ID CS; MATRIX.
AC PS51203;
DT MAY-2006 (CREATED); MAY-2006 (DATA UPDATE); MAR-2013 (INFO UPDATE).
DE CS domain profile.
MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=92;
MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=87;
MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.6717743; R2=0.0056106; TEXT='-LogE';
MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1396; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=1039; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA /DEFAULT: M0=-19; D=-100; I=-100; B1=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA /M: SY='M'; M=12,-33,-13,-24,-46,2,-2,-18,3,-17,36,5,9,6,-4,10,13,16,-13,-16;
MA /M: SY='V'; M=-8,-31,-10,0,-60,-13,-7,11,-2,-5,-20,-5,22,25,-1,17,2,25,-69,-57;
MA /M: SY='T'; M=-14,-34,-13,7,0,-16,21,0,10,-18,-60,1,23,12,-13,-15,40,-3,-65,7;
MA /M: SY='P'; M=-6,31,-12,9,-9,-44,-31,-23,16,-14,-36,-27,81,-55,-54,-24,2,-11,-65,-7;
MA /M: SY='R'; M=-11,-61,-12,17,-22,-27,5,-37,38,-42,-60,7,22,-3,52,9,-7,-42,-6,-28;
MA /M: SY='Y'; M=-39,-32,-50,-47,48,-55,34,1,-60,-7,6,-29,-66,-61,-52,-56,-8,22,24,89;
MA /M: SY='D'; M=-14,-33,52,24,-20,-52,-28,-40,9,-3,-38,-34,-56,1,-10,31,29,-30,-67,2;
MA /M: SY='W'; M=-77,-54,-71,-41,31,-49,-19,-46,-62,-28,-69,-84,-66,-59,-51,-47,-80,-53,166,-7;
MA /M: SY='Y'; M=33,-12,9,-7,14,-24,17,-46,-23,-54,-61,-19,-58,-11,-9,25,34,-56,-59,54;
MA /M: SY='Q'; M=-49,-58,8,23,-75,-64,-48,-68,-51,-52,-64,-43,-53,122,-34,-42,-60,-74,-61,-58;
MA /M: SY='T'; M=-52,3,21,-24,-64,-18,-31,-63,-31,-58,-64,2,-56,-38,43,45,72,-58,-72,-59;
MA /I: I=-22; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA /M: SY='P'; M=-18,-59,29,29,-49,0,12,-18,12,5,-36,12,41,-40,-36,15,-19,-39,-67,-28;
MA /M: SY='D'; M=-32,-58,58,42,-52,-4,-15,-67,20,-60,-64,33,-54,6,-26,21,14,-65,-69,-44;
MA /M: SY='E'; M=-29,0,41,45,24,-62,13,-35,4,-41,-62,14,-56,14,-43,-1,19,-31,-8,19;
MA /I: I=-18; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA /M: SY='V'; M=-30,-32,-61,-64,-48,-65,-60,50,-63,27,-7,-58,-70,-66,-59,-56,-52,75,-72,-48;
MA /M: SY='Y'; M=-58,0,-8,19,32,-54,-2,-13,-7,-23,-38,22,-60,-38,-38,-37,52,5,-57,56;
MA /M: SY='I'; M=-23,-30,-62,-62,-5,-64,-58,57,-61,42,24,-57,-70,-64,-60,-57,-54,51,-69,-47;
