ID MYB_LIKE; MATRIX.
AC PS50090;
DT DEC-2001 (CREATED); FEB-2007 (DATA UPDATE); MAR-2013 (INFO UPDATE).
DE Myb-like domain profile.
MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=52;
MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.3846165; R2=0.0116124; TEXT='-LogE';
MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=483; N_SCORE=5.9875995; MODE=1; TEXT='R';
MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=301; N_SCORE=3.8741427; MODE=1; TEXT='R?';
MA /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-40; E1=-40; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA /M: SY='R'; M=-7,1,-24,-2,-1,-21,-6,-2,-22,7,-19,-11,7,-15,0,12,0,-4,-17,-27,-13,-2;
MA /M: SY='P'; M=-5,-9,-28,-6,2,-24,-14,-13,-15,-4,-21,-12,-8,23,-2,-8,-1,-4,-15,-28,-20,-3;
MA /M: SY='N'; M=-9,7,-26,8,6,-22,-6,-2,-24,3,-23,-15,9,-8,0,2,1,-6,-21,-28,-14,2;
MA /M: SY='L'; M=-7,-14,-23,-15,-9,-11,-22,-8,-2,-4,1,1,-11,-17,-7,0,-11,-7,0,-22,-6,-9;
MA /M: SY='K'; M=-5,2,-22,-3,0,-22,-11,-8,-19,13,-21,-11,7,-15,1,11,-1,-4,-14,-26,-14,0;
MA /M: SY='R'; M=-9,-6,-28,-6,3,-23,-12,-8,-27,24,-23,-11,-2,-10,5,30,-5,-7,-19,-21,-13,2;
MA /M: SY='G'; M=-2,-2,-23,-3,-7,-23,21,-13,-26,-6,-23,-14,4,-16,-9,-6,5,-4,-18,-27,-21,-8;
MA /M: SY='P'; M=0,-3,-22,-4,0,-21,-13,-10,-18,2,-20,-13,2,5,-3,1,3,-1,-16,-28,-16,-3;
MA /M: SY='W'; M=-19,-38,-43,-40,-30,21,-23,-28,-13,-22,-13,-15,-36,-30,-23,-21,-36,-26,-22,117,28,-22;
MA /M: SY='T'; M=1,-1,-13,-5,-5,-15,-13,-16,-14,-8,-17,-13,1,-6,-7,-10,21,31,-5,-33,-14,-6;
MA /M: SY='E'; M=-7,0,-27,2,10,-24,-18,-4,-20,10,-19,-10,-2,-3,6,5,-4,-7,-16,-26,-13,7;
MA /M: SY='E'; M=-6,10,-26,17,34,-29,-16,-3,-26,5,-21,-18,1,-2,12,-3,3,-5,-23,-31,-19,23;
MA /M: SY='E'; M=-11,14,-30,24,55,-31,-19,0,-31,9,-21,-21,2,-1,19,-1,0,-10,-30,-31,-20,37;
MA /M: SY='D'; M=-14,25,-27,36,19,-30,-14,-2,-27,0,-20,-18,8,-10,4,-7,0,-5,-21,-34,-16,11;
MA /M: SY='E'; M=-9,1,-27,3,16,-21,-20,-4,-16,4,-10,-7,-2,-12,13,4,-5,-8,-17,-24,-11,14;
MA /M: SY='M'; M=0,-13,-23,-17,-6,-11,-21,-13,-1,-1,0,3,-11,-16,-3,-3,-9,-6,-2,-21,-8,-5;
MA /M: SY='L'; M=-9,-30,-22,-33,-23,12,-32,-23,25,-29,38,18,-27,-27,-22,-22,-26,-9,15,-18,1,-23;
MA /M: SY='I'; M=-7,-21,-23,-24,-14,-4,-29,-18,14,-11,10,8,-18,-19,-12,-10,-15,-7,11,-20,-1,-15;
