KEGG   Paramecium tetraurelia: GSPATT00038561001
Entry
GSPATT00038561001 CDS       T01055                                 
Name
(RefSeq) hypothetical protein
  KO
K14572  midasin
Organism
ptm  Paramecium tetraurelia
Pathway
ptm03008  Ribosome biogenesis in eukaryotes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ptm00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
    GSPATT00038561001
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis [BR:ptm03009]
    GSPATT00038561001
Ribosome biogenesis [BR:ptm03009]
 Eukaryotic type
  Pre-60S particles
   Other pre-60S particles
    GSPATT00038561001
SSDB
Motif
Pfam: AAA_5 AAA_3 AAA AAA_22 AAA_7 AAA_6 AAA_14 AAA_16 bpMoxR AAA_2 TsaE AAA_18 RsgA_GTPase Viral_helicase1 AAA_19 RNA_helicase Dynein_heavy
Other DBs
NCBI-GeneID: 5023639
NCBI-ProteinID: XP_001437854
Genoscope: GSPATT00038561001
UniProt: A0CI40
Position
undetermined
AA seq 3317 aa
MIALFQVLDGSHVSLSGSKLNILSKDKSNSTILIFDSDLLLFREYLITNRKIQTAFCDPN
IQILLLFEEQEQEQLTQLYSANLEKSFTPISKILIPATKLRTIDWCNCRICALIFENCVV
LYDILLNKILTKITSNYNTISRFLISKKLTQIFCQYQDRENKSICLVLTIENQNEVQKFE
NCAFFKLIEEKDDNNLLMVQYQSNKMVIMLAKFDEEFRIERKIEQQLSNPDQKIMKVGYR
KQTQELLLLDSNQNLHIYSINSDFQINLKAQTIPNIIQFNVSLLKENLILIDNKKNIILQ
KLPSETQIERLTYQTQTLSLASQFKKRAIQGILTDPNISQQTKLFVQQYRTDFDNLSPKF
KSILNLKFKSQFLPLVDFRILNLDQNHNSKFKEFIPKMDTYAETQSVKKHLIQLEAALKG
DNPILCEGGAACGKTSIIQYLAYKNQQPLIIMNLSSFTQISDLIGKVEILPGFKFEFQLG
PFAQAVQEGLWILLDEANLASDSILRVIEDVLELGYITIYGSQINSHVDLVDGTLTIKKH
QNFKLFLTQNPATDQKFASSRNIFSPSLMSQFITIKFEPISPNDLHLIIDQIISQKQQEI
KEQLKQHIPNQQLSSLLMIIYEEIKQKNMDDGLFTIRDIVQIIDLFFLCLEQMKEKVLEI
LSFKDCMKLISTQFISLYKNRELINYQIDQNKVLSNANKLFFSTKNQRESEIQNWNSNQP
LKFLSFHKYLFQMLTLCYKTKRAALIVGQQYCGKLSSVLLWLKLLNISKYEVLELSSNTT
AEDLFGKYQPTQNGFDFILGPVTRCFHQGKILILTNFDAPDCALTESLNGVLEKNFNQLV
VQNQKYQRHENFAIIALSSDLEQLEKKITPSLKSRFVSLQIKFRLNLNDITLLLQSIGLT
KRNFQFPKIIDQLMTLGNSKDTSNLGKKIELISFNKIIRFLKPIQEIQKFAKSQNNQVLQ
QKIFECIDFFLAFCLQDNKSILNDNIKVPINYQELLLNNGRQNNYVITESRKRVADIIAT
AINAKVPLVLQGSAGVGKTKLISTFQQTCKLFESTSFHYINMNQNSELNDLMGQFVSTGQ
KDKIEFTFKKGPLFLGMEQGGIVLIDEANLSDASILNFLANVAKYPSEFHDPVSDQIIRV
HEKFRILFAQNPPSYNGRNLLPDTLASKVIVVNVPNYILEEVLQICTESQPCVQNENQIF
IKRGMEYFLTKLIQYPKDGNERQLNINGTQFTLRQFIRFRNRLARTGFSTNEPNWESILQ
LHQMILFPKNAYEEYNLESQINKIGQNLFFSIKNQQAQLQIALKLKNKILKKYETLVQNL
NSIQRLVFCKIAFCYYFKENILISGETSSKTYLSKLFSELIEFQNPNPFELIYVTSETNI
TDLVGSMESHTKSSYHQYCLSLIRRFNQNMNQNEKKTIEDHLQELKQSYDSPEFFDQTIK
NIGNQFPFIERGLTFNARFGGVLCLKNISLAEQSVIEGLNALLEIEPHFIVNGKEIKLHN
EFILIAIINNTFGGQLSDALQSRFTKIRIQVPDLINPSQEIDISYEKYLINKIPDITQQK