MA /M: SY='T'; M=-13,-3,-19,-2,-13,-61,-15,-48,-3,-24,-16,25,-38,-3,12,28,54,-18,-65,32;
MA /M: SY='I'; M=-37,-58,-66,-66,41,-64,-60,73,-63,17,-54,-56,-70,-65,-60,-55,-41,45,-66,-33;
MA /M: SY='Y'; M=-47,0,17,-1,22,-62,10,-63,16,-18,-44,6,45,-26,18,-2,-4,-38,-56,54;
MA /I: I=-28; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA /M: SY='V'; M=5,-11,-59,-60,-8,-54,-36,30,-50,40,7,-58,-68,-62,-26,-34,-3,50,-69,-17;
MA /I: I=-11; MD=-12;
MA /M: SY='P'; M=-27,-65,-21,5,-30,-29,-4,-57,46,-64,-66,-11,77,-5,-13,16,-3,-49,-68,-41; D=-11;
MA /I: I=-11; MD=-12;
MA /M: SY='N'; M=-25,-71,19,5,-55,20,-38,-38,11,-43,-19,31,6,-14,-29,-5,-67,-51,-70,16; D=-11;
MA /I: I=-11; MD=-12;
MA /M: SY='G'; M=-37,-86,-11,-22,-85,8,-81,1,-22,-27,-85,-24,-33,-81,-19,-18,-38,-48,-19,-35; D=-11;
MA /I: I=-11; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
MA /M: SY='V'; M=1,-36,-52,-23,-11,-56,-27,14,-42,5,10,-65,-37,-21,-28,-40,15,37,-78,-29; D=-11;
MA /I: I=-11; DM=-12;
MA /M: SY='D'; M=-47,-41,51,-40,-66,-60,-14,-39,40,-35,-63,36,-4,0,13,22,19,-30,-22,-61; D=-11;
MA /I: I=-11; DM=-12;
MA /M: SY='P'; M=25,21,-32,4,-63,-16,-3,-4,36,-35,-38,-55,39,-12,-3,18,-9,-7,-68,-44;
MA /M: SY='K'; M=-27,-60,32,37,-44,-12,-54,-56,55,-60,-60,-9,-40,-36,13,35,0,-40,-66,-38;
MA /M: SY='D'; M=-32,-4,77,18,-39,-23,-26,-67,7,-44,-44,43,-57,-3,-35,17,-14,-42,-71,-25;
MA /M: SY='V'; M=-13,-21,-58,-12,-6,-63,-56,40,-58,26,-8,-43,16,-29,-46,-19,-24,51,-67,-4;
MA /M: SY='K'; M=-33,-59,33,20,-24,-60,-16,-15,43,-38,-59,30,-56,39,3,8,-3,-4,-25,-58;
MA /M: SY='V'; M=-15,23,-43,-64,-6,-53,-61,57,-62,-5,-37,-57,-69,-45,-58,-36,-32,68,-68,-6;
MA /M: SY='D'; M=-45,-58,47,43,-33,-49,-14,-12,29,-32,-11,28,-56,-11,0,-11,10,-8,-67,-9;
MA /M: SY='F'; M=-24,-17,-66,-64,66,-35,-60,60,-47,15,-10,-55,-49,-42,-58,-35,-25,23,-61,-45;
MA /M: SY='T'; M=-26,-59,11,26,-45,-15,-55,-50,31,-36,-60,16,-54,27,-15,15,59,-30,-70,-60;
MA /M: SY='P'; M=-22,-25,34,38,-51,-11,-31,-52,25,-50,-17,24,41,-5,-25,21,-7,-29,-68,-63;
MA /I: I=-26; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA /M: SY='N'; M=-43,-59,42,-5,-45,-36,19,-41,19,-28,-60,54,-57,24,18,9,33,-45,-73,-60;
MA /M: SY='H'; M=-24,-14,-10,-11,-1,-41,59,-33,16,-40,8,5,-36,-18,-2,52,19,-26,-67,4;
