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Database: Pfam
Entry: TrwB_AAD_bind
LinkDB: TrwB_AAD_bind
Original site: TrwB_AAD_bind 
#=GF ID   TrwB_AAD_bind
#=GF AC   PF10412.8
#=GF DE   Type IV secretion-system coupling protein DNA-binding domain
#=GF AU   Finn RD, Coggill PC
#=GF SE   Gene3D, pdb_1e9r
#=GF GA   20.50 20.50;
#=GF TC   20.50 20.50;
#=GF NC   20.40 20.40;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 26740544 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF RN   [1]
#=GF RM   11214325
#=GF RT   The bacterial conjugation protein TrwB resembles ring helicases
#=GF RT   and F1-ATPase. 
#=GF RA   Gomis-Ruth FX, Moncalian G, Perez-Luque R, Gonzalez A, Cabezon
#=GF RA   E, de la Cruz F, Coll M; 
#=GF RL   Nature. 2001;409:637-641.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   11748238
#=GF RT   Conjugative plasmid protein TrwB, an integral membrane type IV
#=GF RT   secretion system coupling protein. Detailed structural features
#=GF RT   and mapping of the active site cleft. 
#=GF RA   Gomis-Ruth FX, Moncalian G, de la Cruz F, Coll M; 
#=GF RL   J Biol Chem. 2002;277:7556-7566.
#=GF DR   INTERPRO; IPR019476;
#=GF CC   The plasmid conjugative coupling protein TrwB forms hexamers
#=GF CC   from six structurally very similar protomers [1]. This hexamer
#=GF CC   contains a central channel running from the cytosolic pole (made
#=GF CC   up by the AADs) to the membrane pole ending at the transmembrane
#=GF CC   pore shaped by 12 transmembrane helices, rendering an overall
#=GF CC   mushroom-like structure. The TrwB_AAD (all-alpha domain) domain
#=GF CC   appears to be the DNA-binding domain of the structure. TrwB, a
#=GF CC   basic integral inner-membrane nucleoside-triphosphate-binding
#=GF CC   protein, is the structural prototype for the type IV secretion
#=GF CC   system coupling proteins, a family of proteins essential for
#=GF CC   macromolecular transport between cells and export [2].
#=GF SQ   1294
#=GS D4KCS6_9FIRM/208-394      AC D4KCS6.1
#=GS G8NT31_GRAMM/223-591      AC G8NT31.1
#=GS A0A0F3M775_ORITS/2-251    AC A0A0F3M775.1
#=GS D0Z534_PHODD/173-568      AC D0Z534.1
#=GS A0A0G1TNF2_9BACT/576-740  AC A0A0G1TNF2.1
#=GS A0A0F3MBC1_ORITS/87-469   AC A0A0F3MBC1.1
