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Database: Pfam
Entry: eIF-4B
LinkDB: eIF-4B
Original site: eIF-4B 
#=GF ID   eIF-4B
#=GF AC   PF06273.6
#=GF DE   Plant specific eukaryotic initiation factor 4B
#=GF PI   Plant_eIF4B; 
#=GF AU   Moxon SJ
#=GF SE   Pfam-B_11679 (release 9.0)
#=GF GA   28.00 28.00;
#=GF TC   28.40 28.20;
#=GF NC   27.90 27.90;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 23193494 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   10600500
#=GF RT   Eukaryotic initiation factor 4B from wheat and Arabidopsis
#=GF RT   thaliana is a member of a multigene family. 
#=GF RA   Metz AM, Wong KC, Malmstrom SA, Browning KS; 
#=GF RL   Biochem Biophys Res Commun 1999;266:314-321.
#=GF DR   INTERPRO; IPR010433;
#=GF CC   This family consists of several plant specific eukaryotic
#=GF CC   initiation factor 4B proteins.
#=GF SQ   148
#=GS A9RPZ4_PHYPA/90-184   AC A9RPZ4.1
#=GS A5C2N0_VITVI/77-546   AC A5C2N0.1
#=GS B9HRA2_POPTR/5-325    AC B9HRA2.1
#=GS B4FAX3_MAIZE/1-202    AC B4FAX3.1
#=GS D7KPE9_ARALL/1-535    AC D7KPE9.1
#=GS B8LKF3_PICSI/1-554    AC B8LKF3.1
#=GS Q01K43_ORYSA/154-482  AC Q01K43.1
#=GS I1IYW1_BRADI/1-182    AC I1IYW1.1
#=GS A5JVC2_BRACM/16-250   AC A5JVC2.1
#=GS I1PMA3_ORYGL/187-515  AC I1PMA3.1
#=GS A4S9E3_OSTLU/417-564  AC A4S9E3.1
#=GS D8SHW6_SELML/1-297    AC D8SHW6.1
#=GS Q9SQK7_ARATH/1-519    AC Q9SQK7.1
#=GS Q9LD20_ARATH/1-150    AC Q9LD20.1
#=GS A4S9E3_OSTLU/1-353    AC A4S9E3.1
#=GS B7FAA5_ORYSJ/187-515  AC B7FAA5.1
#=GS I1PMA3_ORYGL/1-190    AC I1PMA3.1
#=GS E1Z5E6_CHLVA/388-540  AC E1Z5E6.1
#=GS F6HZ87_VITVI/7-129    AC F6HZ87.1
#=GS C0HEB9_MAIZE/1-95     AC C0HEB9.1
#=GS Q9SAD7_ARATH/1-532    AC Q9SAD7.1
#=GS Q0JNC1_ORYSJ/50-95    AC Q0JNC1.1
#=GS B9HLP7_POPTR/1-519    AC B9HLP7.1
#=GS C1N8B0_MICPC/70-183   AC C1N8B0.1
#=GS D8SEY2_SELML/1-179    AC D8SEY2.1
#=GS B6TZD9_MAIZE/1-193    AC B6TZD9.1
#=GS F2E4E2_HORVD/1-308    AC F2E4E2.1
#=GS A3A8M4_ORYSJ/50-375   AC A3A8M4.1
#=GS B9HRA2_POPTR/274-347  AC B9HRA2.1
#=GS I1IYW0_BRADI/167-527  AC I1IYW0.1
#=GS B7FMA8_MEDTR/124-216  AC B7FMA8.1
#=GS B9FFR0_ORYSJ/1-190    AC B9FFR0.1
#=GS Q9M7F0_ARATH/1-313    AC Q9M7F0.1
#=GS A5BQN4_VITVI/1-307    AC A5BQN4.1
#=GS Q01K43_ORYSA/79-157   AC Q01K43.1
#=GS D7MFM7_ARALL/282-399  AC D7MFM7.1
#=GS A3BKV8_ORYSJ/99-224   AC A3BKV8.1
#=GS Q9AUJ7_WHEAT/169-510  AC Q9AUJ7.1
#=GS B8CE05_THAPS/49-146   AC B8CE05.1
#=GS I1K4F6_SOYBN/1-514    AC I1K4F6.1
#=GS C5YAR4_SORBI/1-194    AC C5YAR4.1
#=GS Q7XK13_ORYSJ/1-190    AC Q7XK13.1
#=GS B9SQJ2_RICCO/5-285    AC B9SQJ2.1