NIIQFIKELLISTKQYKELFYQNISNRKFYQWMSFLNLDLEATFQQKLALGFQFVILDKY
KVNFEEVITNPELQEHYQQIQNKIQLKIKEKQFFNSQKIIINPITNKILQRIYSAFSTKY
IPCLIGPPGVGKSAIAQELANITKKKFCRICCSDSLSAEDLFGSYAPKIENDKVVFVFQQ
GCLAQAISSNSLILFDEINLVSPEILSTLQALFNTDEKEITIKDSTFIKEKCIFLCSMNP
TTYQGRQELPQCISNLLCEVYIEAFNIDHVIDIFKLKYQKEIIQLQKAGINFNIILDLHK
ELALLDQEQQKSNYDFNIRFLENLLSLYSQYFLNQIQKLNNENLKLELIIVCLDIIYVQH
FYQTEFSQQVLKIILDKFGLSQDQWKKRRVFLEQQGNVIRISRQIGKDFIPIFDQVLSNQ
VIPQLSNNSFVVNLQNSIILEKLFIAINSKKVILCQGDVSSGKTSCVIKMANLLNQRFIL
LPIHSDLETDDLLGSFAQVNPNHDEIQVELERLSKKFILRRQVIGQQQKEMRMKYAEGVL
KICCKFGYWLILDNINLARAEIVERLNSLGEDQPCLFNNEFGDSNTCIIPHENFRLICLQ
NPTRVDQNQLSPAFYNRCIKINFEIDLKHNSNDIIEILTIKGLGQQSIQQDNVVLASNLL
KQVIFIKEHTNALINIRNVIKAFNMIQENGFQQYDQIMEIVFGSEFKESKKNPYFPIFDL
KSHNVTDNIMDKYTDSILNKLVSNTLKQITDQPKKFLDFINISQFLKANLLEKEIQVYQR
FIQGISQQICLVNFVEENQYDLGCYKFQVKGELIKYVGQQTIKIYPTFLSLFIQSKVLKN
LLVKSKFVFQEQSILAEARLNSEGQMLVSFQQPNDLFLVPLIKSLIGPSYQQFFKIFKHM
LSKSEIECSIYLDQHIELFFNFKLLDYSLSYIPNLQFKNIFGQISLNKENIITQFSLSCD
LQLELNQYFIKKGFFSRVHNLNSHRGEISIPPESQIFIFQDYNCFNLFSNINIVQSPKFT
SYIDLEERKVEINLECENSIQIYKLPFHIRINRIFVYFLLKEKITLNGNIQCTFQIFDKD
FCSLKAQIDKSKLKLQLSQGQHQINCQNFIKQFFLNYFESNNIFIQQFVENQKTIIKKLD
LITNTLYWNYEFNFQIDWKMKIFKNIILEMKNMDIYCHIDPQTTNFTICFTIEILKFCFE
FYVDFDFLSFFSKQKKKQLTMILKSGKNSPLLKEIIEVFSKELKSKLQNISGFNQQQTKQ
FKRKEDSPQLFNADNFRKLGEQLSQQFEEKVHQIHNDLGSKLRIENSQSNLNEKIEKEIK
LNYQENSNQKFKLSQESYIIWDDQIELKFSVDLLNQWSVSKYLTLSQCCLNIIAKNQSFD
LNLNGFIKIMNMTLNKFQLLLTPNSLLDLNIENEPLIMQINPISFGFGLLDYQFEDLDIF
PKLDQIVGFQYNMLSQKFNGEFKVGKQNIKHNLSGLQFENIQLVFGSSDNLKNTFATLEI
KVIFFKQEINFYLQFQREQINKPKSLIRQLQFTSYALKNFSFNEFLENSVGITLSQKKLQ
FNVENFEFFLKLEKNLSWKHSIILQIQNSQCQILENFVRLQNLNGLILYKNQSWVDSCIS
GICFVRDFNLGSFSLTFNKEVNGLEAKFQVNPKFETKEFFLTIHNKQLNFIFFENIGHDE
IKVNLGLYNNKTIFELKEEVKIFSWSNISALKLKNIVFKYFVSEEIEIEKNSNFQFEIEI
FDDINLRTKITMLPRTT
NT seq 9951 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgattgcattattttaggttttggatggttcacatgtatccctatctggttctaagctt
aatattctatcaaaagataaatcaaattccactatcttaatatttgattctgatctcctt
ttgtttcgggagtacttgataacaaataggaagatttagactgcattctgtgatccaaac
atacagattctgcttttatttgaagaataggaataagaataattgacttagctttattca
gccaatttagaaaaatcttttacaccaatatcaaaaatattgattccagctactaaacta
agaactatagattggtgtaattgtagaatttgtgcattaattttcgaaaattgtgttgtc
ttatatgatattttgttaaacaaaattttaacaaaaattacatcaaattataatactata
tctagatttttaatttctaaaaagcttacttaaatattttgttaatattaagatagagag
aataaatcgatatgtttggtattaacaattgagaattagaatgaagtatagaagtttgag
aattgtgctttctttaaattaatcgaagaaaaagatgataataatttgttgatggtccaa
tatcaatctaataaaatggtaataatgttggcaaaatttgatgaagaatttagaattgag
