KEGG T00464: A9601

Prochlorococcus marinus AS9601: A9601_12091

Entry

A9601_12091 CDS T00464

Gene name

recB

Definition

UvrD/REP helicase (EC:3.1.11.5)

Orthology

K03582

exodeoxyribonuclease V beta subunit [EC:3.1.11.5]

Organism

pmb Prochlorococcus marinus AS9601

Pathway

pmb03440

Homologous recombination

Class

Genetic Information Processing; Replication and repair; Homologous recombination [PATH:pmb03440]

SSDB

Motif

Pfam:

UvrD-helicase UvrD_C UvrD_C_2 Viral_helicase1 AAA_19 AAA_30

Other DBs

NCBI-GI:

NCBI-GeneID:

JCVI-CMR:

CyanoBase:

CYORF:

UniProt:

Position

complement(1026261..1029887)

AA seq 1208 aa
MDINQIKLNKKFKLVEASAGTGKSFTLAHIVLRNVLEKKVKPDEILLLSFTKNTCSELRD
KILSRFLNLKLYLQSYKECKIDNTLKDWYLNFKDKDKSKEKIISEIDNFINQFYKLKVTT
FHAFCNNIIDEYSIEIGLTQDPYIENNIDNLYKDVIDNLWIDDFLNLNHELISAVYKKKI
SSRFGSRINKSFFVEILKNIDQENIYKFQINNKYKIIDLNNYFNEFFYLNWNEFCFEWNK
KGKELFLQLIELGKLIKESGGKSQIYAAKPRNDKFNQINCWIEEINKRLNSKNVIDFIYD
ISKDDLLSKYFYIENISKEINKHNIKLDFTKFNLLQDKIYKIKEGFFTEFVRIFTQLAYI
KLFELKKSFSIFNFNDLIKTVENTFLDSEISNSNTLSKIQKRFKCVLVDEFQDTDITQWN
LIKKFFNTKNHFLLCVGDPKQAIYKFRGGDIETYLDARSNAIEVFSLTDNYRSSKNLIDV
LNKLYKNGLKQSKLKYSKLTSRINENINPEFKFKDVFEIVEFSKKETDIEDLVTHYIVNF
ILNNKEIDINKIAILTLNNSQCLDFKKKLNQFNLPCKIQNKQNIFDTEASSLLFLFIECL
LNPRSLKNITLLATSKFIEIKLEDLLDHGISNNLEILMNKCITWSQELREKGFLNIVNEL
VINYKSSSIIQDSDLNSNLFQLSEIVEIELINNDLDLNIVFNWYKNQLDHILRISTGEDF
LTKDYNLQNGINLSTIHSSKGLEFEIVLCPYLSIISNKLNKIKGPLWKSNIDRNIYVNIS
NNYAKVEKFKLIEEEDLFKESERLIYVALTRSKYKLIVFNDLEDTNNILNNDLLNNLENI
NIYKSTFKVRIENEKIKEIFSKFQTNRLNNNLWKIDNVNKKISNVFNSDQFISYSSYSSW
IRKDKNIEAVINQYKDYEDNISIIKDSNFKNSKNYPNYFSHPNPLSEFPKGTIAGTCLHK
IIERFEFRNDNNQELIDLIIEELNFHQIDTSLAFKVKDAILRIINISLGRELQNKKLVDI
PNEYLIKELKYDLTLSYEGRNINSNDISNCFFLDQDYEFGEEYANKINDLQIMNKGFHSG
CIDCIFPVGNKLEDSKWWVIDWKSNLISDSDNSDCLPRNYNYENMRNEMIKHHYPLQSHL
YLLALHRLLKWRLKNYQPQKHLGGYIYLFLKGLPDFELFEKSKSEDISPGIFISKAPLKR
INYLDNLF

