ID   G_PROTEIN_GAMMA; MATRIX.
AC   PS50058;
DT   NOV-1997 (CREATED); NOV-1997 (DATA UPDATE); MAR-2013 (INFO UPDATE).
DE   G-protein gamma subunit domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=66;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=61;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-.1439; R2=.01493742; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=578; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=444; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='N'; M=0,6,-19,0,-6,-19,7,5,-19,-9,-23,-9,18,-16,-3,-8,13,0,-18,-33,-16,-5;
MA   /M: SY='T'; M=5,-9,-16,-16,-13,-12,-10,-18,-1,-15,-8,-2,-4,-14,-10,-16,11,16,2,-28,-12,-13;
MA   /M: SY='S'; M=8,4,-18,0,10,-22,-9,-6,-17,-3,-18,-10,7,-10,7,-7,13,5,-15,-30,-17,8;
MA   /M: SY='S'; M=-2,16,-19,18,11,-26,-6,-4,-26,0,-29,-21,17,-10,3,-4,20,6,-19,-37,-19,7;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-28,-21,-33,-24,2,-31,-25,30,-27,28,16,-25,-25,-21,-24,-20,-8,22,-21,-3,-24;
MA   /M: SY='A'; M=19,-6,-16,-10,-4,-23,-2,-14,-16,-8,-19,-13,-3,-2,0,-13,16,8,-10,-27,-19,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=1,2,-26,4,29,-32,-16,1,-22,6,-18,-9,-2,-6,32,1,2,-8,-24,-24,-16,31;
MA   /I: I=-5; MI=-5; IM=-5; B1=0;
MA   /M: SY='L'; M=11,-19,-19,-24,-13,-8,-19,-16,9,-17,15,11,-18,-19,-6,-17,-11,-6,5,-20,-8,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,6,-26,-20,-4,-29,38,-25,-9,0,-15,14,47,-9,-10,-21,-20,-10,8;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-11,-23,-15,-6,-17,-19,-9,-8,18,-9,10,-9,-16,1,14,-10,-8,-3,-21,-9,-3;
MA   /M: SY='T'; M=0,-10,-18,-10,3,-11,-20,-15,-2,-10,1,-1,-12,-15,-6,-12,-1,4,3,-28,-12,-2;
MA   /M: SY='V'; M=0,-27,-10,-28,-28,-1,-29,-29,26,-19,8,8,-27,-28,-28,-19,-7,6,44,-30,-10,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-11,12,-30,22,50,-32,-19,1,-30,9,-21,-18,2,-2,24,0,0,-10,-30,-30,-19,37;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-6,-13,-7,2,-25,-21,-8,-30,33,-25,-11,-2,-17,6,39,-10,-10,-19,-23,-12,2;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-16,-24,-20,-10,-10,-22,-13,2,3,7,12,-14,-19,-5,3,-15,-9,0,-20,-6,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='A'; M=33,-17,-10,-23,-17,-13,-10,-23,3,-13,-3,-3,-17,-17,-17,-20,3,0,17,-23,-17,-17;
MA   /M: SY='N'; M=2,4,-11,-3,-7,-23,9,-11,-25,-2,-25,-16,12,-17,-7,-6,7,0,-19,-30,-20,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-23,-24,-30,-23,1,-31,-21,31,-25,24,18,-17,-24,-18,-22,-20,-8,18,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-13,18,-22,25,26,-33,-16,-1,-29,2,-25,-19,8,0,15,-4,0,-9,-29,-33,-20,20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='M'; M=-3,-18,-23,-23,-13,-12,-26,-15,15,-7,3,16,-15,-18,0,-10,-11,-8,11,-22,-6,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-6,-26,-7,3,-21,-22,-11,-18,26,-12,-4,-6,-14,6,15,-10,-4,-13,-21,-8,4;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,2,-30,4,24,-33,-20,-2,-27,29,-25,-9,0,-8,28,17,-5,-10,-25,-22,-12,26;