#=GS Q9M7F1_WHEAT/106-445  AC Q9M7F1.1
#=GS D8SWA4_SELML/142-233  AC D8SWA4.1
#=GS A8ISG3_CHLRE/2-176    AC A8ISG3.1
#=GS A8ISG3_CHLRE/318-492  AC A8ISG3.1
#=GS D8SIS6_SELML/229-384  AC D8SIS6.1
#=GS B8AVH3_ORYSI/87-415   AC B8AVH3.1
#=GS I1P1T6_ORYGL/1-193    AC I1P1T6.1
#=GS B7FAA5_ORYSJ/1-190    AC B7FAA5.1
#=GS I1KSX2_SOYBN/1-535    AC I1KSX2.1
#=GS I0Z7N7_9CHLO/348-435  AC I0Z7N7.1
#=GS Q0E1I1_ORYSJ/1-160    AC Q0E1I1.1
#=GS Q0E1I1_ORYSJ/147-320  AC Q0E1I1.1
#=GS Q0JCC5_ORYSJ/1-190    AC Q0JCC5.2
#=GS F6I126_VITVI/1-307    AC F6I126.1
#=GS I1IYW0_BRADI/1-182    AC I1IYW0.1
#=GS F1CNH4_EUCGL/1-114    AC F1CNH4.1
#=GS F2EFK6_HORVD/1-179    AC F2EFK6.1
#=GS Q6ZI51_ORYSJ/186-502  AC Q6ZI51.1
#=GS I1K4F5_SOYBN/1-514    AC I1K4F5.1
#=GS F4JUG0_ARATH/3-312    AC F4JUG0.1
#=GS I1P008_ORYGL/319-387  AC I1P008.1
#=GS B7FMA8_MEDTR/1-61     AC B7FMA8.1
#=GS I1LPN1_SOYBN/262-318  AC I1LPN1.1
#=GS Q9M7E8_ARATH/1-532    AC Q9M7E8.1
#=GS B8CE05_THAPS/1-93     AC B8CE05.1
#=GS F2DRT8_HORVD/165-518  AC F2DRT8.1
#=GS B6TZD9_MAIZE/188-510  AC B6TZD9.1
#=GS I1KSX1_SOYBN/1-535    AC I1KSX1.1
#=GS I0Z7N7_9CHLO/1-221    AC I0Z7N7.1
#=GS F6GVM2_VITVI/1-506    AC F6GVM2.1
#=GS D8SEY2_SELML/173-332  AC D8SEY2.1
#=GS A5BQN4_VITVI/307-467  AC A5BQN4.1
#=GS A9TVK2_PHYPA/14-89    AC A9TVK2.1
#=GS E1Z5E6_CHLVA/1-207    AC E1Z5E6.1
#=GS A9SSD6_PHYPA/1-177    AC A9SSD6.1
#=GS D7LR48_ARALL/1-516    AC D7LR48.1
#=GS Q9LD19_ARATH/1-81     AC Q9LD19.1
#=GS Q0WMZ1_ARATH/1-532    AC Q0WMZ1.1
#=GS C5XWJ9_SORBI/192-507  AC C5XWJ9.1
#=GS I1LPN1_SOYBN/5-275    AC I1LPN1.1
#=GS B9FFR0_ORYSJ/186-515  AC B9FFR0.1
#=GS Q00T59_OSTTA/1-537    AC Q00T59.1
#=GS Q0E1I1_ORYSJ/324-392  AC Q0E1I1.1
#=GS D8SEY2_SELML/324-472  AC D8SEY2.1
#=GS Q9LIN5_ARATH/1-520    AC Q9LIN5.1
#=GS C5XWJ9_SORBI/1-197    AC C5XWJ9.1
#=GS C5YAR4_SORBI/190-514  AC C5YAR4.1
#=GS B9SQJ2_RICCO/276-339  AC B9SQJ2.1
#=GS B7G5J6_PHATC/3-82     AC B7G5J6.1
#=GS I1LIY3_SOYBN/259-312  AC I1LIY3.1
#=GS B9SVM6_RICCO/1-475    AC B9SVM6.1
#=GS I1HZT5_BRADI/1-314    AC I1HZT5.1
#=GS F2EFK6_HORVD/168-408  AC F2EFK6.1
#=GS I1HZT5_BRADI/302-387  AC I1HZT5.1
#=GS Q9SZP8_ARATH/297-451  AC Q9SZP8.1
#=GS D8SWA4_SELML/2-146    AC D8SWA4.1
#=GS Q9M7F1_WHEAT/1-115    AC Q9M7F1.1
#=GS I1GTN7_BRADI/313-428  AC I1GTN7.1
#=GS F2E4E2_HORVD/303-372  AC F2E4E2.1
#=GS Q8L6Y0_ARATH/1-149    AC Q8L6Y0.1
#=GS Q9M7E9_WHEAT/1-118    AC Q9M7E9.1
#=GS I1IB69_BRADI/1-501    AC I1IB69.1
#=GS I1P008_ORYGL/1-322    AC I1P008.1
#=GS Q01K43_ORYSA/1-82     AC Q01K43.1
#=GS C1E758_MICSR/1-519    AC C1E758.1
