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Database: Pfam
Entry: Ycf1
LinkDB: Ycf1
Original site: Ycf1 
#=GF ID   Ycf1
#=GF AC   PF05758.7
#=GF DE   Ycf1
#=GF AU   Bateman A
#=GF SE   Pfam-B_6040 (release 8.0)
#=GF GA   29.20 29.20;
#=GF TC   29.40 29.40;
#=GF NC   28.40 29.10;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 23193494 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   10792825
#=GF RT   The two largest chloroplast genome-encoded open reading frames
#=GF RT   of higher plants are essential genes. 
#=GF RA   Drescher A, Ruf S, Calsa T Jr, Carrer H, Bock R; 
#=GF RL   Plant J 2000;22:97-104.
#=GF DR   INTERPRO; IPR008896;
#=GF CC   The chloroplast genomes of most higher plants contain two giant
#=GF CC   open reading frames designated ycf1 and ycf2. Although the
#=GF CC   function of Ycf1 is unknown, it is known to be an essential gene
#=GF CC   [1].
#=GF SQ   1439
#=GS H7CGD7_GINBI/54-281     AC H7CGD7.1
#=GS D3J8L6_VIGRA/21-286     AC D3J8L6.1
#=GS C0K4Y4_9ASPA/3-356      AC C0K4Y4.1
#=GS C0K6G4_9ASPA/3-350      AC C0K6G4.1
#=GS B7ZIL6_KETDA/242-983    AC B7ZIL6.1
#=GS C0K6B8_9ASPA/3-353      AC C0K6B8.1
#=GS C0K666_9ASPA/1-252      AC C0K666.1
#=GS YCF1_DAUCA/21-908       AC Q0G9Q4.1
#=GS G0YDY3_9ROSI/21-264     AC G0YDY3.1
#=GS C0K501_9ASPA/3-354      AC C0K501.1
#=GS C0LIX5_9MAGN/1-159      AC C0LIX5.1
#=GS YCF1_JASNU/21-991       AC Q06R72.1
#=GS C0K6I1_9ASPA/1-260      AC C0K6I1.1
#=GS G7KW22_MEDTR/8-65       AC G7KW22.1
#=GS H6T9N8_9CARY/21-217     AC H6T9N8.1
#=GS YCF1_NUPAD/21-963       AC A1XG13.1
#=GS G3XFB1_9CONI/21-1014    AC G3XFB1.1
#=GS C0K686_9ASPA/3-351      AC C0K686.1
#=GS C0K4W9_9ASPA/3-354      AC C0K4W9.1
#=GS A6YA44_9MAGN/21-273     AC A6YA44.1
#=GS F8TP38_SALOF/2-623      AC F8TP38.1
#=GS G3ETV7_CUCME/565-921    AC G3ETV7.1
#=GS F8TNV5_HYSOF/3-611      AC F8TNV5.1
#=GS C0K5J8_9ASPA/3-355      AC C0K5J8.1
#=GS F8TP48_9LAMI/3-627      AC F8TP48.1
#=GS G8J2X3_PINED/21-1051    AC G8J2X3.1
#=GS D3WDB3_9MAGN/21-971     AC D3WDB3.1
#=GS C0K4P5_9ASPA/3-354      AC C0K4P5.1
#=GS C0K5S9_9ASPA/3-286      AC C0K5S9.1
#=GS H2F5T4_BOWVO/21-890     AC H2F5T4.1
#=GS C0K575_9ASPA/3-354      AC C0K575.1
#=GS D3WAY5_AUCJA/21-954     AC D3WAY5.1
#=GS G0YE11_9MAGN/512-913    AC G0YE11.1
#=GS C0K676_9ASPA/3-354      AC C0K676.1
#=GS Q9BAG3_RANLY/1-162      AC Q9BAG3.1
#=GS C0K636_9ASPA/3-352      AC C0K636.1
#=GS C0K5V1_9ASPA/3-351      AC C0K5V1.1
#=GS C0K5T4_9ASPA/3-356      AC C0K5T4.1
#=GS F8TP28_9LAMI/2-623      AC F8TP28.1
#=GS A2T910_9MAGN/1-158      AC A2T910.1
#=GS G0YEI0_MOLVE/21-212     AC G0YEI0.1
#=GS G0YCU3_9ROSI/21-249     AC G0YCU3.1
