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Database: Pfam
Entry: Ycf1
LinkDB: Ycf1
Original site: Ycf1 
#=GF ID   Ycf1
#=GF AC   PF05758.8
#=GF DE   Ycf1
#=GF AU   Bateman A
#=GF SE   Pfam-B_6040 (release 8.0)
#=GF GA   27.00 27.00;
#=GF TC   28.00 27.00;
#=GF NC   26.40 26.40;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 80369284 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   10792825
#=GF RT   The two largest chloroplast genome-encoded open reading frames
#=GF RT   of higher plants are essential genes. 
#=GF RA   Drescher A, Ruf S, Calsa T Jr, Carrer H, Bock R; 
#=GF RL   Plant J 2000;22:97-104.
#=GF DR   INTERPRO; IPR008896;
#=GF CC   The chloroplast genomes of most higher plants contain two giant
#=GF CC   open reading frames designated ycf1 and ycf2. Although the
#=GF CC   function of Ycf1 is unknown, it is known to be an essential gene
#=GF CC   [1].
#=GF SQ   3092
#=GS V5QGV7_9ASTR/21-276       AC V5QGV7.1
#=GS V5QGV7_9ASTR/270-515      AC V5QGV7.1
#=GS T1WWV2_9ERIC/21-943       AC T1WWV2.1
#=GS K4D777_SOLLC/3-78         AC K4D777.1
#=GS U3R7C3_IPOTF/17-561       AC U3R7C3.1
#=GS H2F5U0_9ASPA/210-999      AC H2F5U0.1
#=GS G8J4Z1_9SPER/112-249      AC G8J4Z1.1
#=GS U5G870_POPTR/1-47         AC U5G870.1
#=GS G0YDY3_9ROSI/21-264       AC G0YDY3.1
#=GS U3R7E3_IPONI/556-641      AC U3R7E3.1
#=GS W8NJE3_9ROSI/21-975       AC W8NJE3.1
#=GS C0LIX5_9MAGN/1-159        AC C0LIX5.1
#=GS G8IUA8_9SPER/21-269       AC G8IUA8.1
#=GS I3VJ26_9CARY/1-275        AC I3VJ26.1
#=GS V5QG36_9ASTR/503-849      AC V5QG36.1
#=GS U3R8V4_9ASTE/542-630      AC U3R8V4.1
#=GS G0YDQ7_9ROSI/21-336       AC G0YDQ7.1
#=GS S4TIJ8_9SPER/296-597      AC S4TIJ8.1
#=GS C0K686_9ASPA/3-351        AC C0K686.1
#=GS C0K4W9_9ASPA/3-354        AC C0K4W9.1
#=GS T1QLY6_EUCDE/21-942       AC T1QLY6.1
#=GS X2D3S0_9SPER/801-1102     AC X2D3S0.1
#=GS C0K5J8_9ASPA/3-355        AC C0K5J8.1
#=GS U3R498_IPOSE/749-1025     AC U3R498.1
#=GS D3WDB3_9MAGN/21-971       AC D3WDB3.1
#=GS C0K575_9ASPA/3-354        AC C0K575.1
#=GS L7P3E7_9ARAE/1-238        AC L7P3E7.1
#=GS U3R5Q2_9ASTE/17-566       AC U3R5Q2.1
#=GS D3WAY5_AUCJA/21-954       AC D3WAY5.1
#=GS G0YE11_9MAGN/514-913      AC G0YE11.1
#=GS R4L5R9_9SPER/823-1175     AC R4L5R9.1
#=GS C0K636_9ASPA/3-352        AC C0K636.1
#=GS YCF1_CHAGL/25-220         AC Q8M9T2.1
#=GS I3VJ37_9CARY/1-256        AC I3VJ37.1
#=GS U3PYE4_9LAMI/1-614        AC U3PYE4.1
#=GS S4TIA8_PINAT/1-123        AC S4TIA8.1
#=GS C0K5T4_9ASPA/3-356        AC C0K5T4.1
#=GS U5LR83_9LILI/305-904      AC U5LR83.1
#=GS F8TP28_9LAMI/2-623        AC F8TP28.1
