GenomeNet

Database: Pfam
Entry: TRAP_alpha
LinkDB: TRAP_alpha
Original site: TRAP_alpha 
#=GF ID   TRAP_alpha
#=GF AC   PF03896.11
#=GF DE   Translocon-associated protein (TRAP), alpha subunit
#=GF PI   TRAP-alpha; 
#=GF AU   Finn RD
#=GF SE   DOMO:DM07004;
#=GF GA   23.10 23.10;
#=GF TC   23.10 23.40;
#=GF NC   22.90 23.00;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 23193494 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   8050590
#=GF RT   The N-terminal region of the alpha-subunit of the TRAP complex
#=GF RT   has a conserved cluster of negative charges. 
#=GF RA   Hartmann E, Prehn S; 
#=GF RL   FEBS Lett 1994;349:324-326.
#=GF DR   INTERPRO; IPR005595;
#=GF CC   The alpha-subunit of the TRAP complex (TRAP alpha) is a
#=GF CC   single-spanning membrane protein of the endoplasmic reticulum
#=GF CC   (ER) which is found in proximity of nascent polypeptide chains
#=GF CC   translocating across the membrane [1].
#=GF SQ   349
#=GS H2VMG0_CAEJA/13-257   AC H2VMG0.1
#=GS SSRA_HUMAN/1-285      AC P43307.3
#=GS C9J5W0_HUMAN/1-266    AC C9J5W0.1
#=GS G3HD93_CRIGR/378-554  AC G3HD93.1
#=GS C9S8H8_VERA1/29-257   AC C9S8H8.1
#=GS I0YXY9_9CHLO/32-238   AC I0YXY9.1
#=GS F1RW78_PIG/1-281      AC F1RW78.1
#=GS H3BGU6_LATCH/2-292    AC H3BGU6.1
#=GS D4D9W4_TRIVH/19-267   AC D4D9W4.1
#=GS H2T6V2_TAKRU/2-288    AC H2T6V2.1
#=GS G1MXQ0_MELGA/1-271    AC G1MXQ0.2
#=GS Q4TI46_TETNG/1-53     AC Q4TI46.1
#=GS H2LDF6_ORYLA/2-293    AC H2LDF6.1
#=GS I1BM71_RHIO9/18-232   AC I1BM71.1
#=GS B0XHD0_CULQU/32-90    AC B0XHD0.1
#=GS C9J3L8_HUMAN/1-245    AC C9J3L8.1
#=GS F2S9J8_TRIT1/22-263   AC F2S9J8.1
#=GS Q7ZYA9_XENLA/8-292    AC Q7ZYA9.1
#=GS B2L4S2_XENBO/1-32     AC B2L4S2.1
#=GS B4IDH0_DROSE/1-302    AC B4IDH0.1
#=GS B6T2R5_MAIZE/5-257    AC B6T2R5.1
#=GS Q9W335_DROME/1-302    AC Q9W335.1
#=GS B0X5A8_CULQU/12-114   AC B0X5A8.1
#=GS C1H7B3_PARBA/28-273   AC C1H7B3.1
#=GS Q52PE3_MOUSE/1-290    AC Q52PE3.1
#=GS SSRA_RABIT/1-285      AC P53815.1
#=GS Q6DCM6_XENLA/1-290    AC Q6DCM6.1
#=GS E9DG93_COCPS/16-265   AC E9DG93.1
#=GS G4MU14_MAGO7/94-267   AC G4MU14.1
#=GS F5H5Y2_HUMAN/64-258   AC F5H5Y2.1
#=GS F6UGG4_MACMU/1-285    AC F6UGG4.1
