KEGG   Prochlorococcus marinus MIT 9515: P9515_11931Help
Entry
P9515_11931       CDS       T00465                                 

Gene name
recD
Definition
exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide (EC:3.1.11.5)
Orthology
K03581  
exodeoxyribonuclease V alpha subunit [EC:3.1.11.5]
Organism
pmc  Prochlorococcus marinus MIT 9515
Pathway
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pmc00001]
 Genetic Information Processing
  Replication and repair
   03440 Homologous recombination
    P9515_11931 (recD)
Enzymes [BR:pmc01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.11  Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.11.5  exodeoxyribonuclease V
     P9515_11931 (recD)
BRITE hierarchy
SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT
Motif Motif
Other DBs
NCBI-GI: 
NCBI-GeneID: 
CyanoBase: 
CYORF: 
UniProt: 
Position
complement(1049435..1051126)
Genome map
AA seq 563 aa AA seqDB search
MNYKKQDIEEFEYIHIFNLLKDILKFNEKKYGDYVKDTLKILLELEKNGETIIDVDKTVV
GFELLKDGWPNIHLKVLKDIGLLNSVNSPFVFNNRKLTLVKWSRKIKRVLNAFLKKIDKI
AINSNNDNKLDQIKNIFKSSNLVFLQGGPGTGKTTMIINFILYCLKSDTYLNIGLAAPTG
KATSRLKESLNQQKDILLSNSLDQIECQTLHKWIFNSNNKAIEFKFKLKELDIFIIDEMS
MVNIDIIETILDLIAKDCKIILVGDRNQLSPVKNCSIWNYLFEYSDNKLINSCIVNLKKT
YRNSGDISLLSNLVFNNNNSLFNKKINELEKEKKIKEINILKSNNTNIPIELLNIIKNNL
SKLRKSTSNLSNKKYIFDNNIDNLISHEKDLVNKILFDLQSHLILCEKNTGNWSVEDIND
TVIGKTKPYDFKNLEEGLPIMCTKNNYELGISNGDIGVLIGNNDNRKYLFRKFNDNNELV
VQLIDPSNLENIVPAIAITIHKSQGSESEKVSILWLKKTKLDESINSDKKESENIFFRDN
YEKRLLYTAITRAKKLLDIYYLN
NT seq 1692 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt
atgaattataaaaaacaagatattgaagaatttgaatatattcatatctttaatcttcta
aaggatatacttaaatttaatgaaaaaaaatatggagattatgttaaggacacattaaaa
atattattagaacttgagaaaaatggtgaaaccataatagacgtagataagactgtagta
ggttttgaattattaaaagatggatggcctaatattcatttaaaagttcttaaggatata
ggattattaaattcagttaattccccattcgtatttaataatagaaaattaacattagta
aaatggtctcggaaaataaaaagagttcttaatgccttcttaaaaaaaatagacaaaatt
gcaataaattcgaataatgataataagcttgatcaaataaaaaatatttttaaaagttca
aatttggtttttttgcaaggaggacccggtacaggcaaaacaactatgattataaatttt
atactctattgcttgaaaagtgatacttatttaaacataggacttgccgcacctacaggt
aaagcaacatctcgacttaaagaatctcttaatcaacaaaaagatatccttttaagtaat
agtcttgatcaaatagaatgtcaaactttacataaatggattttcaattctaataataaa
gctattgaatttaaatttaaattaaaggaactagatattttcataattgatgaaatgtca
atggtaaatattgatataatcgaaacaattttagatttaatagctaaagattgcaaaatc
attcttgttggagatagaaatcaattatctccagttaaaaattgttctatatggaattat
ttatttgaatattctgataataaattaataaattcttgtatagttaatctaaaaaaaact
tatagaaatagtggggatatttcattacttagtaatcttgtatttaataataataattct
ttatttaataaaaagatcaatgaattagaaaaagaaaaaaaaatcaaagaaataaatatt
ttaaaaagtaataatacaaatattcctatagagcttttgaatattatcaaaaataatctt
tcaaaattaagaaaatcaacatcaaatttaagtaataaaaaatatatttttgataataat
attgataacttaatatcccatgaaaaagatttagttaataaaattttatttgatttacaa
agtcatttgattttatgcgaaaagaatacaggaaattggagtgttgaagatataaacgat
accgttattggaaaaacaaaaccttatgattttaaaaatcttgaagaaggtttaccaatt
atgtgtactaaaaataattatgagcttggcatatcaaatggagatattggagttttaatt
ggaaataatgataataggaaatacctttttaggaagtttaatgataataatgagcttgtt
gttcagttaatagacccatcaaatttagaaaatatagttccagcaattgcaattacaatt
cataaatcccaagggagtgaatctgagaaagtaagtattttatggcttaaaaaaactaaa
ttagatgaatccataaatagcgataaaaaagaaagtgaaaatatattcttcagggataat
tatgagaaaagattgctttatacagcaataactagagccaagaaacttttagatatttat
tatttaaattaa

DBGET integrated database retrieval system