#=GS Q6ZI51_ORYSJ/1-192    AC Q6ZI51.1
#=GS Q0JCC5_ORYSJ/188-396  AC Q0JCC5.2
#=GS F2ELL4_HORVD/305-393  AC F2ELL4.1
#=GS Q9SZP8_ARATH/5-311    AC Q9SZP8.1
#=GS B8AER1_ORYSI/1-200    AC B8AER1.1
#=GS B9I9L5_POPTR/9-118    AC B9I9L5.1
#=GS I1P1T6_ORYGL/188-503  AC I1P1T6.1
#=GS F2D620_HORVD/234-349  AC F2D620.1
#=GS B7FMA8_MEDTR/55-139   AC B7FMA8.1
#=GS F6I126_VITVI/307-400  AC F6I126.1
#=GS E5GC13_CUCME/1-392    AC E5GC13.1
#=GS B8AH33_ORYSI/1-161    AC B8AH33.1
#=GS D7MFM7_ARALL/3-296    AC D7MFM7.1
#=GS D8SWA4_SELML/228-434  AC D8SWA4.1
#=GS B8AVH3_ORYSI/1-90     AC B8AVH3.1
#=GS B9H157_POPTR/1-333    AC B9H157.1
#=GS I1IYW1_BRADI/167-527  AC I1IYW1.1
#=GS F2DRT8_HORVD/1-179    AC F2DRT8.1
#=GS B4FXD6_MAIZE/2-80     AC B4FXD6.1
#=GS D8UFJ9_VOLCA/2-173    AC D8UFJ9.1
#=GS I1LIY3_SOYBN/4-267    AC I1LIY3.1
#=GS C0PF30_MAIZE/262-396  AC C0PF30.1
#=GS D8UFJ9_VOLCA/148-301  AC D8UFJ9.1
#=GS I1HEV9_BRADI/44-107   AC I1HEV9.1
#=GS B9HTR6_POPTR/1-507    AC B9HTR6.1
#=GS I1KQS5_SOYBN/333-424  AC I1KQS5.1
#=GS B6TRD2_MAIZE/185-497  AC B6TRD2.1
#=GS B9RNH3_RICCO/16-120   AC B9RNH3.1
#=GS B8AH34_ORYSI/32-146   AC B8AH34.1
#=GS B6TRD2_MAIZE/1-190    AC B6TRD2.1
#=GS F0YIW0_AURAN/3-116    AC F0YIW0.1
#=GS Q9AUJ7_WHEAT/1-180    AC Q9AUJ7.1
#=GS D8SHW6_SELML/288-430  AC D8SHW6.1
#=GS D8UFJ9_VOLCA/292-446  AC D8UFJ9.1
#=GS D8SIS6_SELML/2-233    AC D8SIS6.1
#=GS B9GSF9_POPTR/30-120   AC B9GSF9.1
#=GS A3A8M4_ORYSJ/1-54     AC A3A8M4.1
#=GS C5XAU5_SORBI/267-369  AC C5XAU5.1
#=GS Q7XK13_ORYSJ/187-515  AC Q7XK13.1
#=GS F4JUG0_ARATH/297-407  AC F4JUG0.1
A9RPZ4_PHYPA/90-184              ..........idrdndpavephargw--------...------------------......-----.--------.----------------......----...--..-----------.----...........------....----.----.--.------------.........--...--..-.--------.-----...........................---...-..-------....------.-.-.-.-.---.---...--....................................---------------...---...-.----...--....-....------.--......................-------....................--------..-.......---..--........--...--S.VGVWGVLACRLS..............GSSVCL...MSyte........................edtAGRPKLSLQP.RGSA..S...D.I...A.......SS..SP-A.......KSS.RP.....NP..FGAARPREQVIAER---------.-----..........------------------.--------...............--.---.------.-...-----------.------------------.......--.----...-------------..------..-----..--...---.--...----............................---------------------------........----.---.---------------.-----.-------------------.....----------.------.--..---tgkkeqei............................................