MA /M: SY='E'; M=-5,4,-24,4,10,-24,-15,-2,-22,10,-18,-11,3,-12,7,8,1,-2,-18,-27,-12,8;
MA /M: SY='L'; M=2,-20,-20,-24,-18,1,-14,-14,4,-20,15,5,-18,-23,-16,-18,-14,-7,2,-14,1,-17;
MA /M: SY='V'; M=-5,-21,-17,-24,-19,-6,-28,-4,13,-16,6,7,-17,-24,-15,-11,-13,-7,17,-25,-2,-19;
MA /M: SY='E'; M=-4,1,-25,-1,12,-24,-14,-1,-21,11,-19,-8,3,-12,12,11,0,-6,-18,-26,-13,11;
MA /I: MD=-15;
MA /M: SY='E'; M=-7,0,-25,-1,13,-21,-18,-5,-16,9,-14,-7,0,-12,8,5,-3,-4,-15,-25,-12,10; D=-1;
MA /I: MD=-15;
MA /M: SY='H'; M=-13,-12,-23,-15,-12,4,-22,13,-3,-13,5,6,-7,-24,-8,-9,-14,-9,-7,-13,13,-11; D=-1;
MA /I: MD=-15;
MA /M: SY='G'; M=-2,-7,-27,-5,-13,-25,39,-16,-29,-14,-24,-16,-2,-8,-14,-16,-1,-15,-23,-20,-23,-14; D=-1;
MA /I: I=-4; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
MA /M: SY='E'; M=-4,-1,-14,-1,3,-14,-8,-1,-13,-1,-11,-6,-1,-3,1,-3,0,0,-11,-18,-8,1; D=-1;
MA /I: DM=-15;
MA /M: SY='N'; M=-7,5,-25,0,-4,-21,3,-5,-18,-6,-19,-12,11,-10,-5,-7,0,-5,-19,-28,-16,-6;
MA /M: SY='R'; M=-10,4,-18,2,0,-20,-13,-2,-21,5,-16,-10,8,-18,4,13,-3,-7,-19,-28,-13,1;
MA /M: SY='W'; M=-20,-39,-49,-39,-30,11,-20,-28,-19,-20,-19,-19,-39,-30,-20,-20,-39,-29,-29,146,32,-20;
MA /M: SY='S'; M=0,2,-21,2,5,-22,-10,-6,-21,5,-20,-14,4,-13,2,6,7,2,-14,-28,-14,3;
MA /M: SY='E'; M=-2,-3,-22,-2,8,-17,-17,-11,-14,2,-11,-9,-5,-13,0,-1,-1,-3,-9,-26,-13,4;
MA /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-37,-29,1,-37,-28,43,-28,21,19,-23,-23,-21,-27,-19,-8,31,-22,-2,-29;
MA /M: SY='A'; M=27,-8,-15,-12,-5,-21,-1,-16,-15,-8,-18,-14,-5,-2,-6,-15,15,3,-7,-27,-20,-6;
MA /M: SY='K'; M=-4,0,-25,1,8,-24,-13,-3,-22,12,-20,-10,1,-10,6,10,0,-5,-17,-26,-13,6;
MA /I: MD=-18;
MA /M: SY='H'; M=-11,-6,-22,-8,-4,-12,-17,12,-15,2,-10,-2,-1,-19,1,7,-8,-9,-15,-20,2,-3; D=-3;
MA /I: MD=-18;
MA /M: SY='L'; M=-2,-24,-18,-29,-21,9,-24,-17,16,-22,23,17,-22,-24,-18,-18,-17,-6,13,-18,1,-19; D=-3;
MA /I: I=-5; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA /M: SY='P'; M=-8,-14,-29,-11,-6,-16,-2,-13,-15,-10,-13,-9,-11,16,-9,-13,-9,-10,-18,-19,-12,-10; D=-3;
MA /I: DM=-18;
MA /M: SY='N'; M=-6,3,-23,-1,-6,-20,8,-4,-23,-4,-20,-13,10,-17,-5,-2,3,-2,-19,-27,-15,-6;
MA /M: SY='R'; M=-18,-8,-30,-8,2,-22,-20,1,-30,32,-22,-10,0,-18,10,60,-10,-9,-20,-20,-9,2;
