KEGG   Spiroplasma syrphidicola: SSYRP_v1c03570
Entry
SSYRP_v1c03570    CDS       T02677                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K01992  ABC-2 type transport system permease protein
Organism
ssyr  Spiroplasma syrphidicola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ssyr00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:ssyr02000]
    SSYRP_v1c03570
Transporters [BR:ssyr02000]
 ABC transporters, prokaryotic type
  ABC-2 type and other transporters
   ABC-2 type transporter
    SSYRP_v1c03570
SSDB
Motif
Pfam: ABC2_membrane_2 ABC2_membrane_4 LuxC Corona_6B_7B TSP_Ig-like
Other DBs
NCBI-GeneID: 16153100
NCBI-ProteinID: AGM25951
UniProt: R4UL17
Position
386678..388546
AA seq 622 aa
MNHSVLKNKNQKTSKFQEKLKNAFSLKIFRYSLIKMLKSPSTYVLLAITMVTNAILVLAF
TGFSNSGSNLNNAINEQLTFYLWIFFIFYFSFTAMYIGFKSVQIIRDELDDGTLLIMASL
PITRFKMIFEKWLSLQLICLGYAIIVLFIPPLFGYVTGELGQLLTNAIYSALPYMFLTAI
IIQFLLSSVAILLSLIIGSKGVIGILFILGFLSLIGALGPFIYNVSNNSNPSSIFLSFTS
DSAKKKISLNSTNKNVFKNMTDIRGWDIWNLNSDGLTLKNSSNWGNFSLKYDLTNINKEA
QKIIAEKPNVSSEGYRTYILTNASTYPLMNNLVSDHELTIDNVSLPKYSGGQNFTILEND
NLGINLLSNFYENVKTKKPVTLSWKNNVVGDLGIKNFDTTNITTPEDKAILQLMNEWYQK
ELFTPNSKNYSVKRLIDLYDISKQITGTTFGNLFDLVSSSLNPPYESNNSKGLYFNDLSL
NTIHYFTNNLISEILRPIQSFGKTNNDIDNVNKAIDKIKKQELSYRLMGYLNIWQQWMVM
WTGNKGTNGFLPMLPLNNFLTSQLYPVKYQSGSDIFTTYSIGANFAAPVEIVNLPVMISV
YTIFSLGIAALSVWSITRKDFV
NT seq 1869 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaatcattcagttttaaagaacaaaaatcaaaaaacatcgaagttccaagaaaaactt
aagaatgctttttcattaaaaatttttcgttatagtttaattaaaatgttaaagtcaccg
tcaacctatgtccttttagcaattacaatggttacaaatgccattttagttttagccttt
acgggtttttcaaattctggtagtaatttaaataatgctataaacgaacaattaacattt
tatttgtggattttctttattttttatttttcttttacagcaatgtatataggttttaaa
tcggtccaaattattcgggacgaattagatgatggaacattattaattatggcgtcttta
ccaattactcgctttaaaatgatttttgaaaaatgattatcattacaattaatttgttta
ggttatgcaattattgtattatttattccacctttatttggttatgttactggtgaatta
gggcagttattaactaatgcgatatatagtgctttaccatatatgtttttaacagcaatt
attatccaatttttattatcaagtgttgctattttattatcgttaataattggtagcaaa
ggggtaattggaattctttttatcctaggatttttatcattaattggtgccttggggcct
tttatttataatgtttcaaataacagtaatccaagttcaatttttttatcatttacatct
gattctgctaaaaagaaaatttcattaaatagcacaaacaaaaatgtctttaaaaatatg
acagatattcggggttgagatatttgaaaccttaacagtgacggtttaacacttaaaaat
tctagtaattgaggaaacttttccttaaaatatgatttaaccaatattaataaggaagct
cagaaaattattgctgaaaaacctaatgtttcatcggaaggatatcgaacatatatttta
actaatgctagtacttatcctttaatgaataatcttgttagcgatcatgaattaacaata
gataacgttagtttaccaaaatacagtgggggtcaaaattttacaatattagaaaatgat
aatttgggaatcaatttattatctaatttttatgaaaatgttaaaactaaaaaaccagtt
actttatcatgaaaaaataatgttgttggtgatttaggaattaaaaattttgatacaact
aatattacaaccccagaagacaaagcaattctacaactaatgaatgagtgatatcaaaag
gaactttttactccaaactcaaaaaattattctgtcaaaagattaattgacttatatgat
atatcaaaacaaattacagggacaactttcggtaatttatttgacttagtatctagttct
ttaaacccaccatatgaaagtaacaattcaaaaggattatattttaatgatttatcatta
aatacaattcattattttactaataatctaatatcagaaattttaagaccaatccaaagt
tttggtaaaaccaataatgatattgacaatgttaataaggcaattgacaaaatcaaaaaa
caagaattaagttatcgtttaatgggatacttaaacatttggcaacaatgaatggtaatg
tgaacaggaaacaaaggaactaatgggtttttgccaatgttaccattaaataatttttta
acttcacaattatacccagtaaaatatcaatctggtagtgatatttttacaacttattct
attggtgctaattttgctgctccagttgaaattgtcaatttaccagtaatgatttccgtt
tataccatttttagtcttggtatagctgccttatcagtatgatcaattactagaaaggat
tttgtttaa

  All links  
Ontology (2)   
   KEGG BRITE (2)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (4)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (1)   
   UniProt (1)   
Protein domain (5)   
   Pfam (5)   
All databases (13)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system