#=GS G3N4Y1_GASAC/4-294    AC G3N4Y1.1
#=GS B9EL33_SALSA/2-289    AC B9EL33.1
#=GS B0XUX8_ASPFC/21-261   AC B0XUX8.1
#=GS Q4SR92_TETNG/42-326   AC Q4SR92.1
#=GS F7VTW7_SORMK/19-270   AC F7VTW7.1
#=GS Q1K756_NEUCR/18-270   AC Q1K756.1
#=GS H2Y3G0_CIOIN/2-98     AC H2Y3G0.1
#=GS B2W6X2_PYRTR/15-223   AC B2W6X2.1
#=GS E4XE25_OIKDI/7-252    AC E4XE25.1
#=GS A8JE83_CHLRE/30-244   AC A8JE83.1
#=GS C9JBX5_HUMAN/92-217   AC C9JBX5.1
#=GS G3N5I3_GASAC/2-285    AC G3N5I3.1
#=GS E3N4T0_CAERE/15-257   AC E3N4T0.1
#=GS A9TM35_PHYPA/95-297   AC A9TM35.1
#=GS E0VLV3_PEDHC/1-283    AC E0VLV3.1
#=GS C1FZ84_PARBD/31-272   AC C1FZ84.1
#=GS D3PIC4_9MAXI/22-269   AC D3PIC4.1
#=GS H2S1R8_TAKRU/1-297    AC H2S1R8.1
#=GS G9NF31_HYPAI/1-259    AC G9NF31.1
#=GS Q4SVV5_TETNG/1-36     AC Q4SVV5.1
#=GS F7HEV2_CALJA/1-285    AC F7HEV2.1
#=GS Q4V7D1_RAT/1-286      AC Q4V7D1.1
#=GS E3RTJ6_PYRTT/20-223   AC E3RTJ6.1
#=GS F0J928_AMBVA/1-170    AC F0J928.1
#=GS Q4T5B3_TETNG/1-53     AC Q4T5B3.1
#=GS H3CM16_TETNG/1-72     AC H3CM16.1
#=GS Q0CVF2_ASPTN/23-254   AC Q0CVF2.1
#=GS B0X0C1_CULQU/91-199   AC B0X0C1.1
#=GS E3WJH0_ANODA/1-285    AC E3WJH0.1
#=GS F1L661_ASCSU/8-271    AC F1L661.1
#=GS E5SK10_TRISP/21-293   AC E5SK10.1
#=GS B0X999_CULQU/121-201  AC B0X999.1
#=GS C5FJY9_ARTOC/15-267   AC C5FJY9.1
#=GS A5BQP3_VITVI/3-253    AC A5BQP3.1
#=GS SSRA_MOUSE/1-285      AC Q9CY50.1
#=GS B0X9A1_CULQU/45-185   AC B0X9A1.1
#=GS G3Q4J2_GASAC/1-131    AC G3Q4J2.1
#=GS I1FMY5_AMPQE/5-305    AC I1FMY5.1
#=GS E9EF03_METAQ/16-269   AC E9EF03.1
#=GS D2H0R2_AILME/1-203    AC D2H0R2.1
#=GS C1MKU5_MICPC/21-247   AC C1MKU5.1
#=GS H3CCE2_TETNG/1-149    AC H3CCE2.1
#=GS H3AWY8_LATCH/4-294    AC H3AWY8.1
#=GS A9PFV9_POPTR/1-256    AC A9PFV9.1
#=GS C0S4R4_PARBP/22-263   AC C0S4R4.1
#=GS B6HJ89_PENCW/23-260   AC B6HJ89.1
#=GS Q5BY57_SCHJA/19-141   AC Q5BY57.1
#=GS H0YVS5_TAEGU/1-263    AC H0YVS5.1
#=GS G3NAE9_GASAC/1-262    AC G3NAE9.1
#=GS H5ZVU9_KRYMA/1-66     AC H5ZVU9.1
#=GS B9HRA7_POPTR/4-256    AC B9HRA7.1
#=GS B0XLR7_CULQU/60-218   AC B0XLR7.1
#=GS G3NAP7_GASAC/3-268    AC G3NAP7.1
#=GS SSRA_PONAB/1-290      AC Q5R4X4.1
#=GS B2R6N9_HUMAN/1-285    AC B2R6N9.1
#=GS E9IFB5_SOLIN/5-195    AC E9IFB5.1