MA /M: SY='T'; M=-1,-2,0,-9,-9,-15,-14,-16,-13,-11,-16,-11,1,-13,-9,-10,16,24,-6,-34,-15,-9;
MA /M: SY='D'; M=-6,4,-29,10,2,-27,3,-11,-28,-4,-26,-20,0,4,-6,-9,0,-7,-23,-24,-18,-3;
MA /M: SY='K'; M=-8,6,-24,1,5,-20,-16,-4,-16,11,-19,-9,11,-15,4,6,-2,-3,-15,-25,-12,4;
MA /M: SY='Q'; M=-2,6,-23,8,16,-29,-13,-1,-21,3,-21,-10,4,-10,22,0,8,-2,-21,-28,-15,19;
MA /M: SY='C'; M=-9,-23,67,-32,-29,-12,-32,-29,-5,-29,-6,-7,-21,-34,-27,-28,-12,-8,6,-40,-20,-29;
MA /M: SY='R'; M=-12,-7,-28,-8,3,-22,-21,-3,-21,26,-18,-4,-3,-15,11,32,-9,-9,-16,-20,-8,5;
MA /M: SY='N'; M=-10,9,-24,7,5,-13,-15,6,-15,-5,-10,-9,10,-17,-1,-6,-3,-6,-17,-27,-5,2;
MA /M: SY='R'; M=-18,-10,-30,-10,-2,-12,-22,8,-24,21,-18,-7,-3,-20,7,39,-12,-11,-19,-11,7,-1;
MA /M: SY='W'; M=-19,-34,-41,-36,-28,23,-23,-21,-14,-20,-12,-14,-33,-29,-21,-18,-32,-22,-21,104,36,-21;
MA /M: SY='N'; M=-10,3,-23,-2,2,-17,-17,2,-14,3,-12,-6,9,-17,5,8,-4,-4,-16,-26,-9,2;
MA /M: SY='N'; M=-6,7,-21,0,1,-19,-11,-6,-18,7,-20,-12,14,-15,2,7,4,3,-15,-29,-14,1;
MA /M: SY='Y'; M=-11,-17,-22,-19,-16,3,-26,7,4,-16,8,6,-14,-25,-10,-11,-14,-5,1,-11,18,-15;
MA /M: SY='L'; M=-8,-23,-21,-26,-19,5,-27,-16,15,-20,24,13,-21,-23,-17,-16,-20,-8,10,-19,1,-19;
MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
PP /COMPETES_HIT_WITH: PS51294(4); PS51293;
NR /RELEASE=2013_05,540052;
NR /TOTAL=80(66); /POSITIVE=74(60); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=6(6);
NR /FALSE_NEG=41; /PARTIAL=0;
CC /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC /SCALING_DB=reversed;
CC /AUTHOR=K_Hofmann, PS_Langendijk_Genevaux;
CC /TAXO-RANGE=??EPV; /MAX-REPEAT=3;
CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=myb-like;
CC /VERSION=1;
DR Q4IB96, AEF1_GIBZE , T; P22035, BAS1_YEAST , T; Q6DG03, DMTF1_DANRE, T;
DR Q9Y222, DMTF1_HUMAN, T; Q8CE22, DMTF1_MOUSE, T; Q66HG1, DMTF1_RAT , T;
DR Q9NDJ2, DOM_DROME , T; Q4P209, EAF11_USTMA, T; Q756L0, EAF1_ASHGO , T;
DR Q4WP03, EAF1_ASPFU , T; Q5A119, EAF1_CANAL , T; Q6BI82, EAF1_DEBHA , T;
DR Q5B4Q8, EAF1_EMENI , T; Q6CMB8, EAF1_KLULA , T; Q7SBU6, EAF1_NEUCR , T;
DR Q6C7K8, EAF1_YARLI , T; Q06337, EAF1_YEAST , T; O59773, EAF_SCHPO , T;
DR Q96L91, EP400_HUMAN, T; Q8CHI8, EP400_MOUSE, T; O14108, ETA2_SCHPO , T;