A5C2N0_VITVI/77-546              ..........................MSKPWGGI...GAWAAEAERAEAEEQEQA......AAAIE.TAAANTAA.ESERLPSQKGAN----......-KMK...PK..KMSLFEFRMGD.YMQQ...........DPSMES....KGLM.QDEM.IQ.LPTGPKQRSIEE.........MQ...HS..Q.LGGGFQSY.--RLSgapqgqmrd.........rdgdinhswGGN...R..VLY-GGF....DGDCRV.Q.S.P.R.ALD.FNQ...PS....................................RADQVDKWATTKKYF...PSP...S.VDSG...RH....A....WYNR--.--......................LGGGTSG....................--------..-.......---..--........--...---.-HHWTRKD----..............---FCE...DS..............................HEQPRLILNP.PSRE..V...I.S...N.......DL..I---.......GCN.RP.....NP..FGHARPREEILAEKGVDWKKLDS.EIEYK.........kTSWLMSSYLTRPSSTQSS.QSEDPIAH...............GS.DGA.VKPRPK.V...NPFGDAKPREV.LLEERGKDWRKMDKELEH.......RG.VERP...ETEEEKNLREEIW..DLKREL..QKESE..KR...QSM.KG...SGED...........................qISLQDLILSKERNLEQLNCDLDDKVRF........GRKV.MEK.PGSGAFRGAIISERL.PSQSD.SLVNSRNKEIRLRPQTPGT.....GDVRIRPGDN.RRAFQG.GM..ERR....................................................
B9HRA2_POPTR/5-325               .........................v-SSPWSKP...GAWALDAEEHEAELQQEHe....nSQQAS.TLAAQPLG.GVAEFPSLAAAAATKQ.....pKKKK...NQ..TLSLAEFSNYS.LAKS...........S-----....---H.EPDL.FN.LPTRPRERSAEE.........LD...RA..R.LGGGFKSY.GLSYR..........................nGGEe.sN..SRWGGGG....NGNSRV.S.N.R.E.SSK.EFA...PS....................................RADEIDDWSKTKKSP...AGN...V.YERR...ERe..rGs..sFFDSQS.KAdesaswvsn...kttndgprrfVGANNGGfe................rrGSYDTLSR..E.......RHG..FS........GG...AAD.SDNWGRKKDESF..............--NSGS...VG..............................-ERPKLKLQP.RTLP..V...S.D...G.......N-..GAVE.......KPK.GS.....NP..FGDARPREEVLKEKGMDYKEIDE.KLDS-..........------------------.--------...............--.---.------.-...-----------.------------------.......--.----...-------------..------..-----..--...---.--...----............................---------------------------........----.---.---------------.-----.-------------------.....----------.------.--..---vkissermlrq.........................................
B4FAX3_MAIZE/1-202               ..........................--------...------------------......-----.--------.----------------......----...--..-----------.----...........------....----.----.--.------------.........--...--..-.--------.-----...........................---...-..-------....------.-.-.-.-.---.---...--....................................---------------...---...-.----...--....-....------.--......................-------....................--------..-.......---..--........--...---.------------..............------...--..............................----------.----..-...-.-...-.......--..----.......---.--.....--..--------------------MET.EIDQK.........rTSRPTSSQSSRTESAQPS.RPGSPGSQis...........atGS.EAA.PTARPK.V...NPFGEAKPREV.ILQEKGKDWRKIDQELEH.......RQ.IDRP...KTNEENVLKEEIN..LLKVEL..DESEG..--...-KI.-S...DEDA............................KAMSEKITQMEEQLELLRTAMDDKIRF........L---.-QR.PGSGAGRVIASPP--.---TN.FVDEPQIKESMERPRAHSS.....TEQYTKPTEE.RWGFQG.SR..DRG....................................................