#=GS B4FE49_MAIZE/6-257    AC B4FE49.1
#=GS G3NAG4_GASAC/1-259    AC G3NAG4.1
#=GS I1RTB1_GIBZE/16-264   AC I1RTB1.1
#=GS B4JIP8_DROGR/1-303    AC B4JIP8.1
#=GS G0UPN3_TRYCI/9-271    AC G0UPN3.1
#=GS D4B415_ARTBC/17-267   AC D4B415.1
#=GS H3C7H5_TETNG/1-85     AC H3C7H5.1
#=GS H2LDF7_ORYLA/2-282    AC H2LDF7.1
#=GS G1MGA8_AILME/1-225    AC G1MGA8.1
#=GS E9BFN2_LEIDB/4-282    AC E9BFN2.1
#=GS Q4T9K6_TETNG/2-315    AC Q4T9K6.1
#=GS D3ZI03_RAT/1-291      AC D3ZI03.1
#=GS Q4TFU2_TETNG/101-160  AC Q4TFU2.1
#=GS H6BKF6_EXODN/17-262   AC H6BKF6.1
#=GS B8N5X6_ASPFN/21-261   AC B8N5X6.1
#=GS H9F8Y4_MACMU/1-274    AC H9F8Y4.1
#=GS B7QCV8_IXOSC/1-198    AC B7QCV8.1
#=GS B5M728_AMBAM/1-162    AC B5M728.1
#=GS G1PYP9_MYOLU/1-286    AC G1PYP9.1
#=GS H9K9B3_APIME/1-275    AC H9K9B3.1
#=GS Q8LC49_ARATH/1-258    AC Q8LC49.1
#=GS F2PSB1_TRIEC/27-267   AC F2PSB1.1
#=GS Q4T532_TETNG/1-53     AC Q4T532.1
#=GS H1V8N1_COLHI/17-266   AC H1V8N1.1
#=GS I1GX20_BRADI/7-253    AC I1GX20.1
#=GS B3NT65_DROER/1-302    AC B3NT65.1
#=GS G3VJL8_SARHA/14-289   AC G3VJL8.1
#=GS F2CQ15_HORVD/3-252    AC F2CQ15.1
#=GS D8M0C8_BLAHO/9-209    AC D8M0C8.1
#=GS E4UNM5_ARTGP/19-267   AC E4UNM5.1
#=GS Q6NVB4_XENTR/1-290    AC Q6NVB4.1
#=GS G0RV33_HYPJQ/18-262   AC G0RV33.1
#=GS Q4JI32_ICTPU/2-161    AC Q4JI32.1
#=GS H0XAT7_OTOGA/1-290    AC H0XAT7.1
#=GS F2SRQ0_TRIRC/15-267   AC F2SRQ0.1
#=GS B0WVI8_CULQU/85-172   AC B0WVI8.1
#=GS H2LDG0_ORYLA/58-216   AC H2LDG0.1
#=GS E3UKP9_9NEOP/1-279    AC E3UKP9.1
#=GS F7I3K0_CALJA/1-65     AC F7I3K0.1
#=GS I1Q5A4_ORYGL/5-257    AC I1Q5A4.1
#=GS D3TQU9_GLOMM/1-298    AC D3TQU9.1
#=GS C3XUB3_BRAFL/1-215    AC C3XUB3.1
#=GS G3PM94_GASAC/3-284    AC G3PM94.1
#=GS Q5ZM63_CHICK/1-287    AC Q5ZM63.1
#=GS G1SWH9_RABIT/1-290    AC G1SWH9.1
#=GS C5Z1V6_SORBI/4-257    AC C5Z1V6.1
#=GS B0XG27_CULQU/88-181   AC B0XG27.1
#=GS F4QAX9_DICFS/19-234   AC F4QAX9.1
#=GS B0X0C1_CULQU/42-95    AC B0X0C1.1
#=GS F7CMD2_ORNAN/1-220    AC F7CMD2.1
#=GS A6SHT1_BOTFB/16-235   AC A6SHT1.1
#=GS Q6PGS0_XENLA/1-285    AC Q6PGS0.1
#=GS G3UCI3_LOXAF/1-290    AC G3UCI3.1
#=GS E1Z8H5_CHLVA/18-204   AC E1Z8H5.1
#=GS Q86FE2_SCHJA/19-253   AC Q86FE2.1