DR P34333, GEI8_CAEEL , T; Q3T8J9, GON4L_HUMAN, T; Q9DB00, GON4L_MOUSE, T;
DR Q535K8, GON4L_RAT , T; Q8L727, GSTT2_ARATH, T; Q9FHE1, GSTT3_ARATH, T;
DR Q9C882, GTL1_ARATH , T; Q8H181, GTL2_ARATH , T; Q8IEF6, MYB1_PLAF7 , T;
DR Q54TN2, MYBC_DICDI , T; Q55GK3, MYBM_DICDI , T; Q54CT1, MYBN_DICDI , T;
DR Q54FL0, MYBO_DICDI , T; Q54DP7, MYBR_DICDI , T; Q54DQ3, MYBT_DICDI , T;
DR Q54X08, MYBV_DICDI , T; Q55BV7, MYBW_DICDI , T; Q54Q45, MYBZ_DICDI , T;
DR P01104, MYB_AVIMB , T; Q86VE0, MYPOP_HUMAN, T; Q8R4U1, MYPOP_MOUSE, T;
DR Q08B72, MYPOP_XENLA, T; Q9LZS0, PTL_ARATH , T; P21538, REB1_YEAST , T;
DR P23250, RPI1_YEAST , T; P39650, RSFA_BACSU , T; Q5SXM2, SNPC4_HUMAN, T;
DR Q8BP86, SNPC4_MOUSE, T; Q9FX53, TGT1_ARATH , T; Q39117, TGT2_ARATH , T;
DR Q9SDW0, TGT3A_ARATH, T; O80450, TGT3B_ARATH, T; Q9LU92, TGT4_ARATH , T;
DR Q8GV05, TRY_ARATH , T; Q15361, TTF1_HUMAN , T; Q62187, TTF1_MOUSE , T;
DR P25979, UBF1A_XENLA, T; Q12457, YD026_YEAST, T; P34454, YMA9_CAEEL , T;
DR A6H8Y1, BDP1_HUMAN , N; Q571C7, BDP1_MOUSE , N; Q1LX29, CCD79_DANRE, N;
DR Q8NA31, CCD79_HUMAN, N; Q8C0V1, CCD79_MOUSE, N; Q756C3, CEF1_ASHGO , N;
DR Q6CU65, CEF1_KLULA , N; O22059, CPC_ARATH , N; P0CO99, EAF1_CRYNB , N;
DR P0CO98, EAF1_CRYNJ , N; Q6ZTZ1, MSD1_HUMAN , N; Q8BIL2, MSD1_MOUSE , N;
DR Q5ZHX5, MSD2_CHICK , N; Q6P1R3, MSD2_HUMAN , N; Q6NZR2, MSD2_MOUSE , N;
DR Q0III0, MSD3_BOVIN , N; Q96H12, MSD3_HUMAN , N; Q9CR78, MSD3_MOUSE , N;
DR Q7ZYM8, MSD3_XENLA , N; Q28J92, MSD3_XENTR , N; Q2KJB9, MSD4_BOVIN , N;
DR Q8NCY6, MSD4_HUMAN , N; Q91YU3, MSD4_MOUSE , N; Q501L3, MSD4_RAT , N;
DR Q6GLA1, MSD4_XENTR , N; O15816, MYBB_DICDI , N; Q54NA6, MYBL_DICDI , N;
DR Q54QC0, MYBU_DICDI , N; Q54PP6, MYBY_DICDI , N; Q05950, REB1_KLULA , N;
DR Q9UUI6, RTF_SCHPO , N; P79005, TAZ1_SCHPO , N; Q0VCT3, TE2IP_BOVIN, N;
DR Q7T0L4, TE2IP_CHICK, N; Q6NYJ3, TE2IP_DANRE, N; Q9NYB0, TE2IP_HUMAN, N;
DR Q4R4I0, TE2IP_MACFA, N; Q91VL8, TE2IP_MOUSE, N; Q5EAN7, TE2IP_RAT , N;
DR Q71M44, TE2IP_XENLA, N; B8QB46, TE2IP_XENTR, N;
DR Q61712, DNJC1_MOUSE, F; Q1RMH9, DNJC2_BOVIN, F; P04197, MYB_DROME , F;
DR Q4WNY4, SWC4_ASPFU , F; Q5AAJ7, SWC4_CANAL , F; Q5B4T5, SWC4_EMENI , F;
3D 1H8A; 1UG2; 2EBI; 2JMW;
PR PRU00133;
DO PDOC00037;
//