MA /M: SY='L'; M=-48,-11,-63,-62,50,-65,-58,44,-62,54,-16,-58,-70,-65,-59,-42,-56,28,-63,-42;
MA /M: SY='S'; M=-54,-1,-6,15,-18,-60,29,-27,38,-31,-59,4,-56,-16,14,44,28,-19,-67,-5;
MA /M: SY='F'; M=-15,-60,-65,-65,61,-41,-60,42,-61,17,2,-57,-71,-66,-41,-55,-56,55,-62,-28;
MA /M: SY='S'; M=-26,-15,-10,2,-7,-17,8,-31,26,-41,-35,9,-36,1,1,56,2,-14,-65,6;
MA /I: I=-6; MD=-7;
MA /M: SY='I'; M=24,22,-61,-60,32,-3,5,39,-60,13,8,-27,-31,-45,-42,-30,-58,11,-63,7; D=-6;
MA /I: I=-6; MD=-7;
MA /M: SY='K'; M=-42,-69,-40,-18,-45,-55,11,-15,50,-11,-22,-25,19,-7,3,-14,-1,2,-73,-21; D=-6;
MA /I: I=-6; MD=-7;
MA /M: SY='N'; M=-36,-81,-25,-52,-25,6,-39,-22,-76,-18,-38,16,-37,-3,-59,11,-14,-23,-88,-79; D=-6;
MA /I: I=-6; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7;
MA /M: SY='P'; M=-21,-87,11,-34,-44,-7,8,-45,-7,-70,-87,-2,12,-27,-58,-12,-42,-53,-92,-86; D=-6;
MA /I: I=-6; DM=-7;
MA /M: SY='D'; M=-34,-79,25,-1,-85,25,-6,-82,-16,-59,-44,21,-8,-47,-36,-27,-16,-68,-82,-42; D=-6;
MA /I: I=-6; DM=-7;
MA /M: SY='N'; M=-54,-69,1,13,-74,32,-10,-72,15,-45,-70,34,12,7,-11,-8,-27,-49,-71,-29; D=-6;
MA /I: I=-6; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7;
MA /M: SY='N'; M=-24,-59,16,26,-49,-2,19,-43,31,-35,-21,42,13,-2,6,10,-11,-20,-68,-42;
MA /M: SY='Y'; M=-30,-61,6,31,-24,-21,16,-31,21,-36,-35,-27,29,19,11,1,4,-6,-60,35;
MA /M: SY='Y'; M=-39,-35,-59,-58,34,-65,-3,8,-15,-10,-60,-36,11,-4,6,-7,-12,15,-18,82;
MA /M: SY='Y'; M=-35,-9,-26,21,28,-56,18,30,-1,22,-37,-23,-61,14,-37,-9,-46,2,-58,36;
MA /M: SY='F'; M=-26,16,-16,-58,50,-55,-58,18,-16,41,-34,-2,-46,-44,-10,-24,-42,8,42,-6;
MA /M: SY='D'; M=-46,-58,44,33,-64,-27,24,-24,9,-18,-61,25,-56,14,-26,17,19,0,-69,-14;
MA /M: SY='G'; M=-13,-29,-3,-33,0,38,-14,16,-5,30,-10,-10,-21,-40,-5,-53,-45,-4,19,-16;
MA /M: SY='E'; M=-40,-29,43,44,-7,-51,13,-67,34,-49,-11,11,7,21,8,-21,10,-36,-67,-59;
MA /M: SY='L'; M=-48,-53,-59,-57,55,-66,-56,-38,-61,76,-50,-59,-24,-63,-59,-57,-20,-48,-60,-22;
MA /M: SY='Y'; M=-18,7,-61,-39,64,-51,15,-59,-35,-5,-63,-17,6,-38,-14,9,-32,-57,56,75;
MA /M: SY='H'; M=24,-62,32,0,-48,31,48,-65,29,-52,-60,29,-55,-23,-27,16,-44,-64,2,-64;
MA /M: SY='P'; M=-9,-34,5,46,-66,-59,-29,-29,21,-19,-64,3,61,-18,8,14,-21,-33,-68,-61;
