| Entry |
|
| Definition |
hypothetical protein
|
| Orthology |
| protein phosphatase 1, catalytic subunit [EC: 3.1.3.16] |
|
| Organism |
ptm Paramecium tetraurelia
|
| Pathway |
| mRNA surveillance pathway |
|
| Class |
Genetic Information Processing; Translation; mRNA surveillance pathway [PATH: ptm03015]
 |
| SSDB |
   |
| Motif |
 |
| Other DBs |
NCBI-GI: NCBI-GeneID: Genoscope: UniProt: |
| Position |
undetermined
|
| AA seq |
1310 aa  
MAKDKQGEIDVDNIIERLLSVRGSKPGKNVNLTEPEVRGLCIKARDIFISQPILLELEAP
LKICGDVHGQYFDLLRLFEYGGYPPESNYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENF
FLLRGNHECASINRIYGFYDECKRRYTIKLWKTFTDCFNCLPVAALIDEKILCMHGGLSP
ELSNLEQIRRIMRPTDVPDTGLLCDLLWSDPDKDVQGWADNERGVSYVFSQEIVQVFLKK
HELDLICRAHQVVEDGYEFFSKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGSMMTVDESLMCSFQILKP
AEQGAQGASQQNKPPSAKFVNLIQIREFIYNLKQLKQTNQSFIMFSDLIDQFRQTYQNKY
LTLLEFSNILDQYARLDIRCDLDDNVKEQLYKFIKEKQQNVTYCALETVILEFLLQQEVI
QPQAQINVDTLGKCARRLPLDMLQNINNDFLLQFKNFYKLISNKYGSHVDYRELERLGKE
LQRTIKINSVEIMRYIQPFVDTQQKVKIDEILELSNDLERLINDQNRIQSKGVEGRKSNT
IEQLAEDYHYSSEEDNQKQINVISTASNDRRNFTNIIYQQTDLIKQKFINKAGLSCLTEI
NKATQSIEGLITNLINDIDIKNKKIDELIIEKELTSGQLQQFELEIQNKDQQIQMCLQDN
DMFQTQINQCQDQNKDLKIQLNFYNEELKSITRLETELKEMQLDTRNLKEQLNKLNKENT
RLQLNNKSLMEIIEELETKSQQNKDIDTIKQSLQQHKEQICQLELKLDDLQKQNQQLEEL
NLSYEKIKEGLEQQIIELKREVSHYKKMFENTNIENQQLRSSIIPRTSMFNSQQMNGGGL
GRLSKMSIGGGMTSSKIYIIGRNSSQRMSSIRPNQYGSTFNPLEEIQSGPLKIEEVQDLD
NQSPDQQKVHSNKPAMINSRMDARINPKYENSIVEVINEENEEKEQVGTVVEKPKENQLL
QQFDKFWGGLGTKNLEELAPDTQQIKIDENILYYRDFLGIRDDPKIMEYLKLEKNIYKSI
IQRCFSDGVYRIDAKGKKARRILFLTEHTFYIFEGEKKPSKLSRSFPLKNIHTLVFSEAS
PVICCIKVAGSDDYLIETFKRSELNSFLTEIFASQKITLFKVEFLAQFKIKMKGLKDEIP
ISQVIKKQTSQDQGKTPTFRVSSKQGLYSQNMGWLQLFKKKMFQGDWQEVFVILTNVGLV
LFKKPGDAEPILFVSFVEAVVIKNPLFDTSKQHTIKVTILIPLRSVMKIVIPNSCSMQPQ
VFFQINGMMPSKMQSWNKCDNRISIWYISNNKWWNIEIKLNWINETILLN |
| NT seq |
3933 nt  +upstreamnt +downstreamnt
atggcaaaggataaatagggggagatcgatgtagataacataattgagagattactcagt
gtcagagggagcaagccaggaaaaaatgtaaatttgacagaacctgaggttagaggtctt
tgtataaaagcaagagacattttcatcagctagcctatattattggaattagaggcacct
ctgaagatttgtggcgatgtacacggtcaatatttcgatcttttgagattatttgagtat
ggtggttatcctcctgagagcaattatctttttttgggggattacgtagatagaggtaaa
taatccttggagactatttgtttactgttggcatacaaaattaaatacccagagaacttt
ttccttttgagaggtaatcatgaatgtgcatccatcaatagaatctacggtttttacgat
gaatgtaaacgtcgatatacaattaaattatggaaaacattcacagattgctttaattgt
ttacctgtggcagctctgatagacgagaaaattctatgcatgcatggaggtttgtctccc
gaattgtctaatttggagcaaataagaagaataatgaggcctactgatgttccagataca
ggcctcctatgcgatttgctttggtcagatccagataaggatgtataaggatgggcagat
aacgagagaggagtttcgtatgtgtttagttaagaaattgtgcaggtgttccttaaaaag
catgaattagatcttatttgtagagcccattaggtagttgaagatggctatgaattcttt
agtaaaagataattggtgactctgttttcagctccaaattattgtggtgagtttgataat
gcaggttctatgatgactgttgatgaatcccttatgtgttcgttccaaatactaaagcct
gctgaacaaggtgctcaaggtgcatcacaacaaaacaaacctcctagtgccaagtttgta
aacctgatttaaatcagagaatttatatataatttaaaacaacttaaatagactaattaa
