| Entry |
|
|---|
| Definition |
exodeoxyribonuclease V subunit alpha (EC:3.1.11.5)
|
|---|
| Orthology |
| exodeoxyribonuclease V alpha subunit [EC: 3.1.11.5] |
|
|---|
| Organism |
pin Psychromonas ingrahamii
|
|---|
| Pathway |
|
|---|
| Class |
Genetic Information Processing; Replication and repair; Homologous recombination [PATH: pin03440]
 |
|---|
| SSDB |
    |
|---|
| Motif |
 |
|---|
| Other DBs |
NCBI-GI: NCBI-GeneID: JGI: UniProt: |
|---|
| Position |
1803951..1806047
 |
|---|
| AA seq |
698 aa  
MLTQLKQWKEQGLLRSIDYHFAAFMAEMGADKLTQLSAAFCSEYLGLGHICLPVEEIIIR
LNDKCSLSELDLQGFCREHDMECLLQNNFEAHALLSSSICVGDNAPLCLQFNALYLTRYA
LFEQLIADKLLDQPKLSLGSDIKVELDVLFATNYTYLWQDWCRDPRQPLPLLCEKYIDLL
PGSTVDWVGVEQLFSQAENAQDLQPLGSLIPENKRCNWQKVSAALALTTARCVISGGPGT
GKTTTVTKLLALLLKFQPTLLIKLVAPTGKAAARLTESITHALVELNIEPGIKDKMPKVA
TTIHRLLGVKANSNHFRFNQDEKLNVDLLVVDEASMVDLPLMAKLLMALPDHARLILLGD
KDQLASVEAGAVLGDICHFIESGYSAKKAQLLADLTGYTSLTKTAPRSPNMADNLCLLRK
SYRFDQYSGIGYLAKAINSGRANSKKVMALCDDYNDLQHYPNTELGKKELAALVLEGYRP
YLQNLSTITVDNRNLAGQLLKQFNQFKILCATREGEWGVKCLNKLCETVLEKAGLLTTGQ
VHKDPQHAYVYWYVGRPVMITQNNYHLGLYNGDIGLCLLDESLQLRVYFQMPDASIADFQ
PSRLPNHETVFAMTVHKSQGSEFEHTVLALPENHVSVVSRELIYTAITRAKKQLTLFADL
SLMASAMRHKTKRFSRLVERLKSPSVTLAEKVKQKIKE |
|---|
| NT seq |
2097 nt  +upstreamnt +downstreamnt
atgttaacacaactaaaacaatggaaagagcaggggctattacgttcaattgattaccat
tttgcagcctttatggcggaaatgggggcggataaattaacccagttaagtgctgccttc
tgcagtgaatatctgggtcttgggcatatctgtttacccgttgaagaaatcattatccgt
ttaaatgataaatgttcgttaagtgaacttgatttgcaggggttttgccgggaacatgat
atggaatgtttattgcagaataattttgaggcacatgcgttattaagtagttcaatctgt
gtgggtgataatgcccccctgtgtttacagtttaatgccttgtatcttacccgttacgcc
ctgtttgagcagcttatcgctgataaattattggatcaacctaagttgtccttgggttct
gatatcaaggtggaactcgatgttttatttgccaccaattatacctatttatggcaggat
tggtgccgcgatccaagacaacccctgcctttattatgtgaaaaatatattgatcttctc
cctggatcgacagttgactgggtaggagttgaacagttatttagtcaggccgaaaatgcg
caggatttacaacccttaggatccttgattccggaaaataaacgctgtaactggcaaaag
gtcagtgctgcattagccttgactactgcgcgatgtgttatctcaggagggcccggcacg
ggtaaaactacgactgttactaaactgctcgccttgctgctgaaatttcaaccaacactg
ttgattaaattggttgctccaacgggaaaagctgctgcgcgtttaacagaatctattacc
catgccttagtggaattaaacattgagccgggcattaaagacaaaatgcccaaggtggcg
acgaccattcaccgcttgttgggggtaaaagccaacagtaatcactttcgttttaaccag
gatgaaaaattaaatgtcgatctgctggtggtggatgaagcttcgatggtcgatttgccg
ctgatggcaaaattattaatggcgctaccggatcatgcccgcctgatattattaggtgat
aaagaccagctggcatcggttgaagcgggagctgttttaggggatatttgccattttatt
gaatcgggatacagtgctaaaaaagcgcagctgttggcagatttaacgggttatacctcg
ttaaccaagaccgcccctcggtcacctaatatggctgataatttatgtttgctgcgtaaa
agttaccgttttgaccaatactcggggattggctatttagccaaggcgattaatagcggc
cgcgcaaacagcaaaaaggtgatggcgttatgtgatgattataatgatttgcagcactat
ccgaatactgagttgggtaaaaaagagttggcagctctggtcttggaaggttatcgtccc
tatttacaaaacctgtcgactattaccgtagacaatcgaaaccttgcggggcaactatta
aagcagtttaaccaatttaaaatattatgtgcgacgcgcgaaggggagtggggagtcaag
tgtttaaataaactctgcgaaacggtattagaaaaagcaggcctgttaacgaccgggcaa
gtgcacaaggatccgcaacatgcctatgtttattggtatgtcggtcgtccggttatgata
acccaaaacaattatcatttaggtttatataatggtgatattggcctgtgtttattagat
gaatctttacagttacgtgtttatttccaaatgcccgatgcgtctattgccgattttcag
ccaagtcgtttgcccaaccatgaaactgtttttgccatgacggtacataaaagccaggga
tctgagtttgagcacactgtattagcattacctgaaaatcacgtctctgtggtcagccga
gaactcatttataccgctattacccgcgcaaaaaaacagttgacgctgtttgccgattta
tccttaatggccagtgcgatgcgccataaaacaaaacgttttagccgtttagttgagcgt
ttaaaaagcccatccgtaacccttgcagaaaaagttaaacagaaaataaaagaataa |
|---|
