ID SMB_2; MATRIX.
AC PS50958;
DT 01-JUN-2004 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 25-MAY-2022 INFO UPDATE.
DE Somatomedin B (SMB) domain profile.
MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=43;
MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=43;
MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.7050011; R2=0.0046693; TEXT='NScore';
MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=1596.1196289; R2=4.5231690; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=813; H_SCORE=5273; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='!';
MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=813; H_SCORE=5273; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-100; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA /M: SY='E'; M=-4,10,-26,15,19,-28,-14,8,-28,8,-21,-15,4,-10,7,6,-2,-9,-22,-28,-13,12;
MA /M: SY='Q'; M=-2,-13,-25,-13,2,-20,-23,-12,0,-8,-4,0,-13,-5,9,-10,-7,-7,-3,-24,-12,4;
MA /M: SY='G'; M=-5,-2,-27,-5,-3,-21,11,-13,-27,-2,-26,-18,3,-16,-6,-6,1,-5,-24,-5,-14,-4;
MA /M: SY='S'; M=4,-1,-12,-4,-2,-18,-7,-11,-19,-5,-24,-16,6,-11,-1,-1,29,24,-9,-35,-16,-2;
MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA /M: SY='K'; M=-7,2,-26,3,5,-27,-18,5,-23,19,-22,-9,0,-14,9,15,-6,-9,-16,-24,-8,6;
MA /M: SY='G'; M=-7,-5,-30,-3,-11,-17,28,-17,-32,-10,-25,-18,-2,-6,-16,-14,-5,-15,-25,-20,-19,-13;
MA /M: SY='R'; M=-8,-9,-28,-10,-3,-22,-7,-6,-29,21,-21,-11,-1,-18,4,44,-6,-10,-19,-20,-14,-3;
MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA /M: SY='F'; M=-8,-16,-22,-21,-20,20,5,-15,-16,-20,-10,-10,-8,-22,-23,-17,-2,-3,-11,-7,7,-20;
MA /M: SY='E'; M=-3,7,-25,14,37,-26,-18,-6,-21,3,-16,-16,-3,-6,8,-6,0,-8,-17,-30,-19,22;
MA /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA /M: SY='S'; M=1,-10,-23,-12,-7,-20,1,-14,-18,-8,-14,-10,-6,-3,-4,-4,2,1,-15,-25,-17,-7;
MA /M: SY='F'; M=-18,-20,-23,-24,-22,42,-29,-15,4,-25,11,1,-17,-26,-27,-19,-19,-10,0,-1,22,-23;
MA /M: SY='S'; M=-4,6,-19,5,-1,-22,-3,-7,-24,0,-25,-18,12,-14,-1,8,16,9,-17,-33,-17,-2;
MA /I: I=-13; MD=-27;
MA /M: SY='R'; M=-5,-9,-14,-9,-8,-10,-5,-10,-6,4,-8,-3,-7,-13,-6,9,-5,-5,2,-14,-8,-8; D=-13;
MA /I: I=-13; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA /M: SY='H'; M=-13,7,-23,9,-2,-13,-8,10,-19,-3,-11,-9,7,-17,-3,2,-7,-9,-18,-19,1,-4; D=-13;
MA /I: I=-13; DM=-27;
MA /M: SY='H'; M=0,-1,-19,-2,3,-19,-2,9,-21,-1,-18,-10,2,-11,0,-4,6,1,-16,-24,-9,1; D=-13;
MA /I: I=-13; DM=-27;
MA /M: SY='N'; M=-8,0,-21,-8,-6,-12,-19,-9,-3,-6,-1,-2,6,-18,-1,-5,-3,5,-8,-27,-9,-4;
MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA /M: SY='R'; M=-8,-3,-25,-9,-5,-4,-16,11,-17,1,-15,-7,6,-20,3,12,-5,-8,-18,-15,6,-3;
MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA /M: SY='D'; M=-15,43,-26,56,15,-35,-8,0,-35,-1,-30,-28,23,-11,0,-9,6,-5,-27,-40,-20,8;
MA /M: SY='E'; M=3,-1,-23,2,9,-16,-17,-3,-14,-3,-12,-10,-7,-13,4,-9,-2,-6,-11,-17,0,6;
MA /M: SY='A'; M=8,2,-19,-4,-7,-7,-10,-10,-13,-7,-8,-10,4,-17,-10,-6,-1,-5,-10,-22,-11,-8;
MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA /M: SY='K'; M=-10,-2,-24,0,2,-18,-19,-7,-17,11,-18,-8,-2,-16,8,10,-2,-5,-11,-24,-9,5;
MA /M: SY='D'; M=-13,4,-26,11,8,-16,-19,6,-18,-2,-10,-10,-2,-16,0,1,-6,-8,-14,-24,-1,3;
