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Database: Pfam
Entry: TrwB_AAD_bind
LinkDB: TrwB_AAD_bind
Original site: TrwB_AAD_bind 
#=GF ID   TrwB_AAD_bind
#=GF AC   PF10412.6
#=GF DE   Type IV secretion-system coupling protein DNA-binding domain
#=GF AU   Finn RD, Coggill PC
#=GF SE   Gene3D, pdb_1e9r
#=GF GA   20.50 20.50;
#=GF TC   20.50 20.50;
#=GF NC   20.40 20.40;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 11927849 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF RN   [1]
#=GF RM   11214325
#=GF RT   The bacterial conjugation protein TrwB resembles ring helicases
#=GF RT   and F1-ATPase. 
#=GF RA   Gomis-Ruth FX, Moncalian G, Perez-Luque R, Gonzalez A, Cabezon
#=GF RA   E, de la Cruz F, Coll M; 
#=GF RL   Nature. 2001;409:637-641.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   11748238
#=GF RT   Conjugative plasmid protein TrwB, an integral membrane type IV
#=GF RT   secretion system coupling protein. Detailed structural features
#=GF RT   and mapping of the active site cleft. 
#=GF RA   Gomis-Ruth FX, Moncalian G, de la Cruz F, Coll M; 
#=GF RL   J Biol Chem. 2002;277:7556-7566.
#=GF DR   INTERPRO; IPR019476;
#=GF CC   The plasmid conjugative coupling protein TrwB forms hexamers
#=GF CC   from six structurally very similar protomers [1]. This hexamer
#=GF CC   contains a central channel running from the cytosolic pole (made
#=GF CC   up by the AADs) to the membrane pole ending at the transmembrane
#=GF CC   pore shaped by 12 transmembrane helices, rendering an overall
#=GF CC   mushroom-like structure. The TrwB_AAD (all-alpha domain) domain
#=GF CC   appears to be the DNA-binding domain of the structure. TrwB, a
#=GF CC   basic integral inner-membrane nucleoside-triphosphate-binding
#=GF CC   protein, is the structural prototype for the type IV secretion
#=GF CC   system coupling proteins, a family of proteins essential for
#=GF CC   macromolecular transport between cells and export [2].
#=GF SQ   304
#=GS D4KCS6_9FIRM/208-394      AC D4KCS6.1
#=GS E1QSN0_VULDI/44-117       AC E1QSN0.1
#=GS A5G187_ACICJ/169-562      AC A5G187.1
#=GS G8NT31_GRAMM/223-591      AC G8NT31.1
#=GS A0A060HPN6_9ARCH/51-384   AC A0A060HPN6.1
#=GS Q2N5L1_ERYLH/177-563      AC Q2N5L1.1
#=GS K9ZS43_ANACC/225-331      AC K9ZS43.1
#=GS R7D0B9_9BACE/108-471      AC R7D0B9.1
#=GS A8L0V1_FRASN/421-550      AC A8L0V1.1
#=GS A4XE63_NOVAD/225-611      AC A4XE63.1
#=GS E8X7G8_GRATM/221-596      AC E8X7G8.1
#=GS G4T445_META2/175-239      AC G4T445.1
#=GS R6XPG3_9FIRM/66-133       AC R6XPG3.1
#=GS F6CG73_LACKZ/291-529      AC F6CG73.1
#=GS C7QG99_CATAD/428-558      AC C7QG99.1
#=GS A5CDG3_ORITB/4-295        AC A5CDG3.1
#=GS K9SPD1_9CYAN/171-526      AC K9SPD1.1
#=GS I1YID7_METFJ/173-234      AC I1YID7.1
#=GS C1F5Q5_ACIC5/214-586      AC C1F5Q5.1
