KEGG T00229: SERP0341

Staphylococcus epidermidis RP62A: SERP0341

Entry

SERP0341 CDS T00229

Definition

ABC transporter ATP-binding protein

Orthology

K16012

ATP-binding cassette, subfamily C, bacterial CydC

Organism

ser Staphylococcus epidermidis RP62A

Pathway

ser02010

ABC transporters

Class

Environmental Information Processing; Membrane transport; ABC transporters [PATH:ser02010]

SSDB

Motif

Pfam:

ABC_tran AAA_21 SMC_N ABC_membrane DUF258 AAA_17 AAA_29 AAA_18 T2SE AAA_10 AAA_16 AAA_22 Miro AAA_33 DUF3987 AAA_19 MMR_HSR1 FtsK_SpoIIIE AAA_14 DUF87 SbcCD_C MobB AAA_30

Other DBs

NCBI-GI:

57866273

NCBI-GeneID:

3240661

UniProt:

Q5HR52

Position

342960..344654

AA seq 564 aa
MKSHIHFSIDRDLICAIMVGVLSGIVTLAMFFLSGYMITQSALGAPLYALMILVVSVKLF
GFLRAITRYIERLLSHKTTFTMLRNVRVQFLKMLYPVVPDIYRRFNSSDLITKMISRVEA
LQNIYLRVYYPPIVIGLTAIVSVITMLFLSPLHALVITLSMLLTLWIVPWLSAMKARKLK
QQVTQTQKTFLKRYYDYKEGHEELKRFNRSDDFENTVSQSLRQFDDMQLKERRFLSIYDY
LLNLIAMFSIFMCLVLGAQQIHDGQLNAIYITSIILMILTLFEQAVPMSNVAYYKADTDL
ALEEIQEVIVPKYKIPSEHTNLKRSQNLLLEIKNVTFKYEHQHHSTLKQINLTIEYGDKV
AIIGPSGSGKSTLLHVLLGLYQIEEGEVRLNGKDMNSINDNDKYQTFNAMLQSQYIFDGS
IRDNLFSEQSDDNLKKVLEDVGLEYLNLDSIVTLDGHNLSGGEAQRLSLARLLLRPSAGF
WILDEPTTALDINNTQKIINLIESLSQTLIIATHDLEILPRFNKIIVMNDGEIIENDSYQ
ELMQHDGYLKKVIEMNGNEMKFFN

NT seq 1695 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgaaatcacatattcattttagtatagatagagatttaatatgcgctatcatggtaggt
gttttaagcggaattgtaacattagcaatgttctttttaagtggttatatgattactcaa
agtgcgctaggtgcgccactttatgcattaatgattttagttgtatctgttaaattgttt
ggttttttaagagcaattacacgctatatagaaagattactttcacacaagacgacattt
acaatgttacgtaatgtacgagttcaatttttaaaaatgctatatccagtcgttccagat
atctatagaagatttaattcaagtgatcttattacaaaaatgataagccgtgtagaagct
ttacaaaacatatatctgagagtatattacccaccgattgtaatcggattaactgcaatt
gtttcagtaataactatgttgtttttatctccactacatgcattagtgattactttaagt
atgttattaactttatggattgttccttggttaagtgctatgaaagcacgtaaattaaag
caacaagtgacccaaacgcaaaaaacatttcttaaaagatattatgattataaagaaggt
catgaagaattaaaacgtttcaatcgcagcgatgacttcgaaaatacagtttcccagtct
ttacgacaatttgatgatatgcaacttaaggaacgccgatttctttctatttatgactac
ttgttaaacttaatagcgatgttctcaatatttatgtgtttagtgttaggtgcgcaacag
attcatgatggtcagctcaatgctatttatattacaagtattatattgatgatattaact
ttatttgaacaagcagtacctatgagcaatgtggcatattataaagcagatacagacctg
gcacttgaagagatacaagaggttattgtacctaagtataaaattccttcagaacataca
aacttaaagcgttcgcaaaatcttttattagaaattaaaaatgtcacatttaaatatgaa
catcaacatcattctactttaaaacagattaatctaaccattgaatatggtgataaggtg
gcaatcattggtccttcaggatcaggtaaaagtactttgcttcatgtattacttgggcta
tatcaaatagaagagggagaagtgagattaaatggtaaggatatgaacagtatcaatgac
aatgataaatatcaaacatttaatgcaatgcttcaatctcaatatatttttgatggttca
attcgtgataatttattttctgagcaatcagatgataacctcaaaaaggttctcgaagat
gttggattagaatatttaaatttagatagtatagttacgttagacggtcataatttatca
ggtggggaagctcaacgtctaagtttagcgagattgctattaagaccttcggccggtttt
tggatattagatgaacctactacagcactagatattaataatacccaaaaaattataaat
ttgattgaatccttatcccaaacactcatcatagctacacatgatttagaaatacttcca
agatttaataaaattatagtcatgaatgacggagaaataatagaaaatgattcatatcaa
gaattaatgcagcatgacggttatttaaaaaaagtaatagaaatgaatggaaacgaaatg
aaattttttaattaa

All links

Pathway (1)   
   KEGG PATHWAY (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (4)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   NCBI-GI (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (2)   
   UniProt (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
Protein domain (23)   
   Pfam (23)   
All databases (31)   

Download RDF

DBGET integrated database retrieval system