#=GS H2F5U0_9ASPA/18-999     AC H2F5U0.1
#=GS G0YDZ0_9MAGN/29-262     AC G0YDZ0.1
#=GS F8TNV7_9LAMI/2-626      AC F8TNV7.1
#=GS YCF1_ACOAM/21-990       AC A9LYF8.1
#=GS G0YDP3_9ROSI/21-312     AC G0YDP3.1
#=GS C0K4X5_9ASPA/3-233      AC C0K4X5.1
#=GS G0YE04_9MAGN/21-306     AC G0YE04.1
#=GS C0K5M4_9ASPA/3-354      AC C0K5M4.1
#=GS C4XUX0_CRYJA/14-1036    AC C4XUX0.1
#=GS G8J199_9CONI/21-975     AC G8J199.1
#=GS C0K6A8_9ASPA/3-354      AC C0K6A8.1
#=GS C0K563_9ASPA/3-354      AC C0K563.1
#=GS A6YA70_RIBAM/21-273     AC A6YA70.1
#=GS D3WDP7_CORFO/21-579     AC D3WDP7.1
#=GS C0K6E4_9ASPA/3-340      AC C0K6E4.1
#=GS Q9B1E6_9MAGN/1-167      AC Q9B1E6.1
#=GS F2W5A9_9ERIC/21-260     AC F2W5A9.1
#=GS G8ITP4_PINSY/241-942    AC G8ITP4.1
#=GS C0K6I3_9ASPA/3-346      AC C0K6I3.1
#=GS Q9B1V1_9MAGN/2-167      AC Q9B1V1.1
#=GS H6T9N8_9CARY/331-466    AC H6T9N8.1
#=GS F1AMN1_GOSTH/22-944     AC F1AMN1.1
#=GS C0K5T7_ONCEX/3-354      AC C0K5T7.1
#=GS A2T908_RANLY/1-158      AC A2T908.1
#=GS C0K5X9_9ASPA/3-360      AC C0K5X9.1
#=GS C0K517_9ASPA/3-356      AC C0K517.1
#=GS C0K577_9ASPA/3-354      AC C0K577.1
#=GS C0K614_9ASPA/3-351      AC C0K614.1
#=GS C0K5H5_9ASPA/3-346      AC C0K5H5.1
#=GS YCF1_PINTH/21-262       AC P41647.1
#=GS C0K5W8_9ASPA/3-351      AC C0K5W8.1
#=GS YCF1_CERDE/21-946       AC A8SEG5.1
#=GS B9I1T0_POPTR/21-80      AC B9I1T0.1
#=GS C0K6H3_9ASPA/3-354      AC C0K6H3.1
#=GS C0K660_9ASPA/3-354      AC C0K660.1
#=GS G8J1P2_PINHA/237-924    AC G8J1P2.1
#=GS B0Z4T3_OENAR/21-1218    AC B0Z4T3.1
#=GS C0K5P9_9ASPA/3-354      AC C0K5P9.1
#=GS C0K4R8_9ASPA/3-351      AC C0K4R8.1
#=GS G3LV58_9SOLA/21-339     AC G3LV58.1
#=GS YCF1_CRUWA/22-914       AC A4QKZ2.1
#=GS G8J2H9_PINEG/21-940     AC G8J2H9.1
#=GS YCF1_AMBTC/536-867      AC Q70XV6.2
#=GS C0K5K4_9ASPA/3-354      AC C0K5K4.1
#=GS H2EYA9_9ROSI/21-944     AC H2EYA9.1
#=GS C0K5U2_9ASPA/3-354      AC C0K5U2.1
#=GS C0K611_9ASPA/3-353      AC C0K611.1
#=GS G0YDD5_LILSU/21-402     AC G0YDD5.1
#=GS F8TNZ1_9LAMI/2-610      AC F8TNZ1.1
#=GS C0K6N2_9ASPA/3-354      AC C0K6N2.1
#=GS C0K6C8_9ASPA/3-350      AC C0K6C8.1
#=GS C0K4Q4_9ASPA/3-356      AC C0K4Q4.1
#=GS C0K655_9ASPA/3-346      AC C0K655.1
#=GS G8J089_9CONI/239-937    AC G8J089.1
#=GS F6KG78_JACVU/511-858    AC F6KG78.1
#=GS C0K619_9ASPA/3-354      AC C0K619.1
#=GS C0K500_9ASPA/3-354      AC C0K500.1
#=GS C0K4U9_9ASPA/3-353      AC C0K4U9.1
#=GS Q9B1C4_9MAGN/1-164      AC Q9B1C4.1
#=GS B9PF66_POPTR/1-332      AC B9PF66.1
#=GS C0K6G0_9ASPA/3-351      AC C0K6G0.1
#=GS G4LAP5_9CONI/22-1225    AC G4LAP5.1
#=GS G8IX61_PINPT/21-258     AC G8IX61.1
#=GS G0YEF3_CLAVI/21-212     AC G0YEF3.1
