KEGG R.prowazekii: RP141

Rickettsia prowazekii: RP141

Entry

RP141 CDS R.prowazekii

Definition DNA-directed RNA polymerase subunit beta' (EC:2.7.7.6)

Orthology K03046 DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:2.7.7.6]

Pathway rpr00230 Purine metabolism
rpr00240 Pyrimidine metabolism
rpr01100 Metabolic pathways
rpr03020 RNA polymerase

Class Metabolism; Nucleotide Metabolism; Purine metabolism [PATH:rpr00230]
Metabolism; Nucleotide Metabolism; Pyrimidine metabolism
[PATH:rpr00240]
Genetic Information Processing; Transcription; RNA polymerase
[PATH:rpr03020]
Genetic Information Processing; Replication and Repair; DNA repair
and recombination proteins

SSDB

Motif Pfam: RNA_pol_Rpb1_1 RNA_pol_Rpb1_5 RNA_pol_Rpb1_2 RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4 Apocytochr_F_C Peptidase_M23

Other DBs NCBI-GI: 15604017
NCBI-GeneID: 883787
UniProt: Q9ZE20

Position 164931..169049

AA seq 1372 aa
MSVVNFYGQLSNTQQFDQIRINIASPDQVRSWSFGEVTKPETINYRTFKPEKDGLFCARI
FGPVKDYECLCGKYKRMKNRGITCEKCGVEVTVSRVRRERMGHIELAAPVAHIWFLKSLP
SRISTLLDMTMRDVEKILYFENYVVVDPGLSILQKGELLTEEELQKAKDKYGEDAFTASI
GAEVIQQMLKELDFSKLKQELYDELHITSSEVKKKKLVKRLKLVEDFLESENKPEWMIMD
VLPVIPPEIRPLVMLDGGRFATSDLNELYRRVINRNNRLKKLIESKAPDIIVRNEKRMLQ
EAVDALFDNGRRGRAAKNANKRPFKSLSDMLKGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPE
LKLHQCGLPKKMALELFKPFIYSKLELYGIATTIKAAKRMVEAEKPEVWDVLEEVIREHP
VLLNRAPTLHRLGIQAFEPLLIEGKAIQLHPLVCAAFNADFDGDQMAVHIPLSIEAQLEA
RVFMMSTNNILSPANGRPIIVPDKDIVLGLYYLTIAFDNEVGEGMMFSDLAEMEHALYNK
FITIHTKIKYRRDQLNAEGKMVPVIIDTTYGRLMVGELLPSNPNIEFKFINKQLTKKDIS
LVIDLVYRHCGQKATVIFADQLMKLGFKYACSSGISFGMDDMVVPESKSTHINETQLEIK
EFEQQYSNGLITYGEKYNKVVDAWSRCTDRVANDMMKEIATPPVNDYPNHQKINAIYMMA
ISGARGSFQQIKQLGGMRGLMTKSNGQIIQTPIISNFKEGLTEFECFNSANGMRKGQIDT
ALKTASSGYLTRKLVDVAQDCIITEKDCGTDKGIEVKSVIEGGEIIVPLAEKILGRTAAI
DIFHPVTNDLILNKGELINESKLEQIESAGLDRIMIKSVLTCESSTGICSICYGRDLATG
TLVSEGEAIGVIAAQSIGEPGTQLTMRTFHIGGAATKGAEVSSVEASYDAKVKIISRNVV
INSEERKIVMSRNCELLLLDNNGNEKARHKIPYGARLLVDDGDMVIKTQKLAEWDPYTIP
IITEKSGKVLFKDMVEGISIRDVTDEATGIPSKVIIESKQYSRGAELRPRIQLLDSKGEV
ITLSNGLEARYYLPVGAVLSVEDGIQISVGDIIARIPKESTTTKDITGGLPRVAELVEAR
RPKDHAVIAEVDGRVEFGKDYKSKRRIIIHPIDGTMSIEYMVPKGKHVVVNEGDFVKKGD
LLIDGNPVLQDILKVMGVEVLANYIVKEVQAVYRLQGVKIDDKHIEVIIRQMLQKVEVTD
SGGTTLLVGEKIDRHEFDEINAKAMKNGLKPAEAQLILQGITKASLQTRSFISAASFQET
TRVLTEAAIAGKVDKLRGLKENVIVGRLVPAGTGYFMDKMRKAAVKLDEENV