#=GS A0A0F3PKG5_ORITS/125-312  AC A0A0F3PKG5.1
#=GS A0A0G0IT25_9BACT/48-378   AC A0A0G0IT25.1
#=GS A4XE63_NOVAD/225-611      AC A4XE63.1
#=GS A0A078L5E6_9CHLA/166-549  AC A0A078L5E6.1
#=GS R6XPG3_9FIRM/66-133       AC R6XPG3.1
#=GS A0A0F3RCH6_ORITS/2-168    AC A0A0F3RCH6.1
#=GS A0A0G1NN93_9BACT/21-354   AC A0A0G1NN93.1
#=GS A0A0G0NF63_9BACT/389-724  AC A0A0G0NF63.1
#=GS A0A0G1RG98_9BACT/18-361   AC A0A0G1RG98.1
#=GS A0A0W0SLA7_9GAMM/168-557  AC A0A0W0SLA7.1
#=GS A0A0G1AYM2_9BACT/17-168   AC A0A0G1AYM2.1
#=GS A0A102D5G2_9SPHN/225-617  AC A0A102D5G2.1
#=GS A0A0G0TSJ7_9BACT/22-352   AC A0A0G0TSJ7.1
#=GS A0A011P3Y6_9PROT/153-346  AC A0A011P3Y6.1
#=GS A0A127CRI2_9RHIZ/123-517  AC A0A127CRI2.1
#=GS A0A060UTU0_9PROT/119-488  AC A0A060UTU0.1
#=GS B4WW43_SYNS7/1-244        AC B4WW43.1
#=GS A0A0F3M4Y0_ORITS/1-204    AC A0A0F3M4Y0.1
#=GS A0A0P7AB29_9SPHN/197-583  AC A0A0P7AB29.1
#=GS A8LTZ6_DINSH/432-517      AC A8LTZ6.1
#=GS A0A0F3M8J7_ORITS/1-247    AC A0A0F3M8J7.1
#=GS A0A0G1TDW5_9BACT/73-425   AC A0A0G1TDW5.1
#=GS J2DEY8_KLEPN/171-561      AC J2DEY8.1
#=GS A0A074M7H5_ERYLO/170-562  AC A0A074M7H5.1
#=GS A0A059ETJ7_9MICR/261-525  AC A0A059ETJ7.1
#=GS A0A0G1HI06_9BACT/28-178   AC A0A0G1HI06.1
#=GS T0Z5V5_9BACT/99-500       AC T0Z5V5.1
#=GS A0A0F3NSM5_ORITS/1-46     AC A0A0F3NSM5.1
#=GS A0A0P1IQS6_9RHOB/436-520  AC A0A0P1IQS6.1
#=GS A0A0F3M579_ORITS/2-126    AC A0A0F3M579.1
#=GS K9VS07_9CYAN/127-530      AC K9VS07.1
#=GS A0A0G1NN54_9BACT/19-348   AC A0A0G1NN54.1
#=GS A0A0G0Y5L0_9BACT/365-470  AC A0A0G0Y5L0.1
#=GS A0A0G1KTD7_9BACT/333-665  AC A0A0G1KTD7.1
#=GS A0A0F3NTH2_ORITS/179-261  AC A0A0F3NTH2.1
#=GS A0A0G1TE08_9BACT/429-803  AC A0A0G1TE08.1
#=GS A0A0F3NR64_ORITS/6-168    AC A0A0F3NR64.1
#=GS W1S0I1_9SPHN/224-610      AC W1S0I1.1
#=GS A3VKX4_9RHOB/440-525      AC A3VKX4.1
#=GS A0A0F3MF62_ORITS/1-46     AC A0A0F3MF62.1
#=GS A0A127FCK4_9GAMM/495-540  AC A0A127FCK4.1
#=GS A0A149VX41_9PROT/128-191  AC A0A149VX41.1
#=GS A0A0G1T6U6_9BACT/24-200   AC A0A0G1T6U6.1
#=GS A0A0A0E8P7_9RHOB/436-521  AC A0A0A0E8P7.1
#=GS A0A0M3ALR1_9SPHN/430-480  AC A0A0M3ALR1.1
#=GS A0A0G0T3L8_9BACT/315-649  AC A0A0G0T3L8.1
#=GS A0A0G0IT89_9BACT/48-376   AC A0A0G0IT89.1
#=GS A0A0G0MXI9_9BACT/411-781  AC A0A0G0MXI9.1
#=GS A0A0G0C5C5_9BACT/48-375   AC A0A0G0C5C5.1
