KEGG   Schizosaccharomyces pombe (fission yeast): SPAC26A3.05Help
Entry
SPAC26A3.05       CDS       T00076                                 

Gene name
chc1
Definition
clathrin heavy chain Chc1 (predicted)
Orthology
K04646  
clathrin heavy chain
Organism
spo  Schizosaccharomyces pombe (fission yeast)
Pathway
Endocytosis
Class
Cellular Processes; Transport and catabolism; Endocytosis [PATH:spo04144]
BRITE hierarchy
SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT
Motif Motif
Other DBs
NCBI-GI: 
NCBI-GeneID: 
GeneDB: 
UniProt: 
Position
I:join(3339136..3339177,3339218..3339291,3339348..3344232)
Genome map
AA seq 1666 aa AA seqDB search
MAQQLPIRFSEVLQLASVGIQPSSFGFANVTLESDKYVCVRDNPNGVNQVVIVDLEDPSN
VLRRPISADSVILHPKKKIIALKAQRQLQVFDLEAKAKINSYVMNQDVVYWTWISDSVIG
MVTDTSVFHWTVSGSDPVKMFDRHSSLNGTQIISYKSNYNEEWFTLIGISSRDNRIAGNL
QLYSKKRKVSQPLESHASAFAVIQPEGVDHEVQVLALASRLPTGSKLSIVEVDRNPNNPA
FATKTVDLFFPPEAVNDFPIAIEIGSTYNVAYVVTKYGFIHVYDLETAKCIYMNRVSGES
IFVTTAHKSVNGLMAINRKGQVLSVSINPETIIPYILSNLNDPGLAVRMASHANLPGADN
LYMQQFQQLMAQGNYSEAAKVAASSPRGILRTSQVIDQFKLIQAAPGQIAPILQYFGTLL
DKGPLNEHETIELARPVLAQNRIQLLEKWYGENKLACTEALGDLVKPYNTPFALKIYETA
NVPNKVVMCLSELGDFGKLATYTSQQNITPDYVSLLQNLVRVNPDQAAEFATQMFNSNPS
INLEKIVDIFMSQNLVQQATAFLLDALKDDNPEHSHLQTRLLEINLINAPQVADAILGNQ
MFTHFDRAVIASLCERAGLVQRALELYDKPADIKRVIVHSNLLNPEWLMNYFSRFSPDEV
YDYLREMLRSNLRQNLQIVVQIATRYSDLVGAQRIIEMFEKFKTFEGLYYYLGSIVNITE
DPEVVYKYIQAACLMNQFTEVERICRDNNVYNPEKVKNLLKEAKLADQLPLILVCDRYDF
VNDLVFYLFRNNMFQFIEIYVQRINPSKTPQVVGALLDIDCDEELVQNLLMSVVGQVPVD
ELVEEVERRNRLKLLLPYLESLLQSGSQDRAIYDALAKIYIDSNNNPEVFLKENNFYDTL
TVGKYCEKRDPYLAFIAYEKGGNDTEIINLCNENSMFKQLARYLLKRSDSNLWSEVLQDS
AYRRPLLDQVIATAVPESSDPEAVSIVVKALMEVDLPSQLIELLEKIVLQPSSFSENANL
QNLLFLTAIKADKSRVMEYIDKLDKYDVDEIAEIAIENGLYEEAFRIYKIHNKHEQAMKV
LVEDIVSLDRAQDYAETVEQPEVWSRLAKAQLDGIRIPDAIESYLKADDPSNYSEVIELA
SRAGKYEELIKYLLMARSKMHEPDVDSALLIAYAKTNQLTEMETFLIGSNVADVKAVGDE
CFESKNYEAAKLMYSSISNWSMLATTLVYLGEYQGAVDCARKANSIKVWKQVGTACIDKR
EFRLAQICGLNLIVHAEELPGLIRLYEERGYFEEVISLMEAGLGLERAHMAFYTELAILY
AKYKPERMMEHLKLFWGRLNMAKVIRACDQMHLWNEAVFLYVHDQSYDNAAAVMMEQPEA
FDHQSFKDIIVHVANLELYYRALNFYLEQHPMLLTDLLAALTPRIDHPRVIRIFEKSENT
PLILNFMVAIQHLNIQAVNHAYNDLLIEMEDYQSLQDSIENYDHFDAIALARRLEKHSLL
EFRRIAAYIYRKNKRWTQSIELSKQDRFYKDAIITARDSDQTTIAEDLMKYFVEIGNYEC
FAAILYTCYHLLRNDLVMEISWRKGLQDYAYPYFINFQCEMFSKVLNLEKDLKDRQAVKS
EEESASTIGAGILGNTLMLTQGPMANNNDQFDSFQQASPMPRLGNF
NT seq 5001 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt
atggctcaacaattaccaatacggttcagtgaggtgttacagctcgcatccgtaggaatt
caaccgtcttctttcggatttgcaaatgtaacccttgaatctgacaaatatgtttgtgtt