#=GS A0A0A7PU69_9SPHN/220-606  AC A0A0A7PU69.1
#=GS A9I2I0_BORPD/117-518      AC A9I2I0.1
#=GS G8MQL8_9BURK/135-519      AC G8MQL8.1
#=GS M9RFT3_9RHOB/22-350       AC M9RFT3.1
#=GS W0LE18_9ENTR/175-237      AC W0LE18.1
#=GS A8LTZ6_DINSH/432-517      AC A8LTZ6.1
#=GS V5RUP3_9BACT/410-488      AC V5RUP3.1
#=GS K9Y133_STAC7/259-518      AC K9Y133.1
#=GS A5N4W3_CLOK5/128-290      AC A5N4W3.1
#=GS K9V0I8_9CYAN/123-513      AC K9V0I8.1
#=GS Q8YKS8_NOSS1/106-495      AC Q8YKS8.1
#=GS B4EQJ7_BURCJ/170-553      AC B4EQJ7.1
#=GS A0A037UJ45_SPIME/122-176  AC A0A037UJ45.1
#=GS A0A0D5VER4_9BURK/161-546  AC A0A0D5VER4.1
#=GS K9VS07_9CYAN/127-530      AC K9VS07.1
#=GS D3VGK3_XENNA/25-137       AC D3VGK3.1
#=GS H1Y3U9_9SPHI/195-586      AC H1Y3U9.1
#=GS E4NHN8_KITSK/272-355      AC E4NHN8.1
#=GS A5FU76_ACICJ/175-586      AC A5FU76.1
#=GS I1YFM3_METFJ/146-370      AC I1YFM3.1
#=GS A5CEG6_ORITB/63-358       AC A5CEG6.1
#=GS R2QEM2_9ENTE/305-645      AC R2QEM2.1
#=GS E0UNS9_CYAP2/118-519      AC E0UNS9.1
#=GS D4ILC3_9BACT/227-470      AC D4ILC3.1
#=GS B0RB09_CLAMS/35-399       AC B0RB09.1
#=GS W8L8H3_HALHR/177-237      AC W8L8H3.1
#=GS A0A098GDL7_TATMI/172-337  AC A0A098GDL7.1
#=GS A5CEK8_ORITB/63-358       AC A5CEK8.1
#=GS A0A068QPA9_9ENTR/174-228  AC A0A068QPA9.1
#=GS Q5HXP8_GLUOX/122-316      AC Q5HXP8.1
#=GS K9ZPV0_ANACC/105-499      AC K9ZPV0.1
#=GS Q2G6A0_NOVAD/197-587      AC Q2G6A0.1
#=GS A5VGB7_SPHWW/225-611      AC A5VGB7.1
#=GS E8V193_TERSS/221-593      AC E8V193.1
#=GS C6RJZ5_ACIRA/113-492      AC C6RJZ5.1
#=GS C0ZY02_RHOE4/316-384      AC C0ZY02.1
#=GS F9ZQR7_ACICS/123-291      AC F9ZQR7.1
#=GS C1F5K1_ACIC5/216-586      AC C1F5K1.1
#=GS G0A594_METMM/174-239      AC G0A594.1
#=GS A0A077ZG65_TRITR/171-561  AC A0A077ZG65.1
#=GS A0A085BQY4_9RHOB/436-521  AC A0A085BQY4.1
#=GS K0IN77_NITGG/51-384       AC K0IN77.1
#=GS A5CC23_ORITB/180-562      AC A5CC23.1
#=GS C7PYS7_CATAD/395-475      AC C7PYS7.1
#=GS L0JTW1_NATP1/101-447      AC L0JTW1.1
#=GS K9WNY2_9CYAN/223-494      AC K9WNY2.1
#=GS E1VKQ8_9GAMM/179-241      AC E1VKQ8.1
#=GS F9ZL90_ACICS/129-533      AC F9ZL90.1
#=GS I3Y948_THIV6/139-332      AC I3Y948.1
#=GS B4EWU2_PROMH/146-374      AC B4EWU2.1
#=GS Q93GL8_SALTY/171-561      AC Q93GL8.1
#=GS B1X2H9_CYAA5/267-532      AC B1X2H9.1
#=GS B2FKA6_STRMK/166-525      AC B2FKA6.1
#=GS A1SFG1_NOCSJ/316-395      AC A1SFG1.1
#=GS Q3SI88_THIDA/148-568      AC Q3SI88.1
#=GS H6URM9_PROSM/163-341      AC H6URM9.1
#=GS Q6LW78_PHOPR/172-565      AC Q6LW78.1
#=GS A0A052IX34_9BORD/190-587  AC A0A052IX34.1
#=GS A4JHA9_BURVG/153-538      AC A4JHA9.1
#=GS K9RH70_9CYAN/233-525      AC K9RH70.1
#=GS B2UKE6_RALPJ/377-556      AC B2UKE6.1
#=GS K9V1T9_9CYAN/255-522      AC K9V1T9.1
#=GS U5QEE3_9CYAN/69-463       AC U5QEE3.1
