GenomeNet

Database: PROSITE
Entry: PS50867
LinkDB: PS50867
Original site: PS50867 
ID   PRE_SET; MATRIX.
AC   PS50867;
DT   01-NOV-2002 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 20-DEC-2017 INFO UPDATE.
DE   Pre-SET domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=63;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=58;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1057999; R2=0.0059308; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4844.3583984; R2=3.3438256; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1079; H_SCORE=8452; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=741; H_SCORE=7322; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: M=-8,-9,-12,-12,-6,-8,-21,-13,-8,-6,-10,-6,-6,-13,-4,-7,-2,-1,-5,-25,-9,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-10,-16,-11,-15,-24,33,-13,-28,-18,-25,-15,-2,-15,-14,-18,5,-10,-21,-26,-22,-15;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-19,98,-29,-28,-17,-28,-27,-24,-28,-14,-13,-19,-36,-27,-27,-10,-8,-7,-45,-26,-27;
MA   /M: SY='N'; M=-8,13,-17,13,5,-25,-6,2,-24,-2,-24,-17,14,-15,1,-3,7,-2,-20,-34,-16,3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: I=-2; MD=-9;
MA   /M: SY='K'; M=1,-6,-19,-8,0,-17,-18,-13,-7,2,-10,-5,-6,-13,0,-2,1,2,-2,-24,-11,-1; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-9;
MA   /M: SY='D'; M=-3,14,-23,16,7,-26,11,-7,-28,-4,-24,-19,11,-11,-3,-9,5,-5,-23,-28,-20,2; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9;
MA   /M: SY='D'; M=-3,5,-21,8,5,-22,3,-7,-21,-4,-18,-14,3,-4,-1,-6,3,-5,-17,-24,-17,1; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-19,114,-28,-28,-19,-28,-28,-28,-28,-19,-19,-19,-38,-28,-28,-9,-9,-9,-47,-28,-28; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-6,-17,-8,-5,-10,-9,-11,-9,-9,-6,-3,-2,-15,-4,-7,6,7,-7,-26,-11,-5; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='D'; M=-5,4,-20,7,2,-19,-13,-5,-20,-7,-20,-16,1,5,-5,-11,3,-2,-18,-27,-13,-3; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='S'; M=7,-1,-17,-2,-2,-20,5,-10,-18,-1,-19,-12,2,-10,-1,-4,9,-1,-12,-22,-15,-2; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='B'; M=-2,6,-13,6,5,-13,-7,-4,-11,1,-12,-9,6,-4,0,-3,4,2,-10,-19,-10,2; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='N'; M=-6,10,-22,6,0,-22,-4,-6,-22,9,-25,-15,16,-11,-1,5,5,0,-18,-29,-16,-1; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-17,105,-26,-24,-19,-28,-27,-28,-26,-19,-19,-18,-36,-26,-26,-9,-9,-10,-46,-28,-25; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='A'; M=9,-4,-13,-7,1,-13,-9,-6,-8,-6,-6,-5,-3,-10,0,-8,5,3,-5,-21,-10,0; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-19,114,-28,-28,-19,-28,-28,-28,-28,-19,-19,-19,-38,-28,-28,-9,-9,-9,-47,-28,-28; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='A'; M=6,-14,-21,-18,-12,-13,-7,-14,-2,-15,-2,-2,-11,-11,-10,-17,-5,-6,-2,-18,-12,-12; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-3,-25,-3,5,-24,-12,3,-18,7,-16,-6,-1,-13,15,13,-3,-9,-16,-21,-10,8; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-7,-23,-8,0,-14,-8,-10,-13,1,-3,-2,-6,-16,-1,1,-8,-9,-12,-20,-10,-1; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='N'; M=0,7,-16,-1,-5,-16,-5,-7,-12,-5,-17,-10,15,-10,-4,-7,10,7,-11,-30,-16,-5; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-7,-21,-7,-8,-16,5,-11,-10,-10,-11,-6,-4,-11,-9,-12,-2,-7,-8,-20,-12