#=GS A0A126RH04_9SPHN/224-610  AC A0A126RH04.1
#=GS D4ILC3_9BACT/227-470      AC D4ILC3.1
#=GS W8L8H3_HALHR/177-237      AC W8L8H3.1
#=GS A0A109CY21_9BURK/131-523  AC A0A109CY21.1
#=GS A0A0G1CC05_9BACT/23-361   AC A0A0G1CC05.1
#=GS A0A0G1WGP4_9BACT/29-356   AC A0A0G1WGP4.1
#=GS A0A0P1EPF7_9RHOB/436-521  AC A0A0P1EPF7.1
#=GS V7Q0P3_9BACT/495-565      AC V7Q0P3.1
#=GS A0A136LZM2_9BACT/168-521  AC A0A136LZM2.1
#=GS N1MI85_9SPHN/224-610      AC N1MI85.1
#=GS A0A0F3RHW3_ORITS/158-412  AC A0A0F3RHW3.1
#=GS C0ZY02_RHOE4/316-384      AC C0ZY02.1
#=GS A0A101HLZ3_9BACT/248-591  AC A0A101HLZ3.1
#=GS A0A0G1J8L0_9BACT/359-702  AC A0A0G1J8L0.1
#=GS C1F5K1_ACIC5/216-586      AC C1F5K1.1
#=GS A9MS47_SALAR/134-190      AC A9MS47.1
#=GS A0A0W0ZAE4_9GAMM/116-285  AC A0A0W0ZAE4.1
#=GS I3C1P2_9FLAO/192-477      AC I3C1P2.1
#=GS A5CC23_ORITB/180-562      AC A5CC23.1
#=GS L0JTW1_NATP1/101-447      AC L0JTW1.1
#=GS K9WNY2_9CYAN/223-494      AC K9WNY2.1
#=GS A0A0G0FP31_9BACT/403-752  AC A0A0G0FP31.1
#=GS E1VKQ8_9GAMM/179-241      AC E1VKQ8.1
#=GS A0A0G1FET9_9BACT/23-365   AC A0A0G1FET9.1
#=GS A0A0F3M4Y6_ORITS/1-66     AC A0A0F3M4Y6.1
#=GS A0A1A6C6T0_9GAMM/16-395   AC A0A1A6C6T0.1
#=GS I3Y948_THIV6/139-332      AC I3Y948.1
#=GS A0A0F0LXH1_9MICO/295-636  AC A0A0F0LXH1.1
#=GS B4EWU2_PROMH/146-374      AC B4EWU2.1
#=GS Q93GL8_SALTY/171-561      AC Q93GL8.1
#=GS U9VXF5_9CYAN/159-527      AC U9VXF5.1
#=GS C6I064_9BACT/112-316      AC C6I064.1
#=GS D4EA28_SEROD/171-561      AC D4EA28.1
#=GS A0A013VF28_9SPHN/70-453   AC A0A013VF28.1
#=GS A0A0F5PBL1_9SPHN/224-610  AC A0A0F5PBL1.1
#=GS B1X2H9_CYAA5/267-532      AC B1X2H9.1
#=GS B2FKA6_STRMK/166-525      AC B2FKA6.1
#=GS A1SFG1_NOCSJ/316-395      AC A1SFG1.1
#=GS A0A0G0FW36_9BACT/400-496  AC A0A0G0FW36.1
#=GS A0A0G0NXD2_9BACT/405-740  AC A0A0G0NXD2.1
#=GS A0A0G1UB49_9BACT/365-459  AC A0A0G1UB49.1
#=GS A0A0G1AWT0_9BACT/22-353   AC A0A0G1AWT0.1
#=GS A0A0F9ZBH3_9BACT/315-651  AC A0A0F9ZBH3.1
#=GS A0A0Q9YIW2_9COXI/168-553  AC A0A0Q9YIW2.1
#=GS A0A0D1P8T2_BRAEL/154-513  AC A0A0D1P8T2.1
#=GS A0A0G1BGN0_9BACT/26-361   AC A0A0G1BGN0.1
#=GS A0A0W0RZF4_9GAMM/168-557  AC A0A0W0RZF4.1
#=GS A0A0G1UKK9_9BACT/15-355   AC A0A0G1UKK9.1
#=GS A0A0G1XRH5_9BACT/16-353   AC A0A0G1XRH5.1
