ID ZF_SP_RING; MATRIX.
AC PS51044;
DT DEC-2004 (CREATED); DEC-2004 (DATA UPDATE); MAR-2013 (INFO UPDATE).
DE Zinc finger SP-RING-type profile.
MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=78;
MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=73;
MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.6787088; R2=0.0259866; TEXT='-LogE';
MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=378; N_SCORE=12.5; MODE=1; TEXT='!';
MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=148; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA /DEFAULT: M0=-10; D=-30; I=-30; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA /M: SY='E'; M=-4,2,-27,4,8,-22,6,-6,-28,-5,-28,-20,5,-15,-1,-10,7,-8,-22,-25,-15,4;
MA /M: SY='D'; M=-15,24,-34,38,29,-30,-15,-5,-30,0,-34,-24,5,-11,8,-6,-1,-10,-26,-35,-25,20;
MA /M: SY='D'; M=-7,5,-20,10,7,-25,-8,-11,-20,-7,-24,-16,1,-11,0,-13,3,-7,-16,-31,-22,4;
MA /M: SY='D'; M=-11,17,-26,29,11,-26,-7,-13,-21,-10,-28,-19,0,-13,-2,-17,-2,-9,-17,-33,-25,5;
MA /M: SY='I'; M=-5,-30,-4,-30,-25,-6,-34,-29,26,-23,16,11,-28,-25,-22,-26,-17,-3,25,-26,-11,-24;
MA /M: SY='V'; M=1,-15,-16,-15,-4,-15,-22,-17,4,-11,-2,2,-14,-18,-6,-14,-6,-6,8,-28,-15,-4;
MA /M: SY='V'; M=-3,-15,-16,-12,-4,-14,-25,-19,6,-12,-1,2,-16,-18,-7,-16,-7,-2,8,-27,-15,-5;
MA /M: SY='T'; M=-1,-2,-18,2,-1,-22,-6,-16,-16,-10,-18,-14,-2,-13,-7,-14,7,10,-11,-27,-22,-4;
MA /M: SY='E'; M=-2,2,-22,1,7,-25,-12,-7,-22,2,-20,-11,5,-13,5,2,7,2,-17,-29,-20,6;
MA /M: SY='E'; M=1,-12,-19,-10,3,-15,-19,-10,-10,-5,-9,-7,-10,-16,0,-8,0,-3,-6,-23,-9,1;
MA /M: M=-4,-14,-17,-15,-8,-16,-20,-16,-4,-1,-7,-3,-11,-13,-7,-9,-1,-3,0,-27,-12,-8;
MA /M: SY='I'; M=-7,-28,-13,-28,-21,-3,-33,-25,22,-20,14,12,-27,-24,-15,-24,-18,-7,22,-24,-7,-19;
MA /M: SY='S'; M=-2,2,-17,1,1,-19,-9,-7,-21,4,-21,-13,8,-12,0,-7,20,6,-19,-26,-13,0;
MA /M: SY='L'; M=-9,-38,-10,-38,-29,-1,-39,-30,23,-21,36,18,-30,-29,-21,-22,-20,-9,14,-22,-10,-29;
MA /M: SY='K'; M=-11,2,-29,-4,10,-27,-17,-4,-25,14,-19,-10,9,-15,12,12,0,-2,-20,-29,-18,10;
MA /M: SY='C'; M=-1,-19,67,-17,-30,-21,-25,-26,-13,-25,-14,-12,-22,-26,-24,-27,-4,-8,-13,-23,-21,-23;
MA /M: SY='P'; M=-11,-16,-30,-10,-7,-36,-20,-10,-30,-4,-29,-19,-15,54,-7,-14,-9,-11,-21,-37,-25,-7;
MA /M: SY='L'; M=-11,-35,-11,-35,-29,3,-39,-28,26,-24,29,17,-29,-30,-23,-24,-19,-11,16,-21,-8,-29;