,-9; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='G'; M=-6,1,-24,0,-1,-22,7,-2,-20,-4,-18,-10,4,-14,-1,-2,-2,-9,-17,-22,-14,-2; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='N'; M=-6,0,-18,-1,-1,-18,-5,-7,-20,-5,-14,-11,2,-11,-4,-3,-5,-9,-18,-26,-15,-3; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-9;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-26,-24,-31,-23,39,-27,-13,3,-22,10,3,-22,-27,-24,-17,-20,-9,-1,15,27,-22;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=11,-6,-20,-8,-1,-21,-7,-14,-16,-3,-18,-13,-4,15,-5,-9,2,-1,-14,-23,-19,-5; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-19,-23,-21,-18,27,-29,10,-3,-11,-1,-2,-18,-28,-13,-9,-17,-8,-8,17,59,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-9,15,-17,17,1,-20,-12,-5,-20,-7,-16,-15,8,-15,-6,-10,5,7,-14,-32,-12,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-1,3,-26,3,-1,-25,6,-11,-25,-1,-23,-16,4,-4,-6,-6,0,-8,-20,-26,-19,-4;
MA   /M: SY='B'; M=-6,9,-25,8,5,-24,-8,-1,-22,3,-18,-12,9,-11,4,1,0,-5,-20,-29,-15,4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-3,-21,-4,-8,-23,26,-11,-24,-7,-22,-13,4,-12,-4,-8,4,-7,-19,-21,-19,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-4,-14,-4,2,-14,-13,-4,-14,5,-8,-5,-3,-13,6,16,-3,-4,-11,-18,-8,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-15,-19,-19,-14,-6,-18,-15,11,-10,6,7,-11,-15,-9,-8,-11,-6,8,-18,-6,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-4,-23,-5,0,-13,-19,-4,-8,4,-5,-3,-1,-16,0,13,-9,-8,-8,-21,-8,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-31,-23,12,-30,-22,20,-25,28,15,-25,-23,-22,-17,-22,-9,15,-18,1,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-6,-1,-17,-6,-4,-16,-14,-6,-8,-5,-11,-6,6,-18,-2,-3,-1,-4,-7,-30,-13,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-6,-20,-4,8,-21,-12,-8,-21,4,-21,-12,-4,1,2,2,2,-4,-18,-26,-13,3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-6,-26,-7,-2,-24,11,-9,-23,-4,-21,-12,-2,-15,-1,-5,1,-10,-19,-18,-16,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-2,-21,-2,1,-18,-16,-9,-17,5,-18,-11,-2,-5,-2,1,-2,-1,-14,-23,-7,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-11,-32,-5,0,-26,-17,-13,-17,-7,-21,-12,-13,45,-5,-15,-7,-7,-21,-29,-22,-6;
MA   /I: I=-4; MD=-22;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-11,-11,-13,-10,-1,-14,-10,5,-11,5,1,-11,-7,-9,-10,-4,2,5,-12,0,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-36,-29,1,-36,-29,41,-27,20,17,-24,-24,-23,-26,-18,-7,34,-23,-3,-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-20,-28,-23,-19,29,-29,9,-1,-10,0,0,-16,-27,-14,-7,-18,-10,-7,14,52,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-7,17,-24,6,-7,-20,15,0,-25,-8,-29,-19,32,-20,-6,-7,6,-6,-28,-22,-18,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-8,2,-27,7,7,-24,-12,-7,-24,3,-23,-15,0,5,2,-2,2,-4,-20,-29,-16,3;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-12,-22,-15,-8,-5,-16,-3,-12,-2,-6,-1,-8,-19,-2,4,-5,-5,-8,-18,-2,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-3,-22,-5,-2,-26,3,-12,-26,6,-27,-15,2,-3,-1,2,5,-3,-20,-27,-19,-3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=-4,0,-20,1,-5,-23,0,-6,-24,-10,-25,-18,2,0,-7,-13,5,-4,-20,-22,-17,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-7,-28,-5,0,-20,-18,-6,-19,5,-17,-8,-6,8,1,9,-4,-5,-17,-25,-12,-2;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