GenomeNet

Database: PROSITE
Entry: PS50296
LinkDB: PS50296
Original site: PS50296 
ID   SUI1; MATRIX.
AC   PS50296;
DT   01-DEC-2001 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 22-NOV-2017 INFO UPDATE.
DE   Translation initiation factor SUI1 family profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=71;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=66;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.2859000; R2=0.0154785; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4167.2734375; R2=3.9856045; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=467; H_SCORE=6029; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=337; H_SCORE=5510; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-60; B1=-60; E0=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-21,-35,-29,0,-35,-29,38,-24,16,15,-24,-25,-23,-23,-16,-6,36,-24,-5,-29;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-2,-27,-3,2,-21,-23,17,-14,3,-13,-2,-1,-15,8,2,-7,-7,-14,-25,-2,3;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-29,-26,-38,-29,2,-37,-28,44,-27,18,21,-21,-22,-21,-27,-19,-9,31,-21,-1,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-9,-26,-11,-2,-13,-20,-4,-16,15,-14,-4,-4,-17,3,27,-6,-4,-11,-17,0,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-12,-22,-17,-8,-10,-26,-17,5,-7,3,2,-9,-17,-6,-4,-7,5,4,-24,-7,-9;
MA   /M: SY='Q'; M=0,-3,-23,-4,10,-23,-18,-9,-9,-4,-11,-6,-5,-11,11,-7,1,1,-9,-25,-13,10;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-4,-26,-3,12,-27,-18,-3,-18,12,-18,-4,-3,-7,20,11,-1,-4,-17,-24,-13,16;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-10,-30,-10,-2,-22,-10,-4,-30,23,-22,-11,-1,-15,5,52,-8,-11,-21,-20,-13,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-5,5,-22,-3,-3,-19,-12,-3,-17,7,-19,-11,16,-17,3,20,3,1,-16,-28,-14,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-9,-28,-10,-11,-14,21,-13,-29,1,-24,-13,-3,-18,-11,-4,-4,-13,-21,-14,-9,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-1,-28,-4,-5,-24,12,-5,-32,11,-26,-15,10,-19,-1,27,-4,-12,-25,-23,-18,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,49,-30,-10,0,-10,10,31,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-9,-15,-11,-6,-8,-15,-13,-12,-2,-11,-8,-7,-17,-8,-4,1,6,-5,-22,-4,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-29,-16,-31,-26,1,-30,-25,29,-21,19,16,-27,-27,-24,-19,-16,-4,35,-26,-6,-26;
MA   /M: SY='T'; M=0,-2,-5,-11,-11,-10,-20,-21,-9,-11,-10,-10,-2,-12,-11,-11,18,44,2,-31,-11,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-16,-17,-21,-17,-7,-25,-21,9,-11,3,2,-13,-19,-14,-7,-3,11,14,-26,-8,-17;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-17,-33,-30,0,-33,-30,37,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,43,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,1,-16,1,13,-27,-15,-5,-23,5,-23,-12,2,-10,17,4,11,5,-19,-30,-15,14;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-1,-28,-5,-17,-28,58,-15,-37,-17,-30,-20,10,-20,-17,-17,2,-17,-30,-23,-28,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-22,-33,-24,16,-32,-22,24,-29,35,19,-26,-27,-22,-22,-25,-10,15,-17,3,-23;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