MA /M: SY='I'; M=-54,-59,-43,-67,-51,-62,-61,88,-64,-26,-54,-55,-69,-65,-62,-55,-42,57,-72,-52;
MA /M: SY='D'; M=-30,-14,70,-10,-65,-49,-31,-4,29,-23,-61,48,-59,-14,-53,-10,-34,17,-74,-60;
MA /M: SY='P'; M=-10,-1,20,9,-33,-38,-4,-38,-10,-35,-68,-47,78,-56,-55,19,3,18,-70,-60;
MA /M: SY='E'; M=1,-54,55,69,-55,-38,-27,-68,-4,-59,-64,26,-53,-7,-42,18,-26,-42,-69,-64;
MA /M: SY='E'; M=-2,15,48,48,-35,-12,-54,-65,16,-24,-62,6,-40,7,-14,9,-7,-23,-67,-61;
MA /M: SY='S'; M=5,56,-18,-31,-43,-44,-54,-59,-53,-41,-68,-53,-44,-41,-39,85,-2,-6,-71,-18;
MA /I: I=-20; MD=-21;
MA /M: SY='T'; M=-25,-38,-55,-10,-9,-62,-17,-25,37,-34,-9,-40,-58,-13,7,40,45,0,-13,3; D=-20;
MA /I: I=-20; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA /M: SY='W'; M=-16,-9,-30,-57,17,-58,25,0,-25,-46,-62,-51,-64,-28,-30,-37,-18,18,129,58;
MA /M: SY='T'; M=-39,-7,-21,-39,-19,-51,2,-41,44,-45,-36,31,-36,15,15,11,53,3,-70,-28;
MA /M: SY='I'; M=-22,-36,-45,-41,8,-52,-5,54,-59,16,26,-20,-45,-61,-16,-55,-2,44,-26,2;
MA /M: SY='E'; M=-16,-58,26,41,-19,-25,-3,-33,17,-11,-8,-7,-55,-9,-5,15,34,-36,-65,5;
MA /I: I=-7; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8;
MA /M: SY='G'; M=-24,-28,35,8,-69,41,-55,-64,5,-47,-35,-11,30,9,-45,30,-6,-14,-65,-64; D=-7;
MA /I: I=-7; DM=-8;
MA /M: SY='R'; M=-48,-62,11,-15,-26,16,-18,-64,39,-33,-15,33,-44,-22,46,9,26,-50,-65,-31;
MA /M: SY='K'; M=-38,43,-29,6,-13,-20,-14,-7,46,-11,1,-2,-57,19,17,1,7,-17,-63,-10;
MA /M: SY='I'; M=-42,-57,-62,-41,-2,-64,-58,61,-62,41,-30,-40,-54,-63,-33,-56,-54,49,-67,-10;
MA /M: SY='E'; M=-34,-36,-1,60,-4,-63,39,-6,-28,-30,-60,7,-56,10,-23,0,14,19,-65,-5;
MA /M: SY='I'; M=-42,7,-64,-63,28,-64,-59,70,-62,34,-14,-56,-69,-64,-33,-47,-56,32,-65,-26;
MA /M: SY='T'; M=-42,14,-21,-13,-28,-61,17,5,33,-25,-35,8,-58,-7,-3,19,47,19,-70,-23;
MA /M: SY='L'; M=-50,-12,-58,-57,-22,-65,-54,18,-60,74,37,-59,-69,-61,-33,-59,-55,6,-65,-28;
MA /I: I=-28; MD=-29;
MA /M: SY='R'; M=-4,-61,-18,20,-18,-63,-31,-17,25,-49,-19,-57,25,37,44,-9,5,4,-65,-31; D=-28;
MA /I: I=-28; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA /M: SY='K'; M=-55,-67,-49,-34,-60,-58,-58,-68,107,-63,-47,-49,-47,-54,-39,-28,-62,-67,-64,-60;
