| Entry |
|
| Definition |
ATP-dependent exonuclease V alpha subunit
|
| Orthology |
| exodeoxyribonuclease V alpha subunit [EC: 3.1.11.5] |
|
| Organism |
ssp Staphylococcus saprophyticus
|
| Pathway |
|
| Class |
Genetic Information Processing; Replication and repair; Homologous recombination [PATH: ssp03440]
 |
| SSDB |
    |
| Motif |
 |
| Other DBs |
NCBI-GI: NCBI-GeneID: UniProt: |
| Position |
1188933..1191317
 |
| AA seq |
794 aa  
MGDPTLFNNSMIKGTVDAILFQNKENFYTVLKVDTIESSETFDSMPTIVGFFPEIAEGDV
YTFKGQVVTHPKYGKQLKAETFEKELPQTKEAIISYLSSDLFKGIGKKTAQSIVNKLGEN
AINDILNDPSVLEQVPGLPKKKQKQIAEQIASNQETEQIIIRLHDLGFGPKLAMAIYQAY
LGETLNVVENKPYQLVYDVKGIGFNKADTLARNVGIQFNDTERLKAGLLYVLEEECIKQG
HTYLPTQNVLEMTQDMLSQAPSEIIEMQQLNHVLQELVNDTKLIQQENEVAIPSLYYSEL
KSVQNLYRNYAYKNKLKQIEQSDLLMKIGEIEERNQVNYANSQKDALQTAINSKIMLLTG
GPGTGKTTVIKGIVELYAEIHGLSLNYDDYQNDDYPVVLGAPTGRASKRLAESTGLEAMT
IHRLIGWNQDTQPEDILDNEISAKLIIIDEMSMVDTWLFHQFLSAVPIDAQIILVGDEDQ
LPSVGPGQVFKDLIDSKVIPRVNLTEVYRQQDGSSIIELAHRMKLGEPIDITQRFHDRNF
INCNTDQIPTVVEKVVSSAVNKGYDMSDIQVLAPMYKGSAGIKKLNMVLQDILNPKDKDT
REIEFGDVFFRKGDKVLQLVNRPNDNIFNGDIGVIVGVFWAKENALNKDVLVVDFEGNEI
TFVRQDLIELTHAYCTSIHKSQGSEFPIVIMPMVKQYFRMLQKPILYTGLTRAKQSLVFL
GDPQAFDIGLKTHGQVRMTQLCTFLKAYFNNDASTEEEISDTFDADIILTEDNIFKINPM
INMGDISPYDFVED |
| NT seq |
2385 nt  +upstreamnt +downstreamnt
atgggagaccctacactatttaataattcaatgattaaaggaaccgttgatgcgatttta
tttcaaaataaagaaaatttttatacggttttaaaagttgatacaattgagtcaagtgaa
acatttgattcaatgcctacgattgtagggtttttcccagaaattgctgaaggtgatgtt
tatacattcaaaggccaagttgttacacatccgaagtatggtaaacaacttaaagctgaa
acgtttgaaaaagaattaccacaaactaaagaggcaattattagttatttatcaagtgat
ttatttaaaggtattggtaaaaaaactgcgcaaagtattgttaataaactaggtgaaaat
gctataaacgatatcttaaatgacccgtcggtattagagcaagtacctggtttacctaag
aaaaagcaaaaacaaatagctgaacaaattgctagtaatcaagagacggagcaaattatc
atacgcttacatgatttagggtttggaccaaaactagctatggcgatttaccaagcgtat
ttaggagaaacacttaatgttgttgaaaataaaccctaccaactcgtatatgatgtaaaa
ggaattggatttaataaagctgataccttagcacgtaatgttggaatccagttcaatgat
acagaaagactaaaagcgggtttgttatatgtacttgaagaggaatgtattaagcaagga
catacatatttacctactcaaaatgtattagaaatgactcaagatatgctttctcaagca
cctagtgaaataatagaaatgcaacaattgaatcatgtattacaagaattggtaaatgat
accaaactcattcaacaagaaaatgaagttgcaattccgagtttatattattcagaatta
aaaagtgtgcagaatctttatcgcaattatgcgtataagaataaactcaaacaaatagaa
cagtctgatcttttaatgaagattggagaaattgaagagcgcaatcaagttaattatgca
aattcacaaaaagatgcgttacagactgctattaattctaaaattatgctgctcacaggt
ggccctggtacaggtaaaacaactgtgataaaaggtattgtagaattatatgcagaaatt
catggtctctcattaaattatgatgattatcaaaatgatgattatccagtcgtattaggt
gcgcctacaggaagagcttcaaagcgtttggcagagtcgacaggtttagaagccatgaca
attcatcgcttaatcggatggaatcaggatacacaaccggaagatattttagataatgaa
atatcagcaaaattaattatcattgatgagatgtctatggttgatacttggctgtttcac
caatttttaagtgcagttccaatagatgcacaaatcattttagtaggtgatgaagatcaa
ttgccttctgtaggtcctggtcaagtatttaaagatttaattgattcaaaagtgatacct
cgtgttaatttaacagaagtttatagacaacaagatggttctagtattattgaattagcg
catcggatgaaactaggtgaaccgattgatataacccaacgttttcatgatcgaaatttt
ataaattgtaatacagatcagattccgacagttgtggaaaaagttgtttcaagcgctgtg
aataaaggctatgatatgagtgacattcaagtgcttgcaccaatgtataaagggtcagca
ggcattaaaaaacttaatatggtattacaagatattttaaatcctaaggataaagataca
cgtgaaatagaatttggtgatgtgttttttagaaaaggtgacaaagtcttgcaacttgta
aataggcctaatgataatattttcaacggtgatattggtgtaatcgtgggtgttttttgg
gcaaaagaaaatgcgttgaacaaagatgtattagtcgttgattttgaaggtaatgaaatt
acttttgttcgtcaagatttaatagaattaactcatgcttattgtacgtcgatccataaa
tcacaaggttctgaattcccaatagtcatcatgcctatggtaaaacaatactttagaatg
ctacaaaagcccatattatatactggcttaacaagggctaaacaatcccttgtcttttta
ggtgatccgcaagcctttgatattggtttaaaaacgcatggacaagtgagaatgacacag
ttatgcacatttttaaaagcctactttaataacgatgcatctactgaagaagaaatcagc
gacacatttgatgctgatatcattctaactgaagacaatatttttaaaattaacccaatg
attaatatgggagatatttccccatatgacttcgttgaagattga |