#=GS U3R216_9ASTE/555-645      AC U3R216.1
#=GS M1JXK6_9LILI/306-920      AC M1JXK6.1
#=GS YCF1_PHYPA/25-247         AC Q6YXP5.1
#=GS S4TKP2_9SPER/1-123        AC S4TKP2.1
#=GS G0YDZ0_9MAGN/29-262       AC G0YDZ0.1
#=GS E3T2X4_EQUAR/587-905      AC E3T2X4.1
#=GS S4TK34_9SPER/1-123        AC S4TK34.1
#=GS S4TKN2_PINPO/297-597      AC S4TKN2.1
#=GS S4TII5_PINCU/295-597      AC S4TII5.1
#=GS G0YDP3_STACO/21-312       AC G0YDP3.1
#=GS L0BDQ2_9ASPA/1-296        AC L0BDQ2.1
#=GS YCF1_PELHO/13-378         AC Q06FP6.1
#=GS V9PE31_9LILI/21-956       AC V9PE31.1
#=GS H2F5U5_9ASPA/261-889      AC H2F5U5.1
#=GS U3R3Q3_IPOPC/529-615      AC U3R3Q3.1
#=GS I1WZC1_9LAMI/1-627        AC I1WZC1.1
#=GS F8TNZ3_MELOI/1-626        AC F8TNZ3.1
#=GS G3XFB1_9SPER/289-570      AC G3XFB1.1
#=GS F8TNS5_9LAMI/1-623        AC F8TNS5.1
#=GS C0K6A8_9ASPA/3-354        AC C0K6A8.1
#=GS L0BCK9_9ASPA/1-296        AC L0BCK9.1
#=GS A0A023I2K2_VICFA/21-284   AC A0A023I2K2.1
#=GS C0K563_9ASPA/3-354        AC C0K563.1
#=GS D3WDP7_CORFO/21-579       AC D3WDP7.1
#=GS F6I9B0_OLEEU/21-562       AC F6I9B0.1
#=GS U3R765_9ASTE/634-966      AC U3R765.1
#=GS V5QKR4_9ASTR/503-849      AC V5QKR4.1
#=GS F2W5A9_9ERIC/21-260       AC F2W5A9.1
#=GS L0BE97_LYCRD/1-296        AC L0BE97.1
#=GS I3VJ33_9CARY/1-257        AC I3VJ33.1
#=GS K4D767_SOLLC/21-67        AC K4D767.1
#=GS G8IWJ5_PINPO/643-944      AC G8IWJ5.1
#=GS Q9B1V1_9MAGN/2-167        AC Q9B1V1.1
#=GS L0BEP6_9ASPA/1-296        AC L0BEP6.1
#=GS U3R6C7_9ASTE/17-572       AC U3R6C7.1
#=GS R9ZT85_9FABA/305-917      AC R9ZT85.1
#=GS G8IYL3_9SPER/448-648      AC G8IYL3.1
#=GS U3PXM0_9LAMI/1-625        AC U3PXM0.1
#=GS S4TII4_PINAT/1-123        AC S4TII4.1
#=GS A0A022RTL7_MIMGU/332-626  AC A0A022RTL7.1
#=GS F1AMN1_GOSTH/22-944       AC F1AMN1.1
#=GS C0K5X9_9ASPA/3-360        AC C0K5X9.1
#=GS H2F5T7_9ASPA/278-904      AC H2F5T7.1
#=GS C0K577_9ASPA/3-354        AC C0K577.1
#=GS K4D0A4_SOLLC/1-142        AC K4D0A4.1
#=GS C0K5H5_9ASPA/3-346        AC C0K5H5.1
#=GS A0A023I0H1_9ROSI/22-172   AC A0A023I0H1.1
#=GS YCF1_CERDE/21-946         AC A8SEG5.1
#=GS H6T9N8_9CARY/339-466      AC H6T9N8.1
#=GS C0K660_9ASPA/3-354        AC C0K660.1
#=GS U3R024_IPOTF/721-1057     AC U3R024.1
#=GS U3PYF8_9LAMI/1-436        AC U3PYF8.1
#=GS G3LV58_9SOLA/21-339       AC G3LV58.1
#=GS F0UYL1_9SPER/21-540       AC F0UYL1.1
#=GS YCF1_CUSEX/233-823        AC A8W3G9.1
#=GS I6LRH4_9ROSI/22-942       AC I6LRH4.1
#=GS G8J4K1_9SPER/728-1174     AC G8J4K1.1
#=GS H7CGD7_GINBI/681-979      AC H7CGD7.1
#=GS G8IXZ9_9SPER/220-454      AC G8IXZ9.1