tcatttattatgttttcagacttgatcgatcagttcagataaacttatcagaataaatac
ctaacacttcttgagttttcaaacatattagatcagtatgccagattggatataagatgt
gatttggatgataatgttaaagaatagctgtataagtttatcaaggagaaataacaaaat
gtgacttattgtgcacttgaaactgtcattcttgaattcttattacaataggaagtgatt
caaccctaagcttaaattaatgttgacactctgggtaaatgtgctcgtcgattgcctttg
gatatgttacagaacatcaataatgattttcttctgcaattcaaaaatttctataagttg
atctccaataagtatggcagtcatgttgattatcgtgagttagaaaggttgggtaaggaa
ttgtagagaactatcaaaataaattctgttgaaataatgagatacatccaaccatttgtg
gatactcaatagaaagttaaaatagacgagattcttgaactttccaatgaccttgagaga
ttgattaatgatcaaaatagaatacaatccaaaggggttgaaggcagaaagtcaaacaca
atcgagtaattggcagaagattatcattattcaagtgaggaagacaattaaaaataaatt
aatgtgatttccactgcatcaaatgataggagaaactttacaaatatcatatatcaatag
accgatttaattaaatagaagtttattaataaagcaggtctttcctgtctaactgagata
aacaaagccacttaaagcatcgaaggattgattaccaatttgattaatgatattgacatc
aagaataaaaagatagatgaactgattattgaaaaggaattgacctcgggataattataa
tagtttgagctagaaattcaaaataaggattaatagattcaaatgtgtttacaagataat
gatatgttttaaactcaaattaattaatgtcaagatcagaataaagatctaaaaatacaa
ctcaacttttacaatgaagaattgaaaagtataacgagattggagacagaattgaaggaa
atgtaattagataccagaaatctaaaagaacagttaaataagttgaataaggaaaatact
agattgcaattgaataacaaatcattaatggaaattatagaagaattagagaccaaatct
caatagaataaagatatagatactattaagcaatccttataacaacataaagaataaata
tgttaattagaactcaaattagatgatttatagaaacagaaccaataattagaggagttg
aatttgagttatgagaaaattaaggaaggacttgaataatagataatagaattgaaaaga
gaagtatctcattataaaaagatgtttgaaaatacaaatattgaaaactaatagttgaga
agtagtattattccaagaacaagtatgttcaactcataatagatgaatgggggtggtctt
gggagattgagcaaaatgtcaataggaggtggtatgacatcttctaagatttatataatc
ggccgaaattcatcgcaacgaatgtcttcgatcagacctaatcaatatgggagcaccttt
aatcccttggaagaaatacaaagcgggcctctgaagattgaggaagtttaggatttggac
aattagagtccagattaataaaaagttcatagtaacaaaccagctatgataaatagtagg
atggatgcaagaatcaatccaaaatacgagaatagtattgtggaagtgataaatgaggag
aatgaagagaaggaacaggttgggacagttgtagagaagccaaaagagaatcaactatta
caataatttgataagttttgggggggattgggaaccaagaatttagaggaattggctccg
gatacgcagtagataaagatcgatgaaaacattttatattatagagactttttggggatt
agagatgatcccaagattatggaatacttgaaattggagaagaatatatacaaatcaata
atatagaggtgtttttctgatggagtttatagaatcgatgctaaagggaaaaaggctaga
agaatcctatttttgacagaacatacattctatatatttgagggagaaaagaaaccatct
aaattgtcaagatcatttccattaaaaaacatacatactttggttttttcagaggcttca
cctgtcatttgttgtatcaaagtagcaggttcagatgattatttaattgaaacatttaaa
agaagcgaattaaattcatttttaactgaaatatttgcatcctaaaagattaccttattt
aaagtggaattcttggcttagtttaaaataaaaatgaaaggactcaaagatgaaatcccc
atttcttaagtcattaaaaagtagacaagtcaagatcaaggaaagactccaacattcaga
gtgagttccaaataaggattatactcgtagaatatggggtggttgtagttattcaaaaag
aaaatgttccaaggtgattggtaagaagtctttgtgattttaacaaatgtcggattggtc
ttatttaagaaaccaggtgatgcagaacctatactcttcgtatcctttgtagaggctgtt
gtaattaagaatcccctttttgatactagtaaataacatacaattaaagtaaccatttta
attccacttagatccgttatgaaaattgtgattccgaattcgtgttcaatgcaacctcaa
gtcttcttttagatcaatggcatgatgccatctaaaatgcaatcatggaataagtgcgat
aatagaattagtatttggtacatcagcaacaacaagtggtggaacatcgaaattaaacta
aattggatcaatgaaacaatactattaaattga |