#=GS B3RVF4_TRIAD/21-292   AC B3RVF4.1
#=GS B0X0K8_CULQU/3-108    AC B0X0K8.1
#=GS Q2F5L0_BOMMO/1-279    AC Q2F5L0.1
#=GS Q95XT5_CAEEL/15-257   AC Q95XT5.1
#=GS E9F3N3_METAR/19-270   AC E9F3N3.1
#=GS G5DZH3_9PIPI/1-273    AC G5DZH3.1
#=GS E7D147_LATHE/1-298    AC E7D147.1
#=GS E1FPP3_LOALO/41-302   AC E1FPP3.1
#=GS D7L7L9_ARALL/5-251    AC D7L7L9.1
#=GS SSRA_RAT/1-279        AC Q7TPJ0.1
#=GS Q4TFJ9_TETNG/1-41     AC Q4TFJ9.1
#=GS H3CPB7_TETNG/2-286    AC H3CPB7.1
#=GS H3CFV9_TETNG/1-72     AC H3CFV9.1
#=GS E2QRZ8_CANFA/1-290    AC E2QRZ8.1
#=GS H2QS94_PANTR/1-290    AC H2QS94.1
#=GS F4WNI3_ACREC/3-260    AC F4WNI3.1
#=GS F9X4S9_MYCGM/16-271   AC F9X4S9.1
#=GS B6U444_MAIZE/1-257    AC B6U444.1
#=GS A9TEN3_PHYPA/19-275   AC A9TEN3.1
#=GS B4PWX0_DROYA/1-302    AC B4PWX0.1
#=GS C4WSI8_ACYPI/6-271    AC C4WSI8.1
#=GS G7XX54_ASPKW/20-262   AC G7XX54.1
#=GS G3NAF2_GASAC/2-284    AC G3NAF2.1
#=GS F1P4F4_CHICK/1-287    AC F1P4F4.1
#=GS C7YTK1_NECH7/20-265   AC C7YTK1.1
#=GS Q019P2_OSTTA/16-177   AC Q019P2.1
#=GS F0UBI6_AJEC8/28-262   AC F0UBI6.1
#=GS B0WHB6_CULQU/11-62    AC B0WHB6.1
#=GS Q6AWS7_ARATH/18-251   AC Q6AWS7.1
#=GS Q4TJ24_TETNG/1-79     AC Q4TJ24.1
#=GS C0NWI9_AJECG/29-262   AC C0NWI9.1
#=GS F6UGF5_MACMU/1-66     AC F6UGF5.1
#=GS Q5Z9P6_ORYSJ/6-257    AC Q5Z9P6.1
#=GS F5HAN4_CRYNB/6-228    AC F5HAN4.1
#=GS A9TAL2_PHYPA/27-274   AC A9TAL2.1
#=GS D8UBG5_VOLCA/25-244   AC D8UBG5.1
#=GS C9ZSE4_TRYB9/5-266    AC C9ZSE4.1
#=GS F2UB70_SALS5/1-259    AC F2UB70.1
#=GS G7JPK6_MEDTR/18-256   AC G7JPK6.1
#=GS F7CMD8_ORNAN/1-227    AC F7CMD8.1
#=GS G7MQI4_MACMU/1-290    AC G7MQI4.1
#=GS I1BIU2_RHIO9/23-232   AC I1BIU2.1
#=GS G2YWN1_BOTF4/16-235   AC G2YWN1.1
#=GS G6CKX9_DANPL/1-280    AC G6CKX9.1
#=GS B3N070_DROAN/1-302    AC B3N070.1
#=GS F6ZH62_CALJA/1-290    AC F6ZH62.1
#=GS G3N5V9_GASAC/1-261    AC G3N5V9.1
#=GS C6T7K0_SOYBN/13-258   AC C6T7K0.1
#=GS A9P9I6_POPTR/4-256    AC A9P9I6.1
#=GS Q29ID3_DROPS/1-302    AC Q29ID3.1
#=GS Q4TFU2_TETNG/1-99     AC Q4TFU2.1
#=GS D6WHE5_TRICA/1-287    AC D6WHE5.1
#=GS G3NAE4_GASAC/1-122    AC G3NAE4.1
#=GS A8C1W9_MOUSE/1-105    AC A8C1W9.1
#=GS G0TY20_TRYVI/26-264   AC G0TY20.1
#=GS B2B532_PODAN/15-269   AC B2B532.1