MA   /M: SY='A'; M=25,-12,12,-20,-15,-17,-10,-22,-10,-15,-12,-11,-11,-17,-15,-20,8,5,3,-29,-20,-15;
MA   /M: SY='A'; M=21,-9,15,-15,-12,-21,0,-19,-20,-15,-20,-16,-5,-17,-12,-19,14,2,-8,-32,-23,-12;
MA   /M: SY='A'; M=23,-4,-17,-7,7,-24,-7,-14,-19,6,-18,-13,-4,-8,0,-5,7,-2,-10,-24,-18,4;
MA   /M: SY='E'; M=-13,21,-30,33,43,-33,-17,-1,-33,11,-24,-22,6,-4,13,0,-1,-10,-29,-32,-19,28;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-32,-23,10,-31,-20,24,-27,38,23,-27,-27,-19,-21,-26,-10,15,-19,1,-22;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-15,-24,-18,-7,-10,-23,-7,-1,6,8,21,-14,-19,3,7,-17,-10,-4,-20,-4,-3;
MA   /M: SY='D'; M=1,16,-22,18,8,-30,-9,-4,-25,3,-24,-16,10,-11,9,-4,7,-1,-20,-30,-17,8;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,44,-30,9,0,-16,3,0,-20,-30,-18,-13,-20,-10,-7,24,66,-23;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-24,69,-32,-30,-13,-32,-30,-5,-28,-7,-7,-22,-35,-28,-28,-12,-8,8,-41,-21,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-9,5,-26,11,37,-22,-20,-4,-20,2,-10,-10,-3,-6,11,-4,-2,-4,-20,-29,-16,24;
MA   /M: SY='E'; M=6,1,-24,1,23,-28,-15,-5,-21,8,-18,-11,-2,-7,19,0,3,-3,-19,-24,-16,21;
MA   /M: SY='H'; M=-16,10,-27,6,5,-21,-14,49,-27,1,-23,-9,21,-18,8,12,-3,-12,-28,-31,0,4;
MA   /M: SY='A'; M=27,-6,-14,-11,0,-21,-6,-16,-13,-2,-15,-11,-6,-10,-4,-11,10,1,-4,-25,-18,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-7,-9,-9,-5,-27,2,-10,-28,3,-23,-12,-3,-18,5,9,-2,-6,-21,-25,-18,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-12,21,-27,20,28,-27,-13,12,-27,7,-25,-18,22,-10,10,2,2,-8,-29,-33,-16,19;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-19,-34,-14,-5,-20,-20,-14,-13,-10,-20,-8,-19,57,-9,-18,-11,-9,-21,-22,-14,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-30,-18,-31,-25,5,-31,-25,27,-26,32,16,-29,-29,-24,-21,-22,-6,27,-24,-4,-25;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-7,-17,-12,-8,-14,-21,-17,-5,3,-11,-2,-6,-14,-7,-2,5,16,3,-27,-10,-8;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-12,-32,-10,-15,-30,49,-20,-35,-18,-30,-20,-5,5,-18,-20,-2,-18,-30,-22,-30,-18;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-29,-21,-32,-27,5,-32,-28,28,-23,9,9,-25,-13,-26,-23,-14,-5,29,-23,-5,-28;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-14,-31,-9,-2,-25,-18,-19,-18,-10,-26,-18,-13,59,-9,-17,1,6,-22,-31,-25,-9;
MA   /M: SY='E'; M=13,5,-17,6,14,-24,-9,-11,-21,-4,-19,-17,1,-7,1,-11,13,6,-13,-30,-19,7;
MA   /M: SY='D'; M=0,12,-21,16,7,-30,-2,-5,-26,-4,-26,-18,8,-11,11,-7,16,1,-20,-33,-19,9;
MA   /I: I=-6; MI=-5; IM=-5; DM=-15; MD=-15;
MA   /M: SY='E'; M=-8,0,-25,3,20,-23,-20,3,-21,12,-19,-11,-1,-10,7,4,0,-2,-15,-28,-11,13;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,6,-26,-20,-3,-29,35,-24,-9,0,-15,16,48,-9,-10,-21,-20,-10,8;