MA /M: SY='Y'; M=-15,-6,-25,-6,-8,2,-23,3,-12,-2,-4,-4,-7,-21,-7,2,-11,-4,-11,-11,15,-9;
MA /M: SY='G'; M=-4,-3,-29,-1,-11,-29,42,-12,-32,-13,-24,-11,0,-18,-7,-15,-2,-17,-26,-22,-24,-9;
MA /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA /M: SY='D'; M=-13,35,-25,41,20,-31,-8,1,-31,1,-28,-25,25,-11,4,-6,7,-4,-28,-38,-20,12;
MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA /M: SY='P'; M=-11,-20,-30,-22,-13,-1,-25,-20,-4,-8,-4,-4,-18,3,-14,-11,-15,-6,-8,-2,-3,-14;
MA /M: SY='D'; M=-19,49,-29,64,17,-37,-9,1,-37,0,-30,-29,25,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA /M: SY='Y'; M=-20,-25,-25,-29,-25,53,-30,2,0,-19,5,0,-20,-30,-24,-15,-20,-10,-5,21,57,-25;
MA /M: SY='E'; M=-9,8,-25,12,22,-28,-16,-3,-26,11,-22,-15,4,-8,16,9,5,0,-22,-29,-15,18;
MA /M: SY='S'; M=-1,7,-21,11,11,-25,-9,-6,-26,3,-24,-19,6,-11,4,8,13,2,-18,-32,-18,7;
MA /M: SY='V'; M=1,-16,-16,-21,-12,3,-24,-21,6,-16,4,0,-15,-19,-17,-16,-3,8,11,-22,-6,-14;
MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA /M: SY='G'; M=2,-13,-20,-14,-14,-15,5,-7,-7,-14,-11,-5,-9,-5,-13,-15,-4,-9,-3,-20,-13,-15; D=-11;
MA /I: I=-11; DM=-23;
MA /M: SY='E'; M=-9,5,-25,11,38,-25,-16,1,-24,11,-16,-13,0,-3,20,9,-1,-8,-24,-22,-14,28; D=-11;
MA /I: I=-11; DM=-23;
MA /M: SY='P'; M=-3,-15,-19,-13,-9,-14,-18,-17,-1,-4,-11,-5,-14,11,-11,-9,-3,-2,5,-25,-15,-11; D=-11;
MA /I: I=-11; DM=-23;
MA /M: SY='T'; M=-1,5,1,3,0,-20,-13,-14,-21,-10,-21,-18,3,-13,-6,-12,19,21,-10,-37,-18,-3;
MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR /RELEASE=2022_02,567483;
NR /TOTAL=60(38); /POSITIVE=60(38); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC /SCALING_DB=reversed;
CC /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=2;
CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=SMB;
CC /VERSION=5;
DR A6QLQ8 , ENDOU_BOVIN, T; P21128 , ENDOU_HUMAN, T;
DR Q3V188 , ENDOU_MOUSE, T; Q9PTU6 , ENDOU_PAROL, T;
DR P22413 , ENPP1_HUMAN, T; P06802 , ENPP1_MOUSE, T;
DR Q924C3 , ENPP1_RAT , T; A1A4K5 , ENPP2_BOVIN, T;
DR Q13822 , ENPP2_HUMAN, T; Q9R1E6 , ENPP2_MOUSE, T;
DR Q64610 , ENPP2_RAT , T; P15396 , ENPP3_BOVIN, T;
DR O14638 , ENPP3_HUMAN, T; Q6DYE8 , ENPP3_MOUSE, T;
DR Q5R5M5 , ENPP3_PONAB, T; P97675 , ENPP3_RAT , T;
DR J3SEZ3 , PDE1_CROAD , T; J3SBP3 , PDE2_CROAD , T;
DR P0DQQ4 , PDE_CRODO , T; W8E7D1 , PDE_MACLB , T;
DR A0A2D0TC04, PDE_NAJAT , T; Q92954 , PRG4_HUMAN , T;
DR Q9JM99 , PRG4_MOUSE , T; Q32L50 , SBSPO_BOVIN, T;
DR Q8IVN8 , SBSPO_HUMAN, T; Q3UPR9 , SBSPO_MOUSE, T;
DR Q9UGT4 , SUSD2_HUMAN, T; Q9DBX3 , SUSD2_MOUSE, T;
DR Q3SZI1 , TINAG_BOVIN, T; Q9UJW2 , TINAG_HUMAN, T;
DR Q9GZM7 , TINAL_HUMAN, T; Q99JR5 , TINAL_MOUSE, T;
DR Q9EQT5 , TINAL_RAT , T; P04004 , VTNC_HUMAN , T;
DR P29788 , VTNC_MOUSE , T; P48819 , VTNC_PIG , T;
DR P22458 , VTNC_RABIT , T; P90850 , YCF2E_CAEEL, T;
3D 1OC0; 1S4G; 1SSU; 2CQW; 2JQ8; 2XR9; 2XRG; 2YS0; 3BT1; 3BT2; 3NKM; 3NKN;
3D 3NKO; 3NKP; 3NKQ; 3NKR; 3WAV; 3WAW; 3WAX; 3WAY; 4B56; 4GTW; 4GTX; 4GTY;
3D 4GTZ; 4K24; 4ZG6; 4ZG7; 4ZG9; 4ZGA; 5DLT; 5DLV; 5DLW; 5GZ4; 5GZ5; 5HRT;
3D 5IJQ; 5IJS; 5INH; 5KXA; 5L0B; 5L0E; 5L0K; 5LIA; 5LQQ; 5M0D; 5M0E; 5M0M;
3D 5M0S; 5M7M; 5MHP; 5OHI; 5OLB; 6C01; 6C02; 6G4G; 6LEH; 6WET; 6WEU; 6WEV;
3D 6WEW; 6WFJ; 6XKD; 6Y5M; 7CBA;
PR PRU00350;
DO PDOC00453;
//