#=GS C0K5U2_9ASPA/3-354        AC C0K5U2.1
#=GS L0BCS2_9ASPA/1-296        AC L0BCS2.1
#=GS C0K6C8_9ASPA/3-350        AC C0K6C8.1
#=GS C0K655_9ASPA/3-346        AC C0K655.1
#=GS YCF1_IPOPU/556-642        AC A7Y3K2.1
#=GS I1WZ87_9LAMI/2-623        AC I1WZ87.1
#=GS F8TP24_ROSOF/1-623        AC F8TP24.1
#=GS C0K500_9ASPA/3-354        AC C0K500.1
#=GS V4S284_9ROSI/21-384       AC V4S284.1
#=GS G0YEF3_CLAVI/21-212       AC G0YEF3.1
#=GS YCF1_NANDO/21-285         AC Q09FQ2.1
#=GS I3VJ52_OPUQU/1-265        AC I3VJ52.1
#=GS C0K549_9ASPA/3-354        AC C0K549.1
#=GS G8J6T7_PINBU/754-1203     AC G8J6T7.1
#=GS C0K527_9ASPA/3-356        AC C0K527.1
#=GS A2T912_9MAGN/1-159        AC A2T912.1
#=GS H2F5S5_ASPOF/270-904      AC H2F5S5.1
#=GS H2F5T9_IRITE/21-265       AC H2F5T9.1
#=GS G0YCV6_CARPA/21-250       AC G0YCV6.1
#=GS U3R0W9_9ASTE/17-564       AC U3R0W9.1
#=GS U3R5Q2_9ASTE/558-646      AC U3R5Q2.1
#=GS I3VJ23_9CARY/1-266        AC I3VJ23.1
#=GS T2D3M0_9ROSA/1-293        AC T2D3M0.1
#=GS V9Z818_9MAGN/21-227       AC V9Z818.1
#=GS S4TKM1_PINCO/288-590      AC S4TKM1.1
#=GS G8IZU5_9SPER/235-469      AC G8IZU5.1
#=GS S4TK65_9SPER/295-597      AC S4TK65.1
#=GS H2F5T8_9ASPA/21-281       AC H2F5T8.1
#=GS H2F5T0_9ASPA/284-889      AC H2F5T0.1
#=GS I3VJ61_9CARY/256-400      AC I3VJ61.1
#=GS G8ISN6_9SPER/474-660      AC G8ISN6.1
#=GS H2F5R2_9ASPA/239-499      AC H2F5R2.1
#=GS C0K6C4_9ASPA/3-354        AC C0K6C4.1
#=GS YCF1_HUPLU/576-921        AC Q5SCY7.2
#=GS C0K6M2_9ASPA/3-349        AC C0K6M2.1
#=GS S4TII4_PINAT/295-597      AC S4TII4.1
#=GS C0K514_9ASPA/3-354        AC C0K514.1
#=GS G8J127_9SPER/261-454      AC G8J127.1
#=GS G0YE23_9MAGN/9-243        AC G0YE23.1
#=GS C0K574_9ASPA/3-349        AC C0K574.1
#=GS K7XCC5_9CARY/243-328      AC K7XCC5.1
#=GS S4TKN6_PINPN/297-597      AC S4TKN6.1
#=GS T2D2A6_MALMI/1-286        AC T2D2A6.1
#=GS U3R0W9_9ASTE/556-642      AC U3R0W9.1
#=GS I1WZA8_9LAMI/1-608        AC I1WZA8.1
#=GS H2F5T6_9ASPA/278-898      AC H2F5T6.1
#=GS C0K696_9ASPA/3-343        AC C0K696.1
#=GS R9ZTF6_GLYTO/367-920      AC R9ZTF6.1
#=GS M4I6U2_9SPER/918-1225     AC M4I6U2.1
#=GS C0K598_9ASPA/3-354        AC C0K598.1
#=GS W8NXT1_9SPER/838-1057     AC W8NXT1.1
#=GS C0K4V2_9ASPA/3-350        AC C0K4V2.1
#=GS U3MGT7_9GENT/306-645      AC U3MGT7.1
#=GS G8J458_9SPER/643-942      AC G8J458.1
#=GS D3WEA3_9MAGN/561-923      AC D3WEA3.1
#=GS F2VJE3_9ASPA/21-67        AC F2VJE3.1
#=GS YCF1_RANMC/28-559         AC A1XGT3.2
#=GS U3PZT9_9LAMI/1-625        AC U3PZT9.1
#=GS G8ITW5_9SPER/21-268       AC G8ITW5.1
#=GS C0K554_9ASPA/3-352        AC C0K554.1