=7,8,-24,12,18,-29,-11,-8,-24,2,-21,-18,0,1,4,-8,4,-5,-19,-29,-20,11;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-12,-21,-13,-7,-2,-23,-12,-4,-2,1,0,-12,-19,-9,-4,-9,0,-1,-16,3,-9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-8,14,-28,23,16,-31,7,-6,-32,-4,-23,-20,5,-11,2,-10,1,-11,-26,-30,-21,9;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-23,-24,-28,-21,9,-30,-18,22,-22,15,11,-19,-23,-18,-21,-17,-8,14,-13,9,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-11,29,-27,40,17,-32,-9,-4,-29,0,-25,-23,13,-10,1,-9,2,-7,-23,-35,-19,9;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-23,-25,-23,-13,-1,-27,-15,8,-18,21,10,-23,-7,-11,-15,-21,-8,0,-19,-1,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-7,5,-27,6,12,-25,-17,-6,-26,26,-25,-13,2,-10,8,13,-3,-4,-19,-22,-8,9;
MA   /M: SY='K'; M=-5,3,-25,6,16,-26,-15,-8,-25,19,-23,-14,1,-10,7,11,3,-4,-17,-28,-15,11;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-27,-19,-31,-22,10,-27,-22,20,-26,27,14,-24,-25,-21,-21,-19,-8,15,-18,-1,-22;
MA   /M: SY='A'; M=22,-14,-14,-20,-13,-13,-8,-19,-1,-15,-1,-3,-12,-16,-11,-18,3,0,4,-23,-15,-12;
MA   /M: SY='K'; M=5,-3,-23,-6,3,-25,-13,-11,-24,26,-24,-11,-1,-11,4,19,1,-4,-14,-23,-14,3;
MA   /M: SY='E'; M=-1,0,-23,2,4,-15,-18,-12,-10,-4,-7,-7,-5,-12,-5,-9,-4,-3,-7,-24,-10,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-29,-8,-32,-23,21,-30,-21,12,-30,36,13,-27,-31,-25,-21,-26,-10,6,-17,3,-23;
MA   /M: SY='K'; M=0,-3,-27,-4,5,-29,-11,-10,-26,30,-25,-10,-2,-11,10,19,-5,-9,-19,-20,-13,7;
MA   /M: SY='K'; M=-4,3,-26,2,9,-30,-15,-5,-26,25,-27,-11,4,-11,16,16,2,-5,-20,-25,-13,12;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-3,-29,-3,6,-21,-17,-9,-21,23,-20,-9,-2,-14,4,23,-9,-10,-16,-21,-10,3;
MA   /M: SY='C'; M=-11,-25,31,-34,-28,30,-28,-24,-9,-29,3,-5,-21,-33,-32,-24,-16,-9,-2,-17,2,-28;
MA   /M: SY='A'; M=28,-8,-6,-15,-10,-23,9,-17,-18,-12,-17,-13,-4,-14,-8,-17,9,-3,-9,-25,-22,-9;
MA   /M: SY='C'; M=0,-13,65,-22,-22,-19,-18,-26,-24,-22,-18,-17,-12,-28,-22,-23,1,4,-8,-40,-24,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,3,-23,-1,-11,-26,40,-11,-31,-14,-30,-20,15,-18,-11,-14,11,-7,-26,-29,-26,-11;
MA   /M: SY='G'; M=6,-8,-15,-11,-16,-23,33,-20,-28,-17,-23,-17,-1,-17,-16,-18,8,1,-18,-25,-24,-16;
MA   /M: SY='T'; M=8,0,-10,-7,-6,-15,-10,-16,-14,-10,-18,-14,4,-10,-6,-11,26,33,-4,-33,-15,-6;
MA   /M: SY='V'; M=2,-28,-13,-30,-28,-1,-29,-29,28,-21,12,10,-27,-27,-27,-21,-11,-2,41,-27,-9,-28;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-7,-20,-10,-7,-16,-17,-17,-6,5,-14,-5,-4,-16,-7,-1,0,4,2,-27,-12,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-10,12,-29,15,20,-30,-9,-4,-30,16,-27,-17,9,-4,9,6,-2,-9,-27,-28,-18,14;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='G'; M=-4,6,-24,8,-3,-23,12,-4,-24,-11,-17,-14,5,-16,-8,-13,0,-8,-19,-28,-17,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='P'; M=1,-7,-19,-4,1,-17,-9,-9,-11,-3,-15,-9,-8,30,-1,-8,-2,-4,-14,-16,-14,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='E'; M=-6,3,-15,6,15,-11,-11,-3,-15,6,-11,-8,0,-5,6,1,0,-3,-13,-14,-7,11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-2,-16,0