MA /M: SY='T'; M=5,-5,-11,-5,-6,-21,-6,-15,-16,-6,-16,-11,5,-11,-6,-11,24,27,-11,-25,-21,-6;
MA /M: SY='Y'; M=-12,-22,-21,-25,-16,7,-22,-7,-10,-8,-5,-5,-15,-26,-11,-6,-12,-9,-11,-8,10,-16;
MA /M: SY='S'; M=0,-11,-17,-13,-7,-19,-14,-15,-12,2,-8,-2,-7,-16,-4,0,3,-2,-10,-26,-19,-7;
MA /M: SY='R'; M=-9,-10,-28,-17,-1,-30,-20,-5,-28,18,-20,-11,-2,-9,6,33,-7,-4,-24,-30,-21,-1;
MA /M: SY='M'; M=-10,-31,-10,-31,-26,0,-36,-26,25,-20,23,28,-26,-26,-16,-20,-16,-10,19,-20,-10,-22;
MA /M: SY='K'; M=-9,-4,-29,-8,12,-26,-21,-9,-24,27,-15,-8,-3,-13,10,14,-2,-9,-18,-28,-18,11;
MA /M: SY='I'; M=-10,-23,-15,-23,-16,-2,-33,-17,14,-17,6,2,-21,-24,-16,-20,-14,-4,11,-20,0,-17;
MA /M: SY='P'; M=-4,-20,-26,-11,-10,-38,-18,-20,-28,-10,-28,-19,-20,60,-10,-19,-8,-9,-18,-39,-29,-10;
MA /M: SY='V'; M=2,-25,3,-25,-21,-12,-16,-22,5,-20,-4,-3,-23,-21,-19,-25,-11,-3,13,-22,-8,-20;
MA /M: SY='R'; M=-5,-9,-27,-18,1,-29,-18,-4,-28,24,-19,-10,-2,-17,8,37,-6,-9,-25,-30,-20,1;
MA /M: SY='G'; M=2,-6,-15,-8,-13,-20,22,-14,-27,-13,-27,-19,4,-18,-13,-16,12,-7,-23,-23,-21,-13;
MA /M: M=-8,-12,-13,-15,-8,-15,-22,-2,-7,-3,-7,-1,-6,-20,-6,-6,-3,-8,-7,-26,-11,-7;
MA /M: SY='N'; M=-13,-1,-24,-4,-3,-11,-17,3,-22,1,-21,-14,4,-12,-4,-6,-1,-3,-19,-21,-3,-4;
MA /M: SY='C'; M=0,-30,90,-30,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-10,-30,-30,-30,-30,-10,-10,-10,-20,-20,-30;
MA /M: SY='K'; M=-5,-6,-24,-7,4,-27,-14,-11,-23,11,-20,-11,-2,-5,5,5,4,0,-16,-29,-20,4;
MA /M: SY='H'; M=-20,0,-30,-10,0,-10,-20,80,-30,-10,-30,-20,10,-20,0,0,-10,-20,-30,-20,20,0;
MA /M: SY='I'; M=-10,-29,-14,-30,-25,4,-33,-23,16,-21,16,11,-24,-22,-20,-23,-17,-9,12,-20,-5,-24;
MA /I: I=-8; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA /M: SY='Q'; M=-5,-3,-24,-4,10,-26,-11,-4,-25,6,-18,-4,-1,-11,30,8,0,-6,-17,-20,-12,16; D=-8;
MA /I: I=-8; DM=-27;
MA /M: SY='C'; M=0,-27,72,-27,-34,-17,-27,-27,-5,-26,-7,-7,-27,-26,-26,-27,-10,-8,-5,-19,-17,-26; D=-8;
MA /I: I=-8; DM=-27;
MA /M: SY='F'; M=-18,-30,-18,-30,-28,48,-30,-12,2,-26,4,10,-28,-36,-24,-26,-18,-18,-6,6,22,-26;
MA /M: SY='D'; M=-18,34,-32,52,26,-30,-12,-8,-30,-6,-38,-28,8,-10,4,-16,0,-10,-28,-38,-28,16;
MA /M: SY='L'; M=-2,-29,-13,-30,-22,-5,-21,-24,3,-12,15,6,-22,-25,-16,-15,-12,-10,0,-20,-12,-22;
MA /M: SY='E'; M=-3,-6,-16,-3,7,-22,-19,-13,-16,-1,-12,-7,-7,-14,3,-5,1,1,-11,-26,-19,5;
MA /M: SY='S'; M=10,-8,-12,-8,-2,-19,-7,-13,-16,-5,-15,-10,-1,-13,-4,-10,16,7,-12,-22,-17,-3;