#=GS C0K549_9ASPA/3-354      AC C0K549.1
#=GS G8IV46_PINRA/21-940     AC G8IV46.1
#=GS C0LJ53_RANSE/1-159      AC C0LJ53.1
#=GS C0K527_9ASPA/3-356      AC C0K527.1
#=GS F8TNT1_COLCN/2-625      AC F8TNT1.1
#=GS C0K5V2_9ASPA/3-303      AC C0K5V2.1
#=GS G7JS07_MEDTR/42-109     AC G7JS07.1
#=GS F6GQ56_NELNU/279-890    AC F6GQ56.1
#=GS G0YCV6_CARPA/21-250     AC G0YCV6.1
#=GS A2T907_RANLY/1-158      AC A2T907.1
#=GS C0K6D8_9ASPA/3-356      AC C0K6D8.1
#=GS Q9BAF6_9MAGN/1-170      AC Q9BAF6.1
#=GS C0K5B8_9ASPA/3-275      AC C0K5B8.1
#=GS C0K530_9ASPA/3-354      AC C0K530.1
#=GS G8IVJ0_PINPN/21-940     AC G8IVJ0.1
#=GS D0QXH5_9MAGN/21-270     AC D0QXH5.1
#=GS G8IS32_PINYU/236-938    AC G8IS32.1
#=GS C0K6H7_9ASPA/3-354      AC C0K6H7.1
#=GS C0K5B7_9ASPA/3-262      AC C0K5B7.1
#=GS G0YDS1_9MAGN/21-348     AC G0YDS1.1
#=GS G8ISG5_9CONI/21-942     AC G8ISG5.1
#=GS C0K6C4_9ASPA/3-354      AC C0K6C4.1
#=GS F2W597_9ERIC/21-262     AC F2W597.1
#=GS Q6YSM2_BRANA/21-257     AC Q6YSM2.1
#=GS C0K6M2_9ASPA/3-349      AC C0K6M2.1
#=GS C0K514_9ASPA/3-354      AC C0K514.1
#=GS F8TNX7_9LAMI/2-625      AC F8TNX7.1
#=GS G8J089_9CONI/21-267     AC G8J089.1
#=GS C0K507_9ASPA/3-346      AC C0K507.1
#=GS H2F5S3_9ASPA/21-901     AC H2F5S3.1
#=GS C0K574_9ASPA/3-349      AC C0K574.1
#=GS G0YE23_9MAGN/9-243      AC G0YE23.1
#=GS C0K4U0_9ASPA/3-351      AC C0K4U0.1
#=GS G8IYE2_PINMU/21-258     AC G8IYE2.1
#=GS C0K585_9ASPA/3-354      AC C0K585.1
#=GS F0UWP3_PINGE/372-1105   AC F0UWP3.1
#=GS G0YEN8_TALPA/21-212     AC G0YEN8.1
#=GS C0K696_9ASPA/3-343      AC C0K696.1
#=GS C0K598_9ASPA/3-354      AC C0K598.1
#=GS C0K4V2_9ASPA/3-350      AC C0K4V2.1
#=GS C0K625_9ASPA/3-354      AC C0K625.1
#=GS C0K5U5_9ASPA/3-346      AC C0K5U5.1
#=GS F8TNX3_9LAMI/2-623      AC F8TNX3.1
#=GS C0K5V0_9ASPA/3-351      AC C0K5V0.1
#=GS C0K4T4_9ASPA/3-354      AC C0K4T4.1
#=GS F2VJE3_9ASPA/21-67      AC F2VJE3.1
#=GS YCF1_RANMC/28-559       AC A1XGT3.2
#=GS C0K554_9ASPA/3-352      AC C0K554.1
#=GS C0K5M9_9ASPA/3-351      AC C0K5M9.1
#=GS C0K612_9ASPA/3-348      AC C0K612.1
#=GS C0K522_9ASPA/3-262      AC C0K522.1
#=GS C0K6G2_9ASPA/3-354      AC C0K6G2.1
#=GS F5GV56_9MARC/24-242     AC F5GV56.1
#=GS C0K5U1_9ASPA/3-354      AC C0K5U1.1
#=GS G8ISV7_PINWA/405-1177   AC G8ISV7.1
#=GS C0K510_9ASPA/3-354      AC C0K510.1
#=GS H7CGD7_GINBI/267-979    AC H7CGD7.1
#=GS G0YEM8_STEHA/21-212     AC G0YEM8.1
#=GS C0K5R8_9ASPA/3-354      AC C0K5R8.1
#=GS F8TP20_9LAMI/2-623      AC F8TP20.1
#=GS C0LJ50_RANSE/1-159      AC C0LJ50.1
#=GS I1LX98_SOYBN/3-84       AC I1LX98.1
#=GS C0K5F3_9ASPA/3-350      AC C0K5F3.1
#=GS D3WCI7_NEROL/21-933     AC D3WCI7.1