='N'; M=-8,12,-22,10,4,-21,-11,4,-21,1,-20,-14,16,-15,4,0,5,0,-20,-26,-11,4; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-9,-24,-9,-3,-20,-10,-8,-21,6,-20,-11,-5,-2,1,10,-4,-6,-17,-21,-9,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-9,33,-19,15,-2,-18,-2,7,-17,-2,-25,-16,51,-20,-1,-2,9,2,-26,-38,-18,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,1,-21,-20,-1,-30,31,-21,-10,0,-19,10,68,-10,-10,-20,-20,-10,1;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-29,-12,-30,-27,1,-30,-27,27,-21,16,12,-28,-29,-27,-20,-12,0,40,-28,-8,-27;
MA   /M: SY='V'; M=2,-23,-11,-25,-24,-3,-25,-26,19,-18,6,5,-22,-25,-23,-18,-2,7,34,-30,-10,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-1,-30,0,19,-37,-20,10,-19,9,-19,-1,-1,-11,56,9,-1,-10,-29,-18,-6,37;
MA   /M: SY='R'; M=-10,3,-19,-2,-1,-18,-13,10,-23,10,-22,-9,10,-17,2,12,0,-2,-19,-28,-7,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-8,-29,-9,-18,-29,62,-18,-38,-17,-30,-20,3,-20,-17,-15,1,-18,-29,-21,-29,-18;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2017_12,556388;
NR   /TOTAL=51(51); /POSITIVE=51(51); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=5; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=window20_shuffled;
CC   /AUTHOR=N_Hulo;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=Pre-SET;
CC   /VERSION=5;
DR   O60016    , CLR4_SCHPO , T; Q8X225    , DIM5_NEUCR , T;
DR   Q9H9B1    , EHMT1_HUMAN, T; Q5DW34    , EHMT1_MOUSE, T;
DR   Q96KQ7    , EHMT2_HUMAN, T; Q9Z148    , EHMT2_MOUSE, T;
DR   P34544    , MET2_CAEEL , T; A8XI75    , SET23_CAEBR, T;
DR   Q95Y12    , SET23_CAEEL, T; Q32KD2    , SETB1_DROME, T;
DR   Q28Z18    , SETB1_DROPS, T; Q15047    , SETB1_HUMAN, T;
DR   O88974    , SETB1_MOUSE, T; Q6INA9    , SETB1_XENLA, T;
DR   Q06ZW3    , SETB2_DANRE, T; Q96T68    , SETB2_HUMAN, T;
DR   Q8C267    , SETB2_MOUSE, T; Q6YI93    , SETB2_XENLA, T;
DR   A4IGY9    , SETB2_XENTR, T; Q0VD24    , SETMR_BOVIN, T;
DR   Q53H47    , SETMR_HUMAN, T; Q80UJ9    , SETMR_MOUSE, T;
DR   Q5I0M0    , SETMR_RAT  , T; Q1L8U8    , STB1A_DANRE, T;
DR   Q08BR4    , STB1B_DANRE, T; P45975    , SUV39_DROME, T;
DR   Q294B9    , SUV39_DROPS, T; Q2NL30    , SUV91_BOVIN, T;
DR   O43463    , SUV91_HUMAN, T; O54864    , SUV91_MOUSE, T;
DR   Q5RB81    , SUV91_PONAB, T; Q6NRE8    , SUV91_XENLA, T;
DR   Q32PH7    , SUV92_BOVIN, T; Q5F3W5    , SUV92_CHICK, T;
DR   Q9H5I1    , SUV92_HUMAN, T; Q4R3E0    , SUV92_MACFA, T;
DR   Q9EQQ0    , SUV92_MOUSE, T; Q28CQ7    , SUV92_XENTR, T;
DR   Q9FF80    , SUVH1_ARATH, T; Q93YF5    , SUVH1_TOBAC, T;
DR   O22781    , SUVH2_ARATH, T; Q9C5P4    , SUVH3_ARATH, T;
DR   Q8GZB6    , SUVH4_ARATH, T; O82175    , SUVH5_ARATH, T;
DR   Q8VZ17    , SUVH6_ARATH, T; Q9C5P1    , SUVH7_ARATH, T;
DR   Q9T0G7    , SUVH9_ARATH, T; Q946J2    , SUVR1_ARATH, T;
DR   Q8W595    , SUVR4_ARATH, T; O64827    , SUVR5_ARATH, T;
DR   Q6DGD3    , SV91A_DANRE, T;
DR   Q5QD03    , SUVH3_CHLRE, N; Q9C5P0    , SUVH8_ARATH, N;
DR   Q3EC60    , SUVHA_ARATH, N; Q9FNC7    , SUVR2_ARATH, N;
DR   Q9SRV2    , SUVR3_ARATH, N;
3D   1ML9; 1MVH; 1MVX; 1PEG; 2IGQ; 2O8J; 2R3A; 2RFI; 3BO5; 3FPD; 3HNA; 3K5K;
3D   3MO0; 3MO2; 3MO5; 3RJW; 3SW9; 3SWC; 4I51; 4NJ5; 4NVQ; 4QEN; 4QEO; 4QEP;
3D   5JHN; 5JIN; 5JIY; 5JJ0; 5T0K; 5T0M; 5TTF; 5TTG; 5TUY; 5TUZ; 5VSC; 5VSD;
3D   5VSE; 5VSF;
PR   PRU00157;
DO   PDOC50280;
//
DBGET integrated database retrieval system