cgcgataatccaaatggtgtaaaccaggtcgttattgtcgatttggaagatccatctaat
gtgttgcgacgtcctatttcggcagattcagttatcttacatcccaaaaagaaaattatt
gcattaaaagcacaaagacaacttcaagtattcgacttggaagcgaaagcgaaaattaat
agttatgtaatgaatcaagatgtcgtttactggacttggatcagcgatagcgttatcggt
atggtcactgacacttctgtgttccactggaccgtctccggctctgatcctgttaaaatg
tttgatcgtcatagctcattgaatggaacgcagatcatttcctacaagagcaactataat
gaagaatggtttacattgatcggtatttcctcccgggataaccgtattgctggcaatctt
caactgtattccaaaaagaggaaggtcagtcagcctctggaaagtcacgcttctgcattt
gcagtcattcaaccagaaggcgttgatcatgaagttcaagttttagcacttgccagtcga
ttacccacaggctcgaaacttagtattgttgaggtagaccgtaaccccaacaatcccgcg
tttgctaccaaaaccgtcgatcttttcttccctccggaagccgttaatgattttcctatt
gctattgaaattggttccacttataacgttgcttatgttgttaccaaatatggctttatt
catgtttatgatttggaaaccgcgaaatgcatttatatgaatcgtgtttcgggtgaatca
atctttgtaaccactgctcataaatctgtgaatggtcttatggccattaaccgaaagggt
caagttcttagcgtatccataaaccctgaaaccatcattccttatatcttgtctaatctt
aatgaccctggtttggcagtccgaatggcatctcatgctaatcttcccggagctgacaat
ttgtatatgcaacagttccagcagcttatggctcaaggaaactacagcgaggctgctaag
gtggctgcttcatctcctcgtggtattcttcgtacctctcaggtgattgatcaattcaag
cttattcaagctgctcctggtcaaattgctcctatcttacaatatttcggcactttgttg
gataagggtcctttgaatgaacatgaaacaattgaattggctcgtcctgtgcttgctcaa
aaccgtatccaacttcttgaaaaatggtatggtgaaaacaagttggcctgtacagaagcg
ttgggtgatttagttaaaccttacaacactcctttcgcattgaagatttacgaaactgcc
aatgtgccaaacaaggttgtcatgtgcttatcagagttgggagattttggcaagttggct
acttacacatctcagcaaaacatcactccggattacgtctctcttctccaaaaccttgtt
agagttaaccctgatcaagctgcggagtttgctactcaaatgttcaacagtaacccctcc
attaatttagagaagattgttgacattttcatgtctcagaatttagttcaacaagcgacc
gcatttttgttggatgctcttaaggatgacaatcctgaacattctcatcttcaaactcgt
cttcttgagattaatttaattaatgcccctcaagttgctgatgctattttgggtaaccaa
atgtttactcactttgatcgtgccgtaattgcttcgctttgcgagcgcgctggtttagta
caacgtgctttggagttgtatgataagcctgctgatattaagagagtgattgttcactca
aatttattgaatcctgaatggttgatgaattactttagcagattttcacctgacgaggtt
tatgattaccttcgtgaaatgcttcgctctaatcttcgtcaaaatcttcaaatagttgtc
caaattgctactcgttactcagaccttgttggtgctcaacgcatcattgagatgtttgaa
aagttcaagacttttgaaggattgtactattatttgggtagtattgtaaacatcactgaa
gatccagaagtcgtatataagtatatccaggctgcttgtttgatgaaccagtttactgaa
gttgaacgcatctgtcgtgacaacaatgtttacaaccctgagaaggttaagaacttgctc
aaagaagccaaattagcggatcagcttccccttattcttgtttgcgatcgttatgacttt
gtcaatgatttggttttctatcttttccgaaacaacatgtttcaatttattgaaatatac
gttcaacgtattaatccctctaagactcctcaagtggtaggtgctttgttagatattgat
tgcgatgaagaacttgtccaaaacctcttgatgtctgttgttgggcaggttcctgtggat
gagttggttgaagaagttgagagacgcaatcgccttaaacttttgctgccctatttggaa