agaaaaattgagtaatagctttctaatcctgattaaaaaattatgaaagttggatataga
aaataaacgcaagaattgcttttacttgattcaaactaaaatttgcatatttattcaatt
aattcagatttctagataaatttgaaagcccaaactattccaaatatcatttaatttaat
gtttctctactaaaagaaaacttaatactcattgacaataaaaaaaatataattctataa
aaattgccatcagagacacaaatagagcgtttaacttattaaacataaactttatcctta
gcatctcagtttaaaaagagagctatttagggtattttaacagatccgaatatttcttaa
taaactaaactatttgttcagtaatatcgtacagattttgataacttgagcccaaaattt
aaaagtatactaaatctaaaatttaaatctcagttcttacctctagttgattttagaatt
ctaaatcttgattaaaatcataattcaaaatttaaagaatttattccaaagatggatact
tatgctgaaactcaaagtgtgaagaagcatttgatttaattagaggctgctctcaaagga
gataatccaatcttatgtgaaggtggtgctgcttgtggtaagacttcaataatctaatat
ttggcttataaaaatcaatagccactaataatcatgaatcttagttcttttacttaaatt
tctgatttaattggcaaagttgaaattttaccaggatttaaatttgaattttaacttggt
ccttttgctcaagctgtataagagggtttgtggatacttttggatgaagctaatttggca
agtgattcaatactgagggttattgaagatgttcttgaacttggatacatcactatctat
ggcagttaaattaattctcatgtcgatttagttgatggaaccttaacaataaagaaacat
taaaatttcaaactatttttaactcaaaatccagcaacagattaaaagtttgcttcttct
agaaatattttttctccatctttgatgagttaatttattaccattaaatttgagccaatt
agcccaaatgacctacatttgattattgactaaatcatatcctagaaacagtaagaaata
aaagaacaactaaaacaacatatacctaactaataattatcttcattgctaatgataatt
tatgaggaaattaaatagaaaaatatggatgatggtctgttcaccataagagatattgtt
taaattattgatcttttctttttatgcctagaataaatgaaggagaaagttttagaaata
ttaagttttaaggattgtatgaaattaatctcaacatagttcatctcattatataaaaat
cgtgaactaattaattattaaattgactaaaataaagttctctctaacgcaaataagtta
ttcttctcaactaaaaattagagagagtctgaaatataaaattggaacagtaattagcca
cttaaatttctctcattccataaatatttatttcaaatgttgacattgtgttataaaacg
aaaagagcggctctaattgtgggacaataatattgtggaaaattatcaagtgttctcctt
tggcttaaattgttgaatatttcaaaatatgaagtattagaactatcatcaaataccact
gcagaagatttatttggtaagtatcaaccaacttagaatggttttgatttcatcttagga
ccagtaaccagatgtttccatcaaggaaaaattttaattcttactaattttgatgccccc
gattgtgccttgacagaatcactaaatggtgtattagaaaagaattttaactaactggta
gtataaaatcaaaaatactaaagacatgaaaattttgctataattgcattatcatctgat
ttggagcaattagaaaaaaaaattaccccatctttgaaaagcagattcgtaagtttgtaa
ataaaatttagattgaatttgaatgatatcactttattgttataatcaataggactaaca
aaaagaaatttttaatttcctaaaattattgattagctgatgacattaggtaatagcaag
gatacctcaaatttgggaaaaaagattgaactgatctcatttaataagataattagattt
ttaaaacctatttaagagatataaaagtttgctaaatcttaaaataattaagttttataa
caaaaaatttttgagtgtattgatttcttcttagccttttgtttgcaagataataaatcc
attttgaatgataatataaaagtaccaataaattaccaagaattattattaaataatggt
aggtaaaataattatgtcattactgaatcaaggaaaagggttgcagacattattgcaact
gctattaatgctaaagttccgttagttttataaggatcagcaggcgttggaaaaacaaaa