#=GS C0K612_9ASPA/3-348        AC C0K612.1
#=GS C0K522_9ASPA/3-262        AC C0K522.1
#=GS T2D3L0_9ROSA/1-288        AC T2D3L0.1
#=GS F5GV56_9MARC/24-242       AC F5GV56.1
#=GS U3R7V5_9ASTE/17-561       AC U3R7V5.1
#=GS U3R723_IPOTI/555-641      AC U3R723.1
#=GS D3WF25_PLUAU/362-588      AC D3WF25.1
#=GS C3W2M9_PINPS/21-299       AC C3W2M9.2
#=GS G8IZF1_9SPER/235-469      AC G8IZF1.1
#=GS G0YEM8_STEHA/21-212       AC G0YEM8.1
#=GS N0DNX2_PHAAN/21-285       AC N0DNX2.1
#=GS I1LX98_SOYBN/3-84         AC I1LX98.1
#=GS D3WCI7_NEROL/21-933       AC D3WCI7.1
#=GS I1WZ86_9LAMI/1-419        AC I1WZ86.1
#=GS T1QM96_EUCSP/21-942       AC T1QM96.1
#=GS L0BDM7_HIPPA/1-296        AC L0BDM7.1
#=GS Q9BAF5_9MAGN/1-170        AC Q9BAF5.1
#=GS B9SWJ2_RICCO/1-70         AC B9SWJ2.1
#=GS C0K4S0_9ASPA/3-354        AC C0K4S0.1
#=GS C0K515_9ASPA/3-354        AC C0K515.1
#=GS T1QNR2_EUCER/21-940       AC T1QNR2.1
#=GS G0YE92_CANWI/21-256       AC G0YE92.1
#=GS C0K5X7_9ASPA/3-347        AC C0K5X7.1
#=GS M9PKU8_EQUHY/546-905      AC M9PKU8.1
#=GS T1QHJ1_EUCDV/21-567       AC T1QHJ1.1
#=GS A0A059C2U8_EUCGR/477-565  AC A0A059C2U8.1
#=GS C0K5A0_9ASPA/3-354        AC C0K5A0.1
#=GS C0K5E8_9ASPA/3-350        AC C0K5E8.1
#=GS C0K685_9ASPA/3-354        AC C0K685.1
#=GS H2BLT3_SILLA/21-953       AC H2BLT3.1
#=GS S4TJK6_9SPER/298-597      AC S4TJK6.1
#=GS C0K691_9ASPA/3-346        AC C0K691.1
#=GS J7IHJ4_9ROSA/21-353       AC J7IHJ4.1
#=GS G3LV70_9SOLA/21-974       AC G3LV70.1
#=GS F6I7Z2_OLEEU/21-377       AC F6I7Z2.1
#=GS A6Y9X6_HAMJA/21-267       AC A6Y9X6.1
#=GS C0K512_9ASPA/3-354        AC C0K512.1
#=GS C0K5T2_9ASPA/3-352        AC C0K5T2.1
#=GS F2VJE1_ONCHC/21-71        AC F2VJE1.1
#=GS C0K535_9ASPA/3-352        AC C0K535.1
#=GS G8IY71_9SPER/21-269       AC G8IY71.1
#=GS G8J017_9SPER/636-943      AC G8J017.1
#=GS R9ZR00_9FABA/305-917      AC R9ZR00.1
#=GS I3VJ60_9CARY/1-257        AC I3VJ60.1
#=GS K4B4I3_SOLLC/1-46         AC K4B4I3.1
#=GS G8IWR7_PINPI/21-267       AC G8IWR7.1
#=GS I3VJ34_9CARY/1-245        AC I3VJ34.1
#=GS V5QJT7_9ASTR/21-276       AC V5QJT7.1
#=GS D3WCQ2_PHOSE/326-967      AC D3WCQ2.1
#=GS K4KRQ1_9ROSI/8-488        AC K4KRQ1.1
#=GS K4KEY3_9ROSI/20-514       AC K4KEY3.1
#=GS M9YY40_9ASPA/537-918      AC M9YY40.1
#=GS H2F5S7_9ASPA/251-507      AC H2F5S7.1
#=GS U3R6J3_9ASTE/17-563       AC U3R6J3.1
#=GS I3VJ51_9CARY/1-258        AC I3VJ51.1
#=GS R9ZTR8_GLYTO/21-118       AC R9ZTR8.1
#=GS K4ESE6_9ROSA/21-973       AC K4ESE6.1
#=GS F8TNX1_9LAMI/1-626        AC F8TNX1.1
#=GS G8IWY9_9SPER/609-1050     AC G8IWY9.1
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