KEGG   Rickettsia typhi: RT0030Help
Entry
RT0030            CDS       R.typhi                                

Definition VirB6-like protein of the type IV secretion system
Orthology K03201  type IV secretion system protein VirB6
Pathway rty03070  Bacterial secretion system
Class Environmental Information Processing; Membrane Transport; Bacterial
secretion system [PATH:rty03070]
BRITE hierarchy
SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT
Motif Pfam: TrbL
Motif
Other DBs NCBI-GI: 51473243
NCBI-GeneID: 2959327
UniProt: Q68XX4
Position complement(36090..39005) Genome map
AA seq 971 aa AA seqDB search
MQSNLLKVLGVLAIVATLVCFIFAALGMIGAVRIGNGCYMRYSKDGNGGADSITNTITLN
ANANYFNISKMLPDGTTKLIPDPNRYGEWLNTQVLVEKNQQVNLQVVGQVSLCLAYLPKN
NLQFTERTRPGKSNLDDSNQMIPIPRVQDANSPPVSLIMDAKNNEWRNIAELYANDKVLV
SVSPNFANTDATVDDVFKGVKVTKDCTQGKTSYYPICGKYSIYSGKYVTACELKQNYWKG
NVHREECYCVFGCIYQEENEQWICDAANSASHCCTSLVCDSLPAWINHYSNMPEAYKDDG
SFTFSWSDKSGNLLIDYQDLQCSNNVQIPPNGECPDIVDNRNPKDKDYIGGVHCTSGICK
DGDFQKNRKFWYTADGKGGKGPTGLIYQMNNTGSVSQALPSNLEFAKFVPETEQPPEYKD
KNGKYLYKVIYNIPFNSNIEKSYLQYRLWSPTSQDSSKNTGGYVLNIKQTKCYRENGNSF
KDIFDDRGRVQYIIVQSSENPNTSGKTYAPQGINVDSDGKSHFNANEAGYIWMKILNDPS
NNLKDYKDSEGSYKVHFSTSLKVGSFTIKVMNPLLQLFKTKVQGAATSIFKNMVCYKSTD
NTSCTNFFTYIKAILILYVMTYGAMFLLGFAKINQKELVIRIAKIGMVSGLINGNTFEFF
NNYLFDAITNFSDSIIANMSGYSLFTSTNTISNPFMFLDAIMSKIFFSQTFIAQLLSLLS
LGLSGIIYFIITFIAVCIVIITTLRAIAVYIMAFMATCILIGIAPLFISFLLFDFTRYLF
DNWVRFTIRYMIEPVVMMAGIIVLTQLFTIYLDFVLGYSVCWKCTLPIKIPFIGTILPIA
LLNVPIFCINWFAPWGMDYMSGMMGVNMQNIVALVIIAYGMYGYVEFSGRMVAKLTSAAG
PSATQIGDRMSHDAGQKTLSQIGMDYRTRKGITSRAKSRLKQRNRTLEHAEQNSKKYMKK
IGENTNEGTLK
NT seq 2916 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt
atgcagagtaacttattaaaagttttaggagtactcgctatagtagcaacattagtttgc
tttatttttgcagcacttggtatgataggagcagtaagaatcggtaacggctgttacatg
agatattctaaagacggcaatggaggtgcggattcaataaccaatactataacccttaat
gctaatgctaattatttcaatatttctaagatgttgcctgatggcactactaagcttata
ccagatcctaatcgttacggtgaatggttaaatactcaggtactagtagaaaaaaatcaa
caggtaaatttacaagtggtcggtcaagttagtttatgtttggcttatttaccaaaaaat
aatttacaatttactgaacgtacaagacctggtaaatcgaatctagacgatagcaatcag
atgattccaattccacgtgttcaagatgcaaatagcccacccgtttctctaataatggat
gcaaaaaataatgaatggcgtaatattgctgaattatacgctaatgataaagttttagtt
tctgtatctcctaattttgctaatactgatgcaacagttgatgacgtttttaaaggtgtg
aaggttacaaaagattgtacacaaggaaaaacttcttactatccgatttgtgggaaatat
tctatttattccggtaaatatgttactgcttgtgaactgaagcaaaattattggaaaggt
aatgtgcatcgtgaagaatgttattgtgtttttggatgtatttatcaagaagaaaatgaa
cagtggatatgcgatgctgctaattctgcttctcattgttgtactagtttagtttgtgac
tccttacctgcttggatcaatcactatagtaatatgccggaagcttataaagatgatggc
agttttacatttagttggtcagataagagcggtaatttattaatcgattatcaggatctt
caatgttctaataatgttcagatccctccaaacggtgaatgtcctgatattgttgataat
cgtaatcctaaagataaagattatataggaggggtacattgtacctcaggaatatgtaaa
gacggagattttcaaaaaaatcggaaattttggtatacagcagatggtaaaggcggaaaa
ggtccaaccggattgatatatcaaatgaataatactggttctgtaagtcaagctctacct
tctaatctagaatttgctaagtttgttccagagacagaacaaccacctgaatataaagat
aaaaacggtaaatatttatataaagttatatataatataccttttaacagtaatattgaa
aaaagttatttacaatataggctttggtcgcctacatcacaagattctagtaagaatacg
ggaggatatgttttaaatattaaacagactaagtgttatagagagaatggtaatagtttt
aaagatatttttgatgatcgtggacgagtacaatacataatagtacagtcttcagaaaat
ccgaatactagcggtaaaacttatgcacctcaaggaattaatgttgatagtgatggtaaa
tctcactttaacgcgaatgaggctggttacatatggatgaaaatcttaaatgatcctagt
aataatttaaaggactataaagatagtgaagggagctataaagtgcatttctcaacatca
ttaaaagtaggcagttttactattaaagtaatgaatccattacttcagttatttaaaact
aaagttcaaggtgcagctacttctattttcaaaaatatggtatgttataaatctactgat
aatacatcctgtactaacttttttacctatattaaagcaattttaatcctatatgtgatg
acttacggagcaatgttcttgcttggttttgctaagatcaatcaaaaagagctagtaatt
agaatagcaaaaattggaatggttagcggacttataaatggtaatacttttgaatttttc
aataactatctttttgatgcaattactaatttttcagactcaattattgctaatatgagt
ggatatagtttatttacttctactaatactatttccaatccttttatgtttttagatgca
ataatgagtaaaatattttttagtcaaacctttattgcgcaattactttcacttctttcc
cttggacttagcggtattatatattttataattacttttattgctgtttgtatagtcatt
attacgacacttagagctattgccgtttatattatggcatttatggcgacttgcatatta
atcggtatagcacctttatttattagttttttattatttgattttactagatatttattt
gataattgggtaagatttacgatccgctatatgatagaaccggtagttatgatggcaggt
attatcgtattaactcaactatttacaatttatctagattttgttttaggttatagcgtt
tgttggaaatgtactttaccgatcaaaattccatttattggcactattttgcctattgca
ttgctaaatgtacctatcttctgtattaattggtttgcaccttggggaatggactatatg
tcaggtatgatgggagtaaatatgcaaaatattgtagctttagttattattgcttatggt
atgtatggttatgtcgaattttcaggtcgaatggtagcaaaattaactagtgctgcagga
ccttctgctactcaaattggtgatagaatgtctcatgatgctggacaaaaaacattaagt
caaataggaatggattatagaacaagaaaaggtattaccagcagagcaaaatcaagatta
aaacaacgcaataggacattagaacatgctgagcaaaatagcaaaaaatacatgaaaaaa
attggtgagaatacaaatgaaggaacactaaaataa

DBGET integrated database retrieval system