cttatttctacattctaataaacatgcaaattatttgaatcaactagttttcattatatc
aatatgaattaaaattcagagttaaatgatttaatgggataatttgtatctacaggctag
aaggataagatagaatttacatttaaaaaaggtccattatttttagggatggagtaaggt
ggcatcgttcttatagatgaagctaatctatcagatgctagcatacttaactttttagct
aatgtagccaagtatccatcagaatttcatgatcctgtttcggatcaaataataagggtt
catgaaaaatttcgaatcttatttgcataaaaccctccatcctataatggcagaaatttg
ctcccagacacattagcatctaaagttatagtggtcaatgttccaaattatattttggaa
gaagtactttaaatttgcaccgaatcttagccttgtgtgtaaaatgaaaattagattttc
attaaaagaggtatggaatattttctaaccaaattaatacaatatcctaaagatggtaat
gaaagatagctgaatattaatggtacttaatttactttaaggtaattcattagatttcga
aatcgattagcgagaactggtttctctacaaacgagcctaattgggaaagcattttacaa
ttacattaaatgatactttttccgaaaaatgcctatgaagaatataacttagaatcttag
ataaataaaattggatagaatttatttttttcgattaaaaatcaataagcttaactacaa
atagctcttaaacttaagaataaaattttgaaaaaatatgagacattagttcaaaattta
aactcaatttaaagattagtattctgcaaaatagcattttgctattattttaaagaaaat
attctaatttcaggagagacctcttcaaaaacctacttgtctaaattgttttcagaattg
attgaattttagaatccaaatccatttgaattaatttatgtaacttctgaaaccaatatt
actgatttagttggcagtatggagtctcatactaaaagttcttatcaccaatattgttta
agtttgataagaagatttaattagaatatgaattaaaatgaaaaaaaaactatcgaagat
catttataagaattaaaataaagctatgattcaccagaattctttgatcaaactattaaa
aatataggcaattaatttccctttattgaaagaggattgacatttaatgctagattcggt
ggggttttatgtttaaaaaatatatcattggcagaataatctgttattgaaggattaaat
gctttattggagattgaaccccattttattgtaaatggaaaagaaattaaattacataat
gaatttattttgattgcaattattaataatacatttggaggttaattaagtgatgcatta
tagtcaagatttacaaaaattcgaattcaagttccagaccttattaatccttcttaagaa
atagatatttcttatgaaaaatatcttattaataaaatcccagatataacttaataaaaa
aatattatttagtttataaaggaacttcttattagtacaaaataatataaggagcttttc
tattaaaatatatctaatcgcaaattctattaatggatgagctttttgaatttagatttg
gaggcaacattttaataaaaattagcattaggattttaatttgtgattttggataaatat
aaagtaaattttgaagaagtcattacgaatcctgaactttaagaacactattaataaatt
taaaacaaaatttaacttaaaataaaagaaaaataatttttcaattctcaaaaaatcatt
ataaacccaattactaataaaatattataaagaatatattcagcattttctacaaaatat
ataccttgcctgataggaccacctggagtcggaaaatctgccattgcataggaacttgct
aatataactaaaaaaaaattctgcagaatttgttgctcagattctttgagtgctgaagat
ttatttggatcttatgcaccaaagattgaaaatgataaagtagtattcgttttccaatag
ggttgtttggcataagcaatatcttcaaacagccttattctatttgatgaaattaattta
gtatctcctgaaatattaagcactctttaagctttatttaacactgatgaaaaagaaatt
acaataaaagatagtacatttattaaagaaaaatgcatatttttatgctcaatgaatccc
actacatattaaggaagataagaattaccttaatgcatatcaaatcttttatgcgaagtg
tatattgaagcattcaatattgatcatgtaattgacatatttaaattgaaatactaaaag
gagatcatataattataaaaggctggaattaattttaatattattttagatttacacaaa
