ID Q0E030_ORYSJ Unreviewed; 309 AA.
AC Q0E030;
DT 17-OCT-2006, integrated into UniProtKB/TrEMBL.
DT 17-OCT-2006, sequence version 1.
DT 01-MAY-2013, entry version 53.
DE SubName: Full=Os02g0581300 protein;
DE SubName: Full=cDNA clone:J023105G15, full insert sequence;
GN OrderedLocusNames=Os02g0581300;
OS Oryza sativa subsp. japonica (Rice).
OC Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
OC Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade;
OC Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
OX NCBI_TaxID=39947;
RN [1]
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RA Kikuchi S., Satoh K., Nagata T., Kawagashira N., Doi K., Kishimoto N.,
RA Yazaki J., Ishikawa M., Yamada H., Ooka H., Hotta I., Kojima K.,
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RA Shishiki T., Otomo Y., Murakami K., Iida Y., Sugano S., Fujimura T.,
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RA Kobayashi M., Xie Q., Lu M., Narikawa R., Sugiyama A., Mizuno K.,
RA Yokomizo S., Niikura J., Ikeda R., Ishibiki J., Kawamata M.,
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RT japonica Rice.";
RL Science 301:376-379(2003).
RN [2]
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA].
RC STRAIN=cv. Nipponbare;
RX PubMed=16100779; DOI=10.1038/nature03895;
RG International rice genome sequencing project (IRGSP);
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RL Nature 436:793-800(2005).
RN [3]
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
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RA Ito K., Ito S., Ito T., Ito Y., Ito Y., Iwabuchi A., Kamiya K.,
RA Karasawa W., Kurita K., Katagiri S., Kikuta A., Kobayashi H.,
RA Kobayashi N., Machita K., Maehara T., Masukawa M., Mizubayashi T.,
RA Mukai Y., Nagasaki H., Nagata Y., Naito S., Nakashima M., Nakama Y.,
RA Nakamichi Y., Nakamura M., Meguro A., Negishi M., Ohta I., Ohta T.,
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RA Shimokawa T., Song J., Takazaki Y., Terasawa K., Tsugane M., Tsuji K.,
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RL Nature 436:793-800(2005).
RN [4]
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RG IRGSP(International Rice Genome Sequencing Project);
RT "Oryza sativa nipponbare(GA3) genomic DNA, chromosome 2.";
RL Submitted (FEB-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
RN [5]
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RG The Rice Annotation Project (RAP);
RT "The Second Rice Annotation Project Meeting (RAP2).";
RL Submitted (FEB-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
RN [6]
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RX PubMed=16381971; DOI=10.1093/nar/gkj094;
RA Ohyanagi H., Tanaka T., Sakai H., Shigemoto Y., Yamaguchi K.,
RA Habara T., Fujii Y., Antonio B.A., Nagamura Y., Imanishi T., Ikeo K.,
RA Itoh T., Gojobori T., Sasaki T.;
RT "The Rice Annotation Project Database (RAP-DB): hub for Oryza sativa
RT ssp. japonica genome information.";
RL Nucleic Acids Res. 34:D741-D744(2006).
RN [7]
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RG The Rice Annotation Project (RAP);
RA Itoh T., Tanaka T., Barrero R.A., Yamasaki C., Fujii Y., Hilton P.B.,
RA Antonio B.A., Aono H., Apweiler R., Bruskiewich R., Bureau T.,
RA Burr F., Costa de Oliveira A., Fuks G., Habara T., Haberer G., Han B.,
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RA Kanno M., Kawahara Y., Kawamura T., Kawashima H., Khurana J.P.,
RA Kikuchi S., Komatsu S., Koyanagi K.O., Kubooka H., Lieberherr D.,
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RA Osato N., Palmer L.E., Quetier F., Raghuvanshi S., Saichi N.,
RA Sakai H., Sakai Y., Sakata K., Sakurai T., Sato F., Sato Y.,
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RA Zhang H., Zhao Q., Higo K., Burr B., Gojobori T., Sasaki T.;
RT "Curated Genome Annotation of Oryza sativa ssp. japonica and
RT Comparative Genome Analysis with Arabidopsis thaliana.";
RL Genome Res. 17:175-183(2007).