#=GS Q5LU34_RUEPO/244-358      AC Q5LU34.1
#=GS A0A098G750_9GAMM/172-335  AC A0A098G750.1
#=GS E5AVY3_BURRH/170-553      AC E5AVY3.1
#=GS E6WKX3_PANSA/179-568      AC E6WKX3.1
#=GS K9VTW2_9CYAN/132-530      AC K9VTW2.1
#=GS Q18F70_HALWD/30-423       AC Q18F70.1
#=GS C5A9B0_BURGB/173-576      AC C5A9B0.2
#=GS Q21BL2_RHOPB/152-546      AC Q21BL2.1
#=GS A0A098G8C8_9GAMM/168-554  AC A0A098G8C8.1
#=GS N6X717_9RHOO/159-318      AC N6X717.1
#=GS M4SJE5_9SPHN/197-583      AC M4SJE5.1
#=GS I0ILY2_LEPFC/14-411       AC I0ILY2.1
#=GS D8MK71_ERWBE/178-567      AC D8MK71.1
#=GS A4AE33_9GAMM/173-234      AC A4AE33.2
#=GS A0A068QTB5_9ENTR/174-228  AC A0A068QTB5.1
#=GS D3S2Z0_FERPA/134-488      AC D3S2Z0.1
#=GS K9XAE1_9NOST/103-499      AC K9XAE1.1
#=GS A0A098GBG9_9GAMM/176-569  AC A0A098GBG9.1
#=GS A5VG55_SPHWW/224-610      AC A5VG55.1
#=GS W0JD31_9BACT/52-476       AC W0JD31.1
#=GS W0BF53_9GAMM/168-557      AC W0BF53.1
#=GS L0IV82_MYCSM/304-612      AC L0IV82.1
#=GS E0ULT5_CYAP2/264-513      AC E0ULT5.1
#=GS A0A0D5YST9_9FLAO/46-419   AC A0A0D5YST9.1
#=GS B1I2W3_DESAP/148-350      AC B1I2W3.1
#=GS K9X8E1_9NOST/126-520      AC K9X8E1.1
#=GS A0A0A0ST29_9VIBR/181-578  AC A0A0A0ST29.1
#=GS E8UYL4_TERSS/216-586      AC E8UYL4.1
#=GS K9RXI4_SYNP3/219-321      AC K9RXI4.1
#=GS B7KK02_CYAP7/98-490       AC B7KK02.1
#=GS K9ZQV8_ANACC/127-522      AC K9ZQV8.1
#=GS A4JFK6_BURVG/115-522      AC A4JFK6.1
#=GS R6WC71_9FIRM/39-192       AC R6WC71.1
#=GS D3V0L4_XENBS/174-229      AC D3V0L4.1
#=GS K9XLQ9_9CHRO/147-541      AC K9XLQ9.1
#=GS Q5ZTT3_LEGPH/169-555      AC Q5ZTT3.1
#=GS A0A0A1BAX5_9ENTR/112-491  AC A0A0A1BAX5.1
#=GS H1YI43_9SPHI/196-588      AC H1YI43.1
#=GS D1BL71_VEIPT/185-581      AC D1BL71.1
#=GS D8JCS4_HALJB/31-378       AC D8JCS4.1
#=GS D3VA19_XENNA/174-228      AC D3VA19.1
#=GS C5ANN5_BURGB/170-555      AC C5ANN5.1
#=GS A4V7C3_PSEFS/22-100       AC A4V7C3.1
#=GS F6IHS6_9SPHN/172-555      AC F6IHS6.1
#=GS A5CEI1_ORITB/63-288       AC A5CEI1.1
#=GS A0A098GCM8_9GAMM/168-554  AC A0A098GCM8.1
#=GS W0ADI4_9SPHN/172-553      AC W0ADI4.1
#=GS A0A0A7LQ56_9BACT/420-507  AC A0A0A7LQ56.1
#=GS A0A0A7A4I0_SHIDY/13-403   AC A0A0A7A4I0.1
#=GS A0A0A7PKG8_9SPHN/172-554  AC A0A0A7PKG8.1
#=GS D8J9Y4_HALJB/67-147       AC D8J9Y4.1
#=GS Q7NIZ2_GLOVI/75-462       AC Q7NIZ2.1
#=GS A0A077C4K0_9RICK/198-584  AC A0A077C4K0.1
#=GS W8VV88_9FLAO/28-395       AC W8VV88.1
#=GS K9UDE0_9CHRO/227-314      AC K9UDE0.1
#=GS R7L2Y2_9CLOT/224-448      AC R7L2Y2.1
#=GS R5LFP8_9CLOT/369-569      AC R5LFP8.1
#=GS A0A077FNN7_9RICK/184-560  AC A0A077FNN7.1
#=GS B2JAH2_NOSP7/112-517      AC B2JAH2.1
#=GS K9UPY3_9CHRO/381-566      AC K9UPY3.1
#=GS Q8ZSH1_NOSS1/130-524      AC Q8ZSH1.1
#=GS A5CDJ3_ORITB/4-295        AC A5CDJ3.1
#=GS Q5V7P5_HALMA/133-500      AC Q5V7P5.1
#=GS C5ANZ2_BURGB/170-555      AC C5ANZ2.1