gagcttgctttattagactaagaataataaaaatccaactatgactttaatataagattt
ttggaaaatctcttgtctctttacagctaatattttttaaatcaaatataaaaattaaat
aatgaaaaccttaaattagaattaataattgtttgtttagatattatatatgtttaacac
ttttattagacagaattttcacaataagtactaaaaataatattggataaattcggctta
agttaagattaatggaaaaaacgaagagttttcttagaataatagggaaatgtaattaga
ataagtagataaatcggaaaggattttatacccatatttgattaggttttatcaaattag
gtcattccttaactttccaataattcattcgttgttaacctacaaaactctattatttta
gagaaactctttattgcaattaattctaaaaaagtaatattatgttaaggggatgtttca
tctgggaaaacctcatgtgttattaaaatggcaaatcttttgaactaaaggttcattttg
ttgccaattcatagtgatttagaaactgatgatttacttggtagttttgcttaagtgaac
cctaatcatgatgaaatttaagtggaattagagaggttatcaaaaaaattcatattgaga
agataagtaattggataacaataaaaagagatgcgaatgaaatatgctgaaggagtatta
aaaatttgttgtaaatttggttattggttaattttggataatattaacctagcaagagct
gaaatagtagaaaggttaaattccttaggagaagattagccttgtttatttaataatgaa
tttggtgattcaaatacttgcataattccacatgaaaattttcgtttaatatgtttgtaa
aatccaacgagagtagattaaaattaattgtctcctgccttttataatagatgtattaaa
attaattttgaaattgatctaaaacataattcaaacgatattattgagattttaaccata
aaaggtttagggtaataatcaattcaacaagataatgttgttctggcgagtaatttatta
aagtaagtcatatttattaaagaacatacaaatgctttaattaatataagaaatgttata
aaagccttcaatatgattcaagaaaatggattttaatagtatgattaaataatggaaatt
gtttttggctcagaatttaaagaatccaaaaaaaatccatattttcccatttttgattta
aagtctcataatgttacagataatattatggataaatacactgattccatattaaataaa
ttagtctcaaacacattaaaatagataactgattaacccaaaaaatttctagattttata
aatattagttaatttttaaaagcaaacttgctagaaaaagaaatttaggtttattaaagg
ttcatttaaggtataagccaataaatctgtctagttaattttgtagaggagaactaatat
gatttgggatgttataaatttcaagtaaaaggagaattaattaaatatgttggttaacaa
actataaaaatatatccaacatttttgtccttatttatataaagcaaagtattgaagaat
ttgttagtcaaatctaaatttgtattttaggaataatctattttagctgaggcaaggtta
aattctgaaggtcaaatgttagtatcgttctagtaaccaaatgatttatttttggttcca
ttgattaagtctcttattggaccatcttattaatagttttttaagatttttaagcatatg
ctctcaaaatctgagattgaatgctcaatatatctagattagcatatagaactattcttc
aattttaaattacttgattattcattatcctacatccccaatctttaatttaagaatata
tttggacaaatttctttaaataaagagaatattattacataattttcactaagttgtgat
ttataacttgaattaaattagtattttattaaaaaaggtttctttagcagagtgcataat
ttaaattcacataggggtgagattagtattccccctgaaagttaaatttttatcttttaa
gattacaattgcttcaatttattttcaaatataaatatagtttaatctccaaagtttacc
tcatatatagatcttgaggaaagaaaagtagaaataaatttagaatgtgaaaattctatt
taaatctataagttgccatttcatattagaataaatagaattttcgtttatttcttatta
aaagaaaaaattactctaaatggaaatattcaatgtacatttcagatatttgataaggat
ttttgtagtttaaaggcccaaattgataaatcaaagttaaaattacagttatcttaagga
tagcattaaattaattgttaaaatttcattaaataattttttttgaattattttgagagc