RN [8]
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RG The Rice Annotation Project (RAP);
RA Tanaka T., Antonio B.A., Kikuchi S., Matsumoto T., Nagamura Y.,
RA Numa H., Sakai H., Wu J., Itoh T., Sasaki T., Aono R., Fujii Y.,
RA Habara T., Harada E., Kanno M., Kawahara Y., Kawashima H., Kubooka H.,
RA Matsuya A., Nakaoka H., Saichi N., Sanbonmatsu R., Sato Y., Shinso Y.,
RA Suzuki M., Takeda J., Tanino M., Todokoro F., Yamaguchi K.,
RA Yamamoto N., Yamasaki C., Imanishi T., Okido T., Tada M., Ikeo K.,
RA Tateno Y., Gojobori T., Lin Y.C., Wei F.J., Hsing Y.I., Zhao Q.,
RA Han B., Kramer M.R., McCombie R.W., Lonsdale D., O'Donovan C.C.,
RA Whitfield E.J., Apweiler R., Koyanagi K.O., Khurana J.P.,
RA Raghuvanshi S., Singh N.K., Tyagi A.K., Haberer G., Fujisawa M.,
RA Hosokawa S., Ito Y., Ikawa H., Shibata M., Yamamoto M.,
RA Bruskiewich R.M., Hoen D.R., Bureau TE., Namiki N., Ohyanagi H.,
RA Sakai Y., Nobushima S., Sakata K., Barrero R.A., Sato Y., Souvorov A.,
RA Smith-White B., Tatusova T., An S., An G., OOta S., Fuks G.,
RA Messing J., Christie K.R., Lieberherr D., Kim H., Zuccolo A.,
RA Wing R.A., Nobuta K., Green P.J., Lu C., Meyers BC., Chaparro C.,
RA Piegu B., Panaud O., Echeverria M.;
RT "The Rice Annotation Project Database (RAP-DB): 2008 update.";
RL Nucleic Acids Res. 36:D1028-D1033(2008).
RN [9]
RP GENOME REANNOTATION.
RC STRAIN=cv. Nipponbare;
RX PubMed=18089549; DOI=10.1093/nar/gkm978;
RG The rice annotation project (RAP);
RT "The rice annotation project database (RAP-DB): 2008 update.";
RL Nucleic Acids Res. 36:D1028-D1033(2008).
CC -!- SIMILARITY: Contains 1 TLC (TRAM/LAG1/CLN8) domain.
CC -----------------------------------------------------------------------
CC Copyrighted by the UniProt Consortium, see http://www.uniprot.org/terms
CC Distributed under the Creative Commons Attribution-NoDerivs License
CC -----------------------------------------------------------------------
DR EMBL; AP008208; BAF09158.1; -; Genomic_DNA.
DR EMBL; AK071553; BAG92552.1; -; mRNA.
DR RefSeq; NP_001047244.1; NM_001053779.1.
DR UniGene; Os.14337; -.
DR EnsemblPlants; LOC_Os02g37080.1; LOC_Os02g37080.1; LOC_Os02g37080.
DR GeneID; 4329785; -.
DR KEGG; osa:4329785; -.
DR OMA; IYRMLVR; -.
DR ProtClustDB; CLSN2692880; -.
DR GO; GO:0016021; C:integral to membrane; IEA:UniProtKB-KW.
DR InterPro; IPR016439; Longevity_assurance_LAG1_LAC1.
DR InterPro; IPR006634; TLC-dom.
DR Pfam; PF03798; TRAM_LAG1_CLN8; 1.
DR PIRSF; PIRSF005225; LAG1_LAC1; 1.
DR SMART; SM00724; TLC; 1.
DR PROSITE; PS50922; TLC; 1.
PE 2: Evidence at transcript level;
KW Complete proteome; Membrane; Reference proteome; Transmembrane;
KW Transmembrane helix.
SQ SEQUENCE 309 AA; 36421 MW; F2C81A6513727A70 CRC64;
MGVAAAAGRL LAAVDWEREA YPAYRDFFAL PLFAVFFLVV RYLLDCFVFE WIGRKLIFGK
EKVDYEKEET RKKIRKFKES AWKCVYFLSG EILSLSVTYN EPWFTNTKYF WVGPGDQVWP
DQKIKWKLKA VYMYAAGFYT YSIFALMFWE TRRSDFGVSM SHHVATVALI VLSYVFRFAR
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SEGEDEHED
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