NT seq 3627 nt +upstreamnt +downstreamnt
atggatattaatcaaattaaattaaataaaaaatttaaattagttgaagcaagtgcaggc
actggtaagagttttactttggcacacatagttttaagaaatgttttggagaaaaaagtt
aaaccagatgaaatactcttgctaagctttacaaaaaatacttgttctgaattaagagac
aaaattctctcgagatttcttaatttaaaattatatttgcaaagttataaagaatgtaag
atagataatactcttaaggattggtatctaaattttaaggataaagataaatctaaggaa
aaaataatttccgaaattgacaattttataaatcaattctataagttaaaagtaactacg
ttccatgctttttgtaataatattattgatgaatatagtattgaaataggtttaacacaa
gatccatatattgagaataatattgataatttgtataaagatgtaatagataatttatgg
attgatgattttcttaatcttaatcatgagcttatttcagcagtatacaaaaaaaaaata
agttctagatttggaagtaggatcaataagtcattttttgtagaaattttaaaaaatata
gatcaagaaaatatctataaatttcaaataaataataaatataagattattgatttaaat
aattattttaatgaatttttttatttaaattggaacgagttttgttttgaatggaataag
aaaggtaaggaattatttttacaactcatagagttgggaaaattaattaaggaaagtggt
ggaaaaagtcaaatatatgcagcaaaaccaagaaatgataagtttaatcaaataaattgt
tggattgaagagattaacaaaaggcttaattctaaaaatgttattgatttcatatatgat
atttctaaggatgatcttttatctaaatatttttacattgaaaatatatctaaagaaatt
aataaacataatattaaattagattttactaaatttaatttattacaagataaaatttat
aaaataaaagaaggcttttttactgaatttgtaagaatatttactcaattagcttatata
aaattatttgaattaaagaaaagtttttctattttcaacttcaatgatcttataaagact
gtagaaaatacatttctagattcggaaattagtaatagtaatactctttctaaaattcaa
aaaagatttaaatgtgtcttagttgatgagttccaagatacagatattactcagtggaat
ttaataaaaaagttctttaatacaaaaaatcattttttactttgcgtaggtgatccaaaa
caagcgatttacaaatttagaggtggagatattgaaacttacttagatgcaagatctaat
gcaatcgaagtttttagtcttacagataactatagatcctcaaaaaacttaatcgatgtt
cttaataaactttataagaatggacttaaacaatcaaaactaaaatatagtaaattaacc
tcaagaatcaatgaaaatattaatcctgaatttaaatttaaggatgtatttgaaattgta
gaattttcaaaaaaagagactgatatagaggatcttgtaactcattatatagttaacttt
attttaaataataaagaaattgatattaataaaattgcgattcttacattaaataattct
caatgcttagattttaaaaaaaaattaaatcagtttaacctgccatgcaaaattcaaaat
aaacaaaatatttttgatacagaagcaagttctctactatttttattcattgaatgttta
ttaaatccgaggtctttaaaaaatataactttgcttgctacttcaaagtttatagaaata
aaattagaagatttacttgatcatggaattagtaataatttagaaattttaatgaataaa
tgcattacttggtcccaagaactaagagaaaaaggttttttaaatattgttaatgaacta
gttataaattacaaatcatcctcgattattcaagattcagatttaaattcaaatttattt
caactttcagaaattgttgaaatagaattaataaataatgatttagatctcaatatagtc
ttcaactggtataaaaatcagttagatcatattttaagaatttcaactggagaagatttt
ttgacgaaagattataatcttcaaaatggaataaatctttctaccattcatagtagtaag
ggcctcgaatttgaaatagtcctatgtccatatctctcaattatttcaaataagttaaat
aaaattaaaggacctctttggaaatcaaatattgatagaaatatatacgttaatatttct
aataattacgcgaaggttgaaaaatttaaattaatagaagaagaagatctattcaaagag
agtgagaggttaatttatgtagcacttacgaggagcaaatataaacttattgtttttaat
gatttagaggatacaaataatattttaaataatgatttacttaataatttggaaaatata
aatatttataagtctacttttaaagttaggatagaaaacgagaaaataaaagaaattttt
tctaagttccaaaccaaccgattgaataataatctttggaaaatcgataacgttaataaa
aaaatatctaatgtatttaattctgatcaatttatttcttattcaagttattcttcttgg
atacgtaaagataaaaatattgaagcagtcattaatcaatataaggattatgaagataat
atatcaattatcaaagattctaattttaagaattcaaagaactatcctaattatttctct
catccaaatcccttaagtgaatttccaaaaggaactattgctgggacttgcctgcacaaa
ataatagaaagatttgaatttagaaacgataataatcaagaattaattgatttaattatt
gaggaattgaactttcatcaaatcgatacttctttggcttttaaagtaaaagatgcgatt
ttaagaatcataaatatatctttaggaagagaattacaaaataagaaactagttgatatt
ccaaatgaatacttaattaaagaactcaaatatgatttaaccctatcttatgaaggtaga
aatattaactctaatgatatatcaaattgcttttttttagatcaggattatgaatttggt
gaagaatatgcaaataaaataaatgatcttcaaattatgaataaaggctttcattcagga
tgtattgattgtattttccctgtaggaaataaattagaagatagtaaatggtgggtaatt
gattggaaaagtaatttgatttctgatagtgataatagtgattgtttaccaagaaactat
aactatgaaaacatgagaaatgaaatgattaaacatcattatccattgcaatctcatctt
tatttattagcattgcatagattattaaagtggcgacttaaaaattatcaaccacaaaaa
catctaggaggatatatttatttatttttaaagggattgccagattttgaattatttgaa
aaatctaagtctgaagatatatctccaggtatttttattagcaaggcacctttaaaaaga
attaattatttagataaccttttttag

All links

Pathway (1)   
   KEGG PATHWAY (1)   
Chemical reaction (1)   
   KEGG ENZYME (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (7)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   NCBI-GI (1)   
   CYANOBASE-PMB (1)   
   CYORF-PMB (1)   
   JCVI-CMR (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (2)   
   UniProt (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
Protein domain (6)   
   Pfam (6)   
All databases (18)   

Download RDF

DBGET integrated database retrieval system