,1,-9,-10,-1,-10,8,-6,-2,-3,-10,0,3,-7,-6,-9,-10,1,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='G'; M=0,-4,-8,-5,-7,-16,15,-5,-20,-3,-17,-10,0,-11,-6,-5,0,-7,-14,-16,-13,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='E'; M=-4,5,-17,10,18,-15,-11,-1,-15,1,-9,-9,-1,-6,7,-3,-1,-5,-14,-17,-7,12; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-7,-19,-5,12,-20,-24,-10,-5,-3,-9,-5,-10,-14,7,-4,-4,-6,-2,-28,-13,8;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-36,-29,1,-36,-29,42,-27,20,17,-24,-24,-23,-26,-18,-7,34,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-2,-27,2,22,-27,-22,-3,-12,2,-11,-5,-6,-11,24,-2,-4,-9,-14,-26,-13,23;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-23,-35,-26,4,-35,-26,35,-28,30,18,-25,-25,-22,-25,-22,-8,25,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-16,39,-29,50,17,-35,-6,-1,-35,-1,-29,-27,22,-5,0,-9,1,-9,-30,-38,-21,8;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-9,-26,-10,0,-18,-23,21,-10,-2,-10,2,-5,-18,17,0,-8,-11,-10,-23,0,7;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-12,-24,-15,-9,-15,-16,-10,-10,8,-12,-2,-5,-20,-3,25,-6,-4,-2,-24,-11,-9;
MA   /M: SY='D'; M=-13,13,-29,19,11,-27,-12,9,-28,8,-23,-15,6,-13,6,3,-5,-11,-24,-25,-6,8;
MA   /M: SY='N'; M=-11,9,-25,8,5,-17,-15,2,-21,5,-16,-11,10,-16,1,6,-3,-7,-19,-28,-10,3;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-33,-27,2,-33,-27,34,-26,23,16,-26,-26,-23,-24,-18,-6,31,-24,-4,-27;
MA   /M: M=-5,-11,-11,-13,-3,-15,-17,-10,-10,-1,-9,-4,-8,-17,-6,-6,-7,-8,-7,-26,-11,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-9,12,-26,16,18,-26,-16,-5,-26,4,-22,-17,4,-9,9,0,3,0,-22,-20,-13,14;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-25,-23,-28,-19,29,-29,-8,7,-23,17,6,-21,-27,-22,-17,-21,-11,2,-1,20,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-32,-22,7,-32,-21,27,-29,40,23,-27,-27,-19,-22,-27,-10,15,-20,0,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-12,-20,-14,-5,-10,-23,-11,2,-12,3,0,-10,-15,-8,-11,-6,1,3,-27,-9,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-6,8,-27,12,29,-30,-16,-2,-27,16,-24,-15,4,-7,18,7,2,-6,-24,-28,-16,23;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-8,-24,-10,2,-17,-21,-6,-10,8,-6,1,-8,-15,5,4,-8,-4,-9,-23,-8,3;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-16,-31,-16,-20,-7,25,-13,-23,-19,-14,-12,-11,-24,-18,-18,-12,-18,-21,10,3,-20;
MA   /I: E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2017_11,556196;
NR   /TOTAL=114(114); /POSITIVE=113(113); /UNKNOWN=1(1); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann, N_Hulo;
CC   /TAXO-RANGE=A?EPV; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=SUI1;
CC   /VERSION=5;
DR   Q75CN1    , DENR_ASHGO , T; A1C8E3    , DENR_ASPCL , T;
DR   Q4WBL6    , DENR_ASPFU , T; A2QHG9    , DENR_ASPNC , T;
DR   Q2TVZ2    , DENR_ASPOR , T; A6SIZ0    , DENR_BOTFB , T;
DR   Q2HJ47    , DENR_BOVIN , T; Q9NAH4    , DENR_CAEEL , T;
DR   Q6FXQ4    , DENR_CANGA , T; Q2H5Z7    , DENR_CHAGB , T;
DR   Q5ZJ39    , DENR_CHICK , T; Q1E556    , DENR_COCIM , T;
DR   P0CR81    , DENR_CRYNB , T; P0CR80    , DENR_CRYNJ , T;
DR   Q6DH65    , DENR_DANRE , T; Q6BH22    , DENR_DEBHA , T;