#=GS Q30Q33_SULDN/95-423       AC Q30Q33.1
#=GS E0UD75_CYAP2/99-491       AC E0UD75.1
#=GS Q0BRZ2_GRABC/171-503      AC Q0BRZ2.1
#=GS Q11ZH3_POLSJ/474-623      AC Q11ZH3.1
#=GS S1R099_9ENTE/129-224      AC S1R099.1
#=GS Q2NBK7_ERYLH/197-583      AC Q2NBK7.1
#=GS A0A077ECR7_9FLAO/151-542  AC A0A077ECR7.1
#=GS A4J2S8_DESRM/186-383      AC A4J2S8.1
#=GS F8L2X3_SIMNZ/192-577      AC F8L2X3.1
#=GS U3U483_9ENTR/61-121       AC U3U483.1
#=GS R5XWY7_9FIRM/43-443       AC R5XWY7.1
#=GS N0B4E6_9RHIZ/19-356       AC N0B4E6.1
#=GS D7BUD0_STRBB/405-493      AC D7BUD0.1
#=GS K7SLJ6_GLUOY/170-563      AC K7SLJ6.1
#=GS A0A072TEQ0_MEDTR/181-569  AC A0A072TEQ0.1
#=GS G8MLC6_9BURK/146-533      AC G8MLC6.1
#=GS L0JT23_NATP1/114-192      AC L0JT23.1
#=GS D5BLY3_ZUNPS/62-348       AC D5BLY3.1
#=GS B7KKD2_CYAP7/98-490       AC B7KKD2.1
#=GS D3HTT7_LEGLN/176-569      AC D3HTT7.1
#=GS E0TAY8_PARBH/184-568      AC E0TAY8.1
#=GS B9LVJ7_HALLT/104-183      AC B9LVJ7.1
#=GS R7F8G4_9CLOT/317-511      AC R7F8G4.1
#=GS Q3SHV9_THIDA/122-505      AC Q3SHV9.1
#=GS A0A077EMP6_9FLAO/109-502  AC A0A077EMP6.1
#=GS R4PNG8_9BACT/397-740      AC R4PNG8.1
#=GS A0A073CAA8_PLAAG/122-517  AC A0A073CAA8.1
#=GS B1X2X9_CYAA5/240-346      AC B1X2X9.1
#=GS R5DZI7_9BURK/104-289      AC R5DZI7.1
#=GS A0A0A7PPW0_9SPHN/170-562  AC A0A0A7PPW0.1
#=GS G0IV15_CYCMS/202-591      AC G0IV15.1
#=GS Q1GN15_RUEST/436-521      AC Q1GN15.1
#=GS A7HPV4_PARL1/142-380      AC A7HPV4.1
#=GS A5V2N2_SPHWW/189-575      AC A5V2N2.1
#=GS D3VAD3_XENNA/174-228      AC D3VAD3.1
#=GS D4KCS6_9FIRM/29-202       AC D4KCS6.1
#=GS A0A023P099_9GAMM/119-511  AC A0A023P099.1
#=GS D4Z205_SPHJU/172-553      AC D4Z205.1
#=GS J9ZBJ1_LEPFM/145-551      AC J9ZBJ1.1
#=GS A0A077EDW4_9FLAO/151-544  AC A0A077EDW4.1
#=GS B2VB35_ERWT9/178-564      AC B2VB35.1
#=GS D4H0C4_HALVD/423-495      AC D4H0C4.1
#=GS D3V4C6_XENBS/176-228      AC D3V4C6.1
#=GS R6WC71_9FIRM/213-392      AC R6WC71.1
#=GS A0A0B4Y4Y2_9PROT/5-238    AC A0A0B4Y4Y2.1
#=GS Q1GQ75_SPHAL/169-561      AC Q1GQ75.1
#=GS F2LRX9_BURGS/170-557      AC F2LRX9.1
#=GS G2MQF0_9ARCH/104-183      AC G2MQF0.1
#=GS A0RVG1_CENSY/41-406       AC A0RVG1.1
#=GS Q8YKT5_NOSS1/717-829      AC Q8YKT5.1
#=GS R5JA02_9FIRM/3-317        AC R5JA02.1
#=GS A0A0A7PBD9_9SPHN/172-554  AC A0A0A7PBD9.1
#=GS F4F5S6_VERMA/404-496      AC F4F5S6.1
#=GS T1ZG09_STRIT/129-224      AC T1ZG09.1
#=GS E0UMH3_CYAP2/180-584      AC E0UMH3.1
#=GS K7SP20_GLUOY/117-173      AC K7SP20.1
#=GS Q3JDE5_NITOC/173-234      AC Q3JDE5.1
#=GS B2IZY7_NOSP7/110-505      AC B2IZY7.1
#=GS A6KYZ6_BACV8/100-465      AC A6KYZ6.1
#=GS B2JBL5_NOSP7/229-495      AC B2JBL5.1
#=GS D4GVZ4_HALVD/32-382       AC D4GVZ4.1
#=GS A0A085BZL7_9RHOB/432-517  AC A0A085BZL7.1
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