tctcttttgcaatctggtagtcaagatcgtgctatttatgacgcacttgccaagatatat
attgattccaataacaatcctgaagtatttttgaaagaaaacaacttttatgatactctt
acggttggtaaatactgtgaaaagcgtgatccctatttggctttcatcgcttatgagaag
ggtggtaatgatactgaaatcattaacctatgtaacgaaaactcaatgttcaaacagtta
gctcgttatcttcttaagcgcagtgactctaacctttggtccgaggttttgcaagacagt
gcttaccgccgtcctttgttggaccaggttatcgcaactgcagttcccgaatcttcagat
cctgaagcagtttcaattgtagtgaaagctttaatggaagtagatcttccttcacagctc
attgaattattggagaagattgttttgcaaccttcatccttcagcgaaaatgccaatctt
caaaacttgttgtttttgactgccattaaagctgataaatcacgtgttatggagtatatc
gataagttggataagtacgatgtcgatgagattgccgaaattgctattgaaaatggcctt
tatgaagaggctttcagaatttacaagattcacaacaagcatgaacaggctatgaaggta
ttagttgaggacattgttagtctcgatcgtgctcaagactatgccgaaacagttgaacag
cctgaagtttggtctcgccttgctaaggcccaattggatggaattagaattccggatgct
attgaatcatatttgaaggcagatgatccttcgaattactcagaggtaattgaattagct
tctcgtgctggtaagtatgaggaattgatcaaatatcttttgatggcaagaagcaagatg
catgagcctgatgtcgatagcgctcttcttattgcctatgcaaagaccaaccaattgact
gaaatggaaaccttcttgatcggctctaacgttgctgatgtcaaggcagtcggtgatgaa
tgctttgaaagcaaaaactatgaggcagcaaagcttatgtattccagcatttccaattgg
tctatgcttgccactactttagtctatcttggagaatatcagggagctgttgattgtgct
cgtaaggccaattccattaaggtttggaaacaagttggtaccgcttgtatagacaagcgt
gagtttagacttgctcaaatttgtggtttgaatcttatcgtccatgctgaggaacttcct
ggcctcatccgactttacgaagagcgtggttatttcgaagaggttatctcgttaatggaa
gctggtttgggtttggagcgtgctcatatggctttctacaccgaactcgctattttatat
gctaaatacaagcccgagcgtatgatggagcatttgaaactgttctggggtagactcaat
atggccaaagttattagagcttgtgatcaaatgcatttgtggaatgaagctgttttctta
tatgttcatgaccaaagttacgataatgccgcagctgtgatgatggagcaacccgaggcg
tttgatcatcaatccttcaaggacattattgttcatgttgctaatctcgagctttattat
cgtgcacttaacttctatctggagcaacatcccatgcttctaactgatttgttagctgcc
cttactcctcgcatcgatcatcctcgtgtaattcgtatttttgagaaatccgaaaataca
ccacttattttgaactttatggttgccattcaacatcttaatattcaagctgttaaccat
gcctataatgacttacttattgagatggaagattaccaatccttgcaagattctattgag
aattatgatcattttgatgcgattgctttggccagacgtcttgagaagcattctttattg
gagtttagacgtatcgccgcttacatttatagaaagaacaaacgttggacacaatcaatt
gaactttccaagcaagaccgtttttacaaggatgccattattactgcccgcgattccgat
cagactaccattgccgaggatttaatgaagtactttgtggaaattggcaactatgagtgt
ttcgctgctattctatatacttgctatcacttgttgcgcaacgatttagtaatggaaatt
agctggcgtaagggcttacaagattacgcttacccctactttattaatttccaatgtgaa
atgttttcaaaagttctcaatttagaaaaggacttgaaggatcgacaagccgttaagtcg
gaagaggaatcagctagtacaattggtgccggaatacttggcaatacgttaatgcttacc
caaggacccatggctaacaataatgaccaatttgattctttccaacaagcatccccaatg
ccaagacttggtaatttttag

DBGET integrated database retrieval system