aataacatttttatttaacagtttgtggagaattaaaagactattataaagaaattggat
ttaatcactaatacactatactggaattatgaatttaatttttaaattgattggaaaatg
aaaattttcaaaaatattattttagaaatgaaaaatatggatatctattgtcatattgat
ccttagacaacgaactttactatttgtttcactattgaaattcttaaattttgttttgaa
ttttatgttgattttgactttttgtcttttttttccaaataaaagaaaaagtaattgacg
atgattttaaaaagtggaaaaaattctcctcttctaaaagaaattattgaggtattttca
aaagaattgaaaagcaaattataaaatatttctggatttaattaataacaaaccaaataa
ttcaagaggaaggaagattctccataattattcaatgctgataactttagaaaattagga
gagtaactttcataataatttgaagaaaaagttcattaaatccacaatgatcttggatct
aaattacgcatcgaaaattcttaatccaatttgaatgaaaaaattgaaaaagaaattaaa
ttaaattatcaagaaaatagcaattagaaatttaaattatctcaagaatcttatataata
tgggatgattagattgagttgaaatttagcgtcgatctattaaaccaatggagtgtatcc
aaatacttaacccttagtcaatgttgtttaaatattatagcaaaaaattaaagttttgat
ctgaatttaaatggctttatcaaaattatgaatatgactctaaataagttttagttgtta
ctaactcctaacagcttgcttgatttaaatatcgaaaatgaacccttaataatgtagatc
aatccaattagtttcggttttggcttgcttgattattagtttgaagatttagatatattt
cctaaattagattaaattgttggattttaatacaatatgttatctcaaaagtttaacgga
gagtttaaagttgggaaataaaatattaagcataacctttctggtttatagtttgagaat
atttaactagtatttggttcatctgataatttaaagaataccttcgcaactttggaaata
aaagtcattttctttaagcaagaaattaatttttatttataattttaacgcgaataaatt
aataaacctaaaagtttaattagataattacaatttacttcctatgcattaaagaatttt
agttttaatgaattcttagaaaatagtgttggaataactctttcataaaaaaaattacag
tttaatgttgaaaattttgagttttttttaaaattagaaaagaatttatcttggaaacat
tcaataatattatagatataaaacagttaatgtcaaattttagagaattttgtaagactt
caaaatttgaatggtttgattctttataaaaattaaagttgggtggacagttgtatatca
ggaatatgctttgttcgagattttaacttaggatcttttagtctaacttttaacaaagaa
gtaaatggacttgaagctaaattttaagtaaaccctaaatttgagacgaaagaatttttc
ttaactattcataataaataattgaatttcattttttttgagaatataggacatgatgaa
ataaaagttaacttgggtctttataacaataaaaccatattcgagcttaaagaagaagtt
aaaatattctcatggagtaatatctcagctttaaagttgaaaaacattgtcttcaagtat
tttgtaagtgaagagattgaaatagaaaaaaattcaaatttttaatttgaaatagaaatt
tttgatgatattaatttgagaactaaaataactatgctacctaggaccacc

  All links  
Ontology (2)   
   KEGG BRITE (2)   
Pathway (1)   
   KEGG PATHWAY (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (136)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   RefGene (131)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   GENOSCOPE (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (2)   
   UniProt (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (1)   
   RefSeq(nuc) (1)   
Protein domain (17)   
   Pfam (17)   
All databases (160)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system