPNA/9-386         AC G3XRH1.1
#=GS A0A024NBR3_BRUMA/5-333     AC A0A024NBR3.1
#=GS A8PYE1_MALGO/74-204        AC A8PYE1.1
#=GS H2UFH5_TAKRU/9-457         AC H2UFH5.1
#=GS K7L128_SOYBN/9-145         AC K7L128.1
#=GS M7NPV8_PNEMU/78-263        AC M7NPV8.1
#=GS B4JV51_DROGR/383-459       AC B4JV51.1
#=GS B2AAN0_PODAN/9-47          AC B2AAN0.1
#=GS M7YTB1_TRIUA/165-288       AC M7YTB1.1
#=GS S8AFN3_DACHA/9-223         AC S8AFN3.1
#=GS T1FUL8_HELRO/9-310         AC T1FUL8.1
#=GS M5BZD4_THACB/9-155         AC M5BZD4.1
#=GS M3WZ85_FELCA/13-271        AC M3WZ85.1
#=GS F1MII0_BOVIN/248-378       AC F1MII0.2
#=GS TF2AA_DICDI/6-164          AC Q54G80.1
#=GS Q149E9_MOUSE/1-233         AC Q149E9.1
#=GS M7BG15_CHEMY/4-181         AC M7BG15.1
#=GS F9WW52_ZYMTI/1-72          AC F9WW52.1
#=GS V4KXV2_EUTSA/10-375        AC V4KXV2.1
#=GS G0WBE7_NAUDC/9-170         AC G0WBE7.1
#=GS Q5AFC5_CANAL/120-275       AC Q5AFC5.1
#=GS B3SC95_TRIAD/104-199       AC B3SC95.1
#=GS A0A091CN07_FUKDA/10-475    AC A0A091CN07.1
#=GS B4JRU7_DROGR/11-260        AC B4JRU7.1
#=GS S7W4U3_SPRLO/77-149        AC S7W4U3.1
#=GS I3LE29_PIG/193-317         AC I3LE29.1
#=GS C4YIW1_CANAW/21-390        AC C4YIW1.1
#=GS K7VU39_MAIZE/53-209        AC K7VU39.1
#=GS A1CNY5_ASPCL/9-402         AC A1CNY5.1
#=GS W5FKA5_WHEAT/9-113         AC W5FKA5.1
#=GS K9G6F8_PEND2/9-371         AC K9G6F8.1
#=GS J3KNC0_HUMAN/13-57         AC J3KNC0.1
#=GS A4RSS9_OSTLU/68-182        AC A4RSS9.1
#=GS F4RJK6_MELLP/74-187        AC F4RJK6.1
#=GS Q6CCD2_YARLI/135-249       AC Q6CCD2.1
#=GS G4MXK1_MAGO7/9-407         AC G4MXK1.1
#=GS J8LHY9_SACAR/143-280       AC J8LHY9.1
#=GS W1NIB6_AMBTC/3-178         AC W1NIB6.1
#=GS A7TGI8_VANPO/82-297        AC A7TGI8.1
#=GS H3CWE9_TETNG/244-340       AC H3CWE9.1
#=GS TF2AA_HUMAN/244-376        AC P52655.1
#=GS U9UN52_RHIID/200-293       AC U9UN52.1
#=GS A0A0A6YYG5_HUMAN/714-785   AC A0A0A6YYG5.1
#=GS D3B0V3_POLPA/497-586       AC D3B0V3.1
#=GS Q0D044_ASPTN/9-45          AC Q0D044.1
#=GS F1PJI5_CANFA/13-269        AC F1PJI5.2
#=GS H6C149_EXODN/9-382         AC H6C149.1
#=GS C4R067_PICPG/9-155         AC C4R067.1
#=GS G0VCF8_NAUCC/109-241       AC G0VCF8.1
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#=GS A0A087GC33_ARAAL/97-200    AC A0A087GC33.1
#=GS A0A068XHT0_HYMMI/6-380     AC A0A068XHT0.1
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#=GS B0W689_CULQU/1-304         AC B0W689.1
#=GS M0S9A6_MUSAM/29-413        AC M0S9A6.1
#=GS F6UIY2_XENTR/453-633       AC F6UIY2.1
#=GS S8FU20_FOMPI/23-207        AC S8FU20.1
#=GS K0KDX5_WICCF/83-207        AC K0KDX5.1
#=GS M1CZK8_SOLTU/189-358       AC M1CZK8.1
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#=GS U5HEN4_USTV1/94-210        AC U5HEN4.1
#=GS D8QBP9_SCHCM/219-303       AC D8QBP9.1
#=GS G1PWG1_MYOLU/15-274        AC G1PWG1.1
#=GS L2FR89_COLGN/9-367         AC L2FR89.1
#=GS H2UFH4_TAKRU/9-458         AC H2UFH4.1
#=GS A0A096NRB8_PAPAN/244-376   AC A0A096NRB8.1
#=GS G3VCP6_SARHA/229-360       AC G3VCP6.1
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#=GS G0SCR3_CHATD/9-392         AC G0SCR3.1
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#=GS Q5AFC5_CANAL/9-148         AC Q5AFC5.1
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#=GS A0A068Y7P5_ECHMU/487-659   AC A0A068Y7P5.1
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