MA /M: SY='Y'; M=-17,-30,-18,-30,-25,35,-31,-2,3,-25,-1,-2,-26,-33,-21,-26,-20,-17,-1,6,38,-25;
MA /M: SY='L'; M=-8,-34,-10,-34,-27,-2,-37,-29,24,-21,26,17,-27,-27,-20,-22,-17,-6,19,-23,-11,-26;
MA /M: SY='Q'; M=-9,0,-27,3,17,-24,-21,-7,-19,5,-17,-5,-3,-13,19,-1,0,-5,-13,-26,-16,18;
MA /M: SY='M'; M=-8,-25,-15,-25,-18,-2,-21,-12,1,-15,5,7,-18,-23,-7,-16,-10,-11,0,-12,4,-15;
MA /M: SY='N'; M=-5,-3,0,-9,-8,-23,-15,-9,-18,-7,-14,-8,8,-19,1,-8,4,-1,-16,-27,-17,-4;
MA /M: SY='K'; M=-3,-5,-14,-8,6,-25,-18,-5,-22,7,-18,-11,-3,-16,5,5,0,-8,-18,-28,-17,6;
MA /M: SY='Q'; M=-9,-1,-32,-3,16,-30,-12,-4,-31,16,-24,-11,0,-13,21,16,-2,-11,-23,-26,-18,17;
MA /M: SY='T'; M=-1,-9,-18,-11,-3,-23,-15,-13,-15,2,-13,-7,-3,-13,3,1,5,11,-8,-25,-18,-1;
MA /M: SY='P'; M=-9,0,-29,-1,-4,-33,-2,-9,-31,-3,-29,-19,8,12,-3,-6,-1,-9,-24,-34,-25,-4;
MA /M: SY='T'; M=-1,-11,-17,-14,-8,-20,-11,-16,-11,-2,-8,-5,-4,-15,-4,-8,3,6,-6,-25,-18,-7;
MA /I: I=-7; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA /M: SY='W'; M=-23,-38,-18,-38,-28,7,-18,-20,-28,-28,-19,-10,-38,-37,-19,-28,-26,-18,-27,96,16,-28;
MA /M: SY='N'; M=-14,7,-28,-3,3,-27,-14,0,-24,6,-19,-9,22,-18,13,9,0,-6,-21,-31,-16,5;
MA /M: SY='C'; M=0,-30,90,-30,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-10,-30,-30,-30,-30,-10,-10,-10,-20,-20,-30;
MA /M: SY='P'; M=-9,-19,-28,-10,-10,-38,-20,-20,-28,-10,-28,-19,-18,63,-10,-19,-8,-5,-18,-38,-29,-10;
MA /M: SY='V'; M=-5,-29,-11,-30,-22,-6,-33,-22,28,-22,13,9,-27,-24,-21,-27,-19,-5,29,-28,-8,-22;
MA /M: SY='C'; M=0,-30,90,-30,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-10,-30,-30,-30,-30,-10,-10,-10,-20,-20,-30;
MA /M: SY='S'; M=-2,4,-19,4,-1,-22,-3,-6,-21,-6,-21,-14,9,-14,-2,-10,14,3,-19,-29,-19,-2;
MA /M: SY='K'; M=-3,-1,-26,-3,8,-23,-7,-9,-26,14,-22,-14,-1,-13,5,2,1,-9,-18,-27,-18,7;
MA /M: SY='P'; M=-5,-8,-23,-8,-2,-21,-16,-10,-20,-4,-19,-13,-3,5,-3,-10,0,-1,-13,-27,-14,-2;
MA /M: SY='V'; M=4,-29,-3,-29,-22,-6,-26,-23,13,-18,11,10,-25,-22,-16,-20,-11,-7,14,-22,-8,-20;
MA /M: SY='K'; M=-5,-11,-23,-12,-4,-21,-14,-12,-19,2,-16,-10,-6,-5,-3,1,2,-2,-16,-27,-18,-5;
MA /M: SY='Y'; M=-14,-30,-18,-28,-24,6,-32,-14,5,-22,4,0,-26,-10,-20,-24,-18,-14,2,-14,9,-24;
MA /M: SY='E'; M=-6,7,-25,11,12,-26,-10,-10,-22,4,-24,-16,3,-12,1,-7,5,-2,-15,-31,-22,8;
MA /M: SY='D'; M=-13,13,-28,15,9,-25,-11,4,-26,-4,-26,-17,10,-14,6,-5,1,-6,-24,-30,-17,7;