DR   Q54WG0    , DENR_DICDI , T; Q9VX98    , DENR_DROME , T;
DR   O43583    , DENR_HUMAN , T; Q6CJ30    , DENR_KLULA , T;
DR   A5E3R9    , DENR_LODEL , T; A4QVI3    , DENR_MAGO7 , T;
DR   Q9CQJ6    , DENR_MOUSE , T; A1DAY1    , DENR_NEOFI , T;
DR   Q9P3T4    , DENR_NEUCR , T; A5DGV3    , DENR_PICGU , T;
DR   A3LSY0    , DENR_PICST , T; Q5RFP5    , DENR_PONAB , T;
DR   O42929    , DENR_SCHPO , T; A7TES6    , DENR_VANPO , T;
DR   Q6GLZ1    , DENR_XENLA , T; Q6DFN7    , DENR_XENTR , T;
DR   Q6CA08    , DENR_YARLI , T; A6ZPY2    , DENR_YEAS7 , T;
DR   P47089    , DENR_YEAST , T; O60739    , EIF1B_HUMAN, T;
DR   Q4R4X9    , EIF1B_MACFA, T; Q9CXU9    , EIF1B_MOUSE, T;
DR   P61220    , EIF1B_PIG  , T; Q5E938    , EIF1_BOVIN , T;
DR   P51971    , EIF1_CHICK , T; P41567    , EIF1_HUMAN , T;
DR   P48024    , EIF1_MOUSE , T; Q5RFF4    , EIF1_PONAB , T;
DR   Q58CR3    , EIF2D_BOVIN, T; P41214    , EIF2D_HUMAN, T;
DR   Q61211    , EIF2D_MOUSE, T; Q5RA63    , EIF2D_PONAB, T;
DR   P0CL18    , EIF2D_RABIT, T; Q5PPG7    , EIF2D_RAT  , T;
DR   P42678    , ETIF1_ANOGA, T; Q9VZS3    , ETIF1_DROME, T;
DR   P41568    , SUI11_ARATH, T; Q94JV4    , SUI12_ARATH, T;
DR   Q9YBG9    , SUI1_AERPE , T; O29348    , SUI1_ARCFU , T;
DR   Q755R1    , SUI1_ASHGO , T; Q9SQF4    , SUI1_BRAOL , T;
DR   A0RWW9    , SUI1_CENSY , T; B9LR02    , SUI1_HALLT , T;
DR   Q5UZP9    , SUI1_HALMA , T; B0R868    , SUI1_HALS3 , T;
DR   Q9HME3    , SUI1_HALSA , T; A2BIX0    , SUI1_HYPBU , T;
DR   A8AC05    , SUI1_IGNH4 , T; P56330    , SUI1_MAIZE , T;
DR   Q8TIT3    , SUI1_METAC , T; A7I9K6    , SUI1_METB6 , T;
DR   Q46F27    , SUI1_METBF , T; Q12UF1    , SUI1_METBU , T;
DR   Q2FTC8    , SUI1_METHJ , T; Q57902    , SUI1_METJA , T;
DR   Q8TX33    , SUI1_METKA , T; A2SQ91    , SUI1_METLZ , T;
DR   A4FWB4    , SUI1_METM5 , T; A9A9Q7    , SUI1_METM6 , T;
DR   A6VGZ2    , SUI1_METM7 , T; Q8PYK3    , SUI1_METMA , T;
DR   A3CX23    , SUI1_METMJ , T; Q6LXE5    , SUI1_METMP , T;
DR   B8GDE2    , SUI1_METPE , T; A4YIU6    , SUI1_METS5 , T;
DR   Q2NFW4    , SUI1_METST , T; O26118    , SUI1_METTH , T;
DR   A0B635    , SUI1_METTP , T; P14021    , SUI1_METVA , T;
DR   Q5UQD7    , SUI1_MIMIV , T; Q3IU96    , SUI1_NATPD , T;
DR   A9A389    , SUI1_NITMS , T; A6MZM2    , SUI1_ORYSI , T;
DR   Q0D5W6    , SUI1_ORYSJ , T; Q6L1B9    , SUI1_PICTO , T;
DR   O82569    , SUI1_PIMBR , T; Q9V1U3    , SUI1_PYRAB , T;
DR   Q8ZTB0    , SUI1_PYRAE , T; Q8U006    , SUI1_PYRFU , T;
DR   P58193    , SUI1_PYRHO , T; O48650    , SUI1_SALBA , T;
DR   P79060    , SUI1_SCHPO , T; Q9SM41    , SUI1_SPOST , T;
DR   Q4JAE7    , SUI1_SULAC , T; Q975S0    , SUI1_SULTO , T;
DR   C5A278    , SUI1_THEGJ , T; Q5JDH7    , SUI1_THEKO , T;
DR   B6YSM1    , SUI1_THEON , T; Q97BW9    , SUI1_THEVO , T;
DR   P32911    , SUI1_YEAST , T; Q04600    , TMA64_YEAST, T;
DR   P45116    , Y1225_HAEIN, T; Q55397    , Y546_SYNY3 , T;
DR   P08245    , YCIH_ECOLI , T; P0A2G8    , YCIH_SALTI , T;
DR   P0A2G7    , YCIH_SALTY , T;
DR   Q9VYI3    , RM49_DROME , ?;
3D   1D1R; 2IF1; 2OGH; 2RVH; 3J80; 3J81; 3JAM; 4KZX; 4KZY; 4MO0;
PR   PRU00200;
DO   PDOC00862;
//
DBGET integrated database retrieval system