#=GS F0ZRI4_DICPU/17-230   AC F0ZRI4.1
#=GS F4IGI4_ARATH/1-187    AC F4IGI4.1
#=GS A2R632_ASPNC/19-262   AC A2R632.1
#=GS F5H5Y2_HUMAN/1-67     AC F5H5Y2.1
#=GS B8MQ01_TALSN/23-250   AC B8MQ01.1
#=GS H0VS01_CAVPO/1-290    AC H0VS01.1
#=GS Q4QBX0_LEIMA/2-282    AC Q4QBX0.1
#=GS G3N5I2_GASAC/2-294    AC G3N5I2.1
#=GS E5SZ79_TRISP/8-278    AC E5SZ79.1
#=GS I1FMY4_AMPQE/5-201    AC I1FMY4.1
#=GS H2T6V3_TAKRU/2-294    AC H2T6V3.1
#=GS C9JY01_HUMAN/1-103    AC C9JY01.1
#=GS F1QR23_DANRE/1-271    AC F1QR23.1
#=GS G2XDV3_VERDV/29-257   AC G2XDV3.1
#=GS C6HBS2_AJECH/28-262   AC C6HBS2.1
#=GS Q4TJC2_TETNG/1-35     AC Q4TJC2.1
#=GS H2PHV1_PONAB/1-285    AC H2PHV1.1
#=GS SSRA_ONCMY/2-287      AC P45433.1
#=GS F6PS54_MONDO/1-281    AC F6PS54.1
#=GS D3PFR7_9MAXI/22-269   AC D3PFR7.1
#=GS A1C7U9_ASPCL/21-261   AC A1C7U9.1
#=GS H2S1R9_TAKRU/1-295    AC H2S1R9.1
#=GS E2B9X6_HARSA/1-283    AC E2B9X6.1
#=GS B0XC02_CULQU/154-216  AC B0XC02.1
#=GS H2LDG0_ORYLA/2-60     AC H2LDG0.1
#=GS H3CBY0_TETNG/1-290    AC H3CBY0.1
#=GS A9V874_MONBE/1-241    AC A9V874.1
#=GS B9STC6_RICCO/4-260    AC B9STC6.1
#=GS Q5KPI7_CRYNJ/6-228    AC Q5KPI7.1
#=GS G1TU86_RABIT/1-290    AC G1TU86.1
#=GS G1RLH8_NOMLE/1-285    AC G1RLH8.1
#=GS G1MG98_AILME/1-291    AC G1MG98.1
#=GS A8QCC2_BRUMA/1-253    AC A8QCC2.1
#=GS G3N5W8_GASAC/4-294    AC G3N5W8.1
#=GS F7I3K0_CALJA/62-256   AC F7I3K0.1
#=GS Q57XQ5_TRYB2/4-266    AC Q57XQ5.1
#=GS Q28EA7_XENTR/1-285    AC Q28EA7.1
#=GS G7P4D0_MACFA/1-290    AC G7P4D0.1
#=GS G3N4Y0_GASAC/1-261    AC G3N4Y0.1
#=GS G5BAT1_HETGA/1-200    AC G5BAT1.1
#=GS E9HCM9_DAPPU/4-293    AC E9HCM9.1
#=GS G3RQC7_GORGO/1-285    AC G3RQC7.1
#=GS H9HGD6_ATTCE/2-240    AC H9HGD6.1
#=GS Q4TFM0_TETNG/1-53     AC Q4TFM0.1
#=GS A8WWG0_CAEBR/17-257   AC A8WWG0.1
#=GS A7EUM5_SCLS1/103-235  AC A7EUM5.1
#=GS D3TQU8_GLOMM/1-282    AC D3TQU8.1
#=GS B0XC02_CULQU/212-273  AC B0XC02.1
#=GS G4UEN3_NEUT9/18-270   AC G4UEN3.1
#=GS H3IGE7_STRPU/1-254    AC H3IGE7.1
#=GS A6MLD3_CALJA/1-47     AC A6MLD3.1
#=GS B4L8F1_DROMO/1-302    AC B4L8F1.1
#=GS E9AVK9_LEIMU/5-282    AC E9AVK9.1
#=GS F7CIZ7_XENTR/8-292    AC F7CIZ7.1
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