MA /M: SY='L'; M=-9,-36,-10,-36,-29,-1,-39,-29,25,-22,32,19,-29,-29,-21,-22,-19,-9,16,-22,-10,-28;
MA /M: SY='V'; M=-1,-23,-9,-24,-15,-6,-25,-7,3,-16,-2,-3,-19,-22,-13,-14,-11,-9,4,-20,2,-15;
MA /M: SY='I'; M=-8,-32,-10,-32,-28,-2,-38,-30,34,-26,21,12,-30,-28,-26,-28,-20,-8,29,-28,-10,-28;
MA /M: SY='D'; M=-17,33,-23,47,14,-29,-9,-9,-28,-9,-36,-27,13,-12,-1,-18,3,-8,-28,-38,-28,6;
MA /M: SY='E'; M=-3,-2,-24,4,7,-22,-11,-8,-24,-4,-24,-17,-5,-4,1,-7,0,-6,-18,-26,-14,4;
MA /M: SY='Y'; M=-17,-24,-20,-26,-20,23,-27,1,-8,-17,-5,-5,-15,-30,-14,-14,-15,-13,-11,2,30,-20;
MA /M: SY='F'; M=-10,-27,-15,-27,-20,13,-29,-13,4,-18,7,9,-22,-26,-12,-18,-13,-7,2,-7,10,-18;
MA /M: SY='Q'; M=-12,-16,-14,-18,-9,-13,-23,-12,-14,-5,-7,-2,-11,-22,3,-9,-7,-7,-12,-3,-4,-6;
MA /M: SY='E'; M=-9,3,-28,7,10,-17,-10,-6,-25,0,-25,-17,-2,-16,1,-2,-2,-11,-22,-25,-13,5;
MA /M: SY='I'; M=-9,-29,-12,-30,-24,-4,-33,-26,18,-18,13,8,-27,-27,-20,-22,-17,-10,14,-13,-8,-23;
MA /M: SY='L'; M=-8,-36,-10,-36,-28,-2,-38,-29,22,-21,31,16,-28,-28,-21,-22,-18,-5,15,-23,-11,-28;
MA /M: SY='S'; M=5,2,-21,0,9,-26,-3,-7,-24,3,-23,-15,8,-13,2,-3,11,-3,-17,-31,-21,6;
MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR /RELEASE=2013_05,540052;
NR /TOTAL=26(26); /POSITIVE=26(26); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR /FALSE_NEG=3; /PARTIAL=0;
CC /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC /SCALING_DB=window20;
CC /AUTHOR=N_Hulo;
CC /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1;
CC /FT_KEY=ZN_FING; /FT_DESC=SP-RING-type;
CC /VERSION=1;
DR Q94361, GEI17_CAEEL, T; Q32KY9, NSE2_BOVIN , T; Q96MF7, NSE2_HUMAN , T;
DR Q91VT1, NSE2_MOUSE , T; Q4V8A0, NSE2_RAT , T; P38632, NSE2_YEAST , T;
DR O75925, PIAS1_HUMAN, T; O88907, PIAS1_MOUSE, T; O75928, PIAS2_HUMAN, T;
DR Q8C5D8, PIAS2_MOUSE, T; Q6AZ28, PIAS2_RAT , T; Q9Y6X2, PIAS3_HUMAN, T;
DR O54714, PIAS3_MOUSE, T; O70260, PIAS3_RAT , T; Q8N2W9, PIAS4_HUMAN, T;
DR Q9JM05, PIAS4_MOUSE, T; O94451, PLI1_SCHPO , T; Q680Q4, SIZ1_ARATH , T;
DR Q6L4L4, SIZ1_ORYSJ , T; Q04195, SIZ1_YEAST , T; Q6ASW7, SIZ2_ORYSJ , T;
DR Q12216, SIZ2_YEAST , T; Q9ULJ6, ZMIZ1_HUMAN, T; Q6P1E1, ZMIZ1_MOUSE, T;
DR Q8NF64, ZMIZ2_HUMAN, T; Q8CIE2, ZMIZ2_MOUSE, T;
DR Q8GYH7, NSE2_ARATH , N; Q4PIR3, NSE2_SCHPO , N; Q7ZXH2, NSE2_XENLA , N;
3D 3HTK; 3I2D; 4FO9;
PR PRU00452;
DO PDOC51044;
//