NT seq 4119 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgagcgtagttaatttttatggacaattaagtaatactcaacaatttgaccagataagg
attaatatagccagtcctgatcaggtacgttcttggtcttttggtgaagtaacaaaacct
gaaacgattaattatcgcacttttaaacctgagaaagacggtttattttgtgcaagaatt
tttggtccagtcaaagattatgaatgtctctgcggtaaatataagcggatgaaaaaccgt
ggcattacatgtgagaaatgtggtgttgaagttacagtttctagagtaagacgtgaacga
atgggacatattgagcttgcggctcccgttgctcatatttggtttttaaagtcacttcct
tcgagaattagtacgcttcttgatatgacaatgcgagatgtggaaaagattctttatttt
gaaaattatgtagtagttgatccagggttatcaattttacaaaaaggagaacttttgaca
gaagaagaattacaaaaagcaaaagataagtatggtgaagatgcatttactgcttctata
ggtgcagaagtaatacaacaaatgcttaaagagcttgatttttcaaagttaaagcaagaa
ttatacgatgaattacacattacttcttcagaagtcaaaaagaaaaaattagtaaagcgt
ttaaaattagtcgaggattttttagagtcagaaaataagcctgaatggatgattatggat
gttttacctgtgatccctcctgaaattagaccgcttgttatgcttgatggtggaagattt
gctacttcagacttaaatgaactttatagaagggtaattaatagaaataatcgtttaaag
aaattaatagagtcaaaagctcctgacataatagtcagaaatgaaaaaagaatgttacaa
gaagctgtggatgcgttatttgacaatggtcgtcgcggtagagcagcaaaaaatgctaat
aagcgcccatttaagtcattaagtgatatgcttaaaggtaagcaaggtcgttttcgtcag
aatttactcggtaagagggttgattattcaggacgttcagtgatcgtagtagggcctgag
cttaaacttcatcaatgcggtttacctaaaaaaatggctctagaactatttaagccgttt
atttattctaagcttgagttgtatggtattgctacaactattaaggctgctaaaagaatg
gtggaagcggaaaagcctgaagtttgggatgtacttgaagaggtaattagagagcatccg
gttttactgaatagagctccaactttacataggcttggtattcaagcatttgaacctcta
ttaatcgaaggtaaagcaatacagcttcatccgcttgtttgtgctgcgtttaatgcggat
tttgatggtgatcagatggcggtacatattccattatcgattgaagcacagcttgaagct
agggtatttatgatgtctacaaataatatcttaagtcctgcaaatggacgtcctattatt
gtaccagataaagatatagtacttggtttatattatcttactattgcatttgataatgaa
gtaggcgaagggatgatgttctcagatttagctgaaatggaacacgcgttatataataaa
tttatcactattcatacaaagatcaaatatcgcagagatcagttaaatgctgaaggtaaa
atggtacctgttatcattgatactacatatggtaggttaatggtcggtgagttattacct
tctaatcctaatatagagtttaagtttattaataaacagctaactaaaaaagatatatca
ttagttatagatttagtttatcgtcactgtggtcaaaaagcgacagttatttttgctgat
cagttaatgaaattaggctttaaatatgcttgctcttcaggtatttcttttggaatggat
gatatggtagtgccagaatctaagagtactcatatcaatgaaacacaacttgagataaaa
gaatttgaacaacaatattcaaatggtttaattacttatggagagaaatataataaagta
gttgatgcttggtcaagatgtacagatagagtagcaaacgatatgatgaaagagattgct
acgccaccagttaatgattatccaaatcatcagaaaataaatgctatatatatgatggct
atttctggagcaaggggttctttccagcagattaagcagctaggtggtatgcgaggttta
atgacgaaatcaaacggtcaaattatacaaacgcctattatctctaactttaaggaaggc
ttaactgaatttgagtgttttaattctgctaatggaatgcgtaaagggcaaatagatact
gctttaaaaacagcaagttcaggttatttaacgaggaaattagtcgatgttgcacaagat
tgtattattactgaaaaagattgtggtactgataaaggaattgaagtgaagagcgttatt
gaaggcggagaaattatagtgcctttagctgaaaagattttaggccgtactgctgctatc
gatatatttcatcctgttactaatgatctcattctcaataaaggtgagcttattaatgaa
tcaaaactggaacaaattgagtcagctggacttgacagaattatgattaaatctgtatta
acctgtgaaagtagtaccggtatatgtagcatatgttatggtagggatcttgctactggt
acattagtatcagagggtgaggcaataggtgttatcgcggcccaatctattggggaacct
ggtacacagcttacaatgagaacctttcatataggaggagctgcaacaaaaggtgctgaa
gtttcttccgtagaagcatcctatgacgcaaaagtaaaaattataagtcgtaacgttgtt
attaattccgaagaacgaaaaattgttatgagtcgtaattgtgaattattattgcttgat
aataacggtaatgaaaaagctcgtcataaaattccatatggtgctagattacttgttgat
gacggtgatatggtgattaaaacacaaaaactagcagaatgggatccttatactatacca
attataacagagaagtcaggtaaagttttattcaaagatatggttgagggtatttctatt
cgtgatgtaactgatgaagctactgggatacctagtaaagttattattgaatcaaagcaa
tattcacgtggtgcagaattacgtccgcgtatacagcttttagattctaaaggtgaagtt
ataaccttatcaaatggtttagaagctagatattacttaccggttggagcagtgttaagt
gtagaagatggaatacaaatatcggtaggtgatatcattgcacgtatacctaaagaatca
accactactaaagatattaccggtggtttaccaagagttgctgaacttgtagaagcaaga
cgtcctaaagatcatgcagtgatcgctgaggttgatggtagagtagaattcggtaaagac
tataaatctaagagacgtattattatacatccaattgatggaacaatgtctattgaatat
atggtacctaaaggcaagcatgttgtagtgaacgaaggagactttgttaaaaaaggtgat
ttattaattgatggtaatcctgtactgcaagatattttaaaagtaatgggtgtagaagtg
cttgcaaattatattgttaaggaggttcaagctgtttatcgcctacaaggtgtaaaaatt
gatgataaacacatagaagttattatccgtcagatgttacaaaaagtagaagttacagat
tcaggtggcactacattactagtaggtgaaaaaatagataggcatgaatttgatgaaata
aatgcaaaagctatgaaaaacggtttaaaacctgctgaagcacaattaatattacaaggt
attactaaagcttctctacaaactagatcatttatttctgctgcatcattccaagagact
actagagttttaactgaagcagcgattgcaggtaaagtagataagttacgaggactaaaa
gaaaacgtgatagttgggcgattagtacctgctggcactggttactttatggataaaatg
cgtaaagcagctgtaaagcttgatgaagagaatgtataa

All links

Pathway (4)   
   KEGG PATHWAY (4)   
Chemical reaction (1)   
   KEGG ENZYME (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (4)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   NCBI-GI (2)   
Protein sequence (2)   
   UniProt (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (4)   
   GenBank (2)   
   EMBL (2)   
Protein domain (7)   
   Pfam (7)   
All databases (23)

DBGET integrated database retrieval system