MA   /M: SY='E'; M=-12,15,-31,27,47,-32,-18,-2,-31,6,-23,-22,2,6,13,-4,-1,-10,-30,-32,-21,30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-5,-30,-4,7,-27,-21,-10,-23,34,-21,-7,-5,-4,10,19,-11,-10,-19,-21,-11,8;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-3,-28,-3,3,-27,-3,-10,-31,29,-28,-13,1,-13,4,24,-3,-8,-21,-22,-14,3;
MA   /I: I=-6; MI=-5; IM=-5;  DM=-15; MD=-15; E1=0;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-13,-18,-15,-14,3,1,-17,-14,-17,-16,-12,-5,-12,-17,-16,10,3,-7,-23,-10,-15;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='T'; M=9,-11,-13,-18,-15,-10,-17,-21,4,-15,-6,-4,-8,-15,-13,-16,11,18,11,-29,-12,-15;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-23,-36,-28,9,-35,-27,35,-28,23,16,-24,-25,-24,-25,-20,-8,28,-19,1,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-22,-17,-22,-15,2,-22,-17,10,-25,29,10,-20,-25,-15,-17,-12,-2,5,-25,-5,-15;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2013_05,540052;
NR   /TOTAL=49(49); /POSITIVE=49(49); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=18; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1;
CC   /VERSION=1;
DR   P49809, EGL10_CAEEL, T; P50151, GBG10_HUMAN, T; Q9CXP8, GBG10_MOUSE, T;
DR   Q5E9F0, GBG11_BOVIN, T; P61952, GBG11_HUMAN, T; P61953, GBG11_MOUSE, T;
DR   P61954, GBG11_RAT  , T; Q28024, GBG12_BOVIN, T; Q9UBI6, GBG12_HUMAN, T;
DR   Q9DAS9, GBG12_MOUSE, T; Q5RBQ0, GBG12_PONAB, T; Q9P2W3, GBG13_HUMAN, T;
DR   Q9JMF3, GBG13_MOUSE, T; P02698, GBG1_BOVIN , T; P63210, GBG1_CANFA , T;
DR   P38040, GBG1_DROME , T; P63211, GBG1_HUMAN , T; Q61012, GBG1_MOUSE , T;
DR   P63212, GBG2_BOVIN , T; P59768, GBG2_HUMAN , T; P63213, GBG2_MOUSE , T;
DR   Q5R7U4, GBG2_PONAB , T; P63214, GBG3_BOVIN , T; P63215, GBG3_HUMAN , T;
DR   P63216, GBG3_MOUSE , T; P50150, GBG4_HUMAN , T; P50153, GBG4_MOUSE , T;
DR   Q5R639, GBG4_PONAB , T; P63217, GBG5_BOVIN , T; P63218, GBG5_HUMAN , T;
DR   Q80SZ7, GBG5_MOUSE , T; Q5REH7, GBG5_PONAB , T; P63219, GBG5_RAT   , T;
DR   P30671, GBG7_BOVIN , T; O60262, GBG7_HUMAN , T; Q61016, GBG7_MOUSE , T;
DR   P43425, GBG7_RAT   , T; Q9UK08, GBG8_HUMAN , T; P63078, GBG8_MOUSE , T;
DR   P63077, GBG8_RAT   , T; Q9NFZ2, GBGE_CALVI , T; Q9NFZ3, GBGE_DROME , T;
DR   P50154, GBGT2_BOVIN, T; O97564, GBGT2_CANFA, T; O14610, GBGT2_HUMAN, T;
DR   Q61017, GBGT2_MOUSE, T; Q4VT26, GBG_CAEBR  , T; P54406, GBG_CAEEL  , T;
DR   Q7RWT0, GBG_NEUCR  , T;
DR   Q01821, GBG_LOLFO  , N; P18852, GBG_YEAST  , N; Q9FDX9, GG1_ARATH  , N;
DR   Q93V47, GG2_ARATH  , N; Q6AWT8, GG3_ARATH  , N; O94810, RGS11_HUMAN, N;
DR   Q9Z2H1, RGS11_MOUSE, N; P49758, RGS6_HUMAN , N; Q9Z2H2, RGS6_MOUSE , N;
DR   O46470, RGS7_BOVIN , N; P49802, RGS7_HUMAN , N; O54829, RGS7_MOUSE , N;
DR   P49803, RGS7_RAT   , N; O46469, RGS9_BOVIN , N; O75916, RGS9_HUMAN , N;
DR   O54828, RGS9_MOUSE , N; P49805, RGS9_RAT   , N; Q80ZD1, RGS9_TAMST , N;
3D   1A0R; 1B9X; 1B9Y; 1GG2; 1GOT; 1GP2; 1OMW; 1TBG; 1XHM; 2BCJ; 2TRC; 3AH8;
3D   3CIK; 3KRW; 3KRX; 3PSC; 3PVU; 3PVW; 3SN6; 3UZS; 3V5W;
PR   PRU00592;
DO   PDOC01002;
//