D7KPE9_ARALL/1-535               ..........................MSKPWGGI...GAWADEAERADEEQAAEA......TA---.-----TAA.DSQSFPSLKEAATAKS......-SKK...KK..KMTLSEFTKGA.YTAP...........----SS....AGLT.REQM.LQ.LPTGPRQRSEEE.........MQ...PG..R.LGGGFSSYgGGRSSgppgrmsrdr.......ddsdgswgggGGG...R..RSY-GGF....DDDQRG.S.N.S.R.VSD.LPQ...VS....................................RADEDDDWGKGKK--...SLP...S.FDQG...RQ....G...sRYGGLG.GGggg................agsYGGGGGGag................syG--GGGGG.aG.......GGG..GF........SK...ADE.VDNWAAGKAKSSt............fGSGFRD...SGpepdrwarg............vlpsgggvqEERRRLVLEP.RKVD..A...G.G...S.......ET..PTAG.......KTS.KP.....NP..FGAARPREQVLAEKGLDWKKLDS.DIEAKk.......gqTSRPSSAQSSRPSSAQSN.RSESSALN...............NV.ENV.VKPRPK.V...NPFGDAKPREV.LLEEQGKDWRKIDSELEH.......RR.VDRP...ETEGERMLKEEIE..ELRKKL..EKEAA..IA...PES.KE...SHQEsd.......................snhQNLPDLIREKEKDLDLLIRELDDKVRF........RPRA.VER.PGSSASRAGSYSERP.HSRAG.SIDESRNVEPMERPRSRGT.....GDNWPRPVDD.RRNFQG.SK..ERG....................................................
B8LKF3_PICSI/1-554               ..........................MAKPWGP-...GAWAAEAEQADAEAKAKAn...eaAAERG.SSAVVAGG.GEESFPSLREAAAVGKp....kKKNK...GQ..TLSISEFATGI.YVGPggrt..rgagaASASVS....KGLT.TEEL.MM.LPTGPRERSADE.........PDyggSG..R.LGGGFRDY.GKRVGgggggggggg.......gfrdegdgqwGSN...R..RPFGGGF....DDDRKP.-.Q.T.R.VSD.FE-...PS....................................RADEADNWASTKKVApppPVN...S.FNRS...SR....E....RYDAGG.QTsr.................ydaSGQG--Srade...........adnwaAGKRLESS..D.......HRS..GS........FG...SMN.AERWGGRRTEGF..............AFSDRD...SD..............................RARPRLVLDP.PSRP..R...N.E...SlpapllsDA..PQVD......aSKP.KP.....NP..FGFARPREEVLTKRGEDWKKLDS.EIESR..........-------SSSRPTSAHSS.RPQSPTLN...............-D.GAP.PQSRPK.V...NPFGDAKPREV.LLEKMGKDWRKMDFELEH.......RG.TNRS...ETEEEWKLKEEVN..FLKELV..KKSAE..NE...AQV.DGlalGEQDme........................qmQSTMKELVLKEKQLEQLTRDLDDKVRF........GKRGgDSR.PGSAAGRPFEYLERP.GSRSG.LSDGGRSHDSLERPRSRGGegrvvADVWMSSNEG.QRGVHV.DR..ER-s...................................................
Q01K43_ORYSA/154-482             .......................psp--------...------------------......-----.--------.----------------......----...--..-----------.----...........------....----.----.--.------------.........--...--..-.--------.-----...........................---...-..-------....------.-.-.-.-.---.---...AG....................................RSDDIDDWSRDKK--...PMP...S.----...--....-....RYPS--.--......................LGSGGGG....................GGGFRESP..-.......GFR..DS........PG...PSD.SDRWSRGGSFAP..............---MPH...NG.............................eRERPRLNLDP.PKRD..P...L.A...T.......AT..PPAE......vARN.RP.....SP..FGAARPREEVLAEKGLDWRKMET.EIEQK..........TSRPTSSQSSRPNSAHSS.RPGSPGSQvs...........avGS.EGA.PRSRPK.V...NPFGNAKPREV.VLQEKGKDWRKIDLELEH.......RA.VNRP...ETNEERILKEEIN..LLKEKL..KESEA..NK...TDG.--...PDQAsp.......................edpEDLSEKITQMEKQLELLTIELDDKVRF........G---.-QR.PGSGAGRVSAVPPAI.AEEPQ.IVVS-----IVDRPRSRGG.....MEPFPKPAEE.RWGFQG.SR..ERG....................................................
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