KEGG   Spiroplasma mirum ATCC 29335: SMM_0642
Entry
SMM_0642          CDS       T03003                                 
Name
(GenBank) fibril protein
Organism
smir  Spiroplasma mirum ATCC 29335
SSDB
Motif
Pfam: PNP_UDP_1
Other DBs
NCBI-ProteinID: AHF61064
UniProt: W0GR03
Position
complement(608298..609836)
AA seq 512 aa
MIGVISTAYFTMKDKHSIKTIKKYWWKNCVIQHLKYHGKTFIIATVGYGKANAAMAITYL
LEKYPGLQTIINIDLALSTNDKHDTADTTISTKFIYRDADLTVFKDIKYGQIVNEPESFQ
FDGEFAKVIKDFKLGLTEGVTGTADMLIYNSKQFKEMVDKYGHTIDVIDTEAGAIAQVAK
KSSINYLALKIIYNNALSPWDNDPLHKFKMYETVNTLKYLLRRLFNLLSSRYIIDLSQSS
ADDLDSINELFEIKHDDWIKLFKPNTHKVLSGFGPSLMLVDKQEKSPVALDIIQVMKNKV
KDNEGPSKVILGEDEWKNAPKKWLRKLLFLEQVRVNDDELLWNKSAKYDLNTEKLYKVET
VANEIAAAIAEKAQDKSSYTYNGATVPQKYLLVNCDARISFYITHNQSHEFVEDKHFGSQ
LVSNEFVKYLNEALKDVDSPYQQVVIYMTVPALDYRKIPIFIPSAKGVSRGIKFGNINQK
LQRDYTVVDITRNDYDPIKVGSFKVTIRLKSE
NT seq 1539 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgattggagttatttcaactgcgtatttcacgatgaaagacaaacacagcattaagact
attaaaaagtattggtgaaaaaactgtgttatccaacatctaaaataccatgggaaaact
tttattattgcaactgtaggttatggaaaagctaatgcagcgatggcaataacttactta
ttagaaaaatacccaggattacaaacaattatcaatattgacttagcgttatcaacaaat
gataaacatgatactgctgatacaacaatttcaacaaaatttatttatcgtgatgctgat
ttaacagtatttaaagacattaaatatgggcaaattgttaatgaaccagaatcattccaa
tttgatggtgaatttgccaaagttattaaagactttaaattaggattaactgaaggggtt
actggaacagctgatatgttgatctataactcaaaacaatttaaagaaatggttgacaaa
tatggtcacacaattgatgttattgatactgaagcaggggccatcgcccaagttgcgaaa
aaatcaagtattaattacttagcattaaaaattatttataacaatgcattatcaccatga
gataatgacccattacataaatttaaaatgtatgaaacagttaatactttaaaatactta
ttaagaagattatttaacttattaagttcacgttacattattgatttatcacaatcatca
gcagatgatttagattcaattaatgaattatttgaaattaaacatgatgattgaattaaa
ttattcaaaccaaatactcataaagtattatcaggatttggaccatcattaatgttagtt
gataaacaagaaaaatcaccagttgcgttagacattattcaagttatgaagaataaagtt
aaagacaacgaaggaccaagtaaagttattttaggagaagatgaatgaaaaaatgctcct
aaaaaatgattacgtaaattattattcttagaacaagttcgtgttaatgatgatgaacta
ttatgaaataaatcagctaaatatgatttaaacactgaaaaattatataaagtggagacc
gtggctaacgaaattgctgccgcaattgctgaaaaagcccaagataaatcatcatacaca
tataacggagcaactgttccccaaaaatacttattagttaactgcgatgctagaatttca
ttctacattactcataaccaatcacatgagtttgttgaagacaaacactttggtagtcaa
ttagtaagtaacgaatttgttaaatacttaaacgaagcattaaaagatgttgattcacca
taccaacaagttgtaatttacatgacagtaccagcattggattaccgtaaaattccaatc
tttattccttcagcaaaaggcgtaagtcgtggaattaaatttggaaacataaaccaaaaa
ttacaaagagattacactgtggttgatattacaagaaatgactatgacccaatcaaagtt
ggttcatttaaagtaactattcgtttaaaaagtgaataa

  All links  
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (2)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (1)   
   UniProt (1)   
Protein domain (1)   
   Pfam (1)   
All databases (5)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system