KEGG T01077: POPTR

Populus trichocarpa (black cottonwood): POPTR_216630

Entry

POPTR_216630 CDS T01077

Definition

hypothetical protein

Organism

pop Populus trichocarpa (black cottonwood)

Class

SSDB

Motif

Pfam:

PPR_2 PPR_1 PPR PPR_3 ECSIT RPM2 SPOB_a ATP13

Other DBs

NCBI-GI:

NCBI-GeneID:

JGI:

UniProt:

AA seq 721 aa
MSTMGYRMDEFTLGCFAHSLCKSGKWREALSLLEKEEFVPDTVLYTKMISGLCEASLFEE
AMDFLTRMRASSCLPNVLTYRILLCGCLNKEKLGRCKRILSMMITEGCYPSPRIFNSLVH
AYCRSGDYAYAYKLLKKMVQCGCQPGYVVYNILIGGICSSEEPGKDVLDLAEKAYGEMLE
AGVVLNKVNISNFSRCLCGIGKFEKAYNVIREMMSKGFIPDTSTYSKVIGYLCNASKVEK
AFQLFQEMKRNGIAPDVYVYTTLIDSFCKAGFIEQARNWFDEMERDGCAPNVVTYTALIH
AYLKSRKVSKANEVYEMMLSKGCTPNIVTYTALIDGLCKAGKIEKASQIYKIMKKENVEI
PDVDMHFRVVDGASNEPNVFTYGALVDGLCKAYQVKEARDLLKSMSVEGCEPNHVVYDAL
IDGCCKAGKLDEAQEVFTTMLECGYDPNVYTYSSLIDRLFKDKRLDLALKVLSKMLENSC
APNVVIYTEMIDGLCKVGKTDEAYKLMVMMEEKGCNPNVVTYTAMIDGFGKSGRVEKCLE
LLQQMSSKGCAPNFVTYRVLINHCCSTGLLDEAHKLLEEMKQTYWPRHVAGYRKVIEGFN
REFIASLYLSFEISENDSVPVAPVYRVLIDNFIKAGRLEIALELNEELSSFSPFSAANQN
IHITLIENLSLAHKADKAFELYADMISRGSIPELSILVHLIKGLLRVNRWEEALQLLDSI
C

NT seq 2163 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgtcaactatggggtatagaatggatgagtttactttgggctgttttgcgcattccctt
tgtaaatcaggaaagtggagagaagccttgtcgttactagagaaggaagaatttgtgcct
gatacagtgctttatacgaagatgatatcagggttatgtgaagcttcgctttttgaagaa
gctatggattttttgaccaggatgcgggctagttcttgccttcctaatgttttgacatat
aggattttgctttgtgggtgtttgaataaggaaaaacttggtagatgtaagagaattctt
agtatgatgatcacagagggctgttatcccagtcctaggatatttaattctcttgttcat
gcttattgcagatctggagattatgcttatgcctataagttgctaaagaaaatggtgcaa
tgtgggtgccagccaggttatgtggtttacaatatattgattggtggtatttgtagcagc
gaggagccaggcaaggatgtgctagacttggctgagaaagcctatggtgaaatgcttgaa
gcaggggttgtactaaataaggtcaacatcagcaatttttctcgatgtctttgtgggatt
ggaaaatttgagaaggcatataatgttatccgtgaaatgatgagtaagggttttatacct
gataccagtacttattcaaaagtgattggttatttgtgcaatgcatccaaagtagagaag
gcttttcaattgtttcaagaaatgaaaaggaatggtattgctccagacgtgtatgtatat
actacactaattgatagtttttgtaaagctggttttatagaacaggctcgcaactggttt
gatgaaatggaaagagatggttgtgccccaaatgttgtgacttatactgctcttatacat
gcttaccttaaatctaggaaggtgtctaaggcaaatgaagtttatgagatgatgctgtcc
aaaggctgtactcctaatattgtcacgtatacagctttaatcgatggtctatgtaaagca
gggaagattgaaaaagctagccagatttacaaaataatgaaaaaggaaaatgtggagatc
ccagatgttgatatgcatttcagggttgttgatggtgcttcaaatgaaccaaatgtcttt
acatatggagctctggttgatggtttgtgcaaagcctatcaggtcaaagaggcacgggat
ttgctaaaatctatgtcagtggaaggttgtgagccaaaccatgtcgtatatgatgccctt
atagatggatgttgcaaggctggcaagctggacgaagcacaagaagtgtttactacaatg
ttggagtgtgggtatgacccaaatgtatatacttacagctctttgattgataggttgttt
aaggataaacggttagatcttgccttgaaagtcttgtccaaaatgctagaaaattcatgt
gctcccaatgttgttatttacaccgagatgattgacggcctctgcaaagtcggaaagaca
gatgaagcttacaagcttatggttatgatggaagaaaaaggatgtaatccaaatgtcgta
acttatactgcaatgattgatggctttggaaaatcagggagagttgaaaaatgccttgag
ctgttgcaacaaatgagttccaagggctgtgctccaaattttgtgacctatagggttttg
ataaaccactgctgttctactggccttttagatgaggctcacaaacttttagaagagatg
aaacagacatactggccaagacatgtagcaggttatcgtaaagtcattgaaggtttcaat
cgtgaatttatagcttctctttatctttcatttgagataagtgagaatgattcagtgcca
gttgctccagtttatagagtcctgattgataattttatcaaggctggaagactagagatt
gctcttgagctgaatgaagagctctcatcattttcaccattttccgctgccaatcagaat
atacacattactttgattgagaatctgtcacttgcacataaagctgataaggcttttgag
ttgtatgcggacatgatcagtaggggcagtattccagagctaagcattttagttcacctt
attaaaggactactcagagtcaacagatgggaagaagccttgcaactgttagatagcata
tgt

All links

Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (5)   
   NCBI-Gene (1)   
   NCBI-GI (1)   
   JGI-POP (1)   
   OC (1)   
   PGDBJ (1)   
Protein sequence (2)   
   UniProt (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (1)   
   RefSeq(nuc) (1)   
Protein domain (8)   
   Pfam (8)   
All databases (17)   

Download RDF

DBGET integrated database retrieval system