KEGG   Paramecium tetraurelia: PTMB.247c
Entry
PTMB.247c         CDS       T01055                                 
Name
(RefSeq) Transducin
  KO
K14555  U3 small nucleolar RNA-associated protein 13
Organism
ptm  Paramecium tetraurelia
Pathway
ptm03008  Ribosome biogenesis in eukaryotes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ptm00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
    PTMB.247c
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis [BR:ptm03009]
    PTMB.247c
Ribosome biogenesis [BR:ptm03009]
 Eukaryotic type
  90S particles
   U3 small nucleolar RNA-associated proteins
    PTMB.247c
SSDB
Motif
Pfam: WD40 ANAPC4_WD40 Utp13 RMC1_N WD40_like Nup160 TRADD-like_N
Other DBs
NCBI-GeneID: 2898472
NCBI-ProteinID: XP_001347072
UniProt: Q6BFX5
Position
MT
AA seq 783 aa
MVKIVQATKLLKSRRLTRLKLSKLSLQSKQIVPNKKEQETKQVQIINEDQFITHIEPIKQ
LLPFYQGGKIQITNNVIYTCFNFCVQYLDKKIQHNQEEIANFCVSNLNDYIATFTKNYML
RYVRLNDHITQFTIKTDPLFAIDMQFSPEDVYLALGGTNCMVKIINVKKNQQSTEFRVSG
SVLKLQWIPIMRKLQVAIATDDRRISLFDLVANRILCGFVDFNSRITHIQFSQHMLVSSC
NKYIKFWDTSVQKLTETIEFDIEIETFIYFKNTLIIGTESGDLHIKQQNKKIAIDSQFNG
QQILKFINCNEKLYIITSELHIYITELVSGQIQQQKLLLGYNDEILDVKFIQNNQLLLAT
NSPFMKILNLDSMEVIAWKAHYSVIMCCEFIDDLIVTASKDNCVIIFKYKGFKQPIELHK
YSGHSDDVISIDVNSKYIASVSKDKSLKLWDLKNYQSEQSIKTVVAHEKEMNCVRFSPNN
KLIATSSQDRLIKLWDENLMNKMTLKGHKRGVWDIQFSPIEKILASASGDNTIKLWNLSD
GSIIKSFQGVAPQLKVQWLARGSELISTDSIGNIKLWNVKKQTCINTFSQHTGKIYALDI
KRDNQDIYIVTGANDSNLILWKDKTEQVTQQQQLQQHETKIKLQTFQDFMRDKLYLDAAF
IAFQNNYIKHFIQAVTQIYKQVDYDNVVSMLSQKMVKEDLLKFLQLLITLNQSKKTYQAA
QHLFYYSIKLINVNEFKDEKRELVKKLLQQLKYLTSKCFDRLESNYSSQFLIKFMIDKSK
IVV
NT seq 2352 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggttaaaatcgtataagcaaccaaattgcttaaatcaaggcgtctaactaggttaaaa
ctgagtaaactatcattgtaatctaaacaaattgtacctaataaaaaagaataagaaacc
aaataggttcaaattataaatgaggattaatttattacgcatatagaaccaattaaatag
ttattgcctttctatcaagggggtaaaatacaaataacaaataatgtgatatatacatgt
ttcaatttttgtgtgcaatatcttgataagaaaattcaacataatcaagaagaaatagca
aatttttgtgtgagcaatctaaatgattatatcgcaacatttacaaagaattatatgctc
agatatgttagattgaatgatcatatcacctaatttacaattaagacagatcctctattt
gccattgatatgtaatttagtccagaagatgtctacttggctttaggtggtacaaattgc
atggtcaaaattataaatgttaaaaagaaccaacaaagtactgaattcagagtcagtgga
agtgttctcaaattataatggattcctattatgaggaaattacaagtggcaattgccaca
gatgacagacgcatctcattatttgatttagtagcaaacagaatactgtgcggtttcgtt
gactttaatagtaggataacccatatttagtttagtcagcatatgttggtgtcaagttgc
aataaatacattaaattttgggacacaagcgtataaaaattgactgaaaccatagagttt
gatattgaaattgagacattcatttatttcaaaaatacccttatcataggtacagaatct
ggagatttacatattaaatagcaaaacaaaaaaattgctatagattcataatttaatggc
taataaatattgaaatttattaactgcaatgagaaattgtatatcataacaagtgaattg
catatttatattactgaattagtatctggacaaatacaatagtaaaaattattattagga
tataatgatgaaatactagatgtaaagtttattcaaaataaccaattgcttttggctaca
aattccccatttatgaagatattaaatttagatagcatggaggtcattgcatggaaggct
cattacagtgtgatcatgtgttgtgaatttattgatgatctaatagtaacagcatccaaa
gataattgcgtcattatattcaagtataagggattcaaacaacctatagagttacacaaa
tatagtggtcattctgatgatgtaatttcaatagatgtcaattccaaatatattgcatct
gtttcaaaagacaaatcacttaagttatgggatttaaagaattatcaatctgaataatct
ataaaaactgttgttgctcatgagaaagagatgaattgtgttcgattctcaccaaataat
aaacttattgccacatcttcctaagatagacttattaaattatgggatgaaaatttaatg
aataagatgacacttaaaggtcacaaaagaggagtctgggatatatagttttctccaatt
gaaaaaatattggcttctgcaagtggagacaatactattaagctctggaatcttagtgat
ggctctatcattaaatccttctaaggagtggctcctcaactaaaagtgtaatggcttgcc
agaggatctgaactaataagtactgattctattggtaatattaaattatggaatgtcaaa
aaataaacttgtattaatactttctcacaacatactggtaaaatttatgccttggatata
aagagagataatcaagatatttatatagtgactggagcaaatgattccaatctaattcta
tggaaagataagacagagtaagtgacttagcaataataactacaataacatgaaactaaa
ataaagttacaaacattccaagattttatgagagataaactatatttagatgcagcattt
attgcattttaaaataattatataaagcattttatttaggctgttacttaaatttataag
caagttgattatgacaatgttgtatctatgttatcttaaaaaatggtgaaagaagattta
ttaaaatttttataattgttgataacactaaattaaagcaagaaaacttattaggcagcc
taacatttattctattattcaataaaattaataaatgtaaatgaatttaaagatgaaaaa
agagagttagtgaaaaaattgctgtaataattgaaatatttgacatccaaatgttttgat
cgattggaaagtaattattcttcatagtttctaattaaatttatgattgataagtctaaa
attgttgtttga

DBGET integrated database retrieval system