MA /I: I=-18; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA /M: SY='K'; M=21,-66,-42,-10,-64,-54,-60,-5,55,-21,-8,-14,-32,29,-10,-4,-48,-8,-11,-63; D=-18;
MA /I: I=-18; DM=-18;
MA /M: SY='E'; M=-24,-37,27,56,-68,-21,6,-49,23,-45,-60,27,-43,16,-13,-6,24,-13,-68,-61;
MA /M: SY='P'; M=-20,-27,-16,40,-46,-34,-6,-39,26,-26,-64,1,65,27,-12,19,-30,-67,-65,-32;
MA /I: I=-17; MD=-18;
MA /M: SY='G'; M=-7,-33,-15,8,-9,50,-34,-7,7,-39,35,22,-18,0,-42,-14,-5,-46,-62,-40; D=-17;
MA /I: I=-17; MD=-18;
MA /M: SY='E'; M=-61,-72,-5,44,-84,-80,-2,-46,-33,-24,-78,-16,-4,29,-69,-38,-17,-2,-85,-75; D=-17;
MA /I: I=-17; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA /M: SY='W'; M=-36,-1,-58,-21,-13,-38,24,-10,16,-34,5,-15,-28,0,19,10,-1,-19,107,38;
MA /M: SY='W'; M=-79,-53,-72,-55,11,-38,-71,-70,-62,-62,-72,-90,-65,-59,-50,-42,-84,-75,172,-21;
MA /M: SY='P'; M=-12,-61,14,24,-68,-25,-48,-66,18,-31,-33,6,80,-26,-53,24,-7,-43,-69,-63;
MA /M: SY='R'; M=-21,48,14,-30,-33,-28,14,-64,-2,-45,-63,3,-58,23,53,35,22,-33,-65,-18;
MA /M: SY='L'; M=-35,-13,-56,-56,-30,-65,-56,-3,-62,76,-49,-60,-28,-62,-60,-59,-54,28,-23,-18;
MA /M: SY='T'; M=-56,-14,10,38,29,-36,0,13,-17,14,-58,5,-59,-40,-33,-29,39,7,-66,-52;
MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
PP /COMPETES_HIT_WITH: PS01031;
NR /RELEASE=2013_05,540052;
NR /TOTAL=103(100); /POSITIVE=102(99); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=1(1);
NR /FALSE_NEG=5; /PARTIAL=0;
CC /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC /SCALING_DB=reversed;
CC /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=2;
CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=CS;
CC /VERSION=1;
DR Q9LV09, BOB1_ARATH , T; Q9STN7, BOB2_ARATH , T; Q29RL2, CHRD1_BOVIN, T;
DR Q5ZML4, CHRD1_CHICK, T; Q7T3F7, CHRD1_DANRE, T; Q9VCC0, CHRD1_DROME, T;
DR Q9UHD1, CHRD1_HUMAN, T; Q4R7U2, CHRD1_MACFA, T; Q9D1P4, CHRD1_MOUSE, T;
DR A9YUB1, CHRD1_PIG , T; Q5RD91, CHRD1_PONAB, T; D4A4T9, CHRD1_RAT , T;
DR Q6NUA0, CHRD1_XENLA, T; Q3T168, CYBP_BOVIN , T; Q9HB71, CYBP_HUMAN , T;
DR Q4R4P3, CYBP_MACFA , T; Q9CXW3, CYBP_MOUSE , T; Q5R6Z8, CYBP_PONAB , T;
DR Q6AYK6, CYBP_RAT , T; Q863A5, DYXC1_GORGO, T; Q8WXU2, DYXC1_HUMAN, T;