#=GS C2W8G4_BACCE/37-402       AC C2W8G4.1
#=GS A0A0S8KQL6_9BACT/397-736  AC A0A0S8KQL6.1
#=GS A0A0Q9PWP5_9GAMM/143-533  AC A0A0Q9PWP5.1
#=GS A0A0Q5ZE12_9BRAD/159-527  AC A0A0Q5ZE12.1
#=GS A0A0G0YWJ1_9BACT/507-576  AC A0A0G0YWJ1.1
#=GS A0A0G1BAZ6_9BACT/2-266    AC A0A0G1BAZ6.1
#=GS K9V1T9_9CYAN/255-522      AC K9V1T9.1
#=GS A0A0G0D627_9BACT/25-360   AC A0A0G0D627.1
#=GS A5KTH3_9BACT/412-490      AC A5KTH3.1
#=GS A0A0C1Q412_9ACTN/377-556  AC A0A0C1Q412.1
#=GS A0A0G0JXH6_9BACT/329-660  AC A0A0G0JXH6.1
#=GS A0A0C1YCN8_9CYAN/95-481   AC A0A0C1YCN8.1
#=GS A0A0G1CD13_9BACT/329-503  AC A0A0G1CD13.1
#=GS I0ILY2_LEPFC/14-411       AC I0ILY2.1
#=GS A0A0G1M8C7_9BACT/225-621  AC A0A0G1M8C7.1
#=GS A0A0G1ES60_9BACT/383-471  AC A0A0G1ES60.1
#=GS A0A168VAC6_9ENTR/171-561  AC A0A168VAC6.1
#=GS A0A0G0XPG0_9BACT/17-168   AC A0A0G0XPG0.1
#=GS G2JBM9_9BURK/157-280      AC G2JBM9.1
#=GS A0A0W0WRR6_9GAMM/168-535  AC A0A0W0WRR6.1
#=GS F4QG01_9CAUL/246-637      AC F4QG01.1
#=GS A0A0F3NY13_ORITS/39-379   AC A0A0F3NY13.1
#=GS A0A0G1UZ30_9BACT/361-707  AC A0A0G1UZ30.1
#=GS A0A0G1EYR4_9BACT/16-355   AC A0A0G1EYR4.1
#=GS A0A098GBG9_9GAMM/176-569  AC A0A098GBG9.1
#=GS A0A0G0XSY1_9BACT/19-358   AC A0A0G0XSY1.1
#=GS E0ULT5_CYAP2/264-513      AC E0ULT5.1
#=GS A0A0G0C4T3_9BACT/416-753  AC A0A0G0C4T3.1
#=GS A0A0G0DM03_9BACT/20-375   AC A0A0G0DM03.1
#=GS A0A0G0RNA9_9BACT/19-363   AC A0A0G0RNA9.1
#=GS A0A0A0ST29_9VIBR/181-578  AC A0A0A0ST29.1
#=GS I1AYY7_9RHOB/436-521      AC I1AYY7.1
#=GS A0A0G0FMT1_9BACT/48-387   AC A0A0G0FMT1.1
#=GS A0A0F3QNP8_ORITS/35-97    AC A0A0F3QNP8.1
#=GS A0A0G1VAD0_9BACT/383-722  AC A0A0G1VAD0.1
#=GS A0A0G1LFQ8_9BACT/336-665  AC A0A0G1LFQ8.1
#=GS A0A127FAE2_9GAMM/1-162    AC A0A127FAE2.1
#=GS D8JCS4_HALJB/31-378       AC D8JCS4.1
#=GS A0A0F3MB62_ORITS/40-422   AC A0A0F3MB62.1
#=GS A0A126RVL0_9SPHN/225-611  AC A0A126RVL0.1
#=GS F9UAG9_9GAMM/140-308      AC F9UAG9.1
#=GS A4V7C3_PSEFS/22-100       AC A4V7C3.1
#=GS A0A0F3NQX0_ORITS/1-313    AC A0A0F3NQX0.1
#=GS A5KS53_9BACT/180-258      AC A5KS53.1
#=GS A0A0G1NHP8_9BACT/241-577  AC A0A0G1NHP8.1
#=GS A0A0F3PD83_ORITS/17-88    AC A0A0F3PD83.1
#=GS A5CEI1_ORITB/63-288       AC A5CEI1.1
#=GS A0A0P8A4L1_9SPHN/224-613  AC A0A0P8A4L1.1
#=GS A0A0G0K1B5_9BACT/371-708  AC A0A0G0K1B5.1