#=GS G8J4D0_PINDE/237-941    AC G8J4D0.1
#=GS Q9BAF5_9MAGN/1-170      AC Q9BAF5.1
#=GS C0K515_9ASPA/3-354      AC C0K515.1
#=GS C0K4S0_9ASPA/3-354      AC C0K4S0.1
#=GS G0YE92_CANWI/21-256     AC G0YE92.1
#=GS C0K5X7_9ASPA/3-347      AC C0K5X7.1
#=GS C0K5A0_9ASPA/3-354      AC C0K5A0.1
#=GS YCF1_SOLTU/21-962       AC Q2VEC3.1
#=GS C0K6D7_9ASPA/3-346      AC C0K6D7.1
#=GS C0K568_9ASPA/3-355      AC C0K568.1
#=GS C0K4Y7_9ASPA/3-354      AC C0K4Y7.1
#=GS C0K5E8_9ASPA/3-350      AC C0K5E8.1
#=GS C0K685_9ASPA/3-354      AC C0K685.1
#=GS G8IZ79_9CONI/21-275     AC G8IZ79.1
#=GS C0LJ40_RANLY/1-156      AC C0LJ40.1
#=GS H2BLT3_SILLA/21-953     AC H2BLT3.1
#=GS C0K5T3_9ASPA/3-352      AC C0K5T3.1
#=GS G4LAZ0_9CONI/15-1110    AC G4LAZ0.1
#=GS C0K691_9ASPA/3-346      AC C0K691.1
#=GS F5GV56_9MARC/235-851    AC F5GV56.1
#=GS A6YA62_9MAGN/21-270     AC A6YA62.1
#=GS G3LV70_9SOLA/21-974     AC G3LV70.1
#=GS H2F5U9_9ASPA/21-897     AC H2F5U9.1
#=GS C5HYB3_9MONI/233-885    AC C5HYB3.1
#=GS A6Y9X6_HAMJA/21-267     AC A6Y9X6.1
#=GS C0K6A3_9ASPA/3-355      AC C0K6A3.1
#=GS C0K5T2_9ASPA/3-352      AC C0K5T2.1
#=GS C0K512_9ASPA/3-354      AC C0K512.1
#=GS F2VJE1_ONCHC/21-71      AC F2VJE1.1
#=GS C0K535_9ASPA/3-352      AC C0K535.1
#=GS YCF1_PINKO/21-363       AC Q85WU2.2
#=GS C0K5Y1_9ASPA/3-354      AC C0K5Y1.1
#=GS C0K658_9ASPA/3-351      AC C0K658.1
#=GS YCF1_MORIN/21-935       AC Q09WW0.1
#=GS YCF1_SOLLC/21-964       AC Q2MI42.1
#=GS C0K5N9_9ASPA/3-354      AC C0K5N9.1
#=GS C0K5J0_9ASPA/3-357      AC C0K5J0.1
#=GS C7B2J9_SELML/27-343     AC C7B2J9.1
#=GS H2F5S0_AMABE/21-904     AC H2F5S0.1
#=GS C0K5N6_9ASPA/3-352      AC C0K5N6.1
#=GS YCF1_PHAVU/21-918       AC A4GGF4.1
#=GS H2EXF2_THECC/21-944     AC H2EXF2.1
#=GS G7LAW7_MEDTR/1-214      AC G7LAW7.1
#=GS C0K4X0_9ASPA/3-354      AC C0K4X0.1
#=GS G0YEK0_PHYAM/21-206     AC G0YEK0.1
#=GS F0UWP3_PINGE/21-266     AC F0UWP3.1
#=GS C0K5R4_9ASPA/3-354      AC C0K5R4.1
#=GS C0K538_9ASPA/3-354      AC C0K538.1
#=GS F6I9B0_OLEEU/550-890    AC F6I9B0.1
#=GS C0K675_9ASPA/1-290      AC C0K675.1
#=GS C0K635_9ASPA/3-354      AC C0K635.1
#=GS C0K4S5_9ASPA/3-354      AC C0K4S5.1
#=GS G8J4K1_9CONI/410-1175   AC G8J4K1.1
#=GS F2VJE5_9ASPA/21-98      AC F2VJE5.1
#=GS D3WB64_DILIN/17-940     AC D3WB64.1
#=GS H2B9G3_GOSTO/22-942     AC H2B9G3.1
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#=GS G7L7K6_MEDTR/80-311     AC G7L7K6.1
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#=GS C0K656_9ASPA/3-353      AC C0K656.1
#=GS F8TP10_PERAT/2-623      AC F8TP10.1
#=GS C0K505_9ASPA/3-351      AC C0K505.1
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