DR Q8R368, DYXC1_MOUSE, T; Q863A6, DYXC1_PANPA, T; Q863A7, DYXC1_PANTR, T;
DR Q863A4, DYXC1_PONPY, T; Q5VJS5, DYXC1_RAT , T; O59709, GIT7_SCHPO , T;
DR A7YY55, HACD3_BOVIN, T; Q9P035, HACD3_HUMAN, T; Q8K2C9, HACD3_MOUSE, T;
DR Q5ZM57, HACD_CHICK , T; Q7SY06, HADC_DANRE , T; Q9UKP3, ITBP2_HUMAN, T;
DR Q9R000, ITBP2_MOUSE, T; Q462R2, ITBP2_PIG , T; Q32LH7, NB5R4_BOVIN, T;
DR Q502I6, NB5R4_DANRE, T; Q7L1T6, NB5R4_HUMAN, T; Q3TDX8, NB5R4_MOUSE, T;
DR Q68EJ0, NB5R4_RAT , T; Q28CZ9, NB5R4_XENTR, T; Q503C8, NUDC1_DANRE, T;
DR Q96RS6, NUDC1_HUMAN, T; Q6PIP5, NUDC1_MOUSE, T; Q7T0S2, NUDC1_XENLA, T;
DR Q28IB1, NUDC1_XENTR, T; Q8WVJ2, NUDC2_HUMAN, T; Q9CQ48, NUDC2_MOUSE, T;
DR Q5M823, NUDC2_RAT , T; Q8IVD9, NUDC3_HUMAN, T; Q8R1N4, NUDC3_MOUSE, T;
DR Q5RB75, NUDC3_PONAB, T; Q17QG2, NUDC_BOVIN , T; Q5ZIN1, NUDC_CHICK , T;
DR Q54M64, NUDC_DICDI , T; P17624, NUDC_EMENI , T; Q9Y266, NUDC_HUMAN , T;
DR O35685, NUDC_MOUSE , T; Q63525, NUDC_RAT , T; O60166, NUDC_SCHPO , T;
DR Q5NVQ2, PTAD1_PONAB, T; E9PB15, PTG3L_HUMAN, T; Q9D9A7, PTG3L_MOUSE, T;
DR P28707, SBA1_YEAST , T; Q9SUR9, SGT1A_ARATH, T; Q9SUT5, SGT1B_ARATH, T;
DR Q0JL44, SGT1_ORYSJ , T; Q08446, SGT1_YEAST , T; Q3MHH1, SHQ1_BOVIN , T;
DR A1L1R0, SHQ1_DANRE , T; Q6PI26, SHQ1_HUMAN , T; Q7TMX5, SHQ1_MOUSE , T;
DR O43076, SHQ1_SCHPO , T; Q05B18, SHQ1_XENTR , T; P40486, SHQ1_YEAST , T;
DR Q2KIK0, SUGT1_BOVIN, T; Q55ED0, SUGT1_DICDI, T; Q9Y2Z0, SUGT1_HUMAN, T;
DR Q9CX34, SUGT1_MOUSE, T; B0BN85, SUGT1_RAT , T; Q9CWU0, TDR12_MOUSE, T;
DR Q3ZBF7, TEBP_BOVIN , T; Q90955, TEBP_CHICK , T; Q15185, TEBP_HUMAN , T;
DR Q6PWL5, TEBP_MACFA , T; Q9R0Q7, TEBP_MOUSE , T; Q5NVM4, TEBP_PONAB , T;
DR P83868, TEBP_RAT , T; Q86X45, TILB_HUMAN , T; Q4R3F0, TILB_MACFA , T;
DR O94966, UBP19_HUMAN, T; Q3UJD6, UBP19_MOUSE, T; Q6J1Y9, UBP19_RAT , T;
DR Q11118, WOS2_SCHPO , T; Q6ID70, Y3377_ARATH, T; P0C8Z0, Y8359_ORYSI, T;
DR Q6YYB0, Y8359_ORYSJ, T; Q9VH95, YC17_DROME , T; Q23280, YOCA_CAEEL , T;
DR Q1RMR5, TILB_BOVIN , N; B3DH20, TILB_DANRE , N; Q9VR52, TILB_DROME , N;
DR O88978, TILB_MOUSE , N; Q28FY0, TILB_XENTR , N;
DR O82290, SKL2_ARATH , F;
3D 1EJF; 1LG0; 1RL1; 1WFI; 1WGV; 1WH0; 1X5M; 2CG9; 2CR0; 2JKI; 2K8Q; 2KMW;
3D 2RH0; 2XCM; 3EUD; 3QOR;
PR PRU00547;
DO PDOC51203;
//