#=GS A0A0A7LQ56_9BACT/420-507  AC A0A0A7LQ56.1
#=GS A0A0F3NQT9_ORITS/16-398   AC A0A0F3NQT9.1
#=GS A0A0G1XPG6_9BACT/368-703  AC A0A0G1XPG6.1
#=GS A0A0G1X2T8_9BACT/368-703  AC A0A0G1X2T8.1
#=GS D8J9Y4_HALJB/67-147       AC D8J9Y4.1
#=GS A0A077C4K0_9RICK/198-584  AC A0A077C4K0.1
#=GS A0A0T5NP44_9RHOB/114-199  AC A0A0T5NP44.1
#=GS R5LFP8_9CLOT/369-569      AC R5LFP8.1
#=GS A0A0G1U3L1_9BACT/362-696  AC A0A0G1U3L1.1
#=GS A0A0G1RQ13_9BACT/17-348   AC A0A0G1RQ13.1
#=GS Q8ZSH1_NOSS1/130-524      AC Q8ZSH1.1
#=GS U9VVD8_9CYAN/164-543      AC U9VVD8.1
#=GS A0A0M3AP66_9SPHN/225-611  AC A0A0M3AP66.1
#=GS Q5V7P5_HALMA/133-500      AC Q5V7P5.1
#=GS Q30Q33_SULDN/95-423       AC Q30Q33.1
#=GS A0A0G0UAF4_9BACT/359-718  AC A0A0G0UAF4.1
#=GS Q11ZH3_POLSJ/474-623      AC Q11ZH3.1
#=GS A0A0W0VIT3_9GAMM/173-319  AC A0A0W0VIT3.1
#=GS B4WVQ4_SYNS7/328-503      AC B4WVQ4.1
#=GS U2ZXJ1_9SPHN/172-554      AC U2ZXJ1.1
#=GS A0A077ECR7_9FLAO/151-542  AC A0A077ECR7.1
#=GS A0A0G0RSU6_9BACT/363-723  AC A0A0G0RSU6.1
#=GS A4J2S8_DESRM/186-383      AC A4J2S8.1
#=GS A0A0G0C8S5_9BACT/465-818  AC A0A0G0C8S5.1
#=GS F8L2X3_SIMNZ/192-577      AC F8L2X3.1
#=GS A0A0G0ZWT4_9BACT/30-387   AC A0A0G0ZWT4.1
#=GS A0A0G1KFX9_9BACT/350-427  AC A0A0G1KFX9.1
#=GS R5XWY7_9FIRM/43-443       AC R5XWY7.1
#=GS A0A011PT26_9PROT/153-344  AC A0A011PT26.1
#=GS L1NSJ8_9FLAO/276-593      AC L1NSJ8.1
#=GS A0A0G0KDL1_9BACT/22-365   AC A0A0G0KDL1.1
#=GS A0A0L0LHG1_9BACT/18-353   AC A0A0L0LHG1.1
#=GS A0A0G0B381_9BACT/17-353   AC A0A0G0B381.1
#=GS A0A0G0VGS6_9BACT/363-719  AC A0A0G0VGS6.1
#=GS A0A0W1DK16_9SPHN/220-606  AC A0A0W1DK16.1
#=GS A0A0G1VFN7_9BACT/53-393   AC A0A0G1VFN7.1
#=GS A0A0G0XTU8_9BACT/29-318   AC A0A0G0XTU8.1
#=GS A0A0N0JIS0_9SPHN/171-563  AC A0A0N0JIS0.1
#=GS A0A0G0LJS6_9BACT/48-387   AC A0A0G0LJS6.1
#=GS R7F8G4_9CLOT/317-511      AC R7F8G4.1
#=GS A0A166R0A7_9RHOB/436-521  AC A0A166R0A7.1
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#=GS A0A0J5T3E5_9RHOB/432-517  AC A0A0J5T3E5.1
#=GS B7ADX8_BACEV/101-464      AC B7ADX8.1
#=GS A0A0D6KII1_9CYAN/261-527  AC A0A0D6KII1.1
#=GS L0JT23_NATP1/114-192      AC L0JT23.1
#=GS A0A0Q5R7N5_9SPHN/163-556  AC A0A0Q5R7N5.1
#=GS W1DLY7_KLEPN/122-294      AC W1DLY7.1
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